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JPH05504067A - Shuttle plasmid for E. coli and mycobacteria - Google Patents

Shuttle plasmid for E. coli and mycobacteria

Info

Publication number
JPH05504067A
JPH05504067A JP3504156A JP50415691A JPH05504067A JP H05504067 A JPH05504067 A JP H05504067A JP 3504156 A JP3504156 A JP 3504156A JP 50415691 A JP50415691 A JP 50415691A JP H05504067 A JPH05504067 A JP H05504067A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
promoter
replication
vector
shuttle vector
coli
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP3504156A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
ラドフォード,アンソニー ジョン
ホッグソン,アドリアン エル.エム.
Original Assignee
コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガナイゼイション
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガナイゼイション filed Critical コモンウェルス サイエンティフィック アンド インダストリアル リサーチ オーガナイゼイション
Publication of JPH05504067A publication Critical patent/JPH05504067A/en
Pending legal-status Critical Current

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Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora

Landscapes

  • Genetics & Genomics (AREA)
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。 (57) [Summary] This bulletin contains application data before electronic filing, so abstract data is not recorded.

Description

【発明の詳細な説明】 大腸菌及びマイコバクテリアのためのシャトルプラスミド本発明は、ON八へク ターに関し、そして特にマイコバクテリア及びニスシリチア・コリ(Eschr ichia coli )細胞において複製できるDNA シャトルベクターに 関する0本発明はまた、そのようなりNAベクターを含む細菌宿主にも関し、そ してさらに、そのような細菌を含むワクチンにも関する。[Detailed description of the invention] Shuttle plasmids for E. coli and mycobacteria The present invention with respect to mycobacteria and Niscillichia coli (Eschr. DNA shuttle vector that can replicate in ichia coli) cells The present invention also relates to bacterial hosts containing such NA vectors, It further relates to vaccines containing such bacteria.

マイコバクテリウム ボビス(M cobacterinw bovis )  BCG (この後BCGと言及する)は、結核(TB)に対するワクチンとして 長年使用されて来た。ワクチン接種プログラムは、初めにBCGが長期の細胞介 在免疫性を刺激し、そして第2に、それは著しい安全性記録を有するので、ヒト TBを制御するためにはひじょうに効果的であった。これらの特徴は、組換えワ クチンのための生存投与システムの基礎を形成するためにBCGを良好な候補体 にする。Mycobacterium bovis BCG (hereinafter referred to as BCG) is used as a vaccine against tuberculosis (TB). It has been used for many years. Vaccination programs begin with BCG as a long-term cell-mediated stimulates the immune system, and secondly, it has a remarkable safety record, making it suitable for humans. It was very effective for controlling TB. These characteristics are unique to recombinant BCG is a good candidate to form the basis of a live administration system for Make it.

多くの問題が、マイコバクテリアを包含するDNA操作に関与する。Many issues are involved in DNA manipulation involving mycobacteria.

これらは、E、コリ(E、coli)のような細菌に比較して、ひしように少な い(1つの)プラスミドベクター、マイコバクテリアの遅い増殖速度及び低い形 質転換速度を包含する。これらの問題が付与される場合、毎日毎日の遺伝子操作 のために標準の細菌ワークホース、たとえばE、コリにおいて複製でき、そして 遺伝子操作の最終段階で又は近くでマイコバクテリウムにおいて、さらに復製で きるシャトルベクターを生成することが所望される。この場合、遺伝子は、マイ コバクテリア中に挿入され、そしてマイコバクテリウム増殖に関与する時間の遅 れ及び形質転換がほとんど回避され得る。 Gicquel−5anzeyなど 。 (Acta Lepologica 1989.7.5uppl(1) :  208〜211)は、復製のための2つの起点(1つはマイコバクテリアのた めであり、そして他の1つはE、コリのためである)を含むpAL8として知ら れるマイコバクテリア−E、コリ プラスミドシャトルベクターを記載した。複 製の複数起点は、マイコバクテリア起点を有するマイコバクテリアヘクターはE 、コリにおいて増殖できず、そして逆も真であるように、マイコバクテリアとE 、コリとの間の進化距離により必要であった。そのようなベクターは、2つの起 点の包含により、それらが相当な大きさである問題を有し、これはクローニング 効率、そのようなプラスミド中に挿入され得る所望するDNAフラグメントの大 きさを低め、そしてまた、プラスミド中に挿入され得るユニーク制限部位の数を 高める。These are much rarer than bacteria such as E. coli. (one) plasmid vector, slow growth rate and low morphology of mycobacteria Includes transformation rate. Genetic manipulation day in and day out, given these problems can be replicated in standard bacterial workhorses, such as E. coli, and In mycobacteria at or near the final stage of genetic manipulation, further reproduction is possible. It is desirable to generate shuttle vectors that can In this case, the gene inserted into mycobacteria and involved in mycobacterial growth. rupture and transformation can be largely avoided. Gicquel-5anzey etc. . (Acta Lepologica 1989.7.5uppl(1): 208-211) have two starting points for reproduction (one for mycobacteria). and the other one is for E. coli), known as pAL8. A Mycobacterium E. coli plasmid shuttle vector has been described. multiple Mycobacterium hector E. , mycobacteria and E. coli cannot grow, and vice versa. , was necessary due to the evolutionary distance between it and Cori. Such a vector has two origins. The inclusion of points has the problem that they are of considerable size, which makes cloning efficiency, the size of the desired DNA fragment that can be inserted into such a plasmid. This reduces the number of unique restriction sites that can be inserted into the plasmid. enhance

本出願者は、マイコバクテリア及びE、コリ細胞においてベクターの複製能力を 付与する復製の単一起点を担持するDNA シャトルベクターを提供することに よって、従来技術のシャトルベクターに関する問題を克服した。この後に記載さ れるように本発明の特に好ましい観点においては、複製領域は、コリネバクテリ ア(corynebacteriu)プラスミドpNG2又はそのフラグメント の複製領域に対応する。The applicant has demonstrated the replication ability of the vector in mycobacterial and E. coli cells. To provide a DNA shuttle vector carrying a single origin of replication Thus, the problems associated with prior art shuttle vectors have been overcome. described after this In a particularly preferred aspect of the invention, the replication region is corynebacterium plasmid pNG2 or a fragment thereof corresponds to the replication area.

本発明の第1の観点によれば、復製の単一起点(この複製の起点は、マイコバク テリア及びE、コリ細胞においてベクターの複製を可能にする)及び選択可能マ ーカーを含んで成る復製領域を担持するDNA シャトルベクターが供給される 。そのシャトルベクターは、所望するヌクレオチド配列の挿入のための1又は複 数の制限部位を含むヌクレオチド配列をさろに含んで成る。According to a first aspect of the invention, a single origin of replication (this origin of replication is a Mycobacterium (enables replication of the vector in E. coli and E. coli cells) and selectable matrices. A DNA shuttle vector carrying a reproduction region comprising a marker is provided. . The shuttle vector contains one or more vectors for insertion of the desired nucleotide sequence. It further comprises a nucleotide sequence containing a number of restriction sites.

好ましくは、その復製領域は、マイコバクテリア及びE、コ+、Iにおいて前記 ベクターの?Jj製を可能にするコリネバクテリア プラスミドpNG2又はそ のフラグメントの復製領域に対応する。Preferably, the reproduction region is as described above in mycobacteria and E, co+, I. Vector's? Corynebacterial plasmid pNG2 or its equivalent that enables production of Jj corresponds to the reproduction region of the fragment.

驚くべきことには、プラスミドp〜G2の復製領域;よ、コリネバクテリアとは 異なって、種々の細菌種における復製の能力を付与する。Surprisingly, the reproduction region of plasmid p~G2; Differently, conferring the ability to reproduce in various bacterial species.

[1114シャトルベクターは、さらに、ヌクレオチド配列が1又は複数の制限 部位中に挿入される場合、プロモーターがDNA転写の進行を可能にするように 、プロモーター及びその下流に1又は複数の制限エンドヌクレアーゼ部位を含ん で成る。DNA シャトルベクターは、複数のプロモーター及び下流の制限エン ドヌクレアーゼ部位を含むことができる。[1114 shuttle vectors may further have one or more restriction nucleotide sequences. When inserted into the site, the promoter allows DNA transcription to proceed. , a promoter and one or more restriction endonuclease sites downstream thereof. It consists of DNA shuttle vectors contain multiple promoters and downstream restriction enzymes. Can include a donuclease site.

本明細書で使用される場合、用語“シャトルベクター”とは、二本鎖直鎖又は二 本鎖環状鎖であり得るプラスミドDNAを包含する。As used herein, the term "shuttle vector" refers to a double-stranded linear or double-stranded Includes plasmid DNA which can be a full circular strand.

