CN118027003A - 一种protac化合物及其制备方法和作为雌激素受体降解剂的用途 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种PROTAC化合物、制备方法及化合物作为雌激素受体降解剂的应用。所述PROTAC化合物包含药学上可接受的盐、水合物、溶剂化物、多晶型物或前药,或其雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体衍生物。所述化合物是由linker将8‑(2,4‑二氯苯基)‑9‑(4‑(4‑甲酰基哌啶‑1‑基)苯基)‑6,7‑二氢‑5H‑苯并[7]环烯‑3‑羧酸甲酯及其衍生物与来那度胺、沙利度胺、羟基沙利度胺、泊马度胺、或4‑氨基‑4‑氧代‑2‑(1‑氧代异吲哚‑2‑基)丁酸或它们的衍生物及其异构体构成的E3连接酶配体进行连接制备。为了寻找新型雌激素受体降解剂类药物,研发了一系列蛋白水解靶向嵌合体类化合物。本发明化合物对雌激素受体具有良好的降解效果,可以发展成为新型雌激素受体降解剂类药物。
Description
技术领域
本发明涉及药物合成与应用技术领域,尤其涉及一种PROTAC化合物、制备方法及化合物作为雌激素受体降解剂的应用。
背景技术
乳腺癌是目前最常见的癌症形式之一。根据美国国家癌症研究所(NCI)估计,2017年约有25万名妇女被诊断患有乳腺癌,其中超过4万名病人因其去世。ER+/HER2-乳腺癌约占乳腺癌病患的70%左右。这类病患在初期可以通过内分泌阻断疗法治疗,但随着疾病进展,肿瘤会对此疗法产生抗性,同时也会累积许多突变,造成治疗上的困难。
近年来乳腺癌发病率呈上升趋势,如今在女性恶性肿瘤中排在首位。在乳腺癌患者中,约70%表现为雌激素受体ER阳性乳腺癌。因此ER是乳腺癌药物研究中一个重要靶点。迄今为止,治疗ER阳性乳腺癌的首要干预措施仍然是通过抑制与乳腺癌有关的雌激素水平的内分泌疗法,主要包括选择性雌激素受体调节剂(如他莫昔芬、雷洛昔芬)和芳香化酶抑制剂(如来曲唑、依西美坦)以及选择性ER下调剂。尽管内分泌疗法在治疗乳腺癌患者方面取得了巨大成效,但其存在毒副作用、治疗时间长及耐药等问题。
蛋白质水解靶向嵌合体PROTAC技术是由Craig M.Crews教授团队提出,目前处在前沿的靶向治疗策略,PROTACs是一种杂合双功能分子,一端是可以与E3连接酶结合的配体,另一端是与靶蛋白(protein of interest,POI)结合的配体,中间是连接臂(linker)。作用机制是通过PROTACs分子将靶蛋白募集至E3连接酶附近,使靶蛋白被泛素化标记,随后通过泛素-蛋白酶体途径降解靶蛋白,最终达到治疗疾病目的。通过降解乳腺癌细胞中ER来发挥治疗作用,可以有效克服耐药,是一种富有前景的抗乳腺癌药物。
CN116178340A公开了一种PROTAC化合物。CN115124590A公开了靶向降解FLT3-ITD突变蛋白的PROTAC类化合物。CN114736264A公开了Tau蛋白可视化PROTAC降解化合物。CN113336748A公开了蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)。CN109152843A公开了PROTAC抗体缀合物。CN110612297A公开了雌激素受体蛋白水解调节剂。CN110291087A公开了作为雌激素受体降解剂的四氢萘和四氢异喹啉衍生物。
发明内容
本发明的目的是为了寻找新型雌激素受体降解剂类药物,由此设计了一系列蛋白水解靶向嵌合体类化合物。因此,本发明提供具有通式(I)的雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(化合物I)。
根据本发明的第一个实施方案,提供具有通式(I)的化合物或其立体异构体、互变异构体,或其药学上可接受的盐、水合物、溶剂化物、多晶型物或前药,或其雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体衍生物:
式(I)中,R为C1-C5烷氧基(例如甲氧基,乙氧基,丙氧基,丁氧基),氨基,C1-C5烷基氨基(例如甲基氨基,乙基氨基,丙基氨基,丁基氨基),或OH中的一种。即,结构式(I)中的R为CH3(CH2)pO-,p=0、1、2、3、4或5;或氨基;或CH3(CH2)qNH-,q=0、1、2、3、4或5,或-OH中的一种。
式(I)中E3连接酶配体具有通式(II)的结构;优选,E3连接酶配体为来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮,或它们的衍生物及其异构体:
n=0或1,m=0或1;
其中与linker连接位点为R1,R2和R3中的一个,其余取代基(即R1,R2和R3中的另外两个)各自独立是:H,OH,F,Cl,Br,NH2,CH3或OCH3中的一个。和/或,另外,结构式(II)中的n=0或1,m=0或1,R4为氢或甲基时的一个E3连接酶配体也可以为沙利度胺或其变型4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸中的一种。
式(I)化合物是雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(I)。
优选,式(I)中E3连接酶配体是来那度胺(IIa):
所述来那度胺(IIa)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
(其中*表示连接位点。下同)。
式(IIa-1)中的所述*NH-基团也可以属于linker基团的一部分或末端基团(-NH-),下文同。即,如下式所示:
其中-L’-NH-是(作为二价连接基的)-Linker-或-L-。下同。
或,式(I)中E3连接酶配体是沙利度胺(IIb):
所述沙利度胺(IIb)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
或,式(I)中E3连接酶配体是4-羟基-沙利度胺(IIc-1)或5-羟基-沙利度胺(IIc-2):
所述4-羟基-沙利度胺(IIc-1)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
所述5-羟基-沙利度胺(IIc-2)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
所述*O-基团也可以属于linker基团的一部分或末端基团(-O-),下文同。即,如下式所示:
其中-L’-O-是(作为二价连接基的)-Linker-或-L-。下同。
或,式(I)中E3连接酶配体是泊马度胺(IId):
