DE69425673T2 - Gerät und verfahren zur polymersynthese mit gerüsten - Google Patents
Gerät und verfahren zur polymersynthese mit gerüstenInfo
- Publication number
- DE69425673T2 DE69425673T2 DE69425673T DE69425673T DE69425673T2 DE 69425673 T2 DE69425673 T2 DE 69425673T2 DE 69425673 T DE69425673 T DE 69425673T DE 69425673 T DE69425673 T DE 69425673T DE 69425673 T2 DE69425673 T2 DE 69425673T2
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- polymer
- chamber
- opening
- synthesis
- solid support
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title claims abstract description 84
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims abstract description 79
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title claims abstract description 77
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 38
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 98
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 57
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims abstract description 50
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 36
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 20
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims description 9
- 238000010926 purge Methods 0.000 claims description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 7
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 claims description 6
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 claims description 5
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 claims description 5
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 claims 1
- 230000007723 transport mechanism Effects 0.000 abstract description 9
- 230000008021 deposition Effects 0.000 abstract description 2
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 41
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 39
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 239000005289 controlled pore glass Substances 0.000 description 20
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 238000003491 array Methods 0.000 description 10
- 239000011261 inert gas Substances 0.000 description 10
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N ammonia Natural products N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 9
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 9
- -1 polypropylene Polymers 0.000 description 8
- 239000003570 air Substances 0.000 description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 7
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 7
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 7
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 7
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 6
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 6
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 6
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 5
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 5
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 5
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 5
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 5
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 3
- 229920006362 Teflon® Polymers 0.000 description 3
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 3
- 238000000429 assembly Methods 0.000 description 3
- 230000000712 assembly Effects 0.000 description 3
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 238000000151 deposition Methods 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 3
- 238000011010 flushing procedure Methods 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 3
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 3
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 238000002966 oligonucleotide array Methods 0.000 description 3
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 3
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 3
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 3
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 3
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 2
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 238000006642 detritylation reaction Methods 0.000 description 2
- JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N dichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)Cl JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000003517 fume Substances 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 2
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 150000008039 phosphoramides Chemical class 0.000 description 2
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonium chloride Substances [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- 201000003883 Cystic fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 208000023105 Huntington disease Diseases 0.000 description 1
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-N Metaphosphoric acid Chemical compound OP(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- PPQRONHOSHZGFQ-LMVFSUKVSA-N aldehydo-D-ribose 5-phosphate Chemical group OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PPQRONHOSHZGFQ-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 239000012080 ambient air Substances 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 238000007630 basic procedure Methods 0.000 description 1
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000001818 capillary gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- 239000007810 chemical reaction solvent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- LXAARHUMDMWQIO-UHFFFAOYSA-N chloroform;dibromomethane Chemical compound BrCBr.ClC(Cl)Cl LXAARHUMDMWQIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012459 cleaning agent Substances 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 239000004035 construction material Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000009223 counseling Methods 0.000 description 1
- DMSZORWOGDLWGN-UHFFFAOYSA-N ctk1a3526 Chemical compound NP(N)(N)=O DMSZORWOGDLWGN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- QNNXNBDHNGJHNK-UHFFFAOYSA-N dibromomethane;dichloromethane Chemical compound ClCCl.BrCBr QNNXNBDHNGJHNK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005215 dichloroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229920001971 elastomer Polymers 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000003365 glass fiber Substances 0.000 description 1
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 238000012177 large-scale sequencing Methods 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000005499 meniscus Effects 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 239000002574 poison Substances 0.000 description 1
- 231100000614 poison Toxicity 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 238000007086 side reaction Methods 0.000 description 1
- 229920002379 silicone rubber Polymers 0.000 description 1
- 239000004945 silicone rubber Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- YAHHPOUXPBUKTL-DXKBKMAZSA-N thymidine dimer Chemical compound CC12C(C3N([C@H]4C[C@H](O)[C@@H](CO)O4)C(=O)NC(=O)C13C)N([C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1)C(=O)NC2=O YAHHPOUXPBUKTL-DXKBKMAZSA-N 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 229920000785 ultra high molecular weight polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/04—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers
- C07K1/045—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length on carriers using devices to improve synthesis, e.g. reactors, special vessels
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
- G01N35/10—Devices for transferring samples or any liquids to, in, or from, the analysis apparatus, e.g. suction devices, injection devices
- G01N35/1065—Multiple transfer devices
- G01N35/1072—Multiple transfer devices with provision for selective pipetting of individual channels
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00281—Individual reactor vessels
- B01J2219/00286—Reactor vessels with top and bottom openings
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
- B01J2219/00308—Reactor vessels in a multiple arrangement interchangeably mounted in racks or blocks
- B01J2219/0031—Reactor vessels in a multiple arrangement interchangeably mounted in racks or blocks the racks or blocks being mounted in stacked arrangements
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
- B01J2219/00313—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels being formed by arrays of wells in blocks
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
- B01J2219/00313—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels being formed by arrays of wells in blocks
- B01J2219/00315—Microtiter plates
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
- B01J2219/00324—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels or wells being arranged in plates moving in parallel to each other
- B01J2219/00328—Movement by linear translation
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00364—Pipettes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00364—Pipettes
- B01J2219/00367—Pipettes capillary
- B01J2219/00369—Pipettes capillary in multiple or parallel arrangements
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00414—Means for dispensing and evacuation of reagents using suction
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00414—Means for dispensing and evacuation of reagents using suction
- B01J2219/00416—Vacuum
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00418—Means for dispensing and evacuation of reagents using pressure
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00423—Means for dispensing and evacuation of reagents using filtration, e.g. through porous frits
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00452—Means for the recovery of reactants or products
- B01J2219/00454—Means for the recovery of reactants or products by chemical cleavage from the solid support
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00457—Dispensing or evacuation of the solid phase support
- B01J2219/00459—Beads
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/005—Beads
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00585—Parallel processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/0059—Sequential processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00596—Solid-phase processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00686—Automatic
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00686—Automatic
- B01J2219/00689—Automatic using computers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00695—Synthesis control routines, e.g. using computer programs
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00722—Nucleotides
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00725—Peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07B—GENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
- C07B2200/00—Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
- C07B2200/11—Compounds covalently bound to a solid support
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/06—Libraries containing nucleotides or polynucleotides, or derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
- C40B40/10—Libraries containing peptides or polypeptides, or derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B50/00—Methods of creating libraries, e.g. combinatorial synthesis
- C40B50/14—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B60/00—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries
- C40B60/14—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries for creating libraries
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Other Resins Obtained By Reactions Not Involving Carbon-To-Carbon Unsaturated Bonds (AREA)
- Polymerisation Methods In General (AREA)
- Polyesters Or Polycarbonates (AREA)
- Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
Description
- Die vorliegende Erfindung bezieht sich insgesamt auf eine Polymersynthesevorrichtung, und insbesondere auf eine Polymersynthesevorrichtung, welche Reihenanordnungen verwendet.
- In jüngster Zeit spielen Oligonucleotide eine zunehmende und entscheidendere Rolle in der diagnostischen Medizin, in der forensischen Medizin und in der Molekularbiologieforschung. Eine Hauptfunktion dieser Polymere ist insbesondere ihre Verwendung bei Genprobenuntersuchungen zur Feststellung spezifischer Nukleinsäuresequenzen.
- Genprobenuntersuchungen werden für viele Zwecke verwendet, zu denen die genetische Beratung, die Gewebeklassifizierung und die molekularbiologische Forschung gehören. Beispielsweise kann eine Person daraufhin untersucht werden, ob er oder sie das Gen für die Huntingtonsche Krankheit oder zystische Fibrose trägt. Eine andere Art der Verwendung der Genprobenanalysen umfaßt die Bestimmung der Verträglichkeit vor einer Gewebetransplantation und des Zusammenpassens von Gewebe- oder Blutproben in der Gerichtsmedizin. In der molekularbiologischen Forschung werden diese Untersuchungen schließlich extensiv zur Erforschung von Homologien zwischen Genen unterschiedlicher Arten und zum Klonen von Genen eingesetzt, für die nur eine partielle Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenz bekannt ist, beispielsweise bei der Polymerase-Kettenreaktion (pcr).
- Bei dieser Art von Untersuchungen wird für gewöhnlich auf das Vorhandensein einer speziellen Nukleinsäuresequenz, üblicher weise einer DNS-Sequenz geprüft, obwohl RNS-Sequenzen ebenfalls verwendet werden können. Dies wird, wie auf diesem Gebiet bekannt ist, durch Verwendung von Oligonucleotiden erreicht, die so synthetisiert werden, daß sie spezifische vorgegebene Sequenzen haben. Die Sequenz einer Oligonucleotidprobe kann auf bekannten Aminosäurensequenzen, die als DNS-Sequenzen bekannt sind, oder auf einer "Schätzungs"-Probe beruhen, die auf einer Homologie für bekannte oder vermutete DNS- oder Aminosäuresequenzen basiert. Da DNS ein "degenerierter" Code ist und mehrere DNS-Sequenzen eine einzige Aminosäuresequenz ergeben, verwenden Genprobenanalysen basierend auf einer Aminosäurefrequenz häufig Pools von verwandten Oligonucleotiden, von denen jedes eine unterschiedliche spezifische Nucleotidsequenz hat. Es ist deshalb häufig erforderlich, eine große Anzahl von verwandten, jedoch verschiedenen Oligonucleotiden zu erzeugen, um ein einziges Gen zu klonen.
- Zusätzlich zu der tatsächlichen Sequenz gibt es eine Anzahl von Parametern, die bei der Synthese von Oligonucleotiden geändert werden können. Es ist auch häufig erforderlich, dieses Polymere in einer Vielfalt von Längen zu synthetisieren, da im allgemeinen die Genprobenanalyse um so spezifischer ist, je länger die Oligonucleotidprobe ist, wobei bei jeder besonderen Anwendung eine Spezifizierung erwünscht oder unerwünscht sein kann. Oligonucleotide können aus Desoxyribonucleotiden oder Ribonucleotiden oder Mischungen davon hergestellt werden. Alternativ möchte man auch Oligonucleotide mit modifizierten oder Nicht-Standard-Basen oder eingeschlossenen nichtradioaktiven Markierungen haben. Für bestimmte Anwendungszwecke können in gleicher Weise Oligonucleotide mit geänderten Ribose-Phosphat-Rückgraten erzeugt werden.
- Neben der Genprobenanalyse gibt es noch einige andere Verwendungen von Oligonucleotiden. Beispielsweise kann die Ausbildung eines Einzelstrang-Oligonucleotids mit einer speziellen Sequenz bei der Bildung von extrem stabilen Triplex-DNS-Strukturen verwendet werden. Zu weiteren Anwendungen gehören der direkte Aufbau von synthetischen Genen und Plasmidvektoren durch Anbinden oder Verbinden von 5'-Phosphat-Oligonucleotid- Bausteinen.
- Durch die Zunahme der Verwendung von synthetischen Oligonucleotiden hat sich der Bedarf entsprechend gesteigert. Dies wiederum steigert die Entwicklung von neuen Synthesevorrichtungen und von Methodologien für Basisverfahren nach Oligonucleotiden mit individuell definierter Sequenz. Diese Vorrichtungen und Verfahren sind jedoch im allgemeinen sehr aufwendig in der Anwendung und für eine Massenproduktion nicht leicht verfügbar. Bei der gegenwärtigen Generation von automatisierten DNS-Sequenzsynthetisierern wird gewöhnlich ein derivatisierter massiver Träger, beispielsweise kontrolliertes Porenglas (CPG), in eine individuelle Reaktionskammer einer Säule eingebracht, um an ihr für das Einleiten der Feststoffphasensynthese einen stabilen Anker zu haben. Unter Verwendung einer Reihe von komplexen Ventilanordnungen und Pumpen, die mit der Säule gekoppelt sind, werden in einer vorgegebenen Weise die geeigneten ausgewählten Reagenzien nacheinander durch die Kammer filtriert. Ein Kontakt des Reagenz mit den Polymereinheiten, die vorher an dem CPG befestigt wurden, welches in der Kammer durch eine poröse Fritte als Probenträger gehalten und abgestützt wird, verursacht eine Reaktion, die an ihm zu einem aufgereihten Wachstum führt.
- Obwohl jede Säule dieser Anordnung eine schnelle Massenproduktion einer homogenen Population von sequenzdefinierten Oligonucleotiden zuläßt, bieten die vorhandenen Anordnungen nur vier Säulenfähigkeiten. Eine erhöhte Säulenkapazität ist aufgrund der physikalischen Grenzen der Ventilausgestaltung eingeschränkt. Deshalb können nur vier unabhängige Synthesezyklen gleichzeitig ausgeführt werden. Da außerdem die Synthesevorrichtungen im allgemeinen einer integrierten Automation mit anderen robotischen Laborgerätschaften nicht zugänglich sind, muß eine Bedienungsperson eingreifen, um jede einzelne Synthesesäule von Hand zu füllen und zu leeren. Eine solche Handha bung erhöht die menschliche Fehlerquote.
- Eine bedeutendere Begrenzung besteht darin, daß alle Reagenzien durch einen gemeinsamen Hauptkanal durchgeschleust werden. Deshalb kann nur ein Reagenz oder eine Kombination davon gleichzeitig in ausgewählten Säulen abgeschieden werden. Beispielsweise kann in der Säule eins das Reagenz "Tetrazol" nicht abgeschieden werden, während ein spezielles Amidit-Reagenz gleichzeitig in Säule vier abgeschieden wird. Außerdem muß für jede gesonderte Synthese oder Reaktion der gemeinsame Hauptkanal und die zugehörige Ventilanordnung mit einem Reinigungsmittel so gespült werden, daß restliche Amidit- oder Entblockungsreagenzien nicht in unerwünschter Weise in einer Säule abgeschieden werden. Dieser Lösungsweg verschwendet Zeit und erhöht die Kosten der Bedienungsperson.
- Bekannt ist auch die Reihensynthese von gebundenen Oligonucleotiden oder Peptiden. Bei einem Lösungsweg für eine parallele Synthese, die als Teebeutelverfahren oder als Scheibenkonstruktion bekannt ist, wird eine Reihenanordnung von einzelnen Paketen oder Scheiben von Feststoffträgerperlen physikalisch in vier Amidit-Untermengen für eine Behandlung mit dem ausgewählten Amidit sortiert. Nachdem jedes Paket von Perlen mit dem gemeinsamen Reagenz behandelt worden ist, müssen die Pakete erneut von Hand in vier Untermengen für den darauffolgenden Synthesezyklus sortiert werden. Jedes Sortieren und Neusortieren ist für die Herstellung von großen Reihen von Oligonucleotiden zu mühsam und arbeitsintensiv.
- Ein weiterer Lösungsweg unter Verwendung von Reihenanordnungen ist das Stifteintauchverfahren für eine parallele Oligonucleotidsynthese (Geysen, J. Org. Chem. 56, 6659 (1991)). Bei diesem Verfahren werden kleine Mengen des Feststoffträgers zu Reihen von magnetgesteuerten Polypropylenstiften geschmolzen, die danach in Schalen der geeigneten Reagenzien eingetaucht werden. Die Dichte der Anordnungen ist jedoch begrenzt, und das verwendete Tauchverfahren erweist sich in der Praxis als beschwerlich.
- Auf der Southern, Genome Mapping Sequence Conference, May 1991 in Cold Spring Harbour, N. Y., wurde ein weiteres Schema für eine Oligonucleotid-Reihensynthese offenbart, bei welchem ausgewählte Bereiche auf einer Glasplatte physikalisch maskiert und die gewünschte chemische Reaktion in dem nicht-maskierten Abschnitt der Platte ausgeführt wird. Das Problem bei diesem Verfahren besteht darin, daß nach jeder Interaktion die alte Maske entfernt und eine neue aufgebracht werden muß. Fodor et al., Science 251, 767 (1991), beschreiben ein anderes Verfahren zum Synthetisieren sehr dichter 50-um-Reihenanordnungen von Peptiden (und potentiell Oligonucleotiden) unter Verwendung einer maskenausgerichteten photochemischen Schutzgruppenentfernung und von synthetischen Zwischenprodukten. Dieses Verfahren ist durch die geringe Geschwindigkeit der photochemischen Schutzgruppenentfernung und durch die Empfindlichkeit gegenüber Nebenreaktionen (beispielsweise Thymidin-Dimer-Bildung) bei der Oligonucleotidsynthese beschränkt. Khrapko et al. schlagen in FEBS Letters 256, 118 (1989) eine vereinfachte Synthese und Immobolisierung von Mehrfach-Oligonucleotiden durch direkte Synthese auf einem zweidimensionalen Träger vor, wobei eine druckerartige Vorrichtung verwendet wird, die zu einer Probenahme von jedem der vier Nucleotiden in vorgegebenen Punkten auf der Matrix fähig ist. Es werden jedoch keine Einzelheiten angegeben, wie eine solche Vorrichtung hergestellt oder verwendet werden soll.
- Zusammenfassend zeigt sich, daß der verwandte Stand der Technik zahlreiche Ideen und Informationen bezüglich der Synthese von Reihen von Oligonucleotiden oder Peptiden für die Bestimmung von Nucleotidsequenzen oder der Aminosäuresequenzen spezifischer, sich bindender Peptide enthält. Die vorhandenen oder vorgeschlagenen Verfahren sind jedoch beschränkt und lassen eine zweckmäßige und zuverlässige Massenproduktion sehr großer Reihen nicht zu, die für eine wirksame Sequenzierung in großem Maßstab erforderlich sind.
- WO-A-90/02605 bezieht sich auf eine Vorrichtung und ein Verfahren für eine parallele Festphasensynthese einer Vielzahl von Peptiden auf einem Präparativmaßstab (d. h. Milligramm oder mehr).
- US-A-5,106,583 bezieht sich auf eine Vorrichtung zum Analysieren unbekannter isolierter Proteine durch Aufbrechen der Bindungen zwischen Aminosäuren durch Hydrolyse.
- Es ist deshalb ein Ziel der vorliegenden Erfindung, eine Polymersynthesevorrichtung und ein Verfahren zum Aufbau von Polymerketten mit definierter Sequenz bereitzustellen.
- Ein weiteres Ziel der vorliegenden Erfindung besteht in der Bereitstellung einer Polymersynthesevorrichtung und eines Verfahrens zur Herstellung von Reihen von Oligonucleotiden oder Peptiden in großer Menge auf eine reproduzierbare und schnelle Weise.
- Ein weiteres Ziel der vorliegenden Erfindung besteht darin, eine Polymersynthesevorrichtung und ein Verfahren bereitzustellen, welches den Reagenzabfall während der Herstellung der Reihen von Oligonucleotiden in großer Menge verringert.