シャトルベクターは、当業界において良く知られている多くの技法、たとえば接 合、モビライゼーション、形質転換、トランスフエクンヨン、トランスダクショ ン又はエレクトロポレーシヨンにより細菌細胞中に導入され得る。Shuttle vectors can be used using many techniques well known in the art, such as combination, mobilization, transformation, transfection, transduction They can be introduced into bacterial cells by injection or electroporation.

本明細書で使用される場合、用語“選択可能なマーカー“とは、ヌクレオチド配 列により供給され又はそれをコードするいづれかの選択可能な特徴を言及する。As used herein, the term "selectable marker" refers to the nucleotide sequence Refers to any selectable feature provided by or encoding a column.

適切な選択可能マーカーは、抗生物質又は酵素又は免疫学的に検出可能なタンパ ク質、又は適切な基質を供給される場合、検出可能な反応を引き起こすことがで きる化学物質に対して耐性を包含する0例として、アンピシリン、ストレプトマ イシン、ペニシリン、ヒグロヌインン、カナマイシン、及び同様のもの、β−ガ ラクトシダーゼ、ウレアーゼ、アルカリ ホスファターゼ及び同様のものを挙げ ることができる。Suitable selectable markers include antibiotics or enzymes or immunologically detectable proteins. capable of producing a detectable reaction when supplied with a protein or suitable substrate. Examples of resistance to chemicals that can cause Icin, penicillin, hygronucin, kanamycin, and the like, Includes lactosidase, urease, alkaline phosphatase and the like. can be done.

用語“プロモーター”は、広く使用され、そしてRNAポリメラーゼに結合し、 そしてプロモーターの下流の(3′又は″操作的に結合される)ヌクレオチド配 列の転写を方向付けするいづれかのヌクレオチド配列を言及する。適切なプロモ ーターは、原核プロモーター、たとえばλハクテリオアアージのP1プロモータ ー、trpブロモ−ター、lacプロモーター、トランスポゾンTn903及び トランスポゾンTn5のカナマイシン耐性プロモーター、マイコバクテリア プ ロモーター、たとえば通常のマイコバクテリア65Kd抗原のプロモーター、マ イコバクテリアのリポソームI?NAプロモーター、M、ボビス抗原、MPB7 0. MPB59及びMPB64のプロモーター、真核プロモーターと原核プロ モーターとの間のハイブリッド、及び真核プロモーター、たとえばメタロチオニ ンプロモーター、成長ホルモンプロモーター、及び同様のものを包含する。The term "promoter" is widely used and is used to bind RNA polymerase and and the downstream (3' or "operably linked) nucleotide sequences of the promoter. Refers to any nucleotide sequence that directs transcription of a sequence. proper promo The promoter is a prokaryotic promoter, such as the P1 promoter of -, trp promoter, lac promoter, transposon Tn903 and Kanamycin resistance promoter of transposon Tn5, mycobacterial protein promoter, such as the promoter of the common mycobacterial 65Kd antigen; Icobacterial liposome I? NA promoter, M, bovis antigen, MPB7 0. MPB59 and MPB64 promoters, eukaryotic promoters and prokaryotic promoters hybrids between motors and eukaryotic promoters, e.g. the growth hormone promoter, and the like.

ベクター上に供給される制限エンドヌクレアーゼ部位は、1又は複数の既知制限 エンドヌクレアーゼ、たとえばEcoRl、 BamHl、 Pstl。Restriction endonuclease sites provided on the vector may include one or more known restriction endonuclease sites. Endonucleases, such as EcoRl, BamHl, Pstl.

C1al、 Kpnl、 HindlI[、HincI及びHinc II 、 及び同様のものの切断部位に対応する。制限エンドヌクレアーゼ部位は、多くの 密接にグループ分けされたilJ!エンドヌクレアーゼ部位を含むI又は?J数 のポリリンカーの形で供給され得る。C1al, Kpnl, HindlI[, HincI and HincII, and the like. Restriction endonuclease sites are Closely grouped ilJ! I or ? containing the endonuclease site? J number can be supplied in the form of a polylinker.

対象のヌクレオチド配列は、当業界において良く知られている方法及びたとえば Sambrookなど。(Mo Iecalar Cloning : A L aborat。The nucleotide sequence of interest can be obtained using methods well known in the art and e.g. Sambrook et al. (Mo Iecalar Cloning: A L aborat.

ry Manual、 Co1d Spring Harbor Labora tory、 2nd Edition、 1989)に記載される方法により、 そのアニーリングを可能にするための相補的“付着端”を有するDNAフラグメ ントの連結により又は゛フラッシュ”端(末対のヌクレオチドを有さないi)を 有するヌクレオチド配列の連結により、ベクター上に供給されるエンドヌクレア ーゼ切断部位中に挿入され得る。本発明のベクター中への挿入のためのヌクレオ チド配列は、下流の(3゛)配列の転写を方向付けるためのプロモーターを含む ことができる。プロモーターは転写されるべき遺伝子の天然のプロモーターであ り、又は異なったプロモーターであり得る。前記のように、本発明のシャトルベ クターは、1又はi数の制限エンドヌクレアーゼ切断部位をコードするヌクレオ チド配列から上流に(5゛)、1又は複数のプロモーターを、それ自体含むこと ができる。そのような6[においては、プロモーターを欠く所望するヌクレオチ ド配列が、ベクター中に挿入され、そして所望するヌクレオチド配列の転写がそ のベクター上に存在するプロモーターにより駆動される。ry Manual, Co1d Spring Harbor Labora by the method described in Tory, 2nd Edition, 1989). DNA fragments with complementary “sticky ends” to enable their annealing. or by ligation of the ``flush'' ends (i without the terminal pair of nucleotides) The endonuclease provided on the vector by ligation of the nucleotide sequence with enzyme cleavage site. Nucleotides for insertion into vectors of the invention The sequence contains a promoter to direct transcription of downstream (3') sequences. be able to. Promoter is the natural promoter of the gene to be transcribed. or a different promoter. As mentioned above, the shuttle vector of the present invention vector encodes one or i number of restriction endonuclease cleavage sites. itself contains one or more promoters upstream (5°) from the sequence Can be done. In such 6[, the desired nucleotide lacking a promoter is The code sequence is inserted into the vector and transcription of the desired nucleotide sequence is directed to it. is driven by a promoter present on the vector.

本発明のベクター中への挿入のためのヌクレオチド配列は、疾病を引き起こす細 菌、ウィルス又は寄生体、たとえばタエニア オビヘ/L7 *ユロシス(h胚 崩衰二」Lぶ一膿υ3上−ムじis) 、マイコバクテリウム Lブラエ(M  cobacterium le rae) 、マイコバクテリウムバラツへキュ ロシス(M cobacteriua+ aratuberculosis)  、バクテリオデス ノドサス(Bacterlodgs nodosus )又 はボルデテラ(B。The nucleotide sequences for insertion into the vectors of the invention are suitable for disease-causing organisms. Bacteria, viruses or parasites, such as Taenia obihe/L7 * urosis (h embryo Mycobacterium L brae (M) cobacterium le rae), mycobacterium baratu cobacteria + aratuberculosis , Bacterodgs nodosus is Bordetella (B.

rdetella)からの1又は複数の抗原をコードすることができる。所望す るヌクレオチド配列はまた、ホルモン、たとえばLH1?H1成長ホルモン又は そのエピトープ又は相同体;又は細菌宿主細胞内でヌクレオチド配列と組換えで きるDNA配列;又は宿主細胞内でDNA配列を変異誘発できるヌクレオチド配 列をコードすることができる。本発明のシャトルベクターが発現ベクターとして 機能する場合、所望する生成物をコードするヌクレオチド配列は、適切な宿主細 胞の膜中への挿入又は宿主細胞からの分泌を可能にするシグナル又はリーダー配 列を含むことができる。分泌リーダーの不在は、細菌宿主細胞の細胞質内での抗 原又は他のタンパク質生成物の蓄積を引き起こすであろう(ここで、抗原又は他 のタンパク質生成物は、良く知られた方法により回収される)。rdetella). desired Nucleotide sequences that contain hormones, such as LH1? H1 growth hormone or an epitope or homolog thereof; or a nucleotide sequence recombinant with the bacterial host cell. or a nucleotide sequence capable of mutating a DNA sequence within a host cell. columns can be coded. The shuttle vector of the present invention can be used as an expression vector. If functional, the nucleotide sequence encoding the desired product is A signal or leader sequence that enables insertion into the cell membrane or secretion from the host cell. Can contain columns. The absence of a secretory leader prevents anti-inflammatory activity within the cytoplasm of the bacterial host cell. antigen or other protein products (where the antigen or other The protein product is recovered by well known methods).