所述泊马度胺(IId-1)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
所述*NH-基团也可以属于linker基团的一部分或末端基团(-NH-),下文同。即,如下式所示:
其中-L’-NH-是(作为二价连接基的)-Linker-或-L-。下同。
所述泊马度胺(IId-2)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
所述*NH-基团也可以属于linker基团的一部分或末端基团(-NH-),下文同。即,如下式所示:
其中-L’-NH-是(作为二价连接基的)-Linker-或-L-。下同。
或,式(I)中E3连接酶配体是3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮(IIe):
所述3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮(IIe)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
或,式(I)中E3连接酶配体是4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸(IIf):
所述4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸(IIf)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
或,式(I)中E3连接酶配体是2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮(IIg):
所述2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮(IIg)与linker连接的位点(*)或方式是,或者,式(I)中E3连接酶配体是,例如,下列之一:
式(I)中linker(或L)是(二价)连接基或桥连基团。一般,linker是柔性或刚性连接基或桥连基团中的一种或两种或多种的组合。
优选,刚性linker是选自于下式中的一种:
柔性linker是选自于下式中的一种:
柔性linker与刚性linker的结合是选自于下式中的一种:
在本申请中,n=0-5表示n=0、1、2、3、4或5。类似地,n=2-10表示n=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
根据本发明的第二个实施方案,提供所述雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(I)的制备方法,该方法包括:将化合物5溶解于有机溶剂(例如N,N二甲基甲酰胺,或二甲基亚砜)中,加入E3连接酶配体(优选,来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮或其衍生物),(常温下)搅拌(例0.5-3小时,如1小时),随后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠),(于常温下)继续搅拌,在反应完毕后,分离和纯化(例如萃取纯化),得到目标化合物(I),其中化合物5具有以下结构式:
其中:R为C1-C5烷氧基(例如甲氧基,乙氧基,丙氧基,丁氧基),氨基,C1-C5烷基氨基(例如甲基氨基,乙基氨基,丙基氨基,丁基氨基),或OH中的一种;例如8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-甲酰基哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯。
更具体,所述雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(I)(即化合物(I))的制备方法包括以下步骤:
优选,所述雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(I)(即化合物(I))的制备方法包括:
步骤1:让化合物1与(4-溴苯基)硼酸在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物2,
其中,化合物1和化合物2分别具有以下结构式:
其中:R为C1-C5烷氧基(例如甲氧基,乙氧基,丙氧基,丁氧基),氨基,C1-C5烷基氨基(例如甲基氨基,乙基氨基,丙基氨基,丁基氨基),或OH中的一种。
步骤2:让化合物2与4-(二乙氧基甲基)哌啶在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物3:
步骤3:让化合物3与三溴化吡啶鎓在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物4:
步骤4:让化合物4与(2,4-二氯苯基)硼酸在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物5:
步骤5:将来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮用有机溶剂(例如二甲基亚砜,或N,N二甲基甲酰胺)溶解,加入linker与叔胺化合物(例如含有异丙基的叔胺,如N,N-二异丙基乙胺),在升高的温度(例如80-130℃或90-110℃,如100℃)下反应(例如4-12小时或5-10小时,如6-8h),分离纯化,然后脱去linker上的保护基团,再分离纯化,制得组合体1(例如,2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮)。
步骤6:将化合物5和组合体1用有机溶剂(例如N,N二甲基甲酰胺)溶解,(常温,如10-35度下)搅拌(例如1h)后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠),继续搅拌(优选,在常温下搅拌),反应完毕后,萃取纯化,得到通式(I)的化合物。例如,除下文中所列出的化合物QDE-003-C,化合物QDE-003-D外的其他目标化合物(I),即,下文中所列出的化合物QDE-003,化合物QDE-003-A,化合物QDE-003-B,化合物QDE-003-E,化合物QDE-003-F,化合物QDE-003-G,化合物QDE-003-H,化合物QDE-003-I,或,化合物QDE-003-J。
更优选,所述雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体(I)(即化合物(I))的制备方法包括:
