CN1701122A - Pim-1激酶的晶体结构 - Google Patents
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Abstract
说明了用X-射线晶体学确定的PIM-1的晶体结构。应用PIM-1晶体和结构信息可以,例如,被用于鉴定分子构架和开发结合并且调控PIM-1和其它的PIM激酶的配基。
Description
发明背景
[0001]本发明涉及针对PIM-1的配基的开发领域,也涉及PIM-1的晶体结构的应用领域。
[0002]PIM-1原癌基因(PIM-1 proto-oncogene),起初被鉴定为经常由莫洛尼鼠白血病病毒的原病毒插入到鼠T细胞淋巴瘤中而被激活的一个基因座位(Cuypers,H.T.,Selten,G.,Quint,W.,Zijlstra,M.,Maandag,E.R.,Boelens,W.,van Wezenbeek,P.,Melief,C.,and Bems,A.(1984)Murine leukemia virus-induced T-celllymphomagenesis:integration of proviruses in a distinct chromosomal region.Cell37:141-150)。PIM-1原癌基因也被认为牵涉于人类的造血恶性肿瘤疾病中,由于在人造血细胞系中以及在来自白血病病人的新鲜肿瘤细胞中,频繁地检测到它的过量表达(overexpression)。(Nagarajan L,Louie E,Tsujimoto Y,ar-Rushdi A,Huebner K,and Croce CM.(1986)Localization of the human PIM oncogene(PIM)to aregion of chromosome 6 involved in translocations in acute leukemias.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:2556-2560;Meeker TC,Nagarajan L,ar-Rushdi A,Rovera G,Huebner K,and Croce CM.(1987)Characterization of the human PIM-1 gene:a putativeproto-oncogene coding for a tissue specific member of the protein kinase family.Oncogene Res.1:87-101;Amson R,Sigaux F,Przedborski S,Flandrin G,Givol D,andTelerman A.(1989).The human proto-oncogene product p33PIM is expressed duringfetal hematopoiesis and in diverse leukemias.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:8857-8861)。
[0003]目前已知,在人和鼠中,原癌基因中的PIM家族包括至少三个成员,它们编码高度相关的丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶(Saris CJ,Domen J,and Bems A.(1991)The PIM-1oncogene encodes two related protein-serine/threonine kinases byalternative initiation at AUG and CUG.EMBOJ.10:655-664;Eichmann A,Yuan L,Breant C,Alitalo K,and Koskinen PJ.(2000)Developmental expression of PIM kinasessuggests functions also outside of the hematopoietic system.Oncogene 19:1215-1224)。这三种激酶(PIM-1,PIM-2和PIM-3)的功能在小鼠中似乎是相互补充的,因为,缺失PIM家族蛋白基因的一个时,并不能导致任何严重的缺陷(LairdPW,van der Lugt NM,Clarke A,Domen J,Linders K,McWhir J,Bems A,Hooper M.(1993)In vivo analysis ofPIM-1 deficiency.Nucl.Acids Res.21:4750-4755)。在胚胎发育期间,PIM基因,在免疫系统和中枢神经系统的细胞中,以及在上皮中,以部分重叠的模式进行表达(Eichmann A,Yuan L,Breant C,Alitalo K,and Koskinen PJ.(2000)Developmental expression of PIM kinases suggests functions also outside of thehematopoietic system.Oncogene 19:1215-1224)。PIM-1,即PIM家族的原型成员,定位于胞质和细胞核中,但是,目前还没有完全阐明它在这两个位置中的确切作用。
[0004]携带有通过Emu增强子序列驱动的PIM-1转基因小鼠,证明PIM-1以一个弱的癌基因发挥作用,这是因为其自身并不能导致肿瘤形成;但是当第二个癌基因过表达时,会导致形成肿瘤。在75%的过表达PIM-1的肿瘤中,已经发现过表达的第二个基因是c-myc(van der Houven van Oordt CW,Schouten TG,van KriekenJH,van Dierendonck JH,van der Eb AJ,Breuer ML.(1998)X-ray-inducedlymphomagenesis in E mu-PIM-1 transgenic mice:an investigation of the co-operatingmolecular events.Carcinogenesis 19:847-853)。实际上,当在Emu-PIM转基因小鼠和Emu-myc转基因小鼠之间进行杂交时,基因的此种组合是具有癌基因性质的,后代由于前B细胞淋巴瘤的缘故而在子宫中死亡(Verbeek S,van Lohuizen M,vander Valk M,Domen J,Kraal G,and Bems A.(1991)Mice bearing the Emu-myc andEmu-PIM-1 transgenes develop pre-B-cell leukemia prenatally.Mol.Cell,Biol.,11:1176-1179).
[0005]PIM-1缺陷的小鼠,表现出正常的突触传递和短期的可塑性,但是不能整合持久的LTP,尽管PIM-2和PIM-3在海马中有表达。(Konietzko U,Kauselmann G,Scafidi J,Staubli U,Mikkers H,Bems A,Schweizer M,Waltereit R,and Kuhl D.(1999)PIM kinase expression is induced by LTP stimulation and required for the consolidationof enduring LTP.EMBO J.18:3359-3369)。
[0006]已知有各种不同的因子可以在小鼠和人中增强PIM-1激酶的转录。在触发导致转化和凋亡的胞内信号中,以及选择性抑制导致Bcl-2的凋亡信号通路中,PIM-1与另外一种癌蛋白,即c-myc,相互密切地进行协作(van Lohuizen M,VerbeekS,Krimpenfort P,Domen J,Saris C,Radaszkiewicz T,and Bems A.(1989)Predisposition to lymphomagenesis in PIM-1 transgenic mice:cooperation with c-mycand N-myc in murine leukemia virus-induced tumors.Cell 56:673-682;Breuer ML,Cuypers HT,Bems A.(1989).Evidence for the involvement of PIM-2,a new commonproviral insertion site,in progression of lymphomas.(PIM-2也涉及在淋巴瘤发展的证据,是一个新的常见的原病毒插入位点).EMBO J.8:743-748;Verbeek S,vanLohuizen M,van der Valk M,Domen J,Kraal G,and Bems A.(1991)Mice bearing theE mu-myc and E mu-PIM-1transgenes develop pre-B-cell leukemia prenatally.Mol.Cell.Biol.11:1176-1179;Shirogane T,Fukada T,Muller JM,Shima DT,Hibi M,andHirano T.(1999)Synergistic roles for PIM-1 and c-Myc in STAT3-mediated cell cycleprogression and antiapoptosis.Immunity,11:709-719)。PIM-1激酶是通过T细胞抗原受体与细胞因子和生长因子交联以及由促有丝分裂素(包括IL2,IL3,IL6,IL9,IL12,IL15,GM-CS F,G-CS F,IFNa,INFg,催乳素,ConA,PMA)以及抗CD3抗体来诱导的(Zhu N,Ramirez LM,Lee RL,Magnuson NS,Bishop GA,and GoldMR.(2002)CD40 signaling in B cells regulates the expression of the PIM-1kinase viathe NF-kappa B pathway.J Immunol.168:744-754)。在细胞因子刺激后,PIM-1的表达是被快速诱导的;对于细胞因子的增殖性应答,在来自PIM-1缺陷小鼠的细胞中受到损害。(Domen J,van der Lugt NM,Acton D,Laird PW,Linders K,BemsA.(1993)PIM-1 levels determine the size of early B lymphoid compartments in bonemarrow.J.Exp.Med.178:1665-1673)。
[0007]最近,已经有报道说,激酶中的PIM家族与Socs-1蛋白相互作用,其中Socs-1蛋白是JAK激活的一种强有力的抑制剂,因而在细胞因子受体的信号途径的下游起主要作用。激酶中的PIM家族对Socs-1所进行的磷酸化,延长了Socs-1蛋白的半寿期,因此强化了Socs-1对JAK-STAT激活作用的抑制效应(Chen XP,Losman JA,Cowan S,Donahue E,Fay S,Vuong BQ,Nawijn MC,Capece D,CohanVL,Rothman P.(2002)PIM serine/threonine kinases regulate the stability of Socs-1protein.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 99:2175-2180.)。PIM-1是在细胞周期的Gl/S期被表达的,表明它涉及细胞周期的调控(Liang H,Hittelman W,Nagarajan L.,Ubiquitous expression and cell cycle regulation of the protein kinase PIM-1.(1996)Arch Biochem Biophys.330:259-265)。PIM-1激酶的活性以及蛋白水平,在CD 40介导的B细胞信号通路中增强;并且PIM-1水平的增加是通过NF-kB的活化来介导的(Zhu et al.2002.supra)。PIM-1可以,在Jurkat细胞中,与增强NFATc依赖性反式激活和IL2产生的NPATc转录因子进行物理性地相互作用。(Rainio EM,Sandholm J,Koskinen PJ.(2002)Cutting edge:Transcriptional activity of NFATc 1 isenhanced by the PIM-1kinase.J.Immunol.168:1524-1527)。这表明,一种新型靶向NFATc1的磷酸化依赖性调控机制,通过该机制,PIM-1以ras的下游效应物来发挥作用,促进淋巴细胞的IL2依赖性增殖和生存(同上,Id.)。
[0008]已经表明PIM-1与很多其它的靶分子进行相互作用。c-myc的一种直接转录靶物质,即Cdc25A磷酸酯酶的磷酸化作用,在体内和体外均增强了它的磷酸酯酶活性,这表明:在细胞转化和凋亡中,Cdc25A与PIM-1和c-myc相互关联(Mochizuki T,Kitanaka C,Noguchi K,Muramatsu T,Asai A,and Kuchino Y.(1999)Physical and functional interactions between PIM-1 kinase and Cdc25A phosphatase.Implications for the PIM-1-mediated activation of the c-Myc signaling pathway;J.Biol.Chem.274:18659-18666)。PIM-1也磷酸化PTP-U2S,其是一种在髓样细胞中与分化和凋亡相关的酪氨酸磷酸酯酶,通过磷酸化作用降低了它的磷酸酯酶活性,并且因此阻止了PMA-诱导的分化之后的细胞凋亡的过早起始。(Wang et al.(2001)Pim-1 negatively regulates the activity of PTP-U2S phosphatase and influences terminaldifferentiation and apoptosis of monoblastoid leukemia cells.Arch.Biochem.Biophys.390:9-18)。PIM-1对P100(c-myb的一种共激活剂)的磷酸化作用(Weston,1999,Reassessing the role ofC-MYB in tumorigenesis.Oncogene 18:3034-3038)涉及到转录的Ras-依赖性调控(Leverson JD,Koskinen PJ,Orrico FC,Rainio EM,Jalkanen KJ,Dash AB,Eisenman RN,and Ness SA.(1998)PIM-1kinase and plOO cooperate toenhance c-Myb activity.Mol.Cell.1:417-425)。已经表明,PIM-1的另一个靶分子,即异染色质蛋白1(heterpchromatin protein 1,HP1)的磷酸化作用,涉及转录抑制作用(Koike N,Malta H,Taira T,Ariga H,Iguchi-Ariga SM.(2000)Identification ofheterochromatin protein 1(HP1)as a phosphorylation target by PIM-1 kinase and theeffect of phosphorylation on the transcriptional repression function of HP-1(1).FEBSLett.467:17-21)。
[0009]认为以上所提供的信息仅仅在于帮助读者的理解。在所提供的信息或者所引用的参考文献中,没有一个被认为是相对于本发明的现有技术。
发明概述
[0010]本发明涉及PIM激酶,(如,PIM-1,PIM-2,和PIM-3),含有或者不含有结合化合物的PIM激酶的晶体,关于PIM激酶的结构信息,以及应用PIM激酶和关于PIM激酶的结构信息来开发PIM配基。
[0011]因此,在第一方面中,本发明提供了一个用于得到结合PIM激酶(如,PIM-1,PIM-2,PIM-3)的改良配基的方法,其中所述方法涉及到确定一种化合物的衍生物是否,以比该母体结合化合物更大的亲和性或者更大的特异性或者两者,与PIM激酶结合,其中该化合物结合PIM-1激酶并且与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的一个或者多个相互作用。与母体化合物相比,具有更大的亲和性或者更大的特异性或者两者均有的结合说明了该衍生物是一种改良的配基(improved ligand)。该过程也可以通过连续轮次的选择和衍生化实施,和/或应用多个母化合物来进行,从而得到具有改良配基性质的一个化合物和多个化合物。同样地,可以测试并且选择衍生化合物,以便对于PIM激酶有高的选择性,或者得到对于特定的一套靶物质包括PIM激酶(如PIM-1)有交叉反应性,例如,对于多数的PIM激酶,诸如PIM-1、PIM-2和PIM-3的两种或者更多种的任何组合。
[0012]术语“PIM激酶(PIM kinase)”或者“PIM家族激酶(PIM family kinase)”是指,相对于来自同一个物种的PIM-1的氨基酸序列,具有大于45%的氨基酸序列同一性的蛋白激酶,包括PIM-1、PIM-2、和PIM-3。除非明确地指明是对立面,应用术语“PIM激酶”构成对PIM激酶的组群中的任意一个的指代,特别地,包括对PIM-1、PIM-2、和PIM-3中的每一个的单独指代。
[0013]正如在此所应用的,术语“配基(ligand)”和“调节剂(modulator)”是指调节靶生物分子活性的化合物,如,靶生物分子是酶,例如激酶。一般情况下,配基或者调节剂是一个小分子,其中“小分子”是指分子量是1500道尔顿或者更小的化合物,或者优选地,1000道尔顿或者更小,800道尔顿或者更小,或者,600道尔顿或者更小。因此,“改良配基(improved ligand)”是指,相比于参照化合物,具有较好的药理学和/或药物动力学特性的配基,其中“较好(better)”可以由人对特定的生物学系统或者治疗用途进行定义。
[0014]在结合化合物(binding compounds)、分子架构(molecular scaffolds)和配基(ligands)的语境中,术语“衍生物(derivative)”或者“衍生化合物(derivativecompound)”是指具有一定化学结构的化合物,其含有与母体化合物或者参照化合物共有的核心化学结构,但是由于具有至少一个结构上的差异而不同,例如,具有一个或者多个取代基的加入和/或去除和/或取代,和/或具有用不同的原子进行取代的一个或者多个原子。除非明确指向相反情况,术语“衍生物”并不指用母体化合物作为起始物或者中间物来合成的衍生物,尽管在一些情况下,衍生物可以从母分子合成得到。
[0015]因此,术语“母体化合物(parent compound)”是指另一化合物的参照化合物,它将结构特征延续在衍生物化合物中。一般情况下,虽然并非总是如此,母体化合物比衍生物具有简单的化学结构。
[0016]“化学结构(chemical structure)”或者“化学亚结构(chemical substructure)”是指任何可以定义的原子或者原子团,其组成了分子的一个部分。通常而言,架构或者配基的化学亚结构,在架构和配基与靶分子结合中,担当一定角色;或者可以影响架构或配基的三维形状,静电电荷,和/或构象特性。
[0017]术语“结合(binds)”,与靶分子和潜在的结合化合物相互作用相联系,是指与一般蛋白的缔合(即是,非特异性的结合)相比,潜在的结合化合物与靶分子的缔合达到统计学上的显著程度。因此,术语“结合化合物(binding compound)”是指与靶分子的结合具有统计学显著性的化合物。优选地,结合化合物与特异化靶分子相互作用,其解离常数(Kd)为1mM或者更低。结合化合物可以以“低亲和性”,“很低亲和性”,“极低亲和性”,“中度亲和性”,“中高度亲和性”,或者“高亲和性”进行结合,如在此所述。
[0018]在化合物结合于靶分子的语境下,术语“较高亲和性(greater affinity)”是指该化合物比参照化合物更紧密地结合,或者在参考条件下,比相同化合物的结合更紧密,也就是,具有较低的解离常数。在特定的实施方案中,较高的亲和性是至少2,3,4,5,8,10,50,100,200,400,500,1000,或者10,000-倍高的亲和性。
[0019]同样地,在化合物结合生物分子靶的语境下,术语“较高特异性(greaterspecificity)”是指一个化合物结合特异靶分子的程度高于另一个生物分子或者另一些生物分子,另一个生物分子或者另一些生物分子在相关的结合条件下可能存在,其中,与特异靶分子的结合相比,与这些其它的生物分子的结合产生了不同的生物活性。典型地,特异性是参照于有限的一组其它生物分子,如,对于PIM-1,其它激酶或者其它类型的酶。在特定的实施方案中,较高特异性是至少2,3,4,5,8,10,50,100,200,400,500,或者1000倍高的特异性。
[0020]正如在化合物与PIM激酶如PIM-1的结合相关联中所应用的,术语“相互作用(interact)”是指从被结合化合物到特定氨基酸残基的距离是5.0埃或者更小。在特定的实施方案中,化合物与特定氨基酸残基的距离是4.5埃或者更小,4.0埃或者更小,或者3.5埃或者更小。例如,应用共-晶体学,或者应用化合物在PIM活性位点上的计算机拟合进行估计,可以确定这样的距离。
[0021]参照在PIM-1多肽中的特定氨基酸残基,多肽残基数目的确定通过在Meeker,T.C.,Nagarajan,L.,ar-Rushdi,A.,Rovera,G.,Huebner,K.,Corce,C.M.;(1987)Characterization of the human PIM-1 gene:a putative proto-oncogene coding fora tissue specific member of the protein kinase family.Oncogene Res.1:87-101中的方法计数得到,与SEQ ID NO:1中提供的序列一致。PIM-2在Baytel et al.(1998)Thehuman Phn-2 proto-oncogene and its testicular expression,Biochim.Biophys.Acta1442,274-285中有说明。来自大鼠的PIM-3在Feldman,et al.(1998)KID-1,aprotein kinase induced by depolarization in brain,J.Biol.Chem,273,16535-16543和Kinietzko et al.(1999)Pim kinase expression is induced by LTP stimulation andrequired for the consolidation of enduring LTP,EMBO J.18,3359-3369中有说明(KID-1与PIM-3相同)。在此提供了人PIM-3的核酸和氨基酸序列。
[0022]在一个相关的方面,本发明提供了方法,用于开发对于PIM激酶如PIM-1特异的配基,其中该方法包括确定结合多数个激酶的一种化合物的衍生物,是否对于特定PIM激酶,具有比母体化合物更高的特异性。
[0023]正如在此应用的,与化合物或者配基的结合作用相联系,术语“对于PIM激酶特异的(specific for a PIM kinase)”,“对于PIM-1特异的(specific for PIM-1)”以及类似意思的术语,是指,特定的化合物结合特定的PIM激酶,达到统计学上的程度高于可能存在于特定生物体中的其它激酶。同样地,当说明非结合作用活性的生物学活性时,术语“对PIM激酶的特异性(specific for a PIM kinase)”说明特定化合物具有,相比其它激酶,与特定PIM激酶结合相关的更高生物学活性。优选地,针对其它生物分子(并不限于激酶)的特异性可能存在于一种生物体中。也可以是选择特定的化合物,它“对于PIM激酶是特异的”,这说明它结合和/或具有比其它激酶更高的结合多数个PIM激酶的生物活性。
[0024]在另一方面,本发明关于开发结合PIM激酶,如PIM-1的配基的方法,其中该方法包括将结合至PIM激酶的一个结合位点的一种或者多种化合物鉴定为分子架构;确定与PIM激酶共结晶的至少一个分子架构的定向;鉴定一个或者多个分子架构的化学结构,即,当经过修饰发生变化以后,改变了分子架构和PIM激酶之间的结合亲和性或者结合特异性或者两种均有;并且合成配基,修饰其中的分子架构的一个或者多个化学结构,来得到具有改变结合亲和性或结合特异性或者两者均有的结合PIM激酶的配基。由于PIM-1和其它的PIM激酶高程度的序列同一性,PIM-1也可以被用作代用品,或者被用在同源模式中,确定定向使得可以鉴定化学结构,可以修饰该结构以便得到改良的配基。
[0025]借助“分子架构(molecular scaffold)”,是指一个核心分子(core molecule),其可以共价结合、修饰、或者除去一个或者更多个的另外的化学部分来形成具有共同结构要素的多数个分子。该化学部分可以包括,但不限于,卤素原子,羟基,甲基,硝基,羧基,或者其它类型的分子基团,包括,但不限于,在该申请中叙述的那些。分子架构结合于至少一个靶分子,靶分子可以优选地是一种蛋白或者酶。架构的优选特征可以包括在靶分子的结合位点上的结合,以便在架构上的一个或者多个取代基被置于靶分子结合位点的结合口袋中;具有化学地易处理结构,其可以被化学修饰,特别地,通过合成反应进行化学修饰,如此以致可以很容易地构建组合文库(combinatorial library);具有化学部位,组成部分可以连接于此,但其并不妨碍架构结合于蛋白结合位点,以便这样的架构或者文库成员可以经过修饰来实现另外所需的特征,如,使得配基可以活跃地转移到细胞中和/或至特异的器官,或者使得配基可以结合到层析柱上,以便进行另外的分析。
[0026]“结合位点(binding site)”是指靶分子上配基可以非共价结合的区域。结合位点具有特异的形状,并且经常含有存在于结合位点之内的多个结合口袋。对于一类分子,特定形状一般常常是保守的,如分子家族。在这一类分子中的结合位点中也含有保守结构,例如,在结合位点或者结合位点的某些部分中的化学组成成分,结合口袋的存在,和/或静电电荷。它们均可以影响结合位点的形状。
[0027]“结合口袋(binding pocket)”是指在结合位点之内的特定体积(specificvolume)。结合口袋时常是位于结合位点中的一个特定形状,凹入处或者腔隙。结合口袋可以含有特定的化学基团或者结构,这对于非共价结合另外的分子如,赋予分子之间的离子键、氢键或者范得华力重要的基团。
[0028]“定向(orientation)”,参照结合于靶分子的结合化合物,是指结合化合物和它的组成原子中的至少一些与结合口袋和/或靶分子的至少部分地限定结合口袋的原子之间的空间关系。
[0029]“共-结晶物(co-crystals)”是指非共价结合于靶分子的化合物、分子架构、或者配基构成的复合物,并且以适于X-射线分析或者蛋白质晶体学分析的晶体形式存在。在优选的实施方案中,靶分子-配基复合物可以是蛋白-配基复合物。
[0030]短语“改变结合亲和性或者结合特异性(alter the binding affinity or bindingspecificity)”是指改变第一化合物对另一个化合物的结合常数,或者改变第一化合物结合第二化合物的结合水平,与第一化合物与第三化合物结合水平分别进行比较。例如,如果,与该种化合物和无关蛋白的结合作用相比,对特定蛋白的结合作用的相对水平得以增加,那么化合物对特定蛋白的结合特异性就得以增加。[0031]正如在此所应用的,与测试化合物、结合化合物、和调节剂(配基)相联系,术语“合成(synthesizing)”以及类似术语是指从一种或者更多种前体物质进行的化学合成。
[0032]短语“分子架构的化学结构被修饰(chemical structure of the molecularscaffold is modified)”是指衍生物分子具有不同于分子架构的一个化学结构,但是仍然含有共同的核心化学结构特征。该短语并不一定是指在合成衍生物中应用分子架构作为前体。
[0033]“检测(assaying)”是指建立实验条件,并且收集有关该实验条件下的特定结果的数据。例如,酶可以被基于它们可以作用于可检测底物的能力予以检测。化合物或者配基可以被基于它们可以结合特定的靶分子或者分子的能力予以分析。
[0034]已经鉴定为PIM-1抑制剂的化合物,其先前被认为是abl抑制剂(bcr-abl或者c-abl)。这些化合物包括甲磺酸伊马替尼(imatinib mesylate(GleevecTM))和相关的2-苯基胺嘧啶化合物,和如在实施例14中所示的化合物吡啶-[2,3-d]嘧啶化合物。来自这一组的化合物可以用于治疗与PIM-1相关的疾病的方法,如与PIM-1相关的癌症,应用这些化合物调控PIM-1的方法,以及开发来自这些化合物的衍生物为PIM-1调节剂的方法,例如,在此所述应用晶体结构的方法。这些化合物以及用于制备这些化合物的方法在PCT/EP94/03150,WO 95/09847;U.S.专利5,543,520;U.S.专利5,521,184;U.S.专利5,516,775;U.S.专利5,733,914;U.S.专利5,620,981;U.S.专利5,733,913;U.S.专利5,945,422;以及U.S.专利5,945,422中有说明。这些参考文献的每一个以其整体而一概包括于此。
[0035]另外,已经鉴定了某些化合物是PIM-1的分子架构和结合化合物。因此,在另一方面,本发明提供了方法用于鉴定结合于PIM-1的配基,其包括确定包括选自在此说明的式I、式II、和式III组的核心结构的衍生化合物是否,以与母体化合物相比,改变的结合亲和性或者特异性或者两者结合于PIM-1。
[0036]关于式I、式II、和式III的化合物,术语“核心结构(core structure)”是指用图表显示的环状结构,是式I、式II、和式III的化合物的描述的组成部分,但不包括取代基。更一般地,术语“核心结构”是指对于一套化合物而言具有特征性的共同的化学结构,尤其是,在该套化合物中,携带有不同的取代基的化学结构。在式I、II、和III中,核心结构包括一个环或者稠合环状结构。
[0037]一“套(set)”化合物是指化合物的一个汇合。该类化合物可以是,也可以不是结构上相关的。
[0038]在另一方面,通过从PIM-1结构的电子表示(electronic representation)创建同源模型,关于PIM-1的结构信息也可以用于帮助确定另一个激酶的结构。
[0039]典型地,建立这样的同源模型涉及鉴定在PIM-1和其它感兴趣激酶之间的保守氨基酸残基,转移在PIM-1结构中的多数个保守氨基酸的原子坐标到另外的一些激酶的相对应氨基酸而提供该激酶的粗略结构;并且应用在其它激酶中的残余氨基酸残基的结构的电子表示,构建代表其它激酶的残余物的结构。特别地,对于保守残基,可以应用来自表1的坐标。在结合位点中,可以应用保守的残基,如,可以应用PIM-1的残基49,52,65,67,121,128,和186。
[0040]为了辅助显现激酶结构的其它部分,同源模型也可以利用,或者进行数据拟合,应用来自激酶的一个或者更多个晶体的低分辨率x-射线衍射数据,如,辅助用在连接保守残基中和/或辅助用于一个多肽的末端部分的更好地确定坐标。
[0041]所应用的PIM-1结构信息,可以是不同PIM-1变异体的各种类型,包括全长的野生型,天然产生的变异体(如,等位基因变异体和剪接变异体),野生型或者天然产生变异体的截短型变异体,以及全长或者截短的野生型突变体或者天然产生突变体(其可以在一个或者多个位点被突变)。例如,为了得到与其它激酶结构的各种类型接近的PIM-1结构,可以应用包括P123M(在123位残基,用甲硫氨酸取代脯氨酸)突变的经突变PIM-1,其中所述P123M突变可以是唯一的突变,或者也可以有多数个突变。
[0042]在另一方面,本发明提供了PIM-1的晶形,例如,具有如表1中所述的原子坐标。晶形可以包括一个或者多个重金属原子,例如,用于X-射线晶体学的原子。结形也可以包括处于共-结晶物中的结合化合物,例如,与一个或者更多个PMI-1残基49,52,65,67,121,128和186或者任意两个,任意三个,任意四个,任意五个,任意六个,或者所有这些残基相互作用的结合化合物,并且可以,例如,是式I,式II或者式III的化合物。PIM-1结晶可以是在不同的环境下,例如,在晶体学的板中,用于在X-射线晶体学中安装和/或在X射线电子束中。PIM-1可以是不同的形式,如野生型,变异体,截短型,和/或在此说明的突变体形式。
[0043]本发明进一步关于PIM-1的共结晶物和PIM-1结合化合物。有利地,该共结晶物具有足够的大小和质量,使PIM-1的结构确定成为可能,大小至少为3埃,2.5埃,或者2.0埃。该共结晶物可以,例如,在晶体学的板中,被装配用于X-射线晶体学,和/或在X射线电子束下。这样的共晶可以便于,例如,得到关于PIM-1和结合化合物相互作用的结构信息。
[0044]PIM-1结合化合物可以包括与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的至少一个,或者这些残基中任何2,3,4,5,6,或者7个相互作用的化合物。结合PIM-1的示范性化合物包括式I,式II或者式III的化合物。
[0045]同样地,在另外的方面,提供了得到PIM-1晶体和共结晶物的方法。一方面,提供了方法用于得到PIM-1的晶体,通过将浓度在5-20mg/ml的PIM-1蛋白置于结晶条件下,基本上与Hampton Screen 1的条件2,7,14,17,23,25,29,36,44,或者49等效,放置足够长的时间来形成晶体。详细的Hampton Screen 1条件如下所述:
#2=0.4M四水合酒石酸钠钾
#7=0.1M二甲胂酸钠pH 6.5,1.4M三水合醋酸钠
#14=0.2M二水合氯化钙,0.1M羟乙基哌嗪乙磺酸-Na pH 7.5,28%v/v聚乙二醇400
#17=0.2M一水合硫酸锂,0.1M Tris盐酸盐pH 8.5,30%w/v聚乙二醇4000
#23=0.2M六水合氯化镁,0.1M羟乙基哌嗪乙磺酸-Na pH 7.5,30%w/v聚乙二醇400
#25=0.1M咪唑pH 6.5,1.0M三水合乙酸钠
#29=0.1M羟乙基哌嗪乙磺酸-Na pH 7.5,0.8M四水合酒石酸钠钾
#36=0.1M Tris盐酸盐pH 8.5,8%w/v聚乙二醇8000
#44=0.2M甲酸镁
#49=0.2M一水合硫酸锂,2%w/v聚乙二醇8000
[0046]结晶条件可以以所演示的结晶条件为基础来优化。对于PIM-1的结晶条件,包括0.2M LiCl,0.1M Tris pH 8.5,5-15%聚乙二醇4000;0.4-0.9M三水合醋酸钠pH 6.5,0.1M咪唑,0.2-0.7M.酒石酸钠钾,00.1M MES缓冲液pH 6.5;以及0.25M甲酸镁。为了有助于随后的晶体照像术,PIM-1可以是硒蛋氨酸[/75/Se]标记。同时,正如以上所述,PIM-1可以是任何不同的形式,如,突变体,如P123M突变。
[0047]一个相关的方面提供了一种方法,用于得到PIM-1和结合化合物的共结晶物物,包括调整PIM-1蛋白的浓度为5-20mg/ml的结晶条件,实际上与HamptonScreen 1的条件2,7,14,17,23,25,29,36,44,或者49等效,在存在结合化合物的条件下如上所述维持足够长的时间来形成晶体。依据化合物的性质以不同的浓度加入结合化合物,如,终浓度为0.5到1.0mM。在很多情况下,结合化合物将于有机溶剂中,如二甲基亚砜溶液。一些示范性的共-结晶条件包括0.4-0.9M三水合醋酸钠pH 6.5,0.1M咪唑;或者0.2-0.7M酒石酸钠钾,00.1M MES缓冲液pH6.5。
[0048]在另一方面,对于PIM-1有活性的化合物的制备也提供了一种方法,用于通过让PIM-1与结合PIM-1的化合物接触,用于调控PIM-1活性;并且与49,52,65,67,121,128,和186的超过一个残基相互作用,例如式I,式II,式III的化合物。优选地,化合物以足够调控PIM-1活性的水平提供,至少是10%,更优选的是,至少20%,30%,40%,或者50%。在很多的实施方案中,该化合物的浓度为大约1μM,100μM,或者1mM,或者在1-100nM,100-500nM,500-1000nM,1-100μM,100-500μM,或者500-1000μM的范围内。
[0049]正如在此所应用的,术语“调节(modulating)”或者“调控(modulate)”是指改变生物学活性的效应,尤其是与特定生物分子如PIM-1相关的生物学活性。例如,特定生物分子的促效剂或者拮抗剂调控该生物分子例如酶的活性。
[0050]术语“PIM-1活性(PIM-1 activity)”是指PIM-1的生物学活性,尤其是包括激酶活性。
[0051]在是或者可能是调节剂的化合物的应用、测试或者筛选的语境下,术语“接触(contacting)”是指引起化合物与特定的分子、复合物、细胞、组织、器官或者其它特定物质相互间的距离足够接近,以便在化合物和其它特定物质之间的潜在结合相互作用和/或化学反应可以发生。
[0052]在一个相关的方面,本发明提供了方法用于治疗正在患有以异常PIM激酶活性为特征的病人的方法,例如,异常PIM-1活性,其中该方法涉及到将与一种或者多种PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186相互作用的化合物(例如,式I、式II或式III的化合物)施用给病人。相似地,本发明提供了一种方法,通过施用2-苯胺嘧啶化合物给病人而对病人进行治疗,如,Gleevec或者它的衍生物,或者吡咯-[2,3-d]嘧啶化合物,如在实施例14所示的化合物以及其衍生物,诸如治疗PIM-1相关疾病,如PIM-1相关癌症。这些化合物在以上引用的专利上有说明。
[0053]在某一个具体例子中,疾病或者病症是增生性疾病或者恶性肿瘤,如良性的或者恶性的肿瘤,鳞癣,白血病(如原粒细胞白血病),淋巴瘤,前列腺癌,肝癌,乳腺癌,肉瘤,成神经细胞瘤,Wilm′s肿瘤,膀胱癌,甲状腺癌,上皮瘤,如,乳房癌,或者慢性炎症疾病或者病症,例如,起因于顽固性的感染(如,结核病,梅毒,真菌感染),起因于对内源性(如,提高的血脂)或者外源性(如,硅石,石棉,香烟焦油,外科缝线)毒素的迁延暴露,以及起因于自身免疫反应(如,类风湿性关节炎,系统性狼疮红细胞肿瘤,多发性硬化症,鳞癣)。因此,慢性炎症疾病包括很多常见的病症,如类风湿性关节炎,再狭窄,干癣,多发性硬化症,手术的粘连,结核病,和慢性炎症性肺炎和气管性疾病,如,哮喘肺尘症,慢性梗阻性肺疾病,鼻息肉,和肺纤维症。PIM调节剂也可以用于抑制血肿斑和restinosis的发展,在控制restinosis,作为抗-转移性试剂,在治疗糖尿病并发症,作为抑制免疫力的药,以及在控制血管发生至PIM-1激酶涉及于特定病症的程度。
[0054]正如在此所应用的,术语“PIM-1相关疾病(PIM-1associated disease)”是指PIM-1调控与治疗效果相关的疾病。包括的疾病的特征在于异常的PIM-1活性,以及PIM-1的调控具有信号或者信号通路效应的疾病,该效应可以导致治疗效应。
[0055]由于已经开发和分析了PIM-1的晶体,另一方面是涉及PIM-1的电子表示,例如,含有与表1的坐标所对应的原子坐标展示的电子表示,或者如显示二级结构和/或者链折叠的图示表示,也可以示出保守的活性位点的残基。PIM-1可以是野生型,等位基因变异体,或者突变体形式,或者经过修饰的形式,例如,在此所说明的。
[0056]也可以通过用其它残基的电子展示替换特定残基的电子展示,对电子展示(electronic representation)进行修饰改变。这样,例如,含有与表1的坐标所对应的原子坐标展示的电子展示,可以通过用甲硫氨酸的坐标来替换在123位的脯氨酸的坐标而进行修饰改变。同样地,PIM-1展示可以通过分别的氨基酸残基的取代、插入、和/或缺失来进行修饰,而得到对于另一个PIM激酶结构的展示。在进行修饰改变以后,总体结构的展示可以被调整,以便实现已知的相互作用,该相互作用会因为修饰或者多个修饰而受到影响。在大多数情况下,涉及超过一个氨基酸残基的修饰将用重复形式实现。
[0057]此外,在结合位点的PIM-1结合化合物或者测试化合物的电子展示可以包括,例如,式I,式II,或式III的化合物。
[0058]同样地,在相关的方面,本发明是关于PIM激酶的一部分的电子展示,例如,PIM-1,如,结合位点(可以是一个活性位点),其可以包括PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186的一个或者多个的展示,或者可以包括与那些PIM-1残基对齐的PIM激酶的残基的展示,如在此提供的表2中的PIM排列表中所示的残基。结合位点可以以不同的方式表现出来,如以在结合位点附近残基的原子坐标表现,和/或以结合位点表面的轮廓表现,并且也可以包括在结合位点的特定残基的结合特征表现,如,保守残基。对于PIM-1的电子展示,结合化合物或者测试化合物可以存在于结合位点,结合位点可以是野生型,变异体,突变形式,或者修饰形式的PIM-1。
[0059]在另一方面,PIM-1的结构信息可以用于对于其它激酶的同源模型(基于PIM-1),这样就得到了对于激酶以PMI-1为基础的电子展示的同源模型(homologymodel)。例如,对于保守的氨基酸残基同源模型可以利用来自表1的原子坐标。在特定的具体例子中,可以应用对于野生型,变异体,突变形式,或者修饰形式的PIM-1的原子坐标,包括,例如,在此说明的野生型,变异体,突变形式,特别的,PIM-1结构对于其它的PIM激酶提供了非常近似的同源模型,如,PIM-2和PIM-3。因此在特定的具体例子中,本发明提供了以PIM-1为基础的、针对PIM-2和PIM-3的同源模型。
[0060]在另一方面,本发明提供了经修饰改变的PIM-1晶体结构的电子展示,其中包括经修饰改变的PIM-1的原子坐标的电子展示。在示范性的具体例子中,表1的原子坐标可以通过在PIM-1的123位替换脯氨基的原子坐标为甲硫氨基的原子坐标而进行修饰改变。修饰可以包括取代,缺失(如,C-末端和/或者N-嘧啶的缺失),插入(内部的,C-末端的,和/或N-末端)和/或侧链修饰。
[0061]在另一方面,PIM-1结构信息提供了一种方法,用于开发基于PIM-1的有用途的生物制剂,通过分析PIM-1的结构,来鉴定至少一个组成生物制剂的亚结构。这样的亚结构可以包括对于抗体形成的抗原表位,并且方法包括开发抗该抗原表位的抗体,如通过注射该抗原表位呈递组分到哺乳动物中如,兔子,豚鼠,猪,山羊,或者马中。亚结构也可以包括突变位点,其中的突变预计是或者已知是改变了PIM-1的活性,并且方法包括在该位点产生突变。更进一步,亚结构可以包括连接点用于粘附彼此分离的部分,例如,肽,多肽,固相材料(如,细珠,凝胶,层析用介质,载波片,小片,小的碟状物以及孔的表面),衔接物,和标记物(如直接标记物,象荧光(载体)携带,或者间接标记物,如生物素或者特异结合配对的其它成员)。该方法可包括粘附彼此分离的部分。
[0062]在另一方面,本发明提供了方法,用于鉴定潜在的PIM如PIM-1的结合化合物,是通过,在PIM如PIM-1结合位点的电子展示中,配合一种化合物的至少一个电子展示。结合位点的展示可以是PIM分子的较大部分或所有部分的电子展示的部分,或者可以仅仅是结合位点的展示。电子展示可以是如上所述,也可以是在此说明的别的方式。
[0063]在特定的具体例子中,该方法涉及到,利用PIM激酶的活性位点的计算机展示,从计算机数据库中配制一个化合物的计算机展示,例如,PIM-1;并且涉及到去除与PIM分子组成复合物的一个化合物的计算机展示,并且依据几何学的适合性以及作为潜在的结合化合物的能量最有利的互补结合相互作用,来鉴定该化合物是最适合该活性位点。
[0064]在其它的具体例子中,该方法包括修饰与PIM分子组成复合物的该化合物的计算机展示,如,与PIM-1分子,是通过缺失或者增加一个或者多个化学基团或者两者均有;使得从计算机数据库中所得化合物的计算机展示适合于PIM分子活性位点的计算机展示;和,依据几何学的适合性以及作为潜在的结合化合物的能量最有利的互补结合相互作用,来鉴定该化合物是最适合该活性位点。
[0065]另外,在其它的具体例子中,该方法涉及到去除与PIM激酶如PIM-1组成复合物的一种化合物的计算机展示;和,用化合物搜索计算机程序搜索数据库中与组成复合物的化合物结构上类似的化合物,或者用化合物构建计算机程序通过相似的化学结构来替换组成复合物的化合物的一部分。
[0066]配合一个化合物,包括确定该化合物是否与PIM残基49,52,65,67,21,28,和186中一个或者更多个发生相互作用。选择用于拟合的化合物或者与PIM-1组成复合物的化合物可以是,例如式I、式II和/或式III的化合物。
[0067]另一方面,本发明是关于粘附激酶结合化合物(如,PIM,或者PIM-1结合化合物)与粘合组分相互粘着的方法,以及用于鉴定在激酶结合化合物上的粘合位点的方法。该方法涉及确定用于粘着粘附成分的能量学上允许的位点;和,在能量学上允许的位点上,将该化合物或者衍生物粘着到粘附组分上。激酶可以是PIM-1或者另一种激酶,优选地,该激酶与野生型PIM-1具有至少25%的氨基酸序列同一性或者30%的序列相似性,和/或包括与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中至少一个相匹配的保守残基(即是,与这些残基的一个或者2,3,4,5,6,或者7个的任何相匹配)。
[0068]粘附成分可以包括,例如,用于粘附于固相或者粘附于另一个分子或者其它成分的接头(包括无痕迹接头)。这样的粘附可以通过在与固相介质相粘附的接头上合成化合物以及衍生物来形成,如,在很多种化合物的组合合成中。同样地,粘附与固相介质可以提供一种亲和性的介质(例如,用于亲和层析)。
[0069]粘附组分也可以包括标记物,如携带荧光可以直接检测到该标记物,或者,可以间接检测到如特异的结合配对成员,如生物素。
[0070]确定在激酶结合化合物上的能量学上允许的位点的能力,如,PIM-1结合化合物,在相关的方面,提供了修饰的结合化合物,其具有连接接头的能力,例如,如式I、式II、和式III的化合物,优选地,在允许结合修饰化合物到PIM-1上的能量允许位点。接头可以连接于以上所述的连接部分。
[0071]另一方面是关于经过修饰的PIM-1多肽,其包括P123M修饰,并且也可以包括其它的突变或者其它的修饰。在不同的实施方案中,多肽包括全长的PIM-1多肽,包括经修饰的PIM-1结合位点,包括来自PIM-1的至少20、30、40、50、60、70或者80个连续的氨基酸残基,包括P123M位点,包括PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的任何一个、任何两个、或者所有三个。
[0072]本发明的另一方面是关于开发针对激酶的配基的方法,配基包括与PIM-1残基49、52、65、67、121、128和186的2个、3个、4个、5个、6或者7个匹配的保守残基,是通过是否式I、式II或式III的化合物结合于激酶而确定。该方法也可以包括确定是否该化合物调控激酶的活性。在某一特定的实施方案中,激酶具有与PIM-1的至少25%的序列同一性或者至少30%的序列相似性。
[0073]在特定的实施方案中,所述确定包括计算机适合该化合物到该激酶的结合位点中,和/或,该方法包括形成激酶和该化合物的共晶体。这一共晶体可以用于确定带有激酶的化合物的结合取向,和/或,提供激酶的结构信息,如,在结合位点上和相互作用氨基酸残基。这一结合定向和/或其它的结构信息,可以用X-射线晶体学来完成。
[0074]本发明也提供了化合物,其结合于和/或调控(如,抑制)PIM,如PIM-1激酶活性。同样地,在涉及PIM结合化合物、分子架构、和配基或者调节物的方面和实施方案中,该化合物是弱结合化合物;中度结合化合物;强结合化合物;该化合物与PIM残基49,52,65,67,121,128和186中的一个或者多个相互作用;该化合物是小分子;该化合物结合于很多种不同的激酶(例如,至少5,10,15,20种不同的激酶)。在特定的实施方案中,本发明是关于如下所述式I、式II和式III的化合物。
[0075]因此,在某些实施方案中,本发明是关于式I的化合物:
式I
其中:
[0076]R1是氢,可选择地取代的较低级烷基,可选择地取代的较低级烯基,可选择地取代的较低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-C(X)R20,-C(X)NR16R17,或者-S(O2)R21;
[0077]R2是氢,三氟甲基,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-C(X)R20,C(X)NR16R17,或者-S(O2)R21;
[0078]R3和R4独立地是氢,羟基,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的硫代烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷烃,可选择地取代的低级烯烃,可选择地低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0079]R5是氢,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的低级硫代烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,-NR16C(X)NR16R17,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0080]R6是氢,氟,氯,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的低级硫代烷氧基,或者选择地取代的胺;
[0081]R16和R17独立地是氢,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地的取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基;
[0082]R20是羟基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环炔基,可选择地取代的环炔基,可选择地取代的芳基,可选择地取代芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者选择地取代的杂芳烷基;
[0083]R21是可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0084]X=O,或者S。
[0085]在特定的实施方案中,本发明与如式II所示的化合物有关:
式II
其中:
[0086]R1是氢,羟基,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷烃,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-NR16C(X)NR16R17,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0087]R2是氢,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的硫代烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷烃,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-NR16C(X)NR16R17,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0088]R3和R4独立地是氢,羟基,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-NR16C(X)NR16R17,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0089]R5是氢,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺基,可选择地取代的低级芳基,或者-NR16C(X)NR16R17;
[0090]R16和R17独立地是氢,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃基,可选择地低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基;
[0091]R20是羟基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0092]R21是可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷烃,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0093]X=O或者S。
[0094]在另一个实施方案中,本发明与式III的化合物相关:
式III
其中:
[0095]Z=O,S,NR18或者CR18R19;
[0096]R1是氢,羟基,卤素,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的硫代烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-NR16C(X)NR16R17,S(O2)R21,或者-C(X)R20;
[0097]R2是氢,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃基,可选择地取代的低级炔烃基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0098]R3是氢,羟基,氟,氯,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的胺,NR16C(X)NR16R17,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0099]R4是氢,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,或者可选择地取代的低级烷基;
[0100]R5和R6独立地是氢,羟基,氟,氯,三氟甲基,可选择地取代的烷氧基,可选择地取代的硫代烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,-C(X)R20,或者-S(O2)R21;
[0101]R7是氢,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基,或者-C(X)R8;
[0102]R8是羟基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0103]R9是可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯烃基,可选择地取代的低级炔烃,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0104]R16和R17独立地是氢,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级链烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,可选择地取代的杂芳烷基;
[0105]R18是氢,可选择地取代的烷基,可选择地取代的低级链烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基,C(X)R20,C(X)NR16R17,或者-S(O2)R21;
[0106]R19是氢,可选择地取代的烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基,C(X)R20,C(X)NR16R17,或者-S(O2)R21;
[0107]R20是羟基,可选择地取代的低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0108]R21是可选择地取代的较低级烷氧基,可选择地取代的胺,可选择地取代的低级烷基,可选择地取代的低级烯基,可选择地取代的低级炔基,可选择地取代的环烷基,可选择地取代的杂环烷基,可选择地取代的芳基,可选择地取代的芳烷基,可选择地取代的杂芳基,或者可选择地取代的杂芳烷基;
[0109]X=O或者S。
[0110]本发明的另一方面是关于药学制剂,其中包括治疗有效量的如式I、II或者III所示的化合物,和至少一种药学上可以接受的载剂或者赋形剂。该组合物可以包括多种不同的药学活性化合物。
[0111]“卤素(Halo)”或者“卤族元素(Halogen)”,单独或者组合应用,是指所有的卤族元素,即是,氯(Cl),氟(F),溴(Br),碘(I)。
[0112]“羟基(Hydroxyl)”是指基团-OH。
[0113]“硫羟基(Thiol)”或者“巯基(mercapto)”是指基团-SH。
[0114]“烷基(Alkyl)”,单独或者组合使用,是指烷烃-衍生的基,含有从1到20,优选的是1到15,碳原子(除非特别定义的)。其是直链烷烃,支链烷烃或者环烷烃。优选地,直链或者支链基团含有从1到15个碳原子,优选地是从1到8,更优选地是1到6,更加优选地是1到4,最优选地是1到2,碳原子,如甲基,乙基,丙基,异丙基,丁基,叔丁基和类似物。在此应用,术语“低级烷基(lower alkyl)”来说明如上刚才所述的直链烷基。优选地,环烷基基团是每环3到8环单元的单环、双环或者三环系统,更优选的是每个环上的元成员是3-6元,如环丙烷,环戊基,环己基,金刚烷以及类似物。烷基也包括直链和支链烷基,其含有或者被环烷基部分所中断。直链或者支链烷基基团与任何可能的点接触而得到稳定的化合物。这一例子包括,但不限于,4-(异丙基)-环己乙基或者2-甲基-环丙戊基。取代的烷基是是以前定义的直链烷基,支链烷基,或者环烷基,独立地用1到3个基团或者卤素,羟基,烷氧基,烷硫基烷苯磺基,烷磺酰基,酰氧基,芳氧基,杂芳氧基,氨基的取代物,氨基取代物,可选择的用烷基,芳基或者杂芳基,脒并基,取代的脲基,N-单-或者N,N-二取代的氨基磺酰基,脲基可选择地用烷基、芳基、杂芳基、或者杂环基团取代,氨基磺酰基可选择地用烷基、芳基或者杂芳基、烷磺酰基氨基、芳磺酰基氨基、异芳磺酰基氨基、或者类似物的N-单-或者N,N-二取代。
[0115]“烯基(alkenyl)”,单独或者组合,是指直链、支链或者环形烃,含有2-20,优选地2到17,更优选地2-10,进一步更优选地2-8,最优选地2-4个,碳原子;并且至少一个,优选地1-3,更优选地1-2,最优选地是一个,碳碳双键。对于环烷基基团,超过一个碳碳双键的共轭作用并不是赋予环具有芳香性。碳碳双键可以是,或者包含在环烷基部分中或者是在直链部分或者支链部分中,环丙烷是例外的。烯基基团的例子包括乙烯基,丙烯基,异丙烯基,丁烯基,环己烯基,环己烯烷基以及类似物。取代的烯基是以上所说明的直链烯基、支链烯基或者环烯基基团,用一个到三个基团或者取代基卤素、羟基、烷氧基、烷硫基、烷苯磺基、烷基磺酰基、酰氧基、芳氧基、杂芳氧基、氨基独立地取代,可选择地用烷基、芳基、或者杂芳基对氨基进行单-或者双-取代,脒基基团,可选择地用烷基、芳基、杂芳基、或者杂环烷基取代的脲,可选择地用烷基、芳基、或者杂芳基进行N-单取代或者N,N-双取代的氨基磺酰基,烷基磺酰氨基,芳基磺酰氨基,杂芳基磺酰氨基,烷基羰基胺,芳基羰基胺,杂芳基羰基胺,羧基,烷氧基羧基,芳氧基羧基,杂芳氧基羧基或类似物,粘附于任何可行的位点而得到稳定的化合物。
[0116]“炔基(Alkynyl)”——单独或者组合使用,是指直链或者支链烃,含有2-20个,优选地2到17个,更优选地2-10个,进一步更优选地2-8个,最优选地2-4个,碳原子;并且含有至少一个,优选地,一个碳碳叁键。对于炔基基团的例子包括,乙炔基,丙炔基,丁炔基,等等。取代的炔基是指以上所说明的直链炔基或支链炔基,用一个到三个基团或者取代基卤素、羟基、烷氧基、烷硫基、烷苯磺基、烷基磺酰基、酰氧基、芳氧基、杂芳氧基、氨基进行单独取代,可选择地用烷基、芳基或者杂芳基对氨基进行单取代或者双取代,脒基,可选择地用烷基、芳基、杂芳基或者杂环烷基取代的脲,可选择地用烷基、芳基或者杂芳基进行N-单取代或者N,N-双取代的氨基磺酰基,烷基磺酰氨基,芳基磺酰氨基,杂芳基磺酰氨基,烷基羰基胺,芳基羰基胺,杂芳基羰基胺等类似物,粘附于任何可行的位点而得到稳定的化合物。
[0117]“烷烯基(Alkyl alkenyl)”是指基团-R-CR′=CR_R″″,其中的R是低级烷基,或者取代的低级烷基,R′,R_,R″″可以独立地是氢,卤素,低级烷基,取代的低级烷基,酰基,芳基,取代的芳基,杂芳基(hetaryl),或者如以下所说明的取代的杂芳基。
[0118]“烷炔基(Alkyl alkynyl)”是指基团-RCCR′,其中R是低级烷基,或者取代的低级烷基,R′是氢,低级烷基,取代的低级烷基,酰基,芳基,取代的芳基,杂芳基,或者如以下所说明的取代的杂芳基。
[0119]“烷氧基(Alkoxy)”表示基团-OR,其中R是低级烷基,取代的低级烷基,酰基,芳基,取代的芳基,芳烷基,取代的芳烷基,杂烷基,杂芳烷基,环烷基,取代的环烷基,环杂烷基,或者取代的环杂烷基,如被定义的那样。
[0120]“烷硫基(Alkylthio)”或者“硫代烷氧基(thioalkoxy)”是指基团-SR,-S(O)n=1-2-R,,其中R是低级烷基,取代的低级烷基,芳基,取代的芳基,芳烷基或者取代的芳烷基,如在此所定义的。
[0121]“酰基(Acyl)”是指基团-C(O)R,其中R是氢,低级烷基,取代的低级烷基,芳基,取代的芳基以及类似物,如在此所定义的。
[0122]“芳氧基(Aryloxy)”是指基团-OAr,其中Ar是芳基,取代的芳基,杂芳基,或者取代的杂芳基,如本文所定义的。
[0123]“氨基(Amino)”或者取代胺是指基团NRR′,其中R和R′可以独立地是氢,低级烷基,取代的低级烷基,芳基,取代的芳基,杂芳基,或者如在此所定义的取代杂芳基,酰基或者磺酰基。
[0124]“酰氨基(Amido)”表示基团-C(O)NRR′,其中R和R′可以独立地是氢,低级烷基,取代的低级烷基,芳基,取代的芳基,杂芳基,以及如在此定义的取代的杂芳基。
[0125]“羧基(Carboxyl)”表示基团-C(O)OR,其中R是氢,低级烷基,取代的低级烷基,芳基,取代的芳基,杂芳基,以及如在此定义的取代的杂芳基。
[0126]“芳基(Aryl)”——单独地或者在组合中,是指苯基或者萘基,可选择地与环烷基进行碳环稠合,优选地5到7个,更优选地5-6个环元,和/或,由1到3个基团或者取代基卤素、羟基、烷氧基、烷硫基、烷苯磺基、烷磺酰基、酰氧基、芳氧基、杂芳氧基、氨基基团取代,可选择地用烷基、芳基、或者杂芳基对氨基进行单取代或者双取代,脒基,可选择地用烷基、芳基、杂芳基或者杂环烷基取代的脲,可选择地用烷基、芳基、或者杂芳基,烷磺酰氨基进行N-单取代或者N,N-双取代的氨基磺酰基,芳香磺酰氨基,杂芳香磺酰氨基,烷基羰基胺,芳基羰基胺,杂芳基羰基胺,或者类似物。
[0127]“取代的芳基(substituted aryl)”是指芳基,可选择地用一个或者更多个官能团取代,如,卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,乙炔,氨基,酰氨基,羧基,羟基,芳基,芳氧基,杂环,杂芳基取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺胺基(sulfamido)和类似物。
[0128]“杂环(Heterocycle)”是指饱和的,未饱和的,或者具有单环(如,吗啉,吡啶基或者呋喃)或者多个稠合环(如,萘吡啶基,喹噁啉基,奎林基,吲哚基或者苯并[b]噻吩基)的芳香碳环基团;并且在环中具有至少一个杂原子,如N、O或者S。其可选择地是未取代的,或者由如,卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,乙炔基,氨基,酰氨基,羧基,羟基,芳基,芳氧基,杂环,杂芳基,取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺胺基(sulfamido)以及类似物取代的环。
[0129]“杂芳基(heteroaryl)”——单独地或者在组合中使用,是指单环的芳香环结构,含有5或者6个环原子,或者是指具有8到10个原子的双环芳香基团,其中含有一个或者多个,优选的是1到4,更优选的是1到3,更加优选的是1到2个分别选自类群O,S,和N的杂原子,并且,可选择地用1到3个以下的基团或取代基所取代:卤素,羟基,烷氧基,烷硫基,烷基亚磺酰基,烷磺酰基,酰氧基,酰氧基,芳氧基,杂芳氧基,可选择地用烷基、芳基或杂芳基进行单取代或者双取代的氨基,脒基,可选择地用烷基、芳基、杂芳基或者杂环基团取代的脲,可选择地用烷基、芳基、或者杂芳基进行N-单取代或N,N-双取代的氨基磺酰基,烷磺酰氨基,芳香磺酰氨基,杂芳香磺酰氨基,烷羰基胺,芳香羰基胺,杂芳香羰基胺,或者类似物。也认为杂芳基包括氧化的S或者N,如亚磺酰基,磺酰基和三元环氮的N-氧化物。碳原子和氮原子是杂芳香环结构的粘附点,使得稳定的芳香环得以保持。杂芳香环基团的例子是嘧啶基,哒嗪基,吡嗪基,喹唑啉基,嘌呤基,吲哚基,喹啉基,嘧啶基,吡咯基,噁唑基,噻唑基,噻吩基,异噁唑基,oxathiadiazolyl,异噻唑基,三唑基,咪唑基,三嗪基,呋喃基,苯基呋喃,吲哚基以及类似基团。取代的杂芳基含有连接于可利用的碳原子或者氮原子上的取代基,从而得到稳定的化合物。
[0130]“杂环基(Heterocyclyl)”——单独或者组合使用,是指非芳香性的、具有从5到10个原子的环烷基基团,其中,在环中的1到3个碳原子由杂原子O、S或者N替换,并且可选择地与苯融合,或者与5到6元的杂芳基融合;和/或,可选择地在环烷基的情况下被取代。也认为杂环包括氧化的S或者N,如亚磺酰基,磺酰基和三元含氮环的N-氧化物。连接位点是在碳原子或者氮原子上。杂环基团的例子是四氢呋喃,二氢吡啶基,哌啶基,吡咯烷基,哌嗪基,二氢苯并呋喃基,二氢吲哚基,以及类似物。取代的杂环含有取代的氮,其粘附于可接近的碳原子或者氮原子上,从而得到稳定的化合物。
[0131]“取代的杂环芳基(substituted heteroaryl)”是指可选择的单个杂环或者由一个或者多个功能基团多取代,如卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,乙炔基,氨基,氨基,羧基,羟基,芳基,芳氧基,杂环,取代的杂环,杂芳基,取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺胺基以及相似物。
[0132]“芳烷基(aralkyl)”是指基团-R-Ar,其中Ar是芳基,R是低级烷基或者取代的低级烷基。芳基可以是,可选择地,非取代的或者由如卤素、低级烷基、烷氧基、烷硫基、乙炔、氨基、酰氨基、羧基、羟基、芳基、芳氧基、杂环、取代的杂环、杂芳基、取代的杂芳基、硝基、氰基、硫醇基、磺氨基和类似基团所取代的。
[0133]“杂烷基(heteroalkyl)”是指基团-R-Het,其中Het是杂环基团,并且R是低级烷基。杂烷基基团,可选择地,可以是未取代的,或者由以下基团取代,如:卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,乙炔,氨基,氨基,羧基,芳基,芳氧基,杂环,取代的杂环,杂芳基,取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺氨基以及类似物。
[0134]“杂芳香烷基(heteroarylalkyl)”是指基团-R-HetAr,其中HetAr是杂芳基,并且R是低级烷基或者取代的低级烷基。杂芳香烷基基团,可选择地,是未取代的,或者用如卤素、低级烷基、取代的低级烷基、烷氧基、烷硫基、乙炔、芳基、芳氧基、杂环、取代的杂环、杂芳基、取代的杂芳基、硝基、氰基、硫醇基、磺氨基以及类似物取代的。
[0135]“环烷基(cycloalkyl)”是指含有3到15个碳原子的二价环状的或者多环状的烷基。
[0136]“取代的环烷基(substituted cycloalkyl)”是指含有一个或者多个由以下取代的取代基的环烷基基团,例如,由卤素、低级烷基、取代的低级烷基、烷氧基、烷硫基、乙炔、芳基、芳氧基、杂环、取代的杂环、杂芳基、取代的杂芳基、硝基、氰基、硫醇基、磺氨基以及类似物取代的。
[0137]“环杂烷基(cycloheteroalkyl)”是指环烷基基团,其中环碳原子的一个或者多个是被杂原子替换的(如,N,S,O或者P)。
[0138]“取代的环杂烷基(substituted cycloheteroalkyl)”是指如在此所定义的环杂烷基基团,其含有一个或者多个取代基,如,卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,乙炔,氨基,酰氨基,羧基,羟基,芳基,芳氧基,杂环,取代的杂环,杂芳基,取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺氨基以及相似物取代。
[0139]“烷基环烷基(Alkyl cycloalkyl)”是指基团-R-环烷基,其中的环烷基是环烷基基团,并且R是低级烷基或者取代的低级烷基。环烷基,可选择地,是未取代的或者由以下的基团所取代的,例如由卤素、低级烷基、低级烷氧基、烷硫基、乙炔、氨基、酰氨基、羧基、羟基、芳基、芳氧基、杂环、取代的杂环、杂芳基、取代的杂芳基、硝基、氰基、硫醇基、磺氨基以及相似物取代的。
[0140]“烷基环杂烷基(alkyl cycloheteroalkyl)”是指基团-R-环杂烷基,其中R是低级烷基或者取代的低级烷基。环杂烷基基团,可选择地,可以是未取代的或者由以下基团所取代的,如卤素,低级烷基,低级烷氧基,烷硫基,氨基,酰氨基,羧基,乙炔,羟基,芳基,芳氧基,杂环,取代的杂环,杂芳基,取代的杂芳基,硝基,氰基,硫醇基,磺氨基以及相似物所取代的。
[0141]从以下的细节说明和权利要求书而言,另外的方面和实施方案是显而易见的。
附图简述
[0142]图1显示的是在PIM-1的结合位点中的AMP-PNP的图示说明,显示了保守的相互作用中的氨基酸残基。
优选实施方案的详细说明
[0143]首先简要说明附表。
[0144]表1提供了人PIM-1的原子坐标。在该表和表4中,不同的栏具有以下的内容,从最左边栏开始:
原子(ATOM):是指对于表中的行的相关内容。
原子编号(Atom number):是指在坐标表中的任意原子编号指定。
原子名称(Atom Name):存在于特定坐标处的原子的标识符。
链ID(Chain ID):链ID是指晶体中的蛋白质的一个单体,如,链“A”,或者是指在晶体中存在的其它化合物,如,HOH代表水,L代表配基或者结合化合物。蛋白单体的多个拷贝具有不同的链Id。
残基编号(Residue Number):在链中的氨基酸残基编号。
X,Y,Z:分别是X,Y,和Z的坐标值。
占有率(Occupancy):描述的是在晶体中观察到的该原子的时间分数。例如,占有率=1意味着原子在所有时间中都存在;占有率=0.5意味着原子在该部位的存是该时间的50%。
B-因子(B-factor):原子热运动的一个量度。
元素(Element):元素的标识符。
[0145]表2提供了几种PIM激酶的排列,包括人PIM-1,PIM-2,和PIM-3,以及来自其它物种的PIM激酶。
[0146]表3提供的是一大组激酶的排列,提供了这一组中不同成员之间保守的残基的鉴定。
[0147]表4提供了在结合位点上与AMP-PNP结合的PIM-1的原子坐标(atomiccoordinates)。
[0148]表5提供了人PIM-3的核酸序列和氨基酸序列。
I.介绍
[0149]本发明是关于应用PIM激酶结构,结构信息,以及相关组合物,用于鉴定调控PIM激酶活性的化合物并且用于确定其它激酶结构的应用。
[0150]正如在背景技术中所说明的,已经鉴定PIM-1为丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶。此外,目前已经发现PIM-1具有酪氨酸激酶的活性,并且其因此是双活性蛋白激酶。PIM-1的酪氨酸激酶活性的发现是应用肽底物点阵芯片(细胞信号技术)完成的,使用抗-磷酸化酪氨酸的抗体检测到酪氨酸磷酸化。Meeker et al.(1987)J.Cell.Biochem.35:105-112说明了PIM-1的克隆,并且说明了在198位置的酪氨酸可能与pp60v-src的T416同源,并且表明了“这一发现与假设PIM-1是一种酪氨酸激酶、而不是丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶是相一致的。”然而,正如本文在背景技术中所表明的,随后的报导表明PIM-1具有丝氨酸-氨酸蛋白激酶活性,这样就把PIM-1归类为丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶。发现PIM-1具有酪氨酸激酶的活性,并且发现酪氨酸激酶的抑制剂bcr-abl(或者c-able)也抑制PIM-1,这说明了那些抑制物,相关的化合物,以及对于abl或者相似的酪氨酸激酶有活性的其它抑制剂,也可以用作PIM-1的抑制剂,或者用于开发抑制PIM-1的衍生化合物,如,应用在此所述的方法。
[0151]特异的化合物,它们是c-abl抑制剂、也被发现是PIM-1的抑制剂的化合物,包括甲磺酸伊马替(imatinib mesylate(GleevecTM))和在实施例14中列出的化合物。在Nagar et al.(2002)Cancer Res.62:4236-4243中,说明了这两种化合物与c-Abl的激酶结构域的共结晶结构。这些类别的化合物,即是,2-苯基氨基嘧啶类的化合物,如Gleevec或者其衍生物;吡啶-[2,3-d]嘧啶化合物,如在实施例14中所示的化合物以及其衍生物,可以用在PIM-1相关疾病例如PIM-1相关癌症中,也可以用于开发另外的、衍生的PIM-1抑制剂。这样的化合物在本文的概述部分中所引用的专利出版物中有说明。
[0152]PIM激酶,特别是PIM-1,涉入到很多种疾病状态中。例如,正如在以上的背景技术部分中所表明的,PIM-1在功能上以弱的癌基因起作用。在用Emu增强子序列驱动的PIM-1转基因鼠中,自身过表达PIM-1并不能导致肿瘤形成,但是在与过量表达第二个癌基因联合时会形成肿瘤。在过量表达PIM-1的肿瘤中的75%中,发现第二个过量表达的基因是c-myc(van der Houven van Oordt CW,SchoutenTG,van Krieken JH,van Dierendonck JH,van der Eb AJ,Breuer ML.(1998)X-ray-induced lymphomagenesis in E mu-PIM-1 transgenic mice:an investigation ofthe co-operating molecular events.Carcinogenesis 19:847-853)。其它的PIM激酶也有涉入,这是由于不同的PIM激酶的功能看起来至少具有部分互补性。
与PIM相关联的示范性疾病
[0153]因为PIM-1是原癌基因(protooncogene),并且在引发细胞内信号系统从而导致细胞转化中,与其它原癌基因如c-myc密切配合作用,所以PIM-1抑制剂在治疗不同的癌症,以及其它疾病情形中具有治疗应用。以下说明一些例子。
前列腺癌(prostate cancer)
[0154]在前列腺癌症中,报导了PIM-1与疾病状态的显著的内在相互关系(Dhanasekaran et al.(2001)Delineation of prognostic biomarkers in prostate cancer.Nature 412:822-826.)应用互补DNA的微阵列,在超过50个正常和瘤性前列腺癌症样品,以及三种普通的前列腺癌细胞系中,检查了所得到的大约10,000个基因的基因表达特征。这些基因中的两个,hepsin,是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,和PIM-1,是一种丝氨基/苏氨酸激酶,被上调了几倍。正常组织用抗-PIM-1抗体(Id)染色时,其显示没有染色或者具有弱的染色;而在前列腺癌症组织的细胞质中,PIM-1强烈地表达,这表明了PIM-1是药物开发的一个适当的靶。
白血病(Leukemia)
[0155]已经定位了PIM-1是位于人染色体的6p21区域。Nagarajan et al.(Nagarajanet al.(1986)Localization of the human pirn oncogene(PIM)to a region of chromosome6 involved in translocations in acute leukemias.Proc.Natl.Acad.Sci.USA83:2556-2560)报导了,在K562红白血病细胞系中,发生PIM-1的表达增加,其中该细胞系中含有细胞遗传学上可证明的、在6q21区域的重排。染色体异常性的特征,说明了在髓样白血病中有交互易位t(6;9)(p21;q33),这可能归因于PIM-1的涉入。Amson et al.(1989)也在30%的髓样和淋巴样急性白血病中观察到过表达。这些研究也说明了,在各种白血病的发展和下调中,PIM-1原癌基因起作用。
特发性多发性色素沉着性肉瘤(Kaposi Sarcoma)
[0156]通过在用人疱疹病毒(HHV 8),也称为卡波西肉瘤相关病毒(KSHV)体外感染人的造血细胞之后,通过微阵列分析基因表达特征,结果发现,在被分析的10,000个基因中,有400个基因存在差异表达。在这些四百个基因中,PIM-2被上调至超过3.5倍,这表明PIM-2是治疗性干预的潜在靶。因此,对于PIM-2具有选择性的抑制剂,在治疗由HHV 8介导的疾病情形中,具有很大的治疗价值。(Mikovits et al.(2001)Potential cellular signatures of viral infections in humanhematopoietic cells.Dis.Markers 17:173-178.)