- Ein weiteres Ziel der vorliegenden Erfindung besteht in der Bereitstellung einer Polymersynthesevorrichtung und eines Verfahrens zur Herstellung von Reihen von Oligonucleotiden einer großen Menge bei reduzierten Kosten.
- Ein weiteres Ziel der vorliegenden Erfindung besteht darin, eine Polymer-Reihen-Synthesevorrichtung und ein Verfahren bereitzustellen, das dauerhaft ist, kompakt ist, leicht aufrechtzuerhalten ist, eine minimale Anzahl von Komponenten hat, von ungeschultem Personal leicht eingesetzt werden kann und wirtschaftlich in der Herstellung ist.
- In Übereinstimmung mit den vorliegenden Zielen stellt die vor liegende Erfindung eine Polymersynthesevorrichtung zum Aufbau einer Polymerkette durch sequentielle Zugabe von Polymereinheiten zu einem festen Träger in einem flüssigen Reagenz
- - mit einer Basisanordnung, die einen Reaktionsbehälter und wenigstens eine Öffnung aufweist, die sich in den Behälter erstreckt,
- - mit wenigstens einem in dem Behälter angeordneten festen Träger zum Wachsen und Immobilisieren einer Polymerkette auf ihm,
- - mit einer Reagenzlösung in dem Behälter in Kontakt mit dem festen Träger und mit wenigstens einer Polymereinheit der Polymerkette, die an dem festen Träger festgelegt ist,
- - mit einer Rückhalteeinrichtung, die in dem Behälter angeordnet und so ausgebildet und bemessen ist, daß sie den Durchgang des festen Trägers durch die Öffnung im wesentlichen unterbindet,
- - wobei die Öffnung einen Einlaß in den Behälter und einen Auslaß sowie eine solche Größe und Abmessung hat, daß eine Kapillar-Flüssigkeitsdichtung gebildet wird, um die Reagenzlösung in dem Behälter zur Ermöglichung des Polymerkettenwachstums darin zurückzuhalten, wenn eine Druckdifferenz zwischen einem ersten auf den ersten Reaktionsbehälter ausgeübten Gasdruck und einem zweiten auf den Öffnungsauslaß ausgeübten Gasdruck geringer ist als eine vorgegebene Größe,
- - mit einer Druckreguliereinrichtung zum Regulieren der Druckdifferenz derart, daß, wenn die Druckdifferenz die vorgegebene Größe überschreitet, die Reagenzlösung aus dem Behälter durch die Öffnung ausgetrieben wird, und
- - mit einem oberen Kammermechanismus bereit, der mit einer Oberseite der Basisanordnung so zusammenwirkt, daß eine obere, den Reaktionsbehälter darin einschließende Kammer gebildet wird, wobei die Reguliereinrichtung mit der oberen Kammer zum Regulieren der Druckdifferenz in Verbindung steht.
- Die Synthesevorrichtung kann weiterhin einen Einlaß in die gemeinsame Kammer, der stromauf von den Anschlüssen angeordnet ist, sowie einen Auslaß aus der gemeinsamen Kammer aufweisen, der stromab von den Auslässen angeordnet ist. Mit dem Einlaß ist eine Druckgasquelle für einen kontinuierlichen Gasstrom durch die gemeinsame Kammer von der Kammeraufstromseite zur Kammerabstromseite und aus dem Auslaß heraus gekoppelt, um aus der gemeinsamen Kammer giftige Dämpfe zu spülen, die von den Reagenzien emittiert werden, sowie Luft und Feuchte an einem Einsickern zu hindern.
- Die vorliegende Erfindung stellt auch ein Syntheseverfahren zum Aufbau einer Polymerkette durch sequentielle Zugabe von Polymereinheiten zu wenigstens einem festen Träger zum Wachsen und Immobilisieren einer Polymerkette darauf in einem flüssigen Reagenz bereit, bei welchem
- A) ein flüssiges Reagenz in einen Reaktionsbehälter in Kontakt mit einem festen Träger und wenigstens eine Polymereinheit der Polymerkette eingebracht wird, die an dem festen Träger festgelegt ist, wobei der Behälter wenigstens eine sich in ihn erstreckende Öffnung und eine solche Größe und Abmessung hat, daß eine Kapillar-Flüssigkeitsdichtung gebildet wird, um die Reagenzlösung in dem Behälter zur Ermöglichung des Wachstums der Polymerkette auf dem festen Träger zurückzuhalten,
- B) ein erster Gasdruck an den Reaktionsbehälter derart angelegt wird, daß eine Druckdifferenz zwischen dem ersten Gasdruck und einem zweiten, an einem Auslaß der Öffnung ausgeübten Gasdruck eine vorgegebene Größe überschreitet, die erforderlich ist, um die Kapillar-Flüssigkeitsdichtung aufzuheben und die Reagenzlösung aus dem Behälter durch die Öffnung auszutreiben, und
- C) giftige, von der Reagenzlösung emittierte Dämpfe aus einer gemeinsamen, den Reaktionsbehälter einschließenden Kammer durch Führen eines Gases von einer Druckgasquelle, die mit einem Einlaß in die Kammer verbunden und stromauf von dem Reaktionsbehälter angeordnet ist, und aus der Kammer durch einen Auslaß heraus, der von der gemeinsamen Kammer weggeht und stromab von dem Reaktionsbehälter angeordnet ist, ausgespült werden.
- Die Anordnung der vorliegenden Erfindung hat weitere vorteilhafte Ziele und Merkmale, die aus der folgenden Beschreibung der besten Ausführung der Erfindung und den beiliegenden Ansprüchen unter Bezugnahme auf die beiliegende Zeichnung deutlicher werden, in denen
- Fig. 1 eine auseinandergezogene perspektivische Draufsicht auf die Polymersynthese-Reihenvorrichtung ist, die erfindungsgemäß aufgebaut ist,
- Fig. 2 eine perspektivische Unteransicht einer Kopfanordnung der Polymersynthese-Reihenvorrichtung von Fig. 1 ist, welche die ausgesparten Anschlußenden zeigt,
- Fig. 3 eine Seitenschnittansicht der Polymersynthese-Reihenvorrichtung von Fig. 1 ist, die die Spülwirkung des Inertgasstroms durch die gemeinsame Kammer zeigt,
- Fig. 4 eine Stirnschnittansicht der Polymersynthese-Reihenvorrichtung von Fig. 1 ist, die eine schwenkbar an einer Rahmenanordnung angebrachte Kopfanordnung zeigt,
- Fig. 5 eine vergrößerte Seitenschnittansicht der Polymersynthese-Reihenvorrichtung im wesentlichen längs der Linie 5-5 von Fig. 3 ist, die die Kapillar-Flüssigkeitsdichtung zeigt, die zwischen der flüssigen Reagenzlösung und der entsprechenden Fritte und Öffnung ausgebildet ist,
- Fig. 6 eine vergrößerte Seitenschnittansicht der Polymersynthese-Reihenanordnung im wesentlichen längs der Linie 6-6 von Fig. 3 ist, die die Ballondichtung zeigt,
- Fig. 7 eine vergrößerte, schematische perspektivische Drauf sicht auf eine an der Kopfanordnung der Polymersynthese-Reihenvorrichtung angebrachten Zuführanordnung ist, und
- Fig. 8A und 8B die Ergebnisse der Versuche der Oligonucleotide Nr. 14 bzw. Nr. 15 von Beispiel 1 wiedergeben.
- Die vorliegende Erfindung wird unter Bezugnahme auf wenige spezifische Ausgestaltungen beschrieben, wobei die Beschreibung der Erfindung nur veranschaulichend und nicht als Begrenzung der Erfindung ausgelegt werden soll. Es können verschiedene Modifizierungen bezüglich der vorliegenden Erfindung an den bevorzugten Ausführungsformen vom Fachmann ausgeführt werden, ohne die eigentliche Idee und den Rahmen der Erfindung, wie er durch die beiliegenden Ansprüche definiert ist, zu verlassen. Anzumerken ist, daß zum besseren Verständnis gleiche Bauteile mit gleichen Bezugszeichen in den verschiedenen Figuren bezeichnet sind.
- In Fig. 1 und 2 ist eine Polymersynthesevorrichtung, die insgesamt mit 20 bezeichnet ist, zum Aufbau der Polymerkette durch sequentielle Zugabe von Polymereinheiten zu einem festen Träger in einem flüssigen Reagenz gezeigt. Obwohl die Vorrichtung 20 insbesondere zum Aufbau von sequenzdefinierten Oligonucleotiden geeignet ist, kann die vorliegende Erfindung auch für die Synthese irgendeiner Polymerkette verwendet werden. Der Ausdruck "Polymereinheit" soll deshalb als eine Komponente definiert werden, die an andere Komponenten der gleichen oder von unterschiedlicher Art zur Bildung einer Polymerkette, wie Oligonucleotiden und Peptidketten, definiert werden.
- Bei einer Ausführungsform hat die in Kurzform bezeichnete Synthesevorrichtung 20 eine Kopfanordnung, die insbesondere mit 21 bezeichnet ist, und eine Vielzahl von Anschlüssen 22 (Fig. 2), die daran insgesamt in einer Abstandsbeziehung angebracht sind. Jeder Anschluß 22 ist mit einem Speicher 23 (Fig. 7) für flüssiges Reagenz 24 für eine regulierte Zuführung durch sie hindurch verbunden. Weiterhin gehören eine insgesamt mit 25 bezeichnete Basisanordnung, die wenigstens einen Reaktionsbehälter 26 aufweist, und ein insgesamt mit 27 (Fig. 3) bezeichneter Transportmechanismus dazu, der mit wenigstens einer Kopfanordnung 21 und Basisanordnung 25 zur Erzeugung einer Relativbewegung dazwischen verbunden ist. Dadurch sind ein ausgewählter Reaktionsbehälter 26 und ein ausgewählter Anschluß 22 in fluchtender Ausrichtung für das Einbringen eines ausgewählten Reagenz 24 in den Reaktionsbehälter für die Synthese einer Polymerkette positioniert. Zwischen der Kopfanordnung und der Basisanordnung ist zur Bildung einer gemeinsamen Kammer 31 (Fig. 3), welche sowohl den Reaktionsbehälter als auch die Anschlüsse darin einschließt, eine insgesamt mit 30 bezeichnete Gleitdichtung angeordnet.
- Bei der bevorzugten Ausführungsform wird eine Reihe von Behältern 26 (Fig. 1) vorgesehen, die in einer Mikrotiter-Platte 32 ausgebildet sind, die von einer Gleitplatte 33 der Basisanordnung 25 getragen wird. Die Synthesevorrichtung ist insbesondere so gestaltet, daß sie eine Mikrotiter-Platte mit 96 Behältern verwendet (zur Vereinfachung der Darstellung sind nicht alle Behälter gezeigt), die in 12 gleich beabstandeten Reihen 34, von denen sich jede quer zu einer Längsachse 35 der langgestreckten Basisanordnung 25 erstreckt, mit 8 gleich beabstandeten Spalten 36 in der Breite ausgerichtet sind. Die Mikrotiter-Platte 32 wird vorzugsweise aus einem chemisch inerten Material, wie Polypropylen, hergestellt. Natürlich kann jede beliebige Anzahl von Behältern oder Anordnung von Reihen und Spalten verwendet werden, ohne von der Idee und Art der vorliegenden Erfindung abzuweichen.
- Fig. 1 und 2 zeigen weiterhin, daß die Anschlüsse 22, die in Montageblöcken 37 der Kopfanordnung 21 angebracht sind, weiterhin zu einer Anordnung von Anschlußreihen 40 und -spalten 41 ähnlich der Anordnung der Behälter 26 ausgerichtet sind. Bei der bevorzugten Ausführung entspricht die Anzahl der An schlußspalten 41, von denen sich jede parallel zu einer Längsachse 42 der Kopfanordnung 21 erstreckt, der Anzahl der Behälterspalten 36. Dadurch entspricht jeder Anschluß 22 in einer speziellen Bank oder Reihe 40 von Anschlüssen einer entsprechenden Spalte 36 von Behältern 26 und ist dazu ausgerichtet. Die Anschlüsse in irgendeiner Reihe 40 und Spalte 41 sind im gleichen Abstand voneinander angeordnet, wie er zwischen den Behälterreihen 34 und -spalten 36 vorhanden ist, was eine gleichzeitige Ausrichtung zwischen einen oder mehreren Behälterreihen 34 mit ausgewählten Anschlußreihen 40 während eines einzigen Zyklus ermöglicht. Das bedeutet, daß die Anordnung von Behältern zur Anordnung der Anschlüsse längs einer Vielzahl von Positionen für das gleichzeitige Abscheiden ausgerichtet werden kann.
- Diese Anordnungstechnik für eine sequenzdefinierte Oligonucleotidsynthese wurde zuerst aus der hochdichten Oligonucleotidreihen-Chipanordnung für eine Hybridisierungssequenzbildung entwickelt, die in dem US-Patent 5474796, angemeldet am 4. September 1991, offenbart ist. Deshalb wird diese Aufreihungstechnik für sich nicht als neues Merkmal der vorliegenden Erfindung beansprucht. Diese Anordnung ist jedoch weder geeignet noch passend für Produktionsfähigkeiten im großen Maßstab nach der vorliegenden Erfindung, was nachstehend beschrieben wird.
- Um die Organisation und Herstellung von Polymerketten zu vereinfachen, verbindet eine Zulieferanordnung 43 (Fig. 7) der Synthesevorrichtung zur Steuerung der Zufuhr der flüssigen Reagenzien durch die Anordnung von Anschlüssen alle Anschlüsse 22 in einer speziellen Bank oder Reihe 40 mit einem gemeinsamen, unabhängigen flüssigen Reagenzspeicher 23 miteinander, während jede Bank oder Reihe 40 von Anschlüssen mit einem verschiedenen flüssigen Reagenz verbunden ist, das bei einer speziellen Polymersynthese zugeführt wird. Beispielsweise kann die erste Reihe 40 von Anschlüssen 22 nur den Aktivator Tetrazol abgeben, während die zweite Reihe von Anschlüssen das Ami dit-Thymidin spendet. Bei der Oligonucleotidsynthese kann sich diese Reihenfolge der Verteilung der flüssigen Reagenzien nach unten für Amidit-Adenosin, Cytosin und Guanin, die zusätzliche Basis AnyN, das Waschlösungsmittel/Reaktionslösungsmittel Acetonitril, die Kappe Essigsäureanhydrid, die Kappe N-Methylimidazol, Jod und die Entblocker Dichloressigsäure oder Trichloressigsäure fortsetzen, alles Reagenzien, die für die Synthese von Oligonucleotiden mit definierter Sequenz verwendet werden. Zur Vereinfachung der Darstellung sind nur fünf Reihen von Anschlüssen gezeigt. Selbstverständlich kann der in der Anordnung vorhandene Anschluß mit irgendeinem Reagenzspeicher in Verbindung gebracht werden.
- Die Zuführanordnung 43 der vorliegenden Erfindung setzt jede Bank von Anschlüssen mit einem gemeinsamen Reagenzspeicher 23 über unabhängige Abgaberohre 44 in Verbindung. Jedes Rohr hat einen Durchgang 45 (Fig. 6) und ist mit einem Ende mit dem jeweiligen Anschluß verbunden und endet mit seinem gegenüberliegenden Ende in dem flüssigen Reagenz 24, das in dem Speicher enthalten ist. Diese Rohre sitzen im Preßsitz in Öffnungen 46, die sich durch Montageblöcke 37 und eine Kopfplatte 47 der Kopfanordnung 21 erstrecken. Die flexible und halbelastische Beschaffenheit eines jeden Rohrs 44, vorzugsweise TEFLON®, was durch Kontakt mit den Reagenzien gegen einen Qualitätsverlust widerstandsfähiger ist, gibt eine ausreichende Abdichtung zwischen der Rohraußenseite und der jeweiligen Öffnung.
- Das distale Ende eines jeden Rohres 44 bildet, wie in Fig. 2 und 6 gezeigt ist, einen Anschluß 22, der sich in quer angeordnete Schlitze 50, jedoch nicht darüber hinaus, erstreckt, die in einer Bodenfläche 51 der Kopfplatte 47 ausgebildet sind. Jeder unabhängige Anschluß 22 ist dementsprechend so ausgespart, daß er die Oberseite 52 einer Basisgleitplatte 33 während der relativen Gleitbewegung dazwischen nicht beeinträchtigt. Das unabhängige Erstrecken jedes Anschlusses in Schlitze 50 begünstigt ferner das Entfernen oder Entsorgen von restlichem flüssigen Reagenz, das sich am Ende des Anschlusses nach der Zuführung von Reagenz aus ihm angesammelt hat.
- Es gibt zwei wesentliche Belange bei der Zuführung von flüssigem Reagenz durch die Anschlüsse 22, nämlich 1) wie wird ein Tröpfchen sauber so ausgeworfen, daß kein Tropfen am Ende des Anschlusses hängenbleibt, und 2) wie vermeidet man, daß der Inhalt der Reaktionskammer spritzt, wenn der Reagenzstrom in den Behälter zugeführt wird. Die Auswurfgeschwindigkeit des Reagenz aus dem Anschluß muß ausreichen, um ein Vermischen zwischen dem ersten und zweiten zugeführten Reagenz in der Reaktionskammer auszulösen. Sehr kleine Tröpfchen können sauber mit hohen Auswurfgeschwindigkeiten ausgeworfen werden, haben jedoch keine ausreichende kinetische Energie, um die Oberflächenspannung der bereits in dem Behälter befindlichen Flüssigkeit zur Herbeiführung eines Mischens zu überwinden. Im Gegensatz dazu können größere Tröpfchen ebenfalls sauber mit hohen Auswurfgeschwindigkeiten ausgeworfen werden, neigen jedoch zu einem Verspritzen des Inhalts auf die benachbarten Behälter. Bei niedrigeren Auswurfgeschwindigkeiten neigen die Reagenzien dazu, den letzten Tropfen an dem Anschlußende hängenzulassen, was auch eine Funktion der Querschnittsfläche des Endes ist. Darüber hinaus ändert sich der Flüssigkeitsdurchsatz durch kleine Kapillarrohre direkt mit dem Zuführdruck und umgekehrt zur Rohrlänge und umgekehrt zum Durchmesser. Alle diese Variablen müssen, wenn der Zuführdruck und die Anschlußausgestaltungen konzipiert werden, ebenso wie die Baumaterialien berücksichtigt werden, damit die Reagenzien sauber herausgedrückt werden können, ohne daß ein Resttropfen von flüssigem Reagenz an dem Anschlußende hängenbleibt. Abhängig von dem flüssigen Reagenz kann es deshalb günstiger sein, es in einem kontinuierlichen Strom, als Reihe von Pulsen oder in Tröpfchenform abzugeben.