步骤1:将化合物1在无水无氧环境下,加入1,4二氧六环溶解,加入四三苯基膦钯,碳酸铯,氮气换气多次(例如两次,三次或四次),添加(4-溴苯基)硼酸在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如6-20小时或8-16小时,如10-12小时),TLC监测反应进度,反应完毕后进行过滤(优选,趁热过滤),取滤液利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,真空蒸干,纯化(例如柱层析纯化),得化合物2,
其中,化合物1具有以下结构式:(如/>);
其中,化合物2具有以下结构式:(如/>)。
步骤2:将化合物2和4-(二乙氧基甲基)哌啶在无水无氧环境下,加入有机溶剂(例如1,4二氧六环)溶解,加入三二亚苄基丙酮二钯,2-双环已基膦-2,6-二异丙氧基联苯,碳酸铯,用氮气换气(例如两次,三次或四次),在升高的温度(优选70-120℃,优选75-110℃,更优选80-100℃,例如85、90或95℃)下反应(例如6-20小时或8-16小时,如10-12小时),TLC监测反应进度,反应完毕后过滤(优选,趁热过滤),取滤液利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,真空蒸干,纯化(例如柱层析纯化),得到化合物3:
(如/>)。
步骤3:将化合物3在无水无氧环境下,加入有机溶剂(例如无水四氢呋喃)溶解,(利用冰浴)将混合物降温到2℃至-2℃的温度(例如1℃至-1℃,如0℃),氮气置换(例如两次、三次或四次),将三溴化吡啶鎓在有机溶剂中形成的溶液(例如,使用注射器将三溴化吡啶鎓的四氢呋喃溶液)缓慢滴入反应体系,滴加完毕后(例如撤掉冰浴),在常温(优选20-40℃,如25-35℃)下继续反应(例如4-15小时或5-14小时,如6-13小时、7-12小时或8-10小时),加入无机碱(如碳酸钠溶液或碳酸氢钠溶液或碳酸氢钾溶液)淬灭反应后,反应混合物利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,减压蒸馏(优选,在40-60℃,如50℃的温度下减压蒸馏),纯化(例如柱层析纯化),得到化合物4:
(如/>)。
步骤4:将化合物4与(2,4-二氯苯基)硼酸,四三苯基膦钯,碳酸铯,加入反应器(例如圆底烧瓶)中,加入有机溶剂(例如1,4-二氧六环)来溶解混合物,氮气置换(例如两次、三次或四次),在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如6-15小时或7-12小时,如8-10小时),TLC监测反应进度,反应完毕后,过滤(优选,趁热过滤);反应混合物利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,减压蒸馏(优选,在40-60℃,如50℃的温度下减压蒸馏),纯化(例如柱层析纯化),得到化合物5(即,8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-甲酰基哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯):
(如/>)。
步骤5:将来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮用有机溶剂(例如二甲基亚砜,或N,N二甲基甲酰胺)溶解,加入linker与叔胺化合物(例如含有异丙基的叔胺,如N,N-二异丙基乙胺),在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如4-12小时或5-10小时,如6-8小时),分离纯化,然后脱去linker上的保护基团,分离纯化,制得组合体1(例如,2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮):
步骤6:将化合物5和组合体1用有机溶剂(例如N,N二甲基甲酰胺)溶解,(常温,例如20-40℃,如25-35℃)搅拌(例如1小时)后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠),继续搅拌(优选,在常温例如20-40℃、如25-35℃的温度下搅拌),反应完毕后,萃取纯化,得到通式(I)的化合物。例如,除下文所列出的化合物QDE-003-C,化合物QDE-003-D外的其他目标化合物(I),即,下文所列出的化合物QDE-003,化合物QDE-003-A,化合物QDE-003-B,化合物QDE-003-E,化合物QDE-003-F,化合物QDE-003-G,化合物QDE-003-H,化合物QDE-003-I,或,化合物QDE-003-J。
其中化合物QDE-003-C、化合物QDE-003-D是由化合物QDE-003-A分别加入氨水与氢氧化钠溶液水解后分离纯化制得。其中化合物QDE-003-C是由化合物QDE-003-A加入氢氧化钠溶液进行水解,分离纯化,所制得。其中化合物QDE-003-D是由化合物QDE-003-A加入氨水进行水解,分离纯化,所制得。
因此,上述制备方法还包括以下步骤6:由化合物QDE-003-A加入氢氧化钠溶液进行水解,分离纯化,制得化合物QDE-003-C,或由化合物QDE-003-A加入氨水进行水解,分离纯化,制得化合物QDE-003-D。
根据本发明的优选的实施方案,作为通式(I)化合物,提供下列化合物:
本发明对系列蛋白水解靶向嵌合体类化合物进行了深入的化学和药理活性研究,发现以上十多种化合物(QDE-003以及QDE-003-A至J)对雌激素具有较好的抑制效果,具备开发成新的治疗乳腺癌药物的前景,为研制新的治疗乳腺癌和丰富临床用药品种提供了新途径。
本发明提供的雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体具有良好的雌激素受体蛋白降解活性,可用于制备抗乳腺癌的药物。
本申请还提供一种药物组合物,其含有治疗有效量的本申请的化合物(I)、其异构体或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体。
本申请还提供了本申请的化合物(I)、其异构体或其药学上可接受的盐在制备治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病的药物中的应用。
本申请还提供治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病的方法,包括对需要该治疗的哺乳动物(优选人类)给予治疗有效量的本申请的化合物、其异构体或其药学上可接受的盐。