哮喘和过敏症(Asthma and Allergy)
[0157]已经应用在抗原诱发位点的嗜酸性粒细胞的增加作为证据,证明嗜酸性粒细胞在哮喘的病理生理学中起重要作用。几种不同的细胞因子的异常产生,已经表明导致了嗜酸性粒细胞增多。例如,细胞因子IL-5以很多种方式影响嗜酸性粒细胞的发育和成熟。应用微阵列技术,表明在嗜酸性粒细胞的IL-5信号途径中,PIM-1起作用。(Temple et al.(2001)Microarray analysis ofeosinophils reveals anumber of candidate survival and apoptosis genes.Am.J.Respir.CellMol.Biol.25:425-433.)。因此,PIM-1的抑制剂,在治疗哮喘和过敏症中,具有治疗价值。
炎症(inflammation)
[0158]PIM-1和/或在此说明的化合物,也可以用于治疗慢性的或粒急性的炎症。认为慢性炎症是持续的拖长的炎症(数周或者数月),包括同时发生的活跃性炎症,组织破坏,和在治愈上的尝试。(R.S.Cotran,V.Kumar,and S.L.Robbins,SaundersCo.,(1989)Robbins Pathological Basis of Disease,p.75.)尽管慢性炎症可以是在急性炎症后发作,它也可以是起始于一段时间进展的过程,如,作为慢性感染的结果,如结核病,梅毒,引起迟发性过敏性反应的真菌感染,持续延长暴露于内源性或者外源性毒素,或者自身免疫反应(如,类风湿性关节炎,系统性红斑狼疮,多发性硬化症,posoriasis)。因此,慢性炎症疾病包括很多的常见疾病,正如以上所列的自身免疫病症,慢性感染,手术粘连,肺部和呼吸道的慢性炎症(如,哮喘,尘肺病,慢性阻塞性肺病,鼻息肉,和肺纤维症)。对于皮肤和呼吸道感染疾病,可以分别应用局部的或者吸入形式的药物施用方式。
II.结晶的PIM激酶
[0159]本发明的晶态PIM激酶(如,人PIM-1)包括,天然晶体,衍生晶体和共晶体。本发明的天然结晶一般包括在结晶形式中的、对应于PIM激酶的基本上纯的多肽。
[0160]应当认识到,本发明的结晶激酶并不限于天然产生的或者天然的激酶。实际上,本发明的晶体包括天然激酶突变体的晶体。通过在天然激酶中,用不同的氨基酸残基替换至少一个氨基酸残基得到天然激酶的突变体;或者通过在天然多肽中,或者在天然多肽的N-末端或者C-末端,添加或者删除氨基酸残基得到突变体,并且具有与突变体来源的天然激酶实质上相同的三维结构。
[0161]具有实质上相同的三维结构是指具有一套原子结构的坐标,当用突变体起源的天然激酶的原子结构坐标重叠时,当天然激酶结构域中的至少大约50%到100%的Cα原子包括于重叠中时,这套原子结构的坐标具有的平方根偏差少于或者等于大约2埃。
[0162]并不显著影响这些激酶的三级结构的氨基酸取代、缺失和添加,将部分依赖于取代、添加或者缺失所发生的激酶区域。在分子的高度可变区域中,可以容忍非保守的取代和保守的取代,而并不显著破坏该分子的三维结构。在高度保守区域中,或者含有重要的二级结构的区域,优选保守性氨基酸取代。这样保守的和可变区域,可以通过PIM-1(以及其它的PIM激酶,和其它激酶)的序列排列来鉴定。一些PIM激酶的这样的排列以及很多其它激酶的排列,在表3中有说明。
[0163]保守性氨基酸取代物在本领域是熟知的,并且包括基于相似性所做的取代,基于所涉及氨基酸残基上在极性、电荷、可溶性、疏水性、亲水性和/或两性性质上的相似性。例如,带负电荷的氨基酸包括天冬氨酸和谷氨酸;带正电荷的氨基酸包括赖氨酸和精氨酸;具有相似疏水性值的、不带电荷的极性头部基团的氨基酸包括以下这些:亮氨酸,异亮氨酸,缬氨酸;甘氨酸,丙氨酸;天冬酰胺,谷酰胺;丝氨酸,苏氨酸;苯丙氨酸,酪氨酸。其它保守性氨基酸取代在本技术领域是熟知的。
[0164]对于完全或者部分通过化学合成得到的激酶,可以应用于取代或者添加的氨基酸的选择,并不限于遗传学编码的氨基酸。实际上,在此所述的突变体可以包括非基因编码的氨基酸。就许多非遗传学编码的氨基酸的保守性氨基酸取代而言,是本技术领域熟知的。针对其它氨基酸的保守性取代,可以基于它们的物理性质、并比较遗传学编码的氨基酸的性质来确定。
[0165]在一些情况下,天然激酶的取代、缺失或者添加氨基酸残基,可能具有特别的优势或者有利性,以便在cDNA编码多肽中提供方便的克隆位点,有助于多肽的纯化,或者对多肽的结晶有帮助。并不能实质上改变天然激酶结构域的三维结构的如此取代、删除和/或添加,对于本领域技术人员来说,是显而易见的。
[0166]应当注意到,在此所说的突变体并不是全部表现出激酶活性。实际上,干扰激酶活性的氨基酸取代、添加或者删除,但是这并不显著改变结构域的三维结构,是特别地包括在本发明之内。这样的结晶态多肽,或者由此得到的原子结构坐标,可以用于鉴定结合天然结构域的化合物。这些化合物可以影响天然结构域的活性。
[0167]本发明的衍生晶体(derivative crystals),可能包括与一个或者多个重金属原子共价相联的结晶激酶多肽。多肽可以对应于天然或者突变的激酶。用于提供衍生晶体的重金属原子包括,以举例方式来说,但不限于,金,汞,硒,等。
[0168]本发明的共-晶体,一般包括与一种或者更多种化合物结合在一起的结晶的激酶结构域多肽。结合可以是共价的,也可以是非共价的。这样的化合物包括,但不限于,辅因子,底物,底物类似物,抑制剂,变构效应物,等等。
[0169]PIM家族激酶的示范性突变,包括取代或者在人PIM-1的对应于残基123位取代脯氨酸。一种有用取代是在残基123位的脯氨酸取代为甲硫氨酸(P123M)。这样的取代是有用的,例如有助于应用PIM家族激酶来模仿其它激酶,其中这些其他激酶在此位点没有脯氨酸。另一些示范性的突变,包括取代或者删除PIM-1残基124-128中的一个或者多个,或者来自与PIM-1残基124-128对齐的另一个PIM的一个残基。例如,与PIM-1残基128对齐的一个PIM残基可以被删除。同样地,可以进行在其它位点的突变,如,来制备突变的PIM家族激酶,更类似于另一种激酶,用于结构模拟(structure modeling)和/或者化合物拟合用途(compoundfitting purposes)。
III应用X-射线晶体学的三维结构确定(three dimensional structure determination)
[0170]X-射线晶体学是解析分子三维结构的方法。通过X-射线衍射图案计算一个分子的结构,应用晶体作为衍射光栅。从该蛋白的浓缩水溶液中生长晶体,从晶体得到蛋白分子的三维结构。X-射线晶体学的方法可以包括以下步骤:
(a)合成并且分离(或者用别的方法获得)多肽;
(b)在含有或者不含有调节剂的情况下,从多肽的水溶液中生长出晶体;和
(c)收集晶体的X-射线衍射图案,确定单元晶胞的尺寸和对称,确定电子密度,将多肽的氨基酸序列配合电子密度,并且精修该结构。
多肽的产生
[0171]在此说明的天然的和突变的激酶多肽,可以是全部地或者部分地用本领域已知技术化学合成(参见,如,Creighton(1983)Biopolymers 22(1):49-58)。
[0172]作为选择,可以应用本领域专业人士所熟知的方法,来构建表达载体,其中含有天然或者突变的激酶多肽编码序列,以及适合的转录/翻译控制信号。这些方法包括体外重组DNA技术,合成技术和体内重组/遗传学重组。参见,例如,如下所述的技术:Maniatis,T(1989).Molecular cloning:A laboratory Manual.ColdSpring Harbor Laboratory,New York.Cold Spring Harbor Laboratory Press;和Ausubel,P.M.et al.(1994)Current Protocols in Molecular Biology.John Wiley & Sons,Secaucus,N.J.。
[0173]许多种宿主表达载体系统可以用于表达激酶编码序列。这些包括,但不限于微生物,如用含有激酶结构域编码序列的重组噬菌体DNA、质粒DNA或者粘粒DNA表达载体转化的细菌;用含有激酶结构域编码序列的重组酵母表达载体转化的酵母;用含有激酶结构域编码序列的重组病毒表达载体(如,baculovirus)感染的昆虫细胞系统;用含有激酶结构域编码序列的重组病毒表达载体(如,花椰菜花叶病毒,CaMV;烟草花叶病毒,TMV)感染的植物细胞系统,或者用含有激酶结构域编码序列的重组质粒表达载体(如,Ti质粒)转化的植物细胞系统;或者,动物细胞系统。这些系统的表达元件在它们的强度和特异性上有所不同。
[0174]依赖于所应用的宿主/载体系统,很多适合的转录和转移元件中的任何一个,包括组成型启动子或者诱导型启动子,可以用于表达载体中。例如,当在细菌系统中进行克隆时,可以应用诱导型启动子,如,λ噬菌体的pL,plac,ptrp,ptac(ptrp-lac杂合启动子)以及类似物;当在昆虫细胞中进行克隆时,可以应用如杆状病毒多角体蛋白的启动子;当在植物细胞系统中进行克隆时,可以应用来源于植物细胞基因组的启动子(如热休克启动子;RUBISCO小亚基的启动子,叶绿素a/b结合蛋白的启动子)或者来自植物病毒的启动子(如,CaMV的35S RNA启动子,TMV的衣壳蛋白启动子);当在哺乳动物细胞系统中进行克隆时,可以应用来源于哺乳动物基因组(如,金属硫蛋白的启动子)或者来源于哺乳动物病毒(如,腺病毒晚期基因启动子,痘苗病毒7.5K启动子)的启动子;当产生的细胞系中含有多个拷贝的激酶结构域的DNA时,可以与适当的选择性标记一起来应用SV40-,BPV-和以EBV为基础的载体。
[0175]描述所采用的DNA操作方法、载体、和不同类型细胞的示范性方法,装配载体到细胞中的方法,表达技术,蛋白质纯化和分离方法,以及蛋白质浓缩方法,均在PCT出版物WO 96/18738中有详细的公开。这些出版物在此以其整体予以引入,作为参考,包括任何附图。本领域的技术人员将会理解到,这些阐述对于本发明而言是可以应用的,并且可以很容易地修正适合它。
晶体生长
[0176]通过多种技术,从含有纯化的和浓缩的多肽的水溶液中生长晶体。这些技术包括分批法(batch),液体法(liquid),桥连法(bridge),透析(dialysis),蒸汽扩散(vapor diffusion),和悬滴法(hanging drop methods)。McPherson(1982)JohnWiley,New York;McPherson(1990)Eur.J.Biochem,189:1-23;Webber(1991)Adv.Protein Chem.41:1-36,这些出版物在此完整引入,作为参考,包括所有的图,表和附图。
[0177]本发明的天然晶体(native crystals),总的来说,是通过加入沉淀剂至多肽的浓缩溶液中而生长的。沉淀剂在加入之时的浓度,仅仅低于沉淀蛋白质所必要的水平。通过受控蒸发,去除水,以便形成沉淀条件,该条件一直被保持,直到晶体生长停止。
[0178]对于本发明的晶体,示范性结晶条件在实施例中有说明。本技术领域的技术人员将承认示范性的结晶条件是可以变化的。这些改变可以单独应用,或者组合应用。此外,可以发现其它的结晶条件,如通过应用晶体化筛选板,以便确定其它的条件。
[0179]本发明的衍生晶体(derivative crystals),可以通过将天然晶体浸入含有重金属原子的盐的母液中来得到。已经发现,将天然晶体浸泡于含有大约0.1mM到大约5mM的硫柳汞,4-氯汞苯甲酸或者KAu(CN)2的溶液中,大约2小时到大约72小时,得到衍生结晶,适合于在确定PIM-1的X-射线晶体结构中用作同晶置换(isomorphous replacement)。
[0180]本发明的共晶体(co-crystals),可以通过浸泡天然晶体于含有可以结合激酶的化合物的母液中而得到,或者通过,在存在结合化合物的条件下,共结晶激酶多肽而得到。
[0181]一般地,通过应用在没有结合化合物下结晶相应激酶的业已确定的条件,完成激酶和结合化合物的共结晶(co-crystallization)。如果已经鉴定出针对该激酶的多数个不同的结晶条件,那么这是具有优势的,可以测试这些条件来确定那一个条件给出最好的共晶体。优化共结晶的条件也是有益的。在实施例中,提供了示范性的共结晶条件。
确定晶格大小以及多肽或者多肽复合物的三维结构
[0182]一旦长成晶体,将其置于玻璃毛细管中或者其它的固定装置上,并且固定于与X-射线发生器和X-射线检测装置相连接的支持装置上。X-射线衍射图的收集已被本领域的技术人员很好地记载下来。参见,如,Ducruix和Geige,(1992),IRLPress,Oxford,England,以及在此引用的参考文献。一束X-射线进入到晶体中,然后从晶体衍射出来。可以应用X-射线检测装置来记录从晶体中发出的衍射图案。尽管在这些仪器较早型号上的X-射线检测装置是一片胶片,现代仪器可以数字化记录X-射线衍射的散射。X-射线源可以是各种类型,但是有利地,是应用高强度源,例如,同步加速射线源。
[0183]得到多肽分子或者分子复合物的结晶形式的三维结构的方法,对于本领域技术人员而言,是已知的。参见,如,Ducruix and Geige,(1992),IRLPress,Oxford,England,以及在此所引用的参考文献。下面是在从X-射线衍射数据确定分子或者复合物的三维结构的过程中的步骤。
[0184]在从晶体中收集了X-射线衍射图样之后,可以确定晶体中的晶胞大小和方向。可以从衍射发射线之间的间距,以及这些发射线形成的图样来确定。晶胞大小,在三维方向上,以埃为单位(1埃=10-10米)进行表征,并且以每一个顶点的角度来进行表征。在晶体中,晶胞的对称性也在这一阶段予以表征。在晶体中,晶胞的对称性,通过确定重复图样,可以简化所收集的数据的复杂性。晶胞的对称性和大小的应用,在下文有说明。
[0185]每个衍射图样发射被表征为一个矢量,通过该方法在这一阶段收集的数据确定每个矢量的振幅。矢量的相可以应用多种技术进行确定。在一种方法中,重金属原子可以浸透到晶体中,是一种称为同晶置换的方法,在X-射线分析中,这些矢量的相可以通过应用这些重金属原子作为参照点来确定。(Otwinowski,(1991),Daresbury,United Kingdom,80-86)。同晶置换的方法一般应用多于一种的重金属原子衍生物。在另一种方法中,来自具有业已确定结构的结晶多肽的矢量的振幅和相,可以应用到来自未知结构的结晶多肽的矢量的振幅上,并且随后确定这些矢量的相。第二种方法已知是分子置换,并且用作参照物的蛋白结构必须与感兴趣的蛋白具有非常接近的相关结构。(Narazsi(1994)Proteins 11:281-296)。因此,来自一个已知结构的激酶的矢量信息,如在此所报导的那些,在具有未知结构的另一个激酶的分子置换分析中是有用的。
[0186]一旦确定了矢量的相,用于描述晶体的晶胞,那么,矢量的振幅和相、晶胞大小、以及晶胞对称性,就可以被用作傅立叶变换函数中的项。从这些测量值,傅立叶变换函数计算晶胞中的电子密度。描述晶胞中的分子中的一个或者分子复合物中的一个的电子密度,可以被称作电子密度图(electron density map)。序列的氨基酸结构或者与结晶多肽复合的化合物的分子结构,可以应用各种计算机程序配合到电子密度上。该过程的这一步骤有时称作建模(model building),并且可以通过应用诸如Turbo/FRODO或者“O”的计算机程序完成。(Jones(1985)Methodsin Enzymology 115:157-171)。
[0187]随后,理论上的电子密度图,可以通过氨基酸结构与实验确定电子密度的配合而被计算出来。理论上和实验上的电子密度图可以相互比较,它们两者之间的一致性可以用叫作R-因子(R-factor)的参数进行描述。R-因子的数值较低,说明在理论上和实验上的电子密度图之间存在较高程度的重叠电子密度。
[0188]R-因子通过使用计算机程序而被最小化,该程序精修理论电子密度图(theoretical electron density map)。对于模型的精修,可以由本领域的技术人员应用诸如X-PLOR的计算机程序进行。Briinger(1992)Nature 355:472-475。精修(refinement)可以通过反复过程完成。第一步必须改变在电子密度图中定义说明的原子的构象。原子的构象可以通过提高温度的刺激来进行改变,提高温度增加了键的振动频率并且改变了该结构中的原子的位置。在原子扰动过程中的特定点,力场,它典型地根据允许的键角和键强度来定义原子之间的相互作用,范德华相互作用,氢键,离子相互作用,以及疏水相互作用,可以被用于原子的系统。有利的相互作用,可以根据自由能来描述,并且原子可以被移动很多个来回,直到达到最小自由能。可以重复精修过程,直到R-因子达到最小值。
[0189]分子或者分子复合物的三维结构通过原子描述,原子配合理论电子密度(theoretical electron density),特征在于最小的R-值。然后,产生了关于三维结构的文件,它在三维方向上,通过坐标定义每一个原子。在表1示出了这样的一个结构坐标文件的例子。
IV.PIM-1的结构
[0190]本发明提供了结晶PIM-1的高分辨率的三维结构和原子结构坐标,也提供了PIM-1与示范性的结合化合物共复合的高分辨率三维结构和原子结构坐标,是用X-射线晶体学确定的。在实施例中,说明了用于得到结构坐标的具体方法。结晶PMI-1的原子结构坐标列于表1中,并且与AMP-PMP共结晶的PMI-1的原子坐标列于表4中。共结晶坐标可以以同样方式被应用,例如,在前面所说明的各个方面中,正如针对蛋白质自身的坐标。
[0191]具有本领域技术的人员将认识到,由X-射线晶体学所确定的原子结构坐标并不是没有错误的。因此,应当理解到,所得到的针对PIM-1晶体的任何一套结构坐标,不管是天然晶体、衍生晶体或者共晶体,当应用骨架原子(N,Cα,C和O)、重叠到表1所列出的结构坐标上时,当PIM-1的骨架原子中的至少大约50%到100%被包括在该重叠中时,它的均方根偏差(“r.m.s.d.”)小于或者等于大约1.5埃,则被认为与表1(或者表4)所列的结构坐标是相同的。
V.晶体和原子结构坐标的用途
[0192]本发明的晶体,以及特别地,由它所得到的原子结构坐标,具有广泛的用途。例如,在此所说明的晶体,可以在任何应用本领域已知或者后来开发的激酶的方法中,作为起始点。如此应用的方法包括,例如,确定能够结合到激酶的天然或者突变的催化结构域上的分子。晶体和结构坐标,特别地用于鉴定调控激酶活性的配基,作为一种开发新型治疗剂的途径。特别地,晶体和结构信息在利用利用分子架构开发配基的方法中是有用的。
[0193]在此所说明的结构坐标,可以作为相模型,用于确定另外的激酶的晶体结构,以及这些激酶与配基的共晶体的结构,例如,配基是抑制剂、促效剂、拮抗剂、和其它分子。结构坐标,以及由此所得到的三维结构的模型,也可以用于帮助阐明天然或者突变激酶的基于溶液的结构,正如经由NMR所得到的结构。
VI.激酶结构的电子展示(electronic representations)
[0194]激酶或者激酶的组成部分的结构信息(如,激酶活性位点),可以以多种不同方式予以展示。特别有用的是电子展示,这是因为这些展示使得数据操作以及结构修饰快速而便捷。电子展示可以存储于很多不同的存储或者记忆介质中,经常是计算机可读取介质,例子包括,没有限制地,计算机随机访问存储器(RAM),软盘,磁性硬盘驱动器,磁带(模拟的或者数字的),致密盘(CD),光盘,只读光盘存储器(CD-ROM),内存卡,数字视频盘(DVD),以及其它。存储介质可以是与计算机系统分离的,或者是计算机系统的一部分。这样的计算机系统可以是一个具有专用特定目的,或者嵌入式系统,诸如组成X-射线晶体衍射照像系统的部分的计算机系统,或者可以是一般用途的计算机(其可以与其它设备进行数据连接,例如处在X-射线晶体衍射照像系统中的传感器装置。在很多的情况下,通过这些电子展示所提供的信息,也可以,在二维或者三维中,物理地或者可视化地展示。如,在纸上,作为可视显示(例如,在计算机显示器上,作为二维或者假三维图像的可视显示)或者作为三维物理模型。这样的物理展示也可以被应用,单独地或者与电子展示组合地应用。示范性的有用展示包括,但不限于,以下所述:
原子坐标展示(Atomic Coordinate Representation)
[0195]展示的一种类型是原子坐标的列表或者表格,代表分子结构、结构的部分或者复合物(如,共-晶体)的特定原子的位置。这样的展示也可以包括另外的信息,例如,关于特定坐标的占有率的信息。
相互作用展示的能量面(energy surface)或者表面
[0196]另一个展示是能量面展示(energy surface representation),例如活性位点或者其它结合位点的展示,展示出电子和空间相互作用的能量面。这样的展示也可以包括其它特征。一个例子就是在一个特定氨基酸残基(多个氨基酸残基)上引入一个特定氨基酸残基或者基团的展示,例如参与氢键或者离子相互作用的一个残基或者基团。
结构展示(Structual Representation)
[0197]仍然地,另一种展示是结构展示(structural representation),即是,物理展示,或者此种物理展示的电子展示。这样的结构展示包括,分子或者复合物的特定特征的相对位置的展示,常常在结构特征之间存在连接。例如,结构可以以其中所有原子被连接的方式展示;除了氢原子以外的原子是连接的;骨架原子是连接的,具有或者不具有侧链原子的展示,侧链原子可能参与显著的电子相互作用;在其他事物中。然而,并不是所有的特征需要连接。例如,对于分子或者复合物的部分的结构展示,就该特征的而言,显著的结构特征可以被展示出来(例如,与配基在结合位点具有明显的结合相互作用的氨基酸残基的原子。那些氨基酸残基可能互相间并不相连。
[0198]结构展示也可以是图解展示(schematic representation)。例如,图解展示可以以图解方式显示二级结构和/或三级结构。在多肽的这样的图解展示中,在一个残基上的一个特定氨基酸残基(或者多个氨基酸残基)或者基团(或者多个基团)可以包括,例如,在结合位点上的保守残基,和/或与结合化合物相互作用的残基(或者多个残基)或者基团(或者多个基团)。
VII.用结构坐标对具有未知结构的激酶进行结构确定
[0199]结构坐标(structual coordinates),如在表1中所列出的结构坐标,可以用于确定具有未知结构的激酶的三维结构。下述的方法,可以应用具有已知结构的多肽的结构坐标至另一个数据集中,诸如氨基酸序列、X-射线晶体学的衍射数据、或者核磁共振(NMR)数据。本发明的优选实施方案与其它PIM激酶、其它丝氨基/苏氨酸激酶、以及相关多肽的三维结构的确定有关。
应用氨基酸同源性的结构
[0200]同源建模(homology modeling)是一个方法,是应用已知结构多肽的结构坐标到未知结构多肽的氨基酸序列上。该方法是通过如下展示完成的,使用多肽或者多肽复合物的三维结构的计算机展示,具有已知结构和未知结构的多肽的氨基酸序列的计算机展示,和氨基酸结构的标准计算机展示。同源建模的方法一般涉及(a)对齐具有已知结构和未知结构的多肽的氨基酸序列;(b)将在已知结构中的保守氨基酸坐标,转移至未知结构多肽的相对应氨基酸上;精修随之而来的三维结构;和(d)构建多肽的剩余部分的结构。本领域的技术人员认识到:存在在两种蛋白质之间的保守氨基酸,可以通过步骤(a)中的序列对比步骤确定。
[0201]对本领域技术人员而言,以上方法是熟知的(Greer(1985)Science 228:1055;Bhmdell et al.A(1988)Eur.J.Biocheni.172:513。一个可以由本领域技术人员利用的、用于同源建模的示范性计算机程序,是由Accelerys Inc.发布的Insight II建模软件包中的同源模块(Homology module)。
[0202]氨基酸序列的对齐,是通过首先将具有已知结构的多肽的氨基酸序列的计算机展示置于未知结构的多肽的氨基酸序列之上来完成的。然后,比较序列中的氨基酸,将同源的氨基酸的组群进行分组归类(如化学性质相类似的氨基酸侧链-脂肪族的,芳香族的,极性的,或者带电荷的)。该方法可以检测到多肽的保守区域,并且解释氨基酸插入或者删除。
[0203]一旦具有已知结构和未知结构的多肽的氨基酸序列被排列在一起时,在具有已知结构的多肽的计算机展示中的保守氨基酸的结构,被转移到其结构未知的多肽的相对应氨基酸上。例如,在已知结构的氨基酸序列中的酪氨酸,可以用在未知结构的氨基酸序列中的对应同源氨基酸,即苯丙氨酸替换。
[0204]位于非保守区域的氨基酸的结构是手动给定的,或者通过应用标准的肽几何学或者分子模拟技术(molecular simulation techniques),如,分子动力学。在该过程中,最后步骤是通过应用分子动力学和/或者能量最小化、精修整个结构而完成的。对本技术领域的技术人员而言,同源建模方法是熟知的,并且已经采用不同蛋白质分子予以实践。例如,对应于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、肌球蛋白轻链蛋白激酶的催化结构域的多肽的三维结构,已被从cAMP-依赖性蛋白激酶的催化亚基同源建模得到。(Knighton et al.(1992)Science 258:130-135.)。
应用分子置换的结构
[0205]分子置换(molecular replacement)是一种方法,应用已知结构的多肽的X-射线衍射数据至未知序列的多肽的X-射线衍射数据上。当仅仅知道振幅的条件下,该方法可以用于定义描述未知结构的多肽的X-衍射数据的相。X-PLOR是通常利用的计算机软件包,用于分子置换。Br_nger(1992)Nature 355:472-475。AMORE是另一个用于分子置换的程序。Navaza(1994)Acta Gystallogr.A50:157-163。优选地,得到的结构并不表现出均方根偏差超过3埃。
[0206]分子置换的目的是:通过匹配来自两种结晶的原子衍射数据,对齐晶胞中的原子位置。例如,X-PLOR的程序,其可以包括四个步骤。第一步能够是确定处于晶胞中的分子数目,并且判定它们之间的角度。第二步可以涉及旋转衍射数据,来确定晶胞中的分子的定向。第三步可以是破译在三维水平上的电子密度,来正确定位晶胞中的分子。一旦确定了X-衍射数据中的振幅和相,通过比较来自参照数据集的实验性计算所得电子衍射图和来自新数据集的计算所得电子衍射图,可以计算R-因子。R-因子在30-50%之间,表明晶胞中的原子方向可以合理地通过此方法确定。在该过程中,第四步是将R-因子值降低到大约20%,是通过使用在此说明的、和对本技术领域的技术人员或者普通技术人员而言是已知的技术反复精修该新的电子密度图而实现。
应用NMR(核磁共振)数据的结构
[0207]源于X-射线晶体学技术的多肽或者多肽复合物的结构坐标,可以被用来阐明来自核磁共振(NMR)数据的多肽的三维结构。这样的方法是本领域技术人员所使用的。(Wuthrich,(1986),John Wiley and Sons,New York:176-199;Pflugrath et al.(1986)J.Mol.Biol.189:383-386;Kline et al.(1986)J.Mol.Biol.189:377-382)。虽然多肽的二级结构经常可以很容易地通过应用二维NMR数据确定,但是二级结构的个体碎片之间的空间连接是不容易确定的。定义源于X-射线晶体学技术的多肽的三维结构的坐标,可以指导NMR光谱分析者,使他们对相关结构的多肽的二级结构元件之间的空间相互作用有了解。
[0208]二级结构元件之间的空间相互作用的知识,可以大大简化来自二维NMR实验的Nuclear Overhauser Effect(核Overhauser效应,NOE)数据。另外,在用NMR技术确定二级结构之后,应用晶体学坐标仅仅简化了在多肽序列中分配有关特定氨基酸的NOEs,但是并不能很大程度地使多肽结构的NMR分析发生偏差。相反地,使用晶体学坐标简化NOE数据而同时确定多肽的二级结构,则会使蛋白结构的NMR分析发生偏差。
VIII.利用结构坐标以结构为基础设计激酶功能的调节剂
[0209]以结构为基础的调节剂设计以及鉴定技术是强有力的技术,它涉及搜索含有大量广泛的潜在调节剂和化学功能基团的计算机数据库。调节剂的计算机化设计和鉴定是非常有用的,因为计算机数据库含有比化学文库更多的化合物,一般是多一个数量级。参见以结构为基础的药物设计和鉴定的综述(参见Kuntz et al.(1994),Ace.Chem.Res.27:117;Guida(1994)Current Opinion in Struc.Biol.4:777;Colman(1994)Current Opinion in Struc.Biol.4:868)。
[0210]通过结构坐标确定的多肽的三维结构,是可以通过这些设计方法予以应用的,例如,表1的结构坐标。此外,通过在此所述的同源、分子置换、和NMR技术所确定的激酶的三维结构,也可以用到调节剂设计和鉴定方法中。
[0211]对于鉴定调节剂,可以应用天然激酶的结构信息,特别地,关于激酶活性位点的结构信息。然而,有利的是,应用来自激酶与一个或者更多的结合化合物的一种或者更多种共晶体的结构信息。如果结合化合物具有与测试化合物共同的结构核心,那么也是有优势的。
通过搜索分子数据库设计
[0212]通过将来自分子数据库的化合物进行计算机展示,将计算机展示连接(docking)来搜索调节剂,是有理设计的一个方法。公众可用的数据库包括,例如:
a)ACD,来自分子设计有限公司(Molecular Designs Limited)
b)NCI,来自美国癌症研究所(National Cancer Institute)
c)CCDC,来自剑桥结晶学数据中心(Cambridge Crystallographic Data Center)
d)CAST,来自化学文摘服务(Chemical Abstract Service)
e)Derwent,来自Derwent信息有限公司(Derwent Information Limited)
f)Maybridge(五月桥),来自五月桥化学公司(Maybridge Chemical
Company LTD)
g)Aldrich,来自Aldrich化学品公司(Aldrich Chemical Company)
h)Directory of Natural Products(天然品目录),来自Chapman & Hall
[0213]这样的一个数据库(由分子设计有相似信息系统(Molecular Designs LimitedInformation Systems)发布的ACD)含有合成得到的或者是天然产品的化合物。利用本领域技术人员可以利用的方法,可以转化两维展示的数据集为三维展示的数据集。这些方法能够通过这些计算机程序实现,例如来自Tripos Associates的计算机程序CONCORD,或者来自分子模拟有限公司(Molecular Simulations Limited)的计算机程序DE-Converter。
[0214]以结构为基础的调节剂设计的多种方法,对于本领域技术人员而言,是已知的(Kuntz et al.,(1982),J.Mol.Biol.162:269;Kuntz et aZ.,(1994),Ace.Chem.Res.27:117;Meng et al.,(1992),J.Compt.Chem.13:505;Bohm,(1994),J.Comp.AidedMolec.Design 8:623).
[0215]在理性调节剂设计领域中,被技术人员所广泛应用的一个计算机程序,是来自旧金山的加州大学的DOCK。在该计算机程序以及类似于它的程序中,所利用的一般方法被描述在以下的三个应用中。关于这些技术的更详细信息,可以在Accelerys User Guide,1995中找到。用于该目的的典型计算机程序包括以下步骤:
(a)从蛋白质中去除存在的化合物;
(b)用计算机程序(如DOCK)将另一个化合物的结构放到活性位点,或者通过相互作用移动该化合物至活性位点。
(c)表征在化合物和活性位点原子之间的空间;
(d)搜索文库,寻找分子片段,其(i)可以配合进在化合物和活性位点之间的空的空间,和(ii)可以被连接到该化合物上;并且
(e)连接以上发现的片段至化合物,并且评估该新的经过修饰的化合物。
[0216](c)部分是指表征在活性位点的原子与化合物之间所形成的几何学和互补的相互作用。当化合物和活性位点的原子共享有重要意义的表面积、而不形成不利的空间相互作用时,就达到了有利的几何学适合(geometric fit)。本领域的技术人员将注意到:该方法可以通过跳过(d)和(e)部分以及筛选具有很多化合物的数据库而被实施。
[0217]激酶功能调节剂的以结构为基础的设计和鉴定,可以与分析筛选联系起来应用。因为在大概几个小时之内,就可以搜索化合物的大计算机数据库(大约10,000种化合物),以计算机为基础的方法可以缩小被测试化合物的范围,其中在生化或细胞分析中测试作为激酶功能的潜在调节剂的化合物。
[0218]以结构为基础设计调节剂的以上说明,并不是完全囊括所有的;其他方法被报导在下述文献中:
(1)CAVEAT:Barriett et al.,(1989),in Chemical and Biological Problems in MolecularRecognition(在分子识别中的化学和生物学问题),Roberts,S.M;Ley,S.V.;Campbell,M.M.eds.;Royal Society of Chemistry:Cambridge,pp182-196。
(2)FLOG:Miller et al.,(1994),J.Comp.Aided Molec.Design 8:153。
(3)PRO Modulator:Clark et al.,(1995),J.Comp.Aided Molec.Design 9:13.
(4)MCSS:Mirariker and Karplus,(1991),Proteins:Structure,Function,and Genetics11:29.
(5)AUTODOCK:Goodsell and Olson,(1990),Proteins:Structure,Function,andGenetics 8:195.
(6)GRID:Goodford,(1985),J.Med.Chem.28:849.
通过修饰与PIM-1激酶形成复合物的化合物而设计
[0219]鉴定化合物为潜在调节剂的另一种方式,是在多肽的活性位点上修饰一种已经存在的调节剂。例如,调节剂的计算机展示,可以在PIM-1或者其它PIM激酶的活性位点的计算机展示中被修饰。这一技术的详细说明,可以在AccelerysUser Manual,1995LUD中找到。调节剂的计算机展示一般通过一个化学基团或者多个化学基团的删除或者通过加入一个化学基团或者多个化学基团来进行修饰。
[0220]一旦每一个修饰加到化合物上,经修饰化合物的原子和活性位点,可以在构象中发生位移,并且在调节剂和活性位点原子之间的距离会被记录下来,伴随着在两个分子之间形成的任何互补相互作用。当达到有利的几何学配合以及有利的互补相互作用时,记分达到完全。具有有利得分的化合物就是潜在的调节剂。通过修饰能结合PIM-1激酶的化合物的结构而设计
[0221]以结构为基础设计调节剂的第三种方法,是筛选由调节剂构建或者调节剂搜索计算机程序所设计的化合物。这些类型的程序的例子,可以在分子模拟软件包,催化剂中找到(Molecular Simulations Package,Catalyst)。应用这一程序的说明被以文件形式记录在分子模拟用户指南(1995)(Molecular Simulations UserGuide)。其它用于该项用途的计算机程序,是来自分子设计有限公司(MolecularDesigns Limited)的ISIS/HOS T,ISIS/BASE,ISIS/DRAW;和来自Tripos Associates的UNITY。
[0222]这些程序可以在化合物的结构上进行操作,该化合物已经从化合物-激酶复合物的三维结构的活性位点取出。因为它是处于生物学活性构象中,所以优选对于这样的化合物进行程序操作。
[0223]调节剂构建计算机程序(modulator construction computer program),是一个计算机程序,应用在使用来自计算机数据库的基团替换化学基团的计算机展示中,其中化学基团是存在于与激酶或者其它生物分子复合的一种化合物中。调节剂搜索计算机程序(modulator search computer program),是一个计算机程序,它可以被用于搜索来自计算机数据库的化合物的计算机展示,该化合物具有与结合到特定生物分子上的化合物相似的三维结构和相似的化学基团。
[0224]典型程序,可以通过应用以下的一般步骤进行操作:
(a)根据化学特征对化合物绘图,例如通过氢键供体或者受体,疏水性/亲脂
性位点,带正电离子化位点,或者带负电离子化位点;
(b)加入几何学限制于绘制特征中;并且
(c)用(b)中所产生的模型搜索数据库。
[0225]本领域技术人员也认识到并不是该化合物的所有可能的化学特征需要出现在(b)的模型中。人们可以应用模型的任何亚类,来产生不同的模型,用于数据库搜索。
利用分子架构的调节剂设计
[0226]本发明也有利地利用了设计化合物的方法,指定为分子架构(molecularscaffolds),其可以广泛地跨分子家族发挥作用,并且用于应用分子架构来设计靶向这些家族的单个或者多个成员的配基。在优选的实施方案中,该分子可以是蛋白质,一套化学化合物被装配,以便其具有性质,以致它们是:1)化学设计为作用于某些蛋白质家族;和/或2)行为更象分子架构,意味着:它们具有使得它们特异性结合感兴趣家族中的一个或者多个蛋白质的化学亚结构。替代地,分子架构可以设计为具有优选活性,该优选活性针对单个靶分子。
[0227]分子架构的有用化学性质,可以包括下述特性中的一个或者更多个,但是并不限于此:平均分子量低于大约350道尔顿,或者在从大约150到大约350道尔顿之间,或者从大约150到大约300道尔顿;具有的clogP低于3;可转动键的数目少于4个;氢键供体和受体的数目低于5或者低于4;极性表面积低于50_2;定向结合于蛋白质的结合位点,以便来自组合文库的、粘附于架构的化学取代物可以伸入到蛋白质结合位点的口袋中;并且在其取代物连接位点附加化学上易于处理的结构,该结构可以被修饰,因此可以进行快速的文库构建。
[0228]“clog P”是指一种化合物的计算log P,“P”是指在辛醇和水之间的分配系数。
[0229]术语“分子极性表面面积(Molecular Polar Surface Area,PSA)”是指在一个分子中的极性原子的表面积贡献的总和(一般是氧,氮,以及连接的氢)。已经表明,极性表面积与药物传输特性有良好相关性,如肠内吸收,或者血-脑屏障穿透。
[0230]包含于组合文库的有别化合物的另一个有用的化学性质,包括化学组分粘附于化合物的能力,这并不干扰化合物对于至少一种感兴趣蛋白质的结合,并且这将给予文库成员所需特征,例如,引起文库成员可以主动运输到感兴趣的细胞和/或器官中,或者粘附于诸如层析柱的装置上的能力(例如,通过分子如生物素粘附于链霉亲合素柱中),以此将它们用作组织和蛋白组学测量目的。
[0231]本领域的普通技术人员将认识到:其他性质,以及具有这些性质的化合物也可以以类似方式被寻求和鉴定;其中依赖于应用中的特定需要,上述其他性质对于架构或者文库成员是期望的。筛选化合物用于分析的方法,对本领域技术人员而言,是已知的,例如,在美国专利编号No.6,288.234,6,090,912,5,840,485中所描述的方法和化合物,它们中的每一个以其完整内容一并在此列为参考,包括所有的图表和附图。
[0232]在各种各样的实施方案中,本发明提供了设计配基的方法,配基可以结合一个分子家族的成员中的多个,其中这些配基含有一个共同的分子架构。因此,可以分析一个化合物组与一个分子家族的成员的多数个的结合,如,蛋白质家族。结合家族成员的多数个的一个或者多个化合物,可以被鉴定为分子架构。当确定了这些架构在靶分子的结合位点中的定向、以及鉴定出化学易处理结构时,可以合成一套配基,起始于一个或者几个分子架构、达到多数个配基,其中每一个配基结合到分子家族中的分离的靶分子上,相对于架构,具有改变的或者变化的结合亲和性或者结合特异性。因此,可以依据相同的分子架构,设计出很多的药物前导分子,优先靶向一个分子家族的个体成员,并且以特异方式对它们起作用。
结合分析(Binding Assays)
[0233]本发明的方法涉及能够检测化合物针对靶分子的结合作用的测定,在测定中,信号至少大约三倍于背景信号的标准偏差,或者至少大约四倍于背景信号的标准偏差。本发明的分析,也包括分析对于靶分子以低亲和性结合的化合物。对于不同类型的靶,已知有很多种不同的用于表明结合作用的测定,并且可以用于本发明。广泛作用于蛋白质家族的化合物,对于单个的靶分子,一般不具有较高的亲和性,这是由于它们的结合作用的广泛性。因此,在此所述的分析允许鉴定以低亲和性、很低亲和性、以及极低亲和性结合的化合物。因此,效力(或结合亲和力)并不是鉴定潜在有用的结合化合物的主要的,或者说不是最重要的标志。更合适地说,即使以低亲和性、很低亲和性、或者极低亲和性结合的那些化合物,也认为它们可能是分子架构,它们可以继续配基设计过程的下一个阶段。
[0234]以“低亲和性”进行结合,是指与靶分子结合的解离常数(Kd),在标准条件下大于1μM。以“很低亲和性”进行结合,是指与靶分子结合的解离常数(kd),在标准条件下大于约100μM。以“极低亲和性”进行结合,是指与靶分子结合的解离常数(kd),在标准条件下大于约1mM。“中度亲和性”是指在标准条件下,结合的Kd为从大约200nM到大约1μM。“中度高亲和性”是指在标准条件下,结合的Kd为从大约1nM到大约200nM。“高亲和性”结合是指在标准条件下,结合的Kd低于大约1nM。例如,低亲和性结合的发生,可能是由于较差配合进入靶分子的结合位点中,或者由于非共价键的较少数目,或者存在较弱的共价键,引起架构或者配基与靶分子之结合位点的结合作用较弱,相对于较高亲和性结合作用发生的情况而言。结合的标准条件是在37℃下,pH 7.2,结合一个小时。例如,可以在HEPES 50mM缓冲液中,采用100uL/孔,在pH 7.2,NaCl 15mM,ATP 2μM,以及牛血清白蛋白1μg/孔,在37℃下温育一小时。
[0235]结合化合物也可以用其对于靶分子活性的影响来进行表征。因此,“低活性”化合物具有的抑制浓度(IC50)或者激活浓度(EC50),在标准条件下大于1μM。“很低活性”是指IC50或者EC50,在标准条件下大于100μM。“极低活性”是指IC50或者EC50,在标准条件下大于1mM。“中度活性”是指IC50或者EC50,在标准条件下在200nM到1μM之间。“中度高活性”是指IC50或者EC50,在标准条件下在1nM到200nM之间。“高活性”是指IC50或者EC50,在标准条件下低于1nM。IC50(或者EC50)定义为化合物的浓度:相对于没有化合物存在时的活性,被测量的靶分子(如,酶或者其它蛋白)的活性失去(或者增加)50%时的化合物浓度。活性的测定,可以用本领域技术人员所掌握的方法进行测定,如通过测定由于任何酶促反应的发生而产生的可检测产物或者信号,或者被测量蛋白质的其它活性。
[0236]对于结合分析,“背景信号(background signal)”是指对于特定分析,在标准条件下,在不存在结合靶分子的测试化合物、分子架构、或者配基时所记录的信号。本领域的普通技术人员了解目前存在的可接受的方法,并且是广泛地应用于确定背景信号。
[0237]“标准偏差(standard deviation)”是指偏差的平方根。偏差是背离分布的一个量度。它被计算为以每一个数字背离其平均值的偏差均方值。例如,对于数字1,2,和3,平均值是2,偏差是:
[0238]为了设计或者发现对于蛋白质家族广泛作用的分子架构,针对化合物汇集或者集合,分析感兴趣蛋白质。该分析可以优选的是酶促分析,或者结合分析。在一些实施方案中,可能需要增加筛选中的化合物的溶解性,然后在测定中分析所有表现活性的化合物,包括那些以低亲和性结合或者产生的信号大于三倍背景信号标准偏差的化合物。该测定可以是任何适用的测定,例如,测量两种结合配偶之间的结合亲和性的结合测定。本领域中已知可以用于本发明实践的各种不同类型的筛选测定,如在美国专利编号Nos.5,763,198,5,747,276,5,877,007,6,243,980,6,294,330,和6,294,330中所述的测定。这些文献的每一个被以其全部引入本文,作为参考参考,包括所有的图表和附图。
[0239]在测定的各种实施方案中,至少一种化合物,至少大约5%,至少大约10%,至少大约15%,至少大约20%,或者至少大约25%的化合物,可以以低亲和性结合。总的来说,多至大约20%的化合物可以在筛选测定中表现出活性,并且这些化合物可以直接用高通量的共结晶学技术进行分析,计算分析以便将具有共同结构特征(如,结构核心和/或外形和极性特征)的化合物进行分组归类,和在显示出活性的化合物之间鉴定共同化学结构。
[0240]本领域普通技术人员将认识到:判断可以基于适合于特定条件的需要的标准而作出,判断可以通过计算机软件程序做出。含有几乎任何数目的架构的类别可以被产生,并且所选择的标准可以是基于逐渐增加精确性的标准,直到对于每一类别的任意数目的架构得以实现,其被认为是具有优势的水平。.
表面等离子体共振(surface plasmon resonance)
[0241]结合参数可以应用表面等离子体共振来进行测定,例如,应用由固定化结合组分所包被的BIAcore_芯片(Biacore,Japan)。表面等离子体共振是用于表征sFv或者针对靶分子的其它配基之间的微观结合和解离常数。这些方法在以下的参考文献中有说明,在此一并引入本文,作为参考。Vely F.et al.,(2000)BIAcore_analysis to test phosphopeptide-SH2domain interactions.Methods in MolecularBiology.121:313-21;Liparoto et al.,(1999)Biosensor analysis of the interleukin-2receptorcomplex.Journal of Molecular Recognition.12:316-21;Lipschultz et al.,(2000)Experimental design for analysis of complex kinetics using surface plasmon resonance,Methods.20(3):310-8;Malmqvist,(1999)BIACORE:an affinity biosensor system forcharacterization ofbiomolecular interactions,Biochemical Society Transactions27:335-40;Alfthan,(1998)Surface plasmon resonance biosensors as a tool in antibodyengineering.Biosensors&Bioelectronics.13:653-63;Fivash et al.,(1998)BIAcore formacromolecular interaction,Current Opinion in Biotechnology.9:97-101;Price et al.;(1998)Summary report on the ISOBM TD-4Workshop:analysis of 56 monoclonalantibodies against the MUC1 mucin.Tumour Biology 19 Suppi 1:1-20;Malmqvist et al,(1997)Biomolecular interaction analysis:affinity biosensor technologies for functionalanalysis of proteins.Current Opinion in Chemical Biology.1:378-83;O′Shannessy et al.,(1996)Interpretation of deviations from pseudo-first-order kinetic behavior in thecharacterization ofligand binding by biosensor technology.Analytical Biochemistry.236:275-83;Malmborg et al.,(1995)BIAcore as a tool in antibody engineering,Journalof Immunological Methods.183:7-13;Van Regenmortel,(1994)Use of biosensors tocharacterize recombinant proteins.Developments in Biological Standardization.83:143-51;and O′Shannessy,(1994)Determination of kinetic rate and equilibriumbinding constants for macromolecular interactions:a critique of the surface plasmonresonance literature,Current Opinions in Biotechnology.5:65-71.
[0242]BIAcore_应用表面等离子体共振(SPR)的光学特征,来检测结合于葡聚糖基质上的蛋白质浓度的变化,该基质位于金/玻璃传感器芯片界面的表面上,为葡聚糖生物传感器基质。简要地说,蛋白质以已知浓度共价结合到葡聚糖基质上,蛋白质的配基被注射通过葡聚糖基质。用近红外光直接射向传感器芯片表面的反面,被反射,也在金薄膜中感应衰逝波,反过来,这引起反射光在特定角度有强度降落,其中特定角度被称为共振角。如果传感器芯片表面的折光率发生变化(如,由于配基结合于束缚蛋白),共振角会发生移动。可以测量共振角的移动,并且将其表示为共振单位(RUs),如1000RUs是等价于1ng/mm2的表面蛋白浓度的变化。这些变化相对于时间,沿着传感图的Y轴显示出来,其描述了任何生物学反应的缔合和解离。
高通量筛选(HTS)测定
[0243]HTS一般应用自动化测定,来搜索大量的化合物,寻找所需活性。典型地,HTS测定是用于发现新的药物的,是通过筛选作用于特定的酶或者分子的化学品进行的。例如,如果一个化学品使得一种酶失活,那么它可能被证明在细胞中阻止引起疾病的一个过程中具有功效。高通量的方法使得研究人员可以应用机器人处理系统,很快地对于每一个靶分子测定数千种不同的化学品,并且能够对结果进行自动分析。
[0244]正如在此所应用的,“高通量筛选(high throughput screening)”或者“HTS”是指对于大量的化合物(文库);一般一万到十万种化合物,应用自动化筛选测定,在体外进行快速筛选。超高通量筛选(uHTS)一般是指加速的高通量筛选,超过每天100,000次测试。
[0245]为了完成高通量筛选,有利的是,将样品放到多容器的架子上或者平台上,多容器架子方有助于同时测量多个候选化合物的反应。多孔微板可以用作这种架子。这样的多孔微板,以及在很多测定中应用它们的方法,在本领域人员是已知的,并且可以通过商业途径得到。
[0246]筛选测定可以包括对照组,目的在于校正和确证测试组分的正确操作。空白孔含有所有的反应物,但是通常没有包括化学品文库的成员。正如另一个例子,对于一种酶的已知抑制剂(或者激活剂),来寻找其调节剂,将该抑制剂(或者激活剂)与测定中的一个样品进行温育,而酶活性的所致降低(或者增高)被用作比较物或者是对照物。也应该理解到,调节剂也可以与酶激活剂或者抑制剂一起组合应用,来发现抑制酶激活或者抑制的调节剂,该激活或者抑制是由于存在已知的酶调节剂而引起的。相似地,当寻找神经鞘脂靶物质的配基时,靶分子的已知配基可以存在于对照/校正测定孔中。
在筛选测定中测量酶促反应和结合反应
[0247]测量酶促和结合反应的进程的技术,如在多容器架子中,在本领域是已知的,并且包括,但是不限于,以下所述。
[0248]分光光度分析和光谱荧光分析对于专业人员是了解的。这些分析的例子包括应用比色分析来检测过氧化物,正如在实施例1(b)和Gordon,A.J.and Ford,R.A.,(1972)The Chemist′s Companion:A Handbook Of Practical Data,Techniques.AndReferences.John Wiley and Sons,N.Y.,Page 437中所说明的。
[0249]荧光光谱可以用于监视反应产物的产生。。荧光方法学一般是比吸收方法学更加敏感。本领域技术人员熟悉荧光探针的应用。参见以下的综述文献,Bashfordet al.,(1987)Spectrophotometry and Spectrofluorometry:A Practical Approach,pp.91-114,IRL Press Ltd.;以及Bell,(1981)Spectroscopy m Biochemistry.Vol.I,pp.155-194,CRC Press。
[0250]在光谱荧光测量方法中,酶暴露给底物,当用靶酶处理时,底物改变了其天然的荧光性质。典型地,底物是非荧光的,但通过一个或者多个反应转变成具荧光性质的物质。正如一个非限定的实施例,可以应用Amplex_Red reagent(Molecular Probes,Eugene,OR)检测到SMase活性。为了应用Amplex_Red测量神经磷脂酶的活性,发生了以下的反应。首先,SMase水解了神经鞘磷脂而产生神经酰胺和磷酸胆碱。第二,碱性磷酸酶水解磷酸胆碱产生胆碱。第三,胆碱由胆碱氧化酶氧化得到甜菜碱。最后,H2O2,在存在辣根过氧化酶的条件下,与Amplex_Red反应产生了具荧光的产物,Resorufin,然后用光谱荧光分光术检测所产生的荧光信号。
[0251]荧光偏振(FP)是基于荧光生色团的分子旋转速度的降低,其是在结合于较大分子的情况下才发生,诸如受体蛋白,通过结合的配基使得发射偏振的荧光。FP是经验确定的,是通过在用平面偏振光激发后、测量垂直方向和水平方向的荧光发射而确定。当荧光生色团的分子旋转速度降低时,偏振发射增加。当其结合于较大的分子(如,受体)时,荧光团产生较大的偏振信号,减慢荧光团的分子旋转。偏振信号的数量级定量地与荧光配基结合程度相关。所以,“束缚”信号的偏振作用依赖于保持高亲和性结合。
[0252]FP是相似的技术并且反应非常迅速,经过几秒钟到几分钟就可以达到反应平衡。反应物是稳定的,并且可以大量制备,结果有很好的重现性。由于这些性质,已经证明FP是可以高度自动化的,一般通过与单一的,预先混和的,示踪-受体反应物进行温育就可以进行。参见综述文献,Owickiet al.,(1997),Application ofFluorescence Polarization Assays in High-Throughput Screening,Genetic EngineeringNews,17:27。
[0253]由于,其读数不受发射强度的影响,FP是特别值得需要的(Checovich,W.J.,et al.,(1995)Nature 375:254-256;Dandliker,W.B.,et al.,(1981)Methods inEnzymology 74:3-28)并且其因此对于存在有色化合物不敏感,有色化合物会使得发射的荧光淬灭。FP和FRET(参见以下)对于鉴定阻止神经鞘脂受体与它们的配基的相互作用的化合物是非常适合的。参见,如,Parker et al.,(2000)Developmentof high throughput screening assays using fluorescence polarization:nuclearreceptor-ligand-binding and kinase/phosphatase assays,J Biomol Screen 5:77-88。
[0254]源于神经鞘脂的荧光团可以以商业途径得到,用于FP分析。例如,MolecularProbes(Eugene,OR)目前正在出售神经鞘磷脂和单神经酰胺荧光团。这些是,分别地,N-(4,4-二氟-5,7-二甲基-4-硼-3a,4a-二嗪-s-indacene-3-戊基)鞘氨基磷酸胆碱(BODIPY_FL C5-神经鞘磷脂);N-(4,4-二氟-5,7-二甲基-4-硼-3a,4a-二嗪-s-indacene-3-十二烷基)鞘氨基磷酸胆碱(BODIPY_FL C12-神经鞘磷脂);以及N-(4,4-二氟-5,7-二甲基-4-硼-3a,4a-二嗪-s-indacene-3-戊基)鞘氨醇(BODIPY_FLC5-神经酰胺)。美国专利编号No.4,150,949,(对于庆大霉素的免疫分析),说明了荧光素-标记的庆大霉素,包括荧光素硫代羰基庆大霉素(fluoresceinthiocarbanylgentamicin)。另外的荧光团可以使用本领域技术人员所了解的方法制备。
[0255]示范性的常态-和-偏振荧光读数器包括POLARION_荧光偏振系统(TecanAG,Hombrechtikon,Switzerland)。用于其它分析的普通多孔板读数器,例如,VERSAMAX_读数器和SPECTRAMAX_多孔板分光光度计(两者均来自Molecular Devices(分子设备公司))。
[0256]荧光共振能量转移(Fluorescence resonance energy transfer,FRET)是另一个有用的测试,用于检测相互作用,并且在以下的文献中有说明,参见,如,Heim etal.,(1996)Curr.Biol.6:178-182;Mitra et al.,(1996)Gene 173:13-17;和Selvin et al.,(1995)Meth.Enzymol.246:300-345。FRET检测两种相互靠得很近的荧光物质之间的能量转移,业已知道激发和发射波长。作为一个实例,一种蛋白质可以与绿色荧光蛋白(GFP)以融合蛋白被表达。当两种荧光蛋白相互靠得很近时,正如当蛋白与靶分子特异地相互作用时,共振能量可以从一个激发分子转移到另一个。结果,样品的发射光谱发生位移,其可以用荧光计进行测量,例如fMAX多孔荧光计(Molecular Devices,Sunnyvale Calif.)。
[0257]闪烁亲近分析(SPA)是特定用于检测与靶分子相互作用的分析。SPA广泛用于制药工业,并且在以下的文献中有说明(Hanselman et al.,(1997)J.LipidRes.38:2365-2373;Kahl et al.,(1996)Anal.Biochem.243:282-283;Undenfriend et al.,(1987)Anal.Biochem.161:494-500)。参见美国专利编号Nos.4,626,513和4,568,649,以及欧洲专利编号No.0,154,734。一个可以购买到的系统应用了FLASHPLATE_闪烁-包被板(NEN Life Science Products,Boston,MA)。
[0258]靶分子可以通过已知的各种不同方法结合到闪烁板上。经过衍生化处理的闪烁板是可以得到的,以便结合融合蛋白,诸如GST、His6或者Flag融合蛋白。当靶分子是蛋白复合体或者多聚体时,一种蛋白或者亚基可以先结合到板上,然后,该复合体的其它组分随后在结合条件下加入到其中,得到结合的复合体。
[0259]在典型的SPA分析中,在表达池中的基因产物将业已被放射性标记,随后加入到孔中,使其与固相相互作用,固相是孔中的固定化靶分子和闪烁体包被层。立即进行测定,或者使其达到平衡。任何一种方式下,当放射性标记变得足够接近闪烁体包被层时,其产生可以用诸如TOPCOUNT NXT_微量板闪烁计数器(Packard BioScience Co.,Meriden Conn.)的设备进行检测的信号。如果放射性标记的表达产物结合于靶分子,放射性标记仍保持靠近闪烁体足够长的时间,以便产生可检测的信号。
[0260]相反地,标记蛋白并不结合靶分子或者仅仅短暂结合靶分子,并不能保持与闪烁体接近足够长的时间以便产生高于背景的信号。由于随机布朗运动所引起的、在闪烁体附近所花费的任何时间,也不会导致显著量的信号。同样地,残余未装配上在表达步骤中所应用的放射性标记的情况也会存在,但是并不产生显著的信号,这是因为其在溶液中,而不是与靶分子相互作用。这些非-结合的相互作用,将因此引起一定水平的背景信号,这些可以用数学方法进行处理而去除。如果得到过多种类的信号,直接向分析板中加入盐或者其它改性剂,直到达到所需要的特异性。(Nichols et al.,(1998)Anal.Biochem.257:112-119)。
化合物和分子架构的分析
[0261]架构的优选特征包括:具有低分子量(如,低于350Da,或者从大约100到大约350道尔顿,或者从大约150到大约300道尔顿)。架构的优选clog P是从-1到8,更优选地少于6、5、或者4,最优选地是少于3。在特定的实施方案中,clogP的范围是-1到上限2,3,4,5,6,或者8;或者其范围是0到上限2,3,4,5,6,或者8。旋转键的数目优选的是少于5,更优选的是少于4。氢键供体和受体优选的数目是少于6,更优选的是少于5。另一个有用的标准是极性表面积要少于5。可以用在针对特定应用的鉴定标准中的指导原则,可以在以下的文献中找到Lipinski et al.,(1997)Advanced Drug Delivery Review′s 233-25,在此以其整体引入,作为参考。
[0262]架构可以优选地结合到构型中的一个给定蛋白结合位点上,这引起架构中的取代基部分被定位于蛋白结合位点的口袋中。同样地,架构的一个优选的特性是具有化学上易于处理加工基团,该基团可以被化学修饰,特别地通过合成反应修饰,以便容易地产生一个组合文库。同时,也优选在架构上具有其它成分可以进行粘附的位置,这些位置并不影响架构对于感兴趣蛋白的结合作用,但是会引起架构达到所需要的性质,例如,架构至细胞和/或组织中的活性输送,使得架构粘附于层析柱上便于分析,或者另一些所需的性质。分子架构可以以任何亲和性结合到靶分子上,诸如以可以测量的、三倍于背景信号的标准偏差的亲和性进行结合,或者以高度亲和性,中度亲和性,低度亲和性,很低亲和性,或者极低亲和性进行结合。
[0263]因此,以上标准可以用于选择很多化合物,用于测试具有所需要的属性。具有所述标准的很多化合物,可以在商业市场上得到,依据所应用方法的特定需要,可以被选择用于进行分析。
[0264]“化合物文库(compound library)”或者“文库(library)”是指具有不同不同化学结构的不同化合物的汇集。化合物文库是可以进行筛选的,即是,化合物文库中的成员可以遭受筛选分析。在优选的实施方案中,文库成员具有的分子量范围是从大约100到大约350道尔顿,或者从大约150到大约350道尔顿。以上提供了很多文库的例子。
[0265]本发明的文库含有至少一种以低亲和性结合靶分子的化合物。候选化合物的文库可以通过不同的分析方法进行分析,如以上所述的那些分析方法,例如,荧光偏振分析。文库可以含有化学合成的肽,肽模拟体(peptidomimetics),或者含有或大或小的、聚焦或者不聚焦的组合化学品的阵列。借助“聚焦的(focused)”,涵义是指化合物的集合是应用先前已经表征过的化合物和/或药效团(pharmacophores)的结构制备的。
[0266]化合物文库可以含有分离白天然来源的分子,人工合成的分子,或者是以具有一个或者多个可变部分的方式合成的、分离的、或者制备的分子,例如,各个部分是独立地分离或者随机地合成的。化合物文库中的分子种类包括,但不限于,正如在此所用的术语所指的有机化合物、多肽和核酸,以及它们的衍生物、偶联物和混合物。
[0267]本发明的化合物文库,可以在市场上购买,或者用任何手段制备或者得到,这些手段包括,但不限于,组合化学技术,发酵方法,植物和细胞提取程序以及类似方法(参见,如,Cwiria et al.,(1990)Biochemistry,87,6378-6382;Houghten et al.,(1991)Nature,354,84-86;Lam et al.,(1991)Nature,354,82-84;Brenner et al.,(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89,5381-5383;R.A.Houghten,(1993)Trends Genet.,9,235-239;E.R.Felder,(1994)Chimia,48,512-541;Gallop et al.,(1994)J.Med.Chem.,37,1233-1251;Gordon et al.,(1994)J.Med.Chem.,37,1385-1401;Carell et al.,(1995)Chem.Biol.,3,171-183;Madden et al..Perspectives in Drug Discovery and Design 2,269-282;Lebl et al.,(1995)Biopolymers,37177-198);围绕一个共享的分子结构装配出的小分子;已经由各种商业或者非商业集团装配的化学品的收集,天然产物;海生生物体、真菌、细菌、和植物的提取物。
[0268]优选的文库,可以在均相反应混合物中进行制备,并且在筛选以前,从文库成员中分离未反应试剂是不必要的。尽管很多组合化学途径是基于固态化学,但是液相组合化学是可以产生文库的(Sun CM.,(1999)Recent advances inliquid-phase combinatorial chemistry.Combinatorial Chemistry&High ThroughputScreening.2:299-318)。
[0269]为了从文库得到具有一个或者更多个预先选择的属性的成员,制备由多种类型分子组成的文库,这可以通过多种不同的技术进行制备,包括但不限于,平行阵列合成(Houghton,(2000)Annu Rev Pharmacol Toxicol 40:273-82,Parallel arrayand mixture-based synthetic combinatorial chemistry;solution-phase combinatorialchemistry(Merritt,(1998)Comb Chem High Throughput Screen 1(2):57-72,Solutionphase combinatorial chemistry,Coe et al.,(1998-99)Mol Divers;4(1):31-S,Solution-phase combinatorial chemistry,Sun,(1999)Comb Chem High Tf-iroughputScreen 2(6):299-318,Recent advances in liquid-phase combinatorial chemistry);synthesis on soluble polymer(Gravert et al.,(1997)Curr Opin Chem Biol 1(1):107-13,Synthesis on soluble polymers:new reactions and the construction of small molecules);以及相似文献。参见,如,Dolle et al.,(1999)JComb Chem 1(4):235-82,Comprehensive survey of cominatorial library synthesis:1998.Freidinger RM.,(1999)Nonpeptidic ligands forpeptide and protein receptors.Current Opinion in ChemicalBiology;and Kundu et al..Prog Drug Res;53:S9-156,Combinatorial chemistry:polymer supported synthesis ofpeptide and non-peptide libraries)。.Compounds may beclinically tagged for ease of identification(Chabala,(1995)Curr Opin Biotechnol6(6):633-9,Solid-phase combinatorial chemistry and novel tagging methods foridentifying leads)。
[0270]已经描述了碳水化合物的组合合成以及含有寡糖的文库(Schweizer et al.,(1999)Curr Opin Chem Biol 3(3):291-8,Combinatorial synthesis of carbohydrates)。已经描述了基于化合物文库合成天然产物(Wessjohann,(2000)Curr Opin Chem Biol4(3):303-9,Synthesis of natural-product based compound libraries)。
[0271]用各种不同的方法制备核酸的文库,包括,以非限定实例的方式,此处所描述的技术,用于分离核酸配体(aptamers)。展示在链霉亲和素磁珠表面的、包括寡聚核苷酸和聚氨基寡聚核苷酸的文库是已知的(Markiewicz et al.,(2000)Synthetic oligonucleotide combinatorial libraries and their applications,Farmaco.55:174-7)。下述核酸文库是已知的,其可以与平行取样偶联、并且可以不用复杂程序去卷积,如自动化质谱(Enjalbal C.Martinez J.Aubagnac JL,(2000)Massspectrometry in combinatorial chemistry.Mass Spectrometry Reviews.19:139-61)和平行标记(Perrin DM.,Nucleic acids for recognition and catalysis:landmarks,limitations,and looking to the future,Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening3:243-69)。
[0272]应用组合化学和固相合成,来鉴定肽模拟体(peptidomimetics)(Kim HO.Kahn M.,(2000)A merger of rational drug design and combinatorial chemistry:development and application of peptide secondary structure mimetics,CombinatorialChemistry & High Throughput Screening 3:167-83;al-Obeidi,(1998)Mol Biotechnol9(3):205-23,Peptide and peptidomimetric libraries.Molecular diversity and drugdesign)。合成可以是完全随机的,或者部分地基于一个已知多肽。
[0273]多肽文库可以按照各种不同的技术进行制备。简要地说,可以应用噬菌体展示技术来产生多肽配基(Gram H.,(1999)Phage display in proteolysis and signaltransduction,Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening.2:19-28)。其可以用作合成肽模拟体的基础。多肽,约束肽(constrained peptides),蛋白质,蛋白质结构域,抗体,单链抗体片段,抗体片段以及抗体结合区域,被展示在丝状噬菌体上,用于选择。
[0274]已经产生了人单链Fv抗体的单个变异体的大文库,参见,如,Siegel RW.Alien B.Pavlik P.Marks JD.Bradbury A.,(2000)Mass spectral analysis of a proteincomplex using single-chain antibodies selected on a peptide target:applications tofunctional genomics,Journal of Molecular Biology 302:285-93;Poul MA.Becerril B.Nielsen UB.Morisson P.Marks JD.,(2000)Selection of tumor-specific internalizinghuman antibodies from phage libraries.Source Journal of Molecular Biology.301:1149-61;Amersdorfer P.Marks JD.,(2001)Phage libraries for generation ofanti-botulinum scFv antibodies.Methods in Molecular Biology.145:219-40;Hughes-Jones NC.Bye JM.Gorick BD.Marks JD.Ouwehand WH.,(1999)Synthesisof Rh Fv phage-antibodies using VH and VL gel-inline genes,British Journal ofHaematology.105:8ll-6;McCall AM.Amoroso AR.Sautes C.Marks JD.Weiner LM.,(1998)Characterization of anti-mouse Fc gamma RII single-chain Fv fragments derivedfrom human phage display libraries,Immunotechnology.4:71-87;Sheets MD.Amersdorfer P.Finnem R.Sargent P.Lindquist E.Schier R.Hemingsen G.Wong C.Gerhart JC.Marks JD.Lindquist E.,(1998)Efficient construction of a large nonimmunephage antibody library:the production of high-affinity human single-chain antibodies toprotein antigens(published erratum appears in Proc NatlAcad Sci USA 199996:795),Proe Natl Acad Sci USA 95:6157-62)。
[0275]聚焦的或者智能的化学品以及药效团文库,可以借助先进策略的辅助进行设计,先进策略(sophisticated strategies)包括计算化学(如,Kundu B.Khare SK.Rastogi SK-,(1999)Combinatorial chemistry:polymer supported synthesis of peptideand non-peptide libraries.Progress in Drug Research 53:89-156)和通过数据库搜索和连接、应用以结构为基础的配基,从头进行药物设计和评价配基结合亲和性(Joseph-McCarthy D.,(1999)Computational approaches to structure-based liganddesign.Pharmacology & Therapeutics 84:179-91;Kirkpatrick DL.Watson S.Ulhaq S.,(1999)Structure-based drug design:combinatorial chemistry and molecular modeling.Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening.2:211-21;Eliseev AV.LehnJM.,(1999)Dynamic combinatorial chemistry:evolutionary formation and screening ofmolecular libraries.Current Topics in Microbiology & Immunology 243:159-72;Bolgeret al.,(1991)Methods Enz.203:21-45;Martin,(1991)Methods Enz.203:587-613;Neidle et al,(1991)Methods Enz.203:433-458;U.S.Patent 6,178,384)。
晶体学技术(Crystallography)
[0276]当确定了结合化合物以后,结合于靶分子上的化合物的方向被予以确定。优选地,这一确定涉及分子架构化合物与靶分子共晶体的晶体学。大多数蛋白结晶学平台,优选地设计为分析多至大约500个共复合体,共复合体是结合到蛋白靶上的化合物、配基、或者分子架构构成的共复合体,这样设计的原因在于于仪器的物理参数和操作的便利性。如果具有结合活性的架构数目超过便于应用结晶学方法的数目,那么,就根据具有至少一个共同的化学结构或者其它所需的性质将架构分成组,从一个或者更多的这些类别中选择出代表性化合物。分类可以通过确切标准逐渐提高来进行,一直到获得所需要的分类数目(如,500个)。类群可以基于在该类群中的分子架构之间存在的化学结构相似性,如,所有均含有吡咯环,苯环,或者其它化学特征。同样地,类群可以基于形状特征,如,空间装填特征。
[0277]共结晶学分析(co-crystallography analysis)可以如下进行,通过将每一个架构与其靶分子共-复合,架构是在筛选分析中表现活性的浓度下形成共复合体。这一共复合过程是这样完成的,可以应用带有靶分子的低百分比有机溶剂;然后,浓缩带有每一个架构的靶分子。在优选的实施方案中,这些溶剂是含有少于5%的有机溶剂,如二甲基亚砜(DMSO),乙醇,甲醇,或者乙二醇,它们是在水中或者其它含水溶剂中。与靶分子复合的每一种架构,随后可以在4度和20度下的适合数目的结晶筛选条件下进行筛选。在优选的实施方案中,为了得到关于共复合和结晶条件、以及架构在靶分子的结合位点的定向的足够信息,可以进行大约96个结晶筛选条件。然后,分析晶体结构,以便确定结合的架构是如何在分子家族成员的结合位点或者在一个或者多个结合口袋中物理定向的。
[0278]为了确定,对于该蛋白家族而言,那个是最适合的架构,需要确定结合于靶蛋白的化合物的原子坐标。X-ray晶体学分析,因此是最适合于确定原子坐标的。所选择出的化合物,可以进一步应用药物化学测试。选择用于药物化学测试的化合物是基于其在靶分子上的结合位置。例如,当化合物结合于结合位点时,相对于可以在该化合物的化学易处理结构或者亚结构上进行的化学变化,化合物在靶分子的结合位点上的结合位置可以被考虑,以及在化合物上的这样的修饰是如何可能与在靶分子的结合位点上的结构或者亚结构相互作用可以被考虑。因此,研究人员可以探测靶分子的结合位点以及架构的化学性质,以便决定如何修饰架构,使得配基具有更强的能力和/或选择性。该过程使配基的更直接设计成为可能,是通过利用直接从共复合体中得到的结构和化学信息,这就使得研究人员更有效率地并且更快速地设计出先导化合物,其很可能导致作出有益的药物产品。在各种不同的实施方案中,对于所有结合的架构,或者仅仅是以特定的亲和力结合的那些架构,需要进行共结晶操作,例如,那些仅仅以高度亲和力、中度亲和力、低度亲和力、很低亲和力、极低亲和力结合的那些。对于选择以任何组合的亲和力结合的架构,进行共结晶也是有利的。
[0279]标准的X-射线蛋白衍射研究,诸如通过应用Rigaku RU-200_(Rigaku,Tokyo,Japan),其带有X-射线成像板检测器或者同步加速器光束线,可以在共晶体上进行,并且在标准的X-射线检测器上,例如CCD检测器或者X-射线成像板检测器上测量衍射数据。
[0280]对于大约200种共晶体,进行X-射线结晶学分析,一般会得到大约50个共晶体结构,其将提供大约10个架构用于在化学上进行确证,最终得到大约5个对于靶分子具有选择性的先导物质(leads)。
虚拟分析(Virtual Assays)
[0281]商业途径可以得到的软件,可以用于从所提供的一套坐标生成复合的靶分子和化合物的三维图像展示,用该软件可以用于图解说明和研究:当结合于靶分子时,化合物是如何定向的(例如,QUANTA_,Accelerys,San Diego,CA)。因此,在靶分子结合位点处的结合口袋的存在,可以特定地用于本发明。利用晶体学结构确定方法揭示了这些结合口袋,这些结合口袋表现出了在化合物结合到靶分子结合位点中所涉及的精确的化学相互作用。普通技术人员将认识到:这些图解说明也可以被用于决定化学基团在哪儿可以被添加、取代、修饰或者从构架中删除,以便增强结合或者其他期望效应,是通过考虑未占据空间在复合物中的位置、以及考虑哪一个化学亚结构具有适合的大小和/或电荷特征可以填充该未占据空间来进行的。普通技术人员也懂得,结合位点之内的区域可以具有柔性,并且其特征可以作为构架结合的结果而发生变化,以及化学基团可以特异地靶向那些区域,以便达到所需效果。关于在何处适合的化学结构可以粘附,并且是以何种构型,以及哪一个位点最具化学上的优势,来考虑在分子架构上特异的定位。
[0282]对于化合物结合靶蛋白的力的认识,揭示出哪一种化合物是最具优势可以被用作架构,以及在配基的设计中哪些特性是最有效地被操作。普通技术人员将认识到:空间的、离子的、氢键、以及其它力可以被考虑,因为它们对于保持或者强化靶分子-化合物复合体有贡献。也可以应用自动化计算方法,得到另外的一些数据,如连接(docking)和/或自由能扰动(PEP),来说明其它的能量效应,例如退溶补偿(desolvation penalties)。选定化合物可以用于生成关于靶分子化学相互作用的信息,或者用于阐明可以增加化合物的结合作用的选择性的化学修饰。
[0283]计算机模型,如同源模型(即是,基于已知的、实验上来源的结构),可以应用来自共晶体结构的数据予以构建。当靶分子是一种已知蛋白质或者酶时,用于制作同源模型的优选共晶体结构,在被模型化的蛋白质序列的结合位点中,含有高的序列同一性;并且该蛋白质优先地也是在同一个类别中和/或折叠家族中。在一个蛋白质类别的活性位点中的保守残基的知识,可以被用于选择同源模型,其可以精确地代表结合位点。同源模型也可以用于描绘来自替代蛋白的结构信息,其中一个蛋白部分或者共晶体结构存在于靶蛋白中。
[0284]虚拟筛选方法,例如对接,也可以被用于预测构架、化合物、和/或组合文库成员,对于同源模型的结合构型以及亲和性。应用这一数据,并且用计算机软件进行“虚拟实验(virtual experiments)”,可以节约物质资源,并且使得普通技术人员可以就哪一种化合物适于配基或者架构作出判断,而不必实际上去合成该配基,并且进行共结晶。因此,可以就哪一种化合物应该进行实际合成和共结晶作出决定。对于这些化学相互作用的理解,有助于发现和设计与靶蛋白更具优势地相互作用的药物,和/或对于一种蛋白家族成员比其他成员更具选择性的药物。因此,应用这些原则,可以发现具有更优特征的化合物。
[0285]为了增强共晶体的形成,可以将促进共结晶作用的添加剂理所当然地包括在靶分子的配方中。在蛋白质或者酶的情况下,待测试的架构可以加入到蛋白配方中。优选地,存在的浓度为大约1mg/ml。配方中,也可以含有在0%-10%(v/v)之间的有机溶剂,如,DMSO,甲醇,乙醇,丙烷二醇,或者1,3二甲基丙烷二醇(MPD)或者这些有机溶剂的一些组合。化合物优选地溶解于有机溶剂中,浓度为大约10mM;随后被加入到蛋白样品中,浓度为大约100mM。然后,浓缩蛋白-化合物复合体,使得蛋白质的终浓度达到从大约5到大约20mg/ml。复合作用和浓缩步骤,可以应用96孔格式化浓缩仪器,很方便地予以进行。(例如,Amicon Inc.,Piscataway,NJ)。存在于正结晶的配方中的缓冲液以及其它试剂,含有促进结晶作用的其它组分,或者这些组分与结晶条件相容,如DTT,丙烷二醇,丙三醇。
[0286]结晶实验可以如此准备,通过将浓缩的蛋白质-化合物复合体的很小一部分(1uL)置于96孔格式中,并且在96个结晶条件下进行取样。(也可以应用其它筛选方法,例如使用具有超过96孔的板)。应用标准的结晶方案一般就可以得到晶体,该方案包括将96孔结晶板置于不同的温度条件下。如果需要,对于每一个蛋白-化合物复合体,也可以考虑除了温度之外的共结晶可变化因素。例如,大气压,光或氧存在与否,重力的变化,以及很多其它可变因素,都可以被测试。本领域普通技术人员知道有益地被变化和被考虑的其它可变因素。
配基的设计和制备
[0287]配基的设计和制备,可以在存在或者不存在结构的和/或共结晶的数据的情况下进行,是通过考虑在一套的活性架构之间的共同的化学结构下进行。在这一过程中,可以形成结构-活性假说,并且发现这些化学结构存在于相当数目的架构中,包括那些以低亲和性进行结合的架构,这些化学结构可以认为:对于架构的结合作用具有一些效应。当结合发生在生物系统中(如一个被治疗的哺乳动物)时,假设该结合诱发了所需的生物化学效应。可以测试来自架构的新型或者修饰过的架构或者组合文库,来证明结合作用的最大数目和/或结构-活性假说是错误的。然后,用剩下的假设来设计达到所需结合作用和生物化学效应的配基。
[0288]但是,在很多情况下,优选的是得到共结晶的数据,来考虑如何修饰架构以达到所需的结合效应(如,以较高的亲和性或者较高的选择性来结合)。使用蛋白和酶的例子,共结晶学数据说明了蛋白的结合口袋,其与结合到结合位点的分子架构结合,很明显,可以对在架构上的化学易处理基团进行修饰。例如,在蛋白结合位点或者口袋上的空间的较小体积,可以用修饰架构来填充,以便包括填充这一空间的小的化学基团。空体积的填充可以被预期导致较高的结合亲和性,或者被预期对于蛋白质家族的其它另外成员的不需要结合的丧失。相似地,共结晶学数据可以显示出:在架构上的化学基团的删除可能减少结合的阻碍,并且导致较高的结合亲和性或者特异性。
[0289]期望的是,利用位于蛋白的结合位点或者口袋中的带电荷化学基团的存在。例如,带正电荷化学基团可以与引入到分子架构中的带负电荷化学基团互补。希望这样可以增加结合亲和性或者结合特异性,因此得到一个更期望的配基。在很多情况下,蛋白结合位点或者口袋的区域的已知情况是变化的,基于在那些区域中的氨基酸差异,一个家族成员与另一个成员之间会有变化。在这样的区域加入的化学药品,能够导致某些相互作用(如,疏水的,静电的,熵的)的产生或者消除,这使得化合物对于一种靶蛋白相对于其它蛋白更特异,或者使得化合物的结合亲和性更高,因此可以使得研究人员合成针对特定家族成员的、具有更高选择性或者亲和性的化合物。此外,某些区域可能含有比其它氨基酸已知更具柔性的氨基酸。这常常发生在包含于蛋白质二级结构中的环连接部分氨基酸中,诸如α螺旋或者β链。为了增加发生在感兴趣蛋白靶和化合物之间的特异相互作用的可能性,加入的化学成分也可以直接导向这些柔性区域。也可以在计算机环境内(in silico)进行虚拟筛选方法,来评价,对于蛋白质家族或者一类蛋白质的成员,化学品加入、去除、修饰、和/或取代对化合物的效应。
[0290]可以用任何合适的化学部分,化学结构或者亚结构添加、减去、或者修饰至架构上。例如,下述部分,它们通过举例的方式提供、并且意在不受限制,可被使用:氢,烷基,烷氧基,苯氧基,烯基,炔基,苯烷基,羟烷基,卤代烷,芳基,芳烷基,烷基氧,烷基硫,烯基硫,苯基,苯烷基,苯烷基硫,羟烷基硫,烷基硫carbbamylthio,环己基,吡啶基,哌啶基,烷氨基,氨基,硝基,巯基,氰基,羟基,卤素原子,卤甲基,氧原子(如形成酮或者N-氧化物)或者硫原子(如形成硫醇,硫酮,二-烷基亚砜或者砜),都是可以利用部分的例子。
[0291]可以利用的结构或者亚结构的另外例子是选择性地用一个、两个或者三个取代基取代的芳基,这些取代基独立地选自:烷基,烷氧基,卤素,三卤甲基,羧化物,羧酰胺,硝基,和酯部分;结构式为-NX2X3的胺,其中X2和X3独立地选自:氢,饱和或者不饱和的烃基,以及同素环或者杂环部分;卤素或者三卤甲基;如结构式-COX4的酮基,其中的X4是选自烷基和同素环或者杂环部分;如结构式-(X5)nCOOH的羧酸或者如结构式(X6)nCOOX7的酯,其中X5,X6,和X7独立地选自烷基和同素环或者杂环部分,并且其中n是0或者1;如结构式(X8)nOH的醇或者如结构式-(X8)nOX9的烷氧基,其中X8和X9独立地选自饱和或者不饱和的烃基和同素环或者杂环部分,其中所述环可选择地用一个或者更多的取代基取代,取代基分别选自烷基,烷氧基,卤素,三卤甲基,羧化物,硝基,和酯,并且其中n是0或者1;如结构式NHCOX10的酰胺,其中的X10是选自烷基,羟基和同素环或者杂环成分,其中所述环可选择地用一个或者更多的取代基取代,取代基分别选自烷基,烷氧基,卤素,三卤甲基,羧化物,硝基,和酯;SO2,NX11X12,其中的X11和X12是选自包含以下成分的组,氢,烷基和同素环或者杂环成分;同素环或者杂环可选择地用一个,两个,或者三个取代基取代,取代基独立地选自烷基,烷氧基,卤素,三卤甲基,羧化物,硝基,和酯;如结构式-CHO的醛;结构式-SO2X13的砜,其中X13是选自饱和的或者不饱和的烃基和同素环或者杂环成分;以及结构式为-NO2的硝基。
分子架构和配基上连接位点的鉴定
[0292]除了鉴定和开发针对激酶和其它酶的配基以外,分子架构或者其它结合化合物在结合位点上的方向的确定,使得可以进行对结合分子与另一个组分连接的能量学允许位点的鉴定。对于这样的位点,与存在粘附成分的条件下相联系的任何自由能的变化,将不会使化合物与激酶的结合去稳定化,达到破坏结合的程度。优选地,粘附的结合能是至少4kcal/mol,更优选的是至少6,8,10,12,15,或者20kcal/mol。优选地,在特定位点存在的粘附降低结合能不超过3,4,5,8,10,12,或者15kcal/mol。
[0293]在很多的情况下,合适的连接位点是,在当结合化合物结合于结合位点时,暴露于溶剂的位点。在一些情况下,可以应用连接位点,这将引起酶的一部分的小位移,而不会引起过度的能量损失。可以用各种不同的方法鉴定暴露位点。例如,可以用图形显示或者三维模型的方法鉴定暴露位点。在图形显示中,例如在计算机显示中,可以可视检查结合在结合位点的化合物的图像,来揭示在化合物上的、暴露于溶剂的原子或者基团,或者揭示如此定向的化合物上的原子或者基团,以致在这样的原子或者基团处的粘附将不排除酶和结合化合物之间的结合作用。连接的能量消耗,可以通过基于由连接引起的变化或者扭曲以及熵变来进行计算。
[0294]可以连接很多不同类型的成分。技术人员熟悉用于各种不同连接的化学。可以连接的成分的例子包括,但不限于,固相成分,例如珠子,板,基片,和孔;直接或者间接的标记物;接头,接头可以是无痕迹接头;除了别的以外。这样的接头可以自身连接在其它组分,如,连接到固相介质、标记物和/或者结合部分上。
[0295]化合物的结合能,以及将该分子连接到另一成分上的对结合能的效应,可以应用多种可以利用的软件中的任意一个,或者通过手工计算,进行近似计算。下面是一个例子:
[0296]通过进行计算,来估算不同的有机分子对于两种激酶:PIM-1和CDK2的结合能。认为有机分子包括Staurosporine,鉴定出的结合PIM-1的化合物,以及几种接头。
[0297]应用Tripos软件程序集中的FlexX记分软件(Bohm记分函数的一个工具),得到蛋白质-配基复合体之间的计算结合能。该方程的公式在下面Eqn.1中示出:
ΔGbind=ΔGtr+ΔGhb+ΔGion+ΔGlipo+ΔGarom+ΔGrot
[0298]其中ΔGtr是常数项,其说明配基的旋转和平移熵的总损失,ΔGhb说明在配基和蛋白之间形成的氢键,ΔGion说明配基和蛋白之间离子相互作用,ΔGlipo说明与蛋白配基接触表面相对应的亲脂性相互作用,ΔGarom说明的是在蛋白和配基中的芳香环之间的相互作用,和,ΔGrot说明的是在结合时配基中限制可旋转键的熵补偿。
[0299]该方法估计了先导化合物应当具有的自由能,以便到达一个存在晶体结构的靶蛋白上;并且它说明了柔性接头的熵补偿。因此,它可以被用于估计由于接头连接到正在筛选的分子上所招致的自由能补偿,以及估计先导化合物应当具有的结合能,以便克服接头的自由能补偿。该方法并不说明溶剂化作用,并且在如下情形中,熵补偿很可能会过高估计,即当接头是通过另一个结合复合体,如生物素:链霉素亲和素复合体,与固相结合时。
[0300]通过PIM-1的残基与CDK2中的相对应残基的重叠,对共晶体进行排列对比。用于这些计算的PIM-1结构,是PIM-1与结合化合物的共晶体。所应用的CDK2:Staurosporine共-晶体是来自于Brookhaven数据库文件1aql。蛋白质中加入氢原子,用Sybyl中的AMBER95参数对原子电荷进行赋值。用来自Tripos的Sybyl建模程序集进行所述化合物的修饰。
[0301]这些计算表明:强烈结合到特定靶上(例如Staurosporine:CDK2)的化合物的计算结合能(calculated binding energy),可以低于-25kcal/mol;而对于一个良好骨架或者未优化结合化合物的计算结合亲和力,可以在-15到-20之间的范围内。对于连接到接头上,例如乙二醇或者己三烯,自由能补偿被估计一般在+5到+15kcal/mol的范围之中。
接头(Linkers)
[0302]在本发明中使用的合适接头,可以是多种不同类型。用于特定应用的接头可以依据如下因素进行选择,例如接头化学,与连接到在特定应用中所使用的结合化合物和另外的组分相容。附加因素可以包括,但并不受限,接头长度,接头稳定性,和在合适时间除去接头的能力。典型的接头包括,但不局限于,己基,己三烯基,乙二醇和肽接头。无痕迹接头(traceless linkers)也可以被使用,例如,如Plunkett,M.J.,和Ellman,J.A.,(1995),J.Org.Chem.,60:6006中所描述的。
[0303]典型功能基团,其用于连接结合化合物,包括,但不局限于,羧酸,胺,羟基和硫醇。(例子可以在Solid-supported combinatorial and parallel synthesis ofsmall molecular weight compound libraries(小分子量化合物文库的固体支持的组合和平行合成)(1998)Tetrahedron organic chemistry series Vol.17;Pergamon;p85)中找到。
标记(labels)
[0304]如以上所示,标记也可以连接到结合化合物上或者连接到与连接化合物相连的接头上。这样的连接,可以是直接的(直接连接于结合化合物)或者间接的(连接于直接或者间接连接于结合化合物的组分上)。这样的标记,使直接或者间接地检测化合物成为可能。标记的连接可以使用常规化学反应进行。标记可以包括,例如,荧光标记,放射性标记,光散射颗粒,光吸收颗粒,磁性颗粒,酶,和特异性结合试剂(例如,生物素或者抗体靶部分)。
固相介质(Solid Phase Media)
[0305]可以直接或者间接地连接到结合化合物上的组分的另外例子,包括各种不同的固相介质。与接头和标记物的连接类似,与固相介质连接可以使用常规化学进行。这样的固相介质可以包括,例如,小的组分,如珠子、纳米颗粒和纤维(例如,在悬浮液中或者在凝胶或者层析基质中)。同样地,固相介质可以包括大一些的物体,例如板,木片,玻片,和管。在许多情况中,结合化合物连接在此类物体的仅仅一部分上,例如在一个基本平坦平面上、以点或者其他局部元素形式,或者在孔中,或者在孔的一部分中。
生物制剂的鉴定(Idenfication of Biological Agents)
[0306]有关蛋白质结构信息的获得,也提供了对有用生物学试剂剂的鉴定,如用于开发抗体的抗原决定簇的鉴定,预期影响活性的突变位点的鉴定,和允许把蛋白质连接到材料如标记物、接头、肽、和固相介质的连接部位的鉴定。
[0307]抗体(Abs)在许多领域,包括生物技术、医药和诊断中具有多种应用,实际上,抗体是生命科学研究中最强有力的工具之一。Abs直接针对蛋白质抗原,可以识别,或者是线性的或者是天然的三维(3D)抗原决定簇。获得识别3D抗原决定簇的Abs,要求使用整个天然蛋白质(或者它的一部分,其呈现天然构象)作为免疫原。遗憾的是,由于多种技术原因,这并非一直是一个选择:例如,天然蛋白质正好是不能获得的,蛋白质是有毒的,或者期望应用高密度抗原呈递。在这些情况下,用肽进行免疫是替代方案。当然,用这种方式产生的Abs将识别线性抗原决定簇,它们可能或者不可能识别源天然蛋白质(source native protein),但是它们对于标准的实验室应用是有用的,例如蛋白质印迹。作为免疫原使用的肽的选择,可以通过遵循特定选择规则和/或使用抗原决定簇预测软件,予以完成。
[0308]虽然预测抗原肽的方法并不是绝对可靠的,但是存在几条规律,它们可以被遵循,以便确定来自蛋白质的哪个肽片段可能是抗原性的。这些规则也指示了增加特定肽的Ab识别天然蛋白质的可能性。
·1、抗原肽应该定位在溶剂可接近的区域,并且含有疏水和亲水残基。
o对于具有已知3D结构的蛋白质,溶剂可及性(solvent accessibility)可以使用多种程序确定,如DSSP,NACESS,或者WHATIF,在其他程序之中。
o假如3D结构未知,则可以使用以下任何网络服务器,来预测可及性:
PHD,JPRED,
PredAcc(c),
ACCpro
·2、优先选择位于连接二级结构(SS)基序的长环中的肽,避免位于螺旋区域中的肽。这将增加Ab识别天然蛋白质的几率。这样的肽可以,例如,从晶体结构或者基于晶体结构的同源性模型中被鉴定出来。
o对于具有已知3D坐标的蛋白质,SS可以从Brookhaven数据库(
Brookhaven data bank)的相关词条的序列链接获得。
PDBsum服务器也提供pdb记录的SS分析。
o当没有结构可以利用时,二级结构预测可以从任何以下服务器中的任意一个获得:
PHD,
JPRED,
PSI-PRED,
NNSP,等等。
·3、当可能时,选择位于蛋白质的N-末端和C-末端的肽。因为蛋白质的N-末端和C-末端区域一般是溶剂易接近的,并且是非结构的(unstructured),针对这些区域的Ab也可能识别天然蛋白质。
·4、对于细胞表面糖蛋白,从初始肽,去除那些含有用于N-糖基化的共有位点的部分。
o N-糖基化位点可以使用
Scanprosite或者
NetNGlvc检测。[0309]另外,基于实验决定的抗原决定簇的多种理化性质(柔软性,亲水性,可及性)的几种方法已经发表,用于预测抗原性的决定簇,并且可以使用。抗原性指数和
Preditop就是例子。
[0310]或许,预测抗原性决定簇的最简单方法是Kolaskar和Tongaonkar的方法。Kolaskar和Tongaonkar法基于在实验确定的表位中的氨基酸残基的发生率。(Kolaskar和Tongaonkar(1990)A semio-empirical method for predication of antigenicdeterminants on protein antigens(蛋白质抗原的抗原性决定簇预测的半经验方法)。FEBBSLett.276(1-2):172-174)。预测算法以如下所述起作用:
·1、对每个重叠7-聚体(7-mer),计算平均倾向(average propensity),并将结果分配给7-聚体的中间残基(i+3)。
·2、对整个蛋白质,计算平均值。
·3、(a)假如整个蛋白质的平均值高于1.0,那么所有具有平均倾向高于1.0的所有残基都可能是抗原性的。
·3.(b)假如整个蛋白质的平均值低于1.0,那么具有高于整个蛋白的平均值的所有残基都可能是抗原性的。
·4.找出8-聚体,其中所有残基都通过以上的步骤3进行选择。(在原始文章中,是6-聚体)。
[0311]Kolaskar和Tongaonkar方法也可以从GCG软件包获得,使用命令egcg运行它。
[0312]晶体结构,也可以允许对其处发生突变从而可能改变蛋白质活性的残基进行鉴定。这种残基包括,例如,与底物相互作用的残基,保守的活性位点残基,涉及四级相互作用的有序二级结构的区域中的残基。有可能影响活性的突变,对于不同的分子环境是不同的。影响活性的活性位点中的突变,一般是取代或者删除,取代或删除消除了电荷-电荷或者氢键相互作用,或者引入了空间干扰。可能影响活性的二级结构或者分子相互作用区域中的突变包括,例如取代,取代改变了一个区域的疏水性/亲水性;或者往靠近或包括活性位点的区域中引入足够的张力,这样使得活性位点中的关键残基被移位。这样的取代和/或删除和/或插入被识别出来,突变的预测结构和/或能量效应,可以使用常规软件进行计算。
IX.激酶活性分析
[0313]可以利用激酶活性的多种不同分析,分析针对一种特定激酶或者基团或者多个激酶的活性调节剂,和/或确定调节剂的特异性。除了以下提及的分析外,本领域普通技术人员了解其他可以使用的分析,并且可以修改一种分析,用于特定用途。
[0314]用于PIM激酶,例如PIM-1的激酶活性分析,可以根据以下程序,使用纯化的激酶,使用髓磷脂碱性蛋白(MBP)作为底物,进行分析。示范性分析可以使用以下材料:MBP(M-1891,Sigma);激酶缓冲液(KB=HEPES 50mM,pH7.2,MgCl2∶MnCl2(200uM:200uM);ATP(γ-33P):NEG602H(10mCi/mL)(Perkin-Elmer);在激酶缓冲液中的ATP,以100mM作为储液;100mM EDTA作为储液。
[0315]用激酶+MBP混合物(终浓度100ng+300ng/孔),包被适用于放射性计数的闪烁板(如,来自Perkin-Elmer的FlashPlate,诸如SMP200(碱性)),在激酶缓冲液中,90-uL/孔。从处于DMSO中的10mM储液中,以1ul/孔加入化合物。阳性对照孔被加入1uL DMSO。阴性对照孔被加入2uL EDTA储液。往每孔中添加ATP溶液(10uL),冷ATP的终浓度是2uM,和50nCiATPγ33P]。短时间震荡板,计数以初始计数(IC)起始,使用适应性修改的仪器对所选择的板进行计数,例如,Perkin-Elmer Trilux。板于37℃下储藏4小时,然后再次计数,得到最终计数(FC)。
[0316]净33P掺入(NI)如下计算:NI=FC-IC
[0317]测试化合物的存在的影响,然后,可以被计算为阳性对照的百分数,计算如下:%PC=[(NI-NC)/(PC-NC)]×100,其中NC是阴性对照的净掺入,PC是阳性对照的净掺入。
[0318]如上所示,也可以使用别的分析方法。例如,激酶活性可以在标准聚苯乙烯板上测量,使用生物素化MBP和ATPγ[33P],以及采用链霉亲和素包被的SPA(闪烁亲近)珠提供信号。
[0319]另外的可替代分析方法,可以采用磷特异抗体作为检测试剂,以生物素化的肽作为激酶的底物。这种类别的分析方法可以被格式化,或者以荧光共振能量转移(FRET)格式,或者使用AlphaScreen格式(放大荧光亲近均相测定),通过改变附着到链霉亲和素或者磷特异抗体上的供体和受体试剂而进行。
X.有机合成技术
[0320]以计算机为基础的调节剂的设计和鉴定的多功能性,基于计算机程序所扫描的结构的多样性。计算机程序可以搜索包括大量分子的数据库,修饰具有多种化学功能基团的、与酶已经复合的调节剂。这种化学多样性的结果是:激酶功能的潜在调节剂可能采用不可预测的化学形式。多种有机合成分析技术的广泛种类存在于本技术领域中,可以迎接构建这些潜在调节剂的挑战。在被本领域技术人员所使用的标准参考资料中,详细描述了许多这样的有机合成方法。这样的一个参考例子是March,1994,Advanced Organic Chemistry;Reactions,Mechanisms andStructure.New York,McGraw Hill.因此,有机化学合成领域的技术人员已经可以容易地利用这些技术,用于合成由基于计算机方法所鉴定的、激酶功能的潜在调节剂。
XI.施用
[0321]这些方法和化合物,将典型地被用在人类患者的治疗中。然而,它们也可以在治疗别的脊椎动物的类似和相同疾病中使用,例如其他灵长类动物,体育动物,和宠物,例如马、狗和猫。
[0322]合适的剂量形式,部分地,是依赖于施用的用途或途径,例如,口服的,经皮的,经粘膜的,或者经注射(不经肠道的)。这样的剂量形式,应该使得化合物可以到达靶细胞。在本技术领域中,其他因素是熟知的,包括如下考虑,诸如毒性和剂量形式,剂量形式可以延迟化合物或组合物发挥它的效应。技术和配方,一般可以在Remington′s Pharmaceutical Sciences,18th ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA,1990中找到(因此,引入此处,作为参考)。
[0323]化合物可以制备成药学上可以接受的盐。药学上可以接受的盐,在以它们的施用量和浓度被施用时,是无毒的盐。这样的盐的制备,可以通过改变化合物的物理性质,并不阻止其发挥它的生理效应,从而促进药理学用途。物理性质上的有用改变,包括降低溶点从而促进经粘膜给药,增加溶解性从而促进药物以更高浓度进行给药。
[0324]药学上可以接受的盐包括,酸加成盐,例如那些含有硫酸盐,氯化物,氢氯化物,富马酸盐,马来酸盐,磷酸盐,氨基磺酸盐,醋酸盐,柠檬酸盐,乳酸盐,酒石酸盐,甲磺酸盐,乙磺酸盐,苯磺酸盐,p-甲苯磺酸盐,环己基氨基磺酸盐和奎尼酸盐。药学上可以接受的盐可以由酸获得,如盐酸,马来酸,硫酸,磷酸,氨基磺酸,乙酸,柠檬酸,乳酸,酒石酸,丙二酸,甲磺酸,乙磺酸,苯磺酸,p-甲苯磺酸,环己基氨基磺酸,延胡索酸和奎尼酸。
[0325]药学上可以接受的盐也包括碱加成盐,例如含有苄星,氯普鲁卡因,胆碱,二乙醇胺,乙二胺,葡甲胺,普鲁卡因,铝,钙,锂,镁,钾,钠,铵,烷基胺和锌的那些,当酸性功能基团存在时,诸如羧酸或苯酚。例如,见Remington′sPharmaceutical Sciences,19th ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA,Vol.2,p.1457,1995。这样的盐可以使用合适的相应碱制备。
[0326]药学上可以接受的盐可以通过标准技术制备。例如,化合物的游离碱形式被溶于合适的溶剂中,如含有合适酸的水溶液或水-乙醇溶液,然后通过蒸发溶液进行分离。在另一例子中,通过在有机溶剂中,让游离碱和酸反应制备盐。
[0327]不同化合物的药学上可以接受的盐,可以以复合物形式存在。复合物的例子包括,8-氯茶碱复合物(类似于,例如,茶苯海明:苯海拉明8-氯茶碱(1∶1)复合物;乘晕宁)和各种环糊精包涵复合物。
[0328]载体或赋形剂可以用于生产药物组合物。可以选择载体或赋形剂,从而促进化合物的施用。载体例子包括碳酸钙,磷酸钙,各种糖如乳糖,葡萄糖或蔗糖,或者淀粉的几种类型,纤维素衍生物,明胶,植物油,聚乙二醇和生理上相容溶剂。生理上相容溶剂的例子包括,注射用无菌水溶液(WFI),生理盐水和右旋糖。
[0329]化合物可以通过不同途径施用,包括静脉内,腹膜内,皮下,肌肉内,口服,经粘膜,直肠或经皮。口服施用是优选的。对于口服施用,例如,化合物可以配置成常规的口服剂量形式,如胶囊,片剂和液体制剂如糖浆,酏剂和浓缩滴剂。
[0330]口服使用的药物制剂,可以如此得到,例如通过把活性化合物与固体赋形剂相混和,任选地碾磨所得到的混合物,和把混合物加工成颗粒,加入合适的辅料之后,假如需要的话,得到片剂或锭剂的核心。特别地,合适的赋形剂是一些填料,如糖,包括乳糖,蔗糖,甘露醇或山梨醇;纤维素制剂,例如玉米淀粉,小麦淀粉,水稻淀粉,马铃薯淀粉,明胶,黄蓍树胶,甲基纤维素,羟丙基甲基纤维素,羧甲基纤维素钠(CMC),和/或聚乙烯吡咯烷酮(PVP:聚维酮)。假如需要的话,可以加入分解剂,例如交联的聚乙烯吡咯烷酮,琼脂或海藻酸,或者它们的盐,如海藻酸钠。
[0331]锭剂核心被提供,带有合适的包衣。为此目的,可以使用浓缩的糖溶液,糖溶液可以任选地含有,例如阿拉伯树胶,滑石,聚乙烯吡咯烷酮,聚羰乙烯凝胶,聚乙二醇(PEG),和/或二氧化钛,紫胶漆溶液和合适的有机溶剂或溶剂混合物。可以添加染料或色素到片剂或锭剂包衣中,用于识别或者表征出活性化合物剂量的不同组合。
[0332]可以口服使用的药物制剂包括,由明胶制作的推合式胶囊(“gelcaps”),同时还有由明胶和增塑剂制作而成的软而密闭的胶囊,如甘油或山梨醇作为增塑剂。推合式胶囊可以在具有填料如乳糖,粘合剂如淀粉,和/或滑润剂如滑石或硬脂酸镁,和,任选地,稳定剂,的混合物中含有活性成分。在软胶囊中,活性化合物可以溶于或悬浮于合适的液体中,如脂肪油,液体石蜡,或液体聚乙二醇(PEGs)中。另外,可以加入稳定剂。
[0333]可替代地,可以使用注射(不经肠道给药),例如,肌肉内注射,静脉内注射,腹膜内注射,和/或皮下注射。对于注射,本发明的化合物配置于无菌液体溶液中,优选地,在生理相容缓冲液或溶液中,诸如生理盐水,Hank′s溶液或Ringer′s溶液中。另外,化合物可以配置于固体形式中,使用前,立即再溶解或悬浮。也可以制备成冻干形式。
[0334]也可以通过经粘膜或经皮方式给药。为了经粘膜或经皮施用,在配方中使用能适当透过屏障的渗透剂。在本技术领域,这样的渗透剂一般是已知的,包括,例如,用于经粘膜施用的胆汁盐和夫西地酸衍生物。另外,为了促进渗透,可以施用去垢剂。经粘膜施用,例如,通过鼻喷雾或栓剂(直肠的或阴道的)。
[0335]被施用的各种不同化合物的量,可以通过标准程序确定,考虑因素如化合物IC50,化合物的生物半衰期,患者的年龄、大小和重量,与患者有关的疾病。这些和别的因素的重要性,对于本领域技术人员来说是众所周知的。一般地,对于被治疗的患者,剂量在大约0.01和50mg/kg之间,优选地在0.1和20mg/kg。也可以使用多剂量。
hPIM-3的操作
[0336]通过确定全长人PIM-3(hPIM-3),本发明另外提供了hPIM-3的编码序列,从而能够克隆,构建重组体hPIM-3,产生和纯化重组hPIM-3蛋白,将hPIM-3导入到其他生物体中,和类似操作。
[0337]核酸操作的技术,诸如,例如,亚克隆,标记探针(例如,使用Klenow聚合酶的随机引物标记,切口平移,扩增),测序,杂交和类似技术,在科学和专利文献中有很好的公开,见,例如Sambrook,ed..Molecular Cloning:a LaboratoryMannual(分子克隆实验手册)(2nd ed.),Vols.1-3,Cold Spring Harbor Laboratory,(1989);Current Protocols in Molecular Biology(最新分子生物学实验方案),Ausubel,ed.John Wiley & Sons,Inc.,New York(1997);Laboratory Techniques in Biochemistryand Molecular Biology:Hybridization With Nucleic Acid Probes(生化和分子生物学实验技术:与核酸探针杂交),Part I.Theory and Nucleic Acid Preparation(理论和核酸制备),Tijssen,ed.Elsevier,N.Y.(1993).[0100]假如必要的话,为了进一步使用,核酸序列可以使用扩增的方法予以扩增,如PCR,等温方法,滚环方法,等等,对于本领域技术人员而言是熟知的,见,例如Saiki,“Amplification of Genomic DNA”in PCR Protocols(PCR实验方案中的“基因组DNA扩增”),Innis et al.,Eds.,Academic Press,San Diego,CA 1990,pp 13-20;Wharam et al..Nucleic Acids Res.2001 Jim 1;29(11):E54-E54;Hafiier et al.,Biotechniques 2001Apr;30(4):852-6,858,860passim;Zhong et al.,Biotechniques 2001Apr;30(4):852-6,858,860passim.