本発明の特定の態様によれば、アガロース電気泳動により測定される場合、約3 .IKbの大きさを有するDNA ツヤトルベクターρEP2、コリ矛ハタチリ ウム レプリコンpNG2に由来する複製の単一起点を含む約1.85Kbの複 製領域、カナマイシンに対して耐性の抗生IFI賞遺伝子、及び対象のDNA配 列の挿入のための多くの制限エンドヌクレアーゼ切断部位を含むヌクレオチド配 列が供給される。4.5 KbrのプラスミドpEP3は、pEP2と同し?J [製配列及びE、コ11及びマイコバクテリアの両者において効果的なヒグロマ イシン耐性をコートするマーカーを含む。According to a particular embodiment of the invention, when measured by agarose electrophoresis, about 3 .. DNA with the size of IKb, glossy vector ρEP2, Koriho Hatachiri An approximately 1.85 Kb complex containing a single origin of replication derived from the replicon pNG2. production region, the antibiotic IFI award gene resistant to kanamycin, and the DNA sequence of interest. A nucleotide sequence containing numerous restriction endonuclease cleavage sites for insertion of sequences. columns are supplied. 4. Is the 5 Kbr plasmid pEP3 the same as pEP2? J [Produced sequences and effective hygroma in both E. coli and mycobacteria.] Contains a marker that coats icin resistance.

本発明のシャトルベクターは、Bergey’s Manual of Det erminatiVe Bacteriology、 8th Edition 、 PP、 599−861に定義されるように、グラム陰性及びグラム陽性宿 主、たとえばマイコバクテリウム、E。The shuttle vector of the present invention is described in Bergey's Manual of Det. erminatiVe Bacteriology, 8th Edition , PP, 599-861. Mainly, for example, Mycobacterium, E.

コリ、コリ名バクテリウム及びアクチノマイセテス(Actinom cete s)の種において複製できる。本発明のベクターは、ハシラス(Bacill旦 )Wにおいては複製しないように見える。いづれかの細菌株は、本発明のシャト ルベクターがそこにおいて復製できるか又はいなかを確かめるために、当業界に おいて良く知られている方法に従って容易に試験され得る。好都合には、本発明 のシャトルベクターは、前記のように、世界しゅうのワクチン接種プログラムに 集中的に使用され、そして長期の細胞介在免疫性を刺激する可能性あるアジュバ ントである、細菌株、たとえばマイコバクテリウム ボビスBCGの弱毒株にお いて高いコピー数に復製できる。coli, Bacterium coli and Actinomycetes can be replicated in species s). The vector of the present invention is derived from Bacillus ) W does not seem to replicate. Any of the bacterial strains of the present invention to the art to ascertain whether or not vectors can be reproduced therein. can be easily tested according to methods well known in the art. Advantageously, the present invention The shuttle vector has been used in vaccination programs throughout the world, as described above. Adjuva is used intensively and has the potential to stimulate long-term cell-mediated immunity. bacterial strains, such as a weakened strain of Mycobacterium bovis BCG. can be reproduced to a high copy number.

pNG2の複製の起点を組込むシャトルベクターは、コリネバクテリウム属の生 物において特に効果的である。The shuttle vector that incorporates the origin of replication of pNG2 is Particularly effective in objects.

本発明のもう1つ、の観点によれば、本明細書に定義されるようなシャトルベク ターを含t 1lill W宿主が供給される。そのシャトルベクターは、その 細菌宿主内で単一コピー又はより好ましくはその複数コピーとして存在できる。According to another aspect of the invention, a shuttle vector as defined herein A total of 100 W hosts are provided, including a host. That shuttle vector is It can exist as a single copy or more preferably multiple copies thereof within the bacterial host.

好ましくは、細菌宿主はマイコバクテリア、コリ2バクテリア又はE、コリ株、 たとえばC,プソイドツヘルキュロシス(C,Pseudotuberculo sis) 、M、スメグマチス(ト」■macis )及びM、ボビスBCGで あるが、但しこれだけには限定されない。そのベクターは、前記のように宿主細 胞からの排泄生成物として、その発現のために細菌宿主中に抗原又は他のタンパ ク質遺伝子を運ぶために使用され得る。タンパク質は、プラスミドベクター上に 存在しながら、又は組換えの後、又は染色体中への挿入の後、発現され得る。他 方、発現された生成物は、宿主細胞膜又は細胞壁中に挿入され又はそれに関与し 、又は宿主細胞自体内に存在できる。Preferably, the bacterial host is a Mycobacterium, a Mycobacterium coli strain 2 or an E. coli strain, For example, C. pseudotuberculosis (C. pseudotuberculosis) sis), M. smegmatis (t" macis) and M. bovis BCG Yes, but not limited to this. The vector is isolated from the host cell as described above. As an excretory product from the cells, antigens or other proteins are released into the bacterial host for their expression. can be used to carry proteinaceous genes. Proteins are placed on plasmid vectors It can be expressed while present or after recombination or insertion into the chromosome. other On the other hand, the expressed product is inserted into or participates in the host cell membrane or cell wall. , or within the host cell itself.

所望する抗原を発現する細菌宿主は、ワクチン、たとえば所望する抗原を発現す るM、ボビスBCGとして供給され得る。免疫化に基づいて、免疫応答は、宿主 、たとえばM、ボビスBCG及び疾病を引き起こす細菌、ウィルス又は寄生体の 所望する抗原に蓄積され得る。A bacterial host expressing the desired antigen can be used to create a vaccine, e.g. M, bovis BCG. Based on immunization, the immune response , such as M. bovis BCG and disease-causing bacteria, viruses or parasites. The desired antigen can be accumulated.

本発明のもう1つの観点においては、本明細書に定義されるように、シャトルベ クターを含む細菌宿主細胞により発現される場合、ポリペプチドが供給される。In another aspect of the invention, a shuttle vehicle, as defined herein, The polypeptide is supplied when expressed by a bacterial host cell, including a bacterial vector.

本発明は、マイコバクテリウム及びE、コリにおける複製を付与するために、そ のような変性がそのような配列の能力を阻止しない限り、pNG2の複製領域へ のヌクレオチド配列の挿入又はそれからのヌクレオチド配列の欠失を包含する。The present invention provides for replication in Mycobacterium and E. coli. into the replication region of pNG2, unless modifications such as preclude the ability of such sequences to nucleotide sequences or deletions therefrom.

ヌクレオチド配列の挿入又は欠失のための技法は、当業界において良く知られて いる。変異体は、グラム陰性及びグラム陽性宿主細胞、たとえばE、コリ及びコ リネバクテリアにおいて復製を付与するための能力について容易に試験され得る 。Techniques for insertion or deletion of nucleotide sequences are well known in the art. There is. The mutants can be used in Gram-negative and Gram-positive host cells, such as E. coli and Coli. can be easily tested for the ability to confer reproduction in Lineobacteria .

本発明はまた、適切なベクター中への挿入後、前記ベクターのマイコバクテリア 及びE、コリ中での複製を可能にできる、ρN62自体又はそのフラグメントの 複製領域にも拡張する。The invention also provides that, after insertion into a suitable vector, the mycobacterial and E, of ρN62 itself or a fragment thereof capable of replication in E. coli. Expand to duplicate area as well.

プラスミドpEP2を含むE、コリの培II物は、Au5tralian Go vernsent Analytocal Laboratory(AGAL) 、Pymble、New 5outh Waies、Au5tra1iaでブダ ペス条約下で1990年2月23日に寄託され、そしてN901007080の 寄託番号が得られた。E. coli culture II containing plasmid pEP2 was prepared using Au5tralian Go Vernsent Analytical Laboratory (AGAL) , Pymble, New 5outh Waies, Buda in Au5tra1ia Deposited on February 23, 1990 under the PES Treaty and of N901007080. A deposit number was obtained.

本発明は、次の非制限図及び例により例示されるであろう。The invention will be illustrated by the following non-limiting figures and examples.

図面 第1図は、プラスミドpEP2の構成を示す、プラスミドpNG2 (14,5 )をEcoRIにより消化し、そして最大のフラグメントをpUC4にのKan ’カートリッジに連結した。E、コリ中へのエレクトロポレーションの後、得ら れたプラスミドDNAを抽出し、そしてPs tlにより一部消化し、そして次 に再連結し、そして再びE、コリによりエレクトロポレートした。得られたKa n’コロニーの1つは、プラスミドpEP2を含んだ。制限部位: B(Bag 旧)、 E(EcoRI)、 H(HindI[I)、Hc(Hinc I[) 。drawing Figure 1 shows the structure of plasmid pEP2, plasmid pNG2 (14,5 ) was digested with EcoRI and the largest fragment was transformed into pUC4. 'Connected to the cartridge. E, obtained after electroporation into coli The extracted plasmid DNA was extracted and partially digested with Pstl, and then and electroporated again with E. coli. Obtained Ka One of the n' colonies contained plasmid pEP2. Restriction site: B (Bag old), E (EcoRI), H (HindI[I), Hc (HincI[) .

P(PstI)、 5(Sal r) 、 Kanは、pUC4Kからの耐カナ マイシン性遺伝子を言及する。P (PstI), 5 (Sal r), Kan are resistant kana from pUC4K. Mention the mycinogenic gene.