本申请还提供本申请的化合物、其异构体或其药学上可接受的盐在治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病中的应用。
本申请还提供用于治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病的本申请所示化合物其异构体或其药学上可接受的盐。
本申请还提供用于治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病的本申请所示化合物其异构体或其药学上可接受的盐。
本申请的一些方案中,所述雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病选自肿瘤或癌症。
本申请的一些方案中,所述雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病选自乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、子宫癌、前列腺癌、子宫内膜异位症、肺癌和食管癌。
本申请的一些方案中,所述雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病选自乳腺癌。
相关定义
除非另有说明,本文所用的下列术语和短语旨在具有下列含义。一个特定的术语或短语在没有特别定义的情况下不应该被认为是不确定的或不清楚的,而应该按照普通的含义去理解。当本文中出现商品名时,意在指代其对应的商品或其活性成分。
这里所采用的术语“药学上可接受的”,是针对那些化合物、材料、组合物和/或剂型而言,它们在可靠的医学判断的范围之内,适用于与人类和动物的组织接触使用,而没有过多的毒性、刺激性、过敏性反应。或其它问题或并发症,与合理的利益/风险比相称。
术语“药学上可接受的盐”是指本申请化合物的盐,由本申请发现的具有特定取代基的化合物与相对无毒的酸或碱制备。当本申请的化合物中含有相对酸性的功能团时,可以通过在纯的溶液或合适的惰性溶剂中用足够量的碱与这类化合物接触的方式获得碱加成盐。当本申请的化合物中含有相对碱性的官能团时,可以通过在纯的溶液或合适的惰性溶剂中用足够量的酸与这类化合物接触的方式获得酸加成盐。本申请的某些特定的化合物含有碱性和酸性的官能团,从而可以被转换成任一碱或酸加成盐。
本申请的药学上可接受的盐可由含有酸根或碱基的母体化合物通过常规化学方法合成。一般情况下,这样的盐的制备方法是:在水或有机溶剂或两者的混合物中,经由游离酸或碱形式的这些化合物与化学计量的适当的碱或酸反应来制备。
本申请的化合物可以存在特定的几何或立体异构体形式。本申请设想所有的这类化合物,包括顺式和反式异构体、(-)-和(+)-对映体、(R)-和(S)-对映体、非对映异构体、(D)-异构体、(2)-异构体,及其外消旋混合物和其他混合物,例如对映异构体或非对映体富集的混合物,所有这些混合物都属于本申请的范围之内。烷基等取代基中可存在另外的不对称碳原子。所有这些异构体以及它们的混合物,均包括在本申请的范围之内。
本申请的化合物和中间体还可以不同的互变异构体形式存在,并且所有这样的形式包含于本申请的范围内。术语“互变异构体”或“互变异构体形式”是指可经由低能垒互变的不同能量的结构异构体。例如,质子互变异构体(也称为质子转移互变异构体)包括经由质子迁移的互变,如酮-烯醇及亚胺-烯胺异构化。质子互变异构体的具体实例是咪唑部分,其中质子可在两个环氮间迁移。价互变异构体包括通过一些成键电子的重组的互变。本申请的化合物可以在一个或多个构成该化合物的原子上包含非天然比例的原子同位素。例如,可用放射性同位素标记化合物,比如氚(2H),碘-125(125I)或C-14(14C)。又例如,可用重氢取代氢形成氘代药物,氘与碳构成的键比普通氢与碳构成的键更坚固,相比于未氘化药物,氘代药物有降低毒副作用、增加药物稳定性、增强疗效、延长药物生物半衰期等优势。本申请的化合物的所有同位素组成的变换,无论放射性与否,都包括在本申请的范围之内。
术语“任选”或“任选地”指的是随后描述的事件或状况可能但不是必需出现的,并且该描述包括其中所述事件或状况发生的情况以及所述事件或状况不发生的情况。
术语“靶向嵌合体”表示包含两种小分子配体的双官能分子,一种具有针对目的靶蛋白的高亲和力,以及第二种用于募集E3连接酶,所述E3连接酶使蛋白质泛素化并靶向蛋白质以通过蛋白酶体进行蛋白水解。
本申请的化合物可以通过本领域技术人员所熟知的多种合成方法来制备,包括下面列举的具体实施方式、其与其他化学合成方法的结合所形成的实施方式以及本领域技术上人员所熟知的等同替换方式,优选的实施方式包括但不限于本申请的实施例。
本申请所使用的溶剂可经市售获得。化合物依据本领域常规命名原则或者使用ChemDraw@软件命名,市售化合物采用供应商目录名称。
本发明的有益技术效果
本申请中的化合物作为新结构的双功能ER PROTAC分子,其不仅对雌激素诱导的信号传导有良好的抑制作用,并且对ERa有良好的降解作用。本申请的双功能化合物药代动力学、生物利用度和体内药效等性质良好,可以发展成为新型雌激素受体降解剂类药物。
附图说明
图1是雌激素受体蛋白水解活性测试结果。
具体实施方式
下面对本发明的技术方案进行举例说明,本发明请求保护的范围包括但不限于以下实施例。
为了寻找疗效更好的雌激素受体降解剂,结合目前对该类类药物的认识,根据相关文献合成了多个雌激素受体降解剂,并对获得的目标化合物进行雌激素受体蛋白降解活性测试,发现十个化合物都对雌激素受体具有一定的降解作用,其中化合物QDE-003-C化合物、QDE-003-D、化合物QDE-003-E和化合物QDE-003-F相较于氟维斯群具有更好的降解作用。
目标化合物的结构已经由高分辨质谱(HR-ESI-MS)、核磁共振氢谱(1H-NMR)确证。
本发明实施例选用试剂情况:
在本发明中,化合物1为9-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸或9-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸酯,例如9-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯(CAS2114341-38-5),上海皓鸿生物医药科技有限公司。
4-(二乙氧基甲基)哌啶:CAS144872-31-1。
三溴化吡啶鎓:CAS 39416-48-3。
(2,4-二氯苯基)硼酸:CAS 68716-47-2。
来那度胺:CAS191732-72-6。
沙利度胺:CAS 50-35-1。
4-羟基-沙利度胺:CAS 64567-60-8.