[0338]核酸,载体,衣壳,多肽和类似物,可以用本领域技术人员所熟知的多种一般方法中的任何一种进行分析和定量。这些方法包括,例如分析生化方法,如NMR,分光光度法,射线照像术,电泳,毛细管电泳,高度液相色谱法(HPLC),薄层层析(TLC),和超扩散色谱法,各种免疫学方法,例如,液体或凝胶沉淀反应,免疫扩散,免疫电泳,放射免疫测定(RIAs),酶联免疫吸附试验(ELISAs),免疫荧光分析,Southern分析,Northern分析,斑点印迹分析,凝胶电泳(例如,SDS-PAGE),核酸或靶或信号扩增方法,放射性标记,闪烁计数和亲和层析。
[0339]获得和操作用于实践本发明方法的核酸,可以通过克隆来自基因组样品进行,并且,假如需要的话,筛选和再克隆插入物,插入物分离自或者扩增自,例如,基因组克隆或cDNA克隆。在本发明的方法中,所使用的核酸来源包括基因组或cDNA文库,包含在,例如,哺乳动物人工染色体(MACs),见,例如美国专利号5,721,118;6,025,155;人人工染色体,见,例如Rosenfeld(1997)Nat.Genet.15:333-335;酵母人工染色体(YAC);细菌人工染色体(BAC);P1人工染色体,见,例如Woon(1998)Genomics 50:306-316;P1-衍生的载体(PACs),见,例如Kem(1997)Biotechniques 23:120-124;粘粒,重组病毒,噬菌体或质粒之中。
[0340]本发明的核酸可以可操作地与启动子连接。启动子可以是一个基序或者一个指导核酸转录的核酸控制序列的排列。启动子可以包括靠近转录起点的必须核酸序列,例如,在聚合酶II型启动子的情形中的TATA元件。启动子也可以任选地包括位于离转录起点达几千碱基对之多的远端增强子或抑制子元件。“组成型”启动子是在多数环境下和发育条件下具有活性的启动子。“诱导型”启动子是在环境中或发育调控下的启动子。“组织特异性”启动子是在生物体的一定组织中有活性的,但是在相同生物体的其他组织类型中是没有活性的。术语“可操作连接”是指核酸表达控制序列(如启动子,或者转录因子结合位点的排列)和第二个核酸序列之间的功能性连接,其中表达控制序列指导对应于第二个序列的核酸的转录。
[0341]本发明的核酸也可以被提供在表达载体和克隆载体中,例如,编码本发明的多肽的序列。本发明的表达载体和克隆载体,可以包括病毒颗粒,杆状病毒,噬菌体,质粒,噬菌粒,粘粒,fosmids,细菌人工染色体,病毒的DNA(例如,牛痘病毒,腺病毒,foul pox virus,伪狂犬病毒和SV40的衍生物),基于P1的人工染色体,酵母质粒,酵母人工染色体,和,感兴趣的、针对特异宿主的特异性的其他载体(如bacillus,Aspergillus和酵母)。本发明的载体可以包括染色体的,非染色体的和合成的DNA序列。大量的合适载体对于本技术领域的技术人员而言是已知的,并且是可以通过商业途径获得的。
[0342]本发明的核酸可以被克隆,如果需要,可以通过使用常规分子生物方法克隆进各种载体的任何一个中;用于体外扩增核酸的方法被公开了,例如,美国专利号5,426,039。为了促进扩增序列的克隆,限制性酶切位点可以被“构建”在PCR引物对中。载体可以被导入基因组中,或导入细胞质中或者细胞的核里,并且通过多种常规技术进行表达,这些在科学文献和专利文献中有很好的描述。见,例如,Roberts(1987)Nature 328:731;Schneider(1995)Protein Expr.Purif.6435:10;Sambrook,Tijssen or Ausubel。载体可以由天然来源分离,从ATCC或GenBank的库中的来源中获得,或者通过合成或重组方法制备。例如,本发明的核酸可以在表达盒、载体或病毒中被表达,它们可以在细胞中稳定地或暂时地被表达(例如,附加型表达系统)。选择标记可以整合到表达盒和载体中,以便在转化细胞和序列上提供可选择的表型。例如,选择标记可以编码附加型维持(episomal maintenance)和复制,这样就不要求整合到宿主基因组中。
[0343]一方面,本发明的核酸是体内施用的,用于原位表达本发明的肽或多肽。核酸可以以“裸DNA”(见,例如,美国专利号5,580,859)被施用,或以一个表达载体的形式被施用,例如,重组病毒。核酸可以通过任何途径被施用,包括肿瘤周围或肿瘤内施用,如以下描述。体内施用的载体可以衍生自病毒基因组,包括重组修饰的有包膜或无包膜DNA和RNA病毒,优选地,选自杆状病毒,细小病毒,picomoviridiae,疱疹病毒(herpesveridiae),痘病毒(poxviridae),腺病毒(adenoviridiae)或picomnaviridiae。嵌合载体也可以被采用,它们利用了母载体特性的每一个的优点(见,例如,Feng(1997)Nature Biotechnology 15:866-870)。这样的病毒基因组可以通过重组DNA技术加以修饰,从而包含本发明的核酸;并且,进一步设计出复制缺陷的,条件复制的或复制全能的病毒基因组。在可替代的方面,载体衍生自腺病毒(例如,复制功能不全载体,衍生自人腺病毒基因组,见,例如,美国专利号6,096,718;6,110,458;6,113,913;5,631,236);腺伴随病毒和反转录病毒基因组。反转录病毒载体可以包括那些基于鼠白血病病毒(MuLV),长臂猿白血病病毒(GaLV),类人猿白血病缺陷病毒(SIV),人类免疫缺陷病毒(HIV)的病毒和它们的组合,见,例如,美国专利号6,117,681;6,107,478;5,658,775;5,449,614;Buchscher(1992)J.Virol.66:2731-2739;Johann(1992)J.Virol.66:1635-1640)。基于腺伴随病毒(AAV)的载体可以被用于转导具有靶核酸的细胞,例如,在核酸和肽的体外生产中,和,在体内和离体基因治疗程序中;见,例如,美国专利号6,110,456;5,474,935;Okada(1996)Gene Ther.3:957-964。
[0344]本发明也涉及融合蛋白和编码融合蛋白的核酸。本发明的多肽可以与异源肽或多肽融合,例如赋予所需特性的N-末端识别肽,例如稳定性增加或纯化简化的所需特性。本发明的肽和多肽也可以被合成,表达为与一个或多个额外区域相连的融合蛋白,例如,为了产生免疫原性更强的肽,以便更宜于分离重组合成的肽,以便识别和分离抗体和表达抗体的B细胞,等等。检测和纯化促进域包括,例如,金属螯合肽,如可以在固定化金属上纯化的多组氨酸片段和组氨酸-色氨酸模块;可以在固定化免疫球蛋白上纯化的蛋白A区域;和在FLAGS延伸/亲和系统中使用的区域(Immunex Corp,Seattle WA)。可断裂的接头序列,如Xa因子或肠激酶(Invitrogen,San Diego CA),被包含在纯化区域和包含基序的肽或多肽之间,以促进纯化。例如,表达载体可以包括编码抗原决定簇的核酸序列,此核酸序列连接到六个组氨酸残基上,然后是硫氧还蛋白和肠激酶切割位点(见,例如,Williams(1995)Biochemistry 34:1787-1797;Dobeli(1998)Protein Expr.Purif.12:404-414)。组氨酸残基促进检测和纯化,同时肠激酶切割位点提供了从融合蛋白的剩余物中纯化抗原决定簇的方法。一方面,编码本发明的多肽的核酸以合适的相位装配,同时前导序列可以指导翻译的多肽或片段的分泌。与编码融合蛋白载体相关的技术和融合蛋白的应用,在科学和专利文献中有很好的公开,见,例如,Kroll(1993)DNA Cell.Biol.12:441-53。
[0345]本发明的核酸和多肽可以结合到固体支持物上,例如,为了在筛选和诊断方法中使用。固定支持物可以包括,例如,膜(例如,硝化纤维或尼龙),微量滴定板(例如,PVC,聚丙烯或聚苯乙烯),试管(玻璃或塑料的),测量尺(例如,玻璃,PVC,聚丙烯,聚苯乙烯,乳胶等等),微量超速离心管,或者玻璃,二氧化硅,塑料,金属或聚合物珠或其他物质,如纸。一个固体支持物使用含有金属的柱子(钴或镍),其特异性结合到基因工程到肽上的组氨酸标签上。
[0346]分子粘连到固体支持物上,可以是直接的(例如,分子与固体支持物接触)或间接的(“接头”与支持物结合,感兴趣分子结合到此接头上)。分子可以固定化,或者共价地(例如,利用半胱氨酸残基的单一反应性硫羟基团(见,例如,Colliuod(1993)Bioconjugate Chem.4:528-536)或者非共价地、但是特异地(例如,通过固体化抗体(见,例如,Schuhmann{\99V}Adv.Mater.3:388-391;Lu(1995)Anal.Chem.67:83-87;the biotin/strepavidin system(参见,如,Iwane(1997)Biophys.Biochem.Res.Comm.230:76-80);金属螯合,例如,Langmuir-Blodgett膜(见,例如Ng(1995)Langmuir 11:4048-55);金属螯合物自组装单层(见,例如Sigal(1996)Anal.Chem.68:490-497),用于结合多组氨酸融合物。
[0347]间接结合(indirect binding),可以通过使用各种的可以买到的接头完成。反应性末端,可以是多种官能团中的任何一种,包括,但不局限于:氨基反应性末端如N-羟基琥珀酰(NHS)活性酯,亚胺酸酯,醛,环氧化物,磺酰卤,异氰酸酯,异硫氰酸酯,和硝基芳基卤化物;硫羟反应性末端,如吡啶基二硫化物,马来酰亚胺,硫代苯邻二甲酰亚胺和活性卤素。异双官能交联试剂(heterobifunctionalcrosslinking reagents)具有两个不同的反应末端,例如,氨基-反应末端和硫羟-反应末端;而,同双官能试剂(homobifunctional reagents)具有两个相似的反应末端,例如,双马来酰亚胺己烷(BMH),它允许含有硫氢基(sulfhydryl)的化合物进行交联。间隔基(spacer)可以具有不同长度,可以是脂肪族的或芳香族的。可买到的同双功能交联剂的例子包括,但不局限于,亚胺酸酯如二甲基己二酰亚胺酯二氢氯化物(DMA),二甲基庚二酰亚胺酯二氢氯化物(DMP);和二甲基辛二酰亚胺酯二氢氯化物(DMS)。异双官能试剂包括,可通过商业途径得到的活性卤素-NHS活性酯偶联试剂,如N-琥珀酰亚胺基溴乙酸和N-琥珀酰亚胺基(4-碘乙酰基)氨基苯甲酸酯(SLAB)和磺基琥珀酰亚胺基衍生物诸如琥珀酰亚胺基(4-碘乙酰基)氨基苯甲酸酯(磺基-SLAB)(Pierce)。偶联试剂的另一个类群是异双功能的和硫羟可断裂试剂,如N-琥珀酰亚胺基-3-2-(吡啶基二硫代)-丙酸盐(SPDP)(Pierce Chemicals,Rockford,IL)。
[0348]抗体也可以用于把本发明的多肽和肽结合到固体支持物上。这可以通过直接把肽特异性的抗体结合到柱子上完成,或者它可以通过产生融合蛋白嵌合体而完成,融合蛋白嵌合体包括含基序的肽,其可以与例如已知的表位(例如,标签(例如,FLAG,myc)连接,或者与合适的免疫球蛋白恒定区域序列(“免疫粘合素”,见,例如Capon(1989)Nature 377:525-531(1989)连接。
[0349]本发明的核酸或多肽可以被固定化或应用于阵列。阵列可以用于筛选或监控组合物(例如,小分子,抗体,核酸,等等)的文库,因为它们具有结合到或调节本发明的核酸或多肽活性的能力。例如,在本发明的一个方面,监控参数是含有本发明核酸的基因的转录物表达。细胞的一个或多个转录物、或者所有转录物,都可以通过样品的杂交进行测量,样品包含细胞的转录物,或者,样品包含代表或者互补于细胞的转录物的核酸,是通过杂交到在阵列上或在“生物芯片”上的固定化核酸进行测量的。通过使用位于微芯片上的核酸所构成的“阵列”,细胞的一些或所有转录物可以被同时定量。替代性地,包含基因组核酸的阵列,也可以用于确定通过本发明方法所得到的新工程菌株的基因型。“多肽阵列”也可以用于同时定量多数个蛋白质。
[0350]如同在此使用的,术语“阵列”或者“微阵列”或者“生物芯片”或者“芯片”是多个靶元素的复数,每个靶元素包含确定量的一种或多种多肽(包括抗体)或核酸,其固定化在基片表面的确定面积上。在实践本发明的方法中,任何已知的阵列和/或制造和使用阵列的方法,都可以全部地或者部分地被引入,或者它们的改变,正如在如下文献中所公开的,例如,在美国专利号6,277,628;6,277,489;6,261,776;6,258,606;6,054,270;6,048,695;6,045,996;6,022,963;6,013,440;5,965,452;5,959,098;5,856,174;5,830,645;5,770,456;5,632,957;5,556,752;5,143,854;5,807,522;5,800.992;5,744,305;5,700,637;5,556,752;5,434,049;也参见,例如,WO 99/51773;WO 99/09217;WO 97/46313;WO 96/17958;也见,例如,Johnston (1998)Curr.Biol.8:R171-R174;Schummer(1997)BiotecJmiques23:1087-1092;Kern(1997)Biotechniques 23:120-124;Solinas-Toldo(1997)Genes,Chromosomes & Cancer 20:399-407;Bowtell(1999)Nature Genetics Supp.21:25-32。也参见,已经出版的美国专利申请号20010018642;20010019827;20010016322;20010014449;20010014448;20010012537;20010008765。
宿主细胞和包含hPIM-3序列的转化细胞
[0351]本发明也提供含有本发明的核酸序列的转化细胞,例如编码本发明的多肽的序列,或者,含有本发明的载体的转化细胞。宿主细胞可以是任何为本领域技术人员所熟悉的宿主细胞,包括原核细胞,真核细胞,诸如细菌细胞、真菌细胞、酵母细胞、哺乳动物细胞、昆虫细胞、或者植物细胞。典型细菌细胞包括大肠杆菌(E.coli),链霉菌(Streptomyces),枯草杆菌(Bacillus subtilis.)鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium),和处于Pseiidomonas属,链霉菌属(Streptomyces),以及葡萄球菌属(Staphylococcus)中的各种种类。典型的昆虫细胞,包括DrosophilaS2and Spodoptera Sf9。典型的动物细胞,包括CHO,COS或者Bowes黑色素瘤,或者任何鼠或人的细胞系。合适宿主的选择是在本领域技术人员的能力范围之内。
[0352]可以使用各种技术中的任何一种技术,将载体导入宿主细胞中,包括:转化、转染、转导、病毒感染、基因枪或者Ti-介导的基因转移。特别的方法包括,磷酸钙转染,DEAE-Dextran介导的转染,脂质转染或电穿孔。
[0353]工程宿主菌可以在常规营养介质中培养,对常规营养介质进行修饰,以便适于活化启动子,选择转化子或者扩增本发明的基因。在转化合适的宿主菌株之后,使宿主菌株生长到合适的细胞密度,通过合适的手段诱导所选择的启动子(例如,温度变动或者化学诱导)并将细胞额外培养一段时间,使得它们产生所需的多肽或多肽的片段。
[0354]细胞可以经离心收集,使用物理的或化学手段进行破碎,保留所得到的粗提物,用于进一步纯化。用于表达蛋白质的微生物细胞,可以使用常规方法进行破碎,包括冷冻-融解循环(冻融循环,freeze-thaw cycling)、超声波法、机械破碎、或者使用细胞裂解试剂。这些方法,对于本领域技术人员而言,是熟知的。表达的多肽或片段可以从重组细胞培养物中回收和纯化,使用包括硫酸铵或乙醇沉淀、酸抽提、阴离子或阳离子交换层析、磷酸纤维素层析、疏水作用层析、亲和层析、羟基磷灰石层析和凝集素层析。在完善多肽的构象中,假如需要的话,可以使用蛋白质重折叠步骤。如果期望,在最终的纯化步骤中,可以使用高效液相色谱法(HPLC)。
[0355]各种不同的哺乳动物细胞培养系统,也可以用于表达重组蛋白质。哺乳动物表达系统的例子,包括猴肾成纤维细胞的COS-7系,和其他能够从相容载体表达蛋白质的细胞系,如C127,3T3,CHO,HeLa和BHK细胞系。
[0356]在宿主细胞中的构建物,可以被以常规方式使用,以便产生由重组序列编码的基因产物。依据重组生产程序中所采用的宿主,由含有载体的宿主细胞所产生的多肽,可以是糖基化的或者可以是非糖基化的。本发明的多肽可能包括,或也可能不包括起始的甲硫氨酸残基。
[0357]也可以采用无细胞翻译系统产生本发明的多肽。无细胞反应系统,可以使用由DNA构建物转录得到的mRNA,DNA构建物包含与编码多肽或其片段的核酸可操作地连接的启动子。在某些方面,DNA构建物可以在进行体外转录反应之前被线性化。然后,将转录的mRNA与合适的无细胞翻译提取物温育,例如与兔网织红细胞提取物温育,从而产生期望的多肽或其片段。
[0358]表达载体可以含有一个或多个可选择的标记物基因,提供用于选择转化宿主细胞的表型特征,例如,对于真核细胞培养物,可以是二氢叶酸还原酶或新霉素抗性;或者在大肠杆菌(E.coli)中,为四环素或氨苄青霉素抗性。
[0359]对于在哺乳动物中的瞬时表达,编码感兴趣多肽的cDNA,可以被整合到哺乳动物表达载体中,例如pcDNAl,其可以从Invitrogen Corporation(San Diego,Calif.,U.S.A.;目录编号V490-20)通过商业渠道得到。这是一种多功能的4.2kb质粒载体,设计用于在真核系统中表达cDNA,和在原核生物中进行cDNA分析,在该载体上整合有CMV启动子和增强子、拼接片段和多腺苷酸化信号,SV40和多瘤病毒的复制起点,以及M13起始点,以便获救单链DNA,用于测序和诱变,用于产生有义和反义RNA转录物的Sp6和T7RNA启动子,和Col El-样高拷贝质粒起始点。一个多接头适当地位于CMV启动子(和T7启动子的3’端)的下游。
[0360]cDNA插入物可以首先从以上噬菌粒中被释放出来,其整合在pcDNAI多接头的合适限制性位点中。跨连接部位进行测序,以便确证在pcDNAI中的正确插入物方向。然后,将所得到的质粒引入选择出的哺乳动物细胞宿主中,例如COS-1谱系的衍生于猴的、成纤维细胞样细胞(从美国模式菌种收集中心可以得到,theAmerican Type Culture Collection,Rockville,Md如ATCC CRL 1650)中,进行瞬时表达。
[0361]对于编码蛋白质的DNA的瞬时表达,例如,COS-1细胞可以被转染,以每106个COS细胞采用大约8μg DNA,是通过DEAE介导的DNA转染和用氯喹处理,根据Sambrook等所描述的程序进行,Sambrook等Molecular Cloning:ALaboratory Manual,1989,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring HarborN.Y,pp.16.30-16.37。一个示例性方法如下所述。简要地,将COS-1细胞以5×106细胞/培养皿的密度铺板,然后在添加FBS的DMEM/F12培养基中生长24小时。然后去除培养基,细胞在PBS和培养基中被洗涤。然后,对细胞使用10ml体积的转染溶液,该转染溶液是DMEM/F12培养基,其中含有DEAE葡聚糖(0.4mg/ml)、100μM氯喹、10%NuSerum、DNA(0.4mg/ml)。37℃孵育3小时后,细胞用刚才描述的PBS和培养基洗涤,然后在含有10%DMSO的DMEM/F12培养基中休克1分钟。让细胞在添加10%FBS的培养基中生长2-3天,在孵育结束之时,将培养皿置于冰上,用冰冷的PBS洗涤,然后把细胞刮下来。随后,通过在1000rpm离心10分钟收获细胞,在液氮中冰冻细胞沉淀物,以便随后用在蛋白质表达中。将冰冻细胞的解冻等分试样,采用Northern印迹分析,确证编码受体的cDNA在储存的细胞中的表达。
[0362]以类似方式,也可以制备稳定转化的细胞系,例如,使用两种不同的细胞类型作为宿主:CHO K1和CHO Pro5。为了构建这些细胞系,编码相关蛋白质的cDNA可以整合到哺乳动物表达载体pRC/CMV(Invitrogen)中,pRC/CMV可以实现稳定表达。在此位点的插入物,将cDNA置于巨细胞病毒启动子的表达控制之下,并在多腺苷酸位点和牛生长激素基因的终止子的上游,并且进入到含有新霉素抗性基因(由SV40早期启动子驱动的)作为选择标记的载体背景中。
[0363]一个用于将按照以上描述构建的质粒引入的示例性方法,是如下所述的。首先,将宿主CHO细胞接种在添加10%FBS的MEM培养基中,以5×105的密度种植。在生长24小时后,往培养皿中加入新鲜培养基;和,3小时后,使用磷酸钙-DNA共沉淀程序转染细胞(Sambrook等,见上文)。简要地,3μg DNA被混合,并与钙缓冲溶液孵育,室温孵育10分钟。加入等体积的磷酸缓冲溶液,悬浮液室温孵育15分钟。接下来,将孵育过的悬浮液涂覆到细胞上,作用4小时并被除去,将细胞用含有15%甘油的培养基休克。三分钟后,细胞用培养基洗涤,在普通的生长条件下孵育24小时。在添加10%FBS的、含有G418(1mg/ml)的α-MEM培养基中,选择新霉素抗性细胞。大约2-3周后,分离出G418抗性细胞的单集落,克隆选择,然后繁殖用于分析目的。
实施例
实施例1:PIM-1的克隆(Cloning)
[0364]编码氨基酸1-313和29-313的PIM-1 DNA,是从人脑cDNA(Clonetech)扩增而来,是通过PCR方法扩增的;并被克隆到修饰的pET 29载体(Novagen)中,在NdeI和SalI限制性酶切位点之间。克隆的DNA的氨基酸序列,是用DNA测序确认的,并且表达的蛋白质在其C末端含有六组氨酸序列。蛋白质在E.coliBL21(DE3)pLysS(Novagen)中表达。细菌在22℃下、在极端肉汤(Terrific broth)中生长,达到1-1.2OD600;蛋白质由1mM IPTG诱导16-18小时。通过离心收集细菌沉淀物,-70℃储存,直到用于蛋白质纯化。PIM-2和PIM-3是类似地进行克隆。
实施例2:PIM-1的纯化(Purification)
[0365]将大约250-300克的、表达PIM-1激酶结构域(29-313)的细菌沉淀物(一般来自16升),悬浮在0.6L的裂解缓冲液中(0.1M磷酸钾缓冲液,pH 8.0,10%甘油,1mM PMSF);细胞在2000psi下、在法兰西加压池(French Pressure cell)中裂解。细胞提取物,在Sorval SA 600离心机中,以17,000rpm澄清1小时。悬浮液以17000rpm再离心1小时。往透明的悬浮液中,加入咪唑(pH 8.0)达到5mM,往每40ml细胞提取液中加入2ml的钴珠(50%淤浆)。将珠子,在4℃下、在章动器上,混和3-4小时。钴珠通过4000rpm离心5分钟予以回收。将沉淀的小珠,用裂解液洗涤几次,将珠子填装到Biorad一次性柱子上。结合的蛋白质,用3-4个柱体积的0.1M咪唑洗脱,然后用配制在裂解缓冲液中的0.25M咪唑洗脱。洗脱的蛋白质用SDS凝胶电泳分析纯度和产率。
[0366]从钴珠上得到的洗脱蛋白质,用Centriprep-10(Amicon)浓缩,并在PharmaciaSuperdex 200柱子(16/60)上、在低盐缓冲液(25mM Tris-HCl,pH 8.0,150mM NaCl,14mM β-巯基乙醇)中分离。含有PIM-1激酶的峰组分,在Pharmacia Source Q柱子(10/10)上进一步纯化,是在20mM Tris-HCl pH 7.5和14mM β-巯基乙醇中、使用NaCl梯度进行的,是在AKTA-FPLC(Pharmacia)中进行。PIM-1激酶大致在0.2M NaCl梯度下洗脱。峰组分用SDS凝胶电泳分析,用Centriprep10收集和浓缩。浓缩的PIM-1蛋白质(一般50-60A280/ml)分装在许多管中(60uL),在液氮中瞬时冷冻,储存在-70℃直到被用于结晶。正如从活性分析所得出的结论,冷冻的PIM-1激酶仍然保持激酶活性。PIM-2和PIM-3可以用相同的方式进行纯化,同时对条件稍做调整,例如,洗脱条件。
实施例3:PIM-1的变体(Variants)和衍生物(Derivatives)
[0367]在小鼠中,PIM-1以44kDa和33kDa两种形式表达。p44kDa PIM-1由与p33kDa PIM-1的相同的基因编码,但是翻译是在上游的CUG密码子处启动的(Saris CJ,Domen J,and Bems A.(1991).The PIM-1oncogene encodes two relatedprotein-serine/threonine kinases by alternative initiotion as AUG and CUG(PIM-1癌基因通过在AUG和CUG处的可选择性启动,编码两个相关的蛋白质-丝氨酸/苏氨酸激酶).EMBO J.10:655-664)。这导致p44PIM-1的表达,其具有独特的11kDa的N末端延伸、随后是p33PIM-1序列。p33kDa PIM-1含有几乎整个激酶结构域,p33和p44kDa都具有可比较的激酶活性,两者都可以阻止细胞凋亡(Lilly M,Sandholm J,Cooper JJ,Koskinen PJ,and Kraft A.(1999).The PIM-1serine kinaseprolongs survival and inhibits apoptosis-related mitochondrial dysfunction in partthrough a bcl-2-denpendent pathway(PIM-1丝氨酸激酶延长存活,并且抑制细胞凋亡相关的线粒体功能障碍,部分地通过bcl-2依赖性通路).Oncogene.,18:4022-4031)。CD40的参与导致WEHI-231细胞的细胞质提取物中的PIM1的33and44kDa形式的水平均显著增加。(Zhu N,Ramirez LM,Lee RL,Magnuson NS,BishopGA,and Gold MR.(2002).CD40Signaling in B cells regulates the expression of hePIM-1kinase via the NF-kappa B pathway(B细胞中CD40信号传导通过NF-κB途径调节PIM-1激酶的表达).J hnmunol.168:744-754)。最近发现:p33kDa形式比p44kDa形式更强烈地与Socs-1相关(Chen XP,Losman JA,Cowan S,Donahue E,Fay S,Vuong BQ,Nawijn MC,Capece D,Cohan VL,Rothman P.(2002).PIMserine/threonine kinases regulate the stability of Socs-1protein(PIM丝氨酸/苏氨酸激酶调节Socs-1蛋白的稳定性).Proc Nail Acad Sci USA.,99:2175-2180)。
[0368]在人中,PIM-1以多于一种形式存在并没有报道。PIM-1基因序列的分析,表明框内终止密码子的存在阻止了具有N末端延伸的蛋白质的合成。然而,基于已经报道的DNA序列,人PIM-2基因不含有框内终止密码子(in-frame stop codon)。所以,在上游的起始密码子上的可选择性起始是可能的。我们已经在大肠杆菌(E.coli)中表达了PIM-2激酶结构域,并且通过已经描述的、用于PIM-1激酶的相同方法进行了纯化。
实施例4:PIM-1的结晶(Crystallization)
PIM-1蛋白晶体生长:
[0369]除了特别标明外,所有材料都从Hampton Research,Inc.(Laguna Niguel,CA)购买。PIM-1蛋白质@7和14mg/ml,用Hampton晶体筛选试剂盒1和2(HS1和HS2)进行筛选,产生成功的晶体,在仅从HS1而来的至少10个条件下生长。晶体生长最初使用坐滴法,针对Hampton筛选条件,设置在Greiner 96孔CrystalQuick结晶板中,用100ul储液,往每个平台中加入1ul蛋白质+1ul储液(3个中的1个是可以使用的)。来自Hampton筛选1的条件产生明显的蛋白质晶体,在条件:#2,7,14,17,23,25,29,36,44,和49下。这些晶体在4℃下生长,并且生长成在尺寸上大小不一,所有的都是六边形的棒状形状,并且是坚硬的。
[0370]体积大一些的晶体,100uM宽×400uM长,然后,让其以更大一些的液滴体积和在更大一些的皿中生长。在VDX皿(cat.#HR3-140)或CrysChem皿(cat.#HR3-160)中,用悬滴法和坐滴法进行栅格精修。看起来,在两种方法之间,在晶体大小和质量上并没有明显差异,但是优选使用悬滴法,以便有助于固定程序。
[0371]我们继续进行条件精选,是通过将最初从筛选试剂盒中得到的4个独立储液条件,予以表格化而进行。
1)HS1#17优化为0.2M LiCI,0.1M Tris pH 8.5,5%-15%聚乙二醇4000;
2)HS1#25优化为0.4M-0.9M三水合醋酸钠pH 6.5和0.1M咪唑;
3)HS1#29优化为0.2M-0.7M酒石酸钠钾和0.1M MES缓冲液pH 6.5;
4)HS1#44优化为0.25M甲酸镁
[0372]这些优化的条件产生具有最恒定大小和表观质量的晶体。通过对得到的蛋白质晶体进行X-射线衍射分析,对条件进行评价,也记住在这些条件中的、用于形成化合物共晶体中的效用(如,盐组分和浓度效应,对于在结晶实验中产生合适的化合物溶解度是重要的)。在许多滴剂中,天然晶体生长为棒状,直到大约100um宽和500um长的大尺度。
硒代甲硫氨酸标记的PIM-1蛋白质晶体生长
[0373]按照Hendrickson,W.A.,and Ogata,C.M.(1997)“Phase determination frommultiwavelength anomalous diffraction measurements”.Methods Enzymol.,276,494-523和Hendrickson,W.A.,Horton,J.R.,and LeMaster,D.M.(1990)“Selenomethionyl proteins produced for analysis by multiwavelength anomalousdiffraction(MAD):a vehicle for direct determination of three-dimentional structure”,EMBO J.,9,1665-1672中的描述,表达和纯化硒代甲硫氨酸标记的PIM-1蛋白质(Se-Met labeled PIM protein)。此制剂看起来不那么易溶,因为在筛选滴剂中具有更显著的成核现象,以及由于硒标记的蛋白质的疏水特性。与以前评估的、天然蛋白质可以在其中很好生长的相似滴剂条件相比,晶体生长小并且分散。在更精细栅格化之后,在HS1#17条件下获得20μm宽×100μm长的晶体,是在0.2M LiCl,0.1M Tris pH 8.5和5%-15%PEG 4000下被优化的。这些晶体和所有其他晶体,都被小心地置于位于铜柄磁性支承物上的50-100uM尼龙环中,在液氮下、在合适的缓冲液中、快速冷冻,然后采用Lawerence Berkeley实验室同步加速器(Lawerence Berkeley Lab synchrotron),the Advanced Light Source(ALS)beamline8.3.1。
PIM-1蛋白质/分子骨架共晶体生长:
[0374]为了把化合物加入到PIM-1蛋白质中,化合物直接从它们的DMSO储液(20-200mM)中,以高浓度,加入到蛋白质溶液中。该方法涉及把包含化合物的DMSO储液作为薄层加到含有蛋白质的1.5ml微量离心管的壁上。然后,溶液缓慢在管壁上翻转,直到化合物被置于蛋白质溶液中。在PIM-1溶液中的化合物的最终浓度,一般达到0.5到1mM之间,加入浓度小于2%的DMSO。然后,立刻将溶液按照以上描述设置在皿中。
HS1中PIM-1/化合物共晶体筛选:
[0375]晶体生长的两种条件,已经针对PIM-1蛋白质和所加的化合物,得到了最好的结果。优化的酒石酸Na-K和四水合乙酸钠溶液,如上所列。晶体大小变化很大,但是数据是在大小在20uM到100uM宽度之间的不同晶体上收集的。这些晶体一般是几百微米长,一些要求控制,同时要进行破裂,以便促进至环上的装配程序。有趣的是,一些在有颜色化合物存在的条件下生长的晶体,也同样是有颜色的。
实施例5:PIM-1的衍射分析(Diffraction Analysis)
[0376]首先,晶体在Rigaku RU-200旋转铜阳极X-射线源上确定衍射,该X-射线源装备有Yale聚焦光学设施和R-AXIS 2C成象板系统。生长在优化条件HSl#17(DYplate 12/14/01)中的晶体,用于进行最初的衍射实验。
[0377]按照以上描述,在X-射线衍射最初确定之后,大的天然蛋白质晶体在甲酸镁(DY皿)中生长,通过浸没在液氮中,从而在防冻保护剂中予以冷冻,然后在ALSbeamline 8.3.1处,对衍射进行检验。收集最初数据,作索引,使用Mosflm进行简化。间隔基(Spacegroup)确定为P65。
[0378]我们收集了3组天然数据,合并后,获得具有良好统计学的最高分辨率,为2.0_。
[0379]我们在硒-甲硫氨酸(Se-Met)标记的PIM-1晶体上收集MAD数据集,使用实验确定的12668eV峰值和11000eV远距离值,对硒而言,达到3.2埃。随后,在12668eV辐射的实验确定峰值处,收集2.6埃Se峰值数据集。
[0380]我们收集超过50个的PIM-1/结合化合物的共晶体数据集。所有数据都被索引和被简化,如同以下所述的计算结晶学所表明的。
PIM-1结构鉴定和精修
数据组:天然,分辨率:2.13
[0381]使用分子置换方法进行一级结构鉴定,应用如下程序
EPMR(公共领域)
AmoRe(来自CCP4))
和基于蛋白质磷酸化酶激酶的PIM-1的同源模型
(PDB ID:1PHK-Owen等,1995,Structure 3:467)
[0382]在所有的P6间隔基(P6l,P62,...P65)中,进行分子置换。最好的分辨率是在P65中获得的。
[0383]通过几轮如下的循环,分子置换溶液得以改进,这些循环是
建模在O(来自DatOno AB)
复性在CNX中(来自Accelerys)
SigmaA称重和溶剂平化合成的图,使用DM(来自CCP4)
[0384]这些循环后进行统计,为R~36%。
数据组:硒代甲硫氨酸(2波长),分辨率:3.3
[0385]MAD相控数据(带有SOLVE(来自于Los Alamos National Laboratory))有助于提高REFMAC(来自于CCP4)的精修模型
[0386]得到了模型的进一步改进,是采用SOLVE,使用SAD相控获得;随后用RESOLVE改进,生成优秀图谱,在其中,PIM1模型可以完全重建。
[0387]新建成的模型用CNX/Anneal进行精修,然后用CCP4/Refmac精修得到R=27.7%和Rfree=31.9%
数据组:天然,分辨率:2.1
[0388]使用CCP4/Refinac,相对于天然数据,对以上模型进行进一步精修,得到R=22.1%,Rfree=24.2%。
实施例6:共晶体结构(C-Crystal Structures)
[0389]使用以上一般描述的方法,示例性的共晶体结构已经被鉴定,用与PEM-1在一起的7种化合物进行鉴定。那些共晶体是如下所述的共晶体(数字表明化合物标识号(id),化合物的来源在括号中予以提供):
PIM1_5104579(Chembridge)
PIM1_5317991(Chembridge)
PIM1_5348396(Chembridge)
PIM1_5377348(Chembridge)
PIM1_NRB02258(Maybridge)
PIMl_NRB05093(Maybridge)
PIM1_RJF00907(Maybridge)
实施例7:PIM结合分析(PIM Binding Assays)
[0390]这样的结合分析可以以多种方式进行,包括本领域已知的各种方式。例如,与PIM-1的竞争结合,可以在Nickel-FlashPlates上测量,是使用His-标记的PIM-1(~100ng)和ATPγ[35S](~10nCi)进行测量的。当加入化合物时,信号降低,因为更少的ATPγ[35S]结合到PIM1上,PIM1在FlashPlate中最靠近闪烁体。结合分析可以如下进行,通过往PIM-1蛋白质(90 10ul)中添加化合物(10ul;20mM),然后添加ATPγ[35S],在37℃下温育1小时。通过在Trilus(Perkin-Elmer)中进行闪烁计数,测量放射性。
[0391]可替代地,可以使用任何可以测量配基结合到ATP-结合位点的方法。例如,可以使用荧光配基。当结合到PIMl上时,发出的荧光被极化。一旦通过抑制剂结合法进行了置换,极化降低。
[0392]通过竞争结合测定确定化合物的IC50。(注意Ki是抑制剂结合的解离常数;KD是底物结合的解离常数)。对于此系统,IC50,抑制剂结合常数和底物结合常数可以根据下述公式使之相关:
[0393]当使用放射标记的底物时,K1=
IC50
1+[L*]/KD
当有少量标记底物时,IC50~KI。
实施例8:PIM活性分析(PIM Activity Assays)
[0394]化合物结合到PIM-1的抑制或积极(exhitory)活性,是使用在详述部分中所描述的激酶活性测定进行确定。
[0395]分析在式1、式II和式III中的示例性化合物对PIM-1的抑制活性。开发配基的能力,是被来自喹啉酮分子骨架基团(式III)的2种化合物举例说明的。具有R1,R2,R3,R4,R5,和R6=H的化合物,在200uM浓度下,具有针对PIM-1的100%抑制率;而具有R1=苯基,R2,R3,R5,和R7=H,和R4=OCFs的化合物,在200uM浓度下,具有针对PIM-1的仅仅3%抑制率。
实施例9:式I化合物的合成:
方案-1
[0396]2-氨基苯并咪唑衍生物,由式I代表,可以被按照如方案-1所示进行制备。
式(3)的步骤-1制备
[0397]式(3)的化合物是通过式(1)的化合物与式(2)的胺反应而常规制备的,在式(1)的化合物中,其中X=F或Cl(例如,2-氟硝基苯);在惰性溶剂(例如DMF)中,在碱(例如,K2CO3)的存在下,一般是加热至80℃附近,反应12-36小时而制备。
式(4)的步骤-2制备
[0398]式(4)的化合物是通过式(3)的化合物与还原剂(例如,甲酸铵,HCO2NH4)反应而制备的,是在催化剂(例如,Pd/C)存在的存在下,在合适溶剂(例如,甲醇)中,在室温下,反应几小时常规制备。当反应基本完成时,式(4)的产物用常规方法分离,例如,通过硅藻土(Celite)过滤。
式I的步骤-3制备
[0399]式(4)的化合物与式(5)的异硫氰酸酯反应,是在碳二亚胺的存在下(例如,羰基二亚胺)、在惰性溶剂(例如DMF)中进行反应的。当反应基本完成时,式I的产物通过常规方法分离(例如,反相HPLC)。Smith,等,(1999)J.Comb.Chem.,1,368-370;和,其中的参考文献。
实施例10:式II的化合物的合成:
方案-2
[0400]7-氮杂吲哚衍生物,用式II代表,可以按照方案-2中所示进行制备。
式(8)的步骤-1制备
[0401]式(6)的化合物(例如,2-叔-丁氧基羰基胺-3-甲基吡啶)与强有机碱(例如,n-丁基锂)反应,在惰性溶剂(例如,THF)中,同时予以冷却。然后加入式(7)的化合物(其中X=F,Cl,Br,I,例如,苄基溴),允许反应30分钟,在其时反应物被加热,用水猝灭。式(8)的产物通过常规方法分离;例如,含水逐步分离(aqueous workup),将产物萃取到有机溶剂中,在减压条件下除去溶剂,然后在硅胶上对残余物进行层析。
式(10)的步骤-2制备
[0402]式(8)的化合物与强有机碱(例如,n-丁基锂)反应,在惰性溶剂(例如,THF)中,同时予以冷却。然后加入式(9)的化合物(其中Y=CH3(例如,DMF)或者Y=OCH3(如,Weinreb酰胺,例如,N-甲氧基-N-甲基苯甲酰胺),反应在0℃下进行大约1小时,形成式(10)的中间体,中间体用常规方法分离(例如,含水逐步分离,或者反应混合物被如同步骤3中所描述的方式进行处理,直接得到式II的化合物。
式II的步骤-3制备
[0403]式(10)的化合物用酸处理(例如5.5M HCl),在近45℃加热约1小时,或者步骤2的反应混合物直接用酸淬灭(例如5.5M HCl),近40℃加热大约2小时。式II的产物用常规法分离(例如,反相HPLC,库格尔若蒸馏,或者形成酒石酸盐,然后过滤并中和)Hands,et.al.,(1996)Synthesis,7,877;Merour and Joseph,(2001)Curr.Org.Chem.5,471-506。
实施例11:式III的化合物合成,其中Z=O:
方案-3
[0404]喹啉酮衍生物,由式III代表,其中Z=O,可以如方案-3中所示进行制备。式(13)的步骤-1制备:
[0405]式(13)的化合物通过化合物(11)与式(12)的酰基氯反应而进行常规制备,其中化合物(11),例如,是乙基2-氨基苯甲酸酯;在惰性溶剂,例如,二氯甲烷中;在三元有机碱,例如三乙胺存在的条件下;室温反应大约2-24小时,优选反应过夜。当反应基本完成时,式(13)的产物用常规方法分离,例如含水逐步分离,产物在有机溶剂中提取,溶剂在减压条件下除去,然后在硅胶上对残留物进行层析。
式(14)的步骤-2制备:
[0406]式(14)的化合物可以从式(13)的化合物通过Diekmann环化作用制备,通过与三元有机碱或者碱金属醇盐搅拌,例如叔丁醇金属钾;在惰性溶剂中,例如四氢呋喃中;在0℃到室温下,优选的是室温;搅拌大约2-24小时,优选的是2小时。当反应基本完成时,式(14)的产物通过常规方法分离,例如淬灭反应混合物,产物用有机溶剂提取,例如用乙酸乙酯提取,和,在减压条件下除去溶剂,然后进行结晶。
[0407]式(14)的化合物的一个替代合成,开始于2-硝基-苯甲酸衍生物,在方案-4中显示出来。
方案-4
[0408]式(16)的化合物与式(17)化合物和碱金属酰胺的溶液或悬浮液反应,例如二异丙基酰胺锂,在惰性溶剂中,例如THF;在-40℃到室温下,优选的是-40℃;反应2-24小时,优选的是2小时。当反应基本完成时,式(14)的产物通过常规方法分离,例如反应混合物的淬灭,产物用有机溶剂例如乙酸乙酯提取,在减压条件下除去溶剂,然后结晶。
[0409]式(16)的化合物可以从式(15)的化合物通过还原制备,例如用肼和氯化铁进行还原,在含水氢氧化钠中,在回流,环化,例如在室温下与草酰氯搅拌,然后烷基化,例如,与R2-卤化物和氢化钠、在DMF中、在室温下、进行搅拌,正如在Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 12(2002)85-88中所描述的。
式III的步骤-3制备,其中Z=O:
[0410]式I的化合物可以通过式(14)的化合物与烷化剂反应制备,例如烷化剂为二甲基硫酸;在溶剂混合物中,例如甲醇和水;在回流条件下;反应2-24小时,优选的是6小时。当反应基本完成时,式III的产物,其中Z=O,可以通过常规方法被分离。
实施例12:人PIM-3的分离、克隆和纯化
[0411]使用大鼠PIM3序列(AF086624)查询公共的人EST数据库。发现两个人EST克隆与该大鼠序列具有高度同源性。来自源于脑的神经母细胞瘤细胞的EST#AL530963编码N-末端部分,来自源于皮肤的鳞状细胞癌细胞的EST#BG681342编码C-末端部分。在这些EST序列的基础上,设计两个寡核苷酸PIM-3S(5’-GCAGCCACATATGGCGGACAAGGAGAGCTTCGAG-3’)和PIM-3A(5′-TGCAGCGTCGACCAAGCTCTCGCTGCTGGACGTG-3′),采用PCR从人EST克隆#BF204865扩增该激酶结构域,人EST克隆#BF204865看起来编码全长的人PIM3蛋白。PCR产物亚克隆进入修饰过的pET29a载体中,在读框内带有羧基端His标记,用于细菌表达。His6-标记PIM3蛋白质被表达,并且被纯化,如在PIM1中所描述的。附上编码人全长PIM3蛋白质的核苷酸序列和氨基酸序列,如在表5中所示。
实施例13:PIM激酶的定点诱变(Site-directed Mutagenesis)
[0412]PIM激酶的诱变,诸如PIM-1的P123M突变,可以根据下述方法进行。如同描述于:Molecular Biology:Current Innovations and Future Trends.Eds.A.M.Griffin and H.G.Griffm.(1995)ISBN 1-898486-01-8,Horizon Scientific Press,PO Box1,Wymondham,Norfolk,U.K.,除了别的文献以外。
[0413]体外定点诱变,对于研究蛋白质结构-功能的关系、基因表达和载体修饰来说,是价值无法衡量的一项技术。在文献中,已经出现了几种方法,但是这些方法中的许多种要求单链DNA作为模板。基于此的动机,历史地,是分离互补链以便阻止重退火的需要。在定点突变中使用PCR,实现了链分离,是通过变性步骤分离互补链、并使得PCR引物得以高效聚合而完成。因此,PCR定点方法,使得位点特异诱变整合到实质上的任何双链质粒上;消除了对基于M13的载体或单链获救的需要。
[0414]当进行基于PCR的定点诱变时,减少在PCR过程中的循环数目常常是期望的,以便阻止任何第二点突变(不需要的)的克隆扩展。有限循环将导致降低的产物产率,是通过增加起始模板浓度而予以补偿。应用选择,以便减少来源于反应的母本分子的数目。而且,为了使用单一PCR引物组,需要优化该长PCR方法。进一步地,因为一些热稳定聚合酶的延伸酶活性,经常需要在该程序中引进一个末端补齐步骤,是在PCR生成产物进行末端到末端连接之前引入该补齐步骤,PCR生成产物包含掺入突变,位于一个或者两个PCR引物中。
[0415]以下方案提供了用于定点诱变的一个容易方法,是通过下述步骤的整合,完成以上所需特征:
(i)相对于常规PCR条件,增加模板浓度大约1000倍;(ii)降低循环数,从25-30降低到5-10;(iii)加入限制性内酶切DpnI(识别靶序列:5-Gm6ATC-3,其中A残基是甲基化的),以便相对母本DNA进行选择(注意:从大肠杆菌几乎所有的普通菌株中分离的DNA,在序列5-GATC-3中,是Dam-甲基化的);(iv)使用PCR混合物中的Taq延伸物,使PCR的可靠性增加到10kb;(v)使用Pfu DNA聚合酶,补齐PCR产物的末端;和,(vi)在T4DNA连接酶存在的条件下,有效的分子内连接。
[0416]往PCR混合物(cocktail)中,加入质粒模板DNA(大约0.5皮摩尔),PCR混合物含有,在25ul的1×诱变缓冲液中:(20mM Tris HCl,pH 7.5;8mM MgCl2;40ug/ml BSA);每种引物12-20皮摩尔(其中一种必须含有5-’引发磷酸),每种dNTP为250uM,2.5U Taq DNA聚合酶,2.5U的TaqExtender(Stratagene)。
[0417]PCR循环参数是1个循环由:94℃4分钟,50℃2分钟,72℃2分钟构成;然后5-10个循环,由:94℃1分钟,54℃2分钟和72℃1分钟(步骤1)构成。
[0418]母本模板DNA,和,线性的、整合了诱变引物的新合成DNA,被用DpnI(10U)和Pfu DNA聚合酶(2.5U)处理。这导致体内甲基化的母本模板和杂种DNA的DpnI消化;通过Pfu DNA聚合酶,除去位于线性PCR产物上的Taq DNA聚合酶延伸的碱基。
[0419]反应物在37℃下孵育30分钟,然后转移到72℃种,再孵育30分钟(步骤2)。
[0420]往DpnI消化的、Pfu DNA聚合酶补齐的PCR产物中,加入诱变缓冲液(1×,115ul,含有0.5mM ATP)。
[0421]溶液被混和,取10ul到一个新的微量离心管中,加入T4 DNA连接酶(2-4U)。
[0422]连接反应是在37℃下温育超过60分钟(步骤3)。
[0423]处理过的溶液,转化到感受态大肠杆菌中(步骤4)。
[0424]除了以上描述的基于PCT的定点诱变之外,也可以使用其他方法。例子包括在Kunkel(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.82:488-492;Eckstein et al.(1985)Nucl.Acids Res.13:8764-8785中描述的方法;并且,使用来自Promega的GeneEditorTM定点诱变系统。
实施例14:GleevecTM和别的brc-ab1抑制剂对PIM-1的抑制作用
[0425]与鉴定PIM-1作为双重活性蛋白激酶相一致,发现甲磺酸伊马替尼(GleevecTM)和其他brc-abl抑制剂也是PIM-1的抑制剂。所以,测定了GleevecTM和下述化合物的活性。
[0426]根据生产商的使用说明书,使用PY20 AlphaScreen试剂盒(PackardBioScience),发现GleevecTM对于PIM-1具有的IC50是80nM,而上述化合物具有的IC50为10nM;两种对于abl都大致相同。这些试验证明:这些化合物是PIM-1的有效抑制剂,并且,可以用于治疗PIM相关疾病,如PIM-1相关癌症。
[0427]在说明书中,所列出的所有专利和其他参考文献,是为了指示与本发明相关的技术领域的技术人员的技术水平,并且以它们的整体引入本文作为参考文献,包括任何的表和图,达到如同每个参考文献都是以它的全部个体地引入作为参考的相同程度。
[0428]本领域技术人员将会容易地体会到:本发明是很好改进的,以便获得提及的结果和优点,以及那些在其中所固有的结果和优点。在此描述的方法、变化和组合物,是优选实施方案的目前代表,是示例性的,并不意在作为本发明范围的限定。其中的变化和别的用途将呈现给本领域的技术人员,这是被囊括在本发明的精神之内的,是由权利要求书的范围所确定的。
[0429]对本领域技术人员而言,可以对此处公开的本发明进行改变取代和修饰,而不背离本发明的精神和范围,这是毫无困难和显而易见的。例如,可以对对PIM蛋白质的结晶或共结晶条件进行改变。所以,这样的附加实施方案是在本发明和以下的权利要求书的范围之内。
[0430]在此举例描述本发明是合适的,本发明可以在缺少任何一个要素或者多个要素,在缺少任何一个限定或者多个限定的条件下实施,这些要素和限制在此没有具体描述。所以,例如,在此的每个情形中,术语“含有”“基本上包括”和“由……组成”的任何一个是可以被其他两个中的任何一个所替代。所采用的术语和表达,是用作说明的术语,而不是限制;在此没有这样的意图,即使用这样的术语和表达在于排除所示和所描述的特征或者它们的部分的任何等同物,而是应该承认:各种修改是可能包括在所要求保护的发明的范围之内。所以,应该理解,虽然本发明已经通过优选例子和任选特点加以具体公开,但是,在此公开的概念的修饰和改变将被本领域技术人员所借助,并且这些修饰和变化是在本发明的范围之内,如所附权利要求书所限定的。
[0431]另外,当本发明的特征或方面被采用马库什组或替代性的其他分组描述时,本领域的技术人员将认识到:本发明也是因而以任何个体成员或马库什小组或其他小组的成员的亚组予以描述的。
[0432]而且,除非有相反说明,对于提供给实施方案的各种数字数值,附加实施方案以任何2个不同值作为范围的终末点而予以描述。这样的范围也在描述的发明的范围之内。
[0433]因此,附加的实施方案是在本发明的范围之内,是在以下的权利要求书的范围之内。
[0434]
[0435]
[0436]
表1
HEADER ---- XX-XXX-XX xxxx
COMPND ---
REMARK 3
REMARK 3 REFINEMENT.
REMARK 3 PROGRAM :REFMAC 5.1.19
REMARK 3 AUTHORS :MURSHUDOV,VAGIN,DODSON
REMARK 3
REMARK 3 REFINEMENT TARGET:MAXIMUM LIKELIHOOD
REMARK 3
REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS):2.00
REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS):84.52
REMARK 3 DATA CUTOFF (SIGMA(F)):NONE
REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%):99.27
REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS :28693
REMARK 3
REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 CROSS-VALIDATION METHOD :THROUGHOUT
REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SELECTION :RANDOM
REMARK 3 R VALUE (WORKING+TEST SET) :0.22119
REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) :0.22012
REMARK 3 FREE R VALUE :0.24194
REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%):5.0
REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT :1498
REMARK 3
REMARK 3 FIT IN THE HIGHEST RESOLUTION BIN.
REMARK 3 TOTAL NUMBER OF BINS USED :20
REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE HIGH :2.000
REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE LOW :2.052
REMARK 3 REFLECTION IN BIN (WORKING SET) :2096
REMARK 3 BIN R VALUE (WORKING SET) :0.344
REMARK 3 BIN FREE R VALUE SET COUNT :102
REMARK 3 BIN FREE R VALUE :0.359
REMARK 3
REMARK 3 NUMBER OF NON-HYDROGEN ATOMS USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 ALLATOMS :2382
REMARK 3
REMARK 3 B VALUES.
REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2):NULL
REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL,A**2):49.236
REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE.
REMARK 3 B11(A**2):1.32
REMARK 3 B22(A**2):1.32
REMARK 3 B33(A**2):-1.99
REMARK 3 B12(A**2):0.66
REMARK 3 B13(A**2):0.00
REMARK 3 B23(A**2):0.00
REMARK 3
REMARK 3 ESTIMATED OVERALL COORDINATE ERROR.