第2A図は、マイコバクテリウム−E、コリ シャトルヘラターρEP2の環状 地図である。その制限地図は、適切な切断部位を付与する:B(BamHI)、  E(EcoRI)、H(HindlI[)、 Hc(H4ncII)、 K箪 り、 P(Pstl)、 5(Sal I)。耐カラマイシン性遺伝子はpUC 4Kからの\\\\部分である。第2B図:配列決定法。矢印は、M13ヘクタ ーにクローンされた制限フラグメントから生成される配列の程度及び方間を示す 。Xはオリゴヌクレオチド プライマーを用いて誘導体化された配列を示す。Figure 2A shows the ring shape of Mycobacterium E. coli shuttleherata ρEP2. It's a map. The restriction map gives the appropriate cleavage site: B (BamHI), E (EcoRI), H (HindlI [), Hc (H4ncII), K ri, P (Pstl), 5 (Sal I). Calamycin resistance gene is pUC This is the \\\\ part from 4K. Figure 2B: Sequencing method. The arrow is M13 Hector shows the extent and direction of the sequences generated from restriction fragments cloned into . X indicates a sequence derivatized using an oligonucleotide primer.

第3図は、ρEP2の複製領域の完全なヌクレオチド配列である。適切な制限部 位は、第1図との比較のためにマークされる(E(Eco RI)。FIG. 3 is the complete nucleotide sequence of the replication region of ρEP2. Appropriate restriction The position is marked for comparison with FIG. 1 (E (Eco RI)).

H(Hindl[[)、 Flc(Hinc[I)、 KハLI)、IR及びO R1それぞれ逆方向及び直接的な反復配列、 l?Bs、推定上のリポソーム結 合部位;−−−一一←−−−−1推定上のrho−依存性転写ターミ第一ター、 Tに関与する2回対称軸。0RFA、主要読み取り枠。H(Hindl[[), Flc(Hinc[I), KHALI), IR and O R1 inverted and direct repeat sequences, respectively, l? Bs, putative liposome binding Synthesis site;---11←----1 putative rho-dependent transcription terminus terminus; 2-fold axis of symmetry involving T. 0RFA, major reading frame.

第4図は、E、コリから抽出されたプラスミドpEP2によりプローブされたゲ ルのアガロースゲル(右側のプレート)及びサザンブロノト(左側のプレート) を示す、トラックは、(A) E、 コリからの未消化pEP2 DNA、 5 00ng、 (B) Pst Iにより消化された、E、コリがらのpEP2  DNA、 200ng、 (C) PstI消化された、M、ボビスBCGの完 全なりNA抽出物、2.5 μg、 (D) Pstl消化されたM、ボビスB CG DNA。Figure 4 shows the gene probed with plasmid pEP2 extracted from E. coli. agarose gel (plate on the right) and Southern blotting (plate on the left) (A) Undigested pEP2 DNA from E. coli, 5 00ng, (B) Pst I digested, E. coli cartilage pEP2 DNA, 200 ng, (C) Complete PstI-digested M, bovis BCG Total NA extract, 2.5 μg, (D) Pstl digested M, bovis B CG DNA.

2.5μg、(E)M、ボビスBCG pEP2の未消化DNA抽出物、2.5 μg。2.5μg, (E)M, undigested DNA extract of Bovis BCG pEP2, 2.5 μg.

(F) M、ボビスBCGの未消化DNA抽出物、2.5 tl g、 (G)  HindI[[により消化されたλDNAマーカーを含む。(F) M, undigested DNA extract of Bovis BCG, 2.5 tl g, (G) Contains the λ DNA marker digested by HindI [[.

例1 11Ω旦」座: 特にことわらない限り、岨換え分子の操作及び溶液の調製は、標準の既知技法に よる。そのような技法は、Salbrookなど0MoleaclarC1on ing、 A Laboratory Manual、 Co1d Sprin g Harbor Laboratory。Example 1 11Ω Dan”: Unless otherwise noted, manipulation of engineered molecules and preparation of solutions follow standard known techniques. evening. Such techniques include Salbrook et al. ing, A Laboratory Manual, Co1d Sprin g Harbor Laboratory.

Co1d Spring Harbor (1989) 、 PP、1−500 に記載される。Co1d Spring Harbor (1989), PP, 1-500 It is described in

びプラスミド: マイコバクテリウム ボビスBCG変異C5Lを、Com+*onwealth  SerutmLabora turies (C5L) Aus trali aから凍結乾燥ヒトワクチンとして得た。and plasmid: Mycobacterium bovis BCG mutant C5L, Com+*onwealth Serutm Labora turies (C5L) Aus trali It was obtained as a lyophilized human vaccine from A.

M、スメグマチス(M、 see 5tatic)及びM、フェリ(ム画虹V) を、Fairfield Ho5pital、 Melbourne、 Au5 traliaから得、そして大腸菌JM109をPromega(Madiso n、 Wisconnsin、 U、S、A、)から得た。プラスミド pNG 2(Serwold−Davisなど、 1987. Proc、 Natl、  Acad、 Sci。M, Smegmatis (M, see 5tatic) and M, Feli (Muga Rainbow V) , Fairfield Ho5pital, Melbourne, Au5 tralia and E. coli JM109 was obtained from Promega (Madiso n, Wisconsin, U.S.A.). Plasmid pNG 2 (Serwold-Davis et al., 1987. Proc, Natl. Acad, Sci.

USA 84:4964−4968)及びpPB3を、Dr、Ph1lip B ird (Monash University Faculty of Me dicine、 Alfred Ho5pita1.Melbourne)から 得た。USA 84:4964-4968) and pPB3, Dr. Ph1lip B ird (Monash University Faculty of Me dicine, Alfred Ho5pita1. from Melbourne) Obtained.

プラスミドpAL8 (Gicquel−5anzeyなど、 1989 Ac ta Leprol、7 : 207−211) を、 Or、Brigett e Gicquel−5anzey (Pasteur In5titute、 Paris)から得、そしてプラスミドpUGc4Kを、Pharsacia  LKB (Uppsala、Sweden)から得た。Plasmid pAL8 (Gicquel-5anzey et al., 1989 Ac ta Leprol, 7: 207-211), Or, Bridgett e Gicquel-5anzey (Pasteur In5tituto, and plasmid pUGc4K was obtained from Pharmacia Obtained from LKB (Uppsala, Sweden).

豊−廼: E、コリ株を、Luriaブイヨン(LB : 10 gのトリプトン、5gの 酵母抽出物、10gのNaCl/ I! )中で増殖した。コリネフォルム細菌 を、しB培地(Oxoyd )で増殖し、そしてマイコバクテリウム種を、Du bos又は7H11培地(Oxoid、 Au5tralia )中で増殖した 。Yutaka: E. coli strain in Luria broth (LB: 10 g of tryptone, 5 g of Yeast extract, 10g NaCl/I! ). coryneform bacteria were grown in B medium (Oxoid), and Mycobacterium sp. Grow in bos or 7H11 medium (Oxoid, Au5tralia) .

のエレクトロポレーション: マイコバクテリウム種及びコリネバクテリうム ブソイドツへルキュロシスを、 Bio−Rad Laboratories Incから入手できるGene  Putserを用いて、Lugos iなと、(Tubercule 70:1 59−170 (1989) )に従って、エレクトロポレートした。形質転換 体を、カナマイシン100μg/d又はヒグロマインン8200μg/rdを含 む7H11又は栄養培地上で選択した。Electroporation of: Mycobacterium species and Corynebacterium luculosis, Gene available from Bio-Rad Laboratories Inc. Using Putser, Lugos i (Tubercule 70:1 59-170 (1989)). transformation The body was treated with 100 μg/d of kanamycin or 8200 μg/rd of hygromine. 7H11 or on nutrient medium.

DNA びハイブリダイゼーション :DNAを、酵母からDNAを単離するた めに使用される方法の変法を用いてマイコバクテリウムから抽出した(Mann  and Jeffrey、 Anal。DNA and hybridization: DNA is isolated from yeast. Mycobacterium was extracted using a modification of the method used for and Jeffrey, Anal.

Biochen+、 1981.178 : 82−87)。マイコバクテリウ ム細胞を、40〇−のDubosブイヨンから、遠心分離により収穫し、5dの TEI衝液に再Q濁し、そして70°Cで1時間の処理により熱殺害した。ガラ スピーズ(3〜61111)を添加し、そしてその混合物を最少30秒間、激し く撹拌し、細菌を分散せしめた。次に、細菌懸濁液を、液体窒素の浴中で予備冷 却されたキルタル中の液体窒素に移し、そして予備冷却された乳棒を用いて細か な粉末に粉砕した。細胞の粉砕は、/NNイムザード フードの中で行なわれた 。粉砕された凍結細胞を、溶Ill衝e、(6,6mMのトリス、30gM)E DTA、1.2%−/vのナトリウムラウロイル サルコシネート’)15dに 少量ずつ(ヘラで)添加した。Biochen+, 1981.178: 82-87). mycobacteria Cells were harvested by centrifugation from 400-mL Dubos broth and incubated for 5 d. It was resuspended in TEI buffer and heat killed by treatment at 70°C for 1 hour. gala Add Speed (3-61111) and simmer the mixture for a minimum of 30 seconds. Stir thoroughly to disperse the bacteria. The bacterial suspension is then precooled in a bath of liquid nitrogen. Transfer to liquid nitrogen in a cooled quilter and finely grind using a pre-chilled pestle. Grinded into fine powder. Cell crushing was performed in a /NN Imzard hood. . The crushed frozen cells were lysed (6.6mM Tris, 30gM) and E DTA, 1.2%-/v sodium lauroyl sarcosinate') 15d It was added little by little (with a spatula).

プロテアーゼに5mgを添加し、そしてその混合物を37°Cで90分間インキ ュベートした0次に、その混合物を等体積のフェノール−クロロホルムにより抽 出し、そして水性相を、4 ”Cで10分間、イソプロパツールにより沈殿せし めた。ベレットを、1. OdのTEi衝液に溶解し、そしてフェノール−クロ ロホルムにより抽出し、そして次に水−飽和エーテルにより抽出し、その後、エ タノール沈殿せしめ、そしてTEに再懸濁した。Add 5 mg of protease and ink the mixture for 90 minutes at 37°C. The mixture was then extracted with an equal volume of phenol-chloroform. and the aqueous phase was precipitated with isopropanol for 10 min at 4”C. I met. Beret, 1. Dissolved in Od's TEi buffer and phenol-chloro Extracted with chloroform and then water-saturated ether, then extracted with ether. Tanol precipitated and resuspended in TE.

ゲノムDNAを、前記のようにしてC,ブソイドツへルキュロシスから単離した (Hodgsonなど、、1990)。Genomic DNA was isolated from C. busoidotsherculosis as described above. (Hodgson et al., 1990).

pNG2RI DNAを種々の制限酵素により消化し、そしてフラグメントを、 Hybond N (A僧ersham)ナイロンフィルターにサザンプロット した(Re+dC” 、) e フィルターを、ランダム ヘキサマー プライ マーを用いて32PによりラベルされたpEP2により37℃で一晩、ハイブリ ダイズせしめ、必要なら、上昇する緊縮度(65°Cまでの)で洗浄し、そして X線フィルム(Fuji RX )に照射した。制限消化された全体のゲノムD NAを、M、ボビス BCGから単離し、モしてpEP2により形質転換された DNAをナイロンにサザンプ口、トし、そして上記のようにラベルされたpEP 2によりプローブした。他の形質転換されたマイコバクテリウム種を、D!IA  トンドブロット ハイブリダイゼーシヨンを用いて、ρEP2プローブにより 分析した。C,ブソイドツへルキュロシス形質転換体を、同しB樺で分析した。pNG2RI DNA was digested with various restriction enzymes, and the fragments were Hybond N (Aersham) Southern plot on nylon filter (Re+dC”,)e filter with random hexamer ply Hybridize overnight at 37°C with pEP2 labeled with 32P using Soybean, washed with increasing stringency (up to 65°C) if necessary, and An X-ray film (Fuji RX) was irradiated. Restriction digested whole genome D NA was isolated from M. bovis BCG and transformed with pEP2. Transfer the DNA to nylon and add pEP labeled as above. 2. Other transformed Mycobacterium species were transferred to D! IA Using Tondoblot hybridization, with ρEP2 probe analyzed. C. luculosis transformants were analyzed on the same B birch.

全体の細胞DNAを用いて、カナマイシン又はヒグロマイシン耐性に対するE、 コリを単離し、そして形質転換せしめた。E for kanamycin or hygromycin resistance using whole cellular DNA; E. coli was isolated and transformed.

皿虹父死分梶: ヌクレオチド配列分析を、変性されたT7 DNAポリメラーゼ(Pharsa cia LKB、 Uppsula、 Sweden)を用いて、ジデオキソ鎖 停止方法(Sangerなど、、1977、Proc、 Natl、 Acad 、 Sci、 USA 74 : 5463−5467)により行なった。pE P2の完全なヌクレオチド配列を、一般的な又はオリゴヌクレオチドブライマー を用いて、両鎖上に誘導した(第1B図)。後者は、Gene Assembl er+DNA Synthesizer(Pharmacia LKB。Saranijichi Shibunkaji: Nucleotide sequence analysis was performed using denatured T7 DNA polymerase (Pharsa dideoxo chain using cia LKB, Uppsula, Sweden) How to stop (Sanger et al., 1977, Proc, Natl, Acad , Sci, USA 74: 5463-5467). pE The complete nucleotide sequence of P2 can be converted into a generic or oligonucleotide primer. was used on both strands (Figure 1B). The latter is Gene Assembly er+DNA Synthesizer (Pharmacia LKB.

前記)を用いて合成された。DIIA及びアミノ酸配列のデータを調べ、そして DNA5IS及びPRO!l+Isソフトフェアーパンケージ(Pharmac ia LKB)を用いて分析した。(described above). Examine DIIA and amino acid sequence data, and DNA5IS and PRO! l+Is soft fair package (Pharmac ia LKB).

例2 シャトルベクターの構 びそのへ析: 耐カナマイシン遺伝子を担持するpUc4Kからの1.3KbのEcoR1フラ グメントを、EcoRlにより消化されたpNG2 DNAに連結した。その連 結混合物をE、コリJM109中にエレクトロボレートし、そして形質転換体を 、50μgのカナマイシン/−により補充されたLBプレート上で選択した。す べての形質転換体は、9.5KbのpNG2 EcoR1フラグメントを有する プラスミドを含んだ。これらのクローンの1つからのプラスミドDNA(2u  g)(pNG2 R1)を、PstIにより一部消化し、そしてT4DNAポリ メラーゼを用いてプラント化した。 10Kbよりも小さなりNAフラグメント を、1%アガロースゲルから精製し、そしてR6コリJl’1109を耐カナマ イシン性に形質転換するために使用した。形質転換体から単離された、得られる プラスミド(pEP2)の制限地図を、標準方法(Sambrookなど、1前 記)を用いて誘導体化し、そして第1A図に示す。Example 2 Structure and analysis of shuttle vector: The 1.3 Kb EcoR1 fragment from pUc4K carrying the kanamycin resistance gene The fragment was ligated to EcoRl-digested pNG2 DNA. That series The ligation mixture was electroborated into E. coli JM109 and the transformants were , selected on LB plates supplemented with 50 μg kanamycin/−. vinegar All transformants have a 9.5 Kb pNG2 EcoR1 fragment. Contains plasmids. Plasmid DNA from one of these clones (2u g) (pNG2R1) was partially digested with PstI and T4 DNA poly Planted using merase. NA fragment smaller than 10Kb was purified from a 1% agarose gel and R6 coli Jl'1109 was purified from Kanama resistant used for icinic transformation. isolated from transformants, obtained The restriction map of the plasmid (pEP2) was prepared using standard methods (e.g. Sambrook). ) and is shown in FIG. 1A.

プラスミドpEP2は、アガロースゲル電気泳動により測定される場合、3.I Kbの分子量を有する。このプラスミドは、pUC4にポリリンカーの1つを保 持し、そして従って、ユニークなPst l 、Sal I 、BanHl及び EcoR1部位を有する。ハイブリダイゼーション分析は、プラスミドpEP2 及びpNG2R[(EcoRIによる消化後、pNG2 )の両者が800bp の旧ndlnフラグメントを含むことを示す。pEPプラスミドを有するpNG 2のサブクローンの消化物のサザンブロノトは、第1図に示されるpNG2の領 域がρEP2プラスミドに組込まれた領域であり、そして従って、その領域は複 製の起点を含むことを示した。Plasmid pEP2, as determined by agarose gel electrophoresis, 3. I It has a molecular weight of Kb. This plasmid carries one of the polylinkers in pUC4. and therefore the unique Pstl, SalI, BanHl and It has an EcoR1 site. Hybridization analysis performed on plasmid pEP2 and pNG2R [(pNG2 after digestion with EcoRI) are both 800 bp ndln fragment. pNG with pEP plasmid A Southern blotting of the digest of subclone 2 was carried out using the region of pNG2 shown in Figure 1. region is the region integrated into the ρEP2 plasmid, and therefore the region is It was shown that it contains the starting point of the production.