5-羟基-沙利度胺:CAS203450-07-1。
泊马度胺:CAS19171-19-8。
3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮:CAS26581-81-7。
实施例1:
化合物QDE-003制备,步骤如下:
步骤1:将5g 9-((三氟甲基)磺酰基)氧基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯(14.3mmol),与4.3g 4-溴苯硼酸(21.5mmol),加入1,4二氧六环(50ml)溶解,加入1.65g四(三苯基膦)钯(1.43mmol),9.31g碳酸铯(28.6mmol),氮气换气三次,在100℃下反应10-12小时,TLC监测反应进度,反应完毕后趁热过滤,取滤液用乙酸乙酯与水萃取三次,用分液漏斗分出乙酸乙酯层,真空蒸干,柱层析纯化得3.72g 6,7-二氢-9-(4-溴苯基)-5H-苄环庚烯-3-羧酸甲酯,产率72.2%,即化合物2。多次反应积累此化合物的质量。
步骤2:将2.3g化合物2(6.4mmol)与2.4g 4-(二乙氧基甲基)哌啶(12.8mmol)加入30ml 1,4二氧六环溶解,加入5.86g三二亚苄基丙酮二钯(0.64mmol),6g 2-双环已基膦-2,6-二异丙氧基联苯(1.28mmol),4.17g碳酸铯(12.8mmol),氮气换气三次,90℃下反应10-12h,TLC监测反应进度,反应完毕后趁热过滤,取滤液用乙酸乙酯与水萃取三次,用分液漏斗分出乙酸乙酯层,真空蒸干后柱层析纯化得1.87g 9-(4-(4-(二乙氧基甲基)哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯,产率63%,即化合物3。多次反应积累此化合物的质量。
步骤3:将3g化合物3(6.45mmol),加入50ml四氢呋喃溶解,冰浴降温至0℃,氮气置换三次,使用注射器将2.5g三溴化吡啶鎓(6.45mmol)的10ml四氢呋喃溶液缓慢滴入反应体系,滴加完毕后撤掉冰浴,常温下反应8-10h,加入碳酸氢钠溶液淬灭后,乙酸乙酯与水萃取三次,用分液漏斗分出乙酸乙酯层,50℃下减压蒸馏,柱层析纯化得8-溴-9-(4-(4-甲酰基哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯1.28g,产率42.5%,即化合物4。多次反应积累此化合物的质量。
步骤4:将1.5g化合物4(3.2mmol)与0.8g(2,4-二氯苯基)硼酸(4.8mmol),0.7g四三苯基膦钯(0.32mol),3.1g碳酸铯(9.6mmol),加入圆底烧瓶中,50ml 1,4-二氧六环溶解,氮气置换三次,在100℃下反应8-10h,TLC监测反应进度,反应完毕后,趁热过滤。使用乙酸乙酯与水萃取,萃取三次后用分液漏斗分离出乙酸乙酯,减压蒸馏,柱层析纯化得8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-甲酰基哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯0.76g,产率44.2%,即化合物5。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入6.7g 1-(叔丁氧羰基)哌嗪(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得2-(2,6-二氧代哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮二盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得5.14g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮(即,组合体1),产率83%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.92g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮(2.7mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003纯品0.66g,产率41.0%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)与核磁共振氢谱(1H-NMR)确证QDE-003的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:861.3[M+H]+(calculated for C48H47Cl2N5O6,860.8).1H-NMR(600Hz,CDCl3):7.951-6.650(C-H,13H),5.398(N-CH,1H),3.888(CH3,3H),3.486-3.106(N-CH2,8H),3.169(C=CCH2,2H),2.916-1.253(CH2,18H),1.866(CH,1H)。
实施例2:
化合物QDE-003-A制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将1g化合物5(1.8mmol)与1.36g(S)-3-(1-氧代-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮苯磺酸盐(2.7mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-A 0.42g,产率27%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-A的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:847.5[M+H]+(calculated for C48H49Cl2N5O5,846.8)。
实施例3:
化合物QDE-003-B的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将1g化合物5(1.8mmol)与0.47g(3S)-3-(5-氨基-1,3-二氢-1-氧代-2H-异吲哚-2-基)-2,6-哌啶二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-B纯品0.50g,产率30.1%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS),核磁共振氢谱(1H-NMR)确证QDE-003-B的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:779.3[M+H]+(calculated for C44H42Cl2N4O5,777.7),H-NMR(600Hz,CDCl3):7.945-6.618(C-H,13H),5.210-3.609(N-CH2,7H),3.630(C=C-CH2,2H),3.100(CH3,3H),2.916-1.253(CH2,14H)。
实施例4:
化合物QDE-003-C的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤5共5个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例2基本相同。
步骤6:将0.50g QDE-003-A(0.6mmol)溶于四氢呋喃,加入2M NaOH溶液调节PH=13,常温搅拌5-6小时,TLC检测反应,反应完成后,加入醋酸调节PH=7,乙酸乙酯与饱和食盐水萃取后,取乙酸乙酯相减压蒸馏后柱层析得QDE-003-C纯品0.43g,产率85.1%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-C的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:852.3[M+H]+(calculated for C47H49Cl2N5O6,850.8)。