REMARK 3 ESU BASED ON R VALUE (A):0.158
REMARK 3 ESU BASED ON FREE R VALUE (A):0.142
REMARK 3 ESU BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A):0.127
REMARK 3 ESU FOR B VALUES BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD(A**2):4.758
REMARK 3
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENTS.
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENT FO-FC :0.954
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENT FO-FC FREE:0.947
REMARK 3
REMARK 3 RMS DEVIATIONS FROMIDEAL VALUES COUNT RMS WEIGHT
REMARK 3 BOND LENGTHS REFINED ATOMS (A):2296;0.011;0.021
REMARK 3 BOND ANGLES REFINED ATOMS (DEGREES):3114;1.088;1.945
REMARK 3 TORSION ANGLES,PERIOD 1 (DEGREES):273 ;3.838;5.000
REMARK 3 CHIRAL-CENTER RESTRAINTS (A**3):332 ;0.081;0.200
REMARK 3 GENERAL PLANES REFINED ATOMS (A):1784;0.004;0.020
REMARK 3 NON-BONDED CONTACTS REFINED ATOMS(A):1094;0.215;0.200
REMARK 3 H-BOND(X...Y)REFINED ATOMS (A):138 ;0.121;0.200
REMARK 3 SSYMMETRY VDW REFINED ATOMS (A):60 ;0.282;0.200
REMARK 3 SYMMETRY H-BOND REFINED ATOMS (A):19 ;0.247;0.200
REMARK 3
REMARK 3 ISOTROPIC THERMAL FACTOR RESTRAINTS. COUNT RMS WEIGHT
REMARK 3 MAIN-CHAIN BOND REFINED ATOMS (A**2):1365;1.058;1.500
REMARK 3 MAIN-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):2212;2.010;2.000
REMARK 3 SIDE-CHAIN BOND REFINED ATOMS (A**2):931 ;2.240;3.000
REMARK 3 SIDE-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):902 ;3.766;4.500
REMARK 3
REMARK 3 NCS RESTRAINTS STATISTICS
REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS:NULL
REMARK 3
REMARK 3
REMARK 3 TLS DETAILS
REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS :NULL
REMARK 3
REMARK 3
REMARK 3 BULK SOLVENT MODELLING.
REMARK 3 METHOD USED:BABINET MODEL WITH MASK
REMARK 3 PARAMETERS FOR MASK CALCULATION
REMARK 3 VDW PROBE RADIUS :1.40
REMARK 3 ION PROBE RADIUS :0.80
REMARK 3 SHRINKAGE RADIUS :0.80
REMARK 3
REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS:NULL
REMARK 3
CISPEP 1 GLU A 124 PRO A 125 0.00
CRYST1 99.210 99.210 80.285 90.00 90.00 120.00 P 65
SCALE1 0.010080 0.005819 0.000000 0.00000
SCALE2 0.000000 0.011639 0.000000 0.00000
SCALE3 0.000000 0.000000 0.012456 0.00000
ATOM 1 N PRO A 33 9.285 100.137 -4.493 1.00 93.84 N
ATOM 2 CA PRO A 33 8.922 99.154 -3.430 1.00 93.59 C
ATOM 3 CB PRO A 33 9.624 97.864 -3.896 1.00 93.79 C
ATOM 4 CG PRO A 33 10.732 98.328 -4.833 1.00 93.76 C
ATOM 5 CD PRO A 33 10.201 99.562 -5.499 1.00 93.83 C
ATOM 6 C PRO A 33 9.413 99.588 -2.038 1.00 93.22 C
ATOM 7 O PRO A 33 8.647 100.212 -1.288 1.00 93.33 O
ATOM 8 N LEU A 34 10.667 99.251 -1.716 1.00 92.55 N
ATOM 9 CA LEU A 34 11.325 99.616 -0.457 1.00 91.82 C
ATOM 10 CB LEU A 34 11.402 101.150 -0.303 1.00 92.11 C
ATOM 11 CG LEU A 34 12.362 101.709 0.756 1.00 92.47 C
ATOM 12 CD1 LEU A 34 13.829 101.513 0.349 1.00 92.34 C
ATOM 13 CD2 LEU A 34 12.044 103.183 1.024 1.00 93.01 C
ATOM 14 C LEU A 34 10.758 98.941 0.808 1.00 90.98 C
ATOM 15 O LEU A 34 11.164 97.828 1.157 1.00 91.10 O
ATOM 16 N GLU A 35 9.837 99.614 1.498 1.00 89.80 N
ATOM 17 CA GLU A 35 9.346 99.114 2.780 1.00 88.50 C
ATOM 18 CB GLU A 35 10.297 99.526 3.901 1.00 88.76 C
ATOM 19 CG GLU A 35 10.444 101.039 4.047 1.00 89.07 C
ATOM 20 CD GLU A 35 11.208 101.436 5.292 1.00 89.82 C
ATOM 21 OE1 GLU A 35 10.603 101.403 6.400 1.00 90.45 O
ATOM 22 OE2 GLU A 35 12.411 101.780 5.162 1.00 89.60 O
ATOM 23 C GLU A 35 7.963 99.672 3.060 1.00 87.48 C
ATOM 24 O GLU A 35 7.220 99.114 3.875 1.00 87.62 O
ATOM 25 N SER A 36 7.640 100.781 2.382 1.00 85.74 N
ATOM 26 CA SER A 36 6.316 101.427 2.424 1.00 83.76 C
ATOM 27 CB SER A 36 6.258 102.576 1.402 1.00 84.10 C
ATOM 28 OG SER A 36 7.465 103.332 1.399 1.00 84.47 O
ATOM 29 C SER A 36 5.170 100.444 2.150 1.00 81.91 C
ATOM 30 O SER A 36 3.997 100.755 2.389 1.00 81.51 O
ATOM 31 N GLN A 37 5.535 99.262 1.651 1.00 79.60 N
ATOM 32 CA GLN A 37 4.600 98.179 1.363 1.00 77.25 C
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ATOM 35 CD GLN A 37 6.645 96.330 -1.414 1.00 77.20 C
ATOM 36 OE1 GLN A 37 5.827 95.483 -1.799 1.00 77.03 O
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ATOM 45 CE1 TYR A 38 4.361 93.019 3.032 1.00 63.31 C
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ATOM 50 C TYR A 38 4.125 98.099 6.169 1.00 71.00 C
ATOM 51 O TYR A 38 5.021 98.914 6.385 1.00 70.68 O
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ATOM 55 CG GLN A 39 0.934 100.00 79.385 1.00 73.80 C
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ATOM 57 OE1 GLN A 39 -0.750 98.794 10.625 1.00 79.52 O
ATOM 58 NE2 GLN A 39 1.161 99.330 11.717 1.00 78.94 N
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ATOM 97 C GLY A 45 11.517 88.122 19.027 1.00 69.52 C
ATOM 98 O GLY A 45 11.763 88.937 18.124 1.00 69.05 O
ATOM 99 N SER A 46 12.448 87.517 19.774 1.00 71.08 N
ATOM 100 CA SER A 46 13.891 87.764 19.662 1.00 72.58 C
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ATOM 107 C GLY A 47 17.739 84.965 18.608 1.00 74.12 C
ATOM 108 O GLY A 47 18.133 85.889 17.883 1.00 74.48 O
ATOM 109 N GLY A 48 18.150 83.698 18.490 1.00 73.84 N
ATOM 110 CA GLY A 48 19.109 83.257 17.478 1.00 73.16 C
ATOM 111 C GLY A 48 18.602 83.392 16.048 1.00 72.45 C
ATOM 112 O GLY A 48 19.391 83.374 15.093 1.00 72.37 O
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ATOM 115 CB PHE A 49 15.215 83.187 14.590 1.00 70.83 C
ATOM 116 CG PHE A 49 14.301 83.752 15.661 1.00 73.19 C
ATOM 117 CD1 PHE A 49 13.584 84.933 15.439 1.00 74.32 C
ATOM 118 CE1 PHE A 49 12.738 85.453 16.419 1.00 75.71 C
ATOM 119 CZ PHE A 49 12.587 84.787 17.638 1.00 75.96 C
ATOM 120 CE2 PHE A 49 13.290 83.605 17.874 1.00 75.42 C
ATOM 121 CD2 PHE A 49 14.139 83.090 16.883 1.00 74.82 C
ATOM 122 C PHE A 49 16.696 85.231 14.157 1.00 68.55 C
ATOM 123 O PHE A 49 16.785 85.509 12.963 1.00 69.15 O
ATOM 124 N GLY A 50 16.663 86.164 15.106 1.00 66.20 N
ATOM 125 CA GLY A 50 16.625 87.588 14.795 1.00 62.55 C
ATOM 126 C GLY A 50 15.562 88.351 15.578 1.00 59.75 C
ATOM 127 O GLY A 50 15.316 88.056 16.754 1.00 59.86 O
ATOM 128 N SER A 51 14.945 89.332 14.916 1.00 56.20 N
ATOM 129 CA SER A 51 13.866 90.148 15.480 1.00 51.75 C
ATOM 130 CB SER A 51 14.300 91.614 15.587 1.00 51.18 C
ATOM 131 OG SER A 51 15.454 91.750 16.401 1.00 48.30 O
ATOM 132 C SER A 51 12.699 90.076 14.537 1.00 49.79 C
ATOM 133 O SER A 51 12.848 90.341 13.344 1.00 48.22 O
ATOM 134 N VAL A 52 11.538 89.724 15.064 1.00 47.77 N
ATOM 135 CA VAL A 52 10.345 89.551 14.243 1.00 46.96 C
ATOM 136 CB VAL A 52 9.7958 8.091 14.312 1.00 46.48 C
ATOM 137 CG1 VAL A 52 8.5708 7.924 13.397 1.00 45.18 C
ATOM 138 CG2 VAL A 52 10.873 87.082 13.955 1.00 45.83 C
ATOM 139 C VAL A 52 9.265 90.515 14.701 1.00 47.44 C
ATOM 140 O VAL A 52 8.874 90.493 15.869 1.00 48.09 O
ATOM 141 N TYR A 53 8.784 91.346 13.779 1.00 47.68 N
ATOM 142 CA TYR A 53 7.723 92.315 14.055 1.00 48.21 C
ATOM 143 CB TYR A 53 8.102 93.711 13.532 1.00 47.13 C
ATOM 144 CG TYR A 53 9.290 94.335 14.223 1.00 46.28 C
ATOM 145 CD1 TYR A 53 10.593 93.949 13.897 1.00 43.98 C
ATOM 146 CE1 TYR A 53 11.689 94.495 14.532 1.00 42.59 C
ATOM 147 CZ TYR A 53 11.498 95.475 15.521 1.00 43.72 C
ATOM 148 OH TYR A 53 12.598 96.012 16.159 1.00 43.55 O
ATOM 149 CE2 TYR A 53 10.226 95.884 15.864 1.00 44.06 C
ATOM 150 CD2 TYR A 53 9.117 95.305 15.221 1.00 45.68 C
ATOM 151 C TYR A 53 6.436 91.886 13.363 1.00 49.25 C
ATOM 152 O TYR A 53 6.466 91.335 12.258 1.00 48.07 O
ATOM 153 N SER A 54 5.306 92.162 14.008 1.00 50.84 N
ATOM 154 CA SER A 54 3.996 91.959 13.398 1.00 53.09 C
ATOM 155 CB SER A 54 2.889 92.092 14.445 1.00 53.24 C
ATOM 156 OG SER A 54 1.609 91.939 13.854 1.00 55.73 O
ATOM 157 C SER A 54 3.826 93.019 12.342 1.00 54.41 C
ATOM 158 O SER A 54 4.303 94.129 12.510 1.00 55.46 O
ATOM 159 N GLY A 55 3.151 92.691 11.248 1.00 56.17 N
ATOM 160 CA GLY A 55 3.043 93.625 10.143 1.00 58.09 C
ATOM 161 C GLY A 55 1.800 93.39 19.327 1.00 60.22 C
ATOM 162 O GLY A 55 1.164 92.34 39.433 1.00 60.35 O
ATOM 163 N ILE A 56 1.457 94.38 18.513 1.00 62.12 N
ATOM 164 CA ILE A 56 0.307 94.30 57.635 1.00 64.34 C
ATOM 165 CB ILE A 56 -0.847 95.18 88.169 1.00 64.42 C
ATOM 166 CG1 ILE A 56 -1.391 94.639 9.500 1.00 65.47 C
ATOM 167 CD1 ILE A 56 -2.240 95.670 10.281 1.00 66.61 C
ATOM 168 CG2 ILE A 56 1.969 95.273 7.149 1.00 65.46 C
ATOM 169 C ILE A 56 0.759 94.780 6.267 1.00 65.56 C
ATOM 170 O ILE A 56 1.422 95.805 6.155 1.00 65.96 O
ATOM 171 N ARG A 57 0.419 94.017 5.233 1.00 67.26 N
ATOM 172 CA ARG A 57 0.731 94.386 3.858 1.00 68.96 C
ATOM 173 CB ARG A 57 0.628 93.161 2.946 1.00 68.74 C
ATOM 174 CG ARG A 57 1.139 93.361 1.520 1.00 68.49 C
ATOM 175 CD ARG A 57 0.433 92.424 0.532 1.00 68.56 C
ATOM 176 NE ARG A 57 1.266 91.272 0.179 1.00 68.20 N
ATOM 177 CZ ARG A 57 0.777 90.086 -0.208 1.00 68.80 C
ATOM 178 NH1 ARG A 57 -0.551 89.870 -0.291 1.00 69.12 N
ATOM 179 NH2 ARG A 57 1.616 89.106 -0.517 1.00 69.04 N
ATOM 180 C ARG A 57 -0.259 95.448 3.422 1.00 70.41 C
ATOM 181 O ARG A 57 -1.430 95.146 3.171 1.00 70.64 O
ATOM 182 N VAL A 58 0.218 96.691 3.345 1.00 72.30 N
ATOM 183 CA VAL A 58 -0.626 97.844 2.998 1.00 73.91 C
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ATOM 186 CG2 VAL A 58 0.924 99.394 4.297 1.00 73.45 C
ATOM 187 C VAL A 58 -1.348 97.602 1.666 1.00 74.98 C
ATOM 188 O VAL A 58 -2.468 98.081 1.465 1.00 75.68 O
ATOM 189 N SER A 59 -0.710 96.822 0.788 1.00 75.93 N
ATOM 190 CA SER A 59 -1.268 96.456 -0.521 1.00 76.51 C
ATOM 191 CB SER A 59 -0.255 95.617 -1.320 1.00 76.86 C
ATOM 192 OG SER A 59 1.103 96.061 -1.049 1.00 78.49 O
ATOM 193 C SER A 59 -2.617 95.721 -0.460 1.00 76.40 C
ATOM 194 O SER A 59 -3.382 95.775 -1.422 1.00 76.81 O
ATOM 195 N ASP A 60 -2.902 95.026 0.645 1.00 75.89 N
ATOM 196 CA ASP A 60 -4.174 94.299 0.790 1.00 75.35 C
ATOM 197 CB ASP A 60 -4.230 93.077 -0.148 1.00 75.67 C
ATOM 198 CG ASP A 60 -3.124 92.064 0.126 1.00 76.95 C
ATOM 199 OD1 ASP A 60 -2.835 91.788 1.307 1.00 78.19 O
ATOM 200 OD2 ASP A 60 -2.488 91.483 -0.788 1.00 77.92 O
ATOM 201 C ASP A 60 -4.543 93.872 2.217 1.00 74.33 C
ATOM 202 O ASP A 60 -5.339 92.947 2.398 1.00 74.34 O
ATOM 203 N ASN A 61 -3.965 94.541 3.215 1.00 72.99 N
ATOM 204 CA ASN A 61 -4.194 94.219 4.633 1.00 71.45 C
ATOM 205 CB ASN A 61 -5.599 94.651 5.074 1.00 72.10 C
ATOM 206 CG ASN A 61 -5.790 96.158 5.026 1.00 73.42 C
ATOM 207 OD1 ASN A 61 -5.333 96.885 5.926 1.00 74.58 O
ATOM 208 ND2 ASN A 61 -6.471 96.636 3.975 1.00 74.28 N
ATOM 209 C ASN A 61 -3.928 92.759 5.035 1.00 69.65 C
ATOM 210 O ASN A 61 -4.535 92.242 5.975 1.00 69.76 O
ATOM 211 N LEU A 62 -3.020 92.098 4.323 1.00 67.18 N
ATOM 212 CA LEU A 62 -2.623 90.738 4.680 1.00 64.33 C
ATOM 213 CB LEU A 62 -1.901 90.057 3.518 1.00 64.74 C
ATOM 214 CG LEU A 62 -1.291 88.685 3.821 1.00 65.22 C
ATOM 215 CD1 LEU A 62 -2.383 87.635 4.009 1.00 65.88 C
ATOM 216 CD2 LEU A 62 -0.325 88.264 2.725 1.00 65.33 C
ATOM 217 C LEU A 62 -1.698 90.766 5.883 1.00 61.89 C
ATOM 218 O LEU A 62 -0.682 91.453 5.863 1.00 61.51 O
ATOM 219 N PRO A 63 -2.044 90.010 6.920 1.00 59.57 N
ATOM 220 CA PRO A 63 -1.164 89.840 8.083 1.00 57.75 C
ATOM 221 CB PRO A 63 -1.963 88.888 8.983 1.00 57.73 C
ATOM 222 CG PRO A 63 -3.376 89.106 8.573 1.00 58.58 C
ATOM 223 CD PRO A 63 -3.303 89.261 7.080 1.00 59.38 C
ATOM 224 C PRO A 63 0.180 89.221 7.694 1.00 55.60 C
ATOM 225 O PRO A 63 0.211 88.163 7.075 1.00 55.56 O
ATOM 226 N VAL A 64 1.274 89.902 8.025 1.00 53.21 N
ATOM 227 CA VAL A 64 2.609 89.375 7.773 1.00 50.67 C
ATOM 228 CB VAL A 64 3.306 90.097 6.590 1.00 50.93 C
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ATOM 231 C VAL A 64 3.492 89.445 9.025 1.00 49.15 C
ATOM 232 O VAL A 64 3.175 90.150 9.981 1.00 49.44 O
ATOM 233 N ALA A 65 4.587 88.692 9.015 1.00 46.68 N
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ATOM 235 CB ALA A 65 5.881 87.384 10.654 1.00 45.04 C
ATOM 236 C ALA A 65 6.834 89.315 9.356 1.00 43.92 C
ATOM 237 O ALA A 65 7.123 88.912 8.218 1.00 43.40 O
ATOM 238 N ILE A 66 7.547 90.233 10.012 1.00 42.88 N
ATOM 239 CA ILE A 66 8.716 90.883 9.405 1.00 42.53 C
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ATOM 243 CG2 ILE A 66 9.704 93.067 8.636 1.00 42.39 C
ATOM 244 C ILE A 66 9.958 90.572 10.214 1.00 42.61 C
ATOM 245 O ILE A 66 10.119 91.057 11.342 1.00 41.89 O
ATOM 246 N LYS A 67 10.820 89.731 9.641 1.00 41.21 N
ATOM 247 CA LYS A 67 11.971 89.193 10.353 1.00 41.66 C
ATOM 248 CB LYS A 67 12.052 87.664 10.164 1.00 41.05 C
ATOM 249 CG LYS A 67 13.288 87.013 10.761 1.00 42.61 C
ATOM 250 CD LYS A 67 13.165 85.495 10.666 1.00 44.83 C
ATOM 251 CE LYS A 67 14.213 84.780 11.488 1.00 46.29 C
ATOM 252 NZ LYS A 67 14.165 83.309 11.228 1.00 46.83 N
ATOM 253 C LYS A 67 13.243 89.833 9.867 1.00 41.57 C
ATOM 254 O LYS A 67 13.548 89.773 8.671 1.00 40.97 O
ATOM 255 N HIS A 68 13.988 90.415 10.807 1.00 41.97 N
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ATOM 259 ND1 HIS A 68 13.018 93.384 11.203 1.00 43.58 N
ATOM 260 CE1 HIS A 68 12.376 94.393 10.640 1.00 41.67 C
ATOM 261 NE2 HIS A 68 13.247 95.100 9.942 1.00 41.02 N
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ATOM 263 C HIS A 68 16.408 90.217 10.960 1.00 45.01 C
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ATOM 268 CG1 VAL A 69 19.738 87.093 9.675 1.00 50.89 C
ATOM 269 CG2 VAL A 69 17.266 87.146 9.529 1.00 49.70 C
ATOM 270 C VAL A 69 19.746 90.103 10.038 1.00 51.36 C
ATOM 271 O VAL A 69 19.879 90.721 8.983 1.00 50.89 O
ATOM 272 N GLU A 70 20.634 90.162 11.026 1.00 53.97 N
ATOM 273 CA GLU A 70 21.870 90.924 10.896 1.00 57.27 C
ATOM 274 CB GLU A 70 22.480 91.219 12.272 1.00 57.98 C
ATOM 275 CG GLU A 70 21.674 92.205 13.105 1.00 61.81 C
ATOM 276 CD GLU A 70 22.524 93.240 13.839 1.00 66.09 C
ATOM 277 OE1 GLU A 70 21.982 93.928 14.744 1.00 67.00 O
ATOM 278 OE2 GLU A 70 23.729 93.377 13.518 1.00 68.05 O
ATOM 279 C GLU A 70 22.861 90.148 10.057 1.00 58.15 C
ATOM 280 O GLU A 70 23.115 88.977 10.332 1.00 57.86 O
ATOM 281 N LYS A 71 23.420 90.807 9.041 1.00 60.40 N
ATOM 282 CA LYS A 71 24.433 90.193 8.174 1.00 62.67 C
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ATOM 284 CG LYS A 71 23.999 91.544 6.056 1.00 63.22 C
ATOM 285 CD LYS A 71 24.634 92.387 4.973 1.00 64.60 C
ATOM 286 CE LYS A 71 23.644 92.635 3.848 1.00 65.13 C
ATOM 287 NZ LYS A 71 24.159 93.586 2.831 1.00 66.01 N
ATOM 288 C LYS A 71 25.567 89.589 8.987 1.00 64.37 C
ATOM 289 O LYS A 71 25.990 88.462 8.737 1.00 64.24 O
ATOM 290 N ASP A 72 26.029 90.336 9.986 1.00 67.27 N
ATOM 291 CA ASP A 72 27.153 89.928 10.820 1.00 70.03 C
ATOM 292 CB ASP A 72 27.483 91.037 11.814 1.00 70.83 C
ATOM 293 CG ASP A 72 28.294 92.162 11.177 1.00 73.07 C
ATOM 294 OD1 ASP A 72 27.828 92.764 10.174 1.00 75.44 O
ATOM 295 OD2 ASP A 72 29.412 92.511 11.611 1.00 74.89 O
ATOM 296 C ASP A 72 26.923 88.614 11.551 1.00 71.40 C
ATOM 297 O ASP A 72 27.875 87.895 11.851 1.00 71.59 O
ATOM 298 N ARG A 73 25.658 88.287 11.805 1.00 73.23 N
ATOM 299 CA ARG A 73 25.304 87.068 12.540 1.00 74.86 C
ATOM 300 CB ARG A 73 24.241 87.380 13.602 1.00 75.53 C
ATOM 301 CG ARG A 73 24.741 88.293 14.718 1.00 79.03 C
ATOM 302 CD ARG A 73 23.959 88.151 16.043 1.00 84.58 C
ATOM 303 NE ARG A 73 23.692 86.752 16.394 1.00 88.34 N
ATOM 304 CZ ARG A 73 24.598 85.901 16.878 1.00 89.85 C
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ATOM 307 C ARG A 73 24.839 85.929 11.630 1.00 75.02 C
ATOM 308 O ARG A 73 24.067 85.067 12.054 1.00 75.13 O
ATOM 309 N ILE A 74 25.321 85.926 10.386 1.00 75.26 N
ATOM 310 CA ILE A 74 24.969 84.885 9.420 1.00 75.36 C
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ATOM 312 CG1 ILE A 74 23.188 86.425 8.465 1.00 74.84 C
ATOM 313 CD1 ILE A 74 22.660 87.204 7.280 1.00 75.37 C
ATOM 314 CG2 ILE A 74 23.893 84.408 7.166 1.00 74.86 C
ATOM 315 C ILE A 74 26.189 84.022 9.088 1.00 75.92 C
ATOM 316 O ILE A 74 27.201 84.519 8.578 1.00 76.08 O
ATOM 317 N SER A 75 26.090 82.730 9.386 1.00 76.26 N
ATOM 318 CA SER A 75 27.155 81.784 9.072 1.00 76.63 C
ATOM 319 CB SER A 75 27.184 80.641 10.094 1.00 77.05 C
ATOM 320 OG SER A 75 26.007 79.839 10.009 1.00 78.24 O
ATOM 321 C SER A 75 26.990 81.226 7.660 1.00 76.35 C
ATOM 322 O SER A 75 27.918 81.285 6.855 1.00 76.40 O
ATOM 323 N ASP A 76 25.798 80.703 7.372 1.00 75.95 N
ATOM 324 CA ASP A 76 25.512 80.025 6.109 1.00 75.64 C
ATOM 325 CB ASP A 76 24.528 78.875 6.332 1.00 76.36 C
ATOM 326 CG ASP A 76 25.112 77.756 7.157 1.00 78.38 C
ATOM 327 OD1 ASP A 76 25.828 76.906 6.579 1.00 80.43 O
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ATOM 329 C ASP A 76 24.948 80.952 5.043 1.00 74.58 C
ATOM 330 O ASP A 76 23.946 81.635 5.262 1.00 74.37 O
ATOM 331 N TRP A 77 25.592 80.945 3.879 1.00 73.73 N
ATOM 332 CA TRP A 77 25.148 81.728 2.730 1.00 72.88 C
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ATOM 345 N GLY A 78 24.127 81.159 0.610 1.00 74.27 N
ATOM 346 CA GLY A 78 23.959 80.407 -0.623 1.00 75.77 C
ATOM 347 C GLY A 78 23.491 81.313 -1.740 1.00 77.06 C
ATOM 348 O GLY A 78 23.426 82.534 -1.567 1.00 77.12 O
ATOM 349 N GLU A 79 23.157 80.725 -2.887 1.00 78.52 N
ATOM 350 CA GLU A 79 22.685 81.517 -4.022 1.00 80.32 C
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ATOM 352 CG GLU A 79 24.083 80.152 -5.723 1.00 83.43 C
ATOM 353 CD GLU A 79 24.713 80.234 -7.108 1.00 85.86 C
ATOM 354 OE1 GLU A 79 25.813 80.822 -7.235 1.00 86.43 O
ATOM 355 OE2 GLU A 79 24.107 79.708 -8.071 1.00 86.75 O
ATOM 356 C GLU A 79 21.311 81.091 -4.518 1.00 80.80 C
ATOM 357 O GLU A 79 20.948 79.917 -4.453 1.00 80.46 O
ATOM 358 N LEU A 80 20.558 82.069 -5.012 1.00 81.81 N
ATOM 359 CA LEU A 80 19.233 81.837 -5.582 1.00 82.81 C
ATOM 360 CB LEU A 80 18.441 83.152 -5.596 1.00 82.78 C
ATOM 361 CG LEU A 80 18.289 83.870 -4.254 1.00 83.30 C
ATOM 362 CD1 LEU A 80 17.545 85.189 -4.432 1.00 83.40 C
ATOM 363 CD2 LEU A 80 17.588 82.965 -3.238 1.00 83.57 C
ATOM 364 C LEU A 80 19.343 81.256 -6.998 1.00 83.29 C
ATOM 365 O LEU A 80 20.440 81.256 -7.570 1.00 83.54 O
ATOM 366 N PRO A 81 18.235 80.753 -7.567 1.00 83.78 N
ATOM 367 CA PRO A 81 18.221 80.340 -8.986 1.00 83.97 C
ATOM 368 CB PRO A 81 16.758 79.937 -9.218 1.00 83.94 C
ATOM 369 CG PRO A 81 16.267 79.535 -7.871 1.00 84.00 C
ATOM 370 CD PRO A 81 16.927 80.513 -6.923 1.00 83.86 C
ATOM 371 C PRO A 81 18.623 81.488 -9.926 1.00 84.09 C
ATOM 372 O PRO A 81 18.910 81.267 -11.102 1.00 84.07 O
ATOM 373 N ASN A 82 18.644 82.700 -9.376 1.00 84.20 N
ATOM 374 CA ASN A 82 19.070 83.916 -10.064 1.00 83.96 C
ATOM 375 CB ASN A 82 18.276 85.106 -9.492 1.00 84.25 C
ATOM 376 CG ASN A 82 18.738 86.449 -10.026 1.00 85.14 C
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ATOM 378 ND2 ASN A 82 18.979 87.393 -9.115 1.00 84.89 N
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ATOM 539 C ILE A 104 5.961 79.925 5.622 1.00 42.85 C
ATOM 540 O ILE A 104 7.184 79.743 5.536 1.00 41.68 O
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ATOM 547 CZ ARG A 105 2.156 79.818 -0.763 1.00 68.07 C
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ATOM 550 C ARG A 105 6.464 82.255 3.412 1.00 43.35 C
ATOM 551 O ARG A 105 5.955 83.180 4.045 1.00 40.91 O
ATOM 552 N LEU A 106 7.597 82.359 2.722 1.00 42.75 N
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ATOM 555 CG LEU A 106 10.653 84.564 1.905 1.00 42.45 C
ATOM 556 CD1 LEU A 106 10.906 85.341 3.204 1.00 40.95 C
ATOM 557 CD2 LEU A 106 11.993 84.148 1.293 1.00 40.34 C
ATOM 558 C LEU A 106 7.601 84.394 1.350 1.00 44.07 C
ATOM 559 O LEU A 106 7.620 83.960 0.206 1.00 44.25 O
ATOM 560 N LEU A 107 6.979 85.521 1.683 1.00 44.63 N
ATOM 561 CA LEU A 107 6.241 86.316 0.712 1.00 45.98 C
ATOM 562 CB LEU A 107 5.123 87.107 1.401 1.00 46.13 C
ATOM 563 CG LEU A 107 4.143 86.246 2.202 1.00 46.97 C
ATOM 564 CD1 LEU A 107 3.237 87.069 3.085 1.00 47.43 C
ATOM 565 CD2 LEU A 107 3.330 85.376 1.239 1.00 49.67 C
ATOM 566 C LEU A 107 7.145 87.267 -0.066 1.00 46.90 C
ATOM 567 O LEU A 107 6.793 87.686 -1.177 1.00 46.82 O
ATOM 568 N ASP A 108 8.302 87.601 0.511 1.00 47.11 N
ATOM 569 CA ASP A 108 9.241 88.537 -0.108 1.00 47.79 C
ATOM 570 CB ASP A 108 8.543 89.875 -0.430 1.00 47.83 C
ATOM 571 CG ASP A 108 9.311 90.725 -1.464 1.00 50.15 C
ATOM 572 OD1 ASP A 108 10.299 90.251 -2.085 1.00 50.90 O
ATOM 573 OD2 ASP A 108 8.978 91.903 -1.710 1.00 52.00 O
ATOM 574 C ASP A 108 10.392 88.791 0.841 1.00 48.02 C
ATOM 575 O ASP A 108 10.319 88.447 2.025 1.00 46.97 O
ATOM 576 N TRP A 109 11.453 89.399 0.318 1.00 48.18 N
ATOM 577 CA TRP A 109 12.613 89.748 1.114 1.00 48.85 C
ATOM 578 CB TRP A 109 13.598 88.588 1.170 1.00 48.93 C
ATOM 579 CG TRP A 109 14.148 88.237 -0.171 1.00 51.68 C
ATOM 580 CD1 TRP A 109 13.543 87.478 -1.137 1.00 52.64 C
ATOM 581 NE1 TRP A 109 14.354 87.383 -2.244 1.00 54.00 N
ATOM 582 CE2 TRP A 109 15.509 88.084 -2.013 1.00 54.40 C
ATOM 583 CD2 TRP A 109 15.407 88.645 -0.715 1.00 53.99 C
ATOM 584 CE3 TRP A 109 16.470 89.423 -0.236 1.00 55.22 C
ATOM 585 CZ3 TRP A 109 17.577 89.625 -1.056 1.00 56.91 C
ATOM 586 CH2 TRP A 109 17.641 89.061 -2.348 1.00 57.27 C
ATOM 587 CZ2 TRP A 109 16.621 88.288 -2.839 1.00 55.31 C
ATOM 588 C TRP A 109 13.302 90.989 0.555 1.00 49.39 C
ATOM 589 O TRP A 109 13.160 91.316 -0.638 1.00 49.52 O
ATOM 590 N PHE A 110 14.043 91.672 1.425 1.00 49.52 N
ATOM 591 CA PHE A 110 14.737 92.912 1.077 1.00 50.21 C
ATOM 592 CB PHE A 110 14.005 94.130 1.649 1.00 49.95 C
ATOM 593 CG PHE A 110 12.583 94.259 1.182 1.00 51.89 C
ATOM 594 CD1 PHE A 110 12.268 95.026 0.061 1.00 53.85 C
ATOM 595 CE1 PHE A 110 10.950 95.139 -0.376 1.00 54.01 C
ATOM 596 CZ PHE A 110 9.941 94.477 0.310 1.00 54.23 C
ATOM 597 CE2 PHE A 110 10.249 93.710 1.426 1.00 53.04 C
ATOM 598 CD2 PHE A 110 11.559 93.611 1.855 1.00 52.18 C
ATOM 599 C PHE A 110 16.126 92.848 1.657 1.00 50.39 C
ATOM 600 O PHE A 110 16.331 92.251 2.711 1.00 49.25 O
ATOM 601 N GLU A 111 17.087 93.452 0.966 1.00 51.10 N
ATOM 602 CA GLU A 111 18.440 93.541 1.494 1.00 52.22 C
ATOM 603 CB GLU A 111 19.450 93.076 0.457 1.00 52.56 C
ATOM 604 CG GLU A 111 20.896 93.340 0.835 1.00 54.50 C
ATOM 605 CD GLU A 111 21.857 92.662 -0.109 1.00 57.61 C
ATOM 606 OE1 GLU A 111 21.513 92.561 -1.309 1.00 60.12 O
ATOM 607 OE2 GLU A 111 22.937 92.211 0.348 1.00 59.23 O
ATOM 608 C GLU A 111 18.751 94.974 1.938 1.00 52.56 C
ATOM 609 O GLU A 111 18.340 95.943 1.290 1.00 53.03 O
ATOM 610 N ARG A 112 19.470 95.084 3.050 1.00 52.37 N
ATOM 611 CA ARG A 112 19.880 96.362 3.605 1.00 52.15 C
ATOM 612 CB ARG A 112 19.204 96.601 4.957 1.00 51.55 C
ATOM 613 CG ARG A 112 17.795 97.170 4.862 1.00 50.03 C
ATOM 614 CD ARG A 112 17.101 97.229 6.225 1.00 49.06 C
ATOM 615 NE ARG A 112 15.825 97.939 6.172 1.00 47.63 N
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ATOM 617 NH1 ARG A 112 15.379 97.664 8.420 1.00 47.11 N
ATOM 618 NH2 ARG A 112 13.895 98.797 7.078 1.00 48.44 N
ATOM 619 C ARG A 112 21.380 96.312 3.789 1.00 52.90 C
ATOM 620 O ARG A 112 21.972 95.227 3.727 1.00 52.95 O
ATOM 621 N PRO A 113 22.008 97.466 4.027 1.00 53.80 N
ATOM 622 CA PRO A 113 23.463 97.519 4.222 1.00 53.98 C
ATOM 623 CB PRO A 113 23.696 98.958 4.718 1.00 54.67 C
ATOM 624 CG PRO A 113 22.595 99.746 4.065 1.00 54.14 C
ATOM 625 CD PRO A 113 21.396 98.811 4.112 1.00 54.32 C
ATOM 626 C PRO A 113 23.998 96.489 5.220 1.00 54.07 C
ATOM 627 O PRO A 113 24.980 95.812 4.914 1.00 54.49 O
ATOM 628 N ASP A 114 23.373 96.342 6.382 1.00 54.16 N
ATOM 629 CA ASP A 114 23.903 95.378 7.346 1.00 54.11 C
ATOM 630 CB ASP A 114 24.430 96.112 8.575 1.00 55.71 C
ATOM 631 CG ASP A 114 25.631 96.989 8.245 1.00 58.46 C
ATOM 632 OD1 ASP A 114 25.423 98.057 7.607 1.00 61.78 O
ATOM 633 OD2 ASP A 114 26.805 96.681 8.573 1.00 60.03 O
ATOM 634 C ASP A 114 22.937 94.269 7.755 1.00 52.78 C
ATOM 635 O ASP A 114 23.188 93.548 8.727 1.00 53.03 O
ATOM 636 N SER A 115 21.852 94.111 6.999 1.00 50.98 N
ATOM 637 CA SER A 115 20.856 93.105 7.331 1.00 48.41 C
ATOM 638 CB SER A 115 19.960 93.649 8.439 1.00 48.04 C
ATOM 639 OG SER A 115 18.997 94.528 7.893 1.00 45.84 O
ATOM 640 C SER A 115 19.978 92.666 6.155 1.00 47.32 C
ATOM 641 O SER A 115 19.987 93.285 5.096 1.00 46.92 O
ATOM 642 N PHE A 116 19.198 91.609 6.381 1.00 45.66 N
ATOM 643 CA PHE A 116 18.171 91.174 5.446 1.00 44.29 C
ATOM 644 CB PHE A 116 18.457 89.746 4.994 1.00 44.76 C
ATOM 645 CG PHE A 116 19.567 89.632 3.980 1.00 45.24 C
ATOM 646 CD1 PHE A 116 20.892 89.484 4.385 1.00 45.34 C
ATOM 647 CE1 PHE A 116 21.915 89.360 3.447 1.00 47.24 C
ATOM 648 CZ PHE A 116 21.614 89.387 2.077 1.00 46.18 C
ATOM 649 CE2 PHE A 116 20.291 89.531 1.661 1.00 48.08 C
ATOM 650 CD2 PHE A 116 19.275 89.646 2.615 1.00 47.94 C
ATOM 651 C PHE A 116 16.824 91.238 6.141 1.00 43.43 C
ATOM 652 O PHE A 116 16.721 90.945 7.333 1.00 42.72 O
ATOM 653 N VAL A 117 15.797 91.641 5.411 1.00 42.24 N
ATOM 654 CA VAL A 117 14.450 91.681 5.945 1.00 41.74 C
ATOM 655 CB VAL A 117 13.837 93.087 5.818 1.00 41.89 C
ATOM 656 CG1 VAL A 117 12.473 93.136 6.447 1.00 41.40 C
ATOM 657 CG2 VAL A 117 14.753 94.122 6.451 1.00 42.52 C
ATOM 658 C VAL A 117 13.578 90.652 5.209 1.00 41.80 C
ATOM 659 O VAL A 117 13.507 90.660 3.974 1.00 40.77 O
ATOM 660 N LEU A 118 12.934 89.765 5.974 1.00 41.04 N
ATOM 661 CA LEU A 118 12.094 88.693 5.410 1.00 40.22 C
ATOM 662 CB LEU A 118 12.520 87.337 5.977 1.00 39.98 C
ATOM 663 CG LEU A 118 13.795 86.695 5.423 1.00 40.10 C
ATOM 664 CD1 LEU A 118 15.014 87.562 5.619 1.00 42.56 C
ATOM 665 CD2 LEU A 118 14.032 85.325 6.063 1.00 39.40 C
ATOM 666 C LEU A 118 10.635 88.939 5.720 1.00 40.25 C
ATOM 667 O LEU A 118 10.275 89.223 6.861 1.00 39.35 O
ATOM 668 N ILE A 119 9.795 88.842 4.700 1.00 39.45 N
ATOM 669 CA ILE A 119 8.370 89.028 4.876 1.00 40.37 C
ATOM 670 CB ILE A 119 7.774 89.921 3.756 1.00 40.19 C
ATOM 671 CG1 ILE A 119 8.555 91.248 3.612 1.00 41.49 C
ATOM 672 CD1 ILE A 119 8.540 92.131 4.855 1.00 40.16 C
ATOM 673 CG2 ILE A 119 6.296 90.136 3.989 1.00 39.40 C
ATOM 674 C ILE A 119 7.748 87.638 4.823 1.00 41.09 C
ATOM 675 O ILE A 119 7.793 86.966 3.788 1.00 40.59 O
ATOM 676 N LEU A 120 7.167 87.222 5.939 1.00 41.43 N
ATOM 677 CA LEU A 120 6.634 85.872 6.076 1.00 42.78 C
ATOM 678 CB LEU A 120 7.355 85.144 7.216 1.00 41.61 C
ATOM 679 CG LEU A 120 8.868 85.010 7.046 1.00 40.99 C
ATOM 680 CD1 LEU A 120 9.558 84.928 8.402 1.00 43.47 C
ATOM 681 CD2 LEU A 120 9.234 83.785 6.187 1.00 42.48 C
ATOM 682 C LEU A 120 5.138 85.922 6.330 1.00 44.08 C
ATOM 683 O LEU A 120 4.604 86.963 6.715 1.00 44.77 O
ATOM 684 N GLU A 121 4.449 84.808 6.109 1.00 45.28 N
ATOM 685 CA GLU A 121 3.026 84.738 6.436 1.00 47.09 C
ATOM 686 CB GLU A 121 2.430 83.409 5.985 1.00 47.99 C
ATOM 687 CG GLU A 121 2.534 83.123 4.497 1.00 49.97 C
ATOM 688 CD GLU A 121 1.959 81.759 4.170 1.00 53.32 C
ATOM 689 OE1 GLU A 121 0.911 81.714 3.506 1.00 55.61 O
ATOM 690 OE2 GLU A 121 2.548 80.735 4.586 1.00 52.97 O
ATOM 691 C GLU A 121 2.841 84.862 7.938 1.00 47.78 C
ATOM 692 O GLU A 121 3.753 84.550 8.711 1.00 47.35 O
ATOM 693 N ARG A 122 1.670 85.326 8.351 1.00 48.92 N
ATOM 694 CA ARG A 122 1.369 85.439 9.766 1.00 50.98 C
ATOM 695 CB ARG A 122 1.555 86.883 10.257 1.00 50.78 C
ATOM 696 CG ARG A 122 1.196 87.085 11.730 1.00 51.57 C
ATOM 697 CD ARG A 122 1.716 88.383 12.349 1.00 51.63 C
ATOM 698 NE ARG A 122 1.119 89.578 11.744 1.00 52.11 N
ATOM 699 CZ ARG A 122 -0.133 89.977 11.951 1.00 51.61 C
ATOM 700 NH1 ARG A 122 -0.937 89.274 12.741 1.00 51.42 N
ATOM 701 NH2 ARG A 122 -0.588 91.070 11.354 1.00 50.64 N
ATOM 702 C ARG A 122 -0.054 84.965 10.017 1.00 52.37 C
ATOM 703 O ARG A 122 -1.005 85.749 9.922 1.00 52.94 O
ATOM 704 N PRO A 123 -0.211 83.682 10.328 1.00 53.57 N
ATOM 705 CA PRO A 123 -1.529 83.141 10.672 1.00 54.00 C
ATOM 706 CB PRO A 123 -1.227 81.669 10.973 1.00 54.39 C
ATOM 707 CG PRO A 123 0.057 81.394 10.250 1.00 54.18 C
ATOM 708 CD PRO A 123 0.845 82.652 10.398 1.00 53.87 C
ATOM 709 C PRO A 123 -2.012 83.835 11.928 1.00 54.39 C
ATOM 710 O PRO A 123 -1.172 84.333 12.676 1.00 54.50 O
ATOM 711 N GLU A 124 -3.322 83.862 12.164 1.00 54.85 N
ATOM 712 CA GLU A 124 -3.859 84.533 13.348 1.00 55.63 C
ATOM 713 CB GLU A 124 -3.870 86.046 13.089 1.00 56.97 C
ATOM 714 CG GLU A 124 -3.856 86.946 14.335 1.00 62.93 C
ATOM 715 CD GLU A 124 -4.020 88.417 13.933 1.00 69.90 C
ATOM 716 OE1 GLU A 124 -4.962 88.742 13.153 1.00 72.13 O
ATOM 717 OE2 GLU A 124 -3.195 89.256 14.385 1.00 71.98 O
ATOM 718 C GLU A 124 -5.270 84.018 13.671 1.00 53.97 C
ATOM 719 O GLU A 124 -6.093 83.910 12.764 1.00 54.52 O
ATOM 720 N PRO A 125 -5.563 83.673 14.930 1.00 52.32 N
ATOM 721 CA PRO A 125 -4.601 83.673 16.040 1.00 51.14 C
ATOM 722 CB PRO A 125 -5.504 83.553 17.275 1.00 51.19 C
ATOM 723 CG PRO A 125 -6.689 82.766 16.783 1.00 50.94 C
ATOM 724 CD PRO A 125 -6.906 83.255 15.374 1.00 51.87 C
ATOM 725 C PRO A 125 -3.694 82.453 15.970 1.00 50.27 C
ATOM 726 O PRO A 125 -4.057 81.436 15.379 1.00 49.98 O
ATOM 727 N VAL A 126 -2.526 82.562 16.588 1.00 49.17 N
ATOM 728 CA VAL A 126 -1.525 81.526 16.500 1.00 48.07 C
ATOM 729 CB VAL A 126 -0.508 81.866 15.373 1.00 48.55 C
ATOM 730 CG1 VAL A 126 0.307 83.104 15.726 1.00 49.90 C
ATOM 731 CG2 VAL A 126 0.400 80.711 15.096 1.00 50.31 C
ATOM 732 C VAL A 126 -0.848 81.346 17.855 1.00 46.31 C
ATOM 733 O VAL A 126 -0.787 82.290 18.644 1.00 46.40 O
ATOM 734 N GLN A 127 -0.360 80.129 18.117 1.00 43.89 N
ATOM 735 CA GLN A 127 0.495 79.825 19.270 1.00 41.91 C
ATOM 736 CB GLN A 127 -0.356 79.311 20.438 1.00 41.96 C
ATOM 737 CG GLN A 127 0.414 79.085 21.751 1.00 41.25 C
ATOM 738 CD GLN A 127 -0.498 78.618 22.880 1.00 41.99 C
ATOM 739 OE1 GLN A 127 -1.346 77.744 22.688 1.00 41.61 O
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ATOM 758 O LEU A 129 3.730 73.565 22.403 1.00 34.94 O
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ATOM 763 CD1 PHE A 130 7.678 76.621 25.251 1.00 45.52 C
ATOM 764 CE1 PHE A 130 8.349 76.680 26.489 1.00 46.12 C
ATOM 765 CZ PHE A 130 9.404 75.807 26.747 1.00 46.89 C
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ATOM 768 C PHE A 130 5.099 75.492 23.989 1.00 39.51 C
ATOM 769 O PHE A 130 4.849 74.931 25.064 1.00 38.80 O
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ATOM 772 CB ASP A 131 3.418 78.805 24.088 1.00 43.13 C
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ATOM 774 OD1 ASP A 131 5.574 79.431 24.874 1.00 47.95 O
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ATOM 776 C ASP A 131 2.433 76.642 24.771 1.00 42.09 C
ATOM 777 O ASP A 131 1.888 76.600 25.877 1.00 42.20 O
ATOM 778 N PHE A 132 1.972 76.001 23.696 1.00 41.67 N
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ATOM 783 CE1 PHE A 132 -3.251 73.965 22.053 1.00 41.37 C
ATOM 784 CZ PHE A 132 -3.297 72.581 22.062 1.00 41.96 C
ATOM 785 CE2 PHE A 132 -2.123 71.855 22.173 1.00 40.31 C
ATOM 786 CD2 PHE A 132 -0.910 72.524 22.281 1.00 42.21 C
ATOM 787 C PHE A 132 0.902 74.058 24.760 1.00 42.73 C
ATOM 788 O PHE A 132 -0.006 73.809 25.570 1.00 42.57 O
ATOM 789 N ILE A 133 2.040 73.369 24.718 1.00 42.81 N
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ATOM 794 CG2 ILE A 133 4.026 70.461 26.249 1.00 42.29 C
ATOM 795 C ILE A 133 2.514 72.780 27.054 1.00 46.10 C
ATOM 796 O ILE A 133 2.046 72.191 28.023 1.00 46.11 O
ATOM 797 N THR A 134 3.231 73.894 27.162 1.00 48.42 N
ATOM 798 CA THR A 134 3.487 74.529 28.453 1.00 51.23 C
ATOM 799 CB THR A 134 4.314 75.805 28.261 1.00 51.04 C
ATOM 800 OG1 THE A 134 5.695 75.440 28.115 1.00 52.55 O
ATOM 801 CG2 THR A 134 4.293 76.695 29.524 1.00 53.00 C
ATOM 802 C THR A 134 2.179 74.851 29.159 1.00 52.34 C
ATOM 803 O THR A 134 2.069 74.673 30.365 1.00 53.35 O
ATOM 804 N GLU A 135 1.188 75.303 28.400 1.00 53.42 N
ATOM 805 CA GLU A 135 -0.110 75.662 28.959 1.00 54.43 C
ATOM 806 CB GLU A 135 -0.840 76.644 28.038 1.00 55.03 C
ATOM 807 CG GLU A 135 -0.137 78.004 27.941 1.00 59.01 C
ATOM 808 CD GLU A 135 -0.981 79.054 27.234 1.00 62.58 C
ATOM 809 OE1 GLU A 135 -1.942 78.685 26.505 1.00 64.20 O
ATOM 810 OE2 GLU A 135 -0.675 80.254 27.412 1.00 63.63 O
ATOM 811 C GLU A 135 -1.009 74.468 29.215 1.00 53.96 C
ATOM 812 O GLU A 135 -1.743 74.440 30.206 1.00 54.61 O
ATOM 813 N ARG A 136 -0.975 73.490 28.318 1.00 52.83 N
ATOM 814 CA ARG A 136 -1.947 72.404 28.385 1.00 51.61 C
ATOM 815 CB ARG A 136 -2.646 72.261 27.036 1.00 52.42 C
ATOM 816 CG ARG A 136 -3.486 73.503 26.736 1.00 55.25 C
ATOM 817 CD ARG A 136 -4.130 73.538 25.378 1.00 58.99 C
ATOM 818 NE ARG A 136 -4.990 72.381 25.145 1.00 60.79 N
ATOM 819 CZ ARG A 136 -6.072 72.415 24.379 1.00 61.01 C
ATOM 820 NH1 ARG A 136 -6.425 73.559 23.777 1.00 60.57 N
ATOM 821 NH2 ARG A 136 -6.793 71.310 24.207 1.00 60.45 N
ATOM 822 C ARG A 136 -1.376 71.086 28.887 1.00 50.04 C
ATOM 823 O ARG A 136 -2.116 70.144 29.119 1.00 50.37 O
ATOM 824 N GLY A 137 -0.062 71.033 29.081 1.00 48.53 N
ATOM 825 CA GLY A 137 0.597 69.799 29.477 1.00 46.78 C
ATOM 826 C GLY A 137 0.532 68.744 28.381 1.00 44.89 C
ATOM 827 O GLY A 137 0.183 69.046 27.232 1.00 45.03 O
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ATOM 829 CA ALA A 138 0.841 66.374 27.833 1.00 41.43 C
ATOM 830 CB ALA A 138 1.023 65.083 28.602 1.00 41.46 C
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ATOM 832 O ALA A 138 -1.533 66.476 27.491 1.00 40.85 O
ATOM 833 N LEU A 139 -0.274 66.108 25.693 1.00 38.87 N
ATOM 834 CA LEU A 139 -1.415 66.107 24.794 1.00 37.16 C
ATOM 835 CB LEU A 139 -0.994 66.557 23.392 1.00 34.91 C
ATOM 836 CG LEU A 139 -0.224 67.881 23.369 1.00 36.75 C
ATOM 837 CD1 LEU A 139 0.082 68.270 21.920 1.00 35.15 C
ATOM 838 CD2 LEU A 139 -1.002 68.999 24.124 1.00 35.61 C
ATOM 839 C LEU A 139 -2.039 64.741 24.731 1.00 36.86 C
ATOM 840 O LEU A 139 -1.338 63.733 24.761 1.00 37.14 O
ATOM 841 N GLN A 140 -3.362 64.714 24.626 1.00 37.15 N
ATOM 842 CA GLN A 140 -4.071 63.473 24.348 1.00 38.86 C
ATOM 843 CB GLN A 140 -5.566 63.726 24.208 1.00 39.38 C
ATOM 844 CG GLN A 140 -6.266 63.885 25.540 1.00 45.52 C
ATOM 845 CD GLN A 140 -7.649 64.493 25.395 1.00 52.38 C
ATOM 846 OE1 GLN A 140 -8.442 64.070 24.534 1.00 54.06 O
ATOM 847 NE2 GLN A 140 -7.949 65.488 26.234 1.00 55.44 N
ATOM 848 C GLN A 140 -3.532 62.890 23.062 1.00 37.84 C
ATOM 849 O GLN A 140 -3.192 63.643 22.141 1.00 37.63 O
ATOM 850 N GLU A 141 -3.449 61.559 22.996 1.00 37.43 N
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ATOM 854 CD GLU A 141 -1.571 57.568 23.263 1.00 36.74 C
ATOM 855 OE1 GLU A 141 -1.639 56.867 22.233 1.00 35.36 O
ATOM 856 OE2 GLU A 141 -1.261 57.117 24.383 1.00 37.15 O
ATOM 857 C GLU A 141 -3.596 61.227 20.498 1.00 36.95 C
ATOM 858 O GLU A 141 -2.958 61.254 19.443 1.00 36.70 O
ATOM 859 N GLU A 142 -4.900 61.497 20.566 1.00 36.62 N
ATOM 860 CA GLU A 142 -5.654 61.865 19.373 1.00 36.84 C
ATOM 861 CB GLU A 142 -7.151 62.019 19.677 1.00 37.69 C
ATOM 862 CG GLU A 142 -7.957 62.396 18.443 1.00 39.42 C
ATOM 863 CD GLU A 142 -9.440 62.567 18.730 1.00 43.91 C
ATOM 864 OE1 GLU A 142 -9.809 63.542 19.421 1.00 44.11 O
ATOM 865 OE2 GLU A 142 -10.233 61.727 18.254 1.00 45.16 O
ATOM 866 C GLU A 142 -5.127 63.181 18.814 1.00 35.87 C
ATOM 867 O GLU A 142 -4.975 63.336 17.601 1.00 35.78 O
ATOM 868 N LEU A 143 -4.857 64.120 19.709 1.00 34.68 N
ATOM 869 CA LEU A 143 -4.343 65.422 19.333 1.00 33.92 C
ATOM 870 CB LEU A 143 -4.434 66.378 20.526 1.00 33.86 C
ATOM 871 CG LEU A 143 -3.933 67.812 20.341 1.00 33.72 C
ATOM 872 CD1 LEU A 143 -4.656 68.402 19.137 1.00 31.14 C
ATOM 873 CD2 LEU A 143 -4.227 68.624 21.591 1.00 34.84 C
ATOM 874 C LEU A 143 -2.898 65.304 18.842 1.00 34.15 C
ATOM 875 O LEU A 143 -2.559 65.834 17.786 1.00 34.53 O
ATOM 876 N ALA A 144 -2.060 64.586 19.596 1.00 33.23 N
ATOM 877 CA ALA A 144 -0.669 64.366 19.204 1.00 32.59 C
ATOM 878 CB ALA A 144 0.0466 3.540 20.247 1.00 32.52 C
ATOM 879 C ALA A 144 -0.598 63.676 17.844 1.00 32.09 C
ATOM 880 O ALA A 144 0.2406 4.019 17.038 1.00 31.77 O
ATOM 881 N ARG A 145 -1.494 62.720 17.587 1.00 32.32 N
ATOM 882 CA ARG A 145 -1.545 62.050 16.293 1.00 32.91 C
ATOM 883 CB ARG A 145 -2.600 60.939 16.295 1.00 33.17 C
ATOM 884 CG ARG A 145 -2.769 60.208 14.961 1.00 35.72 C
ATOM 885 CD ARG A 145 -3.871 59.129 14.976 1.00 37.67 C
ATOM 886 NE ARG A 145 -3.583 58.127 15.993 1.00 39.30 N
ATOM 887 CZ ARG A 145 -4.264 57.978 17.127 1.00 41.07 C
ATOM 888 NH1 ARG A 145 -5.331 58.736 17.399 1.00 41.09 N
ATOM 889 NH2 ARG A 145 -3.884 57.050 17.987 1.00 40.07 N
ATOM 890 C ARG A 145 -1.789 63.044 15.155 1.00 33.07 C
ATOM 891 O ARG A 145 -1.063 63.050 14.158 1.00 32.72 O
ATOM 892 N SER A 146 -2.797 63.897 15.310 1.00 33.62 N
ATOM 893 CA SER A 146 -3.103 64.896 14.287 1.00 33.98 C
ATOM 894 CB SER A 146 -4.332 65.711 14.700 1.00 34.87 C
ATOM 895 OG SER A 146 -4.556 66.758 13.767 1.00 37.55 O
ATOM 896 C SER A 146 -1.920 65.837 14.058 1.00 34.16 C
ATOM 897 O SER A 146 -1.518 66.064 12.917 1.00 34.41 O
ATOM 898 N PHE A 147 -1.349 66.347 15.154 1.00 32.41 N
ATOM 899 CA PHE A 147 -0.235 67.278 15.088 1.00 32.56 C
ATOM 900 CB PHE A 147 0.1176 7.793 16.481 1.00 32.83 C
ATOM 901 CG PHE A 147 -0.765 68.925 16.972 1.00 34.64 C
ATOM 902 CD1 PHE A 147 -1.916 69.303 16.275 1.00 34.72 C
ATOM 903 CE1 PHE A 147 -2.725 70.330 16.744 1.00 37.91 C
ATOM 904 CZ PHE A 147 -2.380 71.009 17.911 1.00 36.29 C
ATOM 905 CE2 PHE A 147 -1.223 70.642 18.617 1.00 36.31 C
ATOM 906 CD2 PHE A 147 -0.430 69.603 18.143 1.00 34.51 C
ATOM 907 C PHE A 147 1.005 66.617 14.491 1.00 32.09 C
ATOM 908 O PHE A 147 1.647 67.190 13.625 1.00 31.07 O
ATOM 909 N PHE A 148 1.357 65.436 14.992 1.00 32.05 N
ATOM 910 CA PHE A 148 2.516 64.706 14.486 1.00 32.29 C
ATOM 911 CB PHE A 148 2.701 63.391 15.247 1.00 32.29 C
ATOM 912 CG PHE A 148 4.061 62.783 15.070 1.00 32.26 C
ATOM 913 CD1 PHE A 148 5.212 63.527 15.349 1.00 32.46 C
ATOM 914 CE1 PHE A 148 6.477 62.979 15.206 1.00 29.15 C
ATOM 915 CZ PHE A 148 6.610 61.665 14.771 1.00 30.20 C
ATOM 916 CE2 PHE A 148 5.465 60.909 14.475 1.00 30.97 C
ATOM 917 CD2 PHE A 148 4.198 61.469 14.634 1.00 31.93 C
ATOM 918 C PHE A 148 2.385 64.405 12.990 1.00 32.02 C
ATOM 919 O PHE A 148 3.343 64.536 12.238 1.00 32.46 O
ATOM 920 N TRP A 149 1.196 64.006 12.571 1.00 31.64 N
ATOM 921 CA TRP A 149 0.960 63.687 11.169 1.00 32.22 C
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ATOM 927 CD2 TRP A 149 -0.773 61.542 8.978 1.00 32.84 C
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ATOM 931 CZ2 TRP A 149 -1.279 60.584 6.763 1.00 35.70 C
ATOM 932 C TRP A 149 1.228 64.908 10.309 1.00 32.05 C
ATOM 933 O TRP A 149 1.926 64.810 9.309 1.00 31.43 O
ATOM 934 N GLN A 150 0.720 66.078 10.729 1.00 31.85 N
ATOM 935 CA GLN A 150 0.948 67.309 9.966 1.00 31.22 C
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ATOM 938 CD GLN A 150 2.126 69.553 10.773 1.00 34.62 C
ATOM 939 OE1 GLN A 150 1.850 70.656 10.292 1.00 34.95 O
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ATOM 941 C GLN A 150 2.414 67.686 9.932 1.00 31.38 C
ATOM 942 O GLN A 150 2.884 68.278 8.942 1.00 31.25 O
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ATOM 947 CG2 VAL A 151 4.661 68.652 13.325 1.00 31.32 C
ATOM 948 C VAL A 151 5.259 66.780 9.981 1.00 30.80 C
ATOM 949 O VAL A 151 6.140 67.215 9.239 1.00 30.84 O
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ATOM 954 CD1 LEU A 152 6.723 61.611 9.411 1.00 35.80 C
ATOM 955 CD2 LEU A 152 5.950 62.799 11.422 1.00 36.98 C
ATOM 956 C LEU A 152 5.215 65.052 7.567 1.00 31.63 C
ATOM 957 O LEU A 152 6.131 65.024 6.769 1.00 32.44 O
ATOM 958 N GLU A 153 3.997 65.471 7.252 1.00 31.63 N
ATOM 959 CA GLU A 153 3.671 65.980 5.907 1.00 32.26 C
ATOM 960 CB GLU A 153 2.177 66.330 5.780 1.00 32.59 C
ATOM 961 CG GLU A 153 1.233 65.126 5.736 1.00 33.60 C
ATOM 962 CD GLU A 153 1.423 64.215 4.510 1.00 35.47 C
ATOM 963 OE1 GLU A 153 1.617 64.717 3.392 1.00 38.01 O
ATOM 964 OE2 GLU A 153 1.380 62.991 4.659 1.00 34.71 O
ATOM 965 C GLU A 153 4.538 67.191 5.562 1.00 31.87 C
ATOM 966 O GLU A 153 5.076 67.281 4.449 1.00 30.83 O
ATOM 967 N ALA A 154 4.716 68.101 6.531 1.00 31.04 N
ATOM 968 CA ALA A 154 5.548 69.291 6.318 1.00 30.48 C
ATOM 969 CB ALA A 154 5.440 70.278 7.537 1.00 31.18 C
ATOM 970 C ALA A 154 7.002 68.933 6.082 1.00 31.22 C
ATOM 971 O ALA A 154 7.683 69.544 5.238 1.00 30.96 O
ATOM 972 N VAL A 155 7.504 67.967 6.842 1.00 31.29 N
ATOM 973 CA VAL A 155 8.898 67.580 6.704 1.00 32.75 C
ATOM 974 CB VAL A 155 9.335 66.651 7.856 1.00 32.61 C
ATOM 975 CG1 VAL A 155 10.729 66.132 7.631 1.00 33.47 C
ATOM 976 CG2 VAL A 155 9.292 67.439 9.189 1.00 35.41 C
ATOM 977 C VAL A 155 9.094 66.905 5.336 1.00 33.10 C
ATOM 978 O VAL A 155 10.092 67.155 4.648 1.00 33.39 O
ATOM 979 N ARG A 156 8.130 66.086 4.931 1.00 33.25 N
ATOM 980 CA ARG A 156 8.190 65.429 3.606 1.00 34.45 C
ATOM 981 CB ARG A 156 6.992 64.490 3.396 1.00 33.21 C
ATOM 982 CG ARG A 156 6.999 63.221 4.219 1.00 33.42 C
ATOM 983 CD ARG A 156 5.778 62.320 3.937 1.00 34.78 C
ATOM 984 NE ARG A 156 5.644 62.064 2.494 1.00 35.47 N
ATOM 985 CZ ARG A 156 4.533 61.636 1.903 1.00 33.43 C
ATOM 986 NH1 ARG A 156 3.435 61.411 2.609 1.00 32.42 N
ATOM 987 NH2 ARG A 156 4.525 61.437 0.594 1.00 34.38 N
ATOM 988 C ARG A 156 8.211 66.491 2.501 1.00 34.92 C
ATOM 989 O ARG A 156 8.986 66.414 1.542 1.00 35.22 O
ATOM 990 N HIS A 157 7.369 67.501 2.650 1.00 36.13 N
ATOM 991 CA HIS A 157 7.351 68.588 1.686 1.00 36.56 C
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ATOM 993 CG HIS A 157 6.362 70.863 1.197 1.00 39.12 C
ATOM 994 ND1 HIS A 157 7.005 72.014 1.608 1.00 41.07 N
ATOM 995 CE1 HIS A 157 6.921 72.926 0.658 1.00 39.75 C
ATOM 996 NE2 HIS A 157 6.249 72.407 -0.358 1.00 40.88 N
ATOM 997 CD2 HIS A 157 5.873 71.124 -0.041 1.00 38.81 C
ATOM 998 C HIS A 157 8.710 69.238 1.555 1.00 36.34 C
ATOM 999 O HIS A 157 9.178 69.475 0.435 1.00 36.86 O
ATOM 1000 N CYS A 158 9.354 69.542 2.683 1.00 36.43 N
ATOM 1001 CA CYS A 158 10.664 70.184 2.649 1.00 36.33 C
ATOM 1002 CB CYS A 158 11.177 70.492 4.065 1.00 36.27 C
ATOM 1003 SG CYS A 158 10.201 71.754 4.924 1.00 37.34 S
ATOM 1004 C CYS A 158 11.663 69.290 1.937 1.00 37.14 C
ATOM 1005 O CYS A 158 12.431 69.751 1.069 1.00 36.89 O
ATOM 1006 N HIS A 159 11.678 68.019 2.334 1.00 36.70 N
ATOM 1007 CA HIS A 159 12.624 67.055 1.784 1.00 38.40 C
ATOM 1008 CB HIS A 159 12.521 65.732 2.551 1.00 38.71 C
ATOM 1009 CG HIS A 159 13.136 65.801 3.916 1.00 44.25 C
ATOM 1010 ND1 HIS A 159 13.788 64.734 4.499 1.00 47.72 N
ATOM 1011 CE1 HIS A 159 14.258 65.103 5.681 1.00 49.12 C
ATOM 1012 NE2 HIS A 159 13.948 66.376 5.880 1.00 48.24 N
ATOM 1013 CD2 HIS A 159 13.238 66.834 4.798 1.00 47.23 C
ATOM 1014 C HIS A 159 12.392 66.881 0.277 1.00 38.37 C
ATOM 1015 O HIS A 159 13.337 66.781 -0.481 1.00 36.82 O
ATOM 1016 N ASN A 160 11.128 66.926 -0.127 1.00 39.53 N
ATOM 1017 CA ASN A 160 10.742 66.927 -1.529 1.00 42.14 C
ATOM 1018 CB ASN A 160 9.239 67.045 -1.629 1.00 43.88 C
ATOM 1019 CG ASN A 160 8.602 65.778 -2.013 1.00 48.90 C
ATOM 1020 OD1 ASN A 160 8.727 64.765 -1.312 1.00 53.59 O
ATOM 1021 ND2 ASN A 160 7.913 65.795 -3.160 1.00 53.90 N
ATOM 1022 C ASN A 160 11.322 68.100 -2.286 1.00 42.07 C
ATOM 1023 O ASN A 160 11.668 67.978 -3.461 1.00 41.85 O
ATOM 1024 N CYS A 161 11.397 69.246 -1.616 1.00 40.47 N
ATOM 1025 CA CYS A 161 11.884 70.467 -2.225 1.00 39.41 C
ATOM 1026 CB CYS A 161 11.254 71.669 -1.529 1.00 39.11 C
ATOM 1027 SG CYS A 161 9.498 71.835 -1.845 1.00 40.42 S
ATOM 1028 C CYS A 161 13.391 70.551 -2.129 1.00 38.90 C
ATOM 1029 O CYS A 161 13.979 71.555 -2.518 1.00 39.21 O
ATOM 1030 N GLY A 162 14.022 69.510 -1.596 1.00 38.48 N
ATOM 1031 CA GLY A 162 15.474 69.511 -1.438 1.00 37.84 C
ATOM 1032 C GLY A 162 15.957 70.269 -0.221 1.00 37.83 C
ATOM 1033 O GLY A 162 17.122 70.693 -0.160 1.00 36.57 O
ATOM 1034 N VAL A 163 15.084 70.388 0.789 1.00 37.66 N
ATOM 1035 CA VAL A 163 15.420 71.145 2.007 1.00 37.08 C
ATOM 1036 CB VAL A 163 14.488 72.353 2.166 1.00 37.80 C
ATOM 1037 CG1 VAL A 163 14.748 73.082 3.511 1.00 38.56 C
ATOM 1038 CG2 VAL A 163 14.666 73.306 1.008 1.00 36.79 C
ATOM 1039 C VAL A 163 15.337 70.305 3.294 1.00 37.35 C
ATOM 1040 O VAL A 163 14.363 69.589 3.538 1.00 35.09 O
ATOM 1041 N LEU A 164 16.373 70.436 4.110 1.00 37.93 N
ATOM 1042 CA LEU A 164 16.468 69.790 5.405 1.00 38.78 C
ATOM 1043 CB LEU A 164 17.813 69.089 5.468 1.00 39.15 C
ATOM 1044 CG LEU A 164 18.083 68.153 6.625 1.00 41.81 C
ATOM 1045 CD1 LEU A 164 17.260 66.866 6.466 1.00 42.67 C
ATOM 1046 CD2 LEU A 164 19.553 67.843 6.711 1.00 43.27 C
ATOM 1047 C LEU A 164 16.382 70.911 6.472 1.00 38.81 C
ATOM 1048 O LEU A 164 17.209 71.834 6.474 1.00 38.57 O
ATOM 1049 N HIS A 165 15.387 70.830 7.357 1.00 38.45 N
ATOM 1050 CA HIS A 165 15.164 71.860 8.388 1.00 37.77 C
ATOM 1051 CB HIS A 165 13.758 71.731 8.991 1.00 37.59 C
ATOM 1052 CG HIS A 165 13.398 72.836 9.937 1.00 35.86 C
ATOM 1053 ND1 HIS A 165 13.867 72.891 11.229 1.00 33.70 N
ATOM 1054 CE1 HIS A 165 13.391 73.969 11.823 1.00 34.80 C
ATOM 1055 NE2 HIS A 165 12.628 74.617 10.959 1.00 37.29 N
ATOM 1056 CD2 HIS A 165 12.612 73.926 9.774 1.00 35.10 C
ATOM 1057 C HIS A 165 16.236 71.813 9.464 1.00 37.76 C
ATOM 1058 O HIS A 165 16.784 72.843 9.824 1.00 38.35 O
ATOM 1059 N ARG A 166 16.563 70.612 9.937 1.00 37.85 N
ATOM 1060 CA ARG A 166 17.615 70.390 10.933 1.00 38.53 C
ATOM 1061 CB ARG A 166 18.952 70.946 10.456 1.00 39.48 C
ATOM 1062 CG ARG A 166 19.500 70.338 9.178 1.00 42.23 C
ATOM 1063 CD ARG A 166 20.503 71.265 8.553 1.00 46.58 C
ATOM 1064 NE ARG A 166 21.839 70.788 8.808 1.00 50.91 N
ATOM 1065 CZ ARG A 166 22.933 71.523 8.743 1.00 50.31 C
ATOM 1066 NH1 ARG A 166 22.882 72.821 8.466 1.00 50.71 N
ATOM 1067 NH2 ARG A 166 24.091 70.941 8.972 1.00 50.70 N
ATOM 1068 C ARG A 166 17.370 70.951 12.331 1.00 38.67 C
ATOM 1069 O ARG A 166 18.243 70.839 13.184 1.00 39.30 O
ATOM 1070 N ASP A 167 16.222 71.567 12.569 1.00 38.24 N
ATOM 1071 CA ASP A 167 15.920 72.076 13.912 1.00 39.05 C
ATOM 1072 CB ASP A 167 16.297 73.567 13.972 1.00 40.02 C
ATOM 1073 CG ASP A 167 16.351 74.131 15.396 1.00 44.41 C
ATOM 1074 OD1 ASP A 167 16.656 73.391 16.374 1.00 44.09 O
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ATOM 1076 C ASP A 167 14.442 71.870 14.231 1.00 37.42 C
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ATOM 1224 O ILE A 185 11.105 76.792 12.000 1.00 38.96 O
ATOM 1225 N ASP A 186 11.419 78.807 10.980 1.00 39.40 N
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ATOM 1228 CG ASP A 186 14.441 79.582 13.178 1.00 45.31 C
ATOM 1229 OD1 ASP A 186 15.190 79.992 12.255 1.00 47.25 O
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ATOM 1231 C ASP A 186 13.803 78.013 10.648 1.00 40.90 C
ATOM 1232 O ASP A 186 14.343 77.096 11.285 1.00 40.21 O
ATOM 1233 N PHE A 187 14.087 78.292 9.378 1.00 40.98 N
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ATOM 1243 O PHE A 187 17.346 77.647 7.927 1.00 44.80 O
ATOM 1244 N GLY A 188 16.723 78.868 9.716 1.00 44.55 N
ATOM 1245 CA GLY A 188 18.034 79.449 9.940 1.00 45.36 C
ATOM 1246 C GLY A 188 19.156 78.493 10.252 1.00 45.97 C
ATOM 1247 O GLY A 188 20.320 78.870 10.168 1.00 46.90 O
ATOM 1248 N SER A 189 18.830 77.260 10.631 1.00 46.13 N
ATOM 1249 CA SER A 189 19.853 76.240 10.866 1.00 45.91 C
ATOM 1250 CB SER A 189 19.725 75.652 12.280 1.00 46.57 C
ATOM 1251 OG SER A 189 19.539 76.674 13.258 1.00 51.43 O
ATOM 1252 C SER A 189 19.742 75.111 9.825 1.00 44.92 C
ATOM 1253 O SER A 189 20.356 74.051 9.977 1.00 43.79 O
ATOM 1254 N GLY A 190 18.948 75.337 8.784 1.00 44.05 N
ATOM 1255 CA GLY A 190 18.720 74.310 7.784 1.00 43.67 C
ATOM 1256 C GLY A 190 19.851 74.120 6.783 1.00 43.35 C
ATOM 1257 O GLY A 190 20.908 74.764 6.862 1.00 41.72 O
ATOM 1258 N ALA A 191 19.614 73.222 5.825 1.00 42.84 N
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ATOM 1262 O ALA A 191 18.779 71.813 3.608 1.00 41.24 O
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ATOM 1264 CA LEU A 192 20.170 71.649 1.236 1.00 42.24 C
ATOM 1265 CB LEU A 192 21.059 71.977 0.031 1.00 43.21 C
ATOM 1266 CG LEU A 192 21.088 73.455 -0.389 1.00 46.28 C
ATOM 1267 CD1 LEU A 192 22.271 73.763 -1.328 1.00 49.62 C
ATOM 1268 CD2 LEU A 192 19.778 73.889 -1.025 1.00 46.71 C
ATOM 1269 C LEU A 192 20.244 70.179 1.589 1.00 41.12 C
ATOM 1270 O LEU A 192 21.187 69.742 2.270 1.00 39.72 O
ATOM 1271 N LEU A 193 19.227 69.428 1.190 1.00 41.80 N
ATOM 1272 CA LEU A 193 19.237 67.983 1.401 1.00 43.29 C
ATOM 1273 CB LEU A 193 17.870 67.405 1.066 1.00 43.47 C
ATOM 1274 CG LEU A 193 17.658 65.896 1.213 1.00 45.93 C
ATOM 1275 CD1 LEU A 193 17.805 65.456 2.671 1.00 45.54 C
ATOM 1276 CD2 LEU A 193 16.279 65.518 0.652 1.00 46.41 C
ATOM 1277 C LEU A 193 20.306 67.331 0.512 1.00 43.97 C
ATOM 1278 O LEU A 193 20.386 67.649 -0.667 1.00 44.14 O
ATOM 1279 N LYS A 194 21.110 66.434 1.084 1.00 44.53 N
ATOM 1280 CA LYS A 194 22.106 65.663 0.340 1.00 45.14 C
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ATOM 1283 CD LYS A 194 25.300 67.144 1.961 1.00 45.08 C
ATOM 1284 CE LYS A 194 25.991 66.854 3.284 1.00 46.87 C
ATOM 1285 NZ LYS A 194 27.243 67.643 3.464 1.00 48.08 N
ATOM 1286 C LYS A 194 22.134 64.272 0.920 1.00 45.51 C
ATOM 1287 O LYS A 194 21.615 64.054 2.026 1.00 45.00 O
ATOM 1288 N ASP A 195 22.745 63.335 0.188 1.00 45.31 N
ATOM 1289 CA ASP A 195 22.779 61.933 0.609 1.00 45.82 C
ATOM 1290 CB ASP A 195 22.653 60.999 -0.601 1.00 46.48 C
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ATOM 1293 OD2 ASP A 195 21.243 61.469 -2.499 1.00 49.94 O
ATOM 1294 C ASP A 195 24.038 61.607 1.384 1.00 45.41 C
ATOM 1295 O ASP A 195 24.161 60.519 1.950 1.00 46.43 O
ATOM 1296 N THR A 196 24.984 62.538 1.385 1.00 45.63 N
ATOM 1297 CA THR A 196 26.259 62.371 2.083 1.00 46.00 C
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ATOM 1299 OG1 THR A 196 26.951 64.387 0.899 1.00 44.12 O
ATOM 1300 CG2 THR A 196 27.728 62.348 0.026 1.00 46.47 C
ATOM 1301 C THR A 196 26.211 62.902 3.518 1.00 46.75 C
ATOM 1302 O THR A 196 25.283 63.616 3.886 1.00 46.70 O
ATOM 1303 N VAL A 197 27.237 62.569 4.302 1.00 47.32 N
ATOM 1304 CA VAL A 197 27.294 62.912 5.713 1.00 48.22 C
ATOM 1305 CB VAL A 197 28.440 62.174 6.437 1.00 48.78 C
ATOM 1306 CG1 VAL A 197 29.801 62.699 6.003 1.00 50.58 C
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ATOM 1308 C VAL A 197 27.366 64.409 5.965 1.00 48.10 C
ATOM 1309 O VAL A 197 27.949 65.152 5.182 1.00 47.85 O
ATOM 1310 N TYR A 198 26.717 64.842 7.046 1.00 47.69 N
ATOM 1311 CA TYR A 198 26.810 66.212 7.531 1.00 47.39 C
ATOM 1312 CB TYR A 198 25.437 66.722 7.984 1.00 46.27 C
ATOM 1313 CG TYR A 198 24.412 66.951 6.891 1.00 43.05 C
ATOM 1314 CD1 TYR A 198 23.574 65.924 6.464 1.00 40.17 C
ATOM 1315 CE1 TYR A 198 22.631 66.123 5.466 1.00 39.03 C
ATOM 1316 CZ TYR A 198 22.490 67.368 4.904 1.00 38.13 C
ATOM 1317 OH TYR A 198 21.539 67.577 3.933 1.00 36.97 O
ATCM 1318 CE2 TYR A 198 23.293 68.421 5.317 1.00 39.95 C
ATOM 1319 CD2 TYR A 198 24.256 68.204 6.312 1.00 41.73 C
ATOM 1320 C TYR A 198 27.753 66.211 8.729 1.00 48.60 C
ATOM 1321 O TYR A 198 27.657 65.349 9.597 1.00 48.27 O
ATOM 1322 N THR A 199 28.658 67.183 8.775 1.00 50.37 N
ATOM 1323 CA THR A 199 29.619 67.304 9.875 1.00 52.48 C
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ATOM 1326 CG2 THR A 199 31.393 65.936 8.714 1.00 53.00 C
ATOM 1327 C THR A 199 29.409 68.606 10.636 1.00 53.92 C
ATOM 1328 O THR A 199 30.172 68.924 11.545 1.00 53.86 O
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ATOM 1335 C ASP A 200 26.602 70.424 11.539 1.00 59.05 C
ATOM 1336 O ASP A 200 25.751 69.737 10.957 1.00 58.97 O
ATOM 1337 N PHE A 201 26.365 71.091 12.664 1.00 60.22 N
ATOM 1338 CA PHE A 201 25.061 71.089 13.315 1.00 61.47 C
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ATOM 1343 CZ PHE A 201 21.064 69.560 16.131 1.00 62.12 C
ATOM 1344 CE2 PHE A 201 22.242 69.727 16.856 1.00 61.55 C
ATOM 1345 CD2 PHE A 201 23.464 69.804 16.190 1.00 61.34 C
ATOM 1346 C PHE A 201 24.957 72.286 14.245 1.00 62.42 C
ATOM 1347 O PHE A 201 25.712 72.411 15.214 1.00 62.75 O
ATOM 1348 N ASP A 202 24.012 73.158 13.934 1.00 63.58 N
ATOM 1349 CA ASP A 202 23.820 74.406 14.651 1.00 64.74 C
ATOM 1350 CB ASP A 202 24.100 75.583 13.704 1.00 65.58 C