ヒグロマインン耐性がマイコバクテリア種及びC,ブソイドッへルキュロシスに おいて選択可能なマーカーとして使用され得るかどうかを決定するために、ヒグ ロマイシン ホスホトランスフェラーゼ遺伝子(hph )を、マイコバクテリ ウム シャトルヘクターpEP中にクローン化した。Hygromine resistance in Mycobacterium species and C. Hyg The romycin phosphotransferase gene (hph) was introduced into mycobacterial It was cloned into Shuttle Hector pEP.

pPB3からのヒグロマイシン ホスホトランスフェラーゼ遺伝子(hph ) をpEP2中にクローン化するために、pUc4K DNAをXhoTにより線 状化し、そして次に、DNAポリメラーゼ■のフレノウ フラグメントを用いて プラント化した。pPB3 DNAを、5単位の個々のAlul。Hygromycin phosphotransferase gene (hph) from pPB3 To clone pUc4K into pEP2, pUc4K DNA was linearized with XhoT. and then using the Flenow fragment of DNA polymerase turned into a plant. pPB3 DNA into 5 units of individual Alul.

Hae III及びRsa Iを用いて、氷上で30秒間、消化した。2.OK bの大きさのフラグメントを、ゲル着装しくGeneclean、 Bresa tech) 、そしてプラント末端化された線状のpUc4K DNAにより一 晩連結した。Digested with Hae III and Rsa I for 30 seconds on ice. 2. OK A fragment of size b was gel-mounted using Geneclean, Bresa. (tech), and was isolated by plant-terminated linear pUc4K DNA. Connected in the evening.

その連結混合物をJM109中にエレクトロポレートし、そして組換え体を、1 50μgのヒグロマイシンB (Sigma)/r11により補充されたLBプ レート上で選択した。pUC4にキメラからの1.7KbのSal I −C1 aI挿入体を、pEP2のカナマイシン耐性遺伝子内のSal r −C1a  r部位中に連結した。JM109を、上記のようにして連結混合物によりヒグロ マイシン耐性に形質転換し、そして耐カナマイシン性プラスミド(pEP3)の 制限地図を誘導した。プラスミドpEP3は、ユニーク5a11部位を有し、そ して約4.5Kbの大きさである。The ligation mixture was electroporated into JM109 and the recombinant LB protein supplemented with 50 μg hygromycin B (Sigma)/r11. Selected on rate. 1.7 Kb Sal I-C1 from chimera to pUC4 The aI insert was inserted into Sal r -C1a within the kanamycin resistance gene of pEP2. ligated into the r site. JM109 was hygroconjugated with the ligation mixture as described above. The kanamycin-resistant plasmid (pEP3) was transformed into a mycin-resistant plasmid (pEP3). Guided the restriction map. Plasmid pEP3 has a unique 5a11 site; It has a size of about 4.5 Kb.

耐カナマイシン遺伝子を含まないpEP2のヌクレオチド配列は、第3図に示さ れる。そのDNA配列の試験は、単一の読み取り枠(ORF)を示した。多くの 可能性ある翻訳開始コドンは、この領域内で同一であり得るが、しかしたった1 つが推定上のリポソーム結合部位により先行される。このORFの上流の配列( ORFA)は、E、コリ コンセンサス プロモーターを有さないが、推定上の rho−依存性転写ターミ不一ターが停止コドンの下流に見出された(第2図) 。この推定上のターミぶ一ターは、他のrho−依存性ターミ茅−ターについて 記載されるように(Rosenbergなど、、Nature272.414− 428〔1978) )、TAATCAATATコンセンサス配列に90%マツ チしくRyderなと、、In1tia仁ion of DNA Replic ation (1981) 、^cademic Press。The nucleotide sequence of pEP2, which does not contain the kanamycin resistance gene, is shown in Figure 3. It will be done. Examination of the DNA sequence showed a single open reading frame (ORF). many Potential translation initiation codons can be identical within this region, but only one is preceded by a putative liposome binding site. The upstream sequence of this ORF ( ORFA) does not have an E. coli consensus promoter, but a putative A rho-dependent transcription terminator was found downstream of the stop codon (Figure 2). . This putative terminator is similar to other rho-dependent terminators. As described (Rosenberg et al., Nature 272.414- 428 [1978)), 90% pine in the TAATC AATAT consensus sequence Chishiku Ryder, In1tia ion of DNA Replic ation (1981), ^ academic Press.

New York) 、そして2回対称軸の領域により先行される(第2図)。New York), and is preceded by a region of two-fold symmetry axis (FIG. 2).

従って、0RFAは、28KDa・のタンパク質をコードすることができ、大き さは、他のRapミルタンパクついて報告される大きさと一致する。Therefore, 0RFA can encode a protein of 28 KDa, which is large. The size is consistent with that reported for other Rapmil proteins.

0RFAタンパク質の予測される大きさの他に、本発明者が適切な翻訳領域を同 定したことを示唆する追加の証拠が、誘導化されたアミノ酸配列の試験から生し る。第1に、推定上の0RFA生成物のためのコドンバイアス(Phe、 TT C;Asp、 GAC;Arg、 CG ; Ile、 ATC;Val。In addition to the predicted size of the 0RFA protein, the inventors have also Additional evidence suggesting that the derivatized amino acid sequence Ru. First, the codon bias for the putative 0RFA product (Phe, TT C; Asp, GAC; Arg, CG; Ile, ATC; Val.

GTC; Ala GCC; Thr、 ACC)は、他のコリネバクテリウム のタンノクク質のためのコドンと同じである。第2に、0RFAによりコードさ れる予測されるタンパク質は、それらが複製及び不和合性において演しる役割に おいて重要であるが、Repタンパク質(及び他のD1結合タンパク質)の特徴 である天然において高い塩基性を示す(19%塩基性残基)。GTC; Ala GCC; Thr, ACC) are other Corynebacterium is the same as the codon for protein. Second, coded by 0RFA The predicted proteins that will be included in the Importantly, the characteristics of Rep proteins (and other D1-binding proteins) It exhibits high basicity in nature (19% basic residues).

データヘース研究が、完全な1.85Kbのヌクレオチド配列及び0RFAの予 測されるアミノ酸配列の両者を用いて行なわれたが、しかし有意な相同性は見出 されなかった。さらに、より詳細な分析は、pEPZRepel域とコリネバク テリウム(pBLl、 Martinなど、 、 Biotechnol 。DataHase research has revealed the complete 1.85Kb nucleotide sequence and prediction of 0RFA. However, no significant homology was found. It wasn't done. Furthermore, a more detailed analysis of the pEPZRepel region and Corynebacterium Therium (pBLl, Martin et al., Biotechnol.

など、、GenelT :315−321 r1988) )からの実質的に関 係するプラスミドのいづれかとの間の類似性を示さなかった。etc., GenelT: 315-321 r1988)). It showed no similarity to any of the related plasmids.

プラスミド複製領域は単に複製の起点を有する。はとんどの場合、起点は、非コ ード領域に位置し、直接的な及び逆方向反復体群を有し、そしてA+Tに冨む配 列により先行され得る(Kamioなど、、J。A plasmid replication region simply contains an origin of replication. In most cases, the origin is located in the code region, has direct and inverted repeat groups, and is enriched in A+T. (Kamio et al., J.

Bacteriol、258:307−312 [1984) 、 5cotl など、、Microbiol、 Rev。Bacteriol, 258:307-312 [1984), 5cotl etc., Microbiol, Rev.

48: 1−23 (1984) 、 Rosenなと、、Mo1. Gen、  Genet、 179 : 527−537〔1980) 、 Rauzie rなど、、Gene71 : 315−321 [1988) ) 、 0RF Aの上流領域はORFを含まず、そして多くの直接的な及び逆方向反復体D)1 A配列を存する(第2図)。さらに、n t86と171 との間の領域は、完 全なRep SJI域のために平均45%であるのと比較して、63.5%のA +Tである(第2図)。従って、これは複製のpEP2起点であると思われる。48: 1-23 (1984), Rosenato, Mo1. Gen, Genet, 179: 527-537 [1980], Rauzie r etc., Gene71: 315-321 [1988)), 0RF The upstream region of A does not contain an ORF and contains many direct and inverted repeats D)1 A sequence exists (Figure 2). Furthermore, the area between nt86 and 171 is completely A total of 63.5% A compared to an average of 45% for the full Rep SJI range. +T (Figure 2). Therefore, this appears to be the pEP2 origin of replication.

pEP2の複製領域は、単一の28KDaタンパク質をコードすることができ、 そしてグラム陰性及びグラム陽性細菌においてプラスミドの複製を可能にする単 一の起点を有する。従って、pEP2はユニークシャトルベクターであり、そし てたとえばマイコバクテリウムの遺伝子分析において、及び生存組換えワクチン としてM、ボビスBCGの開発において存用な手段であるはずである。The replicated region of pEP2 can encode a single 28KDa protein; and the monomer that allows plasmid replication in Gram-negative and Gram-positive bacteria. It has one starting point. Therefore, pEP2 is a unique shuttle vector and For example, in genetic analysis of Mycobacterium and live recombinant vaccines. As such, it should be a useful tool in the development of M, Bovis BCG.