- Jeder Reagenzspeicher 23 hat, wie in Fig. 7 gezeigt ist, ein Druckrohr 53, das mit einer Kompressorvorrichtung (nicht gezeigt) verbunden ist, die den Speicherluftraum 54 mit Druck beaufschlagt, um das gespeicherte flüssige Reagenz aus dem Speicher heraus und durch die entsprechenden Abgaberohre 44 zu treiben. Die Zuführung von Reagenzien durch die Abführrohre 44 wird durch eine Anordnung von unabhängigen Ventilanordnungen 55 gesteuert, von denen jede in Reihe dazu angeordnet ist. Diese Ventilanordnungen werden vorzugsweise von magnetgetriebenen Mikroabsperrventilen gebildet, von denen jedes weniger als 5 ms für eine Zuführung von genauen Volumina an flüssigem Reagenz öffnen und schließen kann.
- Um einen konstanten Zuführdruck über jedem Abgaberohr 44 und somit einen konstanten Zuführmengenstrom an flüssigem Reagenz durch einen Anschluß in einer Bank oder Reihe 40 von Anschlüssen 22 sicherzustellen, endet jedes Abgaberohr unabhängig in dem in dem Reagenzspeicher enthaltenen flüssigen Reagenz. Somit ergibt sich bei dieser Ausgestaltung unabhängig von der für die Zuführung eingesetzten Anzahl von Anschlüssen eine Zuführung mit ungleichförmigem Durchsatz, der durch sich ändernden Leitungsdruck verursacht würde.
- Gemäß der vorliegenden Erfindung wirken die Basisanordnung 25 und die Kopfanordnung 21 mit einem Transportmechanismus 27 für einen Relativbewegung zwischen der Basisanordnung und der Kopfanordnung zusammen, um die Reihenanordnung von Behältern mit der Reihenanordnung von Anschlüssen in einer Vielzahl von Positionen fluchtend auszurichten. Vorzugsweise bewegt der Transportmechanismus die Basisanordnung (strichpunktierte Linien in Fig. 3) längs ihrer Längsachse 35 derart, daß die Behälter jeder Reihe 34 fluchtend zu den Anschlußspalten 41 ausgerichtet bleiben. Die Basisanordnung 25 wird dafür durch eine Rahmenanordnung 57 (Fig. 3 und 4) für eine Hin- und Herbewegung in Richtung der Pfeile 60 gleitend getragen. Die Gleitplatte 33, welche die Mikrotiterplatte 32 trägt, ist gleitend verschiebbar in einem Schienenmechanismus 61 der Rahmenanordnung 57 für eine fluchtend ausgerichtete Bewegung aufgenommen. Durch Steuern der Zuführung von Reagenz durch ausgewählte Anschlüsse (über Ventilanordnungen 55) und durch Handhabung des Transportmechanismus kann somit eine Vielzahl von homogenen Populationen von Polymeren mit definierter Sequenz in ausgewählten Behältern auf schnelle und reproduzierbare Weise gleichzeitig synthetisiert werden.
- Der Transportmechanismus 27 hat eine Schrittmotoranordnung 62, die schematisch in Fig. 3 dargestellt und funktionsmäßig mit der Gleitplatte 33 gekoppelt ist. Die Basisanordnung 25 wirkt so mit dem Schienenmechanismus 61 und dem Schrittmotor für eine lineare schrittweise Bewegung zusammen, um die Reihenanordnung von Behältern zu der Reihenanordnung von Anschlüssen in einer Vielzahl von Positionen fluchtend auszurichten. Natürlich kann der Transportmechanismus auch von irgendeiner Motor-/Schienenausgestaltung gebildet werden, welche die Basisanordnung bezüglich der Kopfanordnung bewegt.
- Bevor eine Polymersynthese beginnt oder nachdem der Syntheseprozeß beendet worden ist, kann die Anordnung von Behältern außerhalb einer gemeinsamen Kammer 31 positioniert und der offenen Umgebung für den Zugang ausgesetzt werden, indem die Behälter 26 (über eine Bewegung der Basisanordnung 25) ganz nach rechts oder ganz nach links von der Gleitdichtung 30 bewegt werden. Dadurch kann die Behälteranordnung gereinigt oder mit Feststoffträgermaterial beladen werden, was noch erläutert wird. Wenn außerdem einmal sich die Behälter und Anschlüsse innerhalb der gemeinsamen Kammer befinden, kann ein Zugang durch eine Scharnieranordnung 63 erfolgen, wie in Fig. 4 gezeigt ist, die die Kopfanordnung 21 schwenkbar an der Rahmenanordnung 57 trägt.
- Unter Bezug auf Fig. 1, 3 und 5 wird im folgenden die Gleitdichtung der vorliegenden Erfindung beschrieben. Bei der Oligonucleotidsynthese durch Phosphoramiditbindung gibt es zwei chemische technische Hauptforderungen, da die Bindungsreaktionen schnell und irreversibel sind. So müssen vorzugsweise Wasser und Sauerstoff aus der gemeinsamen Reaktionskammer während der Synthese ausgeschlossen sein. Phosphoramidite sind gegen über einer Hydrolyse durch Spuren von Wasser und gegenüber Oxidation durch Kontakt mit Luft empfindlich. Deshalb wird die Gleitdichtung 30 zwischen der Bodenfläche 51 der Kopfanordnung 21 und der oberen Fläche 52 der Basisanordnung 25 angeordnet, um so umgebungsmäßig sowohl die Reaktionsbehälter als auch die Anschlüsse in einer gemeinsamen Kammer 31 zu haben. Durch Strömenlassen eines Inertgases durch die gemeinsame Kammer 31, um die Luft und Wasserspuren aus der Kammer zu entfernen, können eine Hydrolyse und Oxidation auf ein Minimum reduziert, wenn nicht gänzlich ausgeschlossen werden, was nachstehend im einzelnen erläutert wird.
- Die Gleitdichtung 30 muß so ausgebildet sein, daß sie ein Umgebungsbehältnis bleibt, während sich die Basisanordnung bezüglich der Kopfanordnung verschieben kann. Bei der bevorzugten Ausgestaltung wird die Gleitdichtung 30 von einer elastischen, rechtecksförmigen Dichtung aus einer hydrolysebeständigen Folie oder in Ballonform gebildet, deren oberes Ende an der Unterseite 51 des Kopfes angebracht ist und deren gegenüberliegendes oder unteres Ende 64 in Gleitkontakt mit der oberen Fläche 52 der Basis steht. Diese spezielle Dichtung, die vorzugsweise aus Kautschuk oder dergleichen zusammengesetzt ist, erhöht die Dichtungsintegrität zwischen dem unteren Ende 64 der Dichtung und der oberen Fläche 52 der Basis, wenn der Druck in der gemeinsamen Kammer zunimmt. Fig. 5 zeigt, daß sich das untere Ende 64 der Dichtung am Umfang nach innen zum Innenraum der gemeinsamen Kammer 31 verjüngt. Bei Zunahme des Kammerdrucks dehnt sich die Wand der Dichtung 30 nach außen aus, wodurch der Oberflächenkontakt zwischen dem unteren Ende der Dichtung und der oberen Fläche der Basis zunimmt und den Dichtungseingriff dazwischen verbessert.
- Zur Erleichterung eines Gleitkontakts bei Aufrechterhaltung des Umgebungsumschließungsbehältnisses hat die Dichtung 30 eine klebefreie Beschichtung oder Lage 65 (Fig. 5) vorzugsweise aus TEFLON® zwischen dem unteren Ende der Dichtung und der oberen Fläche der Basis. Diese Schicht dient weiter als Schutz der Dichtung gegenüber einer Oberflächenabsorption von restlichen flüssigen Reagenzien, welche bei Kontakt zu einer Qualitätsverschlechterung der Dichtung teilweise aufgrund ihrer elastischen Beschaffenheit tendieren. Wie in Fig. 5 gezeigt ist, kann die obere Fläche 52 der Basisanordnung auch eine Beschichtung oder Lage 66 aus TEFLON® aufweisen, um den Gleitkontakt zu begünstigen und um die obere Fläche vor restlichem Reagenz zu schützen.
- Natürlich braucht die Abdichtung zwischen dem unteren Ende 64 der Dichtung und der oberen Fläche 52 der Basis nicht hermetisch zu sein. Die Hauptfunktion der Dichtung besteht darin, Sauerstoff aus der Reaktionskammer auszuschließen. Es ist deshalb wesentlich, im Normalfall einen minimalen positiven Druck im Inneren der Kammer 31 zu jeder Zeit während der Synthese aufrechtzuerhalten, der etwas größer ist als der Atmosphärendruck, so daß der Gasstrom, falls ein Leck auftritt, nach außen ginge. Diese minimale positive Druckdifferenz beträgt gewöhnlich etwa 69 Pa (1/100 psi) bis etwa 689 Pa (1/10 psi).
- Wie vorher erwähnt und in Fig. 3, 5 und 6 zu sehen ist, möchte man die Luft und Wasserspuren aus dem Reaktionskopfraum der Kammer mit einem Inertgas, vorzugsweise Argon, herausspülen, um die Hydrolyse und die Oxidation der Amidite während der Synthese auf ein Minimum zu reduzieren. Weiterhin möchte man das Inertgas kontinuierlich durch den Kopfraum strömen lassen, um die empfindlichen Amidite vor den Kappenbildungs- und Entblockungsreagenzien wie wäßrigem Joddampf oder Trichloressigsäure, zu schützen, die mit dem Amiditen reagieren. Dies wird durch Einführen eines Inertgasstroms (dargestellt durch Pfeile 67) durch die gemeinsame Kammer 31 von einem stromauf von der Reihenanordnung von Anschlüssen 22 angeordneten Gaseinlaß 70 aus erreicht, der aus der Kammer durch einen Gasauslaß 71 austritt, der stromab von den Anschlüssen angeordnet ist. Der Gaseinlaß 70 ist mit einer Gasquelle (nicht gezeigt) durch ein Einlaßrohr 72 (Fig. 1) verbunden, die außerdem für den Überdruck in der gemeinsamen Kammer 31 sorgt, der erforderlich ist, um Sauerstoff von der Umgebung auszuschließen. Da der Kopfraum der gemeinsamen Kammer relativ klein ist (in den Figuren ist er zur Veranschaulichung übertrieben groß gezeigt), kann ein ausreichender Gasstrom vorbei in den Anschlüssen erzeugt werden, um die Kammer ohne großen Gasvoluminaverbrauch zu reinigen oder auszuspülen.
- Der Gaseinlaß ist vorzugsweise mit einem langgestreckten Einlaßschlitz 70 (Fig. 2) versehen, der sich in die Kopfplatte 47 erstreckt und quer zu der Längsachse 42 der Kopfplatte 47 ausgerichtet ist. Die Form und Ausrichtung sorgen für einen im wesentlichen laminaren Inertgasstrom von dem stromauf liegenden Einlaß 70 zum stromab liegenden Einlaß 71, wodurch ein Gasquerstrom über die Anschlüsse auf ein Minimum reduziert wird und um die Totzonen mit stillstehenden Reagenzdämpfen aus der Kammer auszuspülen. Zu vermerken ist, daß der Gaseinlaß auch von einer Reihe von Öffnungen gebildet werden kann, die sich quer über die Kopfplatte 47 erstrecken, und daß der Gasauslaß 71 von einem langgestreckten Schlitz oder von einer Reihe von Öffnungen gebildet werden kann.
- Aufgrund des Gasstroms durch die Kammer befinden sich die gegen Säure und Feuchte empfindlichen Phosphoramide stromauf von den Entblockungs- und Kappenreagenzien, die eine Diffusionsgassperre bilden, was den Ausspüleffekt maximiert. Gemäß Fig. 3 würden die Phosphoramide von den Anschlüssen 22 näher zum Gaseinlaß 70 abgegeben werden, während die Kappenbilder, Waschmittel und Entblocker von den Anschlüssen abgegeben werden, die sich näher am Gasauslaß 71 stromab von den Phosphoramid-Abgabeanschlüssen befinden.
- Gemäß einem weiteren Aspekt der vorliegenden Erfindung ist die Polymersynthesevorrichtung 20, wie am besten in Fig. 5 und 6 zu sehen ist, mit Reaktionsbehältern 26 versehen, die wenigstens eine Öffnung, die insgesamt mit 74 bezeichnet ist, haben, welche sich in den Behälter erstreckt. In dem Behälter ist wenigstens ein massiver Träger 75 angeordnet, auf dem eine Polymerkette wächst und mobilisiert wird. Die Reagenzlösung 76 in dem Behälter 26 steht in Kontakt mit dem festen Träger 75, wobei wenigstens eine Polymereinheit der Polymerkette an dem festen Träger festgelegt ist. Die Öffnung 74 hat einen Einlaß 77 in den Behälter 26 von der Seite der gemeinsamen Kammer aus und einen Auslaß 80 aus dem Behälter heraus in ein darunterliegendes unteres Auffangbassin 81. Wesentlich ist, daß die Öffnung eine solche Größe und Abmessung hat, daß eine kapillare Flüssigkeitsdichtung mit der darin enthaltenen Reagenzlösung 76 gebildet wird, um die Reagenzlösung in dem Behälter zurückzuhalten, um in ihm das Wachstum der Polymerkette zu ermöglichen. Um die Lösung 76 in den Behältern 26 zurückzuhalten, muß außerdem eine Druckdifferenz zwischen einem Gasdruck der gemeinsamen Kammer, welcher auf die Reagenzlösung in den Reaktionsbehältern 26 ausgeübt wird, und zwischen einem zweiten Gasdruck, der auf die Öffnungsauslässe 80 (dargestellt durch Pfeile 79 in Fig. 6) ausgeübt wird, kleiner als ein vorgegebener Wert sein. Schließlich wird eine Druckreguliervorrichtung 82 vorgesehen, um die Druckdifferenz so zu regulieren, daß dann, wenn die Druckdifferenz den vorgegebenen Wert überschreitet, die Reagenzlösung 76 aus dem Behälter 26 durch die Öffnung 74 ausgetrieben wird (Fig. 5).
- Wenn also eine richtige Ausrichtung zwischen ausgewählten Behältern 26' mit ausgewählten Anschlüssen 22' (Fig. 6) unter Verwendung der Reihenanordnungstechnik und der neuen oben erwähnten Vorrichtung erreicht ist, können flüssige Reagenzien in ausgewählten Behältern 26' abgelegt werden. Die abgelegten Reagenzlösungen sammeln sich quer über der genau bemessenen Öffnung 74 in Kombination mit einer relativ kleinen Druckdifferenz (nicht größer als der vorgegebene Wert), um einen Meniskus über der Öffnung 74 zu bilden und um eine kapillare Flüssigkeitsabdichtung zu schaffen, damit die Lösung in dem Behälter zurückgehalten wird, ohne durch die Öffnung abzulaufen. Diese Dichtung trennt die gemeinsame Reaktionskammer in wirksamer Weise von der Umgebung des darunter befindlichen Auffangbassins 81. Wenn eine ausreichende Zeit abgelaufen ist, um die Synthesereaktion abzuschließen (insgesamt etwa eine Minute), wird die Reagenzlösung aus dem Behälter 26 durch die Öffnung 74 und in das untere Auffangbassin 81 durch Erhöhen der Gasdruckdifferenz über den vorgegebenen Betrag entleert, wodurch die Kapillarkräfte in der Öffnung überwunden werden (Fig. 5). Danach können die abgeführten Reagenzlösungen aus dem Auffangbassin durch einen Abflußauslaß 83 abgezogen werden. Dieses Verfahren wird für jeden Synthesezyklus (d. h. Entblockungs-, Wasch-, Kupplungs-, Kappen- und Oxidierungsschritte) wiederholt, bis das gewünschte definierte Synthesepolymer hergestellt ist.
- In dem Boden des Behälters 26 zwischen der Öffnung 74 und dem festen Träger 75 ist eine insgesamt mit 84 bezeichnete Rückhaltevorrichtung vorgesehen, die so ausgebildet und bemessen ist, daß sie einen Durchgang des festen Trägers durch die Öffnung im wesentlichen verhindert. Die Rückhaltevorrichtung 84 wird vorzugsweise von einer Fritte aus Polyethylen- oder Glasfaser gebildet, die als eine Filtermembran wirkt, welche den Durchfluß der Reagenzlösung ermöglicht, während der feste Träger und die darauf gewachsene Polymerkette in dem Behälter zurückgehalten werden. Die Porosität der Fritte ist ebenfalls ein Faktor bei der Ausbildung der kapillaren Flüssigkeitsdichtung und bei der Bestimmung der Druckdifferenz, die zum Entleeren des Reaktionsbehälters erforderlich ist.
- Zur Regulierung und Steuerung der Druckdifferenz zwischen der gemeinsamen Kammer 31 und dem unteren Auffangbassin 81 ist, wie erwähnt, eine Druckreguliervorrichtung 82 vorgesehen, die funktionsmäßig dazwischengeschaltet ist. Bei der bevorzugten Ausführungsform ist die Druckreguliervorrichtung 82 in einem Stück mit der Gasstromanordnung ausgebildet, die zum Ausspülen von Reagenzgiftstoffen aus dem Kopfraum in der gemeinsamen Kammer 31 verwendet wird. Nach dem freien Ausspülen der Kammer durch Inertgas vom Gaseinlaß 70 zum Gasauslaß 71 wird die minimale Druckdifferenz im allgemeinen zwischen etwa 1/100 psi bis etwa 1/10 psi gehalten. Diese Druckdifferenz ist ausrei chend positiv, um ein Einsickern von Umgebungsluft in die gemeinsame Kammer zu unterbinden, reicht jedoch nicht aus, um die Kapillarkräfte der kapillaren Flüssigkeitsdichtung in jedem Behälter zu überwinden. Durch Unterbindung oder Beschränkung des Ausstroms von Inertgas durch den Gasauslaß 71 kann der Druck in der Kammer 31 erhöht werden, wodurch die Druckdifferenz zum Entleeren der Behälter (Fig. 5) gesteigert wird, wenn der Druck im Auffangbassin nicht mit dem gleichen Wert oder mehr gesteigert wird.
- Die Druckreguliervorrichtung 82 hat deshalb ein Kammerventil 85 (Fig. 1), das mit dem Gasauslaß 71 verbunden ist, um den Abstrom von die gemeinsame Kammer 31 spülendem Inertgas zu steuern. Durch ausreichendes Fließen oder Drosseln des Stroms durch das Kammerventil 85 kann dementsprechend die Druckdifferenz über den vorgegebenen Wert erhöht werden, so daß die Behälter gleichzeitig Reagenzlösung entleeren können. In gleicher Weise kann durch ausreichendes Öffnen des Kammerventils 85 die Druckdifferenz unter den vorgegebenen Wert abgesenkt werden, wenn man die abgelegte flüssige Lösung in den ausgewählten Behältern zurückhalten möchte.