ATOM 1351 CG ASP A 202 23.966 76.930 14.388 1.00 69.34 C
ATOM 1352 OD1 ASP A 202 24.626 77.141 15.440 1.00 71.91 O
ATOM 1353 OD2 ASP A 202 23.207 77.831 13.950 1.00 72.83 O
ATOM 1354 C ASP A 202 22.397 74.467 15.198 1.00 64.11 C
ATOM 1355 O ASP A 202 21.920 75.524 15.600 1.00 64.30 O
ATOM 1356 N GLY A 203 21.716 73.324 15.202 1.00 63.47 N
ATOM 1357 CA GLY A 203 20.358 73.250 15.712 1.00 62.03 C
ATOM 1358 C GLY A 203 20.346 72.947 17.200 1.00 60.94 C
ATOM 1359 O GLY A 203 21.392 72.972 17.854 1.00 61.08 O
ATOM 1360 N THR A 204 19.158 72.643 17.727 1.00 59.86 N
ATOM 1361 CA THR A 204 18.975 72.364 19.158 1.00 58.03 C
ATOM 1362 CB THR A 204 17.481 72.402 19.547 1.00 57.90 C
ATOM 1363 OG1 THR A 204 16.900 73.630 19.090 1.00 56.77 O
ATOM 1364 CG2 THR A 204 17.332 72.488 21.079 1.00 57.65 C
ATOM 1365 C THR A 204 19.574 71.032 19.575 1.00 57.57 C
ATOM 1366 O THR A 204 19.196 69.966 19.047 1.00 56.94 O
ATOM 1367 N ARG A 205 20.487 71.106 20.545 1.00 56.60 N
ATOM 1368 CA ARG A 205 21.238 69.959 21.022 1.00 56.09 C
ATOM 1369 CB ARG A 205 22.204 70.417 22.124 1.00 56.67 C
ATOM 1370 CG ARG A 205 22.870 69.291 22.879 1.00 59.97 C
ATOM 1371 CD ARG A 205 24.127 69.719 23.631 1.00 63.64 C
ATOM 1372 NE ARG A 205 25.317 69.608 22.785 1.00 64.42 N
ATOM 1373 CZ ARG A 205 26.049 68.501 22.667 1.00 65.48 C
ATOM 1374 NH1 ARG A 205 25.712 67.410 23.340 1.00 65.75 N
ATOM 1375 NH2 ARG A 205 27.114 68.476 21.872 1.00 64.31 N
ATOM 1376 C ARG A 205 20.360 68.784 21.503 1.00 55.41 C
ATOM 1377 O ARG A 205 20.536 67.630 21.069 1.00 55.27 O
ATOM 1378 N VAL A 206 19.420 69.077 22.400 1.00 54.06 N
ATOM 1379 CA VAL A 206 18.634 68.037 23.067 1.00 52.40 C
ATOM 1380 CB VAL A 206 17.704 68.640 24.178 1.00 52.71 C
ATOM 1381 CG1 VAL A 206 18.516 69.018 25.416 1.00 50.99 C
ATOM 1382 CG2 VAL A 206 16.919 69.844 23.636 1.00 51.73 C
ATOM 1383 C VAL A 206 17.799 67.291 22.048 1.00 51.99 C
ATOM 1384 O VAL A 206 17.219 66.257 22.363 1.00 52.27 O
ATOM 1385 N TYR A 207 17.731 67.834 20.830 1.00 50.50 N
ATOM 1386 CA TYR A 207 17.001 67.202 19.738 1.00 49.94 C
ATOM 1387 CB TYR A 207 16.126 68.236 19.021 1.00 49.34 C
ATOM 1388 CG TYR A 207 14.759 68.542 19.600 1.00 48.61 C
ATOM 1389 CD1 TYR A 207 14.604 69.438 20.679 1.00 49.28 C
ATOM 1390 CE1 TYR A 207 13.314 69.753 21.194 1.00 48.65 C
ATOM 1391 CZ TYR A 207 12.182 69.164 20.590 1.00 50.59 C
ATOM 1392 OH TYR A 207 10.901 69.447 21.042 1.00 47.38 O
ATOM 1393 CE2 TYR A 207 12.332 68.284 19.488 1.00 48.14 C
ATOM 1394 CD2 TYR A 207 13.605 67.999 19.007 1.00 48.95 C
ATOM 1395 C TYR A 207 17.982 66.571 18.718 1.00 49.22 C
ATOM 1396 O TYR A 207 17.560 66.165 17.621 1.00 48.88 O
ATOM 1397 N SER A 208 19.269 66.529 19.085 1.00 48.13 N
ATOM 1398 CA SER A 208 20.361 66.030 18.231 1.00 47.87 C
ATOM 1399 CB SER A 208 21.667 66.791 18.496 1.00 48.10 C
ATOM 1400 OG SER A 208 22.280 66.316 19.688 1.00 49.78 O
ATOM 1401 C SER A 208 20.620 64.566 18.503 1.00 46.42 C
ATOM 1402 O SER A 208 20.531 64.110 19.656 1.00 46.94 O
ATOM 1403 N PRO A 209 20.941 63.826 17.449 1.00 44.93 N
ATOM 1404 CA PRO A 209 21.043 62.374 17.545 1.00 43.05 C
ATOM 1405 CB PRO A 209 20.979 61.948 16.083 1.00 43.11 C
ATOM 1406 CG PRO A 209 21.596 63.062 15.366 1.00 43.72 C
ATOM 1407 CD PRO A 209 21.165 64.293 16.070 1.00 45.04 C
ATOM 1408 C PRO A 209 22.334 61.918 18.200 1.00 42.08 C
ATOM 1409 O PRO A 209 23.303 62.675 18.235 1.00 40.92 O
ATOM 1410 N PRO A 210 22.355 60.685 18.705 1.00 41.24 N
ATOM 1411 CA PRO A 210 23.546 60.167 19.374 1.00 42.13 C
ATOM 1412 CB PRO A 210 23.117 58.762 19.830 1.00 41.13 C
ATOM 1413 CG PRO A 210 21.980 58.403 18.942 1.00 41.77 C
ATOM 1414 CD PRO A 210 21.270 59.693 18.669 1.00 40.59 C
ATOM 1415 C PRO A 210 24.768 60.119 18.442 1.00 43.19 C
ATOM 1416 O PRO A 210 25.884 60.302 18.942 1.00 42.91 O
ATOM 1417 N GLU A 211 24.567 59.901 17.138 1.00 43.80 N
ATOM 1418 CA GLU A 211 25.683 59.896 16.184 1.00 45.23 C
ATOM 1419 CB GLU A 211 25.253 59.400 14.780 1.00 44.59 C
ATOM 1420 CG GLU A 211 24.227 60.279 14.079 1.00 42.32 C
ATOM 1421 CD GLU A 211 22.796 59.821 14.334 1.00 41.06 C
ATOM 1422 OE1 GLU A 211 22.529 59.217 15.394 1.00 38.90 O
ATOM 1423 OE2 GLU A 211 21.940 60.065 13.460 1.00 38.76 O
ATOM 1424 C GLU A 211 26.354 61.263 16.095 1.00 46.56 C
ATOM 1425 O GLU A 211 27.563 61.353 15.883 1.00 46.98 O
ATOM 1426 N TRP A 212 25.585 62.331 16.284 1.00 48.34 N
ATOM 1427 CA TRP A 212 26.184 63.658 16.339 1.00 50.36 C
ATOM 1428 CB TRP A 212 25.147 64.769 16.186 1.00 50.50 C
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ATOM 1430 CD1 TRP A 212 25.599 66.830 17.652 1.00 53.01 C
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ATOM 1433 CD2 TRP A 212 26.626 66.877 15.661 1.00 52.72 C
ATOM 1434 CE3 TRP A 212 27.159 66.692 14.373 1.00 52.54 C
ATOM 1435 CZ3 TRP A 212 27.992 67.675 13.842 1.00 52.69 C
ATOM 1436 CH2 TRP A 212 28.306 68.832 14.575 1.00 52.71 C
ATOM 1437 CZ2 TRP A 212 27.802 69.040 15.833 1.00 53.56 C
ATOM 1438 C TRP A 212 26.996 63.835 17.622 1.00 51.79 C
ATOM 1439 O TRP A 212 28.118 64.342 17.588 1.00 52.13 O
ATOM 1440 N ILE A 213 26.435 63.388 18.743 1.00 53.62 N
ATOM 1441 CA ILE A 213 27.095 63.496 20.048 1.00 55.72 C
ATOM 1442 CB ILE A 213 26.195 62.917 21.183 1.00 55.41 C
ATOM 1443 CG1 ILE A 213 24.804 63.568 21.202 1.00 56.07 C
ATOM 1444 CD1 ILE A 213 24.816 65.083 21.258 1.00 57.43 C
ATOM 1445 CG2 ILE A 213 26.874 63.055 22.525 1.00 56.33 C
ATOM 1446 C ILE A 213 28.440 62.771 20.050 1.00 57.10 C
ATOM 1447 O ILE A 213 29.461 63.335 20.447 1.00 57.22 O
ATOM 1448 N ARG A 214 28.416 61.524 19.591 1.00 58.27 N
ATOM 1449 CA ARG A 214 29.559 60.635 19.650 1.00 59.99 C
ATOM 1450 CB ARG A 214 29.083 59.190 19.585 1.00 60.48 C
ATOM 1451 CG ARG A 214 28.391 58.721 20.837 1.00 64.19 C
ATOM 1452 CD ARG A 214 28.138 57.237 20.844 1.00 68.93 C
ATOM 1453 NE ARG A 214 29.398 56.501 20.865 1.00 73.42 N
ATOM 1454 CZ ARG A 214 29.499 55.185 21.015 1.00 76.10 C
ATOM 1455 NH1 ARG A 214 28.405 54.439 21.161 1.00 76.91 N
ATOM 1456 NH2 ARG A 214 30.697 54.609 21.013 1.00 76.26 N
ATOM 1457 C ARG A 214 30.579 60.864 18.546 1.00 59.96 C
ATOM 1458 O ARG A 214 31.774 60.803 18.812 1.00 60.37 O
ATOM 1459 N TYR A 215 30.116 61.106 17.318 1.00 59.65 N
ATOM 1460 CA TYR A 215 31.018 61.161 16.159 1.00 59.46 C
ATOM 1461 CB TYR A 215 30.751 59.997 15.196 1.00 59.78 C
ATOM 1462 CG TYR A 215 30.624 58.648 15.858 1.00 61.91 C
ATOM 1463 CD1 TYR A 215 31.657 58.120 16.639 1.00 63.80 C
ATOM 1464 CE1 TYR A 215 31.532 56.877 17.247 1.00 64.01 C
ATOM 1465 CZ TYR A 215 30.370 56.151 17.070 1.00 65.13 C
ATOM 1466 OH TYR A 215 30.228 54.910 17.657 1.00 66.40 O
ATOM 1467 CE2 TYR A 215 29.346 56.647 16.288 1.00 64.30 C
ATOM 1468 CD2 TYR A 215 29.475 57.885 15.692 1.00 63.31 C
ATOM 1469 C TYR A 215 30.984 62.453 15.364 1.00 58.84 C
ATOM 1470 O TYR A 215 31.672 62.556 14.356 1.00 58.96 O
ATOM 1471 N HIS A 216 30.189 63.431 15.791 1.00 57.99 N
ATOM 1472 CA HIS A 216 30.018 64.666 15.020 1.00 57.44 C
ATOM 1473 CB HIS A 216 31.238 65.583 15.198 1.00 58.54 C
ATOM 1474 CG HIS A 216 31.302 66.231 16.547 1.00 62.71 C
ATOM 1475 ND1 HIS A 216 30.780 67.486 16.793 1.00 65.61 N
ATOM 1476 CE1 HIS A 216 30.965 67.796 18.065 1.00 67.49 C
ATOM 1477 NE2 HIS A 216 31.591 66.788 18.655 1.00 67.79 N
ATOM 1478 CD2 HIS A 216 31.808 65.793 17.730 1.00 65.96 C
ATOM 1479 C HIS A 216 29.721 64.415 13.524 1.00 55.81 C
ATOM 1480 O HIS A 216 30.212 65.135 12.653 1.00 55.97 O
ATOM 1481 N ARG A 217 28.910 63.395 13.243 1.00 53.48 N
ATOM 1482 CA ARG A 217 28.502 63.041 11.881 1.00 51.48 C
ATOM 1483 CB ARG A 217 29.335 61.864 11.347 1.00 51.91 C
ATOM 1484 CG ARG A 217 30.818 62.132 11.121 1.00 54.97 C
ATOM 1485 CD ARG A 217 31.688 60.860 11.180 1.00 59.48 C
ATOM 1486 NE ARG A 217 31.581 60.059 9.957 1.00 63.43 N
ATOM 1487 CZ ARG A 217 32.061 60.411 8.751 1.00 64.73 C
ATOM 1488 NH1 ARG A 217 32.700 61.569 8.577 1.00 66.07 N
ATOM 1489 NH2 ARG A 217 31.892 59.602 7.709 1.00 63.46 N
ATOM 1490 C ARG A 217 27.054 62.581 11.923 1.00 48.94 C
ATOM 1491 O ARG A 217 26.641 61.939 12.884 1.00 48.53 O
ATOM 1492 N TYR A 218 26.300 62.893 10.875 1.00 45.99 N
ATOM 1493 CA TYR A 218 24.938 62.394 10.722 1.00 43.71 C
ATOM 1494 CB TYR A 218 23.976 63.126 11.694 1.00 42.32 C
ATOM 1495 CG TYR A 218 23.830 64.587 11.395 1.00 40.14 C
ATOM 1496 CD1 TYR A 218 24.708 65.529 11.937 1.00 39.79 C
ATOM 1497 CE1 TYR A 218 24.574 66.882 11.628 1.00 42.32 C
ATOM 1498 CZ TYR A 218 23.562 67.298 10.770 1.00 41.14 C
ATOM 1499 OH TYR A 218 23.412 68.630 10.464 1.00 43.32 O
ATOM 1500 CE2 TYR A 218 22.680 66.375 10.224 1.00 39.68 C
ATOM 1501 CD2 TYR A 218 22.828 65.031 10.539 1.00 39.80 C
ATOM 1502 C TYR A 218 24.448 62.520 9.279 1.00 42.58 C
ATOM 1503 O TYR A 218 24.959 63.323 8.492 1.00 42.66 O
ATOM 1504 N HIS A 219 23.434 61.732 8.947 1.00 41.95 N
ATOM 1505 CA HIS A 219 22.769 61.849 7.658 1.00 40.52 C
ATOM 1506 CB HIS A 219 22.655 60.465 7.030 1.00 41.07 C
ATOM 1507 CG HIS A 219 23.984 59.906 6.614 1.00 42.12 C
ATOM 1508 ND1 HIS A 219 24.497 60.080 5.344 1.00 43.99 N
ATOM 1509 CE1 HIS A 219 25.692 59.523 5.273 1.00 42.45 C
ATOM 1510 NE2 HIS A 219 25.982 59.010 6.455 1.00 43.76 N
ATOM 1511 CD2 HIS A 219 24.935 59.246 7.317 1.00 41.90 C
ATOM 1512 C HIS A 219 21.404 62.521 7.843 1.00 39.33 C
ATOM 1513 O HIS A 219 20.779 62.370 8.889 1.00 38.64 O
ATOM 1514 N GLY A 220 20.965 63.270 6.836 1.00 38.11 N
ATOM 1515 CA GLY A 220 19.784 64.103 6.950 1.00 37.81 C
ATOM 1516 C GLY A 220 18.527 63.394 7.405 1.00 38.27 C
ATOM 1517 O GLY A 220 17.931 63.745 8.429 1.00 37.53 O
ATOM 1518 N ARG A 221 18.122 62.386 6.647 1.00 38.11 N
ATOM 1519 CA ARG A 221 16.855 61.717 6.895 1.00 38.50 C
ATOM 1520 CB ARG A 221 16.542 60.729 5.767 1.00 40.47 C
ATOM 1521 CG ARG A 221 16.585 61.401 4.388 1.00 45.37 C
ATOM 1522 CD ARG A 221 16.575 60.448 3.185 1.00 51.09 C
ATOM 1523 NE ARG A 221 16.584 61.200 1.919 1.00 53.82 N
ATOM 1524 CZ ARG A 221 17.690 61.495 1.222 1.00 55.73 C
ATOM 1525 NH1 ARG A 221 18.894 61.099 1.646 1.00 56.00 N
ATOM 1526 NH2 ARG A 221 17.594 62.164 0.075 1.00 55.14 N
ATOM 1527 C ARG A 221 16.824 61.050 8.256 1.00 37.41 C
ATOM 1528 O ARG A 221 15.873 61.254 9.013 1.00 37.16 O
ATOM 1529 N SER A 222 17.858 60.290 8.597 1.00 36.13 N
ATOM 1530 CA SER A 222 17.836 59.563 9.863 1.00 35.73 C
ATOM 1531 CB SER A 222 18.900 58.448 9.890 1.00 34.73 C
ATOM 1532 OG SER A 222 20.215 58.968 9.772 1.00 36.77 O
ATOM 1533 C SER A 222 17.941 60.519 11.069 1.00 35.26 C
ATOM 1534 O SER A 222 17.365 60.250 12.137 1.00 35.32 O
ATOM 1535 N ALA A 223 18.647 61.633 10.899 1.00 34.89 N
ATOM 1536 CA ALA A 223 18.743 62.643 11.958 1.00 34.34 C
ATOM 1537 CB ALA A 223 19.847 63.660 11.666 1.00 32.42 C
ATOM 1538 C ALA A 223 17.399 63.350 12.101 1.00 34.25 C
ATOM 1539 O ALA A 223 16.992 63.726 13.214 1.00 33.94 O
ATOM 1540 N ALA A 224 16.699 63.523 10.983 1.00 33.64 N
ATOM 1541 CA ALA A 224 15.384 64.152 11.033 1.00 32.93 C
ATOM 1542 CB ALA A 224 14.862 64.456 9.651 1.00 33.29 C
ATOM 1543 C ALA A 224 14.410 63.269 11.812 1.00 33.44 C
ATOM 1544 O ALA A 224 13.645 63.770 12.651 1.00 33.58 O
ATOM 1545 N VAL A 225 14.455 61.962 11.562 1.00 32.40 N
ATOM 1546 CA VAL A 225 13.569 61.003 12.228 1.00 31.69 C
ATOM 1547 CB VAL A 225 13.724 59.574 11.622 1.00 32.53 C
ATOM 1548 CG1 VAL A 225 13.083 58.504 12.507 1.00 30.93 C
ATOM 1549 CG2 VAL A 225 13.123 59.544 10.219 1.00 32.75 C
ATOM 1550 C VAL A 225 13.856 60.988 13.740 1.00 32.12 C
ATOM 1551 O VAL A 225 12.943 60.876 14.552 1.00 31.44 O
ATOM 1552 N TRP A 226 15.125 61.117 14.110 1.00 31.95 N
ATOM 1553 CA TRP A 226 15.476 61.173 15.530 1.00 32.47 C
ATOM 1554 CB TRP A 226 16.990 61.279 15.721 1.00 33.06 C
ATOM 1555 CG TRP A 226 17.322 61.494 17.183 1.00 32.56 C
ATOM 1556 CD1 TRP A 226 17.334 62.682 17.851 1.00 32.49 C
ATOM 1557 NE1 TRP A 226 17.660 62.479 19.173 1.00 32.64 N
ATOM 1558 CE2 TRP A 226 17.834 61.134 19.383 1.00 31.73 C
ATOM 1559 CD2 TRP A 226 17.631 60.485 18.148 1.00 31.24 C
ATOM 1560 CE3 TRP A 226 17.757 59.089 18.094 1.00 32.89 C
ATOM 1561 CZ3 TRP A 226 18.096 58.391 19.261 1.00 32.32 C
ATOM 1562 CH2 TRP A 226 18.286 59.080 20.478 1.00 33.34 C
ATOM 1563 CZ2 TRP A 226 18.157 60.444 20.552 1.00 32.43 C
ATOM 1564 C TRP A 226 14.754 62.372 16.178 1.00 32.00 C
ATOM 1565 O TRP A 226 14.071 62.224 17.192 1.00 31.94 O
ATOM 1566 N SER A 227 14.872 63.546 15.558 1.00 31.65 N
ATOM 1567 CA SER A 227 14.217 64.752 16.073 1.00 31.57 C
ATOM 1568 CB SER A 227 14.611 65.982 15.259 1.00 31.61 C
ATOM 1569 OG SER A 227 13.916 66.048 14.016 1.00 33.45 O
ATOM 1570 C SER A 227 12.695 64.599 16.161 1.00 31.31 C
ATOM 1571 O SER A 227 12.052 65.151 17.072 1.00 30.56 O
ATOM 1572 N LEU A 228 12.124 63.841 15.229 1.00 30.36 N
ATOM 1573 CA LEU A 228 10.701 63.545 15.217 1.00 30.48 C
ATOM 1574 CB LEU A 228 10.300 62.865 13.901 1.00 30.69 C
ATOM 1575 CG LEU A 228 10.325 63.767 12.661 1.00 31.45 C
ATOM 1576 CD1 LEU A 228 10.069 62.947 11.389 1.00 30.81 C
ATOM 1577 CD2 LEU A 228 9.321 64.917 12.784 1.00 30.15 C
ATOM 1578 C LEU A 228 10.315 62.661 16.394 1.00 29.84 C
ATOM 1579 O LEU A 228 9.227 62.815 16.958 1.00 30.50 O
ATOM 1580 N GLY A 229 11.206 61.751 16.765 1.00 29.67 N
ATOM 1581 CA GLY A 229 11.008 60.895 17.920 1.00 29.67 C
ATOM 1582 C GLY A 229 10.994 61.723 19.208 1.00 30.52 C
ATOM 1583 O GLY A 229 10.169 61.486 20.105 1.00 28.98 O
ATOM 1584 N ILE A 230 11.920 62.670 19.307 1.00 30.54 N
ATOM 1585 CA ILE A 230 11.986 63.587 20.459 1.00 31.11 C
ATOM 1586 CB ILE A 230 13.199 64.564 20.334 1.00 31.68 C
ATOM 1587 CG1 ILE A 230 14.526 63.792 20.281 1.00 30.92 C
ATOM 1588 CD1 ILE A 230 14.824 62.992 21.546 1.00 30.66 C
ATOM 1589 CG2 ILE A 230 13.229 65.553 21.533 1.00 30.61 C
ATOM 1590 C ILE A 230 10.693 64.397 20.532 1.00 31.56 C
ATOM 1591 O ILE A 230 10.050 64.488 21.596 1.00 31.09 O
ATOM 1592 N LEU A 231 10.289 64.928 19.373 1.00 30.97 N
ATOM 1593 CA LEU A 231 9.050 65.711 19.257 1.00 30.14 C
ATOM 1594 CB LEU A 231 8.894 66.239 17.828 1.00 30.10 C
ATOM 1595 CG LEU A 231 7.627 67.043 17.556 1.00 32.25 C
ATOM 1596 CD1 LEU A 231 7.733 68.372 18.310 1.00 30.47 C
ATOM 1597 CD2 LEU A 231 7.419 67.246 16.065 1.00 30.92 C
ATOM 1598 C LEU A 231 7.798 64.950 19.689 1.00 30.59 C
ATOM 1599 O LEU A 231 6.949 65.484 20.439 1.00 30.81 O
ATOM 1600 N LEU A 232 7.655 63.721 19.210 1.00 29.58 N
ATOM 1601 CA LEU A 232 6.499 62.916 19.552 1.00 30.41 C
ATOM 1602 CB LEU A 232 6.470 61.609 18.745 1.00 30.17 C
ATOM 1603 CG LEU A 232 5.301 60.642 19.033 1.00 30.99 C
ATOM 1604 CD1 LEU A 232 3.947 61.346 18.919 1.00 33.55 C
ATOM 1605 CD2 LEU A 232 5.359 59.465 18.073 1.00 31.95 C
ATOM 1606 C LEU A 232 6.439 62.630 21.062 1.00 30.78 C
ATOM 1607 O LEU A 232 5.371 62.721 21.667 1.00 31.42 O
ATOM 1608 N TYR A 233 7.571 62.272 21.650 1.00 30.02 N
ATOM 1609 CA TYR A 233 7.646 62.042 23.103 1.00 30.55 C
ATOM 1610 CB TYR A 233 9.068 61.662 23.526 1.00 30.26 C
ATOM 1611 CG TYR A 233 9.209 61.373 25.008 1.00 28.93 C
ATOM 1612 CD1 TYR A 233 9.255 62.416 25.930 1.00 29.15 C
ATOM 1613 CE1 TYR A 233 9.353 62.171 27.311 1.00 28.65 C
ATOM 1614 CZ TYR A 233 9.407 60.882 27.769 1.00 31.81 C
ATOM 1615 OH TYR A 233 9.505 60.681 29.132 1.00 36.02 O
ATOM 1616 CE2 TYR A 233 9.365 59.801 26.878 1.00 30.59 C
ATOM 1617 CD2 TYR A 233 9.267 60.058 25.486 1.00 28.47 C
ATOM 1618 C TYR A 233 7.216 63.306 23.834 1.00 31.37 C
ATOM 1619 O TYR A 233 6.416 63.250 24.769 1.00 32.79 O
ATOM 1620 N ASP A 234 7.762 64.434 23.407 1.00 31.52 N
ATOM 1621 CA ASP A 234 7.411 65.750 23.934 1.00 33.52 C
ATOM 1622 CB ASP A 234 8.156 66.833 23.162 1.00 34.26 C
ATOM 1623 CG ASP A 234 7.951 68.224 23.745 1.00 37.82 C
ATOM 1624 OD1 ASP A 234 8.206 68.450 24.956 1.00 39.31 O
ATOM 1625 OD2 ASP A 234 7.531 69.156 23.030 1.00 39.97 O
ATOM 1626 C ASP A 234 5.923 66.023 23.923 1.00 34.29 C
ATOM 1627 O ASP A 234 5.368 66.524 24.931 1.00 35.28 O
ATOM 1628 N MET A 235 5.258 65.695 22.810 1.00 33.03 N
ATOM 1629 CA MET A 235 3.819 65.904 22.713 1.00 33.96 C
ATOM 1630 CB MET A 235 3.293 65.625 21.305 1.00 33.12 C
ATOM 1631 CG MET A 235 3.641 66.708 20.286 1.00 36.42 C
ATOM 1632 SD MET A 235 2.965 66.246 18.692 1.00 39.55 S
ATOM 1633 CE MET A 235 4.174 65.260 18.147 1.00 43.23 C
ATOM 1634 C MET A 235 3.020 65.078 23.703 1.00 33.96 C
ATOM 1635 O MET A 235 2.133 65.607 24.337 1.00 35.00 O
ATOM 1636 N VAL A 236 3.322 63.787 23.816 1.00 34.07 N
ATOM 1637 CA VAL A 236 2.518 62.893 24.660 1.00 35.02 C
ATOM 1638 CB VAL A 236 2.405 61.476 24.055 1.00 35.33 C
ATOM 1639 CG1 VAL A 236 1.757 61.562 22.673 1.00 34.30 C
ATOM 1640 CG2 VAL A 236 3.763 60.805 23.937 1.00 33.11 C
ATOM 1641 C VAL A 236 2.955 62.843 26.129 1.00 35.63 C
ATOM 1642 O VAL A 236 2.225 62.326 26.970 1.00 35.58 O
ATOM 1643 N CYS A 237 4.131 63.389 26.432 1.00 36.11 N
ATOM 1644 CA CYS A 237 4.642 63.383 27.814 1.00 36.98 C
ATOM 1645 CB CYS A 237 5.972 62.630 27.909 1.00 36.35 C
ATOM 1646 SG CYS A 237 5.796 60.844 27.757 1.00 38.34 S
ATOM 1647 C CYS A 237 4.790 64.778 28.416 1.00 37.40 C
ATOM 1648 O CYS A 237 4.983 64.907 29.628 1.00 38.17 O
ATOM 1649 N GLY A 238 4.722 65.812 27.576 1.00 36.49 N
ATOM 1650 CA GLY A 238 4.791 67.183 28.045 1.00 36.34 C
ATOM 1651 C GLY A 238 6.186 67.717 28.259 1.00 37.64 C
ATOM 1652 O GLY A 238 6.353 68.842 28.719 1.00 37.75 O
ATOM 1653 N ASP A 239 7.198 66.916 27.939 1.00 38.11 N
ATOM 1654 CA ASP A 239 8.580 67.369 28.009 1.00 39.21 C
ATOM 1655 CB ASP A 239 9.056 67.339 29.458 1.00 40.74 C
ATOM 1656 CG ASP A 239 10.214 68.302 29.735 1.00 45.40 C
ATOM 1657 OD1 ASP A 239 10.586 69.135 28.867 1.00 49.01 O
ATOM 1658 OD2 ASP A 239 10.822 68.274 30.828 1.00 50.33 O
ATOM 1659 C ASP A 239 9.418 66.434 27.142 1.00 39.28 C
ATOM 1660 O ASP A 239 8.957 65.354 26.769 1.00 39.18 O
ATOM 1661 N ILE A 240 10.630 66.856 26.809 1.00 39.54 N
ATOM 1662 CA ILE A 240 11.529 66.066 25.983 1.00 39.95 C
ATOM 1663 CB ILE A 240 12.641 66.964 25.440 1.00 40.83 C
ATOM 1664 CG1 ILE A 240 13.306 67.740 26.578 1.00 41.83 C
ATOM 1665 CD1 ILE A 240 14.455 68.627 26.125 1.00 44.95 C
ATOM 1666 CG2 ILE A 240 12.092 67.911 24.344 1.00 39.77 C
ATOM 1667 C ILE A 240 12.106 64.916 26.827 1.00 40.26 C
ATOM 1668 O ILE A 240 12.187 65.046 28.049 1.00 40.89 O
ATOM 1669 N PRO A 241 12.470 63.791 26.210 1.00 40.14 N
ATOM 1670 CA PRO A 241 12.941 62.620 26.971 1.00 41.03 C
ATOM 1671 CB PRO A 241 12.879 61.494 25.932 1.00 40.79 C
ATOM 1672 CG PRO A 241 13.150 62.187 24.622 1.00 39.44 C
ATOM 1673 CD PRO A 241 12.444 63.518 24.757 1.00 39.54 C
ATOM 1674 C PRO A 241 14.361 62.737 27.548 1.00 42.89 C
ATOM 1675 O PRO A 241 14.639 62.109 28.571 1.00 42.98 O
ATOM 1676 N PHE A 242 15.243 63.508 26.912 1.00 44.80 N
ATOM 1677 CA PHE A 242 16.644 63.555 27.340 1.00 46.51 C
ATOM 1678 CB PHE A 242 17.589 62.944 26.285 1.00 45.41 C
ATOM 1679 CG PHE A 242 17.145 61.617 25.735 1.00 43.12 C
ATOM 1680 CD1 PHE A 242 16.885 60.545 26.578 1.00 42.42 C
ATOM 1681 CE1 PHE A 242 16.496 59.313 26.068 1.00 41.08 C
ATOM 1682 CZ PHE A 242 16.367 59.148 24.676 1.00 43.10 C
ATOM 1683 CE2 PHE A 242 16.618 60.222 23.824 1.00 40.87 C
ATOM 1684 CD2 PHE A 242 17.012 61.438 24.350 1.00 42.39 C
ATOM 1685 C PHE A 242 17.104 64.973 27.639 1.00 48.94 C
ATOM 1686 O PHE A 242 16.783 65.913 26.903 1.00 48.57 O
ATOM 1687 N GLU A 243 17.884 65.112 28.714 1.00 52.57 N
ATOM 1688 CA GLU A 243 18.514 66.391 29.046 1.00 55.94 C
ATOM 1689 CB GLU A 243 18.204 66.793 30.496 1.00 57.25 C
ATOM 1690 CG GLU A 243 16.930 67.634 30.664 1.00 62.51 C
ATOM 1691 CD GLU A 243 16.911 68.912 29.814 1.00 68.14 C
ATOM 1692 OE1 GLU A 243 17.901 69.697 29.854 1.00 69.83 O
ATOM 1693 OE2 GLU A 243 15.894 69.140 29.104 1.00 69.55 O
ATOM 1694 C GLU A 243 20.022 66.364 28.813 1.00 56.70 C
ATOM 1695 O GLU A 243 20.596 67.329 28.291 1.00 57.61 O
ATOM 1696 N HIS A 244 20.654 65.250 29.169 1.00 57.00 N
ATOM 1697 CA HIS A 244 22.111 65.145 29.128 1.00 57.57 C
ATOM 1698 CB HIS A 244 22.634 64.653 30.484 1.00 57.93 C
ATOM 1699 CG HIS A 244 22.177 65.491 31.641 1.00 60.15 C
ATOM 1700 ND1 HIS A 244 21.243 65.040 32.563 1.00 61.46 N
ATOM 1701 CE1 HIS A 244 21.021 65.986 33.459 1.00 61.53 C
ATOM 1702 NE2 HIS A 244 21.772 67.040 33.145 1.00 61.93 N
ATOM 1703 CD2 HIS A 244 22.501 66.761 32.008 1.00 60.89 C
ATOM 1704 C HIS A 244 22.632 64.251 27.999 1.00 57.12 C
ATOM 1705 O HIS A 244 21.946 63.321 27.564 1.00 56.42 O
ATOM 1706 N ASP A 245 23.850 64.550 27.542 1.00 56.65 N
ATOM 1707 CA ASP A 245 24.536 63.778 26.508 1.00 56.51 C
ATOM 1708 CB ASP A 245 25.982 64.254 26.364 1.00 56.84 C
ATOM 1709 CG ASP A 245 26.093 65.551 25.602 1.00 58.28 C
ATOM 1710 OD1 ASP A 245 25.109 66.322 25.555 1.00 60.57 O
ATOM 1711 OD2 ASP A 245 27.132 65.889 25.003 1.00 61.68 O
ATOM 1712 C ASP A 245 24.520 62.289 26.792 1.00 55.85 C
ATOM 1713 O ASP A 245 24.240 61.487 25.902 1.00 55.84 O
ATOM 1714 N GLU A 246 24.807 61.926 28.038 1.00 55.12 N
ATOM 1715 CA GLU A 246 24.814 60.528 28.473 1.00 54.57 C
ATOM 1716 CB GLU A 246 25.227 60.414 29.948 1.00 55.49 C
ATOM 1717 CG GLU A 246 26.247 61.439 30.419 1.00 59.92 C
ATOM 1718 CD GLU A 246 25.601 62.745 30.853 1.00 64.57 C
ATOM 1719 OE1 GLU A 246 24.864 62.732 31.873 1.00 66.43 O
ATOM 1720 OE2 GLU A 246 25.824 63.779 30.165 1.00 66.00 O
ATOM 1721 C GLU A 246 23.464 59.838 28.284 1.00 52.76 C
ATOM 1722 O GLU A 246 23.405 58.637 27.998 1.00 51.94 O
ATOM 1723 N GLU A 247 22.381 60.583 28.491 1.00 51.08 N
ATOM 1724 CA GLU A 247 21.037 60.031 28.289 1.00 50.00 C
ATOM 1725 CB GLU A 247 19.982 60.949 28.888 1.00 50.91 C
ATOM 1726 CG GLU A 247 20.048 61.069 30.398 1.00 54.76 C
ATOM 1727 CD GLU A 247 19.070 62.089 30.919 1.00 59.14 C
ATOM 1728 OE1 GLU A 247 19.189 63.281 30.568 1.00 61.88 O
ATOM 1729 OE2 GLU A 247 18.172 61.693 31.672 1.00 63.68 O
ATOM 1730 C GLU A 247 20.734 59.785 26.810 1.00 47.56 C
ATOM 1731 O GLU A 247 20.177 58.757 26.463 1.00 46.72 O
ATOM 1732 N ILE A 248 21.102 60.738 25.957 1.00 46.28 N
ATOM 1733 CA ILE A 248 20.964 60.598 24.498 1.00 46.12 C
ATOM 1734 CB ILE A 248 21.446 61.876 23.754 1.00 45.90 C
ATOM 1735 CG1 ILE A 248 20.599 63.092 24.141 1.00 44.91 C
ATOM 1736 CD1 ILE A 248 21.110 64.419 23.588 1.00 44.29 C
ATOM 1737 CG2 ILE A 248 21.444 61.658 22.233 1.00 45.48 C
ATOM 1738 C ILE A 248 21.741 59.390 23.988 1.00 46.47 C
ATOM 1739 O ILE A 248 21.221 58.613 23.199 1.00 46.50 O
ATOM 1740 N ILE A 249 22.977 59.223 24.462 1.00 46.70 N
ATOM 1741 CA ILE A 249 23.845 58.119 24.021 1.00 47.73 C
ATOM 1742 CB ILE A 249 25.315 58.342 24.516 1.00 48.27 C
ATOM 1743 CG1 ILE A 249 25.882 59.634 23.929 1.00 50.01 C
ATOM 1744 CD1 ILE A 249 27.162 60.114 24.638 1.00 54.07 C
ATOM 1745 CG2 ILE A 249 26.208 57.167 24.127 1.00 49.80 C
ATOM 1746 C ILE A 249 23.344 56.752 24.463 1.00 47.21 C
ATOM 1747 O ILE A 249 23.473 55.754 23.735 1.00 47.14 O
ATOM 1748 N ARG A 250 22.798 56.697 25.671 1.00 46.59 N
ATOM 1749 CA ARG A 250 22.259 55.454 26.197 1.00 46.70 C
ATOM 1750 CB ARG A 250 22.052 55.573 27.712 1.00 46.73 C
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ATOM 1752 CD ARG A 250 21.702 54.415 29.942 1.00 49.11 C
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ATOM 1763 N GLN A 252 17.921 55.067 26.290 1.00 46.77 N
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ATOM 1766 CG GLN A 252 16.745 52.797 29.034 1.00 53.27 C
ATOM 1767 CD GLN A 252 17.362 51.495 28.593 1.00 58.82 C
ATOM 1768 OE1 GLN A 252 16.922 50.902 27.587 1.00 62.58 O
ATOM 1769 NE2 GLN A 252 18.381 51.040 29.328 1.00 59.71 N
ATOM 1770 C GLN A 252 15.720 55.388 27.264 1.00 44.36 C
ATOM 1771 O GLN A 252 15.914 56.458 27.842 1.00 43.90 O
ATOM 1772 N VAL A 253 14.534 55.036 26.789 1.00 42.26 N
ATOM 1773 CA VAL A 253 13.366 55.917 26.887 1.00 41.30 C
ATOM 1774 CB VAL A 253 12.515 55.900 25.574 1.00 40.85 C
ATOM 1775 CG1 VAL A 253 11.398 56.917 25.657 1.00 41.13 C
ATOM 1776 CG2 VAL A 253 13.386 56.184 24.330 1.00 41.05 C
ATOM 1777 C VAL A 253 12.452 55.558 28.080 1.00 40.21 C
ATOM 1778 O VAL A 253 11.870 54.475 28.128 1.00 39.18 O
ATOM 1779 N PHE A 254 12.312 56.494 29.004 1.00 40.53 N
ATOM 1780 CA PHE A 254 11.415 56.340 30.147 1.00 41.30 C
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ATOM 1782 CG PHE A 254 11.181 56.979 32.597 1.00 45.89 C
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ATOM 1789 O PHE A 254 10.324 58.388 29.630 1.00 40.62 O
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ATOM 1795 CE1 PHE A 255 6.834 57.267 25.588 1.00 37.08 C
ATOM 1796 CZ PHE A 255 7.715 56.277 25.126 1.00 38.31 C
ATOM 1797 CE2 PHE A 255 8.251 55.353 26.034 1.00 37.42 C
ATOM 1798 CD2 PHE A 255 7.917 55.429 27.379 1.00 36.49 C
ATOM 1799 C PHE A 255 7.233 57.901 31.355 1.00 40.75 C
ATOM 1800 O PHE A 255 6.974 57.139 32.280 1.00 41.63 O
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ATOM 1805 CD ARG A 256 7.915 63.508 31.606 1.00 49.15 C
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ATOM 1810 C ARG A 256 5.096 60.051 32.658 1.00 43.59 C
ATOM 1811 O ARG A 256 4.525 60.251 33.724 1.00 44.72 O
ATOM 1812 N GLN A 257 4.454 59.930 31.498 1.00 42.63 N
ATOM 1813 CA GLN A 257 3.001 59.949 31.403 1.00 41.06 C
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ATOM 1816 CD GLN A 257 1.908 62.984 31.916 1.00 51.18 C
ATOM 1817 OE1 GLN A 257 0.693 62.917 31.711 1.00 52.75 O
ATOM 1818 NE2 GLN A 257 2.428 63.504 33.020 1.00 55.05 N
ATOM 1819 C GLN A 257 2.510 58.618 30.872 1.00 38.68 C
ATOM 1820 O GLN A 257 3.267 57.849 30.300 1.00 38.45 O
ATOM 1821 N ARG A 258 1.226 58.353 31.047 1.00 36.14 N
ATOM 1822 CA ARG A 258 0.614 57.177 30.479 1.00 36.06 C
ATOM 1823 CB ARG A 258 -0.820 57.048 30.997 1.00 34.77 C
ATOM 1824 CG ARG A 258 -1.402 55.659 30.847 1.00 39.04 C
ATOM 1825 CD ARG A 258 -1.624 55.230 29.442 1.00 40.99 C
ATOM 1826 NE ARG A 258 -1.799 53.789 29.300 1.00 40.39 N
ATOM 1827 CZ ARG A 258 -2.327 53.219 28.215 1.00 43.89 C
ATOM 1828 NH1 ARG A 258 -2.730 53.966 27.158 1.00 45.06 N
ATOM 1829 NH2 ARG A 258 -2.444 51.899 28.162 1.00 40.81 N
ATOM 1830 C ARG A 258 0.599 57.345 28.950 1.00 35.62 C
ATOM 1831 O ARG A 258 0.071 58.325 28.463 1.00 35.32 O
ATOM 1832 N VAL A 259 1.159 56.385 28.221 1.00 34.94 N
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ATOM 1835 CG1 VAL A 259 2.782 56.824 24.747 1.00 34.21 C
ATOM 1836 CG2 VAL A 259 2.902 58.365 26.752 1.00 33.65 C
ATOM 1837 C VAL A 259 0.967 55.033 26.235 1.00 35.77 C
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ATOM 1839 N SER A 260 0.055 54.901 25.267 1.00 35.24 N
ATOM 1840 CA SER A 260 -0.269 53.601 24.698 1.00 36.49 C
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ATOM 1842 OG SER A 260 -0.608 54.285 22.377 1.00 37.04 O
ATOM 1843 C SER A 260 0.973 52.855 24.226 1.00 37.15 C
ATOM 1844 O SER A 260 1.981 53.465 23.874 1.00 37.30 O
ATOM 1845 N SER A 261 0.876 51.533 24.178 1.00 37.42 N
ATOM 1846 CA SER A 261 2.000 50.701 23.767 1.00 37.73 C
ATOM 1847 CB SER A 261 1.659 49.225 23.941 1.00 38.27 C
ATOM 1848 OG SER A 261 1.475 48.939 25.316 1.00 42.42 O
ATOM 1849 C SER A 261 2.399 50.965 22.325 1.00 37.68 C
ATOM 1850 O SER A 261 3.578 50.914 21.997 1.00 36.60 O
ATOM 1851 N GLU A 262 1.413 51.260 21.478 1.00 37.69 N
ATOM 1852 CA GLU A 262 1.662 51.578 20.080 1.00 38.33 C
ATOM 1853 CB GLU A 262 0.343 51.655 19.307 1.00 40.07 C
ATOM 1854 CG GLU A 262 -0.522 50.401 19.444 1.00 47.46 C
ATOM 1855 CD GLU A 262 -1.138 49.954 18.125 1.00 55.14 C
ATOM 1856 OE1 GLU A 262 -1.716 50.811 17.407 1.00 58.98 O
ATOM 1857 OE2 GLU A 262 -1.058 48.740 17.799 1.00 59.70 O
ATOM 1858 C GLU A 262 2.469 52.878 19.945 1.00 36.65 C
ATOM 1859 O GLU A 262 3.442 52.911 19.227 1.00 36.27 O
ATOM 1860 N CYS A 263 2.073 53.931 20.651 1.00 35.34 N
ATOM 1861 CA CYS A 263 2.822 55.188 20.621 1.00 34.46 C
ATOM 1862 CB CYS A 263 2.051 56.272 21.363 1.00 34.30 C
ATOM 1863 SG CYS A 263 2.728 57.931 21.207 1.00 34.38 S
ATOM 1864 C CYS A 263 4.250 55.021 21.181 1.00 34.46 C
ATOM 1865 O CYS A 263 5.221 55.477 20.556 1.00 32.45 O
ATOM 1866 N GLN A 264 4.385 54.325 22.321 1.00 33.42 N
ATOM 1867 CA GLN A 264 5.715 54.008 22.859 1.00 33.11 C
ATOM 1868 CB GLN A 264 5.629 53.110 24.097 1.00 33.38 C
ATOM 1869 CG GLN A 264 5.022 53.781 25.364 1.00 35.44 C
ATOM 1870 CD GLN A 264 5.296 52.968 26.647 1.00 37.59 C
ATOM 1871 OE1 GLN A 264 6.162 52.098 26.655 1.00 39.41 O
ATOM 1872 NE2 GLN A 264 4.566 53.262 27.717 1.00 33.63 N
ATOM 1873 C GLN A 264 6.578 53.314 21.795 1.00 33.15 C
ATOM 1874 O GLN A 264 7.753 53.689 21.606 1.00 32.43 O
ATOM 1875 N HIS A 265 6.001 52.322 21.110 1.00 32.53 N
ATOM 1876 CA HIS A 265 6.710 51.575 20.068 1.00 34.99 C
ATOM 1877 CB HIS A 265 5.836 50.455 19.469 1.00 36.23 C
ATOM 1878 CG HIS A 265 6.515 49.687 18.369 1.00 39.71 C
ATOM 1879 ND1 HIS A 265 6.481 50.086 17.050 1.00 40.80 N
ATOM 1880 CE1 HIS A 265 7.189 49.244 16.314 1.00 42.05 C
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ATOM 1882 CD2 HIS A 265 7.286 48.570 18.402 1.00 42.81 C
ATOM 1883 C HIS A 265 7.226 52.508 18.968 1.00 34.14 C
ATOM 1884 O HIS A 265 8.410 52.463 18.613 1.00 34.55 O
ATOM 1885 N LEU A 266 6.355 53.372 18.445 1.00 32.99 N
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ATOM 1889 CD1 LEU A 266 6.584 55.619 14.605 1.00 30.32 C
ATOM 1890 CD2 LEU A 266 4.511 56.820 15.367 1.00 30.03 C
ATOM 1891 C LEU A 266 7.885 55.211 17.904 1.00 31.79 C
ATOM 1892 O LEU A 266 8.907 55.417 17.231 1.00 31.14 O
ATOM 1893 N ILE A 267 7.706 55.750 19.112 1.00 31.36 N
ATOM 1894 CA ILE A 267 8.702 56.661 19.666 1.00 30.41 C
ATOM 1895 CB ILE A 267 8.273 57.184 21.052 1.00 29.95 C
ATOM 1896 CG1 ILE A 267 7.134 58.210 20.924 1.00 30.35 C
ATOM 1897 CD1 ILE A 267 6.410 58.513 22.271 1.00 30.22 C
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ATOM 1900 O ILE A 267 11.093 56.485 19.340 1.00 32.22 O
ATOM 1901 N ARG A 268 10.034 54.774 20.388 1.00 32.17 N
ATOM 1902 CA ARG A 268 11.248 53.988 20.594 1.00 34.65 C
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ATOM 1910 C ARG A 268 11.921 53.622 19.278 1.00 34.22 C
ATOM 1911 O ARG A 268 13.140 53.491 19.223 1.00 34.73 O
ATOM 1912 N TRP A 269 11.124 53.464 18.225 1.00 34.43 N
ATOM 1913 CA TRP A 269 11.649 53.135 16.889 1.00 34.10 C
ATOM 1914 CB TRP A 269 10.503 52.657 15.992 1.00 34.69 C
ATOM 1915 CG TRP A 269 10.921 52.008 14.716 1.00 36.80 C
ATOM 1916 CD1 TRP A 269 12.191 51.632 14.352 1.00 39.30 C
ATOM 1917 NE1 TRP A 269 12.182 51.081 13.090 1.00 38.76 N
ATOM 1918 CE2 TRP A 269 10.895 51.071 12.618 1.00 37.50 C
ATOM 1919 CD2 TRP A 269 10.074 51.669 13.609 1.00 36.90 C
ATOM 1920 CE3 TRP A 269 8.703 51.787 13.359 1.00 35.95 C
ATOM 1921 CZ3 TRP A 269 8.197 51.332 12.136 1.00 37.55 C
ATOM 1922 CH2 TRP A 269 9.047 50.765 11.172 1.00 36.64 C
ATOM 1923 CZ2 TRP A 269 10.392 50.618 11.401 1.00 36.32 C
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ATOM 1943 C ALA A 272 18.191 54.460 17.658 1.00 37.13 C
ATOM 1944 O ALA A 272 18.436 55.466 16.996 1.00 36.83 O
ATOM 1945 N LEU A 273 19.087 53.886 18.447 1.00 38.00 N
ATOM 1946 CA LEU A 273 20.464 54.378 18.537 1.00 39.46 C
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ATOM 1948 CG LEU A 273 20.990 53.795 21.011 1.00 40.61 C
ATOM 1949 CD1 LEU A 273 21.923 52.966 21.914 1.00 40.75 C
ATOM 1950 CD2 LEU A 273 21.174 55.277 21.304 1.00 39.54 C
ATOM 1951 C LEU A 273 21.146 54.350 17.168 1.00 40.47 C
ATOM 1952 O LEU A 273 21.742 55.331 16.747 1.00 40.46 O
ATOM 1953 N ARG A 274 21.051 53.225 16.470 1.00 41.49 N
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ATOM 1956 CG ARG A 274 22.917 50.943 15.665 1.00 51.46 C
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ATOM 1964 N PRO A 275 21.325 54.807 13.409 1.00 41.48 N
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ATOM 1968 CD PRO A 275 22.693 55.340 13.546 1.00 41.06 C
ATOM 1969 C PRO A 275 19.784 54.624 11.429 1.00 41.71 C
ATOM 1970 O PRO A 275 18.633 54.932 11.132 1.00 39.61 O
ATOM 1971 N SER A 276 20.393 53.516 10.993 1.00 41.90 N
ATOM 1972 CA SER A 276 19.774 52.587 10.040 1.00 42.57 C
ATOM 1973 CB SER A 276 20.831 51.624 9.446 1.00 43.08 C
ATOM 1974 OG SER A 276 21.290 50.683 10.419 1.00 45.84 O
ATOM 1975 C SER A 276 18.597 51.799 10.613 1.00 41.74 C
ATOM 1976 O SER A 276 17.786 51.287 9.845 1.00 42.39 O
ATOM 1977 N ASP A 277 18.497 51.696 11.942 1.00 40.48 N
ATOM 1978 CA ASP A 277 17.344 51.038 12.575 1.00 39.45 C
ATOM 1979 CB ASP A 277 17.676 50.520 13.981 1.00 40.14 C
ATOM 1980 CG ASP A 277 18.671 49.374 13.974 1.00 41.45 C
ATOM 1981 OD1 ASP A 277 18.697 48.577 13.010 1.00 43.47 O
ATOM 1982 OD2 ASP A 277 19.471 49.221 14.915 1.00 43.49 O
ATOM 1983 C ASP A 277 16.102 51.946 12.676 1.00 38.59 C
ATOM 1984 O ASP A 277 15.010 51.486 13.014 1.00 37.61 O
ATOM 1985 N ARG A 278 16.269 53.227 12.364 1.00 37.09 N
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ATOM 1989 CD ARG A 278 17.017 57.225 13.957 1.00 35.33 C
ATOM 1990 NE ARG A 278 18.119 57.186 14.913 1.00 35.31 N
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ATOM 1995 O ARG A 278 14.687 53.610 10.156 1.00 36.69 O
ATOM 1996 N PRO A 279 12.936 54.275 11.421 1.00 35.45 N
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ATOM 2001 C PRO A 279 12.174 55.322 9.311 1.00 35.53 C
ATOM 2002 O PRO A 279 12.784 56.354 9.626 1.00 35.63 O
ATOM 2003 N THR A 280 11.661 55.107 8.101 1.00 34.84 N
ATOM 2004 CA THR A 280 11.618 56.145 7.079 1.00 34.43 C
ATOM 2005 CB THR A 280 11.509 55.513 5.683 1.00 34.63 C
ATOM 2006 OG1 THR A 280 10.344 54.690 5.655 1.00 34.43 O
ATOM 2007 CG2 THR A 280 12.712 54.555 5.379 1.00 35.88 C
ATOM 2008 C THR A 280 10.334 56.900 7.337 1.00 34.28 C
ATOM 2009 O THR A 280 9.5015 6.458 8.120 1.00 33.22 O
ATOM 2010 N PHE A 281 10.129 58.012 6.637 1.00 35.30 N
ATOM 2011 CA PHE A 281 8.893 58.771 6.797 1.00 35.82 C
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ATOM 2013 CG PHE A 281 9.984 61.009 6.223 1.00 38.29 C
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ATOM 2015 CE1 PHE A 281 11.320 62.234 7.823 1.00 39.73 C
ATOM 2016 CZ PHE A 281 11.968 62.874 6.810 1.00 41.57 C
ATOM 2017 CE2 PHE A 281 11.621 62.608 5.483 1.00 43.04 C
ATOM 2018 CD2 PHE A 281 10.633 61.681 5.200 1.00 41.16 C
ATOM 2019 C PHE A 281 7.690 57.894 6.477 1.00 36.17 C
ATOM 2020 O PHE A 281 6.671 57.924 7.179 1.00 35.36 O
ATOM 2021 N GLU A 282 7.815 57.101 5.414 1.00 35.33 N
ATOM 2022 CA GLU A 282 6.741 56.194 4.992 1.00 35.04 C
ATOM 2023 CB GLU A 282 7.154 55.461 3.700 1.00 35.95 C
ATOM 2024 CG GLU A 282 6.092 54.530 3.141 1.00 38.88 C
ATOM 2025 CD GLU A 282 6.504 53.872 1.819 1.00 42.76 C
ATOM 2026 OE1 GLU A 282 7.654 54.056 1.362 1.00 43.67 O
ATOM 2027 OE2 GLU A 282 5.654 53.182 1.233 1.00 43.19 O
ATOM 2028 C GLU A 282 6.385 55.199 6.084 1.00 34.27 C
ATOM 2029 O GLU A 282 5.209 54.986 6.378 1.00 34.51 O
ATOM 2030 N GLU A 283 7.397 54.594 6.693 1.00 34.18 N
ATOM 2031 CA GLU A 283 7.194 53.640 7.795 1.00 34.58 C
ATOM 2032 CB GLU A 283 8.512 53.012 8.208 1.00 35.26 C
ATOM 2033 CG GLU A 283 9.077 52.096 7.131 1.00 38.60 C
ATOM 2034 CD GLU A 283 10.406 51.501 7.502 1.00 40.02 C
ATOM 2035 OE1 GLU A 283 11.340 52.257 7.832 1.00 41.52 O
ATOM 2036 OE2 GLU A 283 10.517 50.266 7.435 1.00 44.14 O
ATOM 2037 C GLU A 283 6.524 54.259 9.014 1.00 33.96 C
ATOM 2038 O GLU A 283 5.700 53.614 9.674 1.00 33.93 O
ATOM 2039 N ILE A 284 6.859 55.517 9.298 1.00 33.26 N
ATOM 2040 CA ILE A 284 6.204 56.233 10.401 1.00 31.63 C
ATOM 2041 CB ILE A 284 6.889 57.590 10.650 1.00 31.52 C
ATOM 2042 CG1 ILE A 284 8.282 57.373 11.252 1.00 29.17 C
ATOM 2043 CD1 ILE A 284 9.195 58.585 11.190 1.00 32.09 C
ATOM 2044 CG2 ILE A 284 6.002 58.489 11.602 1.00 29.23 C
ATOM 2045 C ILE A 284 4.732 56.430 10.089 1.00 31.80 C
ATOM 2046 O ILE A 284 3.856 56.165 10.917 1.00 31.97 O
ATOM 2047 N GLN A 285 4.451 56.917 8.886 1.00 32.64 N
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ATOM 2049 CB GLN A 285 3.022 58.099 7.280 1.00 32.86 C
ATOM 2050 CG GLN A 285 3.373 59.566 7.613 1.00 32.93 C
ATOM 2051 CD GLN A 285 3.056 60.507 6.485 1.00 35.30 C
ATOM 2052 OE1 GLN A 285 3.637 60.401 5.395 1.00 34.32 O
ATOM 2053 NE2 GLN A 285 2.122 61.423 6.725 1.00 33.69 N
ATOM 2054 C GLN A 285 2.239 55.948 8.334 1.00 33.74 C
ATOM 2055 O GLN A 285 1.021 55.996 8.454 1.00 34.52 O
ATOM 2056 N ASN A 286 2.889 54.816 8.084 1.00 34.59 N
ATOM 2057 CA ASN A 286 2.165 53.533 8.016 1.00 36.22 C
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ATOM 2059 CG ASN A 286 2.450 53.042 5.553 1.00 37.57 C
ATOM 2060 OD1 ASN A 286 1.397 53.611 5.283 1.00 37.74 O
ATOM 2061 ND2 ASN A 286 3.373 52.785 4.642 1.00 39.91 N
ATOM 2062 C ASN A 286 2.079 52.805 9.360 1.00 36.58 C
ATOM 2063 O ASN A 286 1.432 51.767 9.466 1.00 37.11 O
ATOM 2064 N HIS A 287 2.723 53.356 10.384 1.00 36.48 N
ATOM 2065 CA HIS A 287 2.677 52.771 11.717 1.00 36.00 C
ATOM 2066 CB HIS A 287 3.525 53.596 12.697 1.00 35.69 C
ATOM 2067 CG HIS A 287 3.703 52.938 14.029 1.00 33.97 C
ATOM 2068 ND1 HIS A 287 4.826 52.211 14.359 1.00 35.79 N
ATOM 2069 CE1 HIS A 287 4.706 51.749 15.592 1.00 34.10 C
ATOM 2070 NE2 HIS A 287 3.537 52.138 16.066 1.00 36.32 N
ATOM 2071 CD2 HIS A 287 2.888 52.875 15.103 1.00 33.02 C
ATOM 2072 C HIS A 287 1.238 52.724 12.223 1.00 36.98 C
ATOM 2073 O HIS A 287 0.475 53.663 11.985 1.00 36.67 O
ATOM 2074 N PRO A 288 0.870 51.638 12.909 1.00 37.63 N
ATOM 2075 CA PRO A 288 -0.465 51.480 13.468 1.00 38.40 C
ATOM 2076 CB PRO A 288 -0.318 50.203 14.315 1.00 39.46 C
ATOM 2077 CG PRO A 288 0.684 49.420 13.576 1.00 40.31 C
ATOM 2078 CD PRO A 288 1.699 50.447 13.174 1.00 38.01 C
ATOM 2079 C PRO A 288 -0.936 52.652 14.325 1.00 37.78 C
ATOM 2080 O PRO A 288 -2.096 53.024 14.227 1.00 38.92 O
ATOM 2081 N TRP A 289 -0.062 53.231 15.143 1.00 37.99 N
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ATOM 2101 C MET A 290 -1.973 56.787 12.186 1.00 41.20 C
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ATOM 2105 CB GLN A 291 -4.294 54.031 11.420 1.00 46.70 C
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ATOM 2111 O GLN A 291 -5.165 56.708 13.177 1.00 45.87 O
ATOM 2112 N ASP A 292 -6.064 56.590 11.100 1.00 46.07 N
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ATOM 2115 CG ASP A 292 -8.324 55.099 12.018 1.00 52.03 C
ATOM 2116 OD1 ASP A 292 -8.714 54.836 10.858 1.00 54.96 O
ATOM 2117 OD2 ASP A 292 -8.031 54.164 12.805 1.00 56.19 O
ATOM 2118 C ASP A 292 -7.071 58.739 11.961 1.00 45.48 C
ATOM 2119 O ASP A 292 -7.779 59.181 12.880 1.00 44.34 O
ATOM 2120 N VAL A 293 -6.067 59.433 11.424 1.00 44.87 N
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ATOM 2123 CG1 VAL A 293 -4.791 61.662 9.735 1.00 44.77 C
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ATOM 2126 O VAL A 293 -7.658 61.532 10.653 1.00 45.74 O
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ATOM 2149 O PRO A 296 -8.280 70.739 12.474 1.00 47.68 O
ATOM 2150 N GLN A 297 -9.335 70.684 10.480 1.00 50.01 N
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ATOM 2153 CG GLN A 297 -12.552 72.781 10.298 1.00 55.96 C
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ATOM 2159 N GLI A 298 -11.292 69.234 12.034 1.00 51.63 N
ATOM 2160 CA GLU A 298 -11.819 68.391 13.108 1.00 51.67 C
ATOM 2161 CB GLU A 298 -11.714 66.922 12.736 1.00 52.61 C
ATOM 2162 CG GLU A 298 -12.716 66.406 11.732 1.00 56.45 C
ATOM 2163 CD GLU A 298 -12.568 64.908 11.552 1.00 60.37 C
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ATOM 2165 OE2 GLU A 298 -13.403 64.160 12.112 1.00 63.66 O
ATOM 2166 C GLU A 298 -10.991 68.586 14.372 1.00 50.78 C
ATOM 2167 O GLU A 298 -11.523 68.666 15.490 1.00 50.03 O
ATOM 2168 N THR A 299 -9.676 68.624 14.186 1.00 49.28 N
ATOM 2169 CA THR A 299 -8.756 68.812 15.291 1.00 48.32 C
ATOM 2170 CB THR A 299 -7.310 68.855 14.781 1.00 48.02 C
ATOM 2171 OG1 THR A 299 -7.007 67.636 14.096 1.00 45.02 O
ATOM 2172 CG2 THR A 299 -6.324 68.910 15.951 1.00 47.18 C
ATOM 2173 C THR A 299 -9.072 70.095 16.040 1.00 48.76 C
ATOM 2174 O THR A 299 -9.135 70.101 17.268 1.00 47.62 O
ATOM 2175 N ALA A 300 -9.252 71.181 15.293 1.00 49.46 N
ATOM 2176 CA ALA A 300 -9.540 72.468 15.887 1.00 50.94 C
ATOM 2177 CB ALA A 300 -9.541 73.556 14.820 1.00 50.83 C
ATOM 2178 C ALA A 300 -10.875 72.438 16.664 1.00 51.99 C
ATOM 2179 O ALA A 300 -10.961 72.940 17.793 1.00 51.96 O
ATOM 2180 N GLU A 301 -11.896 71.832 16.064 1.00 53.05 N
ATOM 2181 CA GLU A 301 -13.218 71.757 16.689 1.00 54.49 C
ATOM 2182 CB GLU A 301 -14.220 71.094 15.754 1.00 55.03 C
ATOM 2183 CG GLU A 301 -14.926 72.073 14.831 1.00 58.47 C
ATOM 2184 CD GLU A 301 -15.129 71.518 13.429 1.00 61.94 C
ATOM 2185 OE1 GLU A 301 -15.418 70.303 13.287 1.00 62.49 O
ATOM 2186 OE2 GLU A 301 -15.006 72.306 12.459 1.00 64.87 O
ATOM 2187 C GLU A 301 -13.177 71.018 18.026 1.00 54.40 C
ATOM 2188 O GLU A 301 -13.652 71.536 19.048 1.00 54.62 O
ATOM 2189 N ILE A 302 -12.581 69.826 18.011 1.00 54.14 N
ATOM 2190 CA ILE A 302 -12.487 68.970 19.196 1.00 53.52 C
ATOM 2191 CB ILE A 302 -12.124 67.529 18.791 1.00 53.66 C
ATOM 2192 CG1 ILE A 302 -13.150 66.981 17.795 1.00 53.26 C
ATOM 2193 CD1 ILE A 302 -12.813 65.609 17.254 1.00 52.59 C
ATOM 2194 CG2 ILE A 302 -12.047 66.624 20.026 1.00 53.65 C
ATOM 2195 C ILE A 302 -11.496 69.462 20.246 1.00 53.50 C
ATOM 2196 O ILE A 302 -11.800 69.422 21.440 1.00 53.33 O
ATOM 2197 N HIS A 303 -10.322 69.937 19.822 1.00 53.16 N
ATOM 2198 CA HIS A 303 -9.258 70.220 20.793 1.00 53.02 C
ATOM 2199 CB HIS A 303 -8.018 69.390 20.459 1.00 51.63 C
ATOM 2200 CG HIS A 303 -8.212 67.926 20.680 1.00 47.34 C
ATOM 2201 ND1 HIS A 303 -8.396 67.043 19.640 1.00 45.24 N
ATOM 2202 CE1 HIS A 303 -8.540 65.822 20.119 1.00 42.60 C
ATOM 2203 NE2 HIS A 303 -8.456 65.883 21.437 1.00 42.67 N
ATOM 2204 CD2 HIS A 303 -8.251 67.188 21.815 1.00 43.90 C
ATOM 2205 C HIS A 303 -8.861 71.671 20.960 1.00 54.55 C
ATOM 2206 O HIS A 303 -8.265 72.036 21.979 1.00 54.31 O
ATOM 2207 N LEU A 304 -9.168 72.500 19.966 1.00 56.55 N
ATOM 2208 CA LEU A 304 -8.696 73.876 19.999 1.00 59.36 C
ATOM 2209 CB LEU A 304 -7.967 74.211 18.701 1.00 58.46 C
ATOM 2210 CG LEU A 304 -6.479 73.870 18.549 1.00 58.16 C
ATOM 2211 CD1 LEU A 304 -6.026 72.669 19.390 1.00 55.35 C
ATOM 2212 CD2 LEU A 304 -6.160 73.653 17.061 1.00 56.12 C
ATOM 2213 C LEU A 304 -9.832 74.873 20.273 1.00 62.12 C
ATOM 2214 O LEU A 304 -9.586 76.067 20.431 1.00 62.18 O
ATOM 2215 N HIS A 305 -11.061 74.361 20.340 1.00 65.89 N
ATOM 2216 CA HIS A 305 -12.278 75.150 20.571 1.00 69.84 C
ATOM 2217 CB HIS A 305 -12.201 75.963 21.884 1.00 70.73 C
ATOM 2218 CG HIS A 305 -11.780 75.138 23.069 1.00 74.80 C
ATOM 2219 ND1 HIS A 305 -12.611 74.206 23.664 1.00 77.77 N
ATOM 2220 CE1 HIS A 305 -11.976 73.629 24.674 1.00 78.93 C
ATOM 2221 NE2 HIS A 305 -10.760 74.149 24.753 1.00 79.02 N
ATOM 2222 CD2 HIS A 305 -10.611 75.093 23.760 1.00 77.72 C
ATOM 2223 C HIS A 305 -12.591 76.047 19.382 1.00 71.35 C
ATOM 2224 O HIS A 305 -12.458 77.272 19.463 1.00 72.07 O
ATOM 2225 N SER A 306 -12.998 75.426 18.275 1.00 73.04 N
ATOM 2226 CA SER A 306 -13.372 76.161 17.066 1.00 74.54 C
ATOM 2227 CB SER A 306 -12.563 75.685 15.850 1.00 74.28 C
ATOM 2228 OG SER A 306 -11.270 76.309 15.843 1.00 74.68 O
ATOM 2229 C SER A 306 -14.878 76.061 16.804 1.00 75.41 C
ATOM 2230 O SER A 306 -15.588 77.080 16.858 1.00 76.03 O
ATOM 2231 OXT SER A 306 -15.397 74.966 16.542 1.00 75.98 O
ATOM 2232 N3 IMD I 1 8.128 71.298 26.439 1.00 62.13 N
ATOM 2233 C4 IMD I 1 8.441 71.428 27.755 1.00 62.64 C
ATOM 2234 C5 IMD I 1 7.731 72.513 28.267 1.00 61.10 C
ATOM 2235 C2 IMD I 1 7.245 72.276 26.125 1.00 61.77 C
ATOM 2236 N1 IMD I 1 7.001 73.016 27.242 1.00 61.00 N
ATOM 2237 O HOH W 1 -0.732 54.528 9.728 1.00 45.36 O
ATOM 2238 O HOH W 2 19.630 58.716 6.576 1.00 43.01 O
ATOM 2239 O HOH W 3 0.310 61.264 2.849 1.00 32.73 O
ATOM 2240 O HOH W 4 18.440 64.206 21.527 1.00 32.96 O
ATOM 2241 O HOH W 5 12.988 80.668 8.424 1.00 39.01 O
ATOM 2242 O HOH W 6 -1.368 51.617 30.489 1.00 40.35 O
ATOM 2243 O HOH W 7 16.488 75.633 10.896 1.00 39.22 O
ATOM 2244 O HOH W 8 22.715 62.695 4.286 1.00 41.65 O
ATOM 2245 O HOH W 9 15.546 67.975 9.969 1.00 34.80 O
ATOM 2246 O HOH W 10 9.873 57.733 3.200 1.00 34.66 O
ATOM 2247 O HOH W 11 22.041 77.197 8.223 1.00 59.58 O
ATOM 2248 O HOH W 12 13.921 68.295 7.801 1.00 43.48 O
ATOM 2249 O HOH W 13 -2.001 49.454 29.335 1.00 40.96 O
ATOM 2250 O HOH W 14 22.261 59.914 10.882 1.00 37.32 O
ATOM 2251 O HOH W 15 19.419 50.734 16.966 1.00 40.82 O
ATOM 2252 O HOH W 16 15.338 57.159 9.022 1.00 39.03 O
ATOM 2253 O HOH W 17 17.961 66.549 9.882 1.00 39.50 O
ATOM 2254 O HOH W 18 4.818 76.341 0.545 1.00 44.94 O
ATOM 2255 O HOH W 19 8.855 79.196 7.518 1.00 39.17 O
ATOM 2256 O HOH W 20 17.072 54.130 21.844 1.00 43.20 O
ATOM 2257 O HOH W 21 1.325 69.587 7.110 1.00 36.36 O
ATOM 2258 O HOH W 22 8.150 61.656 1.220 1.00 40.26 O
ATOM 2259 O HOH W 23 -4.435 66.666 10.979 1.00 43.16 O
ATOM 2260 O HOH W 24 10.513 80.713 9.117 1.00 42.28 O
ATOM 2261 O HOH W 25 15.497 65.164 24.557 1.00 34.79 O
ATOM 2262 O HOH W 26 9.900 52.831 3.589 1.00 42.40 O
ATOM 2263 O HOH W 27 -0.200 71.719 8.387 1.00 41.34 O
ATOM 2264 O HOH W 28 -7.398 59.982 15.551 1.00 40.20 O
ATOM 2265 O HOH W 29 3.492 81.322 21.013 1.00 47.98 O
ATOM 2266 O HOH W 30 -4.714 67.425 25.026 1.00 43.45 O
ATOM 2267 O HOH W 31 15.251 68.122 12.673 1.00 36.68 O
ATOM 2268 O HOH W 32 -5.709 62.260 15.119 1.00 39.90 O
ATOM 2269 O HOH W 33 4.553 83.955 11.446 1.00 45.99 O
ATOM 2270 O HOH W 34 18.791 57.169 28.057 1.00 43.68 O
ATOM 2271 O HOH W 35 18.231 65.464 14.872 1.00 37.87 O
ATOM 2272 O HOH W 36 8.971 53.789 30.860 1.00 43.70 O
ATOM 2273 O HOH W 37 5.180 50.983 9.900 1.00 39.96 O
ATOM 2274 O HOH W 38 -4.081 60.211 25.479 1.00 43.04 O
ATOM 2275 O HOH W 39 -1.650 50.298 24.953 1.00 50.05 O
ATOM 2276 O HOH W 40 -0.323 79.686 2.181 1.00 64.08 O
ATOM 2277 O HOH W 41 -4.014 58.332 9.232 1.00 45.77 O
ATOM 2278 O HOH W 42 10.273 50.306 18.899 1.00 43.91 O
ATOM 2279 O HOH W 43 16.890 54.883 8.955 1.00 43.73 O
ATOM 2280 O HOH W 44 3.730 65.993 2.097 1.00 44.04 O
ATOM 2281 O HOH W 45 23.972 70.563 2.275 1.00 40.95 O
ATOM 2282 O HOH W 46 24.633 58.602 10.052 1.00 42.68 O
ATOM 2283 O HOH W 47 19.828 61.618 4.358 1.00 51.38 O
ATOM 2284 O HOH W 48 22.517 90.823 15.952 1.00 70.96 O
ATOM 2285 O HOH W 49 29.354 60.921 3.167 1.00 57.58 O
ATOM 2286 O HOH W 50 11.468 82.369 12.289 1.00 50.02 O
ATOM 2287 O HOH W 51 24.772 62.519 -4.121 1.00 45.22 O
ATOM 2288 O HOH W 52 3.211 68.554 31.582 1.00 69.57 O
ATOM 2289 O HOH W 53 7.936 50.002 23.124 1.00 47.40 O
ATOM 2290 O HOH W 54 15.587 71.212 17.046 1.00 52.35 O
ATOM 2291 O HOH W 55 15.884 79.008 -3.580 1.00 56.72 O
ATOM 2292 O HOH W 56 25.279 56.110 10.230 1.00 44.21 O
ATOM 2293 O HOH W 57 12.514 58.767 4.837 1.00 52.23 O
ATOM 2294 O HOH W 58 1.688 78.234 4.543 1.00 43.74 O
ATOM 2295 O HOH W 59 9.018 82.803 11.168 1.00 50.76 O
ATOM 2296 O HOH W 60 -0.217 85.742 6.096 1.00 53.93 O
ATOM 2297 O HOH W 61 -2.930 82.309 21.772 1.00 58.06 O
ATOM 2298 O HOH W 62 5.504 51.225 5.130 1.00 48.90 O
ATOM 2299 O HOH W 63 20.076 54.469 7.350 1.00 61.18 O
ATOM 2300 O HOH W 64 5.722 68.809 -1.934 1.00 59.42 O
ATOM 2301 O HOH W 65 27.882 66.292 -1.512 1.00 65.79 O
ATOM 2302 O HOH W 66 19.676 72.153 23.229 1.00 61.17 O
ATOM 2303 O HOH W 67 -5.501 71.414 5.301 1.00 61.16 O
ATOM 2304 O HOH W 68 15.016 58.056 6.473 1.00 49.90 O
ATOM 2305 O HOH W 69 -2.012 55.730 6.130 1.00 56.99 O
ATOM 2306 O HOH W 70 -9.447 70.188 7.682 1.00 57.22 O
ATOM 2307 O HOH W 71 2.484 55.120 -0.038 1.00 49.25 O
ATOM 2308 O HOH W 72 -7.908 59.237 8.479 1.00 65.73 O
ATOM 2309 O HOH W 73 22.353 73.255 11.764 1.00 60.74 O
ATOM 2310 O HOH W 74 19.477 67.324 11.857 1.00 50.67 O
ATOM 2311 O HOH W 75 14.506 47.970 13.280 1.00 62.36 O
ATOM 2312 O HOH W 76 16.862 47.807 8.768 1.00 52.55 O
ATOM 2313 O HOH W 77 13.313 53.083 32.098 1.00 54.43 O
ATOM 2314 O HOH W 78 17.503 50.798 19.041 1.00 55.72 O
ATOM 2315 O HOH W 79 -12.736 62.094 18.189 1.00 53.56 O
ATOM 2316 O HOH W 80 33.908 62.979 10.712 1.00 63.79 O
ATOM 2317 O HOH W 81 -6.870 60.605 22.628 1.00 49.67 O
ATOM 2318 O HOH W 82 9.987 47.582 14.046 1.00 66.52 O
ATOM 2319 O HOH W 83 23.183 73.287 2.510 1.00 52.15 O
ATOM 2320 O HOH W 84 27.578 55.770 9.060 1.00 63.00 O
ATOM 2321 O HOH W 85 5.576 82.970 -1.748 1.00 62.58 O
ATOM 2322 O HOH W 86 -0.509 84.330 3.857 1.00 59.32 O
ATOM 2323 O HOH W 87 13.665 91.473 -3.552 1.00 61.08 O
ATOM 2324 O HOH W 88 -2.861 75.397 -2.038 1.00 63.22 O
ATOM 2325 O HOH W 89 10.204 73.979 29.790 1.00 66.32 O
ATOM 2326 O HOH W 90 20.070 78.983 6.971 1.00 67.67 O
ATOM 2327 O HOH W 91 17.169 77.347 21.910 1.00 65.17 O
ATOM 2328 O HOH W 92 -2.870 53.045 18.163 1.00 59.47 O
ATOM 2329 O HOH W 93 11.627 71.628 23.440 1.00 63.19 O
ATOM 2330 O HOH W 94 8.310 74.960 -2.678 1.00 55.47 O
ATOM 2331 O HOH W 95 -12.002 78.851 4.304 1.00 58.94 O
ATOM 2332 O HOH W 96 5.566 49.157 22.796 1.00 51.78 O
ATOM 2333 O HOH W 97 31.358 61.478 0.597 1.00 66.61 O
ATOM 2334 O HOH W 98 24.035 64.093 -2.091 1.00 47.25 O
ATOM 2335 O HOH W 99 11.294 69.111 34.295 1.00 70.13 O
ATOM 2336 O HOH W 100 18.999 64.123 -2.168 1.00 62.14 O
ATOM 2337 O HOH W 101 -9.739 61.493 7.698 1.00 82.68 O
ATOM 2338 O HOH W 102 22.435 52.025 25.439 1.00 54.62 O
ATOM 2339 O HOH W 103 5.045 49.276 12.114 1.00 55.83 O
ATOM 2340 O HOH W 104 -3.965 50.524 12.224 1.00 62.13 O
ATOM 2341 O HOH W 105 13.472 75.945 26.250 1.00 61.94 O
ATOM 2342 O HOH W 106 15.560 72.156 26.297 1.00 58.39 O
ATOM 2343 O HOH W 107 -0.195 96.034 19.635 1.00 69.60 O
ATOM 2344 O HOH W 108 1.243 88.090 -4.031 1.00 62.22 O
ATOM 2345 O HOH W 109 19.973 83.759 20.585 1.00 71.41 O
ATOM 2346 O HOH W 110 -8.152 73.486 8.288 1.00 53.47 O
ATOM 2347 O HOH W 111 23.420 81.722 9.233 1.00 71.36 O
ATOM 2348 O HOH W 112 1.596 82.691 -0.096 1.00 71.76 O
ATOM 2349 O HOH W 113 5.657 56.059 -1.336 1.00 64.94 O
ATOM 2350 O HOH W 114 13.967 51.575 8.374 1.00 51.56 O
ATOM 2351 O HOH W 115 12.416 78.389 25.200 1.00 66.19 O
ATOM 2352 O HOH W 116 17.235 83.392 11.447 1.00 52.25 O
ATOM 2353 O HOH W 117 14.767 52.852 21.314 1.00 47.79 O
ATOM 2354 O HOH W 118 19.075 60.231 -4.028 1.00 64.68 O
ATOM 2355 O HOH W 119 25.476 66.800 28.823 1.00 55.96 O
ATOM 2356 O HOH W 120 4.473 70.021 30.020 1.00 56.80 O
ATOM 2357 O HOH W 121 8.400 80.051 18.580 1.00 47.86 O
ATOM 2358 O HOH W 122 -0.274 81.374 6.467 1.00 70.59 O
ATOM 2359 O HOH W 123 8.016 51.083 3.826 1.00 50.11 O
ATOM 2360 O HOH W 124 -5.762 55.323 8.603 1.00 59.77 O
ATOM 2361 O HOH W 125 24.801 94.210 -1.115 1.00 67.33 O
ATOM 2362 O HOH W 126 9.710 48.669 26.328 1.00 63.06 O
ATOM 2363 O HOH W 127 8.684 99.063 14.167 1.00 63.47 O
ATOM 2364 O HOH W 128 19.451 83.648 8.511 1.00 51.41 O
ATOM 2365 O HOH W 129 -10.889 61.955 10.215 1.00 55.28 O
ATOM 2366 O HOH W 130 -4.253 61.866 27.652 1.00 61.67 O
ATOM 2367 O HOH W 131 27.030 90.340 3.848 1.00 80.85 O
ATOM 2368 O HOH W 132 10.977 87.131 22.623 1.00 65.06 O
ATOM 2369 O HOH W 133 14.634 65.394 -2.521 1.00 56.18 O
ATOM 2370 O HOH W 134 -3.405 52.808 20.692 1.00 57.93 O
ATOM 2371 O HOH W 135 -5.420 55.451 15.525 1.00 51.90 O
ATOM 2372 O HOH W 136 8.056 79.671 22.675 1.00 59.54 O
ATOM 2373 O HOH W 137 28.392 57.786 4.755 1.00 78.57 O
ATOM 2374 O HOH W 138 18.312 99.689 9.767 1.00 61.28 O
ATOM 2375 O HOH W 139 33.446 63.253 17.723 1.00 59.53 O
ATOM 2376 O HOH W 140 24.283 56.206 17.474 1.00 54.00 O
ATOM 2377O HOH W 141 16.808 50.392 32.500 1.00 57.59 O
ATOM 2378O HOH W 142 15.746 83.812 -7.461 1.00 64.85 O
ATOM 2379O HOH W 143 -7.082 94.424 -2.169 1.00 67.76 O
ATOM 2380O HOH W 144 13.631 49.312 10.749 1.00 54.19 O
ATOM 2381O HOH W 145 30.247 61.193 23.440 1.00 71.27 O
ATOM 2382O HOH W 146 13.010 80.075 -6.528 1.00 68.99 O
表2PIM家族激酶的序列比对
在上述比对中,来自下述物种的序列被包括在内:Hs,人(Homo sapiens);Mm,小家鼠(Mus musculus);Dr,斑马鱼(Danio rerio);XI,非洲爪蟾(Xenopus Iaevis);Cc,Cotumix cotumix;和,Ce,线虫(Caenorhabditis elegans)。保守性大于90%或者75%的残基分别是红色和黄色的。磷酸结合位点用紫色圆圈表示。不变地涉入配基结合作用的残基以填充的向上的箭头表示,而可能涉入配基结合作用的残基用空的向上的箭头表示。处于铰链区域的两个残基的骨架原子(用左向箭头表示)已经被示出,在许多激酶/配基复合结构中形成氢键连接配基。注意:PIM家族激酶都是以Pro作为第二个残基,导致一个氢键供体的丧失。
表3
表4
HEAD ---- XX-XXX-XX xxxx
COMPND ---
REMARK 3
REMARK 3 REFINEMENT.