实施例5:
化合物QDE-003-D的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤5共5个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例2基本相同。
步骤6:将0.50g QDE-003-A(0.6mmol)溶于四氢呋喃,加入25%氨水调节PH=8-9,常温搅拌5-6小时,TLC检测反应,反应完成后,加入醋酸调节PH=7,乙酸乙酯与饱和食盐水萃取后,取乙酸乙酯相减压蒸馏后柱层析得QDE-003-D纯品0.33g,产率66%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-D的结构ESI-MS(positive mode)m/z:866.4[M+H]+(calculated for C48H51Cl2N5O6,864.8)。
实施例6:
化合物QDE-003-E的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共4个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将1.5g化合物5(3.2mmol)与0.8g(2,4-二氯苯基)硼酸(4.8mmol),0.7g四三苯基膦钯(0.32mol),3.1g碳酸铯(9.6mmol),加入圆底烧瓶中,50ml 1,4-二氧六环溶解,氮气置换三次,在100℃下反应8-10h,TLC监测反应进度,反应完毕后,趁热过滤。使用乙酸乙酯与水萃取,萃取三次后用分液漏斗分离出乙酸乙酯,减压蒸馏,柱层析纯化得8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-((4-(二乙氧基甲基)哌啶-1-基)甲基)哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯纯品1.63g,产率78.4%,即化合物6。
步骤6:将1.5g化合物6加入10ml盐酸/乙酸乙酯溶液,常温搅拌4-5小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和碳酸氢钠溶液调节PH=7淬灭反应,乙酸乙酯与水萃取,减压蒸馏乙酸乙酯相,柱层析得8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-((4-甲酰基哌啶-1-基)甲基)哌啶-1-酰基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯纯品1.12g,产率83%,即化合物7。
步骤7:将1g化合物7(1.5mmol)与0.68g(S)-3-(1-氧代-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮苯磺酸盐(2.4mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.63g三乙酰基硼氢化钠(3mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-E 0.35g,产率23.6%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS),核磁共振氢谱(1H-NMR)确证QDE-003-E的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:945.5[M+H]+(calculated for C54H60Cl2N5O6,944.0);H-NMR(600Hz,CDCl3):7.945-6.618(C-H,13H),5.210-3.609(N-CH2,19H),3.630(C=C-CH2,2H)3.100(CH3,3H),2.916-1.253(CH2,20H)。
实施例7:
化合物QDE-003-F的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入8.7g 3-(哌啶-4-基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得5-(4-(氮杂环丁烷-3-基)哌啶-1-基)-2-(2,6-二氧哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得6.3g 5-(4-(氮杂环丁烷-3-基)哌啶-1-基)-2-(2,6-二氧哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮,产率77%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.72g 5-(4-(氮杂环丁烷-3-基)哌啶-1-基)-2-(2,6-二氧哌啶-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-F纯品0.61g,产率85.9%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-F的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:915.6[M+H]+(calculated for C52H53Cl2N5O6,914.9)。
实施例8:
化合物QDE-003-G的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入8.7g 4-(氮杂环丁烷-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得6.6g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)异吲哚啉-1,3-二酮,产率79%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.69g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)异吲哚啉-1,3-二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-G纯品0.79g,产率47.0%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS),核磁共振氢谱(1H-NMR)确证QDE-003-G的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:902.4[M+H]+(calculated for C51H51Cl2N5O6,900.9)1H-NMR(600Hz,CDCl3):7.945-6.618(C-H,13H),5.210-3.609(N-CH2,11H),3.630(C=C-CH2,2H),3.100(CH3,3H),2.916-1.253(CH2,20H)。
实施例9:
化合物QDE-003-H的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入8.2g 2,7-二氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸叔丁酯(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得7.26g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-2-基)异吲哚啉-1,3-二酮,产率82%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.69g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)异吲哚啉-1,3-二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-H纯品0.74g,产43.7%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS),核磁共振氢谱(1H-NMR)确证QDE-003-H的结构:
ESI-MS(positive mode)m/z:902.4[M+H]+(calculated for C53H55Cl2N5O6,900.9);1H-NMR(600Hz,CDCl3):7.945-6.618(C-H,13H),5.210-3.609(N-CH2,11H),3.630(C=C-CH2,2H),3.100(CH3,3H),2.916-1.253(CH2,20H)。
实施例10:
化合物QDE-003-I的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入9.2g 3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-羧酸叔丁酯(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得6.21g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮,产率77%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.74g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-I纯品0.77g,产率45.6%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-I的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:930.6[M+H]+(calculated for C53H55Cl2N5O6,929.0)。
实施例11:
化合物QDE-003-J的制备,步骤如下:
从步骤1至步骤4共四个步骤的制备方法除用量外其过程与实施例1基本相同。
步骤5:将5g 5-氟沙利度胺(18.1mmol)用二甲基亚砜溶解,加入9.2g 2,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-羧酸叔丁酯(36.2mmol)与4.7g N,N-二异丙基乙胺(36.2mmol),在90℃下反应8小时,柱层析分离纯化(PE:EA=1:1)后,加入盐酸乙酸乙酯溶液,常温搅拌4小时后真空蒸馏掉溶液,得2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮盐酸盐,加入饱和碳酸氢钠溶液与二氯甲烷1:2常温搅拌3小时后分液,取二氯甲烷层旋干,得5.6g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-基)异吲哚啉-1,3-二酮,产率70%。
步骤6:将1g化合物5(1.8mmol)与0.74g 2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(2,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-2-基)异吲哚啉-1,3-二酮(1.8mmol)用30ml N,N二甲基甲酰胺溶解,常温搅拌1小时后,加入0.76g三乙酰基硼氢化钠(3.6mmol),常温搅拌8-10小时,TLC检测反应完毕后,加入饱和氯化铵溶液淬灭反应,加入乙酸乙酯与水萃取后,饱和食盐水洗乙酸乙酯相,减压蒸馏后制备板分离,得QDE-003-J纯品0.7g,产率41.4%。
通过高分辨质谱(HR-ESI-MS)确证QDE-003-J的结构:ESI-MS(positive mode)m/z:930.6[M+H]+(calculated for C53H55Cl2N5O6,929.0)。
雌激素受体蛋白水解活性测定:
进行雌激素受体蛋白水解活性测试,实验过程如下:
1.取对数生长期的MCF-7细胞,按1.5×106/孔铺至6孔板中,过夜培养;
2.加入终浓度分别为1μM的阳性药和待测物组(DMSO比例为0.1%),培养箱内孵育24h;
3.收集各组细胞,并用PBS清洗1次;加入含1×Protease Inhibitor cocktail与1×Phosphatase Inhibitor Cocktail II的细胞裂解液,冰上充分裂解,4℃,14000rpm离心10min收集上清。
4.BCA试剂盒测定蛋白浓度后,Western blot检测Estrogen Receptor alpha蛋白水平。
测试结果如图1中所示。
上述内容,仅是本发明代表性实施例,并非对本发明作任何形式的限制。凡是依据本发明的技术实质对以上实施例所作的任何修改、等同变化与修饰,均仍属于本发明技术方案的范围。
Claims (10)
1.具有通式(I)的化合物或其立体异构体、互变异构体,或其药学上可接受的盐、水合物、溶剂化物、多晶型物或前药,或其雌激素受体蛋白水解靶向嵌合体衍生物:
式(I)中,R为C1-C5烷氧基,氨基,C1-C5烷基氨基,或OH中的一种;
E3连接酶配体具有通式(II)的结构;优选,E3连接酶配体为来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺,3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮,或它们的衍生物及其异构体:
n=0或1,m=0或1;
其中与linker连接的位点为R1,R2和R3中的一个,其余取代基,即R1、R2和R3中的另外两个,各自独立是:H,OH,F,Cl,Br,NH2,CH3或OCH3中的一个;或者,结构式(II)中的n=0或1,m=0或1,R4为氢或甲基时的一个E3连接酶配体是沙利度胺或其变型4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸中的一种;
式(I)中linker是连接基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中:式(I)中E3连接酶配体是来那度胺(IIa):
或,式(I)中E3连接酶配体是沙利度胺(IIb):
或,式(I)中E3连接酶配体是4-羟基-沙利度胺(IIc-1)或5-羟基-沙利度胺(IIc-2):
或,式(I)中E3连接酶配体是泊马度胺(IId):
或,式(I)中E3连接酶配体是3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮(IIe):
或,式(I)中E3连接酶配体是4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸(IIf):
或,式(I)中E3连接酶配体是2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮(IIg):
3.根据权利要求1或2所述的化合物,其中,linker是柔性或刚性连接基中的一种,或两种或多种的组合。
4.根据权利要求3所述的化合物,其中,刚性linker是选自于下式中的一种:
和/或其中,柔性linker是选自于下式中的一种:
n=0-5;和/或
其中,柔性linker与刚性linker的结合是选自于下式中的一种:
5.具有以下结构式的化合物:
6.权利要求1-4中任何一项所述的通式(I)化合物的制备方法,该方法包括:将化合物5,溶解于有机溶剂中,加入E3连接酶配体(优选,来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮或其衍生物),搅拌,随后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠)继续搅拌,在反应完毕后,分离和纯化,得到目标化合物(I);其中化合物5具有以下结构式:
其中:R为C1-C5烷氧基,氨基,C1-C5烷基氨基,或OH中的一种。
7.权利要求1-4中任何一项所述的通式(I)化合物的制备方法,该方法包括:
步骤1:让化合物1与(4-溴苯基)硼酸在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物2,
其中,化合物1和化合物2分别具有以下结构式:
其中:R为C1-C5烷氧基,氨基,C1-C5烷基氨基,或OH中的一种;
步骤2:让化合物2与4-(二乙氧基甲基)哌啶在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物3:
步骤3:让化合物3与三溴化吡啶鎓在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物4:
步骤4:让化合物4与(2,4-二氯苯基)硼酸在有机溶剂中在催化剂存在下进行反应,分离,得到化合物5:
步骤5:将来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮用有机溶剂(例如二甲基亚砜,或N,N二甲基甲酰胺)溶解,加入linker与叔胺化合物(例如含有异丙基的叔胺,如N,N-二异丙基乙胺),在升高的温度(例如80-130℃或90-110℃,如100℃)下反应(例如4-12小时或5-10小时,如6-8h),分离纯化,然后脱去linker上的保护基团,再分离纯化,制得组合体1(例如,2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮);
步骤6:将化合物5和组合体1用有机溶剂(例如N,N二甲基甲酰胺)溶解,(常温,如10-35度下)搅拌(例如1小时)后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠),继续搅拌(优选,在常温下搅拌),反应完毕后,萃取纯化,得到通式(I)的化合物。
8.根据权利要求7所述的方法,其中
步骤1如下进行:将化合物1在无水无氧环境下,加入1,4二氧六环溶解,加入四三苯基膦钯,碳酸铯,氮气换气多次(例如两次,三次或四次),添加(4-溴苯基)硼酸在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如6-20小时或8-16小时,如10-12小时),TLC监测反应进度,反应完毕后进行过滤(优选,趁热过滤),取滤液利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,真空蒸干,纯化(例如柱层析纯化),得化合物2,
其中,化合物1具有以下结构式:
其中,化合物2具有以下结构式:
和/或
步骤2如下进行:将化合物2和4-(二乙氧基甲基)哌啶在无水无氧环境下,加入有机溶剂(例如1,4二氧六环)溶解,加入三二亚苄基丙酮二钯,2-双环已基膦-2,6-二异丙氧基联苯,碳酸铯,用氮气换气(例如两次,三次或四次),在升高的温度(优选70-120℃,优选75-110℃,更优选80-100℃,例如85、90或95℃)下反应(例如6-20小时或8-16小时,如10-12小时),TLC监测反应进度,反应完毕后过滤(优选,趁热过滤),取滤液利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,真空蒸干,纯化(例如柱层析纯化),得到化合物3:
和/或
步骤3如下进行:将化合物3在无水无氧环境下,加入有机溶剂(例如无水四氢呋喃)溶解,(利用冰浴)将混合物降温到2℃至-2℃的温度(例如1℃至-1℃,如0℃),氮气置换(例如两次、三次或四次),将三溴化吡啶鎓在有机溶剂中形成的溶液(例如,使用注射器将三溴化吡啶鎓的四氢呋喃溶液)缓慢滴入反应体系,滴加完毕后(例如撤掉冰浴),在常温(优选20-40℃,如25-35℃)下继续反应(例如4-15小时或5-14小时,如6-13小时、7-12小时或8-10小时),加入无机碱(如碳酸钠溶液或碳酸氢钠溶液或碳酸氢钾溶液)淬灭反应后,反应混合物利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,减压蒸馏(优选,在40-60℃,如50℃的温度下减压蒸馏),纯化(例如柱层析纯化),得到化合物4:
和/或
步骤4如下进行:将化合物4与(2,4-二氯苯基)硼酸,四三苯基膦钯,碳酸铯,加入反应器(例如圆底烧瓶)中,加入有机溶剂(例如1,4-二氧六环)来溶解混合物,氮气置换(例如两次、三次或四次),在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如6-15小时或7-12小时,如8-10小时),TLC监测反应进度,反应完毕后,过滤(优选,趁热过滤);反应混合物利用作为萃取剂的有机溶剂和水(例如乙酸乙酯与水)萃取(例如三次),用分液漏斗分出有机溶剂(例如乙酸乙酯)层,减压蒸馏(优选,在40-60℃,如50℃的温度下减压蒸馏),纯化(例如柱层析纯化),得到化合物5,即,8-(2,4-二氯苯基)-9-(4-(4-甲酰基哌啶-1-基)苯基)-6,7-二氢-5H-苯并[7]环烯-3-羧酸甲酯:
和/或
步骤5如下进行:将来那度胺、沙利度胺、4-羟基-沙利度胺、5-羟基-沙利度胺、泊马度胺、3-(1-氧代异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮、4-氨基-4-氧代-2-(1-氧代异吲哚-2-基)丁酸或2-(1-甲基-2,6-二氧代哌啶-3-基)异吲哚-1,3-二酮用有机溶剂(例如二甲基亚砜,或N,N二甲基甲酰胺)溶解,加入linker与叔胺化合物(例如含有异丙基的叔胺,如N,N-二异丙基乙胺),在升高的温度(优选80-130℃,优选85-120℃,更优选90-110℃,例如95、100或105℃)下反应(例如4-12小时或5-10小时,如6-8小时),分离纯化,然后脱去linker上的保护基团,分离纯化,制得组合体1(例如,2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-5-(哌嗪-1-基)异吲哚啉-1,3-二酮);
和/或
步骤6如下进行:将化合物5和组合体1用有机溶剂(N,N二甲基甲酰胺)溶解,(常温,例如20-40℃,如25-35℃)搅拌(例如1小时)后加入还原剂(例如碱金属硼氢化物,如硼氢化钠、硼氢化钾、硼氢化锂或三乙酰基硼氢化钠),继续搅拌(优选,在常温例如20-40℃、如25-35℃的温度下搅拌),反应完毕后,萃取纯化,得到通式(I)的化合物。
9.药物组合物,其中,该组合物含有:治疗有效量的权利要求1-4中任何一项所述的化合物(I)、其异构体或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体;
或
该组合物含有:治疗有效量的权利要求5所述的化合物、其异构体或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体。
10.权利要求1-4中任何一项所述的化合物(I)或权利要求5所述的化合物、其异构体或其药学上可接受的盐在制备治疗与雌激素受体蛋白降解靶向嵌合体相关疾病的药物中的应用。
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CN119751533A (zh) * | 2025-03-10 | 2025-04-04 | 山东大学 | 一种基于雌甾三烯结构的雌激素受体蛋白靶向降解嵌合体衍生物及其制备方法和应用 |
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