- Die flüssige Reaktionslösung fließt nicht im Leckstrom aus der Behälteröffnung 74 ab oder entleert sich aus ihr, bis eine ausreichende Flüssigkeitssäule in dem Behälter oder eine ausreichende Gasdruckdifferenz zwischen der gemeinsamen Kammer und dem unteren Auffangbassin vorhanden ist, um die Kapillarkräfte in der Öffnung zu überwinden. Die Größe des schwerkraft- und druckbedingten Leckstroms aus der Öffnung wird hauptsächlich durch die Viskosität des Lösungsmittel, die Porosität der Fritte, die Größe der Öffnung und die Gasdruckdifferenz bestimmt. Beispielsweise tragen eine 10-u-UHMW-Polyethylenfritte und eine Öffnung mit 0,04 cm² (0,015 in²) eine Flüssigkeitssäule von wenigstens 2,0 cm (0,79 Zoll) aus Acetonitril (mit einer Viskosität von etwa 0,345 Centipoise (7,2 · 10&supmin;&sup5; (lbf · s)/ft2) bei einer Betriebstemperatur von etwa 20ºC (68ºF)), bevor ein Überwinden der Kapillarkräfte in der Öffnung beginnt. Andererseits stellt sich durch Erhöhen der Druckdifferenz über den vorgegebenen Wert (insgesamt etwa 6895 Pa (1 psi) bis etwa 34474 Pa (5 psi)) ein schnelles Entleeren des Behälters ein. In der Praxis ist es erforderlich, eine Druckdifferenz zwischen etwa 17237 Pa (2,5 psi) und etwa 34474 Pa (5 psi) aufrechtzuerhalten, um die Reagenzlösung gleichzeitig aus den Reaktionsbehältern in ausreichendem Maße abzuführen. Wenn sich die einzelnen Behälter zu leeren beginnen, nimmt der Durchsatz an Inertgas durch die leeren Behälter der Mikrotiterplatte merklich zu, wodurch der Druck in der gemeinsamen Kammer 31 abnimmt. Diese Abnahme des Innendrucks verringert dementsprechend den Entleerung- oder Ablaufstrom der Reagenzlösung durch die Öffnungen, wobei der Effekt durch die rückhaltende Filtermembran 84 verstärkt wird.
- Natürlich kann die Druckdifferenz auch durch Ausbildung eines Vakuums im unteren Auffangbassin 81 zum Entleeren der Reaktionsbehälter erzeugt werden. Aus Fig. 1 ist ersichtlich, daß eine Zugangsöffnung 86 in das untere Auffangbassin 81 durch einen Deckel 87 abgedichtet werden kann und daß ein Ablaufauslaß 83 mit einer Vakuumpumpe verbunden werden kann, die in dem Bassin ein Vakuum erzeugt. Die Druckdifferenz kann also auch aus einer Kombination von Überdruck in der gemeinsamen Kammer 31 und einem Vakuum in dem Auffangbassin 81 erzeugt werden. Da sich die Reagenzlösung in dem Reaktionsbehälter für eine Reaktion anstelle eines kontinuierlichen Strömens durch die Kammer, wie es bei einigen bekannten Anordnungen verwendet wird, ansammeln kann, wird der Verbrauch an Reagenz wesentlich minimiert, was Kosten spart. Die Laborkosten werden durch Minimierung jeder Zykluszeit ebenfalls reduziert.
- Um alle gleichzeitigen Wirkungen zu koordinieren, ist zwischen den Transportmechanismus 27, die Ventilanordnungen 55 und die Druckreguliervorrichtung 82 ein Steuermechanismus 90 (Fig. 7) funktionsmäßig geschaltet. Es kann eine Ablaufdatei eingegeben werden, die eine geordnete Liste der Behälterposition, des Maßstabs, eine abschließende Entblockungsinstruktion und die ATGC- und N-(ungerade Base)-Sequenz für jedes Oligonucleotid enthält. Die Datei wirkt mit einer Steuerdatei zusammen, die zur Anzeige der tatsächlichen Anzahl und Reihenfolge der Entblockungs-, Wasch-, Kupplungs-, Kappen-, Oxidierungsschritte und der Länge der Zeit für Warteschritte und Druck und/oder Vakuum für Abzugsschritte verwendet wird, welche den kompletten Kupplungszyklus bilden.
- Oligonucleotide werden gewöhnlich auf festen Trägern aus gesteuertem Porenglas (CPG) synthetisiert, wobei das erste Nucleotid vorher mit dem CPG durch die 3'-Succinat-Verbindung verknüpft ist. Bei der Vorbereitung der Polymersynthese wird deshalb jeder Behälter individuell mit dem richtigen CPG-Derivativ geladen. Obwohl man mit einer vollen Syntheseplatte unter Verwendung nur eines CPG-Derivativs, beispielsweise T (d. h. dT-Icaa-CPG), beginnen könnte, möchte man eine Reihensynthese durchführen, bei der sich irgendeine Base in der ersten Position befinden kann. Das individuelle Abwiegen und Überführen von Mengen von 0,5 mg von geeignetem trockenen CPG- Derivativ auf jeden Behälter kann umständlich und zeitraubend sein.
- Bei der vorliegenden Erfindung wird zum Abscheiden der genauen Menge von CPG in einen Reaktionsbehälter eine Technik mit einer Aufschlämmung mit ausgeglichener Dichte verwendet. Durch Suspendieren des CPG in einer Suspensionslösung kann eine gewünschte Menge von CPG durch Pipettieren, entweder automatisch oder von Hand, eines entsprechenden Volumens der Suspensionslösung in einem Behälter genau abgelegt werden. Beispielsweise kann eine sich nicht absetzende 10%→1% Gewichts-/Volumensuspension von CPG in einer 2,5 : 1-Volumen-/Volumen-Dibrommethan- Dichlormethan-Lösung hergestellt werden. Danach kann vor der Synthese unter Verwendung der oben erwähnten Technik das CPG aus der Suspensionslösung gewaschen und entfernt werden.
- Gemäß einem weiteren Aspekt der vorliegenden Erfindung wird ein Verfahren zur Synthese einer Polymerkette bereitgestellt, welches die Schritte aufweist:
- A) Ausrichten eines Reaktionsbehälters 26 und eines ausgewählten Anschlusses 22 der Synthesevorrichtung 20 durch den Transportmechanismus 27, der mit wenigstens einer Kopfanordnung 21 und einer Basisanordnung 25 verbunden ist, um eine Relativbewegung dazwischen zu erzeugen,
- B) Abscheiden eines flüssigen Reagenz 24 in einen Behälter 26 aus einem Reagenzspeicher 23 durch einen Anschluß, um die Synthese einer Polymerkette zu ermöglichen, und schließlich
- C) Ausspülen von giftigen Dämpfen, die von den Reagenzien emittiert werden, aus der gemeinsamen Kammer 31 durch Führen eines Gases aus einer Druckgasquelle, die mit einem Einlaß 70 in die gemeinsame Kammer 31 verbunden und stromauf von den Anschlüssen angeordnet ist, und aus der gemeinsamen Kammer durch einen Auslaß 71 heraus, der stromab von den Anschlüssen angeordnet ist.
- Für den Aufbau einer Polymerkette durch sequentielles Zugeben von Polymereinheiten zu wenigstens einem festen Träger, um auf ihm eine Polymerkette in einem flüssigen Reagenz wachsen zu lassen und zu immobilisieren, wird ein weiteres Verfahren der Polymersynthese bereitgestellt. Das Verfahrens weist die Schritte auf
- A) Abscheiden von flüssigem Reagenz 24 in einem Reaktionsbehälter 26, der eine geeignet bemessene Öffnung 74 hat, in Kontakt mit wenigstens einem festen Träger 75, wobei wenigstens eine Polymereinheit der Polymerkette auf dem festen Träger 75 festgelegt ist, und Ausbilden einer kapillaren Flüssigkeitsdichtung, um die Reagenzlösung in dem Behälter 26 zu halten, damit die Polymerkette auf dem festen Träger 75 wachsen kann, und darauf folgend
- B) Anlegen eines ersten Gasdrucks an die Reaktionskammer 31 derart, daß eine Druckdifferenz zwischen dem ersten Gasdruck und einem zweiten Gasdruck, der auf einen Auslaß 80 der Öffnung 74 ausgeübt wird, den vorgegebenen Wert überschreitet, der erforderlich ist, um die kapillare Flüs sigkeitsdichtung zu überwinden und um die Reagenzlösung aus dem Behälter 26 durch die Öffnung 74 auszutreiben.
- Durch Wiederholen der Schritte der beiden vorstehend erwähnten Verfahren kann eine kontinuierliche Kette von Polymereinheiten gebildet werden.
- Das folgende Beispiel dient zur besseren Beschreibung der Art und Weise der Verwendung der vorstehend beschriebenen Erfindung sowie zur Darlegung der in Betracht gezogenen besten Art der Durchführung der verschiedenen Aspekte der Erfindung. Selbstverständlich dient dieses Beispiel in keiner Weise dazu, den wahren Rahmen der Erfindung zu beschränken, sondern wird nur zu Erläuterungszwecken angegeben. Selbstverständlich kann jedes Verfahren der Oligonucleotidsynthese bei der vorliegenden Erfindung verwendet werden.
- Das allgemeine Synthese-Arbeitsverfahren folgt den veröffentlichten Arbeitsgängen für das Phosphoramidit- und Wasserstoffphosphonat-Verfahren der Oligonucleotidsynthese, beispielsweise Verfahren, wie sie in Oligonucleotides und Analogues: A Practical Approach, F. Eckstein, Ed. IRL Press, Oxford University; Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach, Gait, Ed., IRL Press, Washington D. C.; und US-Patent Nrn. 4,458,066, 4,500,707 und 5,047,524 beschrieben sind. Selbstverständlich können bei der vorliegenden Erfindung auch andere Verfahren der Oligonucleotidsynthese verwendet werden.
- Die Basisschritte der Synthesereaktion sind bei geeigneten Acetonitril-Waschschritten insgesamt die folgenden:
- a) Das erste Nucleosid, das an der 5'-Position geschützt worden ist, wird auf einen festen Träger derivatisiert, gewöhnlich gesteuertes Porenglas (CPG), oder wird präderivatisiert erhalten.
- b) Die Zuckergruppe des ersten Nucleosids wird unter Verwendung von Trichlor-Dichlormethan-Essigsäure als Schutz entfernt oder detrityliert, was ein farbiges Produkt ergibt, das für den Reaktionsfortschritt überwacht werden kann.
- c) Das zweite Nucleotid, bei welchem die Phosphor-Zucker- und Basengruppen geschützt sind, wird der wachsenden Kette, gewöhnlich bei Vorhandensein eines Tetrazol-Katalysators, zugegeben.
- d) Das erste Nucleosid, das nicht reagiert hat, wird unter Verwendung von Essigsäureanhydrid und N-Methylimidazol zur Vermeidung von fortdauernden Fehlern mit Kappen versehen.
- e) Zur Bildung des stabilieren Phosphat-Triesters wird gewöhnlich unter Verwendung von Jodreagenzien der Phosphit- Triester oxidiert.
- f) Der Prozeß wird abhängig von der gewünschten Länge des Oligonucleotids nach Bedarf wiederholt.
- g) Es erfolgt das Abtrennen von dem festen Träger, wofür gewöhnlich wäßriges Ammoniak bei erhöhten Temperaturen über einen Zeitraum von Stunden verwendet wird.
- Entsprechend wird eine Ablaufdatei aufgestellt, welche die 3'- 5'-Sequenz und die Behälternummer für jedes zu synthetisierende Oligonucleotid, den Maßstab der Reaktion für jedes Nucleotid anzeigt und angibt, ob am Ende der Reaktion bei dem Produkt eine abschließende Detritylierung durchgeführt werden soll. Die Software ist so ausgelegt, daß sie eine gleichzeitige unabhängige Synthese von Oligonucleotiden unterschiedlicher Längen und Maßstäbe trägt. Die Sequenz von 15 unterschiedlichen Oligonucleotiden ist in der nachstehenden Tabelle 1 gezeigt. TABELLE 1
- Es wird eine Steuerdatei erstellt, die die Folge der Reaktionsschritte enthält, die während eines Kupplungszyklus ausgeführt werden. Die Grundbefehle sind WASCHEN (Volumen), ENTBLOCKUNG (Volumen), KUPPLUNG, KAPPE, OXIDIEREN, WARTEN (Sekunden) und ABZIEHEN (Druck/Vakuumsekunden), wie es in der nachstehenden Tabelle 2 gezeigt ist. TABELLE 2
- Es wird eine Konfigurationsdatei erstellt, welche die Betriebscharakteristika der Maschine, die Flüssigkeitsdurchsätze, die Konzentration und die Moläquivalente enthält, die für jedes der Reagenzien verwendet werden, wie es in der nachstehenden Tabelle 3 gezeigt ist. TABELLE 3
- Es wurden Platten mit 96 Behältern verwendet, die einen konischen unteren Abschnitt haben, der zur Aufnahme einer Filterplatte mit 0,50 cm (0,196 Zoll) im Preßsitz ausgespart war. Unter dem Filter befand sich eine Krümmungsverengung und eine Kapillar-Flüssigkeitsdichtungsöffnung mit einem Durchmesser von 0,05 cm (0,020 Zoll) mal einer Länge von 0,89 cm (0,350 Zoll). Der Außendurchmesser der Kapillardichtung am Auslaßende betrug 0,09 cm (0,035 Zoll). Nach dem Einpassen in Whatman-GF/A-Filter betrug der Gasdurchsatz durch eine vollständige trockene Platte mit einem oberen Kammerdruck von 6895 Pa (1 psi) 10 l/min. Bei einem Kammerdruck von 138 Pa (0,02 psi) trägt die Kapillardichtung am Boden des Synthesebehälters eine Acetonitril-Flüssigkeitssäule von etwa 1 cm über dem Filter, bevor ein langsamer Leckstrom beginnt. Die Platten wurden aus geformtem Polypropylen hergestellt.
- Jedem Behälter wird die genaue Menge von CPG mit einer derivatisierten ersten Base, entweder A, T, C oder G zugegeben. Beispielsweise wurden 0,5 mg CPG bei einer 20-Nanomol-Maßstabs-Reaktion verwendet. Die CPG-Perlen wurden einer Aufschlämmung in Dibrommethan-Chloroform zugesetzt, die in jedem Behälter pipettiert wurde. Dieser Schritt wurde in einer üblichen Laboratmosphäre vor dem Laden der Platte in die Maschine ausgeführt. Nach dem Laden der Platte in die Maschine wird ein WASCH-Acetonitril-Zyklus durchgeführt, um die Aufschlämmung auszuspülen und um festzustellen, daß alle Behälter richtig ablaufen.
- Die Anschluß-Ventilspeicher wurden mit Argon gespült und dann mit frischen Reagenzien aus den Vorratsflaschen durch Drucküberführung befüllt, um eine Verunreinigung durch Luft und Wasser zu vermeiden. Die Ventilspeicher wurden dann auf den Konfigurationsdruck von 27579 Pa (4 psi) unter Druck gesetzt. Dann wurde die Anschlußverrohrung gefüllt durch Abgabe einer kleinen Menge von Flüssigkeit, wobei sich die Gleitplatte in der Reinigungsposition für jedes Reagenz befindet.
- Während der Reagenzzugabe und der Reaktionswarteperioden wurde der laminare Spülgasstrom über die Reaktionskammer auf 0,4 l/min bei einem Innendruck von etwa 138 Pa (0,02 psi) einreguliert. Während des Entfernens des zugegebenen Reagenz und der Waschzyklen wurde der Kammerdruck auf ein Maximum von 34474 Pa (5 psi) erhöht. Bei 17237 Pa (2,5 psi) entleerten sich die Synthesebehälter mit einem Mengenstrom von etwa 150 λ/s.
- Dann wurde die Maschine in den AUTOmatik-Modus geschaltet, um mit der tatsächlichen Synthese zu beginnen. Die Maschine pausierte während des ersten, zweiten und letzten Zyklus, um eine Sammlung der ENTBLOCKUNGS-Trityl-Produkte für eine kolorimetrische Analyse zu ermöglichen. Dies wurde dadurch erreicht, daß eine zweite 96-Behälter-Mikrotiterplatte in die untere Vakuum-/Abzugkammer unmittelbar unter die kapillaren Austrittsenden der Syntheseplatte geschoben wurde. Unter Verwendung eines Plattenlesers wurde die optische Dichte der Detritylierungslösung bei 490 nm gelesen. Der Wert für den ersten Zyklus bestätigte die Menge des in einen Behälter geladenen CPG, und ein Vergleich des zweiten Zyklus mit dem letzten Zyklus erlaubte eine Berechnung des Synthesekupplungswirkungsgrads. Der letzte Zykluswert zeigte auch die Oligonucleotidmenge, die man nach der Seitenketten-Schutzgruppenentfernung durch Ammoniakabspaltung erhält.
- Nachdem die Maschine die Synthese in allen Behältern abgeschlossen hat, wird die Syntheseplatte aus der Maschine entfernt. Die Syntheseplatte wird auf der Oberseite einer zweiten 96-Behälter-Deprotektor-Platte (Beckman Tiefbehälter-Titerplatte 267001) gestapelt. Die Oligonucleotide wurden von dem Träger durch Pipettieren von 200 ul konzentrierter NH&sub4;OH in jeden Behälter abgelöst, worauf eine Inkubation bei 25ºC für 15 min erfolgt. Die Ammoniak-Abspaltungslösungen wurden durch das Filter und den Kapillarauslaß in die Behälter der Schutzgruppenentfernungsplatte durch Druck, Vakuum oder vorzugsweise kurzes Zentrifugieren des Stapels herausgespült. Dieser Abspaltschritt wurde zweimal mit frischen Aliquots von Ammoniak wiederholt.
- Wenn die für die Synthese verwendeten Phosphoramidite Benzoyl- und Isobutyryl-Schutzgruppen hatten, wurde die abschließende Schutzgruppenentferung durch Erhitzen des rohen Ammoniakabspaltprodukts abgeschlossen. Die Behälter der Schutzgruppenentfernungs-Titerplatte wurden mit einer mit Vertiefungen versehenen Siliconkautschukkappe (Beckman 267002) abgedichtet und die Kappen an Ort und Stelle unter Verwendung einer federbelasteten Plattenpresse gehalten. Die abgedichtete Vorrichtung wurde in einem Luftofen oder Wasserbad über 8 bis 15 Stunden auf 55ºC gehalten und dann in einem Eisbad abgekühlt. Die Schutzgruppenentfernungsplatte wurde von der Presse entfernt und vor dem Entfernen der Kappe kurz zentrifugiert.
- Die Ammoniaklösung wurde dann bis zur Trockenheit unter Verwendung eines Savant 210 Speed Vac, die mit einem Mikroplattenrotor versehen war, verdampft. Die so erhaltenen Oligonucleotidtabletten waren insgesamt ausreichend rein für eine direkte Verwendung in den meisten Sequenz-Primer- und PCR-Anwendungen. Die Oligonucleotidmenge, die durch die letzte Trityl- Prüfung vorhergesagt wurde, wurde durch eine optische Dichte bei 260 nm und die Homogenität des Produkts verifiziert, die durch HPLC oder Kapillargel-Elektrophorese geprüft wurde. Die Kapillar-Elektrophorese-Analyse wurde auf einem Applied Biosystems 270A-Gerät nach dem Herstellerprotokoll für Oligonucleotide 14 und 15 aus dem obigen Versuch durchgeführt und sind in den Fig. 8A bzw. 8B gezeigt. Typische Ausbeuten für eine 20- Nanomol-Maßstab-Synthese eines 20-mer kann 2,5 OD (85 Mikrogramm) betragen.
Claims (10)
1. Polymersynthesevorrichtung (20) zum Aufbau einer
Polymerkette durch sequentielle Zugabe von Polymereinheiten zu
einem festen Träger (75) in einem flüssigen Reagenz (76)
- mit einer Basisanordnung (25), die einen
Reaktionsbehälter (26) und wenigstens eine Öffnung (74) aufweist,
die sich in den Behälter (26) erstreckt,
- mit wenigstens einem in dem Behälter (26) angeordneten
festen Träger (75) zum Wachsen und Immobilisieren einer
Polymerkette auf ihm,
- mit einer Reagenzlösung (76) in dem Behälter (26) in
Kontakt mit dem festen Träger (75) und mit wenigstens
einer Polymereinheit der Polymerkette, die an dem
festen Träger (75) festgelegt ist,
- mit einer Rückhalteeinrichtung (84), die in dem
Behälter (26) angeordnet und so ausgebildet und bemessen
ist, daß sie den Durchgang des festen Trägers (75)
durch die Öffnung (74) im wesentlichen unterbindet,
- wobei die Öffnung (74) einen Einlaß (77) in den
Behälter (26) und einen Auslaß (80) sowie eine solche Größe
und Abmessung hat, daß eine
Kapillar-Flüssigkeitsdichtung gebildet wird, um die Reagenzlösung (76) in dem
Behälter (26) zur Ermöglichung des
Polymerkettenwachstums darin zurückzuhalten, wenn eine Druckdifferenz
zwischen einem ersten auf den Reaktionsbehälter (26)
ausgeübten Gasdruck und einem zweiten auf den
Öffnungsauslaß (80) ausgeübten Gasdruck geringer ist als eine
vorgegebene Größe,
- mit einer Druckreguliereinrichtung (82) zum Regulieren
der Druckdifferenz derart, daß, wenn die Druckdifferenz
die vorgegebene Größe überschreitet, die Reagenzlösung
(76) aus dem Behälter (26) durch die Öffnung (74)
ausgetrieben wird, und
- mit einem oberen Kammermechanismus (21), der mit einer
Oberseite (52) der Basisanordnung (25) so
zusammenwirkt, daß eine obere, den Reaktionsbehälter darin
einschließende Kammer (31) gebildet wird, wobei die
Reguliereinrichtung (82) mit der oberen Kammer (31) zum
Regulieren der Druckdifferenz in Verbindung steht.
2. Polymersynthesevorrichtung (20) nach Anspruch 1, welche
weiterhin eine Druckgasquelle aufweist, die mit einem
Einlaß (70) in die obere Kammer (31) verbunden und stromauf
von der Öffnung (74) angeordnet ist, wobei die obere
Kammer (31) einen Auslaß (71) aus der oberen Kammer (31) hat,
der stromab von der Öffnung (74) angeordnet ist, wodurch
von der Reagenzlösung (76) emittierte giftige Dämpfe aus
der oberen Kammer (31) durch Führen eines Gases aus der
Druckgasquelle durch die obere Kammer (31) weggespült
werden.
3. Polymersynthesevorrichtung (20) nach Anspruch 2, bei
welcher die Reguliereinrichtung (82) weiterhin ein mit dem
Auslaß (71) verbundenes Kammerventil (85) aufweist, das
den Gasabstrom aus der Kammer (31) abhängig vom Anstieg
der Druckdifferenz über die vorgegebene Größe oder
abhängig von einem Absinken der Druckdifferenz unter die
vorgegebene Größe steuert.
4. Polymersynthesevorrichtung (20) nach einem der
vorhergehenden Ansprüche, bei welcher die Rückhalteeinrichtung
(84) ein Filterelement aufweist, das in dem Behälter (26)
zwischen der einen Öffnung (74) und dem Tragaufbau
angeordnet ist.
5. Polymersynthesevorrichtung (20) nach Anspruch 4, bei
welcher das Filterelement (84) und die Öffnung (74) so
zusam
menwirken, daß die Kapillar-Flüssigkeitsdichtung gebildet
wird.
6. Polymersynthesevorrichtung (20) nach einem der
vorhergehenden Ansprüche, welche weiterhin einen unteren
Kammermechanismus (81) aufweist, der mit einer Unterseite der
Basisanordnung (25) so zusammenwirkt, daß eine untere Kammer
gebildet wird, in der die Öffnung (74) eingeschlossen ist,
wobei die Reguliereinrichtung (82) mit der unteren Kammer
zur Regulierung der Druckdifferenz in Verbindung steht.
7. Syntheseverfahren zum Aufbau einer Polymerkette durch
sequentielle Zugabe von Polymereinheiten zu wenigstens einem
festen Träger (75) zum Wachsen und Immobilisieren einer
Polymerkette darauf in einem flüssigen Reagenz (76), wobei
das Verfahren die Schritte aufweist:
A) Einbringen eines flüssigen Reagenz (76) in einen
Reaktionsbehälter (26) in Kontakt mit wenigstens einem
festen Träger (75) und Einbringen wenigstens einer
Polymereinheit der Polymerkette, die an dem festen Träger
(75) festgelegt ist, wobei der Behälter (26) wenigstens
eine sich in ihn erstreckende Öffnung (74) und eine
solche Größe und Abmessung hat, daß eine
Kapillar-Flüssigkeitsdichtung gebildet wird, um die Reagenzlösung
(76) in dem Behälter (26) zur Ermöglichung des Wachsens
der Polymerkette auf dem festen Träger (75)
zurückzuhalten,
B) Anlegen eines ersten Gasdrucks an den Reaktionsbehälter
(26) derart, daß eine Druckdifferenz zwischen dem
ersten Gasdruck und einem zweiten an einem Auslaß (80)
der Öffnung (74) ausgeübten Gasdruck eine vorgegebene
Größe überschreitet, die erforderlich ist, um die
Kapillar-Flüssigkeitsdichtung aufzuheben und die
Reagenzlösung (76) aus dem Behälter (26) durch die Öffnung
(74) auszutreiben, und
C) Ausspülen von giftigen, von der Reagenzlösung (76)
emittierten Dämpfen aus einer gemeinsamen, den
Reaktionsbehälter (26) einschließenden Kammer (31) durch Führen
eines Gases von einer Druckgasquelle, die mit einem
Einlaß (70) in die Kammer (31) verbunden und stromauf
von dem Reaktionsbehälter (26) angeordnet ist, uhd aus
der Kammer (31) durch einen Auslaß (71) heraus, der von
der gemeinsamen Kammer (31) weg geht und stromab von
dem Reaktionsbehälter (26) angeordnet ist.
8. Verfahren nach Anspruch 7, welches weiterhin den Schritt
aufweist, die Druckdifferenz durch eine
Druckreguliereinrichtung (82) abhängig vom Anstieg der Druckdifferenz über
die vorgegebene Größe oder vom Absinken der Druckdifferenz
unter die vorgegebene Größe zu steuern.
9. Verfahren nach Anspruch 7 oder Anspruch 8, welches
weiterhin den Schritt aufweist, die Schritte A), B) und C) zu
wiederholen, um wenigstens eine fortlaufende Kette von
Polymereinheiten zu bilden.
10. Verfahren nach einem der Ansprüche 7 bis 9, welches
weiterhin das Bereitstellen einer Anordnung von
Reaktionsbehältern (26), von denen jeder von der gemeinsamen Kammer
(31) umschlossen ist, und das Ausführen der Schritte A)
bis C) für jeden Reaktionsbehälter aufweist.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US08/142,593 US5472672A (en) | 1993-10-22 | 1993-10-22 | Apparatus and method for polymer synthesis using arrays |
PCT/US1994/011936 WO1995011262A1 (en) | 1993-10-22 | 1994-10-19 | Apparatus and method for polymer synthesis using arrays |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE69425673D1 DE69425673D1 (de) | 2000-09-28 |
DE69425673T2 true DE69425673T2 (de) | 2001-04-19 |
Family
ID=22500483
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE69425673T Expired - Lifetime DE69425673T2 (de) | 1993-10-22 | 1994-10-19 | Gerät und verfahren zur polymersynthese mit gerüsten |
DE69433635T Expired - Lifetime DE69433635T2 (de) | 1993-10-22 | 1994-10-19 | Vorrichtung und Verfahren zur Synthese von Polymeren mit Anwendung von Arrays |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE69433635T Expired - Lifetime DE69433635T2 (de) | 1993-10-22 | 1994-10-19 | Vorrichtung und Verfahren zur Synthese von Polymeren mit Anwendung von Arrays |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (8) | US5472672A (de) |
EP (2) | EP0734397B1 (de) |
JP (3) | JP3677041B2 (de) |
AT (2) | ATE195671T1 (de) |
CA (1) | CA2174648C (de) |
DE (2) | DE69425673T2 (de) |
WO (1) | WO1995011262A1 (de) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE102004047963B4 (de) * | 2004-04-01 | 2006-12-28 | Korea Advanced Institute Of Science & Technology | Mikrofluidischer Chip für Hochdurchsatz-Screening und Hochdurchsatz-Assay |
Families Citing this family (367)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5472672A (en) * | 1993-10-22 | 1995-12-05 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Apparatus and method for polymer synthesis using arrays |
US6558633B1 (en) * | 1994-09-21 | 2003-05-06 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Chemical reaction apparatus and methods |
US5585069A (en) * | 1994-11-10 | 1996-12-17 | David Sarnoff Research Center, Inc. | Partitioned microelectronic and fluidic device array for clinical diagnostics and chemical synthesis |
WO1996015768A1 (en) * | 1994-11-18 | 1996-05-30 | The Procter & Gamble Company | Oral compositions |
US6239273B1 (en) | 1995-02-27 | 2001-05-29 | Affymetrix, Inc. | Printing molecular library arrays |
US5599695A (en) * | 1995-02-27 | 1997-02-04 | Affymetrix, Inc. | Printing molecular library arrays using deprotection agents solely in the vapor phase |
US5959098A (en) | 1996-04-17 | 1999-09-28 | Affymetrix, Inc. | Substrate preparation process |
WO1996030393A1 (en) * | 1995-03-27 | 1996-10-03 | Warner-Lambert Company | A method for the synthesis of mixtures of compounds |
US5759779A (en) * | 1995-08-29 | 1998-06-02 | Dehlinger; Peter J. | Polynucleotide-array assay and methods |
US5716584A (en) * | 1995-09-07 | 1998-02-10 | Pathogenesis Corporation | Device for the synthesis of compounds in an array |
US7026114B1 (en) * | 1995-09-13 | 2006-04-11 | Affymetrix, Inc. | Methods and compositions for monitoring polymer array synthesis |
ATE201149T1 (de) * | 1995-09-22 | 2001-06-15 | Berlex Lab | Vorrichtung und verfahren für mehrfachen chemischen reaktionen |
US5888830A (en) | 1995-09-22 | 1999-03-30 | Berlex Laboratories, Inc. | Apparatus and process for multiple chemical reactions |
GB9521775D0 (en) * | 1995-10-24 | 1996-01-03 | Pa Consulting Services | Microwell plates |
US5763263A (en) * | 1995-11-27 | 1998-06-09 | Dehlinger; Peter J. | Method and apparatus for producing position addressable combinatorial libraries |
US6660233B1 (en) * | 1996-01-16 | 2003-12-09 | Beckman Coulter, Inc. | Analytical biochemistry system with robotically carried bioarray |
EP2574617B1 (de) * | 1996-02-09 | 2016-04-20 | Cornell Research Foundation, Inc. | Erkennung von Nukleinsäurensequenz-Unterschieden mittels der Ligaseerkennungsreaktion mit adressierbaren Arrays |
US6063633A (en) * | 1996-02-28 | 2000-05-16 | The University Of Houston | Catalyst testing process and apparatus |
AU2609997A (en) * | 1996-04-09 | 1997-10-29 | David Sarnoff Research Center, Inc. | Plate for reaction system |
US6033544A (en) * | 1996-10-11 | 2000-03-07 | Sarnoff Corporation | Liquid distribution system |
US5840256A (en) * | 1996-04-09 | 1998-11-24 | David Sarnoff Research Center Inc. | Plate for reaction system |
US5733509A (en) * | 1996-04-17 | 1998-03-31 | Motorola, Inc. | Method and system for synthesizing oligonucleotides using nucleotide-specific dispensing bars |
US6706875B1 (en) * | 1996-04-17 | 2004-03-16 | Affyemtrix, Inc. | Substrate preparation process |
US5731152A (en) * | 1996-05-13 | 1998-03-24 | Motorola, Inc. | Methods and systems for biological reagent placement |
US6048691A (en) * | 1996-05-13 | 2000-04-11 | Motorola, Inc. | Method and system for performing a binding assay |
US5792431A (en) * | 1996-05-30 | 1998-08-11 | Smithkline Beecham Corporation | Multi-reactor synthesizer and method for combinatorial chemistry |
DE19625397A1 (de) * | 1996-06-25 | 1998-01-08 | Deutsches Krebsforsch | Verfahren zur Kombination von paralleler Oligonukleotidsynthese und Darstellung von Oligomer-Chips |
US5817489A (en) * | 1996-08-01 | 1998-10-06 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Di-nitrogen heterocycle compositions |
US5922872A (en) * | 1996-08-01 | 1999-07-13 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Meta-benzylic and alpha-amido compositions and methods for preparing same |
US5798360A (en) * | 1996-08-01 | 1998-08-25 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | N-(aminoalkyl)- and/or N-(amidoalkyl)- dinitrogen heterocyclic compositions |
US5731438A (en) * | 1996-08-01 | 1998-03-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | N-(aminoalkyl)-and/or N-(amidoalkyl)-dinitrogen heterocycles |
US5792430A (en) * | 1996-08-12 | 1998-08-11 | Monsanto Company | Solid phase organic synthesis device with pressure-regulated manifold |
US5981733A (en) * | 1996-09-16 | 1999-11-09 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Apparatus for the chemical synthesis of molecular arrays |
US6042789A (en) * | 1996-10-23 | 2000-03-28 | Glaxo Group Limited | System for parallel synthesis of organic compounds |
US6149869A (en) * | 1996-10-23 | 2000-11-21 | Glaxo Wellcome Inc. | Chemical synthesizers |
US6875620B1 (en) * | 1996-10-31 | 2005-04-05 | Agilent Technologies, Inc. | Tiling process for constructing a chemical array |
US5780241A (en) | 1996-11-05 | 1998-07-14 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Complex chemical libraries |
US6054325A (en) * | 1996-12-02 | 2000-04-25 | Glaxo Wellcom Inc. | Method and apparatus for transferring and combining distinct chemical compositions with reagents |
US6083761A (en) * | 1996-12-02 | 2000-07-04 | Glaxo Wellcome Inc. | Method and apparatus for transferring and combining reagents |
US5865224A (en) * | 1996-12-20 | 1999-02-02 | Life Technologies, Inc. | Method and apparatus for automated dispensing |
EP2295988A2 (de) * | 1996-12-31 | 2011-03-16 | High Throughput Genomics, Inc. | Multiplex-Analysevorrichtung zur Analyse von Molekülen und zugehöriges Herstellungsverfahren |
AU5820798A (en) * | 1997-01-09 | 1998-08-03 | Mercury Diagnostics Inc. | Methods for applying a reagent to an analytical test device |
US6274094B1 (en) | 1997-01-13 | 2001-08-14 | Weller, Iii Harold Norris | Nestable, modular apparatus for synthesis of multiple organic compounds |
US5812272A (en) * | 1997-01-30 | 1998-09-22 | Hewlett-Packard Company | Apparatus and method with tiled light source array for integrated assay sensing |
US6001311A (en) * | 1997-02-05 | 1999-12-14 | Protogene Laboratories, Inc. | Apparatus for diverse chemical synthesis using two-dimensional array |
DK0963246T3 (da) * | 1997-02-17 | 2004-03-01 | Abimed Analysen Technik Gmbh | Indretning til en automatiseret kemisk syntese |
US6126904A (en) * | 1997-03-07 | 2000-10-03 | Argonaut Technologies, Inc. | Apparatus and methods for the preparation of chemical compounds |
US6045755A (en) * | 1997-03-10 | 2000-04-04 | Trega Biosciences,, Inc. | Apparatus and method for combinatorial chemistry synthesis |
US6224832B1 (en) | 1997-05-30 | 2001-05-01 | Smithkline Beecham Corporation | Multi-reactor synthesizer and method for combinatorial chemistry |
DE19828995B4 (de) * | 1997-06-30 | 2006-01-12 | INSTITUT FüR MIKROTECHNIK MAINZ GMBH | Anordnung von Mikroreaktionsgefäßen und Verfahren zur Abgabe einer Flüssigkeit aus einer Anordnung von Mikroreaktionsgefäßen |
US7112449B1 (en) * | 2000-04-05 | 2006-09-26 | Nanogram Corporation | Combinatorial chemical synthesis |
US5961925A (en) | 1997-09-22 | 1999-10-05 | Bristol-Myers Squibb Company | Apparatus for synthesis of multiple organic compounds with pinch valve block |
WO1999020395A1 (en) * | 1997-10-22 | 1999-04-29 | Argonaut Technologies, Inc. | Systems and methods for combinatorial organic synthesis of arrays of reaction |
US6177558B1 (en) * | 1997-11-13 | 2001-01-23 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and composition for chemical synthesis using high boiling point organic solvents to control evaporation |
CA2253164A1 (en) * | 1997-11-14 | 1999-05-14 | Edward Michael Sioma | Apparatus and method used in multiple, simultaneous synthesis of general compounds |
US6121054A (en) * | 1997-11-19 | 2000-09-19 | Trega Biosciences, Inc. | Method for separation of liquid and solid phases for solid phase organic syntheses |
US20030039967A1 (en) * | 1997-12-19 | 2003-02-27 | Kris Richard M. | High throughput assay system using mass spectrometry |
US6083682A (en) * | 1997-12-19 | 2000-07-04 | Glaxo Group Limited | System and method for solid-phase parallel synthesis of a combinatorial collection of compounds |
US20030096232A1 (en) * | 1997-12-19 | 2003-05-22 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
US20100105572A1 (en) * | 1997-12-19 | 2010-04-29 | Kris Richard M | High throughput assay system |
US5939024A (en) * | 1997-12-23 | 1999-08-17 | Packard Instrument Co. | Microplate assembly |
US6087102A (en) * | 1998-01-07 | 2000-07-11 | Clontech Laboratories, Inc. | Polymeric arrays and methods for their use in binding assays |
US7470547B2 (en) * | 2003-07-31 | 2008-12-30 | Biodot, Inc. | Methods and systems for dispensing sub-microfluidic drops |
US6063339A (en) * | 1998-01-09 | 2000-05-16 | Cartesian Technologies, Inc. | Method and apparatus for high-speed dot array dispensing |
US20020159919A1 (en) * | 1998-01-09 | 2002-10-31 | Carl Churchill | Method and apparatus for high-speed microfluidic dispensing using text file control |
US6289229B1 (en) | 1998-01-20 | 2001-09-11 | Scimed Life Systems, Inc. | Readable probe array for in vivo use |
US20030215957A1 (en) * | 1998-02-20 | 2003-11-20 | Tony Lemmo | Multi-channel dispensing system |
US6027695A (en) * | 1998-04-01 | 2000-02-22 | Dupont Pharmaceuticals Company | Apparatus for holding small volumes of liquids |
US20040186071A1 (en) | 1998-04-13 | 2004-09-23 | Bennett C. Frank | Antisense modulation of CD40 expression |
US7321828B2 (en) | 1998-04-13 | 2008-01-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | System of components for preparing oligonucleotides |
WO1999054031A1 (en) * | 1998-04-23 | 1999-10-28 | Otter Coast Automation, Inc. | Method and apparatus for synthesis of libraries of organic compounds |
DE19819735A1 (de) * | 1998-05-02 | 1999-11-04 | Novartis Ag | Vorrichtung und Verfahren zur Herstellung einer Anordnung von Kettenmolekülen auf einem Trägermaterial |
US6253168B1 (en) | 1998-05-12 | 2001-06-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Generation of virtual combinatorial libraries of compounds |
US6872535B2 (en) | 1998-05-20 | 2005-03-29 | Aventis Pharmaceuticals Inc. | Three-dimensional array of supports for solid-phase parallel synthesis and method of use |
US6270730B1 (en) | 1998-06-16 | 2001-08-07 | Northwest Engineering Inc. | Multi-well rotary synthesizer |
US6551557B1 (en) | 1998-07-07 | 2003-04-22 | Cartesian Technologies, Inc. | Tip design and random access array for microfluidic transfer |
US6908770B1 (en) | 1998-07-16 | 2005-06-21 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Fluid based analysis of multiple analytes by a sensor array |
US6238627B1 (en) | 1998-08-26 | 2001-05-29 | Arqule, Inc. | Reaction block and cover |
US6271042B1 (en) | 1998-08-26 | 2001-08-07 | Alpha Innotech Corporation | Biochip detection system |
US6461812B2 (en) | 1998-09-09 | 2002-10-08 | Agilent Technologies, Inc. | Method and multiple reservoir apparatus for fabrication of biomolecular arrays |
US6475440B1 (en) | 1998-09-16 | 2002-11-05 | Clontech Laboratories, Inc. | Applicator for use in deposition of fluid samples onto a substrate surface |
EP1000661A1 (de) * | 1998-10-29 | 2000-05-17 | Hans-Knöll-Institut für Naturstoff-Forschung e.v. | Ultradünnwandige Mehrfachlochplatte für Heizblock-Thermozyklen |
US6258323B1 (en) | 1998-11-16 | 2001-07-10 | Rohm And Haas Company | Apparatus and method used in multiple, simultaneous synthesis of general compounds |
US6309828B1 (en) | 1998-11-18 | 2001-10-30 | Agilent Technologies, Inc. | Method and apparatus for fabricating replicate arrays of nucleic acid molecules |
US6264891B1 (en) * | 1998-12-22 | 2001-07-24 | Eos Biotechnology, Inc. | Apparatus and method for concurrent chemical synthesis |
DE59906395D1 (de) * | 1998-12-30 | 2003-08-28 | Mwg Biotech Ag | Vorrichtung zur durchführung von chemischen reaktionen |
US20030180789A1 (en) * | 1998-12-30 | 2003-09-25 | Dale Roderic M.K. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US6087112A (en) * | 1998-12-30 | 2000-07-11 | Oligos Etc. Inc. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US20030207464A1 (en) * | 1999-02-19 | 2003-11-06 | Tony Lemmo | Methods for microfluidic aspirating and dispensing |
US6800250B1 (en) | 1999-03-19 | 2004-10-05 | Scott P. Hunicke-Smith | Polymer synthesizer |
WO2000056445A1 (en) * | 1999-03-19 | 2000-09-28 | Genomic Instrumentation Services, Inc. | Polymer synthesizer |
US6511849B1 (en) | 1999-04-23 | 2003-01-28 | The Sir Mortimer B. Davis - Jewish General Hospital | Microarrays of biological materials |
US6143252A (en) * | 1999-04-12 | 2000-11-07 | The Perkin-Elmer Corporation | Pipetting device with pipette tip for solid phase reactions |
DE19919607A1 (de) * | 1999-04-29 | 2000-11-16 | Mets Ion Gmbh Ges Fuer Angewan | Verfahren und Vorrichtung zur parallelen Herstellung von wenigstens 4n Oligonukleotiden |
WO2000066360A1 (en) * | 1999-05-04 | 2000-11-09 | Orchid Biosciences, Inc. | Multiple fluid sample processor with single well addressability |
US6969763B1 (en) | 1999-05-12 | 2005-11-29 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Molecular interaction sites of interleukin-2 RNA and methods of modulating the same |
US20030083483A1 (en) * | 1999-05-12 | 2003-05-01 | Ecker David J. | Molecular interaction sites of vimentin RNA and methods of modulating the same |
US6589791B1 (en) | 1999-05-20 | 2003-07-08 | Cartesian Technologies, Inc. | State-variable control system |
WO2000071559A1 (en) | 1999-05-24 | 2000-11-30 | Invitrogen Corporation | Method for deblocking of labeled oligonucleotides |
WO2000076662A2 (en) * | 1999-06-11 | 2000-12-21 | Orchid Biosciences, Inc. | Microenabled chemical reaction in microfluidic chips |
US6830902B1 (en) | 1999-07-02 | 2004-12-14 | Invitrogen Corporation | Compositions and methods for enhanced sensitivity and specificity of nucleic acid synthesis |
US6346423B1 (en) | 1999-07-16 | 2002-02-12 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and compositions for producing biopolymeric arrays |
AU7078200A (en) | 1999-08-27 | 2001-03-26 | United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services, The | Polypeptides, comprising il-6 ligand-binding receptor domains and related nucleic acids, antibodies, compositions, and methods of use |
US6307004B1 (en) * | 1999-09-20 | 2001-10-23 | General Electric Company | Method for parallel melt-polymerization |
US6171797B1 (en) | 1999-10-20 | 2001-01-09 | Agilent Technologies Inc. | Methods of making polymeric arrays |
US6329210B1 (en) * | 1999-10-29 | 2001-12-11 | Agilent Technologies, Inc. | Method and apparatus for high volume polymer synthesis |
AU2576601A (en) * | 1999-12-08 | 2001-07-03 | Glaxo Group Limited | Novel supports for solid phase synthesis |
US7390459B2 (en) * | 1999-12-13 | 2008-06-24 | Illumina, Inc. | Oligonucleotide synthesizer |
US6800439B1 (en) * | 2000-01-06 | 2004-10-05 | Affymetrix, Inc. | Methods for improved array preparation |
US7316899B2 (en) * | 2000-01-31 | 2008-01-08 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Portable sensor array system |
JP2003527953A (ja) * | 2000-03-22 | 2003-09-24 | デワルチ テクノロジーズ、インコーポレイテッド | 単一容器内での物質の処理方法および器具 |
US20080260593A1 (en) * | 2000-03-22 | 2008-10-23 | Dewalch Norman Binz | Method and apparatus for processing substances in a single container |
WO2001072412A1 (de) * | 2000-03-28 | 2001-10-04 | Laser- Und Medizin-Technologie Gmbh Berlin | Verfahren und vorrichtung zum aufbau und untersuchung von substanzbibliotheken |
ATE380071T1 (de) * | 2000-04-03 | 2007-12-15 | Parabol Technologies S A | Vorrichtung zur abgabe von genau kontrollierten kleinen flüssigkeitsmengen |
US6432365B1 (en) * | 2000-04-14 | 2002-08-13 | Discovery Partners International, Inc. | System and method for dispensing solution to a multi-well container |
US6994827B2 (en) * | 2000-06-03 | 2006-02-07 | Symyx Technologies, Inc. | Parallel semicontinuous or continuous reactors |
CA2697031C (en) * | 2000-07-13 | 2017-10-31 | The Johns Hopkins University School Of Medicine | Detection and treatment of polycystic kidney disease |
US7018589B1 (en) * | 2000-07-19 | 2006-03-28 | Symyx Technologies, Inc. | High pressure parallel reactor |
EP1180548B1 (de) * | 2000-07-31 | 2005-11-02 | Agilent Technologies, Inc. (a Delaware corporation) | Array-basierende Methoden zur Synthese von Nukleinsäuregemischen |
US6900013B1 (en) | 2000-08-25 | 2005-05-31 | Aviva Biosciences Corporation | Methods and compositions for identifying nucleic acid molecules using nucleolytic activities and hybridization |
WO2002016647A1 (en) * | 2000-08-24 | 2002-02-28 | Aviva Biosciences Corporation | Methods and compositions for identifying nucleic acid molecules using nucleolytic activities and hybridization |
US20040185464A1 (en) * | 2000-09-15 | 2004-09-23 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
EP1325323A2 (de) * | 2000-10-13 | 2003-07-09 | Avantium International B.V. | Verfahren und vorrichtung zum screening von polykondensationskatalysatoren |
US6849409B2 (en) * | 2000-10-16 | 2005-02-01 | Axxima Pharmaceuticals Ag | Cellular kinases involved in Cytomegalovirus infection and their inhibition |
US6656740B1 (en) * | 2000-10-31 | 2003-12-02 | Agilent Technologies, Inc. | Pressure variation in array fabrication |
US20080261220A1 (en) * | 2000-11-30 | 2008-10-23 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic Acid Detection Assays |
US6932943B1 (en) | 2001-01-26 | 2005-08-23 | Third Wave Technologies | Nucleic acid synthesizers |
US7435390B2 (en) * | 2001-01-26 | 2008-10-14 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic acid synthesizers |
NL1017374C2 (nl) * | 2001-02-15 | 2002-08-16 | Univ Delft Tech | Inrichting voor het uitvoeren van een reactie, alsmede een werkwijze voor het uitvoeren van een reactie in de inrichting. |
DE10108892B4 (de) * | 2001-02-23 | 2005-08-18 | Graffinity Pharmaceuticals Ag | Synthesevorrichtung und Verfahren zu deren Herstellung |
US7731905B2 (en) | 2001-03-26 | 2010-06-08 | Canon Kabushiki Kaisha | Process for producing probe carrier and apparatus thereof |
US20020136772A1 (en) * | 2001-03-26 | 2002-09-26 | Tai-Nang Huang | Polymer synthesis |
AU2002303159A1 (en) * | 2001-03-26 | 2002-10-08 | Linden Technologies, Inc. | Polymer synthesis |
US6692708B2 (en) * | 2001-04-05 | 2004-02-17 | Symyx Technologies, Inc. | Parallel reactor for sampling and conducting in situ flow-through reactions and a method of using same |
US6867050B2 (en) * | 2001-05-16 | 2005-03-15 | Academia Sinica | Apparatus and methods for chemical synthesis |
WO2002094846A2 (en) * | 2001-05-22 | 2002-11-28 | Parallel Synthesis Technologies, Inc. | Method for in situ, on-chip chemical synthesis |
US6800491B2 (en) | 2001-06-08 | 2004-10-05 | Nalge Nunc International Corporation | Robotic reservoir without liquid hangup |
WO2003004596A1 (fr) * | 2001-07-06 | 2003-01-16 | Precision System Science Co., Ltd. | Recipient de reaction et dispositif de reaction |
US7708946B1 (en) * | 2001-07-19 | 2010-05-04 | Michael Sherman | Device for protein detecting tests |
US6969489B2 (en) * | 2001-08-24 | 2005-11-29 | Cytoplex Biosciences | Micro array for high throughout screening |
US20030044798A1 (en) * | 2001-08-31 | 2003-03-06 | Lefkowitz Steven M. | Methods for generating ligand arrays via deposition of ligands onto olefin displaying substrates, and arrays produced thereby |
US7390463B2 (en) * | 2001-09-07 | 2008-06-24 | Corning Incorporated | Microcolumn-based, high-throughput microfluidic device |
US6974671B1 (en) | 2001-09-12 | 2005-12-13 | Salk Institute For Biological Studies | Methods for indentifying compounds that modulate gluconeogenesis through the binding of CREB to the PGC-1 promoter |
US20030086829A1 (en) * | 2001-10-24 | 2003-05-08 | Livesay Eric A. | High throughput chemical synthesizer |
US6696298B2 (en) | 2001-12-07 | 2004-02-24 | Biosearch Technologies, Inc. | Multi-channel reagent dispensing apparatus |
US20030113937A1 (en) * | 2001-12-14 | 2003-06-19 | 3M Innovative Properties Company | Desiccator system having modular elements |
US6846454B2 (en) * | 2001-12-24 | 2005-01-25 | Agilent Technologies, Inc. | Fluid exit in reaction chambers |
US7282183B2 (en) * | 2001-12-24 | 2007-10-16 | Agilent Technologies, Inc. | Atmospheric control in reaction chambers |
US6783737B2 (en) * | 2002-01-25 | 2004-08-31 | Bristol-Myers Squibb Company | High pressure chemistry reactor |
US7163823B2 (en) * | 2002-01-28 | 2007-01-16 | Nanosphere, Inc. | DNA hybridization device and method |
US6910569B2 (en) | 2002-01-29 | 2005-06-28 | Siemens Technology-To-Business Center, Llc | Load singulation system and method |
US7036653B2 (en) | 2002-01-29 | 2006-05-02 | Siemens Technology-To-Business Center Llc | Load manipulation system |
FR2837726B1 (fr) * | 2002-03-26 | 2005-02-04 | Centre Nat Rech Scient | Dispositif et couvercle permettant l'acces aux echantillons d'une "plaque" d'echantillonage |
US20030186302A1 (en) * | 2002-03-29 | 2003-10-02 | Yixin Wang | Colorectal cancer diagnostics |
US7122159B2 (en) * | 2002-04-29 | 2006-10-17 | Symyx Technologies, Inc. | High pressure parallel reactor with individually sealable vessels |
EP2290368B1 (de) | 2002-05-08 | 2012-12-19 | NorthWest Biotherapeutics, Inc. | Qualitätstests für antigenpräsentierende zellen |
EP1364710B1 (de) * | 2002-05-13 | 2009-10-07 | Becton, Dickinson and Company | Probenplatte mit Verteileraufsatz |
US20030232140A1 (en) * | 2002-06-14 | 2003-12-18 | Joseph Remick | Methods for reagent removal in flow chambers |
US20060045821A1 (en) * | 2002-07-26 | 2006-03-02 | Mckelvy Michael J | Microreactor witii controllable pressure and temperature for in situ material investigations |
US7452712B2 (en) | 2002-07-30 | 2008-11-18 | Applied Biosystems Inc. | Sample block apparatus and method of maintaining a microcard on a sample block |
DE10237704A1 (de) * | 2002-08-09 | 2004-03-11 | Chemogenix Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zum intermolekularen Transfer von Aktivierungsenergie zur Bindungsspaltung durch den Raum |
JP2006504597A (ja) * | 2002-10-29 | 2006-02-09 | シーメンス アクチエンゲゼルシヤフト | 分散形物品操作を行うコンベヤシステム |
DE20219127U1 (de) | 2002-12-10 | 2003-03-06 | MWG-BIOTECH AG, 85560 Ebersberg | Abdeckvorrichtung für Mikrotiterplatten |
US7541152B2 (en) * | 2002-12-24 | 2009-06-02 | Agilent Technologies, Inc. | Integrated light source for diagnostic arrays |
KR100537504B1 (ko) * | 2003-01-20 | 2005-12-19 | 삼성전자주식회사 | 생물학적 시료 내에서의 단백질 검출을 위한 자동화된 유동 시스템 |
US20040191782A1 (en) * | 2003-03-31 | 2004-09-30 | Yixin Wang | Colorectal cancer prognostics |
US7025935B2 (en) * | 2003-04-11 | 2006-04-11 | Illumina, Inc. | Apparatus and methods for reformatting liquid samples |
EP1623010A4 (de) * | 2003-04-25 | 2007-12-26 | Janssen Pharmaceutica Nv | Konservierung von rna in einer biologischen probe |
DE10320871B3 (de) * | 2003-05-09 | 2004-09-16 | Evotec Technologies Gmbh | Probenablageeinrichtung für einen Zellsortierer |
US8409528B2 (en) | 2003-06-19 | 2013-04-02 | Abbott Laboratories | Apparatus and method for handling fluids for analysis |
US20040259100A1 (en) | 2003-06-20 | 2004-12-23 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping |
WO2005003314A2 (en) * | 2003-06-27 | 2005-01-13 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | A method of selecting an active oligonucleotide predictive model |
US7570443B2 (en) | 2003-09-19 | 2009-08-04 | Applied Biosystems, Llc | Optical camera alignment |
US20050221357A1 (en) | 2003-09-19 | 2005-10-06 | Mark Shannon | Normalization of gene expression data |
US20050226779A1 (en) | 2003-09-19 | 2005-10-13 | Oldham Mark F | Vacuum assist for a microplate |
US7417726B2 (en) | 2003-09-19 | 2008-08-26 | Applied Biosystems Inc. | Normalization of data using controls |
US7460223B2 (en) | 2003-09-19 | 2008-12-02 | Applied Biosystems Inc. | Inverted orientation for a microplate |
US20050107909A1 (en) * | 2003-11-14 | 2005-05-19 | Siemens Technology-To-Business Center Llc | Systems and methods for programming motion control |
US20050107911A1 (en) * | 2003-11-14 | 2005-05-19 | Siemens Technology-To-Business Center Llc | Systems and methods for controlling load motion actuators |
US20050065633A1 (en) * | 2003-11-14 | 2005-03-24 | Michael Wynblatt | Systems and methods for relative control of load motion actuators |
US6991311B2 (en) * | 2003-12-12 | 2006-01-31 | Industrial Technology Research Institute | Apparatus and method for introducing micro-volume liquid |
EP1694428A4 (de) * | 2003-12-15 | 2010-10-06 | Life Technologies Corp | Automatisierte oligomersynthese |