REMARK 3 PROGRAM :REFMAC 5.1.21
REMARK 3 AUTHORS :MURSHUDOV,VAGIN,DODSON
REMARK 3
REMARK 3 REFINEMENT TARGET:MAXIMUM LIKELIHOOD
REMARK 3
REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH(ANGSTROMS):2.03
REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS):81.65
REMARK 3 DATA CUTOFF (SIGMA(F)):NONE
REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%):99.81
REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS :25766
REMARK 3
REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 CROSS-VALIDATION METHOD :THROUGHOUT
REMARK 3 FREE R VALLUE TEST SET SELECTION :RANDOM
REMARK 3 R VALUE (WORKING+TEST SET):0.19077
REMARK 3 R VALUE (WORKING SET):0.19920
REMARK 3 FREE R VALUE :0.22121
REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%):5.0
REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT :1368
REMARK 3
REMARK 3 FIT IN THE HIGHEST RESOLUTION BIN.
REMARK 3 TOTAL NUMBER OF BINS USED :20
REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE HIGH :2.030
REMARK 3 BIN RESOLUTION RANGE LOW :2.083
REMARK 3 REFLECTION IN BIN (WORKING SET):1894
REMARK 3 BIN R VALUE (WORKING SET):0.289
REMARK 3 BIN FREE R VALUE SET COUNT :113
REMARK 3 BIN FREE R VALUE :0.297
REMARK 3
REMARK 3 NUMBER OF NON-HYDROGEN ATOMS USED IN REFINEMENT.
REMARK 3 ALL ATOMS :2400
REMARK 3
REMARK 3 B VALUES.
REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2):NULL
REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL,A**2):27.297
REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE.
REMARK 3 B11(A**2): 0.50
REMARK 3 B22(A**2): 0.50
REMARK 3 B33(A**2):-0.74
REMARK 3 B12(A**2): 0.25
REMARK 3 B13(A**2): 0.00
REMARK 3 B23(A**2): 0.00
REMARK 3
REMARK 3 ESTIMATED OVERALL COORDINATE ERROR.
REMARK 3 ESU BASED ON R VALUE (A):0.151
REMARK 3 ESU BASED ON FREE R VALUE (A):0.140
REMARK 3 ESU BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A):0.105
REMARK 3 ESU FOR B VALUES BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A**2):3.960
REMARK 3
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENTS.
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENT FO-FC :0.959
REMARK 3 CORRELATION COEFFICIENT FO-FC FREE:0.946
REMARK 3
REMARK 3 RMS DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES COUNT RMS WEIGHT
REMARK 3 BOND LENGTHS REFINED ATOM S (A):2334;0.011;0.021
REMARK 3 BOND ANGLES REFINED ATOMS (DEGREES):3174;1.105;1.959
REMARK 3 TORSION ANGLES,PERIOD 1 (DEGREES):273 ;5.228;5.000
REMARK 3 CHIRAL-CENTER RESTRAINTS (A**3):336 ;0.080;0.200
REMARK 3 GENERAL PLANES REFINED ATOMS (A):1800;0.004;0.020
REMARK 3 NON-BONDED CONTACTS REFINED ATOMS (A):1070;0.202;0.200
REMARK 3 H-BOND(X...Y)REFINED ATOMS (A):150 ;0.145;0.200
REMARK 3 SYMMETRY VDW REFINED ATOMS (A):46 ;0.199;0.200
REMARK 3 SYMMETRY H-BOND REFINED ATOMS (A):10 ;0.267;0.200
REMARK 3
REMARK 3 ISOTROPIC THERMAL FACTOR RESTRAINTS. COUNT RMS WEIGHT
REMARK 3 MAIN-CHAIN BOND REFINED ATOMS (A**2):1365;0.799;1.500
REMARK 3 MAIN-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):2214;1.519;2.000
REMARK 3 SIDE-CHAIN BOND REFINED ATOMS (A**2):969 ;2.024;3.000
REMARK 3 SIDE-CHAIN ANGLE REFINED ATOMS (A**2):960 ;3.247;4.500
REMARK 3
REMARK 3 NCS RESTRAINTS STATISTICS
REMARK 3 NUMBER OF NCS GROUPS:NULL
REMARK 3
REMARK 3
REMARK 3 TLS DETAILS
REMARK 3 NUMBER OF TLS GROUPS :2
REMARK 3
REMARK 3 TLS GROUP:1
REMARK 3 NUMBER OF COMPONENTS GROUP:1
REMARK 3 COMPONENTS C SSSEQI TO C SSSEQI
REMARK 3 RESIDUE RANGE: A 33 A 306
REMARK 3 ORIGIN FOR THE GROUP (A):65.5800 27.1270 -0.6960
REMARK 3 T TENSOR
REMARK 3 T11: 0.1410 T22: 0.1266
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ATOM 158 O SER A 54 80.586 42.513 -0.616 1.00 25.83 O
ATOM 159 N GLY A 55 78.878 42.932 -2.023 1.00 26.75 N
ATOM 160 CA GLY A 55 79.720 43.609 -2.991 1.00 27.76 C
ATOM 161 C GLY A 55 78.986 44.633 -3.827 1.00 28.87 C
ATOM 162 O GLY A 55 77.762 44.772 -3.737 1.00 28.62 O
ATOM 163 N ILE A 56 79.750 45.358 -4.641 1.00 30.03 N
ATOM 164 CA ILE A 56 79.200 46.346 -5.557 1.00 31.52 C
ATOM 165 CB ILE A 56 79.291 47.773 -4.953 1.00 31.73 C
ATOM 166 CG1 ILE A 56 78.306 47.955 -3.790 1.00 32.00 C
ATOM 167 CD1 ILE A 56 78.762 48.992 -2.750 1.00 34.29 C
ATOM 168 CG2 ILE A 56 79.038 48.830 -6.014 1.00 32.25 C
ATOM 169 C ILE A 56 79.927 46.274 -6.901 1.00 32.27 C
ATOM 170 O ILE A 56 81.153 46.245 -6.956 1.00 32.20 O
ATOM 171 N ARG A 57 79.147 46.225 -7.976 1.00 33.45 N
ATOM 172 CA ARG A 57 79.664 46.308 -9.332 1.00 34.77 C
ATOM 173 CB ARG A 57 78.574 45.902 -10.319 1.00 34.53 C
ATOM 174 CG ARG A 57 79.075 45.541 -11.692 1.00 35.85 C
ATOM 175 CD ARG A 57 78.037 45.746 -12.766 1.00 37.31 C
ATOM 176 NE ARG A 57 77.459 44.488 -13.210 1.00 38.72 N
ATOM 177 CZ ARG A 57 76.191 44.334 -13.580 1.00 39.18 C
ATOM 178 NH1 ARG A 57 75.347 45.360 -13.561 1.00 38.58 N
ATOM 179 NH2 ARG A 57 75.764 43.143 -13.967 1.00 40.00 N
ATOM 180 C ARG A 57 80.134 47.740 -9.604 1.00 35.42 C
ATOM 181 O ARG A 57 79.329 48.667 -9.609 1.00 35.07 O
ATOM 182 N VAL A 58 81.438 47.901 -9.822 1.00 36.96 N
ATOM 183 CA VAL A 58 82.069 49.221 -9.962 1.00 38.44 C
ATOM 184 CB VAL A 58 83.626 49.118 -10.083 1.00 38.53 C
ATOM 185 CG1 VAL A 58 84.270 50.494 -10.251 1.00 38.65 C
ATOM 186 CG2 VAL A 58 84.226 48.422 -8.863 1.00 38.97 C
ATOM 187 C VAL A 58 81.472 50.033 -11.125 1.00 39.26 C
ATOM 188 O VAL A 58 81.243 51.238 -10.989 1.00 39.41 O
ATOM 189 N SER A 59 81.194 49.357 -12.239 1.00 40.32 N
ATOM 190 CA SER A 59 80.704 50.007 -13.459 1.00 41.50 C
ATOM 191 CB SER A 59 80.627 49.012 -14.625 1.00 41.60 C
ATOM 192 OG SER A 59 80.059 47.777 -14.225 1.00 42.83 O
ATOM 193 C SER A 59 79.380 50.778 -13.310 1.00 41.87 C
ATOM 194 O SER A 59 79.205 51.830 -13.933 1.00 42.28 O
ATOM 195 N ASP A 60 78.463 50.269 -12.488 1.00 42.04 N
ATOM 196 CA ASP A 60 77.147 50.897 -12.330 1.00 41.97 C
ATOM 197 CB ASP A 60 76.118 50.187 -13.223 1.00 42.37 C
ATOM 198 CG ASP A 60 75.881 48.739 -12.810 1.00 43.55 C
ATOM 199 OD1 ASP A 60 76.449 48.309 -11.781 1.00 44.32 O
ATOM 200 OD2 ASP A 60 75.142 47.959 -13.451 1.00 43.86 O
ATOM 201 C ASP A 60 76.631 50.996 -10.878 1.00 41.41 C
ATOM 202 O ASP A 60 75.479 51.372 -10.657 1.00 41.59 O
ATOM 203 N ASN A 61 77.484 50.667 -9.905 1.00 40.49 N
ATOM 204 CA ASN A 61 77.122 50.639 -8.475 1.00 39.60 C
ATOM 205 CB ASN A 61 76.722 52.026 -7.961 1.00 39.96 C
ATOM 206 CG ASN A 61 77.888 52.981 -7.902 1.00 41.52 C
ATOM 207 OD1 ASN A 61 78.785 52.837 -7.065 1.00 42.83 O
ATOM 208 ND2 ASN A 61 77.883 53.971 -8.792 1.00 42.64 N
ATOM 209 C ASN A 61 76.058 49.615 -8.056 1.00 38.30 C
ATOM 210 O ASN A 61 75.557 49.667 -6.930 1.00 38.56 O
ATOM 211 N LEU A 62 75.724 48.685 -8.947 1.00 36.52 N
ATOM 212 CA LEU A 62 74.768 47.623 -8.623 1.00 34.93 C
ATOM 213 CB LEU A 62 74.519 46.720 -9.832 1.00 35.10 C
ATOM 214 CG LEU A 62 73.421 45.662 -9.712 1.00 35.38 C
ATOM 215 CD1 LEU A 62 72.047 46.269 -9.961 1.00 36.89 C
ATOM 216 CD2 LEU A 62 73.679 44.527 -10.677 1.00 35.30 C
ATOM 217 C LEU A 62 75.222 46.778 -7.425 1.00 33.33 C
ATOM 218 O LEU A 62 76.351 46.288 -7.404 1.00 32.86 O
ATOM 219 N PRO A 63 74.340 46.624 -6.436 1.00 32.03 N
ATOM 220 CA PRO A 63 74.576 45.708 -5.312 1.00 30.66 C
ATOM 221 CB PRO A 63 73.328 45.893 -4.440 1.00 30.79 C
ATOM 222 CG PRO A 63 72.770 47.219 -4.848 1.00 32.09 C
ATOM 223 CD PRO A 63 73.039 47.311 -6.319 1.00 32.13 C
ATOM 224 C PRO A 63 74.657 44.263 -5.804 1.00 28.94 C
ATOM 225 O PRO A 63 73.788 43.821 -6.570 1.00 28.84 O
ATOM 226 N VAL A 64 75.705 43.554 -5.393 1.00 26.63 N
AT0M 227 CA VAL A 64 75.862 42.135 -5.723 1.00 24.40 C
ATOM 228 CB VAL A 64 76.903 41.905 -6.870 1.00 24.56 C
ATOM 229 CG1 VAL A 64 76.430 42.528 -8.195 1.00 23.44 C
ATOM 230 CG2 VAL A 64 78.292 42.436 -6.471 1.00 23.53 C
ATOM 231 C VAL A 64 76.295 41.339 -4.488 1.00 23.30 C
ATOM 232 O VAL A 64 76.650 41.922 -3.451 1.00 22.79 O
ATOM 233 N ALA A 65 76.259 40.014 -4.609 1.00 21.63 N
ATOM 234 CA ALA A 65 76.828 39.124 -3.608 1.00 20.83 C
ATOM 235 CB ALA A 65 75.761 38.231 -2.984 1.00 20.55 C
ATOM 236 C ALA A 65 77.892 38.290 -4.281 1.00 20.04 C
ATOM 237 O ALA A 65 77.704 37.828 -5.408 1.00 21.14 O
ATOM 238 N ILE A 66 79.015 38.111 -3.600 1.00 18.86 N
ATOM 239 CA ILE A 66 80.165 37.439 -4.186 1.00 17.57 C
ATOM 240 CB ILE A 66 81.422 38.346 -4.117 1.00 17.68 C
ATOM 241 CG1 ILE A 66 81.148 39.723 -4.747 1.00 18.56 C
ATOM 242 CD1 ILE A 66 82.220 40.772 -4.424 1.00 19.55 C
ATOM 243 CG2 ILE A 66 82.602 37.668 -4.775 1.00 16.32 C
ATOM 244 C ILE A 66 80.402 36.161 -3.408 1.00 16.96 C
ATOM 245 O ILE A 66 80.775 36.206 -2.227 1.00 16.17 O
ATOM 246 N LYS A 67 80.179 35.031 -4.077 1.00 16.24 N
ATOM 247 CA LYS A 67 80.255 33.718 -3.444 1.00 15.79 C
ATOM 248 CB LYS A 67 78.975 32.905 -3.707 1.00 15.38 C
ATOM 249 CG LYS A 67 79.010 31.493 -3.119 1.00 14.88 C
ATOM 250 CD LYS A 67 77.664 30.772 -3.303 1.00 17.48 C
ATOM 251 CE LYS A 67 77.585 29.486 -2.479 1.00 18.05 C
ATOM 252 NZ LYS A 67 76.184 28.951 -2.470 1.00 18.14 N
ATOM 253 C LYS A 67 81.478 32.943 -3.915 1.00 16.15 C
ATOM 254 O LYS A 67 81.667 32.705 -5.122 1.00 15.33 O
ATOM 255 N HIS A 68 82.293 32.534 -2.951 1.00 16.82 N
ATOM 256 CA HIS A 68 83.519 31.792 -3.235 1.00 17.55 C
ATOM 257 CB HIS A 68 84.683 32.368 -2.435 1.00 17.11 C
ATOM 258 CG HIS A 68 85.043 33.764 -2.818 1.00 17.46 C
ATOM 259 ND1 HIS A 68 84.358 34.860 -2.348 1.00 18.28 N
ATOM 260 CE1 HIS A 68 84.897 35.958 -2.844 1.00 17.55 C
ATOM 261 NE2 HIS A 68 85.909 35.614 -3.617 1.00 17.90 N
ATOM 262 CD2 HIS A 68 86.019 34.245 -3.622 1.00 17.05 C
ATOM 263 C HIS A 68 83.319 30.353 -2.829 1.00 18.47 C
ATOM 264 O HIS A 68 82.899 30.085 -1.707 1.00 17.74 O
ATOM 265 N VAL A 69 83.628 29.434 -3.735 1.00 19.87 N
ATOM 266 CA VAL A 69 83.538 28.016 -3.441 1.00 21.97 C
ATOM 267 CB VAL A 69 82.386 27.316 -4.229 1.00 22.09 C
ATOM 268 CG1 VAL A 69 82.270 25.863 -3.809 1.00 22.01 C
ATOM 269 CG2 VAL A 69 81.049 28.011 -3.992 1.00 22.34 C
ATOM 270 C VAL A 69 84.870 27.345 -3.768 1.00 23.59 C
ATOM 271 O VAL A 69 85.331 27.388 -4.903 1.00 23.28 O
ATOM 272 N GLU A 70 85.474 26.719 -2.766 1.00 26.14 N
ATOM 273 CA GLU A 70 86.719 25.981 -2.948 1.00 29.32 C
ATOM 274 CB GLU A 70 87.280 25.543 -1.599 1.00 29.52 C
ATOM 275 CG GLU A 70 88.286 26.512 -1.001 1.00 32.13 C
ATOM 276 CD GLU A 70 88.827 25.043 0.342 1.00 34.86 C
ATOM 277 OE1 GLU A 70 89.185 24.847 0.448 1.00 34.79 O
ATOM 278 OE2 GLU A 70 88.899 26.871 1.288 1.00 35.33 O
ATOM 279 C GLU A 70 86.486 24.760 -3.834 1.00 31.18 C
ATOM 280 O GLU A 70 85.485 24.044 -3.674 1.00 30.70 O
ATOM 281 N LYS A 71 87.402 24.540 -4.774 1.00 33.73 N
ATOM 282 CA LYS A 71 87.292 23.422 -5.718 1.00 36.85 C
ATOM 283 CB LYS A 71 88.426 23.459 -6.734 1.00 36.40 C
ATOM 284 CG LYS A 71 88.228 24.487 -7.822 1.00 35.73 C
ATOM 285 CD LYS A 71 89.373 24.457 -8.814 1.00 35.72 C
ATOM 286 CE LYS A 71 89.168 25.490 -9.898 1.00 35.77 C
ATOM 287 NZ LYS A 71 90.289 25.535 -10.874 1.00 35.56 N
ATOM 288 C LYS A 71 87.206 22.046 -5.047 1.00 39.35 C
ATOM 289 O LYS A 71 86.492 21.169 -5.536 1.00 39.62 O
ATOM 290 N ASP A 72 87.904 21.872 -3.922 1.00 42.63 N
ATOM 291 CA ASP A 72 87.873 20.615 -3.161 1.00 46.03 C
ATOM 292 CB ASP A 72 89.021 20.560 -2.145 1.00 46.33 C
ATOM 293 CG ASP A 72 90.396 20.511 -2.811 1.00 48.21 C
ATOM 294 OD1 ASP A 72 90.519 19.935 -3.918 1.00 49.79 O
ATOM 295 OD2 ASP A 72 91.418 21.025 -2.300 1.00 50.39 O
ATOM 296 C ASP A 72 86.539 20.371 -2.452 1.00 47.89 C
ATOM 297 O ASP A 72 86.138 19.221 -2.253 1.00 48.61 O
ATOM 298 N ARG A 73 85.861 21.457 -2.085 1.00 50.08 N
ATOM 299 CA ARG A 73 84.592 21.405 -1.352 1.00 52.11 C
ATOM 300 CB ARG A 73 84.430 22.662 -0.486 1.00 52.39 C
ATOM 301 CG ARG A 73 85.333 22.711 0.739 1.00 54.59 C
ATOM 302 CD ARG A 73 84.894 23.708 1.827 1.00 58.87 C
ATOM 303 NE ARG A 73 83.451 23.686 2.113 1.00 62.15 N
ATOM 304 CZ ARG A 73 82.792 22.682 2.708 1.00 63.76 C
ATOM 305 NH1 ARG A 73 83.427 21.579 3.094 1.00 64.18 N
ATOM 306 NH2 ARG A 73 81.484 22.779 2.917 1.00 63.67 N
ATOM 307 C ARG A 73 83.376 21.251 -2.272 1.00 52.88 C
ATOM 308 O ARG A 73 82.246 21.100 -1.793 1.00 52.85 O
ATOM 309 N ILE A 74 83.613 21.307 -3.585 1.00 54.14 N
ATOM 310 CA ILE A 74 82.553 21.153 -4.583 1.00 55.27 C
ATOM 311 CB ILE A 74 83.013 21.668 -5.983 1.00 55.13 C
ATOM 312 CG1 ILE A 74 83.104 23.193 -5.985 1.00 54.96 C
ATOM 313 CD1 ILE A 74 83.829 23.776 -7.180 1.00 55.18 C
ATOM 314 CG2 ILE A 74 82.053 21.205 -7.084 1.00 55.44 C
ATOM 315 C ILE A 74 82.107 19.691 -4.638 1.00 56.17 C
ATOM 316 O ILE A 74 82.902 18.798 -4.973 1.00 56.10 O
ATOM 317 N SER A 75 80.836 19.459 -4.298 1.00 57.17 N
ATOM 318 CA SER A 75 80.287 18.101 -4.234 1.00 58.19 C
ATOM 319 CB SER A 75 78.943 18.064 -3.485 1.00 58.21 C
ATOM 320 OG 5ER A 75 78.112 19.161 -3.831 1.00 58.80 O
ATOM 321 C SER A 75 80.178 17.482 -5.629 1.00 58.59 C
ATOM 322 O SER A 75 80.890 16.520 -5.939 1.00 58.89 O
ATOM 323 N ASP A 76 79.313 18.055 -6.469 1.00 58.93 N
ATOM 324 CA ASP A 76 79.125 17.581 -7.840 1.00 59.19 C
ATOM 325 CB ASP A 76 77.646 17.265 -8.101 1.00 59.25 C
ATOM 326 CG ASP A 76 77.174 16.004 -7.377 1.00 60.21 C
ATOM 327 OD1 ASP A 76 75.950 15.733 -7.378 1.00 60.76 O
ATOM 328 OD2 ASP A 76 77.946 15.218 -6.783 1.00 61.47 O
ATCM 329 C ASP A 76 79.655 18.576 -8.875 1.00 59.17 C
ATOM 330 O ASP A 76 79.536 19.794 -8.702 1.00 59.08 O
ATOM 331 N TRP A 77 80.245 18.043 -9.943 1.00 59.21 N
ATOM 332 CA TRP A 77 80.737 18.850 -11.059 1.00 59.31 C
ATOM 333 CB TRP A 77 82.186 18.497 -11.399 1.00 58.89 C
ATOM 334 CG TRP A 77 83.207 18.816 -10.338 1.00 57.61 C
ATOM 335 CD1 TRP A 77 83.449 18.112 -9.191 1.00 56.71 C
ATOM 336 NE1 TRP A 77 84.469 18.695 -8.480 1.00 56.23 N
ATOM 337 CE2 TRP A 77 84.921 19.793 -9.166 1.00 55.87 C
ATOM 338 CD2 TRP A 77 84.149 19.899 -10.345 1.00 55.83 C
ATOM 339 CE3 TRP A 77 84.416 20.957 -11.226 1.00 54.75 C
ATOM 340 CZ3 TRP A 77 85.429 21.857 -10.909 1.00 54.49 C
ATOM 341 CH2 TRP A 77 86.179 21.722 -9.728 1.00 54.62 C
ATOM 342 CZ2 TRP A 77 85.942 20.700 -8.846 1.00 54.88 C
ATOM 343 C TRP A 77 79.880 18.620 -12.297 1.00 59.97 C
ATOM 344 O TRP A 77 79.309 17.539 -12.479 1.00 59.95 O
ATOM 345 N GLY A 78 79.814 19.636 -13.152 1.00 60.60 N
ATOM 346 CA GLY A 78 79.019 19.573 -14.362 1.00 61.69 C
ATOM 347 C GLY A 78 79.663 20.261 -15.546 1.00 62.62 C
ATOM 348 O GLY A 78 80.722 20.887 -15.425 1.00 62.53 O
ATOM 349 N GLU A 79 79.016 20.127 -16.700 1.00 63.55 N
ATOM 350 CA GLU A 79 79.470 20.764 -17.932 1.00 64.55 C
ATOM 351 CB GLU A 79 79.841 19.724 -19.007 1.00 64.74 C
ATOM 352 CG GLU A 79 78.740 18.730 -19.386 1.00 65.56 C
ATOM 353 CD GLU A 79 78.780 18.319 -20.857 1.00 67.08 C
ATOM 354 OE1 GLU A 79 79.892 18.197 -21.428 1.00 67.41 O
ATOM 355 OE2 GLU A 79 77.693 18.111 -21.446 1.00 66.84 O
ATOM 356 C GLU A 79 78.425 21.745 -18.456 1.00 64.93 C
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ATOM 359 CA LEU A 80 78.039 23.875 -19.589 1.00 66.20 C
ATOM 360 CB LEU A 80 78.763 25.227 -19.663 1.00 66.19 C
ATOM 361 CG LEU A 80 79.128 25.944 -18.359 1.00 66.08 C
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ATOM 363 CD2 LEU A 80 77.881 26.238 -17.525 1.00 65.99 C
ATOM 364 C LEU A 80 77.662 23.402 -20.996 1.00 66.59 C
ATOM 365 O LEU A 80 78.387 22.585 -21.575 1.00 66.81 O
ATOM 366 N PRO A 81 76.539 23.885 -21.547 1.00 66.88 N
ATOM 367 CA PRO A 81 76.220 23.634 -22.963 1.00 66.94 C
ATOM 368 CB PRO A 81 75.035 24.573 -23.226 1.00 67.02 C
ATOM 369 CG PRO A 81 74.363 24.703 -21.892 1.00 67.04 C
ATOM 370 CD PRO A 81 75.477 24.665 -20.877 1.00 66.98 C
ATOM 371 C PRO A 81 77.408 23.972 -23.884 1.00 66.80 C
ATOM 372 O PRO A 81 77.505 23.438 -24.990 1.00 66.90 O
ATOM 373 N ASN A 82 78.296 24.842 -23.405 1.00 66.49 N
ATOM 374 CA ASN A 82 79.543 25.182 -24.087 1.00 66.14 C
ATOM 375 CB ASN A 82 80.114 26.482 -23.492 1.00 66.36 C
ATOM 376 CG ASN A 82 81.498 26.816 -24.015 1.00 67.00 C
ATOM 377 OD1 ASN A 82 81.734 26.837 -25.225 1.00 67.52 O
ATOM 378 ND2 ASN A 82 82.424 27.089 -23.100 1.00 67.69 N
ATOM 379 C ASN A 82 80.576 24.044 -24.035 1.00 65.50 C
ATOM 380 O ASN A 82 81.273 23.787 -25.019 1.00 65.53 O
ATOM 381 N GLY A 83 80.664 23.369 -22.888 1.00 64.74 N
ATOM 382 CA GLY A 83 81.614 22.284 -22.683 1.00 63.59 C
ATOM 383 C GLY A 83 82.826 22.690 -21.857 1.00 62.70 C
ATOM 384 O GLY A 83 83.967 22.600 -22.326 1.00 62.98 O
ATOM 385 N THR A 84 82.571 23.149 -20.632 1.00 61.37 N
ATOM 386 CA THR A 84 83.621 23.529 -19.682 1.00 59.87 C
ATOM 387 CB THR A 84 83.742 25.067 -19.576 1.00 60.05 C
ATOM 388 OG1 THR A 84 83.799 25.643 -20.888 1.00 60.81 O
ATOM 389 CG2 THR A 84 85.080 25.468 -18.954 1.00 60.25 C
ATOM 390 C THR A 84 83.309 22.938 -18.310 1.00 58.33 C
ATOM 391 O THR A 84 82.139 22.816 -17.930 1.00 58.41 O
ATOM 392 N ARG A 85 84.356 22.576 -17.572 1.00 56.14 N
ATOM 393 CA ARG A 85 84.198 22.026 -16.231 1.00 53.98 C
ATOM 394 CB ARG A 85 85.445 21.223 -15.844 1.00 54.58 C
ATOM 395 CG ARG A 85 85.227 20.243 -14.703 1.00 56.25 C
ATOM 396 CD ARG A 85 86.028 18.945 -14.819 1.00 58.89 C
ATOM 397 NE ARG A 85 85.870 18.099 -13.630 1.00 60.27 N
ATOM 398 CZ ARG A 85 84.879 17.226 -13.445 1.00 60.85 C
ATOM 399 NH1 ARG A 85 83.933 17.065 -14.370 1.00 61.04 N
ATOM 400 NH2 ARG A 85 84.834 16.506 -12.329 1.00 60.48 N
ATOM 401 C ARG A 85 83.906 23.130 -15.200 1.00 51.86 C
ATOM 402 O ARG A 85 84.789 23.931 -14.865 1.00 51.74 O
ATOM 403 N VAL A 86 82.659 23.172 -14.721 1.00 48.87 N
ATOM 404 CA VAL A 86 82.224 24.121 -13.680 1.00 45.97 C
ATOM 405 CB VAL A 86 81.335 25.276 -14.251 1.00 46.05 C
ATOM 406 CG1 VAL A 86 82.074 26.064 -15.322 1.00 46.41 C
ATOM 407 CG2 VAL A 86 80.008 24.755 -14.781 1.00 45.90 C
ATOM 408 C VAL A 86 81.462 23.409 -12.553 1.00 43.56 C
ATOM 409 O VAL A 86 80.984 22.292 -12.750 1.00 43.24 O
ATOM 410 N PRO A 87 81.345 24.040 -11.380 1.00 41.11 N
ATOM 411 CA PRO A 87 80.494 23.495 -10.314 1.00 39.00 C
ATOM 412 CB PRO A 87 80.654 24.499 -9.158 1.00 39.06 C
ATOM 413 CG PRO A 87 81.251 25.719 -9.759 1.00 40.31 C
ATOM 414 CD PRO A 87 82.015 25.287 -10.966 1.00 40.95 C
ATOM 415 C PRO A 87 79.037 23.413 -10.755 1.00 36.73 C
ATOM 416 O PRO A 87 78.567 24.258 -11.535 1.00 35.64 O
ATOM 417 N MET A 88 78.343 22.391 -10.255 1.00 34.56 N
ATOM 418 CA MET A 88 76.936 22.171 -10.564 1.00 32.47 C
ATOM 419 CB MET A 88 76.408 20.950 -9.799 1.00 33.23 C
ATOM 420 CG MET A 88 75.047 20.407 -10.263 1.00 36.09 C
ATOM 421 SD MET A 88 74.917 19.957 -12.033 1.00 43.02 S
ATOM 422 CE MET A 88 76.260 18.799 -12.218 1.00 41.30 C
ATOM 423 C MET A 88 76.110 23.423 -10.274 1.00 30.24 C
ATOM 424 O MET A 88 75.169 23.717 -11.006 1.00 29.10 O
ATOM 425 N GLU A 89 76.487 24.169 -9.231 1.00 28.21 N
ATOM 426 CA GLU A 89 75.773 25.392 -8.843 1.00 26.55 C
ATOM 427 CB GLU A 89 76.393 26.043 -7.576 1.00 26.83 C
ATOM 428 CG GLU A 89 75.711 27.347 -7.134 1.00 27.21 C
ATOM 429 CD GLU A 89 75.939 27.733 -5.670 1.00 29.78 C
ATOM 430 OE1 GLU A 89 76.956 27.292 -5.073 1.00 29.01 0
ATOM 431 OE2 GLU A 89 75.080 28.483 -5.118 1.00 29.29 O
ATOM 432 C GLU A 89 75.669 26.392 -10.000 1.00 25.41 C
ATOM 433 O GLU A 89 74.609 26.988 -10.223 1.00 25.07 O
ATOM 434 N VAL A 90 76.761 26.566 -10.744 1.00 24.25 N
ATOM 435 CA VAL A 90 76.747 27.435 -11.927 1.00 23.34 C
ATOM 436 CB VAL A 90 78.193 27.717 -12.452 1.00 23.97 C
ATOM 437 CG1 VAL A 90 78.178 28.460 -13.796 1.00 23.00 C
ATOM 438 CG2 VAL A 90 78.989 28.530 -11.411 1.00 23.11 C
ATOM 439 C VAL A 90 75.822 26.881 -13.020 1.00 22.89 C
ATOM 440 O VAL A 90 75.002 27.622 -13.570 1.00 22.78 O
ATOM 441 N VAL A 91 75.926 25.579 -13.305 1.00 22.51 N
ATOM 442 CA VAL A 91 75.048 24.917 -14.293 1.00 22.19 C
ATOM 443 CB VAL A 91 75.316 23.382 -14.399 1.00 22.50 C
ATOM 444 CG1 VAL A 91 74.265 22.688 -15.314 1.00 22.61 C
ATOM 445 CG2 VAL A 91 76.688 23.116 -14.934 1.00 22.68 C
ATOM 446 C VAL A 91 73.569 25.143 -13.965 1.00 21.66 C
ATOM 447 O VAL A 91 72.783 25.594 -14.807 1.00 20.36 O
ATOM 448 N LEU A 92 73.215 24.856 -12.715 1.00 21.61 N
ATOM 449 CA LEU A 92 71.833 24.963 -12.256 1.00 21.57 C
ATOM 450 CB LEU A 92 71.682 24.326 -10.873 1.00 21.14 C
ATOM 451 CG LEU A 92 72.112 22.854 -10.778 1.00 21.50 C
ATOM 452 CD1 LEU A 92 71.945 22.365 -9.349 1.00 20.58 C
ATOM 453 CD2 LEU A 92 71.378 21.928 -11.767 1.00 18.41 C
ATOM 454 C LEU A 92 71.331 26.408 -12.255 1.00 21.79 C
ATOM 455 O LEU A 92 70.212 26.671 -12.706 1.00 21.50 O
ATOM 456 N LEU A 93 72.159 27.332 -11.764 1.00 22.36 N
ATOM 457 CA LEU A 93 71.808 28.755 -11.756 1.00 23.34 C
ATOM 458 CB LEU A 93 72.861 29.584 -11.018 1.00 23.50 C
ATOM 459 CG LEU A 93 72.714 29.608 -9.482 1.00 24.22 C
ATOM 460 CD1 LEU A 93 73.985 30.131 -8.852 1.00 23.74 C
ATOM 461 CD2 LEU A 93 71.493 30.431 -9.048 1.00 22.10 C
ATOM 462 C LEU A 93 71.594 29.301 -13.162 1.00 23.97 C
ATOM 463 O LEU A 93 70.642 30.037 -13.409 1.00 23.67 O
ATOM 464 N LYS A 94 72.468 28.922 -14.088 1.00 24.87 N
ATOM 465 CA LYS A 94 72.265 29.290 -15.491 1.00 26.26 C
ATOM 466 CB LYS A 94 73.448 28.847 -16.356 1.00 26.36 C
ATOM 467 CG LYS A 94 74.664 29.745 -16.166 1.00 29.54 C
ATOM 468 CD LYS A 94 75.932 29.132 -16.750 1.00 34.13 C
ATOM 469 CE LYS A 94 76.210 29.633 -18.167 1.00 36.90 C
ATOM 470 NZ LYS A 94 76.658 31.059 -18.181 1.00 39.00 N
ATOM 471 C LYS A 94 70.946 28.761 -16.045 1.00 26.31 C
ATOM 472 O LYS A 94 70.240 29.481 -16.756 1.00 26.21 0
ATOM 473 N LYS A 95 70.610 27.515 -15.712 1.00 26.64 N
ATOM 474 CA LYS A 95 69.356 26.916 -16.172 1.00 28.04 C
ATOM 475 CB LYS A 95 69.295 25.427 -15.824 1.00 27.38 C
ATOM 476 CG LYS A 95 70.096 24.557 -16.777 1.00 28.63 C
ATOM 477 CD LYS A 95 70.218 23.114 -16.294 1.00 29.42 C
ATOM 478 CE LYS A 95 68.891 22.361 -16.392 1.00 30.74 C
ATOM 479 NZ LYS A 95 68.513 22.039 -17.803 1.00 31.02 N
ATOM 480 C LYS A 95 68.096 27.657 -15.674 1.00 28.66 C
ATOM 481 O LYS A 95 67.088 27.707 -16.379 1.00 28.72 O
ATOM 482 N VAL A 96 68.167 28.239 -14.480 1.00 30.05 N
ATOM 483 CA VAL A 96 67.017 28.940 -13.899 1.00 31.67 C
ATOM 484 CB VAL A 96 66.818 28.631 -12.383 1.00 31.32 C
ATOM 485 CG1 VAL A 96 66.594 27.139 -12.159 1.00 30.44 C
ATOM 486 CG2 VAL A 96 67.978 29.149 -11.546 1.00 29.93 C
ATOM 487 C VAL A 96 66.997 30.458 -14.119 1.00 33.63 C
ATOM 488 O VAL A 96 65.999 31.112 -13.783 1.00 33.80 O
ATOM 489 N SER A 97 68.074 31.018 -14.676 1.00 35.26 N
ATOM 490 CA SER A 97 68.109 32.455 -14.979 1.00 37.17 C
ATOM 491 CB SER A 97 69.490 32.907 -15.483 1.00 37.37 C
ATOM 492 OG SER A 97 69.844 32.265 -16.699 1.00 38.96 O
ATOM 493 C SER A 97 67.009 32.865 -15.962 1.00 38.05 C
ATOM 494 O SER A 97 66.797 32.223 -16.996 1.00 38.07 O
ATOM 495 N SER A 98 66.302 33.934 -15.603 1.00 39.50 N
ATOM 496 CA SER A 98 65.224 34.521 -16.409 1.00 40.49 C
ATOM 497 CB SER A 98 64.109 33.499 -16.685 1.00 40.48 C
ATOM 498 OG SER A 98 63.105 33.547 -15.681 1.00 41.42 O
ATOM 499 C SER A 98 64.671 35.738 -15.656 1.00 40.82 C
ATOM 500 O SER A 98 65.177 36.091 -14.582 1.00 41.27 O
ATOM 501 N GLY A 99 63.632 36.364 -16.210 1.00 40.95 N
ATOM 502 CA GLY A 99 63.015 37.535 -15.602 1.00 40.62 C
ATOM 503 C GLY A 99 62.281 37.294 -14.283 1.00 40.18 C
ATOM 504 O GLY A 99 61.912 38.263 -13.600 1.00 40.34 O
ATOM 505 N PHE A 100 62.056 36.019 -13.942 1.00 39.30 N
ATOM 506 CA PHE A 100 61.391 35.628 -12.694 1.00 38.13 C
ATOM 507 CB PHE A 100 61.038 34.135 -12.709 1.00 38.35 C
ATOM 508 CG PHE A 100 60.296 33.656 -11.471 1.00 37.90 C
ATOM 509 CD1 PHE A 100 59.100 34.258 -11.069 1.00 36.99 C
ATOM 510 CE1 PHE A 100 58.411 33.801 -9.924 1.00 37.18 C
ATOM 511 CZ PHE A 100 58.922 32.727 -9.177 1.00 35.96 C
ATOM 512 CE2 PHE A 100 60.108 32.116 -9.573 1.00 35.95 C
ATOM 513 CD2 PHE A 100 60.792 32.585 -10.718 1.00 37.98 C
ATOM 514 C PHE A 100 62.266 35.944 -11.491 1.00 37.35 C
ATOM 515 O PHE A 100 63.365 35.409 -11.354 1.00 37.45 O
ATOM 516 N SER A 101 61.768 36.814 -10.620 1.00 36.17 N
ATOM 517 CA SER A 101 62.534 37.263 -9.468 1.00 35.23 C
ATOM 518 CB SER A 101 62.048 38.647 -9.003 1.00 35.81 C
ATOM 519 OG SER A 101 60.697 38.612 -8.570 1.00 37.04 O
ATOM 520 C SER A 101 62.571 36.280 -8.291 1.00 33.45 C
ATOM 521 O SER A 101 63.260 36.544 -7.295 1.00 33.93 O
ATOM 522 N GLY A 102 61.856 35.157 -8.402 1.00 31.13 N
ATOM 523 CA GLY A 102 61.760 34.190 -7.310 1.00 28.02 C
ATOM 524 C GLY A 102 63.026 33.377 -7.066 1.00 26.06 C
ATOM 525 O GLY A 102 63.183 32.736 -6.040 1.00 24.79 O
ATOM 526 N VAL A 103 63.936 33.396 -8.030 1.00 25.16 N
ATOM 527 CA VAL A 103 65.213 32.726 -7.877 1.00 24.40 C
ATOM 528 CB VAL A 103 65.377 31.540 -8.863 1.00 24.34 C
ATOM 529 CG1 VAL A 103 66.675 30.797 -8.585 1.00 25.25 C
ATOM 530 CG2 VAL A 103 64.214 30.567 -8.737 1.00 23.66 C
ATOM 531 C VAL A 103 66.300 33.759 -8.104 1.00 24.50 C
ATOM 532 O VAL A 103 66.217 34.566 -9.040 1.00 24.27 O
ATOM 533 N ILE A 104 67.303 33.744 -7.232 1.00 23.78 N
ATOM 534 CA ILE A 104 68.477 34.576 -7.383 1.00 24.18 C
ATOM 535 CB ILE A 104 69.526 34.185 -6.324 1.00 24.30 C
ATOM 536 CG1 ILE A 104 70.384 35.394 -5.954 1.00 23.11 C
ATOM 537 CD1 ILE A 104 69.581 36.449 -5.162 1.00 22.00 C
ATOM 538 CG2 ILE A 104 70.327 32.934 -6.766 1.00 23.91 C
ATOM 539 C ILE A 104 69.083 34.483 -8.789 1.00 24.77 C
ATOM 540 O ILE A 104 69.188 33.403 -9.366 1.00 25.02 O
ATOM 541 N ARG A 105 69.479 35.619 -9.337 1.00 25.08 N
ATOM 542 CA ARG A 105 70.070 35.622 -10.667 1.00 26.17 C
ATOM 543 CB ARG A 105 69.566 36.833 -11.454 1.00 27.31 C
ATOM 544 CG ARG A 105 70.349 37.173 -12.714 1.00 32.33 C
ATOM 545 CD ARG A 105 69.728 38.311 -13.536 1.00 39.80 C
ATOM 546 NE ARG A 105 68.331 38.040 -13.891 1.00 45.22 N
ATOM 547 CZ ARG A 105 67.573 38.838 -14.646 1.00 47.93 C
ATOM 548 NH1 ARG A 105 68.062 39.976 -15.139 1.00 48.73 N
ATOM 549 NH2 ARG A 105 66.319 38.498 -14.908 1.00 48.97 N
ATOM 550 C ARG A 105 71.593 35.590 -10.594 1.00 25.19 C
ATOM 551 O ARG A 105 72.211 36.402 -9.885 1.00 24.65 O
ATOM 552 N LEU A 106 72.188 34.634 -11.304 1.00 24.85 N
ATOM 553 CA LEU A 106 73.642 34.609 -11.499 1.00 24.90 C
ATOM 554 CB LEU A 106 74.136 33.223 -11.918 1.00 24.41 C
ATOM 555 CG LEU A 106 75.651 33.073 -12.127 1.00 24.89 C
ATOM 556 CD1 LEU A 106 76.449 33.148 -10.796 1.00 24.67 C
ATOM 557 CD2 LEU A 106 75.961 31.790 -12.871 1.00 23.97 C
ATOM 558 C LEU A 106 74.004 35.639 -12.554 1.00 25.16 C
ATOM 559 O LEU A 106 73.536 35.565 -13.695 1.00 25.41 O
ATOM 560 N LEU A 107 74.825 36.604 -12.163 1.00 25.22 N
ATOM 561 CA LEU A 107 75.217 37.703 -13.046 1.00 25.72 C
ATOM 562 CB LEU A 107 75.427 38.991 -12.240 1.00 25.54 C
ATOM 563 CG LEU A 107 74.167 39.501 -11.524 1.00 25.95 C
ATOM 564 CD1 LEU A 107 74.478 40.685 -10.620 1.00 25.00 C
ATOM 565 CD2 LEU A 107 73.067 39.868 -12.525 1.00 27.51 C
ATOM 566 C LEU A 107 76.465 37.363 -13.847 1.00 25.66 C
ATOM 567 O LEU A 107 76.553 37.678 -15.040 1.00 25.68 O
ATOM 568 N ASP A 108 77.420 36.717 -13.177 1.00 25.47 N
ATOM 569 CA ASP A 108 78.699 36.333 -13.762 1.00 25.47 C
ATOM 570 CB ASP A 108 79.624 37.557 -13.872 1.00 25.78 C
ATOM 571 CG ASP A 108 80.569 37.485 -15.071 1.00 27.00 C
ATOM 572 OD1 ASP A 108 80.828 36.385 -15.610 1.00 27.45 O
ATOM 573 OD2 ASP A 108 81.111 38.501 -15.537 1.00 29.70 O
ATOM 574 C ASP A 108 79.358 35.308 -12.856 1.00 25.21 C
ATOM 575 O ASP A 108 78.938 35.119 -11.711 1.00 23.96 O
ATOM 576 N TRP A 109 80.405 34.669 -13.369 1.00 25.09 N
ATOM 577 CA TRP A 109 81.235 33.785 -12.565 1.00 25.83 C
ATOM 578 CB TRP A 109 80.668 32.360 -12.565 1.00 26.03 C
ATOM 579 CG TRP A 109 80.690 31.729 -13.918 1.00 27.82 C
ATOM 580 CD1 TRP A 109 79.727 31.818 -14.883 1.00 28.39 C
ATOM 581 NE1 TRP A 109 80.102 31.102 -15.995 1.00 30.13 N
ATOM 582 CE2 TRP A 109 81.332 30.539 -15.770 1.00 30.67 C
ATOM 583 CD2 TRP A 109 81.732 30.914 -14.465 1.00 29.83 C
ATOM 584 CE3 TRP A 109 82.970 30.460 -13.987 1.00 30.76 C
ATOM 585 CZ3 TRP A 109 83.758 29.664 -14.809 1.00 32.48 C
ATOM 586 CH2 TRP A 109 83.334 29.313 -16.107 1.00 33.06 C
ATOM 587 CZ2 TRP A 109 82.126 29.739 -16.602 1.00 32.39 C
ATOM 588 C TRP A 109 82.689 33.808 -13.045 1.00 26.10 C
ATOM 589 O TRP A 109 82.973 34.170 -14.191 1.00 25.61 O
ATOM 590 N PHE A 110 83.599 33.425 -12.155 1.00 26.36 N
ATOM 591 CA PHE A 110 85.028 33.407 -12.449 1.00 26.90 C
ATOM 592 CB PHE A 110 85.734 34.607 -11.796 1.00 27.07 C
ATOM 593 CG PHE A 110 85.249 35.945 -12.285 1.00 28.66 C
ATOM 594 CD1 PHE A 110 85.909 36.602 -13.330 1.00 30.61 C
ATOM 595 CE1 PHE A 110 85.464 37.851 -13.785 1.00 31.43 C
ATOM 596 CZ PHE A 110 84.344 38.446 -13.195 1.00 31.46 C
ATOM 597 CE2 PHE A 110 83.679 37.795 -12.153 1.00 30.52 C
ATOM 598 CD2 PHE A 110 84.140 36.556 -11.701 1.00 28.63 C
ATOM 599 C PHE A 110 85.646 32.117 -11.924 1.00 27.02 C
ATOM 600 O PHE A 110 85.227 31.591 -10.879 1.00 26.50 O
ATOM 601 N GLU A 111 86.638 31.614 -12.655 1.00 26.99 N
ATOM 602 CA GLU A 111 87.454 30.500 -12.201 1.00 27.50 C
ATOM 603 CB GLU A 111 87.683 29.476 -13.323 1.00 27.99 C
ATOM 604 CG GLU A 111 88.309 28.179 -12.828 1.00 28.36 C
ATOM 605 CD GLU A 111 88.468 27.116 -13.894 1.00 29.75 C
ATOM 606 OE1 GLU A 111 87.864 27.215 -14.989 1.00 31.47 O
ATOM 607 OE2 GLU A 111 89.206 26.154 -13.622 1.00 30.33 O
ATOM 608 C GLU A 111 88.796 31.023 -11.696 1.00 27.98 C
ATOM 609 O GLU A 111 89.415 31.891 -12.310 1.00 28.26 O
ATOM 610 N ARG A 112 89.225 30.490 -10.560 1.00 28.31 N
ATOM 611 CA ARG A 112 90.541 30.760 -10.004 1.00 28.18 C
ATOM 612 CB ARG A 112 90.403 31.378 -8.614 1.00 28.37 C
ATOM 613 CG ARG A 112 90.263 32.883 -8.622 1.00 27.57 C
ATOM 614 CD ARG A 112 89.828 33.452 -7.293 1.00 27.27 C
ATOM 615 NE ARG A 112 89.976 34.899 -7.282 1.00 26.93 N
ATOM 616 CZ ARG A 112 89.758 35.671 -6.233 1.00 27.51 C
ATOM 617 NH1 ARG A 112 89.360 35.146 -5.079 1.00 28.76 N
ATOM 618 NH2 ARG A 112 89.932 36.979 -6.339 1.00 26.92 N
ATOM 619 C ARG A 112 91.255 29.413 -9.933 1.00 28.60 C
ATOM 620 O ARG A 112 90.627 28.379 -10.197 1.00 28.00 O
ATOM 621 N PRO A 113 92.556 29.402 -9.616 1.00 28.77 N
ATOM 622 CA PRO A 113 93.282 28.129 -9.517 1.00 28.93 C
ATOM 623 CB PRO A 113 94.697 28.557 -9.102 1.00 29.22 C
ATOM 624 CG PRO A 113 94.817 29.977 -9.608 1.00 29.25 C
ATOM 625 CD PRO A 113 93.444 30.560 -9.383 1.00 28.81 C
ATOM 626 C PRO A 113 92.642 27.163 -8.505 1.00 28.63 C
ATOM 627 O PRO A 113 92.473 25.982 -8.829 1.00 28.81 O
ATOM 628 N ASP A 114 92.239 27.664 -7.340 1.00 28.09 N
ATOM 629 CA ASP A 114 91.740 26.800 -6.269 1.00 27.57 C
ATOM 630 CB ASP A 114 92.605 26.991 -5.020 1.00 28.11 C
ATOM 631 CG ASP A 114 94.078 26.644 -5.272 1.00 30.45 C
ATOM 632 OD1 ASP A 114 94.959 27.360 -4.740 1.00 31.83 O
ATOM 633 OD2 ASP A 114 94.438 25.680 -5.998 1.00 30.94 O
ATOM 634 C ASP A 114 90.252 26.962 -5.921 1.00 26.62 C
ATOM 635 O ASP A 114 89.754 26.323 -4.980 1.00 26.49 O
ATOM 636 N SER A 115 89.549 27.806 -6.677 1.00 25.25 N
ATOM 637 CA SER A 115 88.150 28.130 -6.382 1.00 23.81 C
ATOM 638 CB SER A 115 88.100 29.182 -5.276 1.00 23.83 C
ATOM 639 OG SER A 115 88.650 30.403 -5.733 1.00 22.52 O
ATOM 640 C SER A 115 87.352 28.653 -7.586 1.00 23.20 C
ATOM 641 O SER A 115 87.917 28.964 -8.639 1.00 22.61 O
ATOM 642 N PHE A 116 86.039 28.761 -7.400 1.00 22.13 N
ATOM 643 CA PHE A 116 85.175 29.515 -8.306 1.00 21.81 C
ATOM 644 CB PHE A 116 84.074 28.627 -8.901 1.00 21.79 C
ATOM 645 CG PHE A 116 84.578 27.655 -9.921 1.00 22.56 C
ATOM 646 CD1 PHE A 116 85.096 26.425 -9.532 1.00 23.50 C
ATOM 647 CE1 PHE A 116 85.581 25.515 -10.487 1.00 25.19 C
ATOM 648 CZ PHE A 116 85.550 25.846 -11.835 1.00 24.86 C
ATOM 649 CE2 PHE A 116 85.032 27.080 -12.230 1.00 25.05 C
ATOM 650 CD2 PHE A 116 84.551 27.974 -11.271 1.00 24.09 C
ATOM 651 C PHE A 116 84.556 30.678 -7.553 1.00 21.29 C
ATOM 652 O PHE A 116 84.349 30.605 -6.341 1.00 21.62 O
ATOM 653 N VAL A 117 84.280 31.757 -8.275 1.00 20.75 N
ATOM 654 CA VAL A 117 83.674 32.944 -7.707 1.00 19.94 C
ATOM 655 CB VAL A 117 84.628 34.134 -7.791 1.00 20.10 C
ATOM 656 CG1 VAL A 117 84.036 35.341 -7.089 1.00 19.06 C
ATOM 657 CG2 VAL A 117 86.019 33.768 -7.189 1.00 20.50 C
ATOM 658 C VAL A 117 82.399 33.242 -8.489 1.00 19.85 C
ATOM 659 O VAL A 117 82.441 33.393 -9.713 1.00 20.09 O
ATOM 660 N LEU A 118 81.276 33.327 -7.785 1.00 19.32 N
ATOM 661 CA LEU A 118 79.981 33.584 -8.400 1.00 19.32 C
ATOM 662 CB LEU A 118 78.936 32.565 -7.912 1.00 19.30 C
ATOM 663 CG LEU A 118 78.914 31.157 -8.510 1.00 20.91 C
ATOM 664 CD1 LEU A 118 80.203 30.381 -8.224 1.00 23.74 C
ATOM 665 CD2 LEU A 118 77.741 30.382 -7.949 1.00 22.22 C
ATOM 666 C LEU A 118 79.514 34.981 -8.051 1.00 19.31 C
ATOM 667 O LEU A 118 79.574 35.387 -6.887 1.00 19.13 O
ATOM 668 N ILE A 119 79.048 35.715 -9.062 1.00 19.23 N
ATOM 669 CA ILE A 119 78.521 37.053 -8.860 1.00 19.06 C
ATOM 670 CB ILE A 119 79.093 38.062 -9.898 1.00 19.52 C
ATOM 671 CG1 ILB A 119 80.627 37.931 -10.022 1.00 19.59 C
ATOM 672 CD1 ILE A 119 81.434 38.222 -8.736 1.00 19.03 C
ATOM 673 CG2 ILE A 119 78.652 39.509 -9.557 1.00 18.88 C
ATOM 674 C ILE A 119 77.008 36.958 -8.938 1.00 19.43 C
ATOM 675 O ILE A 119 76.446 36.592 -9.977 1.00 19.01 O
ATOM 676 N LEU A 120 76.358 37.266 -7.823 1.00 19.78 N
ATOM 677 CA LEU A 120 74.913 37.097 -7.683 1.00 20.66 C
ATOM 678 CB LEU A 120 74.609 36.193 -6.483 1.00 20.51 C
ATOM 679 CG LEU A 120 75.197 34.788 -6.594 1.00 21.71 C
ATOM 680 CD1 LEU A 120 75.218 34.103 -5.236 1.00 23.12 C
ATOM 681 CD2 LEU A 120 74.403 33.967 -7.591 1.00 22.78 C
ATOM 682 C LEU A 120 74.253 38.436 -7.455 1.00 20.91 C
ATOM 683 O LEU A 120 74.853 39.319 -6.848 1.00 20.71 O
ATOM 684 N GLU A 121 73.015 38.588 -7.919 1.00 21.58 N
ATOM 685 CA GLU A 121 72.238 39.775 -7.581 1.00 22.82 C
ATOM 686 CB GLU A 121 70.883 39.780 -8.308 1.00 23.93 C
ATOM 687 CG GLU A 121 69.759 39.096 -7.559 1.00 26.70 C
ATOM 688 CD GLU A 121 68.493 38.950 -8.387 1.00 30.59 C
ATOM 689 OE1 GLU A 121 67.830 39.973 -8.654 1.00 33.17 O
ATOM 690 OE2 GLU A 121 68.159 37.811 -8.759 1.00 31.26 O
ATOM 691 C GLU A 121 72.062 39.836 -6.065 1.00 22.52 C
ATOM 692 O GLU A 121 72.087 38.800 -5.391 1.00 22.12 O
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ATOM 696 CG ARG A 122 72.814 41.952 -1.920 1.00 21.41 C
ATOM 697 CD ARG A 122 74.128 42.195 -1.161 1.00 21.79 C
ATOM 698 NE ARG A 122 74.932 43.293 -1.726 1.00 20.54 N
ATOM 699 CZ ARG A 122 74.781 44.581 -1.418 1.00 21.80 C
ATOM 700 NH1 ARG A 122 73.860 44.973 -0.543 1.00 21.45 N
ATOM 701 NH2 ARG A 122 75.568 45.489 -1.977 1.00 23.39 N
ATOM 702 C ARG A 122 70.575 42.249 -3.864 1.00 23.50 C
ATOM 703 O ARG A 122 70.764 43.419 -4.156 1.00 23.59 O
ATOM 704 N PRO A 123 69.429 41.818 -3.330 1.00 24.57 N
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ATOM 708 CD PRO A 123 69.047 40.411 -3.109 1.00 24.18 C
ATOM 709 C PRO A 123 68.860 43.599 -1.703 1.00 25.82 C
ATOM 710 O PRO A 123 69.678 43.129 -0.900 1.00 25.56 O
ATOM 711 N GLU A 124 68.358 44.830 -1.607 1.00 26.56 N
ATOM 712 CA GLU A 124 68.738 45.750 -0.533 1.00 27.26 C
ATOM 713 CB GLU A 124 69.952 46.591 -0.958 1.00 27.95 C
ATOM 714 CG GLU A 124 70.730 47.274 0.171 1.00 30.91 C
ATOM 715 CD GLU A 124 71.867 48.140 -0.367 1.00 35.36 C
ATOM 716 OE1 GLU A 124 71.616 48.930 -1.311 1.00 37.56 O
ATOM 717 OE2 GLU A 124 73.017 48.036 0.134 1.00 36.68 O
ATOM 718 C GLU A 124 67.544 46.649 -0.201 1.00 26.82 C
ATOM 719 O GLU A 124 67.053 47.358 -1.078 1.00 27.29 O
ATOM 720 N PRO A 125 67.061 46.617 1.045 1.00 25.92 N
ATOM 721 CA PRO A 125 67.599 45.755 2.101 1.00 24.79 C
ATOM 722 CB PRO A 125 67.062 46.403 3.373 1.00 24.95 C
ATOM 723 CG PRO A 125 65.759 46.993 2.960 1.00 24.96 C
ATOM 724 CD PRO A 125 65.936 47.437 1.530 1.00 25.81 C
ATOM 725 C PRO A 125 67.095 44.316 1.989 1.00 23.97 C
ATOM 726 O PRO A 125 66.109 44.040 1.287 1.00 23.35 O
ATOM 727 N VAL A 126 67.789 43.412 2.670 1.00 23.02 N
ATOM 728 CA VAL A 126 67.507 41.987 2.583 1.00 22.32 C
ATOM 729 CB VAL A 126 68.333 41.305 1.439 1.00 22.37 C
ATOM 730 CG1 VAL A 126 69.815 41.129 1.837 1.00 21.96 C
ATOM 731 CG2 VAL A 126 67.732 39.971 1.028 1.00 22.11 C
ATOM 732 C VAL A 126 67.809 41.342 3.925 1.00 22.20 C
ATOM 733 O VAL A 126 68.600 41.866 4.723 1.00 22.19 O
ATOM 734 N GLN A 127 67.159 40.209 4.166 1.00 21.35 N
ATOM 735 CA GLN A 127 67.429 39.378 5.323 1.00 20.84 C
ATOM 736 CB GLN A 127 66.653 39.883 6.540 1.00 20.45 C
ATOM 737 CG GLN A 127 66.866 39.053 7.796 1.00 20.49 -C
ATOM 738 CD GLN A 127 66.156 39.632 8.999 1.00 22.00 C
ATOM 739 OE1 GLN A 127 64.953 39.891 8.944 1.00 22.10 O
ATOM 740 NE2 GLN A 127 66.892 39.842 10.082 1.00 20.41 N
ATOM 741 C GLN A 127 66.996 37.952 4.963 1.00 20.56 C
ATOM 742 O GLN A 127 65.917 37.760 4.392 1.00 20.00 O
ATOM 743 N ASP A 128 67.845 36.967 5.250 1.00 19.63 N
ATOM 744 CA ASP A 128 67.454 35.593 5.008 1.00 19.54 C
ATOM 745 CB ASP A 128 68.672 34.650 4.844 1.00 19.72 C
ATOM 746 CG ASP A 128 69.276 34.181 6.158 1.00 21.27 C
ATOM 747 OD1 ASP A 128 68.578 34.093 7.189 1.00 22.90 O
ATOM 748 OD2 ASP A 128 70.480 33.843 6.237 1.00 24.10 O
ATOM 749 C ASP A 128 66.381 35.126 6.016 1.00 19.14 C
ATOM 750 O ASP A 128 66.220 35.724 7.079 1.00 18.98 O
ATOM 751 N LEU A 129 65.642 34.077 5.658 1.00 18.65 N
ATOM 752 CA LEU A 129 64.485 33.651 6.429 1.00 18.28 C
ATOM 753 CB LEU A 129 63.611 32.662 5.619 1.00 17.80 C
ATOM 754 CG LEU A 129 62.291 32.181 6.245 1.00 17.80 C
ATOM 755 CD1 LEU A 129 61.344 33.350 6.565 1.00 16.86 C
ATOM 756 CD2 LEU A 129 61.591 31.180 5.327 1.00 15.45 C
ATOM 757 C LEU A 129 64.861 33.096 7.804 1.00 18.57 C
ATOM 758 O LEU A 129 64.095 33.220 8.760 1.00 18.46 O
ATOM 759 N PHE A 130 66.047 32.503 7.908 1.00 18.90 N
ATOM 760 CA PHE A 130 66.545 32.032 9.200 1.00 19.18 C
ATOM 761 CB PHE A 130 67.887 31.311 9.033 1.00 19.86 C
ATOM 762 CG PHE A 130 68.531 30.931 10.339 1.00 22.10 C
ATOM 763 CD1 PHE A 130 69.471 31.764 10.933 1.00 23.65 C
ATOM 764 CE1 PHE A 130 70.069 31.423 12.155 1.00 26.57 C
ATOM 765 CZ PHE A 130 69.712 30.232 12.792 1.00 25.84 C
ATOM 766 CE2 PHE A 130 68.765 29.398 12.206 1.00 26.84 C
ATOM 767 CD2 PHE A 130 68.179 29.748 10.982 1.00 24.38 C
ATOM 768 C PHE A 130 66.704 33.176 10.203 1.00 19.08 C
ATOM 769 O PHE A 130 66.287 33.060 11.374 1.00 17.75 O
ATOM 770 N ASP A 131 67.316 34.274 9.753 1.00 19.37 N
ATOM 771 CA ASP A 131 67.489 35.442 10.622 1.00 20.03 C
ATOM 772 CB ASP A 131 68.375 36.505 9.966 1.00 20.64 C
ATOM 773 CG ASP A 131 69.836 36.090 9.894 1.00 23.72 C
ATOM 774 OD1 ASP A 131 70.258 35.197 10.671 1.00 28.11 O
ATOM 775 OD2 ASP A 131 70.642 36.603 9.084 1.00 27.01 O
ATOM 776 C ASP A 131 66.136 36.030 10.947 1.00 19.62 C
ATOM 777 O ASP A 131 65.868 36.368 12.086 1.00 19.32 O
ATOM 778 N PHE A 132 65.275 36.133 9.936 1.00 19.50 N
ATOM 779 CA PHE A 132 63.969 36.758 10.094 1.00 19.48 C
ATOM 780 CB PHE A 132 63.233 36.740 8.754 1.00 19.50 C
ATOM 781 CG PHE A 132 61.939 37.481 8.749 1.00 20.08 C
ATOM 782 CD1 PHE A 132 61.906 38.839 8.455 1.00 21.55 C
ATOM 783 CE1 PHE A 132 60.704 39.535 8.433 1.00 22.42 C
ATOM 784 CZ PHE A 132 59.506 38.861 8.680 1.00 22.64 C
ATOM 785 CE2 PHE A 132 59.522 37.505 8.962 1.00 21.42 C
ATOM 786 CD2 PHE A 132 60.734 36.814 8.991 1.00 21.38 C
ATOM 787 C PHE A 132 63.186 36.015 11.167 1.00 20.30 C
ATOM 788 O PHE A 132 62.643 36.642 12.088 1.00 20.08 O
ATOM 789 N ILE A 133 63.131 34.682 11.064 1.00 20.79 N
ATOM 790 CA ILE A 133 62.411 33.875 12.064 1.00 21.52 C
ATOM 791 CB ILE A 133 62.195 32.429 11.583 1.00 21.38 C
ATOM 792 CG1 ILE A 133 61.215 32.402 10.402 1.00 19.84 C
ATOM 793 CD1 ILE A 133 61.200 31.104 9.665 1.00 16.74 C
ATOM 794 CG2 ILE A 133 61.665 31.539 12.747 1.00 21.31 C
ATOM 795 C ILE A 133 63.097 33.868 13.438 1.00 22.84 C
ATOM 796 O ILE A 133 62.430 33.825 14.472 1.00 22.75 O
ATOM 797 N THR A 134 64.423 33.888 13.446 1.00 23.77 N
ATOM 798 CA THR A 134 65.167 34.000 14.696 1.00 25.24 C
ATOM 799 CB THR A 134 66.683 33.9721 14.427 1.00 24.97 C
ATOM 800 OG1 THR A 134 67.056 32.682 13.921 1.00 24.99 O
ATOM 801 CG2 THR A 134 67.486 34.101 15.735 1.00 25.41 C
ATOM 802 C THR A 134 64.779 35.286 15.433 1.00 26.05 C
ATOM 803 O THR A 134 64.514 35.271 16.636 1.00 26.27 O
ATOM 804 N GLU A 135 64.728 36.386 14.693 1.00 27.17 N
ATOM 805 CA GLU A 135 64.424 37.693 15.268 1.00 28.48 C
ATOM 806 CB GLU A 135 64.830 38.807 14.302 1.00 28.91 C
ATOM 807 CG GLU A 135 66.282 39.221 14.449 1.00 32.87 C
ATOM 808 CD GLU A 135 66.702 40.288 13.450 1.00 37.37 C
ATOM 809 OE1 GLU A 135 65.813 41.022 12.939 1.00 38.58 O
ATOM 810 OE2 GLU A 135 67.927 40.383 13.177 1.00 38.32 O
ATOM 811 C GLU A 135 62.958 37.853 15.657 1.00 28.36 C
ATOM 812 O GLU A 135 62.656 38.416 16.710 1.00 27.93 O
ATOM 813 N ARG A 136 62.056 37.345 14.817 1.00 27.83 N
ATOM 814 CA ARG A 136 60.635 37.631 14.983 1.00 27.91 C
ATOM 815 CB ARG A 136 60.022 38.109 13.657 1.00 28.19 C
ATOM 816 CG ARG A 136 60.551 39.487 13.244 1.00 30.84 C
ATOM 817 CD ARG A 136 60.046 40.034 11.909 1.00 33.40 C
ATOM 818 NE ARG A 136 58.583 40.081 11.805 1.00 35.56 N
ATOM 819 CZ ARG A 136 57.907 40.978 11.081 1.00 35.76 C
ATOM 820 NH1 ARG A 136 58.556 41.923 10.403 1.00 35.79 N
ATOM 821 NH2 ARG A 136 56.580 40.938 11.041 1.00 34.21 N
ATOM 822 C ARG A 136 59.836 36.488 15.594 1.00 26.86 C
ATOM 823 O ARG A 136 58.683 36.677 15.980 1.00 27.36 O
ATOM 824 N GLY A 137 60.452 35.316 15.713 1.00 25.61 N
ATOM 825 CA GLY A 137 59.754 34.134 16.187 1.00 24.72 C
ATOM 826 C GLY A 137 58.763 33.584 15.156 1.00 24.39 C
ATOM 827 O GLY A 137 58.796 33.952 13.969 1.00 23.90 O
ATOM 828 N ALA A 138 57.880 32.699 15.615 1.00 23.04 N
ATOM 829 CA ALA A 138 56.864 32.089 14.760 1.00 22.25 C
ATOM 830 CB ALA A 138 55.895 31.269 15.612 1.00 22.29 C
ATOM 831 C ALA A 138 56.101 33.152 13.968 1.00 22.02 C
ATOM 832 O ALA A 138 55.694 34.174 14.523 1.00 21.11 O
ATOM 833 N LEU A 139 55.914 32.906 12.671 1.00 20.97 N
ATOM 834 CA LEU A 139 55.223 33.860 11.814 1.00 20.45 C
ATOM 835 CB LEU A 139 55.673 33.676 10.358 1.00 19.75 C
ATOM 836 CG LEU A 139 57.194 33.668 10.121 1.00 19.78 C
ATOM 837 CD1 LEU A 139 57.509 33.578 8.624 1.00 17.80 C
ATOM 838 CD2 LEU A 139 57.871 34.908 10.772 1.00 19.37 C
ATOM 839 C LEU A 139 53.706 33.707 11.938 1.00 20.32 C
ATOM 840 O LEU A 139 53.209 32.589 12.007 1.00 20.36 O
ATOM 841 N GLN A 140 52.979 34.828 11.950 1.00 19.81 N
ATOM 842 CA GLN A 140 51.530 34.796 11.751 1.00 19.77 C
ATOM 843 CB GLN A 140 50.958 36.210 11.624 1.00 20.35 C
ATOM 844 CG GLN A 140 50.938 37.006 12.913 1.00 24.46 C
ATOM 845 CD GLN A 140 50.666 38.484 12.674 1.00 30.48 C
ATOM 846 OE1 GLN A 140 49.836 38.846 11.827 1.00 32.68 O
ATOM 847 NE2 GLN A 140 51.357 39.343 13.421 1.00 32.67 N
ATOM 848 C GLN A 140 51.211 34.035 10.469 1.00 18.78 C
ATOM 849 O GLN A 140 51.957 34.118 9.494 1.00 17.03 O
ATOM 850 N GLU A 141 50.088 33.325 10.453 1.00 18.57 N
ATOM 851 CA GLU A 141 49.769 32.482 9.296 1.00 18.81 C
ATOM 852 CB GLU A 141 48.563 31.588 9.579 1.00 18.86 C
ATOM 853 CG GLU A 141 48.922 30.461 10.531 1.00 20.50 C
ATOM 854 CD GLU A 141 47.785 29.504 10.762 1.00 20.11 C
ATOM 855 OE1 GLU A 141 47.107 29.151 9.779 1.00 20.79 O
ATOM 856 OE2 GLU A 141 47.572 29.120 11.933 1.00 21.96 O
ATOM 857 C GLU A 141 49.605 33.235 7.970 1.00 18.75 C
ATOM 858 O GLU A 141 49.969 32.702 6.931 1.00 18.07 O
ATOM 859 N GLU A 142 49.048 34.454 8.002 1.00 18.37 N
ATOM 860 CA GLU A 142 48.939 35.263 6.787 1.00 18.46 C
ATOM 861 CB GLU A 142 48.216 36.589 7.078 1.00 18.72 C
ATOM 862 CG GLU A 142 48.076 37.515 5.889 1.00 20.48 C
ATOM 863 CD GLU A 142 47.411 38.836 6.241 1.00 24.11 C
ATOM 864 OE1 GLU A 142 48.061 39.692 6.891 1.00 23.55 O
ATOM 865 OE2 GLU A 142 46.232 39.017 5.851 1.00 25.93 O
ATOM 866 C GLU A 142 50.329 35.529 6.179 1.00 17.83 C
ATOM 867 O GLU A 142 50.506 35.530 4.959 1.00 17.80 O
ATOM 868 N LEU A 143 51.309 35.761 7.037 1.00 16.88 N