EP2 びEP3によるマイコバクテリアのエレクトロポレーション:pEP2  DNAによりマイコバクテリウム種のエレクトロポレーションは、それぞれカ ナマイシン耐性への形質転換をもたらした(第1表)。Electroporation of mycobacteria with EP2 and EP3: pEP2 Electroporation of Mycobacterium species by DNA This resulted in transformation to namycin resistance (Table 1).

プラスミドがマイコバクテリアに存在することを確かめるために、合計の細胞調 製物を、耐カナマイシン性形質転換体から製造した。To confirm that the plasmid is present in mycobacteria, total cell preparation Products were made from kanamycin resistant transformants.

第4図は、pEP2により形質転換されたBCG CSL株から抽出された合計 の細胞DNAのアガロースゲル及びサザンブロノト分析の結合を示す。さらに、 ゲルバンドの相対的な強度は、pEPプラスミドがこれらの細菌中において高い コピー数に複製することを示唆する。さらに、耐業物性形質転換体から単離され た合計のゲノムDNAを用いて、E、コリをエレクトロボレートする場合、約1 .0X10’個の耐カナマイシン性クローンが、1μgのON八へたりに得られ た。−緒に取られたこれらのデータは、PEP2レプリコンがこれらの細菌中に おいて高いコピー数に安定したプラスミド複製を促進することを示唆する。Figure 4 shows the total amount extracted from the BCG CSL strain transformed with pEP2. Figure 3 shows a combination of agarose gel and Southern blonot analysis of cellular DNA. moreover, The relative intensity of the gel bands indicates that the pEP plasmid is high in these bacteria. Copy number suggests replication. Furthermore, it was isolated from the industrially resistant transformant. When electroborating E. coli using the total genomic DNA obtained, approximately 1 .. 0x10' kanamycin-resistant clones were obtained per 1 μg of ON. Ta. - These data taken together indicate that the PEP2 replicon is present in these bacteria. This suggests that high copy numbers promote stable plasmid replication.

プラスミドpEP3は、M、スメグマチス及びM、ボビスBCG C3Lを少な くとも200μgのヒグロマイシン/−に対して耐性に形質転換することができ た(第1表)。ρEP3により形質転換されたM、スメグマチスから単離された 合計の細胞DNAは、E、コリを耐ヒグロマイシン性に形質転換することができ た。これは、ヒグロマイシン耐性をコードするPhp遺伝子がマイコバクテリア 及びE、コリの両者において効果的であり、そしてそれによって、それらの細菌 のための有用なマーカーを構成することを示す。Plasmid pEP3 contains a small amount of M. smegmatis and M. bovis BCG C3L. can be transformed to be resistant to at least 200 μg of hygromycin/−. (Table 1). M. smegmatis transformed with ρEP3 Total cellular DNA can transform E. coli to hygromycin resistance. Ta. This is because the Php gene encoding hygromycin resistance is mycobacterial. and E. coli, and thereby kill those bacteria. is shown to constitute a useful marker for.

第1表 マイコバクテリア及び関連する種のエレクトロポレーシゴンプラスミド エレク トロポレーション効率: Kan’ CFU/1μgのプラスミドDNA 細菌種 pEP2 pAL8 pEP3BCG var CSL 10” 10 ’ 10’N/D =Not done、 −−−=耐性表現型への形質転換は 存在しなかった。Table 1 Electroporated Plasmids for Mycobacteria and Related Species Troporation efficiency: Kan' CFU/1 μg of plasmid DNA Bacterial species pEP2 pAL8 pEP3BCG var CSL 10” 10 '10'N/D = Not done, --- = Transformation to resistant phenotype It didn't exist.

個々のエレクトロポレーションについての異なった数字は、別の実験の結果を示 す。Different numbers for individual electroporations indicate the results of separate experiments. vinegar.

EP2 びEP3による の 種のエレクトロポレーション:pEPレプリコン の宿主範囲を決定するために、pEP2及び3プラスミドDNAを、コリネバク テリウム ブソイドツベルキュロシス中にエレクトロポレートした。形質転換は 、C,ブソイドツへルキュロシスにおいて発生した(第1表)、これらの結果は 、pEP2プラスミドが広い宿主範囲を有することを示す。Electroporation of seeds by EP2 and EP3: pEP replicon pEP2 and 3 plasmid DNA was used to determine the host range of Corynebacterium spp. Electroporated into T. tuberculosis. Transformation is , which occurred in C. pseudotusherculosis (Table 1), these results , indicating that the pEP2 plasmid has a broad host range.

例3 EP26 の び : マイコバクテリアの65KDa熱ショックタンパク質(0,6Kb)からのプロ モーターを担持するPCR誘導DNAフラグメントを、pEP2のPstl−R am旧部位中にクローンし、pEP5として言及されるプラスミドを生成した。Example 3 EP26: Protein from mycobacterial 65KDa heat shock protein (0.6Kb) The PCR-derived DNA fragment carrying the motor was converted into Pstl-R of pEP2. am old site, generating a plasmid referred to as pEP5.

このプロモーターは、E、コリ及びマイコバクテリアにおいて機能することが知 られており、そして従って、シャトルヘラター発現システムにおいて有用である 。This promoter is known to function in E. coli and mycobacteria. and is therefore useful in shuttle herater expression systems. .

クロラムフェニコール−アセチルトランスフェラーゼ(CAT ) ヲコードす る遺伝子を、pEP5のBamH1部位中にクローンした。65KDaのプロモ ーターにより駆動されるCAT遺伝子の発現を、PhaIIlacia(登録商 標、Pharmacia、 Pitcataway、 N、J、、IJ、S、A 、) CAT検出検出キン用いて検出した。このアッセイによれば、64KDa のプロモーターは、E、コリ及びC,ブソイドツへル牛ユロシスの両者における 誘発されたIacプロモーターに相当する強さを有する。Chloramphenicol-acetyltransferase (CAT) code The gene was cloned into the BamH1 site of pEP5. 65KDa promo CAT gene expression driven by PhaIIlacia (registered trademark) Mark, Pharmacia, Pitcataway, N, J,, IJ, S, A ,) CAT detection was detected using the detection sensor. According to this assay, 64KDa The promoter of E. coli and C. It has a strength comparable to that of the induced Iac promoter.

?1PB70は、M、ボビスの主な分泌タンパク譬及びPPDの成分である。こ の遺伝子及びそのシグナル配列を、pEP2発現システム中に組込んだ。MPB 70遺伝子の切断形は、そのプロモーターを除去するが、しかしそのリポソーム 結合部位(RBS )を損なわないままに残すPCRにより生成された。これは 、pEP2中に、Ps t4−BaIll)!1フラグメント(0,5Kb)と してクローン化された。次に、65KDaプロモーターを、Pstl−5cal  フラグメント上のMP870 BSの上流にクローン化した。? 1PB70 is the main secreted protein of M. bovis and a component of PPD. child The gene and its signal sequence were integrated into the pEP2 expression system. MPB A truncated form of the 70 gene removes its promoter, but its liposomal Generated by PCR which leaves the binding site (RBS) intact. this is , in pEP2, Ps t4-BaIll)! 1 fragment (0.5Kb) was cloned. Next, the 65KDa promoter was transformed into Pstl-5cal was cloned upstream of the MP870 BS on the fragment.

E、コリ及びC,ブソイドツへルキュロシス中へのエレクトロポレーションの後 、発現をウェスターンプロット及びElisasにより試験した。この構成体は 、E、コリにおいて発現しなかった。しかし。After electroporation into E. coli and C. , expression was examined by Western plot and Elisa. This construct is , was not expressed in E. coli. but.

なから、それは、C,ブソイドツへルキュロシスにおいて発現し、そして生成物 は、音波処理物及び培養濾液の両者に検出された。これは、MPB7011Bs がE、コリにおいて不活性であり、そしてC,プソイドッへルキュロシスにおい て機能的であることを示す。Therefore, it is expressed in C. pseudotusherculosis and the product was detected in both the sonicated material and the culture filtrate. This is MPB7011Bs is inactive in E. coli and in C. pseudoherculosis. It shows that it is functional.

当業者は、本明細書に記載される発明が、特別に記載される発明以外の変更及び 修飾を受けることができることを理解している。本発明は、請求の範囲内でその ような変更及び修飾を包含することが理解されるべきである。本発明はまた、本 明細書に言及され又は示されるすべての段階、特徴、組成物及び化合物を個々に 又は集合的に、及び前記段階又は特徴のいづれがの組合せのすべてを包含する。Those skilled in the art will appreciate that the invention described herein is susceptible to modifications and variations other than those specifically described. I understand that I may receive qualifications. The present invention is within the scope of the claims. It is to be understood that such changes and modifications are included. The present invention also includes the book All steps, features, compositions and compounds mentioned or illustrated in the specification or collectively and encompassing all combinations of any of the aforementioned steps or features.

ABCDEF ABCDEFG 要約書 マイコ要約子リア、E、コリ及び他の細菌宿主において複製できるDNA シャ トルベクターが記載される。そのシャトルベクターは、多くの細菌種における複 製の能力を付与する複製の単一起点を含んで成る。また、所望するポリペプチド 、たとえば疾病を引き起こす細菌、ウィルス及び寄生体の抗原をコードするシャ トルベクターが開示される。ABCDEF ABCDEFG abstract DNA fragments that can replicate in Mycobacteria, E. coli, and other bacterial hosts. Torvector is described. The shuttle vector is a complex vector in many bacterial species. It comprises a single origin of replication that confers the ability to create products. Also, the desired polypeptide , for example, molecules encoding antigens of disease-causing bacteria, viruses, and parasites. A torque vector is disclosed.

国際調査報告international search report

Claims (21)

【特許請求の範囲】[Claims] 1.複製の単一起点、該複製の起点はマイコバクテリア及びE.コリ細胞におい てベクターの複製を可能にし;及び選択可能マーカーを含んで成る複製領域を担 持するDNAシャトルベクター。1. A single origin of replication, which originates from mycobacteria and E. coli cell odor to enable replication of the vector; and carry a replication region comprising a selectable marker. DNA shuttle vector with 2.前記複製の起点に操作的に結合される第1のヌクレオチド配列を含んで成り 、そして所望する第2のヌクレオチド配列の挿入のための1又は複数の制限エン ドヌクレアーゼ切断部位を含む請求の範囲第1項記載のシャトルベクター。2. a first nucleotide sequence operably linked to said origin of replication; , and one or more restriction enzymes for insertion of the desired second nucleotide sequence. The shuttle vector according to claim 1, comprising a donuclease cleavage site. 3.所望するポリペプチドをコードする核酸配列に操作的に結合した1又は複数 のプロモーターを含んで成る請求の範囲第1又は2項記載のシャトルベクター。3. one or more operably linked to a nucleic acid sequence encoding a desired polypeptide. The shuttle vector according to claim 1 or 2, comprising a promoter. 4.前記選択可能マーカーが、抗生物質又は酵素に対しての耐性を付与し、又は 適切な基質と共に供給される場合、検出可能な反応を引き起こすことができる免 疫学的に検出可能なタンパク質又は化学化合物をコードする請求の範囲第1項記 載のシャトルベクター。4. said selectable marker confers resistance to antibiotics or enzymes, or An immunosorbent that can cause a detectable reaction when supplied with an appropriate substrate. Claim 1 which encodes an epidemiologically detectable protein or chemical compound Shuttle vector. 5.前記選択可能マーカーが、アンピシリン、ストレプトマイシン、ペニシリン 、ヒグロマイシン又はカナマイシンに対する耐性を付与する請求の範囲第4項記 載のシャトルベクター。5. The selectable marker is ampicillin, streptomycin, penicillin. , hygromycin or kanamycin. Shuttle vector. 6.前記選択可能マーカーが、β−ガラクトシダーゼ、ウレアーゼ又はアルカリ ホスファターゼをコードする遺伝子である請求の範囲第4項記載のシャトルベク ター。6. The selectable marker is β-galactosidase, urease or alkali. The shuttle vector according to claim 4, which is a gene encoding phosphatase. Tar. 7.前記プロモーターが、バクテリオファージλのP1プロモーター、trpプ ロモーター、lacプロモーター、トランスポゾンTn903又はトランスポゾ ンTn5の耐カナマイシン性プロモーター、通常のマイコバクテリア65Kd抗 原のマイコバクテリアプロモーター、マイコバクテリアのリボソームRNAプロ モーター、M.ボビス抗原MPB70,MPB59及びMPB64のプロモータ ー、メタロチオニンプロモーター、成長ホルモンプロモーター又は真核及び原核 プロモーター間のハイブリッドから選択される請求の範囲第3項記載のシャトル ベクター。7. The promoter is P1 promoter of bacteriophage λ, trp promoter, promoter, lac promoter, transposon Tn903 or transposon Kanamycin resistance promoter of Tn5, common mycobacterial 65Kd anti-promoter The original mycobacterial promoter, mycobacterial ribosomal RNA promoter Motor, M. Promoter of bovis antigens MPB70, MPB59 and MPB64 -, metallotionine promoter, growth hormone promoter or eukaryotic and prokaryotic A shuttle according to claim 3 selected from hybrids between promoters. vector. 8.前記所望するペプチドが、疾病を引き起こす細菌、ウィルス又は寄生体から の1又は複数の抗原をコードする請求の範囲第3項記載のシャトルベクター。8. The desired peptide is isolated from disease-causing bacteria, viruses or parasites. 4. The shuttle vector of claim 3 encoding one or more antigens. 9.前記1又は複数の抗原が、タエニアボビス、ロタウイルス、バベシアボビス 、マイコバクテリウムボビス、マイコバクテリウムツベルキュロシス、マイコバ クテリウムレプラエ、マイコバクテリウムパラツベキュロシス、バクテリオデス ノドサス又はボルデテラの抗原から選択される請求の範囲第8項記載のシャトル ベクター。9. The one or more antigens are Taenia bovis, rotavirus, Babesia bovis. , Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium Cuterium leprae, Mycobacterium paratubeculosis, Bacteriodes The shuttle according to claim 8, which is selected from antigens of Nodosus or Bordetella. vector. 10.前記所望するポリペプチドがホルモン又はそのエピトープである請求の範 囲第3項記載のシャトルベクター。10. Claims wherein the desired polypeptide is a hormone or an epitope thereof. The shuttle vector according to paragraph 3. 11.前記複製の起点が、マイコバクテリア及びE.コリにおいて前記ベクター の複製を可能にするコリネバクテリウムプラスミドpNG2又はそのフラグメン トの複製領域を含んで成る請求の範囲第1項記載のシャトルベクター。11. The origin of replication is mycobacteria and E. In coli, the vector Corynebacterium plasmid pNG2 or a fragment thereof that allows the replication of The shuttle vector according to claim 1, comprising a replication region of . 12.アクチノマイセテスにおいて複製できる請求の範囲第1〜11のいづれか 1項記載のシャトルベクター。12. Any of claims 1 to 11 that can be reproduced in Actinomycetes The shuttle vector according to item 1. 13.コリネバクテリアにおいて複製できる請求の範囲第1〜11のいづれか1 項記載のシャトルベクター。13. Any one of claims 1 to 11 that can be replicated in corynebacteria. Shuttle vector as described in section. 14.pEP2及びpEP3から選択されたシャトルベクター。14. Shuttle vector selected from pEP2 and pEP3. 15.請求の範囲第1〜14のいづれか1項記載のシャトルベクターを含む細菌 宿主細胞。15. Bacteria comprising the shuttle vector according to any one of claims 1 to 14. host cell. 16.マイコバクテリア,E.コリ,コリネバクテリア及びアクチノマイセテス から選択される請求の範囲第15項記載の宿主細胞。16. Mycobacteria, E. Cori, Corynebacteria and Actinomycetes 16. The host cell of claim 15 selected from: 17.M.フレイ,M.スメグマチス,M.ボビスBCG,E.コリJM109 ,C.プソイドツベルキュロシスから選択される請求の範囲第15項記載の宿主 細胞。17. M. Frey, M. Smegmatis, M. Bovis BCG, E. Cori JM109 ,C. The host according to claim 15, which is selected from Pseudotuberculosis. cell. 18.コリネバクテリウムプラスミドpNG2又はそのフラグメントの複製の起 点をコードするDNA配列であって、前記プラスミド又はそのフラグメントが、 マイコバクテリア及びE.コリにおいて前記DNA配列を含むベクターの複製を 可能にすることを特徴とするDNA配列。18. Origin of replication of Corynebacterium plasmid pNG2 or a fragment thereof a DNA sequence encoding a point, the plasmid or fragment thereof comprising: Mycobacteria and E. The replication of the vector containing the above DNA sequence in coli A DNA sequence characterized in that it enables. 19.前記複製の起点に操作的に結合される複製の起点を含む請求の範囲第17 項記載のDNA配列。19. Claim 17 comprising an origin of replication operatively coupled to said origin of replication. DNA sequence described in section. 20.前記DNA配列が、プロモーターに操作的に結合される所望するポリペプ チドをコードする請求の範囲第18項記載のDNA配列。20. The DNA sequence is a desired polypeptide operably linked to a promoter. 19. The DNA sequence according to claim 18, which encodes tido. 21.宿主細胞により発現されるポリペプチドであって、前記ポリペプチドが、 前記宿主細胞内に内在する、請求の範囲第4,8及び9のいづれか1項記載のシ ャトルベクターによりコードされることを特徴とするポリペプチド。21. A polypeptide expressed by a host cell, said polypeptide comprising: The system according to any one of claims 4, 8 and 9, which is resident in the host cell. A polypeptide characterized in that it is encoded by a vector.
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