US20050186577A1 (en) | 2004-02-20 | 2005-08-25 | Yixin Wang | Breast cancer prognostics |
US20050266432A1 (en) * | 2004-02-26 | 2005-12-01 | Illumina, Inc. | Haplotype markers for diagnosing susceptibility to immunological conditions |
US20060257941A1 (en) * | 2004-02-27 | 2006-11-16 | Mcdevitt John T | Integration of fluids and reagents into self-contained cartridges containing particle and membrane sensor elements |
US20060257854A1 (en) * | 2004-02-27 | 2006-11-16 | Mcdevitt John T | Membrane assay system including preloaded particles |
US20060257991A1 (en) * | 2004-02-27 | 2006-11-16 | Mcdevitt John T | Integration of fluids and reagents into self-contained cartridges containing particle-based sensor elements and membrane-based sensor elements |
US8101431B2 (en) | 2004-02-27 | 2012-01-24 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Integration of fluids and reagents into self-contained cartridges containing sensor elements and reagent delivery systems |
US8105849B2 (en) | 2004-02-27 | 2012-01-31 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Integration of fluids and reagents into self-contained cartridges containing sensor elements |
US7781226B2 (en) * | 2004-02-27 | 2010-08-24 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Particle on membrane assay system |
US20050244984A1 (en) * | 2004-04-28 | 2005-11-03 | Parker Russell A | Methods and compositions for calibrating chemical array readers |
EP2290076B1 (de) | 2004-05-28 | 2015-03-25 | Asuragen, Inc. | Verfahren und Zusammensetzungen mit MicroRNA |
US7702466B1 (en) | 2004-06-29 | 2010-04-20 | Illumina, Inc. | Systems and methods for selection of nucleic acid sequence probes |
ES2507544T3 (es) | 2004-11-12 | 2014-10-15 | Asuragen, Inc. | Procedimientos y composiciones que implican miARN y moléculas inhibidoras de miARN |
WO2006060653A2 (en) * | 2004-11-30 | 2006-06-08 | Veridex Llc | Lung cancer prognostics |
US7977119B2 (en) | 2004-12-08 | 2011-07-12 | Agilent Technologies, Inc. | Chemical arrays and methods of using the same |
KR100624458B1 (ko) * | 2005-01-17 | 2006-09-19 | 삼성전자주식회사 | 휴대용 원심분리기 |
BRPI0607874A2 (pt) * | 2005-04-04 | 2009-10-20 | Veridex Llc | análises de microarranjo e microdissecção a laser de tumores de mama revelam genes relacionados com receptor de estrogênio e vias |
US8377398B2 (en) | 2005-05-31 | 2013-02-19 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Methods and compositions related to determination and use of white blood cell counts |
WO2006138284A2 (en) | 2005-06-15 | 2006-12-28 | Callida Genomics, Inc. | Nucleic acid analysis by random mixtures of non-overlapping fragments |
WO2007033176A2 (en) * | 2005-09-14 | 2007-03-22 | Illumina, Inc. | Continuous polymer synthesizer |
DK2402758T3 (da) | 2005-09-19 | 2014-11-03 | Janssen Diagnostics Llc | Fremgangsmåder og anvendelser til identificering af oprindelsen af et karcinom med ukendt primær oprindelse |
US20070202515A1 (en) * | 2005-10-12 | 2007-08-30 | Pathologica, Llc. | Promac signature application |
US7329860B2 (en) | 2005-11-23 | 2008-02-12 | Illumina, Inc. | Confocal imaging methods and apparatus |
US20070172837A1 (en) * | 2006-01-23 | 2007-07-26 | Kyle Schleifer | Flow cell comprising ports and methods for using the same |
US7995202B2 (en) * | 2006-02-13 | 2011-08-09 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Methods and systems for simultaneous real-time monitoring of optical signals from multiple sources |
US7715001B2 (en) | 2006-02-13 | 2010-05-11 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Methods and systems for simultaneous real-time monitoring of optical signals from multiple sources |
JP2009529880A (ja) * | 2006-03-13 | 2009-08-27 | ベリデックス・エルエルシー | 原発細胞の増殖 |
US7914988B1 (en) | 2006-03-31 | 2011-03-29 | Illumina, Inc. | Gene expression profiles to predict relapse of prostate cancer |
ES2551577T3 (es) | 2006-06-19 | 2015-11-20 | Yeda Research And Development Company Limited | Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína |
EP2115138A2 (de) | 2006-09-19 | 2009-11-11 | Asuragen, Inc. | Bei pankreatischen erkrankungen differentiell exprimierte mikro-rnas und verwendungen davon |
EP2145001A2 (de) | 2006-09-19 | 2010-01-20 | Asuragen, Inc. | Von mir-15, mir-26, mir -31,mir -145, mir-147, mir-188, mir-215, mir-216 mir-331, mmu-mir-292-3p regulierte gene und stoffwechselwege als ziele für einen therapeutischen eingriff |
DE102006035388A1 (de) * | 2006-11-02 | 2008-05-15 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Klassifizierung von Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
DE102006035392A1 (de) | 2006-11-02 | 2008-10-16 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Vorhersage des fünfjährigen progressionsfreien Überlebens von Patienten mit Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
DE102006035393A1 (de) | 2006-11-02 | 2008-05-15 | Signature Diagnostics Ag | Prognostische Marker für die Klassifizierung des dreijährigen progessionsfreien Überlebens von Patienten mit Kolonkarzinomen basierend auf Expressionsprofilen von biologischen Proben |
WO2008089449A2 (en) | 2007-01-19 | 2008-07-24 | Biodot, Inc. | Systems and methods for high speed array printing and hybridization |
US7807109B2 (en) | 2007-05-14 | 2010-10-05 | Freeslate, Inc. | Parallel batch reactor with pressure monitoring |
US7655191B2 (en) * | 2007-05-14 | 2010-02-02 | Symyx Solutions, Inc. | Methods for chemical reactions in a parallel batch reactor |
US20080286170A1 (en) * | 2007-05-14 | 2008-11-20 | Symyx Technologies, Inc. | Parallel batch reactor |
WO2009032084A1 (en) * | 2007-08-28 | 2009-03-12 | Merck & Co., Inc. | Expression profiles of biomarker genes in notch mediated cancers |
US8877141B2 (en) * | 2007-09-06 | 2014-11-04 | Qiagen Sciences Llc | System for preparing arrays of biomolecules |
EP2222851B1 (de) | 2007-11-20 | 2017-06-28 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modulation der cd40-expression |
US8602958B1 (en) * | 2007-11-29 | 2013-12-10 | Life Technologies Corporation | Methods and assemblies for collecting liquid by centrifugation |
US8211370B2 (en) | 2007-12-07 | 2012-07-03 | Thomas Downing | Polymer synthesizer |
EP2237886A1 (de) * | 2007-12-17 | 2010-10-13 | Gong, Hai-Qing | Mikrofluidische vorrichtung |
US20100298163A1 (en) * | 2008-01-04 | 2010-11-25 | The Royal Institution For The Advancement Of Learning/Mcgill University | Microfluidic microarray system and method for the multiplexed analysis of biomolecules |
MX2010008008A (es) * | 2008-01-22 | 2010-08-10 | Veridex Llc | Estadificacion molecular en etapa ii y iii del cancer de colon y pronostico. |
US7932036B1 (en) | 2008-03-12 | 2011-04-26 | Veridex, Llc | Methods of determining acute myeloid leukemia response to treatment with farnesyltransferase |
CN101270332B (zh) * | 2008-04-30 | 2012-05-30 | 广东省人民医院 | 用于细胞或组织培养和处理的装置和方法 |
EP2990487A1 (de) | 2008-05-08 | 2016-03-02 | Asuragen, INC. | Zusammensetzungen und verfahren in zusammenhang mit der mirna-modulation von neovaskularisation oder angiogenese |
JP5892791B2 (ja) | 2008-05-14 | 2016-03-23 | ミレニアム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドMillennium Pharmaceuticals, Inc. | 適応免疫における免疫調節物質の効果をモニターするための方法およびキット |
CN102308004A (zh) | 2008-10-30 | 2012-01-04 | 卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司 | 评价rna图案的方法 |
JP2012508577A (ja) | 2008-11-12 | 2012-04-12 | カリス ライフ サイエンシズ ルクセンブルク ホールディングス | 表現型を決定するためのエキソソームの使用方法およびそのシステム |
US8741581B2 (en) | 2009-04-27 | 2014-06-03 | Technion Research And Development Foundation Ltd. | Markers for cancer detection |
US20110021749A1 (en) * | 2009-07-27 | 2011-01-27 | Demmitt Thomas J | Chemical Plugs used with Automated Organic Polymer Synthesizers |
US9771618B2 (en) * | 2009-08-19 | 2017-09-26 | Bioarray Genetics, Inc. | Methods for treating breast cancer |
AU2010324594B2 (en) | 2009-11-30 | 2016-09-15 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh | Methods and systems for isolating, storing, and analyzing vesicles |
WO2011069200A1 (en) * | 2009-12-09 | 2011-06-16 | Ezygene Pty Ltd | Hyperprimers |
CA2787027A1 (en) | 2010-01-13 | 2011-07-21 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. | Detection of gastrointestinal disorders |
EP2525905B1 (de) | 2010-01-19 | 2020-11-04 | Illumina, Inc. | Verfahren und zusammensetzungen zur verarbeitung chemischer reaktionen |
WO2011102914A2 (en) * | 2010-02-22 | 2011-08-25 | Oligoco | Automated polymer-synthesis system |
US8361396B2 (en) | 2010-02-22 | 2013-01-29 | Oligoco, Inc. | Automated polymer-synthesis system |
AU2011223789A1 (en) | 2010-03-01 | 2012-09-20 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh | Biomarkers for theranostics |
WO2011108930A1 (en) | 2010-03-04 | 2011-09-09 | Interna Technologies Bv | A MiRNA MOLECULE DEFINED BY ITS SOURCE AND ITS DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC USES IN DISEASES OR CONDITIONS ASSOCIATED WITH EMT |
US9469876B2 (en) | 2010-04-06 | 2016-10-18 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh | Circulating biomarkers for metastatic prostate cancer |
EP2388336A1 (de) | 2010-05-19 | 2011-11-23 | Signature Diagnostics AG | Verfahren und Kits zur Diagnostizierung eines kolorektalen Karzinoms |
WO2011146725A1 (en) | 2010-05-19 | 2011-11-24 | Bayer Healthcare Llc | Biomarkers for a multikinase inhibitor |
WO2011159942A1 (en) | 2010-06-18 | 2011-12-22 | Illumina, Inc. | Conformational probes and methods for sequencing nucleic acids |
CA2804599C (en) | 2010-07-06 | 2023-01-31 | Interna Technologies Bv | Mirna and its diagnostic and therapeutic uses in diseases or conditions associated with melanoma, or in diseases or conditions associated with activated braf pathway |
EP2772550B1 (de) | 2010-11-17 | 2017-03-29 | Interpace Diagnostics, LLC | MiRNA als Biomarker zur Unterscheidung zwischen benignen und malignen Thyroid-Neoplasien |
EP2474617A1 (de) | 2011-01-11 | 2012-07-11 | InteRNA Technologies BV | MIR zur Behandlung von Neoangiogenese |
WO2012100205A2 (en) | 2011-01-21 | 2012-07-26 | Biodot, Inc. | Piezoelectric dispenser with a longitudinal transducer and replaceable capillary tube |
WO2012158238A2 (en) | 2011-02-28 | 2012-11-22 | University Of Iowa Research Foundation | Anti-müllerian hormone changes in pregnancy and prediction ofadverse pregnancy outcomes and gender |
EP2520661A1 (de) | 2011-05-02 | 2012-11-07 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Blutbasierte Genexpressionssignaturen bei Lungenkrebs |
EP2527459A1 (de) | 2011-05-02 | 2012-11-28 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Blutbasierte Gendetektion von nichtkleinzelligem Lungenkrebs |
EP2710147A1 (de) | 2011-05-18 | 2014-03-26 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Molekulare analyse von akuter myeloischer leukämie |
EP2524968A1 (de) | 2011-05-19 | 2012-11-21 | Signature Diagnostics AG | Verfahren und Kits zur Diagnostizierung eines kolorektalen Karzinoms |
EP2524967A1 (de) | 2011-05-19 | 2012-11-21 | Signature Diagnostics AG | Verfahren und Kits zur Diagnostizierung eines kolorektalen Karzinoms |
WO2012170936A2 (en) | 2011-06-09 | 2012-12-13 | Illumina, Inc. | Patterned flow-cells useful for nucleic acid analysis |
US9644241B2 (en) | 2011-09-13 | 2017-05-09 | Interpace Diagnostics, Llc | Methods and compositions involving miR-135B for distinguishing pancreatic cancer from benign pancreatic disease |
WO2014153188A2 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Life Technologies Corporation | High efficiency, small volume nucleic acid synthesis |
CN107058059B (zh) | 2011-09-26 | 2020-08-07 | 基因技术股份公司 | 高效的小体积核酸合成 |
WO2013063519A1 (en) | 2011-10-26 | 2013-05-02 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving mirna expression levels for distinguishing pancreatic cysts |
EP2771487A1 (de) | 2011-10-27 | 2014-09-03 | Asuragen, INC. | Mirnas als diagnostische biomarker zur unterscheidung gutartiger von bösartigen tumoren in der schilddrüse |
WO2013063382A2 (en) | 2011-10-28 | 2013-05-02 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
US9827246B2 (en) | 2011-10-28 | 2017-11-28 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers of response to NAE inhibitors |
US20150184246A1 (en) | 2011-11-11 | 2015-07-02 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers of response to proteasome inhibitors |
US9920373B2 (en) | 2011-11-11 | 2018-03-20 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers of response to proteasome inhibitors |
WO2013075065A1 (en) | 2011-11-18 | 2013-05-23 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | 2-hydroxyglutarate as a biomarker for chronic hypoxia |
US8748097B1 (en) | 2011-12-02 | 2014-06-10 | President And Fellows Of Harvard College | Identification of agents for treating calcium disorders and uses thereof |
WO2013087789A1 (en) | 2011-12-13 | 2013-06-20 | Glykos Finland Ltd. | Antibody isoform arrays and methods thereof |
AU2013222414B2 (en) | 2012-02-21 | 2018-02-15 | Cytonics Corporation | Systems, compositions, and methods for transplantation |
US9012022B2 (en) | 2012-06-08 | 2015-04-21 | Illumina, Inc. | Polymer coatings |
EP2870263A1 (de) | 2012-07-03 | 2015-05-13 | InteRNA Technologies B.V. | Diagnoseportfolio und dessen verwendungen |
JP6254944B2 (ja) * | 2012-08-31 | 2017-12-27 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 変形要素内蔵分注チップ、変形要素内蔵分注装置および変形要素内蔵分注処理方法 |
JP6486826B2 (ja) | 2012-10-01 | 2019-03-20 | ミレニアム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドMillennium Pharmaceuticals, Inc. | 阻害剤に対する応答を予測するためのバイオマーカーおよび方法、ならびにそれらの使用 |
WO2014055117A1 (en) | 2012-10-04 | 2014-04-10 | Asuragen, Inc. | Diagnostic mirnas for differential diagnosis of incidental pancreatic cystic lesions |
DK2925888T3 (en) | 2012-11-28 | 2017-12-18 | Merck Sharp & Dohme | COMPOSITIONS AND METHODS OF CANCER TREATMENT |
EP2946345B1 (de) | 2013-01-17 | 2024-04-03 | Personalis, Inc. | Verfahren und system zur phylogenetischen analyse |
US9944992B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-04-17 | The University Of Chicago | Methods and compositions related to T-cell activity |
EP2971149B1 (de) | 2013-03-15 | 2018-05-09 | Baylor Research Institute | Marker für mit colitis ulcerosa (uc) assoziierten kolorektalen neoplasien |
ES2685549T3 (es) | 2013-03-15 | 2018-10-09 | Illumina Cambridge Limited | Nucleósidos o nucleótidos modificados |
EP2971132B1 (de) | 2013-03-15 | 2020-05-06 | Baylor Research Institute | Gewebe- und blutbasierte mirna-biomarker zur diagnose, prognose und vorhersage des metastasepotenzials bei kolorektalkrebs |
US10683536B2 (en) | 2013-04-02 | 2020-06-16 | Molecular Assemblies, Inc. | Reusable initiators for synthesizing nucleic acids |
US8808989B1 (en) | 2013-04-02 | 2014-08-19 | Molecular Assemblies, Inc. | Methods and apparatus for synthesizing nucleic acids |
US9279149B2 (en) | 2013-04-02 | 2016-03-08 | Molecular Assemblies, Inc. | Methods and apparatus for synthesizing nucleic acids |
US11331643B2 (en) | 2013-04-02 | 2022-05-17 | Molecular Assemblies, Inc. | Reusable initiators for synthesizing nucleic acids |
US9771613B2 (en) | 2013-04-02 | 2017-09-26 | Molecular Assemblies, Inc. | Methods and apparatus for synthesizing nucleic acid |
US11384377B2 (en) | 2013-04-02 | 2022-07-12 | Molecular Assemblies, Inc. | Reusable initiators for synthesizing nucleic acids |
US9069358B2 (en) | 2013-06-24 | 2015-06-30 | Biolytic Lab Performance, Inc. | System for controlling and optimizing reactions in solid phase synthesis of small molecules |
PL3017065T3 (pl) | 2013-07-01 | 2019-03-29 | Illumina, Inc. | Funkcjonalizacja powierzchni i szczepienie polimeru bez użycia katalizatora |
WO2015031654A2 (en) | 2013-08-28 | 2015-03-05 | Cytonics Corporation | Systems, compositions, and methods for transplantation and treating conditions |
EP3965111A1 (de) | 2013-08-30 | 2022-03-09 | Personalis, Inc. | Verfahren und system zur genomanalyse |
WO2015051275A1 (en) | 2013-10-03 | 2015-04-09 | Personalis, Inc. | Methods for analyzing genotypes |
MX2016004283A (es) | 2013-10-03 | 2016-10-12 | Oklahoma Med Res Found | Biomarcadores para la actividad, e intesidad y arrebato de la enfermedad lupus eritematoso sistemico. |
US20160304969A1 (en) | 2013-12-17 | 2016-10-20 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Ifn-gamma gene signature biomarkers of tumor response to pd-1 antagonists |
WO2015095291A1 (en) | 2013-12-19 | 2015-06-25 | Illumina, Inc. | Substrates comprising nano-patterning surfaces and methods of preparing thereof |