ATOM 869 CA LEU A 143 52.653 36.029 6.568 1.00 16.41 C
ATOM 870 CB LEU A 143 53.497 36.667 7.666 1.00 16.81 C
ATOM 871 CG LEU A 143 54.952 36.998 7.288 1.00 16.83 C
ATOM 872 CD1 LEU A 143 54.999 37.909 6.049 1.00 15.94 C
ATOM 873 CD2 LEU A 143 55.625 37.670 8.464 1.00 16.70 C
ATOM 874 C LEU A 143 53.307 34.749 6.057 1.00 15.72 C
ATOM 875 O LEU A 143 53.921 34.745 4.983 1.00 15.44 O
ATOM 876 N ALA A 144 53.173 33.670 6.824 1.00 14.81 N
ATOM 877 CA ALA A 144 53.692 32.364 6.404 1.00 14.61 C
ATOM 878 CB ALA A 144 53.444 31.327 7.470 1.00 14.33 C
ATOM 879 C ALA A 144 53.078 31.914 5.077 1.00 14.82 C
ATOM 880 O ALA A 144 53.754 31.270 4.253 1.00 14.19 O
ATOM 881 N ARG A 145 51.796 32.235 4.884 1.00 14.19 N
ATOM 882 CA ARG A 145 51.090 31.869 3.666 1.00 15.16 C
ATOM 883 CB ARG A 145 49.587 32.205 3.764 1.00 15.23 C
ATOM 884 CG ARG A 145 48.803 32.031 2.453 1.00 16.28 C
ATOM 885 CD ARG A 145 47.303 32.380 2.564 1.00 18.20 C
ATOM 886 NE ARG A 145 46.693 31.573 3.615 1.00 17.28 N
ATOM 887 CZ ARG A 145 46.238 32.049 4.761 1.00 17.72 C
ATOM 888 NH1 ARG A 145 46.270 33.352 5.018 1.00 17.11 N
ATOM 889 NH2 ARG A 145 45.747 31.212 5.657 1.00 18.63 N
ATOM 890 C ARG A 145 51.727 32.562 2.471 1.00 15.43 C
ATOM 891 O ARG A 145 52.034 31.917 1.470 1.00 16.61 O
ATOM 892 N SER A 146 51.941 33.868 2.578 1.00 15.08 N
ATOM 893 CA SER A 146 52.557 34.618 1.491 1.00 15.89 C
ATOM 894 CB SER A 146 52.558 36.114 1.823 1.00 15.77 C
ATOM 895 OG SER A 146 53.374 36.817 0.907 1.00 18.17 O
ATOM 896 C SER A 146 53.976 34.104 1.170 1.00 15.75 C
ATOM 897 O SER A 146 54.311 33.849 0.000 1.00 15.69 O
ATOM 898 N PHE A 147 54.777 33.926 2.220 1.00 15.20 N
ATOM 899 CA PHE A 147 56.145 33.423 2.104 1.00 15.40 C
ATOM 900 CB PHE A 147 56.801 33.392 3.487 1.00 15.25 C
ATOM 901 CG PHE A 147 57.345 34.724 3.939 1.00 16.31 C
ATOM 902 CD1 PHE A 147 57.041 35.903 3.246 1.00 17.31 C
ATOM 903 CE1 PHE A 147 57.552 37.121 3.663 1.00 18.81 C
ATOM 904 CZ PHE A 147 58.389 37.178 4.790 1.00 18.13 C
ATOM 905 CE2 PHE A 147 58.696 36.017 5.480 1.00 17.81 C
ATOM 906 CD2 PHE A 147 58.176 34.793 5.052 1.00 16.34 C
ATOM 907 C PHE A 147 56.195 32.024 1.483 1.00 14.94 C
ATOM 908 O PHE A 147 56.927 31.786 0.522 1.00 15.80 O
ATOM 909 N PHE A 148 55.407 31.114 2.033 1.00 14.80 N
ATOM 910 CA PHE A 148 55.354 29.733 1.549 1.00 15.37 C
ATOM 911 CB PHE A 148 54.409 28.887 2.418 1.00 14.71 C
ATOM 912 CG PHE A 148 54.574 27.399 2.224 1.00 14.42 C
ATOM 913 CD1 PHE A 148 55.810 26.776 2.456 1.00 13.47 C
ATOM 914 CE1 PHE A 148 55.962 25.379 2.277 1.00 10.13 C
ATOM 915 CZ PHE A 148 54.876 24.618 1.864 1.00 12.94 C
ATOM 916 CE2 PHE A 148 53.635 25.237 1.625 1.00 14.02 C
ATOM 917 CD2 PHE A 148 53.495 26.622 1.813 1.00 14.27 C
ATOM 918 C PHE A 148 54.898 29.648 0.089 1.00 15.20 C
ATOM 919 O PHE A 148 55.459 28.902 -0.703 1.00 14.97 O
ATOM 920 N TRP A 149 53.866 30.413 -0.253 1.00 15.54 N
ATOM 921 CA TRP A 149 53.393 30.477 -1.634 1.00 15.37 C
ATOM 922 CB TRP A 149 52.230 31.470 -1.739 1.00 15.34 C
ATOM 923 CG TRP A 149 51.671 31.606 -3.110 1.00 15.24 C
ATOM 924 CD1 TRP A 149 52.070 32.494 -4.075 1.00 14.51 C
ATOM 925 NE1 TRP A 149 51.301 32.333 -5.205 1.00 15.75 N
ATOM 926 CE2 TRP A 149 50.394 31.326 -4.998 1.00 15.41 C
ATOM 927 CD2 TRP A 149 50.595 30.845 -3.682 1.00 15.51 C
ATOM 928 CE3 TRP A 149 49.766 29.804 -3.210 1.00 15.20 C
ATOM 929 CZ3 TRP A 149 48.777 29.287 -4.064 1.00 14.40 C
ATOM 930 CH2 TRP A 149 48.614 29.788 -5.376 1.00 15.19 C
ATOM 931 CZ2 TRP A 149 49.405 30.804 -5.857 1.00 15.74 C
ATOM 932 C TRP A 149 54.516 30.881 -2.585 1.00 15.47 C
ATOM 933 O TRP A 149 54.709 30.266 -3.637 1.00 15.67 O
ATOM 934 N GLN A 150 55.267 31.913 -2.213 1.00 16.07 N
ATOM 935 CA GLN A 150 56.354 32.394 -3.063 1.00 16.16 C
ATOM 936 CB GLN A 150 56.926 33.704 -2.522 1.00 16.54 C
ATOM 937 CG GLN A 150 56.012 34.904 -2.760 1.00 17.72 C
ATOM 938 CD GLN A 150 56.654 36.188 -2.309 1.00 20.82 C
ATOM 939 OE1 GLN A 150 57.668 36.594 -2.860 1.00 20.46 O
ATOM 940 NE2 GLN A 150 56.078 36.825 -1.291 1.00 22.67 N
ATOM 941 C GLN A 150 57.470 31.366 -3.231 1.00 16.22 C
ATOM 942 O GLN A 150 58.068 31.271 -4.311 1.00 16.09 O
ATOM 943 N VAL A 151 57.747 30.613 -2.165 1.00 15.69 N
ATOM 944 CA VAL A 151 58.719 29.528 -2.219 1.00 15.67 C
ATOM 945 CB VAL A 151 58.973 28.914 -0.819 1.00 15.75 C
ATOM 946 CG1 VAL A 151 59.838 27.661 -0.920 1.00 15.14 C
ATOM 947 CG2 VAL A 151 59.648 29.950 0.087 1.00 14.26 C
ATOM 948 C VAL A 151 58.232 28.454 -3.186 1.00 15.73 C
ATOM 949 O VAL A 151 58.979 28.003 -4.048 1.00 15.25 O
ATOM 950 N LEU A 152 56.967 28.065 -3.046 1.00 16.29 N
ATOM 951 CA LEU A 152 56.348 27.138 -3.992 1.00 17.18 C
ATOM 952 CB LEU A 152 54.859 26.947 -3.658 1.00 17.37 C
ATOM 953 CG LEU A 152 54.467 25.690 -2.874 1.00 19.91 C
ATOM 954 CD1 LEU A 152 54.643 24.445 -3.756 1.00 22.90 C
ATOM 955 CD2 LEU A 152 55.236 25.494 -1.621 1.00 23.13 C
ATOM 956 C LEU A 152 56.512 27.572 -5.453 1.00 16.62 C
ATOM 957 O LEU A 152 56.889 26.765 -6.299 1.00 16.65 O
ATOM 958 N GLU A 153 56.217 28.841 -5.739 1.00 16.61 N
ATOM 959 CA GLU A 153 56.333 29.375 -7.096 1.00 16.62 C
ATOM 960 CB GLU A 153 55.832 30.827 -7.180 1.00 16.56 C
ATOM 961 CG GLU A 153 54.331 30.997 -6.968 1.00 17.23 C
ATOM 962 CD GLU A 153 53.514 30.514 -8.156 1.00 17.86 C
ATOM 963 OE1 GLU A 153 53.901 30.807 -9.303 1.00 20.00 O
ATOM 964 OE2 GLU A 153 52.487 29.843 -7.945 1.00 17.52 O
ATOM 965 C GLU A 153 57.777 29.297 -7.568 1.00 16.68 C
ATOM 966 O GLU A 153 58.038 28.986 -8.732 1.00 16.20 O
ATOM 967 N ALA A 154 58.712 29.559 -6.656 1.00 16.55 N
ATOM 968 CA ALA A 154 60.140 29.496 -6.992 1.00 16.97 C
ATOM 969 CB ALA A 154 61.004 30.188 -5.919 1.00 15.90 C
ATOM 970 C ALA A 154 60.621 28.063 -7.243 1.00 16.84 C
ATOM 971 O ALA A 154 61.345 27.818 -8.207 1.00 17.76 O
ATOM 972 N VAL A 155 60.218 27.126 -6.386 1.00 16.64 N
ATOM 973 CA VAL A 155 60.584 25.724 -6.564 1.00 16.78 C
ATOM 974 CB VAL A 155 60.201 24.871 -5.326 1.00 17.27 C
ATOM 975 CG1 VAL A 155 60.395 23.386 -5.589 1.00 16.81 C
ATOM 976 CG2 VAL A 155 61.032 25.313 -4.084 1.00 17.68 C
ATOM 977 C VAL A 155 59.958 25.163 -7.852 1.00 16.84 C
ATOM 978 O VAL A 155 60.621 24.445 -8.603 1.00 16.56 O
ATOM 979 N ARG A 156 58.690 25.491 -8.107 1.00 16.70 N
ATOM 980 CA ARG A 156 58.051 25.086 -9.374 1.00 17.03 C
ATOM 981 CB ARG A 156 56.603 25.570 -9.461 1.00 16.46 C
ATOM 982 CG ARG A 156 55.645 24.827 -8.564 1.00 17.08 C
ATOM 983 CD ARG A 156 54.201 25.302 -8.681 1.00 16.07 C
ATOM 984 NE ARG A 156 53.815 25.379 -10.087 1.00 15.86 N
ATOM 985 CZ ARG A 156 52.921 26.218 -10.591 1.00 16.05 C
ATOM 986 NH1 ARG A 156 52.280 27.071 -9.805 1.00 14.03 N
ATOM 987 NH2 ARG A 156 52.672 26.199 -11.895 1.00 15.89 N
ATOM 988 C ARG A 156 58.839 25.599 -10.573 1.00 17.05 C
ATOM 989 O ARG A 156 59.071 24.864 -11.529 1.00 17.34 O
ATOM 990 N HIS A 157 59.266 26.855 -10.522 1.00 17.35 N
ATOM 991 CA HIS A 157 60.090 27.397 -11.594 1.00 18.31 C
ATOM 992 CB HIS A 157 60.449 28.859 -11.330 1.00 18.48 C
ATOM 993 CG HIS A 157 61.374 29.443 -12.351 1.00 20.28 C
ATOM 994 ND1 HIS A 157 62.696 29.733 -12.078 1.00 23.93 N
ATOM 995 CE1 HIS A 157 63.262 30.241 -13.158 1.00 23.06 C
ATOM 996 NE2 HIS A 157 62.356 30.288 -14.118 1.00 23.55 N
ATOM 997 CD2 HIS A 157 61.168 29.796 -13.639 1.00 20.83 C
ATOM 998 C HIS A 157 61.361 26.559 -11.806 1.00 18.61 C
ATOM 999 O HIS A 157 61.691 26.199 -12.947 1.00 17.98 O
ATOM 1000 N CYS A 158 62.064 26.247 -10.715 1.00 18.74 N
ATOM 1001 CA CYS A 158 63.259 25.405 -10.800 1.00 19.66 C
ATOM 1002 CB CYS A 158 63.837 25.146 -9.413 1.00 19.79 C
ATOM 1003 SG CYS A 158 64.537 26.620 -8.683 1.00 22.60 S
ATOM 1004 C CYS A 158 62.979 24.077 -11.501 1.00 19.92 C
ATOM 1005 O CYS A 158 63.677 23.712 -12.447 1.00 20.10 O
ATOM 1006 N HIS A 159 61.955 23.365 -11.032 1.00 20.09 N
ATOM 1007 CA HIS A 159 61.580 22.085 -11.612 1.00 20.50 C
ATOM 1008 CB HIS A 159 60.484 21.410 -10.782 1.00 20.39 C
ATOM 1009 CG HIS A 159 60.934 20.995 -9.414 1.00 21.38 C
ATOM 1010 ND1 HIS A 159 60.503 19.834 -8.814 1.00 22.95 N
ATOM 1011 CE1 HIS A 159 61.055 19.727 -7.616 1.00 22.06 C
ATOM 1012 NE2 HIS A 159 61.845 20.769 -7.426 1.00 21.41 N
ATOM 1013 CD2 HIS A 159 61.790 21.577 -8.534 1.00 21.73 C
ATOM 1014 C HIS A 159 61.175 22.194 -13.092 1.00 20.62 C
ATOM 1015 O HIS A 159 61.558 21.340 -13.883 1.00 20.59 O
ATOM 1016 N ASN A 160 60.433 23.240 -13.463 1.00 20.97 N
ATOM 1017 CA ASN A 160 60.110 23.508 -14.882 1.00 21.47 C
ATOM 1018 CB ASN A 160 59.230 24.754 -15.042 1.00 21.81 C
ATOM 1019 CG AASN A 160 57.985 24.688 -14.251 0.50 22.71 C
ATOM 1020 CG BASN A 160 58.366 24.731 -16.318 0.50 21.42 C
ATOM 1021 OD1 AASN A 160 57.565 25.688 -13.683 0.50 25.62 O
ATOM 1022 OD1 BASN A 160 58.380 25.680 -17.103 0.50 21.10 O
ATOM 1023 ND2 AASN A 160 57.364 23.518 -14.203 0.50 26.04 N
ATOM 1024 ND2 BASN A 160 57.598 23.664 -16.506 0.50 19.99 N
ATOM 1025 C ASN A 160 61.353 23.728 -15.731 1.00 21.48 C
ATOM 1026 O ASN A 160 61.344 23.430 -16.925 1.00 21.00 O
ATOM 1027 N CYS A 161 62.404 24.278 -15.115 1.00 20.77 N
ATOM 1028 CA CYS A 161 63.691 24.462 -15.773 1.00 21.07 C
ATOM 1029 CB CYS A 161 64.395 25.716 -15.231 1.00 20.76 C
ATOM 1030 SG CYS A 161 63.499 27.235 -15.609 1.00 26.51 S
ATOM 1031 C CYS A 161 64.628 23.242 -15.665 1.00 20.01 C
ATOM 1032 O CYS A 161 65.791 23.329 -16.052 1.00 19.64 O
ATOM 1033 N GLY A 162 64.141 22.124 -15.130 1.00 18.99 N
ATOM 1034 CA GLY A 162 64.965 20.921 -15.005 1.00 18.24 C
ATOM 1035 C GLY A 162 65.968 20.898 -13.850 1.00 17.99 C
ATOM 1036 O GLY A 162 66.963 20.153 -13.878 1.00 16.70 O
ATOM 1037 N VAL A 163 65.696 21.678 -12.805 1.00 17.86 N
ATOM 1038 CA VAL A 163 66.634 21.799 -11.688 1.00 17.74 C
ATOM 1039 CB VAL A 163 67.173 23.251 -11.564 1.00 18.57 C
ATOM 1040 CG1 VAL A 163 67.897 23.479 -10.215 1.00 17.79 C
ATOM 1041 CG2 VAL A 163 68.078 23.608 -12.766 1.00 17.89 C
ATOM 1042 C VAL A 163 65.970 21.373 -10.374 1.00 17.54 C
ATOM 1043 O VAL A 163 64.851 21.780 -10.071 1.00 17.67 O
ATOM 1044 N LEU A 164 66.673 20.550 -9.612 1.00 17.14 N
ATOM 1045 CA LEU A 164 66.235 20.142 -8.288 1.00 17.15 C
ATOM 1046 CB LEU A 164 66.298 18.614 -8.170 1.00 17.23 C
ATOM 1047 CG LEU A 164 65.715 17.973 -6.909 1.00 18.35 C
ATOM 1048 CD1 LEU A 164 64.183 18.038 -6.939 1.00 18.69 C
ATOM 1049 CD2 LEU A 164 66.201 16.530 -6.783 1.00 15.82 C
ATOM 1050 C LEU A 164 67.151 20.802 -7.269 1.00 16.92 C
ATOM 1051 O LEU A 164 68.367 20.594 -7.305 1.00 17.02 O
ATOM 1052 N HIS A 165 66.574 21.583 -6.359 1.00 16.61 N
ATOM 1053 CA HIS A 165 67.356 22.378 -5.410 1.00 15.80 C
ATOM 1054 CB HIS A 165 66.462 23.440 -4.747 1.00 16.02 C
ATOM 1055 CG HIS A 165 67.212 24.444 -3.924 1.00 15.04 C
ATOM 1056 ND1 HIS A 165 67.698 24.155 -2.668 1.00 13.63 N
ATOM 1057 CE1 HIS A 165 68.311 25.218 -2.175 1.00 14.79 C
ATOM 1058 NE2 HIS A 165 68.248 26.188 -3.071 1.00 16.20 N
ATOM 1059 CD2 HIS A 165 67.571 25.726 -4.182 1.00 14.88 C
ATOM 1060 C HIS A 165 68.065 21.520 -4.352 1.00 16.12 C
ATOM 1061 O HIS A 165 69.281 21.692 -4.112 1.00 15.47 O
ATOM 1062 N ARG A 166 67.301 20.628 -3.708 1.00 15.81 N
ATOM 1063 CA ARG A 166 67.802 19.692 -2.685 1.00 16.34 C
ATOM 1064 CB ARG A 166 68.933 18.830 -3.231 1.00 16.34 C
ATOM 1065 CG ARG A 166 68.542 17.800 -4.282 1.00 17.58 C
ATOM 1066 CD ARG A 166 69.743 17.471 -5.131 1.00 23.63 C
ATOM 1067 NE ARG A 166 70.090 16.080 -5.010 1.00 27.91 N
ATOM 1068 CZ ARG A 166 71.277 15.551 -5.274 1.00 28.25 C
ATOM 1069 NH1 ARG A 166 72.327 16.299 -5.636 1.00 26.61 N
ATOM 1070 NH2 ARG A 166 71.404 14.246 -5.142 1.00 25.73 N
ATOM 1071 C ARG A 166 68.284 20.261 -1.348 1.00 17.04 C
ATOM 1072 O ARG A 166 68.778 19.491 -0.517 1.00 17.97 O
ATOM 1073 N ASP A 167 68.165 21.571 -1.127 1.00 16.44 N
ATOM 1074 CA ASP A 167 68.537 22.157 0.172 1.00 17.08 C
ATOM 1075 CB ASP A 167 70.018 22.615 0.164 1.00 16.76 C
ATOM 1076 CG ASP A 167 70.639 22.733 1.576 1.00 19.52 C
ATOM 1077 OD1 ASP A 167 70.136 22.109 2.552 1.00 19.71 0
ATOM 1078 OD2 ASP A 167 71.660 23.441 1.792 1.00 20.05 O
ATOM 1079 C ASP A 167 67.593 23.303 0.559 1.00 16.55 C
ATOM 1080 O ASP A 167 68.028 24.327 1.065 1.00 17.85 O
ATOM 1081 N ILE A 168 66.289 23.130 0.321 1.00 16.37 N
ATOM 1082 CA ILE A 168 65.304 24.165 0.643 1.00 15.43 C
ATOM 1083 CB ILE A 168 63.919 23.803 0.061 1.00 15.49 C
ATOM 1084 CG1 ILE A 168 63.990 23.685 -1.467 1.00 15.11 C
ATOM 1085 CD1 ILE A 168 62.816 22.891 -2.049 1.00 15.98 C
ATOM 1086 CG2 ILE A 168 62.841 24.821 0.481 1.00 14.46 C
ATOM 1087 C ILE A 168 65.226 24.257 2.159 1.00 15.89 C
ATOM 1088 O ILE A 168 64.988 23.247 2.828 1.00 15.71 O
ATOM 1089 N LYS A 169 65.445 25.459 2.682 1.00 15.34 N
ATOM 1090 CA LYS A 169 65.458 25.724 4.116 1.00 15.97 C
ATOM 1091 CB LYS A 169 66.666 25.055 4.793 1.00 16.17 C
ATOM 1092 CG LYS A 169 68.018 25.601 4.321 1.00 18.35 C
ATOM 1093 CD LYS A 169 69.165 24.636 4.595 1.00 21.69 C
ATOM 1094 CE LYS A 169 69.449 24.497 6.073 1.00 23.35 C
ATOM 1095 NZ LYS A 169 70.883 24.061 6.239 1.00 24.28 N
ATOM 1096 C LYS A 169 65.542 27.234 4.314 1.00 15.57 C
ATOM 1097 O LYS A 169 65.954 27.971 3.392 1.00 15.50 O
ATOM 1098 N ASP A 170 65.213 27.676 5.526 1.00 15.04 N
ATOM 1099 CA ASP A 170 65.179 29.090 5.868 1.00 15.81 C
ATOM 1100 CB ASP A 170 64.849 29.284 7.358 1.00 15.73 C
ATOM 1101 CG ASP A 170 65.734 28.457 8.295 1.00 18.50 C
ATOM 1102 OD1 ASP A 170 66.780 27.869 7.880 1.00 19.79 O
ATOM 1103 OD2 ASP A 170 65.450 28.361 9.509 1.00 21.07 O
ATOM 1104 C ASP A 170 66.433 29.880 5.468 1.00 16.21 C
ATOM 1105 O ASP A 170 66.321 30.954 4.874 1.00 16.22 O
ATOM 1106 N GLU A 171 67.607 29.341 5.792 1.00 16.57 N
ATOM 1107 CA GLU A 171 68.918 29.951 5.480 1.00 17.89 C
ATOM 1108 CB GLU A 171 70.040 28.959 5.796 1.00 18.41 C
ATOM 1109 CG GLU A 171 70.770 29.167 7.082 1.00 24.87 C
ATOM 1110 CD GLU A 171 71.735 28.024 7.352 1.00 29.19 C
ATOM 1111 OE1 GLU A 171 72.124 27.876 8.521 1.00 34.95 O
ATOM 1112 OE2 GLU A 171 72.072 27.259 6.407 1.00 30.15 O
ATOM 1113 C GLU A 171 69.096 30.224 3.998 1.00 16.68 C
ATOM 1114 O GLU A 171 69.853 31.125 3.626 1.00 15.52 O
ATOM 1115 N ASN A 172 68.468 29.391 3.171 1.00 15.92 N
ATOM 1116 CA ASN A 172 68.601 29.487 1.707 1.00 15.37 C
ATOM 1117 CB ASN A 172 68.806 28.111 1.093 1.00 14.94 C
ATOM 1118 CG ASN A 172 70.122 27.517 1.493 1.00 15.14 C
ATOM 1119 OD1 ASN A 172 71.047 28.264 1.760 1.00 15.76 O
ATOM 1120 ND2 ASN A 172 70.218 26.188 1.567 1.00 13.68 N
ATOM 1121 C ASN A 172 67.454 30.228 1.026 1.00 15.23 C
ATOM 1122 O ASN A 172 67.198 30.038 -0.154 1.00 15.24 O
ATOM 1123 N ILE A 173 66.799 31.102 1.778 1.00 15.43 N
ATOM 1124 CA ILE A 173 65.714 31.920 1.252 1.00 15.78 C
ATOM 1125 CB ILE A 173 64.350 31.416 1.775 1.00 15.76 C
ATOM 1126 CG1 ILE A 173 64.066 29.987 1.287 1.00 16.39 C
ATOM 1127 CD1 ILE A 173 62.948 29.264 2.080 1.00 14.60 C
ATOM 1128 CG2 ILE A 173 63.211 32.396 1.379 1.00 15.41 C
ATOM 1129 C ILE A 173 65.947 33.363 1.701 1.00 15.85 C
ATOM 1130 O ILE A 173 66.149 33.622 2.884 1.00 15.12 O
ATOM 1131 N LEU A 174 65.914 34.285 0.741 1.00 16.29 N
ATOM 1132 CA LEU A 174 66.139 35.707 0.992 1.00 16.81 C
ATOM 1133 CB LEU A 174 67.035 36.307 -0.105 1.00 16.84 C
ATOM 1134 CG LEU A 174 68.479 35.805 -0.189 1.00 17.08 C
ATOM 1135 CD1 LEU A 174 69.217 36.628 -1.214 1.00 16.20 C
ATOM 1136 CD2 LEU A 174 69.187 35.865 1.153 1.00 16.61 C
ATOM 1137 C LEU A 174 64.816 36.419 0.956 1.00 17.35 C
ATOM 1138 O LEU A 174 63.963 36.085 0.127 1.00 17.94 O
ATOM 1139 N ILE A 175 64.641 37.387 1.850 1.00 17.74 N
ATOM 1140 CA ILE A 175 63.470 38.255 1.833 1.00 18.68 C
ATOM 1141 CB ILE A 175 62.818 38.360 3.226 1.00 18.50 C
ATOM 1142 CG1 ILE A 175 62.456 36.976 3.794 1.00 18.87 C
ATOM 1143 CD1 ILE A 175 62.302 36.995 5.327 1.00 18.86 C
ATOM 1144 CG2 ILE A 175 61.576 39.278 3.167 1.00 18.77 C
ATOM 1145 C ILE A 175 63.902 39.649 1.389 1.00 19.58 C
ATOM 1146 O ILE A 175 64.664 40.322 2.095 1.00 19.31 O
ATOM 1147 N ASP A 176 63.412 40.074 0.228 1.00 20.23 N
ATOM 1148 CA ASP A 176 63.581 41.449 -0.230 1.00 21.84 C
ATOM 1149 CB ASP A 176 63.315 41.541 -1.739 1.00 22.01 C
ATOM 1150 CG ASP A 176 63.414 42.967 -2.280 1.00 23.60 C
ATOM 1151 OD1 ASP A 176 63.243 43.920 -1.502 1.00 23.50 0
ATOM 1152 OD2 ASP A 176 63.625 43.217 -3.482 1.00 24.73 O
ATOM 1153 C ASP A 176 62.588 42.286 0.587 1.00 22.79 C
ATOM 1154 O ASP A 176 61.387 42.316 0.297 1.00 22.81 O
ATOM 1155 N LEU A 177 63.102 42.924 1.634 1.00 23.58 N
ATOM 1156 CA LEU A 177 62.271 43.537 2.660 1.00 24.93 C
ATOM 1157 CB LEU A 177 63.132 44.012 3.835 1.00 25.33 C
ATOM 1158 CG LEU A 177 63.764 42.908 4.700 1.00 25.91 C
ATOM 1159 CD1 LEU A 177 64.830 43.473 5.621 1.00 26.41 C
ATOM 1160 CD2 LEU A 177 62.715 42.118 5.504 1.00 27.00 C
ATOM 1161 C LEU A 177 61.345 44.658 2.164 1.00 25.53 C
ATOM 1162 O LEU A 177 60.231 44.789 2.661 1.00 26.29 O
ATOM 1163 N ASN A 178 61.789 45.433 1.177 1.00 25.87 N
ATOM 1164 CA ASN A 178 60.985 46.525 0.607 1.00 26.30 C
ATOM 1165 CB ASN A 178 61.875 47.492 -0.187 1.00 26.74 C
ATOM 1166 CG ASN A 178 62.544 48.534 0.690 1.00 28.73 C
ATOM 1167 OD1 ASN A 178 62.308 48.600 1.904 1.00 31.92 O
ATOM 1168 ND2 ASN A 178 63.382 49.361 0.078 1.00 30.86 N
ATOM 1169 C ASN A 178 59.857 46.042 -0.307 1.00 26.01 C
ATOM 1170 O ASN A 178 58.771 46.630 -0.338 1.00 25.84 O
ATOM 1171 N ARG A 179 60.134 44.986 -1.066 1.00 25.22 N
ATOM 1172 CA ARG A 179 59.202 44.497 -2.073 1.00 25.06 C
ATOM 1173 CB ARG A 179 59.951 44.089 -3.340 1.00 25.43 C
ATOM 1174 CG ARG A 179 60.482 45.270 -4.157 1.00 26.18 C
ATOM 1175 CD ARG A 179 61.170 44.845 -5.426 1.00 29.81 C
ATOM 1176 NE ARG A 179 61.712 45.951 -6.219 1.00 33.67 N
ATOM 1177 CZ ARG A 179 60.987 46.869 -6.859 1.00 35.31 C
ATOM 1178 NH1 ARG A 179 59.658 46.854 -6.805 1.00 36.83 N
ATOM 1179 NH2 ARG A 179 61.598 47.816 -7.559 1.00 36.82 N
ATOM 1180 C ARG A 179 58.330 43.355 -1.574 1.00 24.41 C
ATOM 1181 O ARG A 179 57.345 43.004 -2.221 1.00 24.91 O
ATOM 1182 N GLY A 180 58.675 42.786 -0.421 1.00 23.59 N
ATOM 1183 CA GLY A 180 57.977 41.611 0.083 1.00 22.56 C
ATOM 1184 C GLY A 180 58.160 40.359 -0.779 1.00 21.90 C
ATOM 1185 O GLY A 180 57.320 39.456 -0.754 1.00 21.19 O
ATOM 1186 N GLU A 181 59.263 40.310 -1.524 1.00 21.18 N
ATOM 1187 CA GLU A 181 59.542 39.216 -2.462 1.00 21.26 C
ATOM 1188 CB GLU A 181 60.001 39.767 -3.815 1.00 20.99 C
ATOM 1189 CG GLU A 181 58.883 40.426 -4.598 1.00 22.33 C
ATOM 1190 CD GLU A 181 59.360 41.165 -5.827 1.00 24.38 C
ATOM 1191 OE1 GLU A 181 60.493 40.911 -6.310 1.00 25.63 O
ATOM 1192 OE2 GLU A 181 58.578 42.011 -6.317 1.00 26.99 O
ATOM 1193 C GLU A 181 60.613 38.281 -1.928 1.00 20.80 C
ATOM 1194 O GLU A 181 61.659 38.735 -1.467 1.00 20.59 O
ATOM 1195 N LEU A 182 60.348 36.979 -2.002 1.00 20.60 N
ATOM 1196 CA LEU A 182 61.297 35.963 -1.555 1.00 20.56 C
ATOM 1197 CB LEU A 182 60.570 34.791 -0.891 1.00 20.37 C
ATOM 1198 CG LEU A 182 60.517 34.821 0.631 1.00 21.15 C
ATOM 1199 CD1 LEU A 182 59.818 36.090 1.096 1.00 22.41 C
ATOM 1200 CD2 LEU A 182 59.801 33.559 1.145 1.00 19.08 C
ATOM 1201 C LEU A 182 62.118 35.439 -2.725 1.00 20.73 C
ATOM 1202 O LEU A 182 61.612 35.341 -3.849 1.00 20.32 O
ATOM 1203 N LYS A 183 63.372 35.096 -2.442 1.00 20.55 N
ATOM 1204 CA LYS A 183 64.313 34.617 -3.448 1.00 20.89 C
ATOM 1205 CB LYS A 183 65.374 35.692 -3.759 1.00 21.35 C
ATOM 1206 CG LYS A 183 64.883 36.741 -4.750 1.00 24.94 C
ATOM 1207 CD LYS A 183 65.757 37.973 -4.773 1.00 26.84 C
ATOM 1208 CE LYS A 183 65.777 38.639 -6.149 1.00 30.89 C
ATOM 1209 NZ LYS A 183 64.436 38.886 -6.765 1.00 30.16 N
ATOM 1210 C LYS A 183 65.005 33.373 -2.927 1.00 19.72 C
ATOM 1211 O LYS A 183 65.572 33.384 -1.844 1.00 19.28 O
ATOM 1212 N LEU A 184 64.960 32.317 -3.725 1.00 18.78 N
ATOM 1213 CA LEU A 184 65.689 31.088 -3.462 1.00 18.80 C
ATOM 1214 CB LEU A 184 65.057 29.957 -4.278 1.00 18.65 C
ATOM 1215 CG LEU A 184 65.182 28.479 -3.925 1.00 22.15 C
ATOM 1216 CD1 LEU A 184 64.840 28.132 -2.445 1.00 22.78 C
ATOM 1217 CD2 LEU A 184 64.302 27.643 -4.894 1.00 19.46 C
ATOM 1218 C LEU A 184 67.166 31.270 -3.827 1.00 17.97 C
ATOM 1219 O LEU A 184 67.500 31.813 -4.895 1.00 17.51 O
ATOM 1220 N ILE A 185 68.048 30.840 -2.932 1.00 16.83 N
ATOM 1221 CA ILE A 185 69.482 30.849 -3.204 1.00 16.25 C
ATOM 1222 CB ILE A 185 70.215 31.922 -2.348 1.00 16.56 C
ATOM 1223 CG1 ILE A 185 69.892 31.720 -0.859 1.00 15.91 C
ATOM 1224 CD1 ILE A 185 70.811 32.451 0.107 1.00 16.54 C
ATOM 1225 CG2 ILE A 185 69.924 33.333 -2.865 1.00 15.65 C
ATOM 1226 C ILE A 185 70.098 29.504 -2.880 1.00 16.22 C
ATOM 1227 O ILE A 185 69.411 28.607 -2.380 1.00 16.13 O
ATOM 1228 N ASP A 186 71.409 29.408 -3.127 1.00 15.92 N
ATOM 1229 CA ASP A 186 72.254 28.263 -2.788 1.00 15.84 C
ATOM 1230 CB ASP A 186 72.344 28.039 -1.269 1.00 16.13 C
ATOM 1231 CG ASP A 186 73.351 26.972 -0.898 1.00 15.73 C
ATOM 1232 OD1 ASP A 186 73.977 26.372 -1.791 1.00 17.28 O
ATOM 1233 OD2 ASP A 186 73.571 26.621 0.268 1.00 16.60 O
ATOM 1234 C ASP A 186 71.875 26.980 -3.505 1.00 17.14 C
ATOM 1235 O ASP A 186 71.185 26.128 -2.968 1.00 17.68 O
ATOM 1236 N PHE A 187 72.372 26.828 -4.721 1.00 17.98 N
ATOM 1237 CA PHE A 187 72.163 25.603 -5.459 1.00 19.11 C
ATOM 1238 CB PHE A 187 71.813 25.935 -6.905 1.00 19.00 C
ATOM 1239 CG PHE A 187 70.462 26.572 -7.042 1.00 18.98 C
ATOM 1240 CD1 PHE A 187 70.277 27.914 -6.731 1.00 17.58 C
ATOM 1241 CE1 PHE A 187 69.010 28.508 -6.832 1.00 19.96 C
ATOM 1242 CZ PHE A 187 67.917 27.743 -7.260 1.00 19.45 C
ATOM 1243 CE2 PHE A 187 68.094 26.402 -7.575 1.00 18.98 C
ATOM 1244 CD2 PHE A 187 69.366 25.817 -7.452 1.00 19.42 C
ATOM 1245 C PHE A 187 73.367 24.669 -5.342 1.00 19.81 C
ATOM 1246 O PHE A 187 73.540 23.776 -6.162 1.00 20.32 O
ATOM 1247 N GLY A 188 74.157 24.864 -4.285 1.00 20.15 N
ATOM 1248 CA GLY A 188 75.355 24.074 -4.027 1.00 20.64 C
ATOM 1249 C GLY A 188 75.130 22.581 -3.824 1.00 20.89 C
ATOM 1250 O GLY A 188 76.061 21.795 -4.008 1.00 20.70 O
ATOM 1251 N SER A 189 73.904 22.186 -3.460 1.00 20.61 N
ATOM 1252 CA SER A 189 73.585 20.774 -3.205 1.00 20.36 C
ATOM 1253 CB SER A 189 72.891 20.598 -1.843 1.00 20.68 C
ATOM 1254 OG SER A 189 73.701 21.035 -0.766 1.00 20.77 O
ATOM 1255 C SER A 189 72.668 20.218 -4.276 1.00 20.23 C
ATOM 1256 O SER A 189 72.229 19.079 -4.181 1.00 19.67 O
ATOM 1257 N GLY A 190 72.359 21.040 -5.273 1.00 19.66 N
ATOM 1258 CA GLY A 190 71.362 20.701 -6.256 1.00 20.11 C
ATOM 1259 C GLY A 190 71.779 19.655 -7.282 1.00 20.35 C
ATOM 1260 O GLY A 190 72.924 19.203 -7.309 1.00 20.22 O
ATOM 1261 N ALA A 191 70.830 19.271 -8.122 1.00 19.81 N
ATOM 1262 CA ALA A 191 71.085 18.339 -9.201 1.00 20.13 C
ATOM 1263 CB ALA A 191 70.902 16.875 -8.722 1.00 20.04 C
ATOM 1264 C ALA A 191 70.130 18.652 -10.323 1.00 20.23 C
ATOM 1265 O ALA A 191 69.126 19.344 -10.122 1.00 20.11 O
ATOM 1266 N LEU A 192 70.446 18.144 -11.512 1.00 20.33 N
ATOM 1267 CA LEU A 192 69.504 18.154 -12.617 1.00 20.48 C
ATOM 1268 CB LEU A 192 70.160 17.538 -13.870 1.00 20.65 C
ATOM 1269 CG LEU A 192 71.394 18.241 -14.460 1.00 21.30 C
ATOM 1270 CD1 LEU A 192 72.025 17.441 -15.650 1.00 24.01 C
ATOM 1271 CD2 LEU A 192 71.028 19.649 -14.922 1.00 20.92 C
ATOM 1272 C LEU A 192 68.301 17.329 -12.171 1.00 20.62 C
ATOM 1273 O LEU A 192 68.472 16.302 -11.520 1.00 20.87 O
ATOM 1274 N LEU A 193 67.092 17.787 -12.488 1.00 20.82 N
ATOM 1275 CA LEU A 193 65.883 17.033 -12.163 1.00 20.67 C
ATOM 1276 CB LEU A 193 64.626 17.901 -12.333 1.00 20.90 C
ATOM 1277 CG LEU A 193 63.271 17.308 -11.915 1.00 21.37 C
ATOM 1278 CD1 LEU A 193 63.216 16.979 -10.428 1.00 19.30 C
ATOM 1279 CD2 LEU A 193 62.103 18.226 -12.303 1.00 23.02 C
ATOM 1280 C LEU A 193 65.770 15.784 -13.042 1.00 20.94 C
ATOM 1281 O LEU A 193 66.005 15.837 -14.250 1.00 20.46 O
ATOM 1282 N LYS A 194 65.403 14.666 -12.423 1.00 20.70 N
ATOM 1283 CA LYS A 194 65.191 13.411 -13.140 1.00 20.09 C
ATOM 1284 CB LYS A 194 66.464 12.559 -13.094 1.00 20.03 C
ATOM 1285 CG LYS A 194 66.780 11.998 -11.717 1.00 18.07 C
ATOM 1286 CD LYS A 194 68.169 11.391 -11.691 1.00 19.71 C
ATOM 1287 CE LYS A 194 68.381 10.652 -10.385 1.00 20.42 C
ATOM 1288 NZ LYS A 194 69.586 9.789 -10.403 1.00 19.70 N
ATOM 1289 C LYS A 194 64.025 12.658 -12.505 1.00 19.94 C
ATOM 1290 O LYS A 194 63.669 12.913 -11.349 1.00 19.51 O
ATOM 1291 N ASP A 195 63.456 11.722 -13.260 1.00 19.71 N
ATOM 1292 CA ASP A 195 62.308 10.943 -12.808 1.00 19.96 C
ATOM 1293 CB ASP A 195 61.352 10.706 -13.972 1.00 20.12 C
ATOM 1294 CG ASP A 195 60.843 12.005 -14.573 1.00 21.01 C
ATOM 1295 OD1 ASP A 195 60.213 12.792 -13.832 1.00 21.96 O
ATOM 1296 OD2 ASP A 195 61.028 12.311 -15.770 1.00 22.33 O
ATOM 1297 C ASP A 195 62.684 9.613 -12.166 1.00 20.21 C
ATOM 1298 O ASP A 195 61.811 8.866 -11.740 1.00 20.16 O
ATOM 1299 N THR A 196 63.979 9.324 -12.111 1.00 20.34 N
ATOM 1300 CA THR A 196 64.459 8.086 -11.519 1.00 20.80 C
ATOM 1301 CB THR A 196 65.550 7.433 -12.402 1.00 20.79 C
ATOM 1302 OG1 THR A 196 66.489 8.431 -12.832 1.00 19.71 O
ATOM 1303 CG2 THR A 196 64.942 6.891 -13.701 1.00 20.94 C
ATOM 1304 C THR A 196 64.997 8.357 -10.132 1.00 21.32 C
ATOM 1305 O THR A 196 65.059 9.515 -9.686 1.00 21.17 O
ATOM 1306 N VAL A 197 65.387 7.290 -9.447 1.00 21.71 N
ATOM 1307 CA VAL A 197 65.741 7.385 -8.039 1.00 22.75 C
ATOM 1308 CB VAL A 197 65.661 5.983 -7.364 1.00 22.95 C
ATOM 1309 CG1 VAL A 197 66.823 5.098 -7.798 1.00 24.30 C
ATOM 1310 CG2 VAL A 197 65.592 6.094 -5.849 1.00 23.66 C
ATOM 1311 C VAL A 197 67.102 8.074 -7.834 1.00 22.86 C
ATOM 1312 O VAL A 197 68.044 7.862 -8.611 1.00 23.08 O
ATOM 1313 N TYR A 198 67.176 8.939 -6.823 1.00 22.60 N
ATOM 1314 CA TYR A 198 68.441 9.506 -6.375 1.00 22.42 C
ATOM 1315 CB TYR A 198 68.242 10.922 -5.829 1.00 21.98 C
ATOM 1316 CG TYR A 198 67.927 11.966 -6.869 1.00 19.83 C
ATOM 1317 CD1 TYR A 198 66.610 12.197 -7.262 1.00 18.45 C
ATOM 1318 CE1 TYR A 198 66.301 13.147 -8.205 1.00 16.56 C
ATOM 1319 CZ TYR A 198 67.307 13.909 -8.772 1.00 17.06 C
ATOM 1320 OH TYR A 198 66.949 14.848 -9.713 1.00 15.18 O
ATOM 1321 CE2 TYR A 198 68.641 13.708 -8.410 1.00 16.87 C
ATOM 1322 CD2 TYR A 198 68.942 12.732 -7.455 1.00 18.51 C
ATOM 1323 C TYR A 198 69.010 8.631 -5.266 1.00 22.99 C
ATOM 1324 O TYR A 198 68.273 8.209 -4.363 1.00 22.53 O
ATOM 1325 N THR A 199 70.314 8.370 -5.337 1.00 23.94 N
ATOM 1326 CA THR A 199 71.034 7.617 -4.302 1.00 25.22 C
ATOM 1327 CB THR A 199 71.694 6.331 -4.880 1.00 25.19 C
ATOM 1328 OG1 THR A 199 72.604 6.688 -5.923 1.00 25.62 O
ATOM 1329 CG2 THR A 199 70.681 5.427 -5.571 1.00 25.21 C
ATOM 1330 C THR A 199 72.111 8.475 -3.635 1.00 26.00 C
ATOM 1331 O THR A 199 72.881 7.982 -2.818 1.00 25.92 O
ATOM 1332 N ASP A 200 72.170 9.752 -4.007 1.00 27.25 N
ATOM 1333 CA ASP A 200 73.121 10.694 -3.424 1.00 28.69 C
ATOM 1334 CB ASP A 200 74.132 11.197 -4.477 1.00 29.29 C
ATOM 1335 CG ASP A 200 73.490 12.085 -5.559 1.00 32.11 C
ATOM 1336 OD1 ASP A 200 73.879 13.277 -5.649 1.00 34.36 O
ATOM 1337 OD2 ASP A 200 72.609 11.686 -6.370 1.00 34.31 O
ATOM 1338 C ASP A 200 72.374 11.855 -2.788 1.00 28.79 C
ATOM 1339 O ASP A 200 71.327 12.278 -3.283 1.00 28.34 O
ATOM 1340 N PHE A 201 72.904 12.350 -1.677 1.00 29.39 N
ATOM 1341 CA PHE A 201 72.328 13.501 -1.000 1.00 30.23 C
ATOM 1342 CB PHE A 201 71.140 13.077 -0.140 1.00 29.94 C
ATOM 1343 CG PHE A 201 70.534 14.196 0.660 1.00 28.00 C
ATOM 1344 CD1 PHE A 201 69.676 15.109 0.062 1.00 27.14 C
ATOM 1345 CE1 PHE A 201 69.104 16.143 0.791 1.00 27.27 C
ATOM 1346 CZ PHE A 201 69.381 16.266 2.148 1.00 27.00 C
ATOM 1347 CE2 PHE A 201 70.244 15.357 2.763 1.00 28.69 C
ATOM 1348 CD2 PHE A 201 70.811 14.322 2.012 1.00 28.58 C
ATOM 1349 C PHE A 201 73.381 14.192 -0.146 1.00 31.40 C
ATOM 1350 O PHE A 201 74.097 13.542 0.614 1.00 31.87 O
ATOM 1351 N ASP A 202 73.449 15.512 -0.274 1.00 32.09 N
ATOM 1352 CA ASP A 202 74.428 16.314 0.432 1.00 33.18 C
ATOM 1353 CB ASP A 202 75.581 16.677 -0.510 1.00 34.28 C
ATOM 1354 CG ASP A 202 76.918 16.282 0.054 1.00 37.84 C
ATOM 1355 OD1 ASP A 202 77.292 15.090 -0.089 1.00 42.28 O
ATOM 1356 OD2 ASP A 202 77.655 17.087 0.671 1.00 41.24 O
ATOM 1357 C ASP A 202 73.823 17.576 1.024 1.00 32.23 C
ATOM 1358 O ASP A 202 74.550 18.471 1.451 1.00 32.66 O
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ATOM 1493 C ARG A 217 65.808 7.429 -1.749 1.00 22.74 C
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ATOM 1499 CD1 TYR A 218 67.160 10.880 -1.870 1.00 15.03 C
ATOM 1500 CE1 TYR A 218 68.265 11.679 -2.220 1.00 14.80 C
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ATOM 1503 CE2 TYR A 218 66.790 13.145 -3.453 1.00 15.34 C
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ATOM 1514 CD2 HIS A 219 61.621 7.653 -6.230 1.00 16.82 C
ATOM 1515 C HIS A 219 62.651 12.255 -5.551 1.00 16.15 C
ATOM 1516 O HIS A 219 62.346 12.681 -4.438 1.00 15.76 O
ATOM 1517 N GLY A 220 62.938 13.048 -6.576 1.00 16.23 N
ATOM 1518 CA GLY A 220 63.172 14.462 -6.384 1.00 16.70 C
ATOM 1519 C GLY A 220 61.992 15.217 -5.807 1.00 16.87 C
ATOM 1520 O GLY A 220 62.110 15.886 -4.788 1.00 16.14 O
ATOM 1521 N ARG A 221 60.848 15.097 -6.469 1.00 17.28 N
ATOM 1522 CA ARG A 221 59.691 15.923 -6.150 1.00 17.64 C
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ATOM 1526 NE ARG A 221 58.705 15.933 -11.013 1.00 32.56 N
ATOM 1527 CZ ARG A 221 59.512 15.147 -11.720 1.00 35.42 C
ATOM 1528 NH1 ARG A 221 59.879 13.956 -11.241 1.00 36.89 N
ATOM 1529 NH2 ARG A 221 59.943 15.539 -12.920 1.00 35.53 N
ATOM 1530 C ARG A 221 59.155 15.652 -4.764 1.00 16.82 C
ATOM 1531 O ARG A 221 58.922 16.596 -4.015 1.00 16.95 O
ATOM 1532 N SER A 222 58.981 14.374 -4.417 1.00 15.97 N
ATOM 1533 CA SER A 222 58.439 14.002 -3.111 1.00 15.37 C
ATOM 1534 CB SER A 222 58.036 12.510 -3.066 1.00 15.54 C
ATOM 1535 OG SER A 222 59.136 11.654 -3.333 1.00 15.91 O
ATOM 1536 C SER A 222 59.396 14.347 -1.971 1.00 14.74 C
ATOM 1537 O SER A 222 58.963 14.684 -0.874 1.00 14.86 O
ATOM 1538 N ALA A 223 60.694 14.270 -2.225 1.00 14.48 N
ATOM 1539 CA ALA A 223 61.686 14.738 -1.253 1.00 14.36 C
ATOM 1540 CB ALA A 223 63.081 14.313 -1.677 1.00 14.45 C
ATOM 1541 C ALA A 223 61.619 16.266 -1.091 1.00 14.53 C
ATOM 1542 O ALA A 223 61.718 16.779 0.030 1.00 14.59 O
ATOM 1543 N ALA A 224 61.441 16.982 -2.205 1.00 13.88 N
ATOM 1544 CA ALA A 224 61.310 18.444 -2.169 1.00 13.96 C
ATOM 1545 CB ALA A 224 61.174 19.032 -3.591 1.00 13.04 C
ATOM 1546 C ALA A 224 60.116 18.832 -1.296 1.00 13.72 C
ATOM 1547 O ALA A 224 60.220 19.713 -0.462 1.00 14.14 O
ATOM 1548 N VAL A 225 59.001 18.123 -1.470 1.00 14.13 N
ATOM 1549 CA VAL A 225 57.776 18.363 -0.704 1.00 13.34 C
ATOM 1550 CB VAL A 225 56.602 17.517 -1.301 1.00 13.99 C
ATOM 1551 CG1 VAL A 225 55.370 17.457 -0.352 1.00 11.55 C
ATOM 1552 CG2 VAL A 225 56.236 18.063 -2.701 1.00 12.97 C
ATOM 1553 C VAL A 225 57.986 18.076 0.778 1.00 14.00 C
ATOM 1554 O VAL A 225 57.513 18.820 1.650 1.00 14.66 O
ATOM 1555 N TRP A 226 58.695 16.996 1.087 1.00 13.82 N
ATOM 1556 CA TRP A 226 59.037 16.751 2.481 1.00 14.22 C
ATOM 1557 CB TRP A 226 59.908 15.501 2.626 1.00 14.10 C
ATOM 1558 CG TRP A 226 60.362 15.305 4.045 1.00 14.21 C
ATOM 1559 CD1 TRP A 226 61.444 15.888 4.651 1.00 13.01 C
ATOM 1560 NE1 TRP A 226 61.516 15.488 5.961 1.00 13.97 N
ATOM 1561 CE2 TRP A 226 60.473 14.643 6.231 1.00 13.33 C
ATOM 1562 CD2 TRP A 226 59.723 14.510 5.046 1.00 14.66 C
ATOM 1563 CE3 TRP A 226 58.583 13.683 5.063 1.00 14.53 C
ATOM 1564 CZ3 TRP A 226 58.254 13.024 6.238 1.00 14.25 C
ATOM 1565 CH2 TRP A 226 59.020 13.173 7.395 1.00 14.22 C
ATOM 1566 CZ2 TRP A 226 60.132 13.981 7.415 1.00 15.55 C
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ATOM 1568 O TRP A 226 59.406 18.468 4.136 1.00 14.16 O
ATOM 1569 N SER A 227 60.764 18.485 2.349 1.00 13.20 N
ATOM 1570 CA SER A 227 61.522 19.610 2.875 1.00 13.52 C
ATOM 1571 CB SER A 227 62.793 19.886 2.043 1.00 13.28 C
ATOM 1572 OG SER A 227 62.448 20.474 0.803 1.00 12.96 O
ATOM 1573 C SER A 227 60.634 20.845 2.967 1.00 13.72 C
ATOM 1574 O SER A 227 60.848 21.702 3.816 1.00 13.60 O
ATOM 1575 N LEU A 228 59.614 20.917 2.110 1.00 13.17 N
ATOM 1576 CA LEU A 228 58.673 22.028 2.171 1.00 13.14 C
ATOM 1577 CB LEU A 228 57.807 22.105 0.891 1.00 12.32 C
ATOM 1578 CG LEU A 228 58.606 22.646 -0.297 1.00 11.69 C
ATOM 1579 CD1 LEU A 228 57.931 22.321 -1.659 1.00 13.88 C
ATOM 1580 CD2 LEU A 228 58.893 24.135 -0.171 1.00 10.58 C
ATOM 1581 C LEU A 228 57.801 21.968 3.427 1.00 12.15 C
ATOM 1582 O LEU A 228 57.489 22.990 4.020 1.00 12.32 O
ATOM 1583 N GLY A 229 57.405 20.766 3.811 1.00 12.02 N
ATOM 1584 CA GLY A 229 56.693 20.556 5.056 1.00 12.19 C
ATOM 1585 C GLY A 229 57.512 20.973 6.281 1.00 12.64 C
ATOM 1586 O GLY A 229 56.968 21.560 7.224 1.00 12.42 O
ATOM 1587 N ILE A 230 58.811 20.662 6.269 1.00 13.07 N
ATOM 1588 CA ILE A 230 59.718 21.050 7.357 1.00 13.99 C
ATOM 1589 CB ILE A 230 61.145 20.421 7.133 1.00 13.90 C
ATOM 1590 CG1 ILE A 230 61.067 18.894 7.053 1.00 13.25 C
ATOM 1591 CD1 ILE A 230 60.622 18.243 8.368 1.00 11.51 C
ATOM 1592 CG2 ILE A 230 62.118 20.815 8.272 1.00 14.90 C
ATOM 1593 C ILE A 230 59.785 22.587 7.409 1.00 14.39 C
ATOM 1594 O ILE A 230 59.686 23.211 8.488 1.00 14.11 O
ATOM 1595 N LEU A 231 59.915 23.182 6.222 1.00 14.04 N
ATOM 1596 CA LEU A 231 59.961 24.620 6.083 1.00 14.10 C
ATOM 1597 CB LEU A 231 60.197 24.995 4.609 1.00 14.16 C
ATOM 1598 CG LEU A 231 60.121 26.508 4.330 1.00 15.24 C
ATOM 1599 CD1 LEU A 231 61.292 27.224 4.967 1.00 15.13 C
ATOM 1600 CD2 LEU A 231 60.075 26.778 2.838 1.00 15.78 C
ATOM 1601 C LEU A 231 58.688 25.299 6.615 1.00 14.01 C
ATOM 1602 O LEU A 231 58.775 26.270 7.382 1.00 13.50 O
ATOM 1603 N LEU A 232 57.515 24.796 6.217 1.00 13.22 N
ATOM 2073 N HIS A 287 45.362 23.711 -1.820 1.00 19.57 N
ATOM 2074 CA HIS A 287 44.943 23.402 -0.455 1.00 19.96 C
ATOM 2075 CB HIS A 287 46.161 23.008 0.398 1.00 20.42 C
ATOM 2076 CG HIS A 287 45.811 22.535 1.776 1.00 20.16 C
ATOM 2077 ND1 HIS A 287 45.771 21.201 2.120 1.00 21.24 N
ATOM 2078 CE1 HIS A 287 45.417 21.085 3.388 1.00 20.50 C
ATOM 2079 NE2 HIS A 287 45.224 22.298 3.878 1.00 21.14 N
ATOM 2080 CD2 HIS A 287 45.469 23.220 2.891 1.00 19.59 C
ATOM 2081 C HIS A 287 44.212 24.613 0.140 1.00 20.17 C
ATOM 2082 O HIS A 287 44.585 25.753 -0.140 1.00 20.09 O
ATOM 2083 N PRO A 288 43.154 24.375 0.921 1.00 20.64 N
ATOM 2084 CA PRO A 288 42.399 25.468 1.540 1.00 20.94 C
ATOM 2085 CB PRO A 288 41.409 24.741 2.463 1.00 21.25 C
ATOM 2086 CG PRO A 288 41.229 23.429 1.836 1.00 21.49 C
ATOM 2087 CD PRO A 288 42.549 23.063 1.215 1.00 20.84 C
ATOM 2088 C PRO A 288 43.263 26.449 2.323 1.00 20.62 C
ATOM 2089 O PRO A 288 42.995 27.641 2.242 1.00 21.00 O
ATOM 2090 N TRP A 289 44.290 25.982 3.027 1.00 20.44 N
ATOM 2091 CA TRP A 289 45.144 26.903 3.785 1.00 20.73 C
ATOM 2092 CB TRP A 289 46.165 26.169 4.668 1.00 19.78 C
ATOM 2093 CG TRP A 289 46.932 27.139 5.535 1.00 18.93 C
ATOM 2094 CD1 TRP A 289 46.469 27.795 6.646 1.00 17.79 C
ATOM 2095 NE1 TRP A 289 47.450 28.617 7.152 1.00 17.69 N
ATOM 2096 CE2 TRP A 289 48.560 28.535 6.348 1.00 17.45 C
ATOM 2097 CD2 TRP A 289 48.265 27.614 5.316 1.00 16.35 C
ATOM 2098 CE3 TRP A 289 49.252 27.348 4.352 1.00 16.19 C
ATOM 2099 CZ3 TRP A 289 50.488 27.992 4.453 1.00 14.25 C
ATOM 2100 CH2 TRP A 289 50.753 28.894 5.498 1.00 15.51 C
ATOM 2101 CZ2 TRP A 289 49.805 29.181 6.453 1.00 16.21 C
ATOM 2102 C TRP A 289 45.868 27.924 2.897 1.00 21.43 C
ATOM 2103 O TRP A 289 46.219 29.005 3.371 1.00 21.35 O
ATOM 2104 N MET A 290 46.081 27.575 1.627 1.00 22.16 N
ATOM 2105 CA MET A 290 46.795 28.432 0.672 1.00 23.41 C
ATOM 2106 CB MET A 290 47.570 27.561 -0.328 1.00 23.44 C
ATOM 2107 CG MET A 290 48.631 26.687 0.341 1.00 23.18 C
ATOM 2108 SD MET A 290 50.289 27.282 -0.016 1.00 24.31 S
ATOM 2109 CE MET A 290 50.282 28.805 0.810 1.00 21.67 C
ATOM 2110 C MET A 290 45.935 29.456 -0.093 1.00 24.66 C
ATOM 2111 O MET A 290 46.465 30.229 -0.901 1.00 24.82 O
ATOM 2112 N GLN A 291 44.627 29.472 0.161 1.00 25.63 N
ATOM 2113 CA GLN A 291 43.725 30.390 -0.541 1.00 27.47 C
ATOM 2114 CB GLN A 291 42.263 29.932 -0.399 1.00 28.12 C
ATOM 2115 CG GLN A 291 41.931 28.612 -1.133 1.00 30.95 C
ATOM 2116 CD GLN A 291 42.797 28.376 -2.378 1.00 35.68 C
ATOM 2117 OE1 GLN A 291 42.599 29.038 -3.414 1.00 37.06 O
ATOM 2118 NE2 GLN A 291 43.766 27.441 -2.277 1.00 34.40 N
ATOM 2119 C GLN A 291 43.879 31.844 -0.094 1.00 27.73 C
ATOM 2120 O GLN A 291 44.222 32.122 1.059 1.00 28.09 O
ATOM 2121 N ASP A 292 43.651 32.765 -1.026 1.00 28.22 N
ATOM 2122 CA ASP A 292 43.678 34.207 -0.750 1.00 28.34 C
ATOM 2123 CB ASP A 292 42.553 34.596 0.224 1.00 29.02 C
ATOM 2124 CG ASP A 292 41.176 34.236 -0.308 1.00 31.45 C
ATOM 2125 OD1 ASP A 292 40.817 34.731 -1.402 1.00 33.30 O
ATOM 2126 OD2 ASP A 292 40.400 33.452 0.291 1.00 34.49 O
ATOM 2127 C ASP A 292 45.027 34.718 -0.245 1.00 27.65 C
ATOM 2128 O ASP A 292 45.098 35.446 0.761 1.00 27.28 O
ATOM 2129 N VAL A 293 46.094 34.334 -0.946 1.00 26.88 N
ATOM 2130 CA VAL A 293 47.429 34.808 -0.622 1.00 25.72 C
ATOM 2131 CB VAL A 293 48.538 34.025 -1.396 1.00 26.36 C
ATOM 2132 CG1 VAL A 293 48.546 34.374 -2.881 1.00 26.33 C
ATOM 2133 CG2 VAL A 293 49.912 34.299 -0.799 1.00 24.82 C
ATOM 2134 C VAL A 293 47.550 36.311 -0.877 1.00 25.50 C
ATOM 2135 O VAL A 293 47.007 36.824 -1.848 1.00 24.70 O
ATOM 2136 N LEU A 294 48.261 37.004 0.009 1.00 25.07 N
ATOM 2137 CA LEU A 294 48.630 38.392 -0.226 1.00 25.15 C
ATOM 2138 CB LEU A 294 49.280 38.998 1.017 1.00 24.83 C
ATOM 2139 CG LEU A 294 48.500 39.140 2.329 1.00 24.86 C
ATOM 2140 CD1 LEU A 294 49.412 39.783 3.371 1.00 22.85 C
ATOM 2141 CD2 LEU A 294 47.199 39.941 2.148 1.00 24.42 C
ATOM 2142 C LEU A 294 49.621 38.487 -1.384 1.00 25.66 C
ATOM 2143 O LEU A 294 50.437 37.585 -1.598 1.00 25.15 O
ATOM 2144 N LEU A 295 49.539 39.585 -2.128 1.00 26.06 N
ATOM 2145 CA LEU A 295 50.587 39.950 -3.071 1.00 26.73 C
ATOM 2146 CB LEU A 295 50.122 41.106 -3.981 1.00 27.23 C
ATOM 2147 CG LEU A 295 48.775 40.944 -4.717 1.00 29.21 C
ATOM 2148 CD1 LEU A 295 48.330 42.237 -5.412 1.00 31.53 C
ATOM 2149 CD2 LEU A 295 48.829 39.801 -5.721 1.00 31.44 C
ATOM 2150 C LEU A 295 51.841 40.337 -2.265 1.00 26.44 C
ATOM 2151 O LEU A 295 51.729 40.733 -1.103 1.00 25.11 O
ATOM 2152 N PRO A 296 53.028 40.170 -2.851 1.00 27.04 N
ATOM 2153 CA PRO A 296 54.277 40.535 -2.164 1.00 27.59 C
ATOM 2154 CB PRO A 296 55.331 40.358 -3.250 1.00 27.65 C
ATOM 2155 CG PRO A 296 54.772 39.247 -4.091 1.00 27.68 C
ATOM 2156 CD PRO A 296 53.292 39.564 -4.171 1.00 26.80 C
ATOM 2157 C PRO A 296 54.265 41.964 -1.623 1.00 28.49 C
ATOM 2158 O PRO A 296 54.608 42.151 -0.459 1.00 28.36 O
ATOM 2159 N GLN A 297 53.854 42.942 -2.430 1.00 29.34 N
ATOM 2160 CA GLN A 297 53.801 44.328 -1.960 1.00 30.65 C
ATOM 2161 CB GLN A 297 53.467 45.305 -3.102 1.00 31.10 C
ATOM 2162 CG GLN A 297 53.783 46.766 -2.787 1.00 33.83 C
ATOM 2163 CD GLN A 297 55.239 46.993 -2.374 1.00 37.47 C
ATOM 2164 OE1 GLN A 297 56.158 46.742 -3.153 1.00 38.85 O
ATOM 2165 NE2 GLN A 297 55.444 47.468 -1.147 1.00 39.03 N
ATOM 2166 C GLN A 297 52.830 44.490 -0.782 1.00 30.41 C
ATOM 2167 O GLN A 297 53.174 45.125 0.210 1.00 30.58 O
ATOM 2168 N GLU A 298 51.640 43.900 -0.891 1.00 30.38 N
ATOM 2169 CA GLU A 298 50.699 43.839 0.235 1.00 30.73 C
ATOM 2170 CB GLU A 298 49.479 42.981 -0.103 1.00 31.10 C
ATOM 2171 CG GLU A 298 48.534 43.558 -1.141 1.00 33.59 C
ATOM 2172 CD GLU A 298 47.270 42.722 -1.289 1.00 37.83 C
ATOM 2173 OE1 GLU A 298 47.369 41.480 -1.435 1.00 36.99 O
ATOM 2174 OE2 GLU A 298 46.166 43.313 -1.272 1.00 40.82 O
ATOM 2175 C GLU A 298 51.378 43.269 1.485 1.00 30.06 C
ATOM 2176 O GLU A 298 51.258 43.837 2.577 1.00 30.09 O
ATOM 2177 N THR A 299 52.096 42.156 1.301 1.00 28.83 N
ATOM 2178 CA THR A 299 52.857 41.496 2.360 1.00 27.61 C
ATOM 2179 CB THR A 299 53.619 40.265 1.782 1.00 27.45 C
ATOM 2180 OG1 THR A 299 52.690 39.346 1.192 1.00 25.03 O
ATOM 2181 CG2 THR A 299 54.269 39.447 2.897 1.00 26.87 C
ATOM 2182 C THR A 299 53.840 42.442 3.062 1.00 27.70 C
ATOM 2183 O THR A 299 53.890 42.487 4.289 1.00 27.42 O
ATOM 2184 N ALA A 300 54.626 43.177 2.278 1.00 27.78 N
ATOM 2185 CA ALA A 300 55.622 44.093 2.819 1.00 28.26 C
ATOM 2186 CB ALA A 300 56.517 44.627 1.706 1.00 28.09 C
ATOM 2187 C ALA A 300 54.972 45.250 3.588 1.00 28.73 C
ATOM 2188 O ALA A 300 55.444 45.636 4.658 1.00 28.08 O
ATOM 2189 N GLU A 301 53.884 45.785 3.040 1.00 29.58 N
ATOM 2190 CA GLU A 301 53.169 46.894 3.668 1.00 31.18 C
ATOM 2191 CB GLU A 301 52.063 47.433 2.738 1.00 31.45 C
ATOM 2192 CG GLU A 301 52.592 48.250 1.555 1.00 34.28 C
ATOM 2193 CD GLU A 301 51.553 48.517 0.460 1.00 37.15 C
ATOM 2194 OE1 GLU A 301 50.659 47.668 0.219 1.00 37.47 O
ATOM 2195 OE2 GLU A 301 51.642 49.589 -0.177 1.00 38.55 O
ATOM 2196 C GLU A 301 52.610 46.488 5.042 1.00 31.10 C
ATOM 2197 O GLU A 301 52.779 47.211 6.019 1.00 31.18 O
ATOM 2198 N ILE A 302 51.989 45.311 5.107 1.00 31.28 N
ATOM 2199 CA ILE A 302 51.371 44.823 6.340 1.00 31.59 C
ATOM 2200 CB ILE A 302 50.284 43.767 6.019 1.00 31.30 C
ATOM 2201 CG1 ILE A 302 49.201 44.378 5.115 1.00 31.02 C
ATOM 2202 CD1 ILE A 302 48.293 43.357 4.435 1.00 29.87 C
ATOM 2203 CG2 ILE A 302 49.673 43.195 7.311 1.00 30.80 C
ATOM 2204 C ILE A 302 52.384 44.286 7.373 1.00 32.02 C
ATOM 2205 O ILE A 302 52.263 44.577 8.560 1.00 31.80 O
ATOM 2206 N HIS A 303 53.391 43.544 6.909 1.00 32.60 N
ATOM 2207 CA HIS A 303 54.253 42.750 7.790 1.00 33.26 C
ATOM 2208 CB HIS A 303 54.176 41.282 7.379 1.00 32.20 C
ATOM 2209 CG HIS A 303 52.832 40.662 7.606 1.00 29.68 C
ATOM 2210 ND1 HIS A 303 52.385 40.293 8.857 1.00 27.26 N
ATOM 2211 CE1 HIS A 303 51.171 39.780 8.755 1.00 27.29 C
ATOM 2212 NE2 HIS A 303 50.819 39.796 7.481 1.00 26.60 N
ATOM 2213 CD2 HIS A 303 51.839 40.346 6.743 1.00 26.43 C
ATOM 2214 C HIS A 303 55.723 43.174 7.849 1.00 35.09 C
ATOM 2215 O HIS A 303 56.435 42.838 8.796 1.00 34.73 O
ATOM 2216 N LEU A 304 56.181 43.889 6.827 1.00 37.42 N
ATOM 2217 CA LEU A 304 57.588 44.256 6.724 1.00 40.17 C
ATOM 2218 CB LEU A 304 58.187 43.707 5.421 1.00 39.43 C
ATOM 2219 CG LEU A 304 58.574 42.224 5.234 1.00 38.74 C
ATOM 2220 CD1 LEU A 304 57.830 41.238 6.125 1.00 34.54 C
ATOM 2221 CD2 LEU A 304 58.465 41.807 3.760 1.00 35.74 C
ATOM 2222 C LEU A 304 57.751 45.774 6.796 1.00 42.83 C
ATOM 2223 O LEU A 304 58.861 46.286 6.661 1.00 43.07 O
ATOM 2224 N HIS A 305 56.629 46.462 7.033 1.00 46.30 N
ATOM 2225 CA HIS A 305 56.516 47.933 7.107 1.00 49.71 C
ATOM 2226 CB HIS A 305 56.747 48.459 8.545 1.00 50.37 C
ATOM 2227 CG HIS A 305 58.085 48.106 9.125 1.00 53.30 C
ATOM 2228 ND1 HIS A 305 58.344 46.886 9.716 1.00 56.26 N
ATOM 2229 CE1 HIS A 305 59.597 46.860 10.138 1.00 57.48 C
ATOM 2230 NE2 HIS A 305 60.159 48.022 9.847 1.00 57.58 N
ATOM 2231 CD2 HIS A 305 59.234 48.820 9.216 1.00 56.22 C
ATOM 2232 C HIS A 305 57.339 48.707 6.063 1.00 50.97 C
ATOM 2233 O HIS A 305 58.423 49.221 6.359 1.00 51.59 O
ATOM 2234 N SER A 306 56.795 48.799 4.850 1.00 52.46 N
ATOM 2235 CA SER A 306 57.518 49.345 3.693 1.00 53.65 C
ATOM 2236 CB SER A 306 56.768 49.009 2.401 1.00 53.75 C
ATOM 2237 OG SER A 306 57.340 47.873 1.784 1.00 54.33 O
ATOM 2238 C SER A 306 57.820 50.851 3.763 1.00 54.12 C
ATOM 2239 O SER A 306 58.964 51.291 3.600 1.00 54.51 O
ATOM 2240 OXT SER A 306 56.943 51.696 3.974 1.00 54.48 O
ATOM 2241 O1A ANP L 1 74.739 30.562 -0.833 1.00 18.02 O
ATOM 2242 PA ANP L 1 74.774 30.444 0.630 1.00 19.01 P
ATOM 2243 O2A ANP L 1 73.576 29.828 1.256 1.00 17.67 O
ATOM 2244 O3A ANP L 1 76.090 29.652 0.938 1.00 19.50 O
ATOM 2245 PB ANP L 1 76.391 28.426 1.887 1.00 21.38 P