US10364469B2 (en) | 2014-01-16 | 2019-07-30 | Illumina, Inc | Gene expression panel for prognosis of prostate cancer recurrence |
US10261084B1 (en) | 2014-02-19 | 2019-04-16 | Stc.Unm | Activated GTPase-based assays and kits for the diagnosis of sepsis and other infections |
GB201414098D0 (en) | 2014-08-08 | 2014-09-24 | Illumina Cambridge Ltd | Modified nucleotide linkers |
WO2016026924A1 (en) | 2014-08-21 | 2016-02-25 | Illumina Cambridge Limited | Reversible surface functionalization |
US10040048B1 (en) | 2014-09-25 | 2018-08-07 | Synthego Corporation | Automated modular system and method for production of biopolymers |
WO2016070131A1 (en) | 2014-10-30 | 2016-05-06 | Personalis, Inc. | Methods for using mosaicism in nucleic acids sampled distal to their origin |
WO2016066586A1 (en) | 2014-10-31 | 2016-05-06 | Illumina Cambridge Limited | Novel polymers and dna copolymer coatings |
SG11201704660YA (en) | 2014-12-08 | 2017-07-28 | Berg Llc | Use of markers including filamin a in the diagnosis and treatment of prostate cancer |
WO2016094512A1 (en) | 2014-12-09 | 2016-06-16 | yLIFE TECHNOLOGIES CORPORATION | High efficiency, small volume nucleic acid synthesis |
MX2017007535A (es) | 2014-12-09 | 2017-08-10 | Merck Sharp & Dohme | Sistema y metodos para derivar biomarcadores de firmas geneticas de la respuesta a antagonistas de muerte programada 1 (pd-1). |
EP3283882B2 (de) | 2015-04-17 | 2024-10-16 | Merck Sharp & Dohme LLC | Blutbasierte biomarker der tumorempfindlichkeit gegen pd-1-antagonisten |
ES2945607T3 (es) | 2015-07-17 | 2023-07-04 | Illumina Inc | Láminas de polímero para aplicaciones de secuenciación |
ES2861478T3 (es) | 2016-05-18 | 2021-10-06 | Illumina Inc | Estampación de autoensamblado que utiliza superficies hidrófobas estampadas |
US11299783B2 (en) | 2016-05-27 | 2022-04-12 | Personalis, Inc. | Methods and systems for genetic analysis |
GB2568608B (en) | 2016-05-27 | 2022-10-12 | Personalis Inc | Personalized genetic testing |
AU2017278261A1 (en) | 2016-06-05 | 2019-01-31 | Berg Llc | Systems and methods for patient stratification and identification of potential biomarkers |
EP3568686A4 (de) * | 2017-01-16 | 2020-11-18 | SPI Bio Inc. | Analysevorrichtung und verfahren zur beurteilung eines analyten in einer probe |
WO2018140606A1 (en) | 2017-01-26 | 2018-08-02 | Oklahoma Medical Research Foundation | Biomarkers for systemic lupus erythematosus disease activity, and intensity and flare |
AR111432A1 (es) | 2017-04-28 | 2019-07-10 | Merck Sharp & Dohme | Biomarcadores para agentes terapéuticos contra el cáncer |
WO2018213803A1 (en) | 2017-05-19 | 2018-11-22 | Neon Therapeutics, Inc. | Immunogenic neoantigen identification |
WO2019051430A1 (en) * | 2017-09-11 | 2019-03-14 | Synthego Corporation | METHOD AND SYSTEM FOR BIOPOLYMER SYNTHESIS |
JP2021501594A (ja) | 2017-11-03 | 2021-01-21 | インテアールエヌエー テクノロジーズ ビー.ヴイ.InteRNA Technologies B.V. | ニューロンの欠損に関連する状態及び/又は疾患を処置及び/又は診断するため、或いはニューロンの再生/発生のための、miRNA分子、等価物、アンタゴミル、又はそれらの供給源 |
WO2019109016A1 (en) | 2017-12-01 | 2019-06-06 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Biomarkers and methods for treatment with nae inhibitors |
US20210031201A1 (en) * | 2018-04-15 | 2021-02-04 | Optofluidic Bioassay, Llc | Differential pressure assisted drainage system |
US10801064B2 (en) | 2018-05-31 | 2020-10-13 | Personalis, Inc. | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples |
US11814750B2 (en) | 2018-05-31 | 2023-11-14 | Personalis, Inc. | Compositions, methods and systems for processing or analyzing multi-species nucleic acid samples |
CA3116539C (en) | 2018-10-18 | 2023-10-03 | Oklahoma Medical Research Foundation | Biomarkers for a systemic lupus erythematosus (sle) disease activity immune index that characterizes disease activity |
US11293061B2 (en) | 2018-12-26 | 2022-04-05 | Illumina Cambridge Limited | Sequencing methods using nucleotides with 3′ AOM blocking group |
US20220126285A1 (en) | 2019-02-18 | 2022-04-28 | Ctc Analytics Ag | Fluid delivery device and method for carrying out chemical or biological assays |
US11421271B2 (en) | 2019-03-28 | 2022-08-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing using photoswitchable labels |
WO2020210521A2 (en) | 2019-04-12 | 2020-10-15 | The Regents Of The University Of California | Compositions and methods for increasing muscle mass and oxidative metabolism |
WO2020223576A1 (en) | 2019-04-30 | 2020-11-05 | Chondrial Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for determining effectiveness of frataxin replacement therapy |
US11724261B1 (en) | 2019-05-13 | 2023-08-15 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Synthesizer system with inflatable seal and valve arrangement |
MX2022005327A (es) | 2019-11-27 | 2022-08-04 | Illumina Cambridge Ltd | Tintes y composiciones que contienen ciclooctatetraeno.. |
AU2021290908A1 (en) * | 2020-06-16 | 2023-01-19 | Dna Script | Systems, apparatus and kits for enzymatic polynucleotide synthesis |
EP4168421A1 (de) | 2020-06-22 | 2023-04-26 | Illumina Cambridge Limited | Nukleoside und nukleotide mit 3'-acetal-blockierungsgruppe |
US11666882B2 (en) | 2020-06-26 | 2023-06-06 | Biolytic Lab Performance, Inc. | Bidirectional flow reaction system for solid phase synthesis |
US11473699B2 (en) | 2020-06-26 | 2022-10-18 | Biolytic Lab Performance, Inc | Tubing support system |
US11981964B2 (en) | 2020-07-28 | 2024-05-14 | Illumina Cambridge Limited | Substituted coumarin dyes and uses as fluorescent labels |
WO2022047359A1 (en) | 2020-08-31 | 2022-03-03 | Berg Llc | Protein biomarkers for pancreatic cancer |
US20220195516A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods, systems and compositions for nucleic acid sequencing |
US20220195196A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Alkylpyridinium coumarin dyes and uses in sequencing applications |
US20220195517A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Long stokes shift chromenoquinoline dyes and uses in sequencing applications |
US20220195518A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
WO2022197916A1 (en) * | 2021-03-17 | 2022-09-22 | Illumina, Inc. | Non-contact dispenser assemblies and related systems and methods |
CA3214833A1 (en) | 2021-04-06 | 2022-10-13 | Bpgbio, Inc. | Protein markers for the prognosis of breast cancer progression |
WO2022216841A1 (en) | 2021-04-06 | 2022-10-13 | Berg Llc | Protein markers for estrogen receptor (er)-positive luminal a(la)-like and luminal b1 (lb1)-like breast cancer |
EP4320441A1 (de) | 2021-04-06 | 2024-02-14 | BPGbio, Inc. | Proteinmarker für östrogenrezeptor (er)-positiv- und östrogenrezeptor (er)-negativ-ähnlichen brustkrebs |
AU2022269804A1 (en) | 2021-05-05 | 2023-11-02 | Illumina Cambridge Limited | Fluorescent dyes containing bis-boron fused heterocycles and uses in sequencing |
US20220396832A1 (en) | 2021-05-20 | 2022-12-15 | Illumina Cambridge Limited | Compositions and methods for sequencing by synthesis |
EP4355476A1 (de) | 2021-06-15 | 2024-04-24 | Illumina, Inc. | Hydrogelfreie oberflächenfunktionalisierung zur sequenzierung |
US20230116852A1 (en) | 2021-07-23 | 2023-04-13 | Illumina, Inc. | Methods for preparing substrate surface for dna sequencing |
DE102021121265B4 (de) | 2021-08-16 | 2024-03-07 | Bluecatbio Gmbh | Dispensiervorrichtung, Zentrifuge mit einer solchen Dispensiervorrichtung und Verfahren zum Reinigen von Dispensierdüsen |
CN118355128A (zh) | 2021-10-20 | 2024-07-16 | 因美纳有限公司 | 用于捕获测序用文库dna的方法 |
CA3222807A1 (en) | 2022-03-22 | 2023-09-28 | Alexandra SZEMJONOV | Substrate with orthogonally functional nanodomains |
AU2023246676A1 (en) | 2022-03-28 | 2024-01-18 | Illumina Inc. | Labeled avidin and methods for sequencing |
WO2023186819A1 (en) | 2022-03-29 | 2023-10-05 | Illumina Cambridge Limited | Chromenoquinoline dyes and uses in sequencing |
US20230357851A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-11-09 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring frataxin-replacement therapy |
US20230383342A1 (en) | 2022-05-31 | 2023-11-30 | Illumina Cambridge Limited | Compositions and methods for nucleic acid sequencing |
WO2023240201A1 (en) | 2022-06-08 | 2023-12-14 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring progression and treatment of leigh syndrome |
WO2024003087A1 (en) | 2022-06-28 | 2024-01-04 | Illumina, Inc. | Fluorescent dyes containing fused tetracyclic bis-boron heterocycle and uses in sequencing |
WO2024028794A1 (en) | 2022-08-02 | 2024-02-08 | Temple Therapeutics BV | Methods for treating endometrial and ovarian hyperproliferative disorders |
WO2024039516A1 (en) | 2022-08-19 | 2024-02-22 | Illumina, Inc. | Third dna base pair site-specific dna detection |
AU2023348238A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-10-03 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for reducing photo damage during sequencing |
US20240219835A1 (en) | 2022-12-07 | 2024-07-04 | Illumina, Inc. | Etch-free photoresist patterning in multi-depth nanowells |
US20240247311A1 (en) | 2022-12-22 | 2024-07-25 | Illumina, Inc. | Palladium catalyst compositions and methods for sequencing by synthesis |
AU2023409138A1 (en) | 2022-12-22 | 2024-10-03 | Illumina, Inc. | Transition-metal catalyst compositions and methods for sequencing by synthesis |
US20240271206A1 (en) | 2022-12-27 | 2024-08-15 | Illumina, Inc. | Methods of sequencing using 3' allyl blocked nucleotides |
WO2024206407A2 (en) | 2023-03-29 | 2024-10-03 | Illumina, Inc. | Naphthalimide dyes and uses in nucleic acid sequencing |
WO2024206394A1 (en) | 2023-03-30 | 2024-10-03 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for nucleic acid sequencing |
Family Cites Families (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US458066A (en) * | 1891-08-18 | John r | ||
US4500707A (en) * | 1980-02-29 | 1985-02-19 | University Patents, Inc. | Nucleosides useful in the preparation of polynucleotides |
US4458066A (en) * | 1980-02-29 | 1984-07-03 | University Patents, Inc. | Process for preparing polynucleotides |
US4517338A (en) * | 1983-06-20 | 1985-05-14 | Chiron Corporation | Multiple reactor system and method for polynucleotide synthesis |
DK492788D0 (da) * | 1988-09-02 | 1988-09-05 | Morten Meldal | Peptidsynteseapparat |
US5047524A (en) * | 1988-12-21 | 1991-09-10 | Applied Biosystems, Inc. | Automated system for polynucleotide synthesis and purification |
US5106583A (en) * | 1989-03-08 | 1992-04-21 | Applied Biosystems, Inc. | Automated protein hydrolysis system |
DE4005518A1 (de) | 1990-02-22 | 1991-08-29 | Boehringer Ingelheim Kg | Verfahren und vorrichtung zur simultanen synthese mehrerer polypeptide |
SE9002579D0 (sv) * | 1990-08-07 | 1990-08-07 | Pharmacia Ab | Method and apparatus for carrying out biochemical reactions |
JPH04308600A (ja) | 1991-04-03 | 1992-10-30 | Kokusan Kagaku Kk | ペプチド合成用反応容器およびペプチド合 成用キット |
US6589726B1 (en) * | 1991-09-04 | 2003-07-08 | Metrigen, Inc. | Method and apparatus for in situ synthesis on a solid support |
US5474796A (en) * | 1991-09-04 | 1995-12-12 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US6921636B1 (en) * | 1991-09-04 | 2005-07-26 | Metrigen, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US5378776A (en) * | 1991-12-26 | 1995-01-03 | Nippon Petrochemicals Company, Limited | Method for preparing optical polymer with radial transition in refractive index |
DE4206488C2 (de) * | 1992-03-02 | 1993-12-23 | Deutsches Krebsforsch | Vorrichtung zur Durchführung zeitgleich oder sequentiell ablaufender chemischer Reaktionen |
US5368823A (en) * | 1993-02-11 | 1994-11-29 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Automated synthesis of oligonucleotides |
US5472672A (en) * | 1993-10-22 | 1995-12-05 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Apparatus and method for polymer synthesis using arrays |
US6001311A (en) * | 1997-02-05 | 1999-12-14 | Protogene Laboratories, Inc. | Apparatus for diverse chemical synthesis using two-dimensional array |
JP4308600B2 (ja) | 2003-07-10 | 2009-08-05 | パイロットインキ株式会社 | 水性ボールペン |
-
1993
- 1993-10-22 US US08/142,593 patent/US5472672A/en not_active Expired - Lifetime
-
1994
- 1994-10-19 DE DE69425673T patent/DE69425673T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-10-19 JP JP51219195A patent/JP3677041B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1994-10-19 EP EP94931933A patent/EP0734397B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-10-19 CA CA002174648A patent/CA2174648C/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-10-19 WO PCT/US1994/011936 patent/WO1995011262A1/en active IP Right Grant
- 1994-10-19 EP EP00103594A patent/EP1025902B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-10-19 AT AT94931933T patent/ATE195671T1/de not_active IP Right Cessation
- 1994-10-19 AT AT00103594T patent/ATE261765T1/de not_active IP Right Cessation
- 1994-10-19 DE DE69433635T patent/DE69433635T2/de not_active Expired - Lifetime
-
1995
- 1995-05-30 US US08/453,972 patent/US5814700A/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-05-30 US US08/452,967 patent/US5837858A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-07-13 US US08/502,312 patent/US5529756A/en not_active Expired - Lifetime
-
2002
- 2002-06-12 US US10/171,497 patent/US20030069411A1/en not_active Abandoned
-
2004
- 2004-12-21 US US11/022,377 patent/US20050281719A1/en not_active Abandoned
-
2005
- 2005-02-10 JP JP2005034746A patent/JP3862726B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2005-12-20 JP JP2005366979A patent/JP4182104B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2008
- 2008-07-22 US US12/177,768 patent/US7858364B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2010
- 2010-11-19 US US12/950,335 patent/US8084245B2/en not_active Expired - Fee Related
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE102004047963B4 (de) * | 2004-04-01 | 2006-12-28 | Korea Advanced Institute Of Science & Technology | Mikrofluidischer Chip für Hochdurchsatz-Screening und Hochdurchsatz-Assay |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20030069411A1 (en) | 2003-04-10 |
EP1025902A3 (de) | 2000-10-18 |
WO1995011262A1 (en) | 1995-04-27 |
JP3677041B2 (ja) | 2005-07-27 |
CA2174648C (en) | 2007-04-17 |
JP2005187821A (ja) | 2005-07-14 |
US5472672A (en) | 1995-12-05 |
JPH09507505A (ja) | 1997-07-29 |
DE69425673D1 (de) | 2000-09-28 |
ATE195671T1 (de) | 2000-09-15 |
JP3862726B2 (ja) | 2006-12-27 |
JP4182104B2 (ja) | 2008-11-19 |
EP1025902B1 (de) | 2004-03-17 |
EP0734397B1 (de) | 2000-08-23 |
EP1025902A2 (de) | 2000-08-09 |
JP2006206883A (ja) | 2006-08-10 |
US5529756A (en) | 1996-06-25 |
US20110124529A1 (en) | 2011-05-26 |
US20050281719A1 (en) | 2005-12-22 |
EP0734397A1 (de) | 1996-10-02 |
US7858364B2 (en) | 2010-12-28 |
US5814700A (en) | 1998-09-29 |
EP0734397A4 (de) | 1997-04-02 |
US20090054605A1 (en) | 2009-02-26 |
DE69433635D1 (de) | 2004-04-22 |
US8084245B2 (en) | 2011-12-27 |
DE69433635T2 (de) | 2005-02-17 |
CA2174648A1 (en) | 1995-04-27 |
ATE261765T1 (de) | 2004-04-15 |
US5837858A (en) | 1998-11-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DE69425673T2 (de) | Gerät und verfahren zur polymersynthese mit gerüsten | |
US6143252A (en) | Pipetting device with pipette tip for solid phase reactions | |
DE69233331T3 (de) | Kombinatorische Strategien zur Polymersynthese | |
DE19950809B4 (de) | Verfahren und Vorrichtung für eine Flüssigkeitsübertragung | |
US4483964A (en) | Reactor system and method for polynucleotide synthesis | |
EP1461147B1 (de) | Reagenzdosierapparatur mit multiplen kanälen sowie dosierverfahren | |
DE10393406T5 (de) | Parallele Beladung von Arrays | |
DE60103782T2 (de) | Vorrichtung und Verfahren zur Übertragung von Flüssigkeiten | |
EP2065702B1 (de) | Mikrofluidisches Extraktionsverfahren | |
DE3789812T2 (de) | Poröser wafer zur segmentierten herstellung von bipolymeren. | |
DE3415014A1 (de) | Vorrichtung zur synthese chemischer verbindungen | |
EP0963246B1 (de) | Vorrichtung für eine automatisierte chemische synthese | |
DE10308931A1 (de) | System und Verfahren zur Synthese von Polymeren | |
DE19642777A1 (de) | Reaktor für mikrochemische bzw. mikrobiologische Synthesen | |
Brennan | Method for polymer synthesis in a reaction well | |
WO2003000403A2 (de) | Vorrichtung zur gleichzeitigen multiplen und hochparallelen synthese | |
DE69711663T2 (de) | Umkehrfiltrationsvorrichtung sowie anwendungsverfahren |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
8364 | No opposition during term of opposition |