ATOM 2246 O1B ANP L 1 77.321 27.642 1.069 1.00 18.82 O
ATOM 2247 O2B ANP L 1 77.348 29.007 2.991 1.00 24.75 O
ATOM 2248 N3B ANP L 1 75.190 27.617 2.664 1.00 20.02 N
ATOM 2249 PG ANP L 1 73.526 27.764 2.959 1.00 31.62 P
ATOM 2250 O3G ANP L 1 73.022 29.016 3.938 1.00 19.18 O
ATOM 2251 O2G ANP L 1 73.054 27.935 1.600 1.00 20.72 O
ATOM 2252 O1G ANP L 1 72.907 26.389 3.404 1.00 20.30 O
ATOM 2253 O5*ANP L 1 74.945 31.880 1.324 1.00 18.06 O
ATOM 2254 C5*ANP L 1 75.248 31.923 2.714 1.00 17.09 C
ATOM 2255 C4*ANP L 1 74.482 33.091 3.324 1.00 18.01 C
ATOM 2256 O4*ANP L 1 74.771 34.292 2.621 1.00 19.09 O
ATOM 2257 C1*ANP L 1 73.660 35.124 2.442 1.00 17.31 C
ATOM 2258 C2*ANP L 1 72.535 34.397 3.160 1.00 18.01 C
ATOM 2259 O2*ANP L 1 72.451 34.900 4.487 1.00 19.01 O
ATOM 2260 C3*ANP L 1 72.983 32.937 3.178 1.00 17.74 C
ATOM 2261 O3*ANP L 1 72.429 32.083 4.163 1.00 17.16 O
ATOM 2262 N9 ANP L 1 73.486 35.319 0.979 1.00 17.49 N
ATOM 2263 C8 ANP L 1 73.739 34.403 -0.019 1.00 15.85 C
ATOM 2264 N7 ANP L 1 73.458 34.943 -1.228 1.00 14.30 N
ATOM 2265 C5 ANP L 1 73.025 36.193 -1.045 1.00 15.53 C
ATOM 2266 C6 ANP L 1 72.607 37.177 -1.929 1.00 16.13 C
ATOM 2267 N6 ANP L 1 72.542 36.951 -3.254 1.00 14.38 N
ATOM 2268 C4 ANP L 1 73.039 36.448 0.334 1.00 15.81 C
ATOM 2269 N3 ANP L 1 72.632 37.646 0.795 1.00 17.04 N
ATOM 2270 C2 ANP L 1 72.219 38.650 -0.068 1.00 17.00 C
ATOM 2271 N1 ANP L 1 72.213 38.406 -1.417 1.00 16.49 N
ATOM 2272 O HOH W 1 63.572 15.756 8.058 1.00 26.33 O
ATOM 2273 O HOH W 2 61.017 10.214 -2.362 1.00 24.27 O
ATOM 2274 O HOH W 3 54.457 23.038 -11.444 1.00 30.92 O
ATOM 2275 O HOH W 4 63.756 21.549 -5.585 1.00 27.71 O
ATOM 2276 O HOH W 5 63.196 11.516 -9.068 1.00 26.46 O
ATOM 2277 O HOH W 6 58.424 12.040 -6.552 1.00 34.61 O
ATOM 2278 O HOH W 7 54.593 37.425 12.022 1.00 32.21 O
ATOM 2279 O HOH W 8 71.368 23.298 -3.142 1.00 29.05 O
ATOM 2280 O HOH W 9 64.911 20.478 -0.663 1.00 26.42 O
ATOM 2281 O HOH W 10 43.132 26.500 18.254 1.00 34.21 O
ATOM 2282 O HOH W 11 64.667 17.153 -3.465 1.00 26.68 O
ATOM 2283 O HOH W 12 75.478 24.941 1.494 1.00 29.16 O
ATOM 2284 O HOH W 13 63.267 18.804 11.098 1.00 24.60 O
ATOM 2285 O HOH W 14 47.333 35.497 10.172 1.00 39.07 O
ATOM 2286 O HOH W 15 41.592 25.798 13.188 1.00 29.60 O
ATOM 2287 O HOH W 16 46.216 35.678 3.186 1.00 30.38 O
ATOM 2288 O HOH W 17 73.656 23.760 -0.205 1.00 33.83 O
ATOM 2289 O HOH W 18 54.975 14.884 -3.637 1.00 27.43 O
ATOM 2290 O HOH W 19 58.350 33.360 -6.094 1.00 29.01 O
ATOM 2291 O HOH W 20 58.458 11.832 15.075 1.00 34.06 O
ATOM 2292 O HOH W 21 48.299 24.286 17.311 1.00 29.81 O
ATOM 2293 O HOH W 22 67.356 21.562 3.234 1.00 31.16 O
ATOM 2294 O HOH W 23 84.186 28.990 2.689 1.00 31.81 O
ATOM 2295 O HOH W 24 43.050 31.228 3.507 1.00 47.48 O
ATOM 2296 O HOH W 25 88.316 32.615 -4.360 1.00 32.51 O
ATOM 2297 O HOH W 26 71.447 43.185 -7.672 1.00 43.19 O
ATOM 2298 O HOH W 27 64.646 19.993 -3.620 1.00 28.98 O
ATOM 2299 O HOH W 28 71.618 43.781 0.688 1.00 40.30 O
ATOM 2300 O HOH W 29 70.325 37.710 6.677 1.00 31.97 O
ATOM 2301 O HOH W 30 71.184 18.590 9.525 1.00 35.40 O
ATOM 2302 O HOH W 31 53.890 12.402 -3.734 1.00 32.44 O
ATOM 2303 O HOH W 32 52.246 19.524 -9.419 1.00 35.84 O
ATOM 2304 O HOH W 33 40.639 26.398 16.837 1.00 35.65 O
ATOM 2305 O HOH W 34 60.620 13.344 -8.811 1.00 44.92 O
ATOM 2306 O HOH W 35 75.110 44.117 2.424 1.00 40.04 O
ATOM 2307 O HOH W 36 74.471 37.990 7.461 1.00 40.83 O
ATOM 2308 O HOH W 37 59.228 35.799 -5.068 1.00 33.92 O
ATOM 2309 O HOH W 38 57.123 17.309 16.065 1.00 40.82 O
ATOM 2310 O HOH W 39 73.994 32.523 -2.675 1.00 33.30 O
ATOM 2311 O HOH W 40 69.993 44.693 3.957 1.00 50.42 O
ATOM 2312 O HOH W 41 65.864 18.120 0.377 1.00 37.77 O
ATOM 2313 O HOH W 42 48.834 35.741 2.440 1.00 31.77 O
ATOM 2314 O HOH W 43 52.185 7.956 4.576 1.00 38.71 O
ATOM 2315 O HOH W 44 64.765 11.133 -15.777 1.00 33.65 O
ATOM 2316 O HOH W 45 48.197 17.129 -9.023 1.00 35.25 O
ATOM 2317 O HOH W 46 71.559 9.704 -7.782 1.00 42.63 O
ATOM 2318 O HOH W 47 72.838 31.092 -4.833 1.00 32.07 O
ATOM 2319 O HOH W 48 54.340 33.741 -9.311 1.00 38.01 O
ATOM 2320 O HOH W 49 54.223 11.905 9.111 1.00 33.22 O
ATOM 2321 O HOH W 50 52.887 36.641 -1.776 1.00 38.05 O
ATOM 2322 O HOH W 51 58.033 32.102 18.276 1.00 41.20 O
ATOM 2323 O HOH W 52 58.764 11.092 17.987 1.00 35.48 O
ATOM 2324 O HOH W 53 56.210 29.247 -10.737 1.00 40.52 O
ATOM 2325 O HOH W 54 75.583 29.566 5.684 1.00 42.12 O
ATOM 2326 O HOH W 55 82.299 27.704 4.152 1.00 43.41 O
ATOM 2327 O HOH W 56 61.670 6.0871 5.210 1.00 42.46 O
ATOM 2328 O HOH W 57 41.909 26.005 9.492 1.00 38.52 O
ATOM 2329 O HOH W 58 72.941 15.417 4.788 1.00 53.05 O
ATOM 2330 O HOH W 59 56.478 27.573 -12.787 1.00 37.09 O
ATOM 2331 O HOH W 60 83.158 40.743 6.932 1.00 41.95 O
ATOM 2332 O HOH W 61 44.574 20.141 -2.416 1.00 38.16 O
ATOM 2333 O HOH W 62 51.818 13.854 13.409 1.00 36.87 O
ATOM 2334 O HOH W 63 56.901 22.491 -11.879 1.00 46.71 O
ATOM 2335 O HOH W 64 46.066 31.890 -3.335 1.00 46.54 O
ATOM 2336 O HOH W 65 46.390 17.471 11.120 1.00 41.50 O
ATOM 2337 O HOH W 66 73.021 18.047 7.679 1.00 45.56 O
ATOM 2338 O HOH W 67 56.272 6.117 -3.207 1.00 47.16 O
ATOM 2339 O HOH W 68 78.807 46.222 0.194 1.00 43.86 O
ATOM 2340 O HOH W 69 70.343 14.512 -11.989 1.00 41.06 O
ATOM 2341 O HOH W 70 43.908 38.440 0.670 1.00 53.02 O
ATOM 2342 O HOH W 71 40.352 28.430 2.051 1.00 45.97 O
ATOM 2343 O HOH W 72 44.496 19.095 11.235 1.00 54.47 O
ATOM 2344 O HOH W 73 47.165 15.788 6.720 1.00 41.01 O
ATOM 2345 O HOH W 74 56.445 43.287 -5.157 1.00 44.15 O
ATOM 2346 O HOH W 75 73.363 25.539 -17.736 1.00 50.03 O
ATOM 2347 O HOH W 76 67.665 14.838 -15.990 1.00 47.37 O
ATOM 2348 O HOH W 77 77.512 31.796 8.477 1.00 43.71 O
ATOM 2349 O HOH W 78 64.562 45.570 -0.458 1.00 42.82 O
ATOM 2350 O HOH W 79 72.601 12.906 5.087 1.00 41.65 O
ATOM 2351 O HOH W 80 64.569 29.017 13.834 1.00 46.57 O
ATOM 2352 O HOH W 81 58.851 5.715 -3.038 1.00 36.10 O
ATOM 2353 O HOH W 82 66.378 16.370 -1.785 1.00 36.18 O
ATOM 2354 O HOH W 83 52.161 13.315 8.870 1.00 38.72 O
ATOM 2355 O HOH W 84 84.302 27.201 -0.028 1.00 44.09 O
ATOM 2356 O HOH W 85 49.501 13.263 -4.243 1.00 40.50 O
ATOM 2357 O HOH W 86 63.118 41.154 -5.640 1.00 44.61 O
ATOM 2358 O HOH W 87 75.334 10.847 -0.667 1.00 41.03 O
ATOM 2359 O HOH W 88 51.946 9.440 7.089 1.00 44.13 O
ATOM 2360 O HOH W 89 46.051 15.476 9.731 1.00 44.74 O
ATOM 2361 O HOH W 90 60.662 7.651 -3.345 1.00 33.21 O
ATOM 2362 O HOH W 91 78.926 37.602 8.589 1.00 45.81 O
ATOM 2363 O HOH W 92 83.687 38.788 8.645 1.00 42.46 O
ATOM 2364 O HOH W 93 65.774 37.305 -9.200 1.00 42.61 O
ATOM 2365 O HOH W 94 48.890 32.798 13.190 1.00 44.81 O
ATOM 2366 O HOH W 95 71.057 6.982 7.124 1.00 46.01 O
ATOM 2367 O HOH W 96 73.156 42.259 2.367 1.00 41.64 O
ATOM 2368 O HOH W 97 56.031 35.393 16.920 1.00 47.09 O
ATOM 2369 O HOH W 98 90.130 23.863 -3.527 1.00 56.29 O
ATOM 2370 O HOH W 99 64.199 16.375 1.499 1.00 32.31 O
ATOM 2371 O HOH W 100 52.185 30.882 13.804 1.00 45.03 O
ATOM 2372 O HOH W 101 78.245 25.957 -3.060 1.00 37.82 O
ATOM 2373 O HOH W 102 70.395 32.498 -12.472 1.00 40.91 O
ATOM 2374 O HOH W 103 76.497 26.635 -1.230 1.00 45.90 O
ATOM 2375 O HOH W 104 53.869 39.933 10.992 1.00 48.40 O
ATOM 2376 O HOH W 105 52.957 42.953 -5.317 1.00 43.64 O
ATOM 2377 O HOH W 106 81.062 46.768 -1.405 1.00 51.11 O
ATOM 2378 O HOH W 107 85.023 38.607 -2.261 1.00 44.62 O
ATOM 2379 O HOH W 108 55.351 15.949 -6.982 1.00 56.30 O
ATOM 2380 O HOH W 109 72.893 16.276 -11.510 1.00 40.24 O
ATOM 2381 O HOH W 110 64.150 29.039 11.361 1.00 44.87 O
ATOM 2382 O HOH W 111 70.497 11.613 14.584 1.00 42.70 O
ATOM 2383 O HOH W 112 47.743 30.590 14.200 1.00 41.84 O
ATOM 2384 O HOH W 113 67.986 19.239 2.487 1.00 45.28 O
ATOM 2385 O HOH W 114 66.956 9.523 -15.205 1.00 44.06 O
ATOM 2386 O HOH W 115 71.948 39.028 3.510 1.00 48.92 O
ATOM 2387 O HOH W 116 73.384 36.583 9.395 1.00 49.46 O
ATOM 2388 O HOH W 117 69.213 13.943 11.885 1.00 43.79 O
ATOM 2389 O HOH W 118 92.376 29.991 -13.421 1.00 50.66 O
ATOM 2390 O HOH W 119 71.748 33.616 8.364 1.00 44.60 O
ATOM 2391 O HOH W 120 72.751 30.625 9.138 1.00 54.54 O
ATOM 2392 O HOH W 121 44.373 14.896 1.763 1.00 54.90 O
ATOM 2393 O HOH W 122 72.331 37.663 5.252 1.00 54.91 O
ATOM 2394 O HOH W 123 85.766 37.929 7.966 1.00 45.42 O
ATOM 2395 O HOH W 124 82.375 46.624 -12.952 1.00 49.98 O
ATOM 2396 O HOH W 125 69.185 5.514 -10.117 1.00 57.15 O
ATOM 2397 O HOH W 126 72.843 16.943 -2.415 1.00 48.35 O
ATOM 2398 O HOH W 127 58.459 18.549 -11.193 1.00 68.47 O
ATOM 2399 O HOH W 128 64.272 33.293 -12.839 1.00 48.86 O
ATOM 2400 O HOH W 129 59.782 37.121 -16.253 1.00 59.29 O
表5
hPIM-3核酸序列
1 ATGCTGCTCT CCAAGTTCGG CTCCCTGGCG CACCTCTGCG GGCCCGGCGG CGTGGACCAC
61 CTCCCGGTGA AGATCCTGCA GCCAGCCAAG GCGGACAAGG AGAGCTTCGA GAAGGCGTAC
121 CAGGTGGGCG CCGTGCTGGG TAGCGGCGGC TTCGGCACGG TCTACGCGGG TAGCCGCATC
181 GCCGACGGGC TCCCGGTGGC TGTGAAGCAC GTGGTGAAGG AGCGGGTGAC CGAGTGGGGC
241 AGCCTGGGCG GCGCGACCGT GCCCCTGGAG GTGGTGCTGC TGCGCAAGGT GGGCGCGGCG
301 GGCGGCGCGC GCGGCGTCAT CCGCCTGCTG GACTGGTTCG AGCGGCCCGA CGGCTTCCTG
361 CTGGTGCTGG AGCGGCCCGA GCCGGCGCAG GACCTCTTCG ACTTTATCAC GGAGCGCGGC
421 GCCCTGGACG AGCCGCTGGC GCGCCGCTTC TTCGCGCAGG TGCTGGCCGC CGTGCGCCAC
481 TGCCACAGCT GCGGGGTCGT GCACCGCGAC ATTAAGGACG AAAATCTGCT TGTGGACCTG
541 CGCTCCGGAG AGCTCAAGCT CATCGACTTC GGTTCGGGTG CGCTGCTCAA GGACACGGTC
601 TACACCGACT TCGACGGCAC CCGAGTGTAC AGCCCCCCGG AGTGGATCCG CTACCACCGC
661 TACCACGGGC GCTCGGCCAC CGTGTGGTCG CTGGGCGTGC TTCTCTACGA TATGGTGTGT
721 GGGGACATCC CCTTCGAGCA GGACGAGGAG ATCCTCCGAG GCCGCCTGCT CTTCCGGAGG
781 AGGGTCTCTC CAGAGTGCCA GCAGCTGATC CGGTGGTGCC TGTCCCTGCG GCCCTCAGAG
841 CGGCCGTCGC TGGATCAGAT TGCGGCCCAT CCCTGGATGC TGGGGGCTGA CGGGGGCGCC
901 CCGGAGAGCT GTGACCTGCG GCTGTGCACC CTCGACCCTG ATGACGTGGC CAGCACCACG
961 TCCAGCAGCG AGAGCTTGTG A
hPIM-3氨基酸序列
1 MLLSKFGSLA HLCGPGGVDH LPVKTLQPAK ADKESFEKAY QVGAVLGSGG FGTVYAGSRI
61 ADGLPVAVKH VVKERVTEWG SLGGATVPLE VVLLRKVGAA GGARGVIRLL DWFERPDGFL
121 LVLERPEPAQ DLFDFITERG ALDEPLARRF FAQVLAAVRH CHSCGVVHRD IKDENLLVDL
181 RSGELKLIDF GSGALLKDTV YTDFDGTRVY SPPEWIRYHR YHGRSATVWS LGVLLYDMVC
241 GDIPFEQDEE ILRGRLLFRR RVSPECQQLI RWCLSLRPSE RPSLDQIAAH PWMLGADGGA
301 PESCDLRLCT LEPDDVASTT SSSESL
ATOM 1604 CA LEU A 232 56.256 25.394 6.644 1.00 13.16 C
ATOM 1605 CB LEU A 232 55.031 24.750 5.949 1.00 13.56 C
ATOM 1606 CG LEU A 232 53.653 25.362 6.282 1.00 12.22 C
ATOM 1607 CD1 LEU A 232 53.627 26.902 6.159 1.00 13.83 C
ATOM 1608 CD2 LEU A 232 52.521 24.721 5.419 1.00 11.85 C
ATOM 1609 C LEU A 232 56.112 25.294 8.164 1.00 13.79 C
ATOM 1610 O LEU A 232 55.723 26.269 8.817 1.00 14.65 O
ATOM 1611 N TYR A 233 56.445 24.133 8.723 1.00 13.34 N
ATOM 1612 CA TYR A 233 56.407 23.940 10.175 1.00 13.68 C
ATOM 1613 CB TYR A 233 56.870 22.524 10.551 1.00 12.73 C
ATOM 1614 CG TYR A 233 56.786 22.263 12.044 1.00 14.51 C
ATOM 1615 CD1 TYR A 233 57.791 22.713 12.908 1.00 14.02 C
ATOM 1616 CE1 TYR A 233 57.728 22.487 14.266 1.00 13.74 C
ATOM 1617 CZ TYR A 233 56.647 21.796 14.798 1.00 15.95 C
ATOM 1618 OH TYR A 233 56.590 21.586 16.169 1.00 17.38 O
ATOM 1619 CE2 TYR A 233 55.630 21.352 13.978 1.00 15.69 C
ATOM 1620 CD2 TYR A 233 55.705 21.588 12.594 1.00 14.19 C
ATOM 1621 C TYR A 233 57.296 24.989 10.855 1.00 14.14 C
ATOM 1622 O TYR A 233 56.893 25.639 11.837 1.00 14.22 O
ATOM 1623 N ASP A 234 58.497 25.162 10.304 1.00 14.64 N
ATOM 1624 CA ASP A 234 59.462 26.128 10.820 1.00 14.70 C
ATOM 1625 CB ASP A 234 60.741 26.074 9.986 1.00 15.23 C
ATOM 1626 CG ASP A 234 61.806 27.031 10.482 1.00 17.95 C
ATOM 1627 OD1 ASP A 234 62.134 27.038 11.693 1.00 17.66 O
ATOM 1628 OD2 ASP A 234 62.372 27.815 9.707 1.00 23.64 O
ATOM 1629 C ASP A 234 58.902 27.550 10.842 1.00 15.14 C
ATOM 1630 O ASP A 234 59.130 28.304 11.808 1.00 14.44 O
ATOM 1631 N MET A 235 58.177 27.921 9.782 1.00 14.52 N
ATOM 1632 CA MET A 235 57.585 29.248 9.679 1.00 15.77 C
ATOM 1633 CB MET A 235 56.946 29.472 8.300 1.00 15.95 C
ATOM 1634 CG MET A 235 57.955 29.567 7.157 1.00 19.29 C
ATOM 1635 SD MET A 235 57.147 30.105 5.616 1.00 23.96 S
ATOM 1636 CE MET A 235 56.577 28.752 5.093 1.00 24.70 C
ATOM 1637 C MET A 235 56.535 29.503 10.756 1.00 15.44 C
ATOM 1638 O MET A 235 56.551 30.545 11.395 1.00 15.28 O
ATOM 1639 N VAL A 236 55.622 28.557 10.944 1.00 15.79 N
ATOM 1640 CA VAL A 236 54.480 28.780 11.845 1.00 16.11 C
ATOM 1641 CB VAL A 236 53.169 28.062 11.349 1.00 16.48 C
ATOM 1642 CG1 VAL A 236 52.709 28.622 9.995 1.00 15.52 C
ATOM 1643 CG2 VAL A 236 53.327 26.521 11.277 1.00 14.68 C
ATOM 1644 C VAL A 236 54.808 28.422 13.295 1.00 17.29 C
ATOM 1645 O VAL A 236 54.084 28.833 14.220 1.00 17.67 O
ATOM 1646 N CYS A 237 55.901 27.673 13.503 1.00 17.50 N
ATOM 1647 CA CYS A 237 56.276 27.261 14.863 1.00 18.98 C
ATOM 1648 CB CYS A 237 56.400 25.735 14.986 1.00 18.51 C
ATOM 1649 SG CYS A 237 54.825 24.891 14.842 1.00 22.03 S
ATOM 1650 C CYS A 237 57.548 27.914 15.366 1.00 18.98 C
ATOM 1651 O CYS A 237 57.788 27.936 16.562 1.00 18.75 O
ATOM 1652 N GLY A 238 58.359 28.443 14.452 1.00 19.38 N
ATOM 1653 CA GLY A 238 59.584 29.125 14.835 1.00 20.34 C
ATOM 1654 C GLY A 238 60.776 28.206 14.966 1.00 21.28 C
ATOM 1655 O GLY A 238 61.871 28.677 15.269 1.00 21.63 O
ATOM 1656 N ASP A 239 60.572 26.906 14.743 1.00 21.89 N
ATOM 1657 CA ASP A 239 61.662 25.904 14.741 1.00 23.14 C
ATOM 1658 CB ASP A 239 62.038 25.466 16.161 1.00 24.31 C
ATOM 1659 CG ASP A 239 63.557 25.367 16.363 1.00 28.93 C
ATOM 1660 OD1 ASP A 239 64.268 24.729 15.530 1.00 31.83 O
ATOM 1661 OD2 ASP A 239 64.126 25.919 17.333 1.00 34.08 O
ATOM 1662 C ASP A 239 61.271 24.671 13.918 1.00 22.10 C
ATOM 1663 O ASP A 239 60.110 24.508 13.582 1.00 22.05 O
ATOM 1664 N ILE A 240 62.241 23.823 13.590 1.00 21.41 N
ATOM 1665 CA ILE A 240 61.995 22.616 12.803 1.00 21.20 C
ATOM 1666 CB ILE A 240 63.299 22.130 12.119 1.00 21.27 C
ATOM 1667 CG1 ILE A 240 64.418 21.934 13.162 1.00 22.95 C
ATOM 1668 CD1 ILE A 240 65.727 21.359 12.604 1.00 24.55 C
ATOM 1669 CG2 ILE A 240 63.711 23.113 11.020 1.00 22.14 C
ATOM 1670 C ILE A 240 61.390 21.516 13.687 1.00 21.05 C
ATOM 1671 O ILE A 240 61.628 21.507 14.896 1.00 20.43 O
ATOM 1672 N PRO A 241 60.596 20.610 13.112 1.00 21.20 N
ATOM 1673 CA PRO A 241 59.885 19.609 13.924 1.00 22.14 C
ATOM 1674 CB PRO A 241 58.818 19.070 12.967 1.00 22.34 C
ATOM 1675 CG PRO A 241 59.418 19.243 11.581 1.00 20.54 C
ATOM 1676 CD PRO A 241 60.303 20.461 11.670 1.00 21.11 C
ATOM 1677 C PRO A 241 60.762 18.466 14.413 1.00 23.21 C
ATOM 1678 O PRO A 241 60.432 17.885 15.443 1.00 23.48 O
ATOM 1679 N PHE A 242 61.843 18.143 13.699 1.00 24.34 N
ATOM 1680 CA PHE A 242 62.625 16.949 13.999 1.00 25.31 C
ATOM 1681 CB PHE A 242 62.503 15.894 12.881 1.00 24.74 C
ATOM 1682 CG PHE A 242 61.097 15.596 12.440 1.00 22.55 C
ATOM 1683 CD1 PHE A 242 60.115 15.212 13.354 1.00 21.74 C
ATOM 1684 CE1 PHE A 242 58.812 14.916 12.923 1.00 21.18 C
ATOM 1685 CZ PHE A 242 58.489 15.011 11.556 1.00 21.06 C
ATOM 1686 CE2 PHE A 242 59.467 15.392 10.642 1.00 20.29 C
ATOM 1687 CD2 PHE A 242 60.763 15.672 11.088 1.00 21.16 C
ATOM 1688 C PHE A 242 64.099 17.286 14.169 1.00 27.27 C
ATOM 1689 O PHE A 242 64.671 18.038 13.370 1.00 27.35 O
ATOM 1690 N GLU A 243 64.716 16.692 15.186 1.00 29.13 N
ATOM 1691 CA GLU A 243 66.149 16.849 15.428 1.00 31.65 C
ATOM 1692 CB GLU A 243 66.404 17.361 16.849 1.00 32.51 C
ATOM 1693 CG GLU A 243 65.779 18.723 17.153 1.00 37.83 C
ATOM 1694 CD GLU A 243 66.521 19.895 16.505 1.00 43.98 C
ATOM 1695 OE1 GLU A 243 66.675 19.903 15.260 1.00 46.61 O
ATOM 1696 OE2 GLU A 243 66.941 20.824 17.241 1.00 46.61 O
ATOM 1697 C GLU A 243 66.951 15.568 15.187 1.00 31.62 C
ATOM 1698 O GLU A 243 68.096 15.630 14.759 1.00 32.81 O
ATOM 1699 N HIS A 244 66.361 14.409 15.454 1.00 31.55 N
ATOM 1700 CA HIS A 244 67.089 13.146 15.307 1.00 31.42 C
ATOM 1701 CB HIS A 244 67.187 12.423 16.650 1.00 32.01 C
ATOM 1702 CG HIS A 244 67.774 13.265 17.738 1.00 34.56 C
ATOM 1703 ND1 HIS A 244 67.014 13.790 18.763 1.00 36.67 N
ATOM 1704 CE1 HIS A 244 67.791 14.502 19.561 1.00 37.86 C
ATOM 1705 NE2 HIS A 244 69.026 14.462 19.087 1.00 37.93 N
ATOM 1706 CD2 HIS A 244 69.041 13.697 17.945 1.00 36.34 C
ATOM 1707 C HIS A 244 66.482 12.235 14.243 1.00 30.37 C
ATOM 1708 O HIS A 244 65.279 12.327 13.941 1.00 29.56 O
ATOM 1709 N ASP A 245 67.326 11.360 13.689 1.00 29.19 N
ATOM 1710 CA ASP A 245 66.909 10.373 12.691 1.00 28.54 C
ATOM 1711 CB ASP A 245 68.005 9.315 12.473 1.00 28.34 C
ATOM 1712 CG ASP A 245 69.208 9.853 11.726 1.00 28.71 C
ATOM 1713 OD1 ASP A 245 69.183 11.016 11.252 1.00 28.60 O
ATOM 1714 OD2 ASP A 245 70.242 9.174 11.572 1.00 30.07 O
ATOM 1715 C ASP A 245 65.624 9.670 13.103 1.00 28.04 C
ATOM 1716 O ASP A 245 64.724 9.485 12.284 1.00 27.65 O
ATOM 1717 N GLU A 246 65.566 9.292 14.381 1.00 27.40 N
ATOM 1718 CA GLU A 246 64.451 8.563 14.978 1.00 27.37 C
ATOM 1719 CB GLU A 246 64.743 8.286 16.468 1.00 28.11 C
ATOM 1720 CG GLU A 246 65.942 7.369 16.736 1.00 32.49 C
ATOM 1721 CD GLU A 246 67.302 8.072 16.650 1.00 37.16 C
ATOM 1722 OE1 GLU A 246 67.413 9.255 17.037 1.00 39.44 O
ATOM 1723 OE2 GLU A 246 68.276 7.434 16.191 1.00 40.05 O
ATOM 1724 C GLU A 246 63.128 9.318 14.844 1.00 26.19 C
ATOM 1725 O GLU A 246 62.087 8.720 14.570 1.00 25.74 O
ATOM 1726 N GLU A 247 63.178 10.630 15.054 1.00 24.84 N
ATOM 1727 CA GLU A 247 61.997 11.473 14.925 1.00 24.64 C
ATOM 1728 CB GLU A 247 62.228 12.861 15.550 1.00 24.76 C
ATOM 1729 CG GLU A 247 62.600 12.823 17.029 1.00 27.07 C
ATOM 1730 CD GLU A 247 63.106 14.164 17.539 1.00 31.82 C
ATOM 1731 OE1 GLU A 247 63.956 14.804 16.873 1.00 31.23 O
ATOM 1732 OE2 GLU A 247 62.653 14.582 18.623 1.00 35.62 O
ATOM 1733 C GLU A 247 61.573 11.592 13.458 1.00 23.43 C
ATOM 1734 O GLU A 247 60.388 11.491 13.151 1.00 22.84 O
ATOM 1735 N ILE A 248 62.546 11.782 12.563 1.00 22.82 N
ATOM 1736 CA ILE A 248 62.269 11.827 11.119 1.00 22.09 C
ATOM 1737 CB ILE A 248 63.555 12.106 10.284 1.00 22.33 C
ATOM 1738 CG1 ILE A 248 64.103 13.506 10.594 1.00 21.24 C
ATOM 1739 CD1 ILE A 248 65.557 13.692 10.191 1.00 23.01 C
ATOM 1740 CG2 ILE A 248 63.273 11.965 8.767 1.00 21.11 C
ATOM 1741 C ILE A 248 61.567 10.547 10.665 1.00 22.18 C
ATOM 1742 O ILE A 248 60.512 10.608 10.038 1.00 21.20 O
ATOM 1743 N ILE A 249 62.144 9.396 11.016 1.00 22.55 N
ATOM 1744 CA ILE A 249 61.595 8.083 10.646 1.00 23.21 C
ATOM 1745 CB ILE A 249 62.539 6.943 11.136 1.00 23.49 C
ATOM 1746 CG1 ILE A 249 63.856 6.947 10.348 1.00 24.43 C
ATOM 1747 CD1 ILE A 249 64.971 6.114 11.041 1.00 26.84 C
ATOM 1748 CG2 ILE A 249 61.853 5.562 11.051 1.00 24.03 C
ATOM 1749 C ILE A 249 60.175 7.875 11.200 1.00 23.18 C
ATOM 1750 O ILE A 249 59.312 7.314 10.520 1.00 22.99 O
ATOM 1751 N ARG A 250 59.943 8.318 12.435 1.00 23.13 N
ATOM 1752 CA ARG A 250 58.614 8.204 13.044 1.00 23.60 C
ATOM 1753 CB ARG A 250 58.679 8.421 14.562 1.00 23.56 C
ATOM 1754 CG ARG A 250 57.356 8.162 15.290 1.00 24.55 C
ATOM 1755 CD ARG A 250 57.504 7.770 16.760 1.00 24.93 C
ATOM 1756 NE ARG A 250 56.208 7.638 17.430 1.00 25.45 N
ATOM 1757 CZ ARG A 250 55.636 8.594 18.168 1.00 25.98 C
ATOM 1758 NH1 ARG A 250 56.234 9.770 18.349 1.00 24.37 N
ATOM 1759 NH2 ARG A 250 54.459 8.373 18.733 1.00 26.41 N
ATOM 1760 C ARG A 250 57.621 9.159 12.375 1.00 23.56 C
ATOM 1761 O ARG A 250 56.468 8.802 12.165 1.00 23.53 O
ATOM 1762 N GLY A 251 58.089 10.357 12.022 1.00 23.63 N
ATOM 1763 CA GLY A 251 57.282 11.334 11.314 1.00 24.56 C
ATOM 1764 C GLY A 251 56.082 11.864 12.096 1.00 25.30 C
ATOM 1765 O GLY A 251 55.074 12.248 11.496 1.00 25.76 O
ATOM 1766 N GLN A 252 56.177 11.877 13.423 1.00 25.26 N
ATOM 1767 CA GLN A 252 55.082 12.373 14.263 1.00 25.84 C
ATOM 1768 CB GLN A 252 55.005 11.603 15.593 1.00 26.06 C
ATOM 1769 CG GLN A 252 53.796 11.937 16.488 1.00 29.12 C
ATOM 1770 CD GLN A 252 52.439 11.649 15.837 1.00 32.13 C
ATOM 1771 OE1 GLN A 252 51.537 12.506 15.854 1.00 31.35 O
ATOM 1772 NE2 GLN A 252 52.292 10.448 15.264 1.00 32.42 N
ATOM 1773 C GLN A 252 55.271 13.863 14.504 1.00 25.11 C
ATOM 1774 O GLN A 252 56.310 14.303 15.008 1.00 24.98 O
ATOM 1775 N VAL A 253 54.265 14.634 14.123 1.00 24.33 N
ATOM 1776 CA VAL A 253 54.351 16.085 14.196 1.00 24.36 C
ATOM 1777 CB VAL A 253 53.751 16.750 12.922 1.00 24.24 C
ATOM 1778 CG1 VAL A 253 53.971 18.240 12.948 1.00 24.73 C
ATOM 1779 CG2 VAL A 253 54.356 16.124 11.647 1.00 24.87 C
ATOM 1780 C VAL A 253 53.601 16.576 15.431 1.00 23.69 C
ATOM 1781 O VAL A 253 52.427 16.275 15.602 1.00 23.22 O
ATOM 1782 N PHE A 254 54.297 17.321 16.278 1.00 23.14 N
ATOM 1783 CA PHE A 254 53.683 17.993 17.403 1.00 23.19 C
ATOM 1784 CB PHE A 254 54.295 17.481 18.702 1.00 22.64 C
ATOM 1785 CG APHE A 254 53.868 18.247 19.912 0.70 21.91 C
ATOM 1786 CG BPHE A 254 53.915 16.067 18.997 0.30 22.47 C
ATOM 1787 CD1 APHE A 254 52.711 17.897 20.596 0.70 20.57 C
ATOM 1788 CD1 BPHE A 254 54.877 15.073 19.055 0.30 21.39 C
ATOM 1789 CE1 APHE A 254 52.308 18.608 21.724 0.70 18.82 C
ATOM 1790 CE1 BPHE A 254 54.517 13.772 19.304 0.30 20.97 C
ATOM 1791 CZ APHE A 254 53.054 19.677 22.163 0.70 20.33 C
ATOM 1792 CZ BPHE A 254 53.180 13.445 19.476 0.30 21.52 C
ATOM 1793 CE2 APHE A 254 54.214 20.045 21.486 0.70 20.58 C
ATOM 1794 CE2 BPHE A 254 52.207 14.421 19.400 0.30 21.67 C
ATOM 1795 CD2 APHE A 254 54.615 19.333 20.369 0.70 21.56 C
ATOM 1796 CD2 BPHE A 254 52.574 15.720 19.157 0.30 21.61 C
ATOM 1797 C PHE A 254 53.789 19.507 17.295 1.00 23.65 C
ATOM 1798 O PHE A 254 54.876 20.055 17.059 1.00 23.03 O
ATOM 1799 N PHE A 255 52.652 20.173 17.475 1.00 24.25 N
ATOM 1800 CA PHE A 255 52.600 21.636 17.448 1.00 24.57 C
ATOM 1801 CB PHE A 255 51.367 22.117 16.705 1.00 24.07 C
ATOM 1802 CG PHE A 255 51.421 21.819 15.250 1.00 22.93 C
ATOM 1803 CD1 PHE A 255 51.972 22.743 14.368 1.00 20.88 C
ATOM 1804 CE1 PHE A 255 52.048 22.466 13.018 1.00 18.91 C
ATOM 1805 CZ PHE A 255 51.585 21.254 12.540 1.00 20.61 C
ATOM 1806 CE2 PHE A 255 51.047 20.307 13.426 1.00 19.19 C
ATOM 1807 CD2 PHE A 255 50.974 20.595 14.762 1.00 19.54 C
ATOM 1808 C PHE A 255 52.668 22.239 18.830 1.00 25.43 C
ATOM 1809 O PHE A 255 51.839 21.958 19.691 1.00 25.30 O
ATOM 1810 N ARG A 256 53.701 23.057 19.015 1.00 26.64 N
ATOM 1811 CA ARG A 256 54.026 23.713 20.274 1.00 27.50 C
ATOM 1812 CB ARG A 256 55.556 23.791 20.412 1.00 28.35 C
ATOM 1813 CG ARG A 256 56.282 24.268 19.116 1.00 31.19 C
ATOM 1814 CD ARG A 256 57.825 24.203 19.164 1.00 35.66 C
ATOM 1815 NE ARG A 256 58.346 23.171 18.257 1.00 38.13 N
ATOM 1816 CZ ARG A 256 59.580 22.660 18.298 1.00 40.12 C
ATOM 1817 NH1 ARG A 256 60.466 23.080 19.204 1.00 40.47 N
ATOM 1818 NH2 ARG A 256 59.930 21.716 17.431 1.00 38.85 N
ATOM 1819 C ARG A 256 53.444 25.122 20.255 1.00 27.08 C
ATOM 1820 O ARG A 256 53.389 25.807 21.279 1.00 27.90 O
ATOM 1821 N GLN A 257 53.023 25.546 19.068 1.00 26.07 N
ATOM 1822 CA GLN A 257 52.369 26.834 18.871 1.00 25.36 C
ATOM 1823 CB GLN A 257 53.126 27.643 17.803 1.00 25.81 C
ATOM 1824 CG GLN A 257 54.514 28.095 18.215 1.00 29.91 C
ATOM 1825 CD GLN A 257 54.493 29.381 19.019 1.00 35.63 C
ATOM 1826 OE1 GLN A 257 53.596 30.222 18.846 1.00 37.93 O
ATOM 1827 NE2 GLN A 257 55.480 29.545 19.901 1.00 37.58 N
ATOM 1828 C GLN A 257 50.931 26.611 18.399 1.00 23.15 C
ATOM 1829 O GLN A 257 50.618 25.574 17.821 1.00 22.57 O
ATOM 1830 N ARG A 258 50.072 27.593 18.633 1.00 21.04 N
ATOM 1831 CA ARG A 258 48.726 27.571 18.079 1.00 19.58 C
ATOM 1832 CB ARG A 258 47.862 28.674 18.683 1.00 19.69 C
ATOM 1833 CG ARG A 258 46.355 28.438 18.509 1.00 21.79 C
ATOM 1834 CD ARG A 258 45.834 28.809 17.134 1.00 24.81 C
ATOM 1835 NE ARG A 258 44.538 28.195 16.847 1.00 26.49 N
ATOM 1836 CZ ARG A 258 43.844 28.395 15.725 1.00 27.04 C
ATOM 1837 NH1 ARG A 258 44.316 29.200 14.757 1.00 27.33 N
ATOM 1838 NH2 ARG A 258 42.677 27.789 15.570 1.00 25.64 N
ATOM 1839 C ARG A 258 48.811 27.738 16.564 1.00 18.78 C
ATOM 1840 O ARG A 258 49.282 28.759 16.074 1.00 18.29 O
ATOM 1841 N VAL A 259 48.367 26.716 15.843 1.00 17.49 N
ATOM 1842 CA VAL A 259 48.404 26.682 14.389 1.00 17.02 C
ATOM 1843 CB VAL A 259 49.533 25.733 13.879 1.00 16.57 C
ATOM 1844 CG1 VAL A 259 49.472 25.544 12.361 1.00 15.19 C
ATOM 1845 CG2 VAL A 259 50.929 26.259 14.310 1.00 17.98 C
ATOM 1846 C VAL A 259 47.043 26.171 13.920 1.00 16.99 C
ATOM 1847 O VAL A 259 46.541 25.190 14.460 1.00 16.43 O
ATOM 1848 N SER A 260 46.451 26.843 12.930 1.00 17.02 N
ATOM 1849 CA SER A 260 45.141 26.451 12.398 1.00 17.31 C
ATOM 1850 CB SER A 260 44.687 27.398 11.273 1.00 17.29 C
ATOM 1851 OG SER A 260 45.399 27.137 10.073 1.00 17.50 O
ATOM 1852 C SER A 260 45.145 25.005 11.916 1.00 17.62 C
ATOM 1853 O SER A 260 46.182 24.484 11.518 1.00 17.40 O
ATOM 1854 N SER A 261 43.974 24.367 11.957 1.00 17.98 N
ATOM 1855 CA SER A 261 43.820 22.972 11.559 1.00 18.43 C
ATOM 1856 CB SER A 261 42.398 22.499 11.855 1.00 18.46 C
ATOM 1857 OG SER A 261 42.169 22.473 13.254 1.00 19.59 O
ATOM 1858 C SER A 261 44.118 22.748 10.082 1.00 18.64 C
ATOM 1859 O SER A 261 44.630 21.694 9.701 1.00 18.31 O
ATOM 1860 N GLU A 262 43.780 23.729 9.256 1.00 19.27 N
ATOM 1861 CA GLU A 262 44.102 23.659 7.829 1.00 20.49 C
ATOM 1862 CB GLU A 262 43.461 24.807 7.058 1.00 21.45 C
ATOM 1863 CG GLU A 262 42.033 24.525 6.627 1.00 27.18 C
ATOM 1864 CD GLU A 262 41.304 25.782 6.184 1.00 35.25 C
ATOM 1865 OE1 GLU A 262 41.928 26.645 5.498 1.00 38.82 O
ATOM 1866 OE2 GLU A 262 40.101 25.915 6.522 1.00 39.29 O
ATOM 1867 C GLU A 262 45.615 23.663 7.614 1.00 19.31 C
ATOM 1868 O GLU A 262 46.131 22.851 6.853 1.00 18.98 O
ATOM 1869 N CYS A 263 46.318 24.561 8.297 1.00 18.97 N
ATOM 1870 CA CYS A 263 47.785 24.596 8.196 1.00 18.66 C
ATOM 1871 CB CYS A 263 48.359 25.805 8.937 1.00 18.56 C
ATOM 1872 SG CYS A 263 50.133 26.031 8.731 1.00 18.69 S
ATOM 1873 C CYS A 263 48.385 23.275 8.703 1.00 18.45 C
ATOM 1874 O CYS A 263 49.223 22.664 8.024 1.00 18.06 O
ATOM 1875 N GLN A 264 47.932 22.827 9.873 1.00 18.01 N
ATOM 1876 CA GLN A 264 48.389 21.553 10.434 1.00 18.32 C
ATOM 1877 CB GLN A 264 47.650 21.210 11.748 1.00 17.97 C
ATOM 1878 CG GLN A 264 48.085 22.034 12.955 1.00 18.25 C
ATOM 1879 CD GLN A 264 47.598 21.447 14.282 1.00 20.77 C
ATOM 1880 OE1 GLN A 264 47.359 20.240 14.382 1.00 19.45 O
ATOM 1881 NE2 GLN A 264 47.464 22.299 15.304 1.00 19.10 N
ATOM 1882 C GLN A 264 48.191 20.419 9.424 1.00 18.18 C
ATOM 1883 O GLN A 264 49.068 19.581 9.252 1.00 18.03 O
ATOM 1884 N HIS A 265 47.033 20.405 8.768 1.00 18.36 N
ATOM 1885 CA HIS A 265 46.712 19.366 7.805 1.00 19.15 C
ATOM 1886 CB HIS A 265 45.269 19.505 7.310 1.00 19.80 C
ATOM 1887 CG HIS A 265 44.890 18.474 6.295 1.00 23.71 C
ATOM 1888 ND1 HIS A 265 45.147 18.627 4.948 1.00 27.52 N
ATOM 1889 CE1 HIS A 265 44.712 17.562 4.294 1.00 28.98 C
ATOM 1890 NE2 HIS A 265 44.190 16.720 5.170 1.00 29.95 N
ATOM 1891 CD2 HIS A 265 44.294 17.264 6.430 1.00 27.50 C
ATOM 1892 C HIS A 265 47.701 19.383 6.624 1.00 18.47 C
ATOM 1893 O HIS A 265 48.219 18.340 6.236 1.00 17.33 O
ATOM 1894 N LEU A 266 47.973 20.577 6.089 1.00 17.86 N
ATOM 1895 CA LEU A 266 48.891 20.717 4.968 1.00 17.70 C
ATOM 1896 CB LEU A 266 48.925 22.167 4.440 1.00 17.79 C
ATOM 1897 CG LEU A 266 49.889 22.490 3.277 1.00 16.98 C
ATOM 1898 CD1 LEU A 266 49.700 21.533 2.080 1.00 16.25 C
ATOM 1899 CD2 LEU A 266 49.731 23.941 2.832 1.00 16.33 C
ATOM 1900 C LEU A 266 50.282 20.225 5.372 1.00 17.61 C
ATOM 1901 O LEU A 266 50.906 19.443 4.642 1.00 17.30 O
ATOM 1902 N ILE A 267 50.741 20.639 6.555 1.00 17.19 N
ATOM 1903 CA ILE A 267 52.072 20.263 7.023 1.00 16.80 C
ATOM 1904 CB ILE A 267 52.425 20.934 8.385 1.00 16.67 C
ATOM 1905 CG1 ILE A 267 52.702 22.433 8.196 1.00 15.36 C
ATOM 1906 CD1 ILE A 267 52.656 23.273 9.494 1.00 14.12 C
ATOM 1907 CG2 ILE A 267 53.626 20.245 9.024 1.00 15.66 C
ATOM 1908 C ILE A 267 52.173 18.753 7.137 1.00 17.49 C
ATOM 1909 O ILE A 267 53.119 18.156 6.618 1.00 16.97 O
ATOM 1910 N ARG A 268 51.178 18.140 7.783 1.00 17.52 N
ATOM 1911 CA ARG A 268 51.165 16.692 7.997 1.00 18.02 C
ATOM 1912 CB ARG A 268 49.990 16.302 8.907 1.00 18.56 C
ATOM 1913 CG ARG A 268 50.240 16.587 10.386 1.00 20.63 C
ATOM 1914 CD ARG A 268 49.234 15.899 11.331 1.00 25.57 C
ATOM 1915 NE ARG A 268 48.912 16.743 12.487 1.00 29.85 N
ATOM 1916 CZ ARG A 268 49.629 16.737 13.585 1.00 31.14 C
ATOM 1917 NH1 ARG A 268 50.663 15.929 13.648 1.00 34.34 N
ATOM 1918 NH2 ARG A 268 49.331 17.507 14.615 1.00 30.34 N
ATOM 1919 C ARG A 268 51.104 15.910 6.668 1.00 17.59 C
ATOM 1920 O ARG A 268 51.676 14.833 6.544 1.00 16.65 O
ATOM 1921 N TRP A 269 50.397 16.470 5.693 1.00 17.56 N
ATOM 1922 CA TRP A 269 50.336 15.913 4.341 1.00 18.04 C
ATOM 1923 CB TRP A 269 49.340 16.717 3.490 1.00 18.77 C
ATOM 1924 CG TRP A 269 48.810 15.979 2.265 1.00 21.08 C
ATOM 1925 CD1 TRP A 269 49.030 14.662 1.914 1.00 22.56 C
ATOM 1926 NE1 TRP A 269 48.387 14.372 0.730 1.00 24.35 N
ATOM 1927 CE2 TRP A 269 47.716 15.491 0.301 1.00 23.34 C
ATOM 1928 CD2 TRP A 269 47.957 16.522 1.248 1.00 22.70 C
ATOM 1929 CE3 TRP A 269 47.377 17.781 1.033 1.00 23.10 C
ATOM 1930 CZ3 TRP A 269 46.576 17.970 -0.102 1.00 24.93 C
ATOM 1931 CH2 TRP A 269 46.351 16.922 -1.014 1.00 24.84 C
ATOM 1932 CZ2 TRP A 269 46.911 15.679 -0.829 1.00 23.75 C
ATOM 1933 C TRP A 269 51.711 15.906 3.667 1.00 17.27 C
ATOM 1934 O TRP A 269 52.137 14.870 3.149 1.00 16.99 O
ATOM 1935 N CYS A 270 52.400 17.056 3.687 1.00 16.34 N
ATOM 1936 CA CYS A 270 53.759 17.173 3.134 1.00 16.21 C
ATOM 1937 CB CYS A 270 54.294 18.607 3.275 1.00 15.97 C
ATOM 1938 SG CYS A 270 53.427 19.842 2.287 1.00 16.89 S
ATOM 1939 C CYS A 270 54.742 16.241 3.824 1.00 16.04 C
ATOM 1940 O CYS A 270 55.711 15.774 3.195 1.00 15.33 O
ATOM 1941 N LEU A 271 54.488 15.978 5.112 1.00 15.59 N
ATOM 1942 CA LEU A 271 55.357 15.124 5.907 1.00 16.36 C
ATOM 1943 CB LEU A 271 55.574 15.727 7.304 1.00 15.90 C
ATOM 1944 CG LEU A 271 56.248 17.116 7.361 1.00 16.31 C
ATOM 1945 CD1 LEU A 271 56.473 17.592 8.793 1.00 13.91 C
ATOM 1946 CD2 LEU A 271 57.590 17.113 6.570 1.00 14.64 C
ATOM 1947 C LEU A 271 54.861 13.667 6.010 1.00 16.92 C
ATOM 1948 O LEU A 271 55.190 12.969 6.976 1.00 17.11 O
ATOM 1949 N ALA A 272 54.085 13.217 5.021 1.00 17.22 N
ATOM 1950 CA ALA A 272 53.627 11.819 4.971 1.00 18.16 C
ATOM 1951 CB ALA A 272 52.691 11.581 3.798 1.00 18.05 C
ATOM 1952 C ALA A 272 54.839 10.921 4.852 1.00 18.59 C
ATOM 1953 O ALA A 272 55.768 11.216 4.083 1.00 18.17 O
ATOM 1954 N LEU A 273 54.835 9.835 5.621 1.00 19.19 N
ATOM 1955 CA LEU A 273 55.953 8.894 5.630 1.00 19.94 C
ATOM 1956 CB LEU A 273 55.754 7.832 6.728 1.00 20.56 C
ATOM 1957 CG LEU A 273 56.079 8.298 8.162 1.00 21.18 C
ATOM 1958 CD1 LEU A 273 55.894 7.176 9.193 1.00 21.79 C
ATOM 1959 CD2 LEU A 273 57.491 8.889 8.262 1.00 20.34 C
ATOM 1960 C LEU A 273 56.178 8.254 4.258 1.00 20.58 C
ATOM 1961 O LEU A 273 57.322 8.138 3.800 1.00 20.82 O
ATOM 1962 N ARG A 274 55.090 7.849 3.605 1.00 20.78 N
ATOM 1963 CA ARG A 274 55.164 7.292 2.259 1.00 21.86 C
ATOM 1964 CB ARG A 274 53.968 6.373 1.955 1.00 22.23 C
ATOM 1965 CG ARG A 274 53.714 5.266 2.975 1.00 27.91 C
ATOM 1966 CD ARG A 274 52.588 4.263 2.576 1.00 35.10 C
ATOM 1967 NE ARG A 274 52.637 3.917 1.150 1.00 40.44 N
ATOM 1968 CZ ARG A 274 51.914 2.962 0.564 1.00 44.04 C
ATOM 1969 NH1 ARG A 274 51.061 2.223 1.275 1.00 45.20 N
ATOM 1970 NH2 ARG A 274 52.047 2.741 -0.742 1.00 44.81 N
ATOM 1971 C ARG A 274 55.226 8.418 1.227 1.00 20.85 C
ATOM 1972 O ARG A 274 54.312 9.249 1.157 1.00 20.77 O
ATOM 1973 N PRO A 275 56.297 8.452 0.435 1.00 20.06 N
ATOM 1974 CA PRO A 275 56.479 9.502 -0.576 1.00 20.15 C
ATOM 1975 CB PRO A 275 57.684 9.007 -1.384 1.00 19.41 C
ATOM 1976 CG PRO A 275 58.448 8.169 -0.409 1.00 19.87 C
ATOM 1977 CD PRO A 275 57.432 7.509 0.469 1.00 20.03 C
ATOM 1978 C PRO A 275 55.245 9.709 -1.474 1.00 20.50 C
ATOM 1979 O PRO A 275 54.842 10.860 -1.692 1.00 20.44 O
ATOM 1980 N SER A 276 54.650 8.618 -1.966 1.00 20.58 N
ATOM 1981 CA SER A 276 53.454 8.693 -2.811 1.00 20.56 C
ATOM 1982 CB SER A 276 53.146 7.323 -3.430 1.00 20.69 C
ATOM 1983 OG SER A 276 52.516 6.487 -2.479 1.00 22.25 O
ATOM 1984 C SER A 276 52.219 9.234 -2.067 1.00 20.21 C
ATOM 1985 O SER A 276 51.232 9.612 -2.697 1.00 20.43 O
ATOM 1986 N ASP A 277 52.264 9.266 -0.737 1.00 19.88 N
ATOM 1987 CA ASP A 277 51.173 9.875 0.027 1.00 19.72 C
ATOM 1988 CB ASP A 277 51.093 9.311 1.443 1.00 19.57 C
ATOM 1989 CG ASP A 277 50.404 7.945 1.501 1.00 21.58 C
ATOM 1990 OD1 ASP A 277 49.751 7.540 0.504 1.00 20.40 O
ATOM 1991 OD2 ASP A 277 50.470 7.222 2.522 1.00 21.84 O
ATOM 1992 C ASP A 277 51.266 11.407 0.085 1.00 19.39 C
ATOM 1993 O ASP A 277 50.295 12.068 0.483 1.00 20.39 O
ATOM 1994 N ARG A 278 52.413 11.962 -0.308 1.00 18.14 N
ATOM 1995 CA ARG A 278 52.633 13.408 -0.252 1.00 17.60 C
ATOM 1996 CB ARG A 278 54.137 13.740 -0.277 1.00 17.19 C
ATOM 1997 CG ARG A 278 54.859 13.330 1.009 1.00 16.29 C
ATOM 1998 CD ARG A 278 56.388 13.456 0.995 1.00 15.61 C
ATOM 1999 NE ARG A 278 56.954 12.458 1.908 1.00 15.33 N
ATOM 2000 CZ ARG A 278 58.152 11.885 1.769 1.00 15.76 C
ATOM 2001 NH1 ARG A 278 58.965 12.239 0.770 1.00 13.75 N
ATOM 2002 NH2 ARG A 278 58.541 10.966 2.649 1.00 13.90 N
ATOM 2003 C ARG A 278 51.908 14.104 -1.391 1.00 17.58 C
ATOM 2004 O ARG A 278 51.716 13.506 -2.466 1.00 17.77 O
ATOM 2005 N PRO A 279 51.508 15.357 -1.166 1.00 16.97 N
ATOM 2006 CA PRO A 279 50.820 16.142 -2.192 1.00 16.86 C
ATOM 2007 CB PRO A 279 50.364 17.387 -1.415 1.00 17.33 C
ATOM 2008 CG PRO A 279 51.426 17.533 -0.313 1.00 16.46 C
ATOM 2009 CD PRO A 279 51.685 16.125 0.088 1.00 16.42 C
ATOM 2010 C PRO A 279 51.768 16.573 -3.290 1.00 17.64 C
ATOM 2011 O PRO A 279 52.967 16.757 -3.021 1.00 17.91 O
ATOM 2012 N THR A 280 51.245 16.735 -4.507 1.00 17.35 N
ATOM 2013 CA THR A 280 51.998 17.353 -5.593 1.00 17.56 C
ATOM 2014 CB THR A 280 51.284 17.108 -6.937 1.00 17.70 C
ATOM 2015 OG1 THR A 280 49.989 17.716 -6.885 1.00 18.13 O
ATOM 2016 CG2 THR A 280 50.976 15.600 -7.152 1.00 18.27 C
ATOM 2017 C THR A 280 52.048 18.864 -5.326 1.00 18.09 C
ATOM 2018 O THR A 280 51.342 19.358 -4.427 1.00 18.12 O
ATOM 2019 N PHE A 281 52.838 19.600 -6.113 1.00 18.50 N
ATOM 2020 CA PHE A 281 52.870 21.066 -6.000 1.00 19.56 C
ATOM 2021 CB PHE A 281 53.863 21.702 -6.994 1.00 19.97 C
ATOM 2022 CG PHE A 281 55.322 21.369 -6.721 1.00 22.52 C
ATOM 2023 CD1 PHE A 281 55.834 21.383 -5.433 1.00 25.27 C
ATOM 2024 CE1 PHE A 281 57.198 21.070 -5.177 1.00 26.96 C
ATOM 2025 CZ PHE A 281 58.040 20.748 -6.235 1.00 29.27 C
ATOM 2026 CE2 PHE A 281 57.535 20.748 -7.553 1.00 28.17 C
ATOM 2027 CD2 PHE A 281 56.183 21.061 -7.781 1.00 26.44 C
ATOM 2028 C PHE A 281 51.474 21.656 -6.211 1.00 19.44 C
ATOM 2029 O PHE A 281 51.064 22.559 -5.481 1.00 19.75 O
ATOM 2030 N GLU A 282 50.742 21.119 -7.188 1.00 18.94 N
ATOM 2031 CA GLU A 282 49.396 21.592 -7.492 1.00 19.12 C
ATOM 2032 CB GLU A 282 48.851 20.940 -8.787 1.00 19.45 C
ATOM 2033 CG GLU A 282 47.360 21.133 -9.034 1.00 21.47 C
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ATOM 2047 O GLU A 283 47.090 21.208 -2.519 1.00 16.78 O
ATOM 2048 N ILE A 284 49.260 21.208 -3.109 1.00 16.34 N
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ATOM 2050 CB ILE A 284 51.182 22.296 -1.977 1.00 15.68 C
ATOM 2051 CG1 ILE A 284 51.837 20.997 -1.492 1.00 15.14 C
ATOM 2052 CD1 ILE A 284 53.373 20.968 -1.576 1.00 13.98 C
ATOM 2053 CG2 ILE A 284 51.552 23.488 -1.074 1.00 15.67 C
ATOM 2054 C ILE A 284 49.003 23.507 -2.320 1.00 16.48 C
ATOM 2055 O ILE A 284 48.371 24.076 -1.447 1.00 16.43 O
ATOM 2056 N GLN A 285 49.162 24.009 -3.539 1.00 16.57 N
ATOM 2057 CA GLN A 285 48.677 25.335 -3.872 1.00 17.32 C
ATOM 2058 CB GLN A 285 49.376 25.867 -5.124 1.00 16.61 C
ATOM 2059 CG GLN A 285 50.848 26.173 -4.858 1.00 16.82 C
ATOM 2060 CD GLN A 285 51.485 26.941 -5.984 1.00 16.61 C
ATOM 2061 OE1 GLN A 285 51.643 26.408 -7.087 1.00 16.49 O
ATOM 2062 NE2 GLN A 285 51.822 28.204 -5.731 1.00 12.74 N
ATOM 2063 C GLN A 285 47.153 25.426 -3.998 1.00 17.59 C
ATOM 2064 O GLN A 285 46.596 26.520 -3.882 1.00 17.62 O
ATOM 2065 N ASN A 286 46.495 24.292 -4.231 1.00 17.76 N
ATOM 2066 CA ASN A 286 45.038 24.227 -4.189 1.00 18.67 C
ATOM 2067 CB ASN A 286 44.507 23.196 -5.199 1.00 19.01 C
ATOM 2068 CG ASN A 286 44.599 23.683 -6.644 1.00 20.31 C
ATOM 2069 OD1 ASN A 286 44.581 24.890 -6.923 1.00 21.12 O
ATOM 2070 ND2 ASN A 286 44.697 22.746 -7.566 1.00 21.21 N
ATOM 2071 C ASN A 286 44.473 23.948 -2.787 1.00 19.15 C
ATOM 2072 O ASN A 286 43.253 23.959 -2.585 1.00 18.66 O
Claims (119)
1.用于得到结合PIM-1的改良配基的方法,包括
确定结合PIM-1、并且与PIM-1残基49、52、65、67、121、128、和186中的一个或者多个相互作用的化合物的衍生物,是否以比所述化合物更高的亲和性或者更高的特异性或者两者结合PIM-1,其中以更高的亲和性或者更高的特异性或者两者进行结合表明所述衍生物是改良配基。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述衍生物具有比所述化合物高至少10倍的亲和性或者特异性或者两者。
3.如权利要求1所述的方法,其中所述衍生物具有比所述化合物高至少100倍的亲和性或者特异性或者两者。
4.如权利要求1所述的方法,其中所述化合物具有式I、式II、或者式III的化学结构。
5.用于开发对PIM-1具有特异性的配基的方法,包括
确定结合多种激酶的化合物的衍生物,是否比所述化合物对PIM-1具有更高的特异性。
6.如权利要求5所述的方法,其中所述化合物结合PIM-1的亲和性,比结合所述多种激酶中的任意一个,高至少10倍。
7.如权利要求5所述的方法,其中所述化合物与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的至少一个相互作用。
8.如权利要求5所述的方法,其中所述化合物是式I,式II,或者式III的化合物。
9.如权利要求5所述的方法,其中所述化合物与所述多种激酶微弱地结合。
10.开发结合PIM-1的配基的方法,包括
鉴定结合PIM-1的结合位点的一个或者多个化合物为分子架构;
在与PIM-1形成的共晶体中,确定至少一个分子架构的定向;并且
鉴定所述分子架构的化学结构,当经过修饰后,改变了分子架构和PIM-1之间的结合亲和性或者结合特异性或者两者;并且
合成配基,其中分子架构中的一个或者多个化学结构经过修饰,以便提供具有改变的结合亲和性或者结合特异性或者两者的结合PIM-1的配基。
11.如权利要求10所述的方法,其中所述分子架构是微弱结合化合物。
12.如权利要求10所述的方法,其中所述分子架构结合多种激酶。
13.如权利要求10所述的方法,其中所述分子架构与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的一个或者多个相互作用。
14.如权利要求10所述的方法,其中所述分子架构具有式I、式II、或者式III的化学结构。
15.开发具有增加的PIM特异性的配基的方法,包括
测定激酶结合化合物之衍生物的增加的PIM特异性,其中增加的特异性表示所述衍生物是具有增加的PIM特异性的配基。
16.如权利要求15所述的方法,其中所述激酶结合化合物结合至少5种不同的人激酶。
17.如权利要求15所述的方法,其中所述激酶结合化合物结合至少10种不同的人激酶。
18.如权利要求15所述的方法,其中所述PIM是PIM-1,PIM-2,PIM-3,或者PIM-1,PIM-2,PIM-3中的至少两个的任意组合。
19.鉴定结合PIM-1的配基的方法,包括
确定包括选自式I、式II、或者式III的核心结构的衍生化合物,是否以相比于母体化合物,以改变的结合亲和性或者特异性或者两者结合PIM-1。
20.确定激酶结构的方法,包括
从PIM-1结构的电子展示产生同源模型。
21.如权利要求20的方法,其中所述产生包括
鉴定PIM-1与所述激酶之间的保守氨基酸残基;
转移在所述PIM结构中的多个保守氨基酸的原子坐标,至所述激酶相对应的氨基酸上,以便提供所述激酶的粗略结构;并且
应用在所述激酶中的剩余氨基酸残基的结构的电子展示,构建展示所述激酶的剩余部分的结构。
22.如权利要求21的方法,进一步包括配合所述同源模型,至来自所述激酶的一个或者多个晶体的低分辨率x-射线衍射数据。
23.如权利要求21的方法,其中来自表1的保守残基的坐标被利用。
24.如权利要求21的方法,其中来自突变的PIM-1的保守残基的坐标被利用。
25.如权利要求24的方法,其中所述突变的PIM-1包含P123M突变。
26.PIM-1和PIM-1结合化合物的共晶体。
27.如权利要求26的共晶体,其中所述结合化合物与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的至少一个残基相互作用。
28.如权利要求26的共晶体,其中所述结合化合物具有式I,式II,或者式III的化学结构。
29.如权利要求26的共晶体,其中所述共晶体是在X-射线束下。
30.PIM-1的结晶形式
31.如权利要求30的结晶形式,具有表1中所描述的坐标。
32.如权利要求30的结晶形式,包含一个或者更多个重金属原子。
33.如权利要求30的结晶形式,其中所述结晶形式包含PIM-1与结合化合物的共晶体。
34.如权利要求33的结晶形式,其中所述结合化合物与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的一个或者多个相互作用。
35.如权利要求34的结晶形式,其中所述共晶体是在X-射线束下。
36.如权利要求30的结晶形式,其中所述结晶形式是在X-射线束下。
37.如权利要求30的结晶形式,其中所述PIM-1是突变的。
38.如权利要求37的结晶形式,其中所述PIM-1包含P123M突变。
39.得到PIM-1晶体的方法,包括将PIM-1蛋白,以5-20mg/ml的浓度,置于结晶条件下,基本相当于Hampton筛选1的条件2,7,14,17,23,25,29,36,44,或者49,放置足够的时间,用于晶体形成。
40.如权利要求39的方法,进一步包括优化所述结晶条件。
41.如权利要求37的方法,其中所述结晶条件是选自包括以下的组:0.2MLiCl,0.1M Tris pH8.5,5-15%聚乙二醇4000;0.4-0.9M三水合乙酸钠pH6.5,0.1M咪唑;0.2-0.7M酒石酸钠钾,00.1M MES缓冲液pH6.5;和0.25M甲酸镁。
42.如权利要求39的方法,其中所述PIM-1是硒-甲硫氨酸标记的PIM-1。
43.如权利要求39的方法,其中所述PIM-1是突变的。
44.如权利要求43的方法,其中所述PIM-1包含P123M突变。
45.得到PIM-1与结合化合物的共晶体的方法,包括将PIM-1蛋白,以5-20mg/ml的浓度,置于结晶条件下,基本相当于Hampton筛选1的条件2,7,14,17,23,25,29,36,44,或者49,在存在结合化合物的条件下,放置足够的时间,用于晶体形成。
46.如权利要求45的方法,其中所述结合化合物被加入到所述蛋白质中,至终浓度为0.5到1.0mM。
47.如权利要求46的方法,其中所述结合化合物是在二甲基亚砜溶液中。
48.如权利要求45的方法,其中所述结晶条件是0.4-0.9M三水合乙酸钠pH6.5,0.1M的咪唑;或者0.2-0.7M酒石酸钠钾,00.1M MES缓冲液pH6.5。
49.调节PIM-1活性的方法,包括
让PIM-1与结合PIM-1的化合物接触,并且与残基49,52,65,67,121,128,和186残基中的超过一个相互作用。
50.如权利要求49的方法,其中所述化合物是式I,式II,或者式III的化合物。
51.如权利要求49的方法,其中所述化合物是在200μM或者更低的浓度下。
52.治疗患有以异常PIM-1活性为特征的疾病或者病症的患者的方法,包括
给所述病人,施用与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的一个或者多个相互作用的化合物。
53.如权利要求52的方法,其中所述化合物是式I,式II,或者式III的化合物。
54.如权利要求50的方法,其中所述疾病或者病症是癌症。
55.如权利要求52的方法,其中所述疾病或者病症是发炎性疾病或者病症。
56.PIM-1的晶体结构的电子展示。
57.如权利要求56的电子展示,含有原子坐标展示,对应于表1所列坐标。
58.如权利要求56的电子展示,包括图解展示。
59.如权利要求56的图解展示,其中利用了突变的PIM-1的原子坐标。
60.如权利要求59的电子展示,其中所述突变的PIM-1含有P123M突变。
61.如权利要求59的电子展示,含有原子坐标展示,对应于列在表1中的坐标,是经过用甲硫氨酸的坐标置换在第123位的脯氨酸的坐标而被修饰。
62.PIM-1的结合位点的电子展示。
63.如权利要求62的电子展示,包括PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186的展示。
64.如权利要求62的电子展示,包括结合位点的表面轮廓。
65.如权利要求62的电子展示,包括多个保守氨基酸残基的结合特征的展示。
66.如权利要求62的电子展示,进一步包括在PIM-1结合位点的结合化合物的电子展示。
67.如权利要求62的电子展示,其中所述PIM-1是突变的PIM-1。
68.如权利要求67的电子展示,其中所述PIM-1是用甲硫氨酸替换第123位的脯氨酸而被突变的。
69.基于激酶的同源模型的PIM-1的电子展示。
70.如权利要求69的电子展示,其中所述同源模型利用了表1的保守残基的原子坐标。
71.如权利要求69的电子展示,其中利用了突变的PIM-1的原子坐标。
72.如权利要求71的电子展示,其中所述突变的PIM-1包含P123M突变。
73.修饰的PIM-1晶体结构的电子展示,包括
修饰的PIM-1的原子坐标的电子展示。
74.如权利要求73的电子展示,包括表1的原子坐标,是经过在PIM-1残基123位、用甲硫氨酸的原子坐标置换脯氨酸的原子坐标而修饰。
75.如权利要求73的电子展示,其中所述修饰的PIM-1包括C-末端的缺失,或者N-末端的缺失或者两者。
76.开发生物制剂的方法,包括
分析PIM-1结构,并且鉴定用于形成所述生物制剂的至少一个亚结构。
77.如权利要求76的方法,其中所述亚结构包括表位,并且所述方法进一步包括开发针对所述表位的抗体。
78.如权利要求76的方法,其中所述亚结构包括预计提供改变的活性的突变位点,并且所述方法进一步包括在所述位点产生突变,从而提供修饰的PIM-1。
79.如权利要求76的方法,其中所述亚结构包括用于粘附分离部分的粘附点。
80.如权利要求79的方法,其中所述分离部分是选自肽,多肽,固相材料,接头和标记物。
81.如权利要求79的方法,进一步包括粘附所述分离部分。
82.鉴定潜在的PIM-1结合化合物的方法,包括
将化合物的至少一个电子展示,配合在PIM-1结合位点的电子展示中。
83.如权利要求82的方法,其中PIM-1结合位点的所述电子展示是由表1中说明的原子结构坐标定义的。
84.如权利要求83的方法,包括
去除与PIM-1复合的化合物的计算机展示,并且将来自计算机数据库的化合物的计算机展示与PIM-1活性位点的计算机展示配合;并且
基于几何学有利配合以及能量学有利互补相互作用,鉴定与所述活性位点最适合的化合物,作为潜在的结合化合物。
85.如权利要求83的方法,包括
通过一个或者多个化学基团的删除或者添加或者两者,修饰与PIM-1复合的化合物的计算机展示;
配合来自计算机数据库的化合物的计算机展示与PIM-1的活性位点的计算机展示;并且
基于几何学有利配合以及能量学有利互补相互作用,鉴定最适合所述活性位点的化合物,作为潜在的结合化合物。
86.如权利要求83的方法,包括
去除与PIM-1复合的化合物的计算机展示并且;
应用化合物搜索计算机程序,搜索数据库,寻找与所述化合物具有结构相似性的化合物,或者,应用化合物构建计算机程序,用相似的化学结构替换所述化合物的部分。
87.如权利要求83的方法,其中与PIM-1复合的所述化合物是式I、式II、或者式III的一种化合物。
88.如权利要求82的方法,其中所述配合包括确定所述化合物是否将与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的一个或者多个相互作用。
89.粘附激酶结合化合物至粘附组分的方法,包括
对于所述粘附组分与激酶结合化合物的粘附,鉴定能量学允许的位点;并且
在所述能量学允许的位点,粘附所述化合物或者其衍生物至所述粘附组分。
90.如权利要求89的方法,其中所述粘附组分是用于粘附至固相介质的接头,并且所述方法进一步包括,通过粘附于所述能量学允许位点的接头,粘附所述化合物或者其衍生物至固相介质。
91.如权利要求89的方法,其中所述激酶是PIM-1激酶。
92.如权利要求89的方法,其中所述激酶包括与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的至少一个相匹配的保守残基。
93.如权利要求90的方法,其中所述接头是一个无痕接头。
94.如权利要求90的方法,其中所述激酶结合化合物或者其衍生物是在粘附于所述固相介质的接头上合成的。
95.如权利要求94方法,其中多种所述化合物或者衍生物是以组合合成方式合成的。
96.如权利要求90的方法,其中所述化合物对于所述固相介质的粘附提供了亲和介质。
97.如权利要求89的方法,其中所述粘附组分包括标记物。
98.如权利要求97的方法,其中所述标记物包括荧光团。
99.修饰的化合物,包括
式I,式II,或者式III的化合物,其上粘附有接头部分。
100.如权利要求99的化合物,为了所述修饰化合物结合PIM-1,其中所述接头是粘附于能量学允许位点。
101.如权利要求99的化合物,其中所述接头粘附于固相。
102.如权利要求99的化合物,其中所述接头包括或者粘附于标记物。
103.如权利要求99的化合物,其中所述接头是无痕接头。
104.修饰的PIM-1多肽,包括P123M修饰。
105.如权利要求104的修饰的PIM-1多肽,其中所述多肽包括全长PIM-1多肽。
106.如权利要求104的修饰的PIM-1多肽,其中所述多肽包括修饰的PIM-1结合位点。
107.如权利要求104的修饰的PIM-1多肽,其中所述多肽包括至少50个相邻氨基酸残基,源自PIM-1序列,包括所述P123M修饰。
108.如权利要求104的修饰的PIM-1多肽,包括全长PIM-1。
109.开发针对包括与PIM-1残基49、52、65、67、121、128和186中的一个或者更多个相匹配的保守残基的激酶的配基的方法,包括
确定式I,式II,或者式III的化合物是否结合所述激酶。
110.如权利要求109的方法,其中所述激酶包括与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186中的至少两个相匹配的保守残基。
111.如权利要求109的方法,其中所述激酶包括与PIM-1残基49,52,65,67,121,128,和186相匹配的保守残基。
112.如权利要求109的方法,进一步包括确定是否所述化合物调节所述激酶。
113.如权利要求109的方法,其中所述确定包括在所述激酶的结合位点计算机配合所述化合物。
114.如权利要求109的方法,进一步包括所述激酶与所述化合物形成共晶体。
115.如权利要求114的方法,进一步包括确定所述化合物与所述激酶的结合定向。
116.如权利要求109的方法,其中所述激酶与全长PIM-1具有至少25%序列同一性。
117.治疗PIM-1相关疾病的方法,包括
给患有PIM-1相关疾病或者处于PIM-1相关疾病的风险下的患者,施用治疗量的2-苯基氨基嘧啶化合物或者吡啶-[2,3-d]嘧啶化合物。
118.如权利要求117的方法,其中所述化合物是甲磺酸伊马替尼或者其衍生物。
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- 2003-09-16 CN CN 03825157 patent/CN1701122A/zh active Pending
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C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C02 | Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001) | ||
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |