Faktor transkripsi

Dalam genetika, faktor transkripsi adalah sekelompok protein di dalam inti sel yang berperan serta dalam proses transkripsi kode genetik menjadi mRNA. Faktor transkripsi merupakan mata rantai terakhir pada lintasan transduksi sinyal yang mengkonversi sinyal ekstraselular menjadi modulasi ekspresi genetik. Regulasi transkripsi dicapai dengan terikatnya protein pada deret dan motif struktur DNA tertentu yang biasanya terletak pada hulu gen target.^[1]

Sebelum proses transkripsi terjadi, DNA mengalami suatu tahapan "pematangan" atau penyiapan. Ini biasanya berupa perubahan konformasi pada molekul DNA dan pembukaan pilinan secara lokal. Selanjutnya beberapa protein akan menempati beberapa titik di dekat promoter inti untuk mempersiapkan tempat bagi enzim RNA-polimerase dan menunjukkan ribosom tempat ia harus memposisikan diri. Rangkaian protein inilah yang disebut faktor transkripsi.

Faktor transkripsi diketahui berperan penting dalam pengendalian sejumlah variasi fenotipe penting. Selain itu, banyak lokus sifat kuantitatif (QTL) yang ditemukan ternyata memuat sekuens yang mengkode faktor transkripsi. Sekuens-sekuens yang mengkode faktor transkripsi untuk suatu gen disebut sebagai trans-acting sequences ("sekuens beraksi trans") karena mengatur ekspresi suatu gen dari kejauhan.

Selain bekerja sendiri, faktor transkripsi juga dapat bekerja dengan beberapa protein lainnya, baik bekerja dengan mempromosikan (faktor transkripsi bekerja sebagai activator), maupun memblokir (faktor transkripsi bekerja sebagai represor) pada perekrutan RNA polimerase ke gen tertentu.^[2]^[3]

Struktur

Faktor transkripsi memiliki struktur yang berisi beberapa domain, yaitu:^[4]

Domain pengikatan DNA (DBD): Domain ini menempel pada urutan DNA tertentu (baik dalam bentuk peningkat maupun promotor. DBD merupakan domain dasar yang diperlukan untuk semua jenis vektor. Domain ini berguna untuk mendorong transkripsi urutan promotor transgen vektor) yang berdekatan dengan gen yang diatur. Urutan DNA yang mengikut faktor transkripsi sering juga disebut sebagai elemen respon.
Domain aktifasi (AD): Domain ini berisi situs pengikatan untuk protein lain seperti koregulator transkripsi. Situs pengikatan ini sering disebut sebagai fungsi aktifasi (AFs), domain transaktifasi (TAD) atau Trans-activating domain TAD tetapi yang tidak bercampur dengan domain TAD^[5]
Domain penginderaan sinyal (SSD), sebagai opsional, sebagai contoh yaitu domain pengikat ligan. Domain penginderaan sinyal merupakan domain yang merasakan sinyal eksternal, dan sebagai tanggapan, atau mentransmisikan sinyal ke seluruh kompleks transkripsi. Domain ini menghasilkan naik atau turunnya regulasi gen. Selain itu, domain DBD dengan domain penginderaan sinyal dapat bertempat pada protein terpisah.^[6]

Proto-onkogen

Banyak proto-onkogen merupakan faktor transkripsi dan dapat ditemukan melalui tiap-tiap homolog retroviral bersangkutan.^[1] Beberapa contoh meliputi erb A, ets, fos, jun, myb, and c-myc. Kompleks antara fos dan jun membentuk faktor transkripsi AP-1 yang mengendalikan ekspresi genetik mitosis, sedangkan Erb A merupakan pencerap hormon T3

Proto-onkogen yang berfungsi layaknya faktor transkripsi sering teraktivasi oleh translokasi kromosomal pada neoplasma padat dan hematologis, sehingga para ahli selalu berupaya untuk mendayagunakan faktor transkripsi untuk terapi kanker.^[7] Sebagai contoh, proto-onkogen c-myc sering kali teraktivasi oleh translokasi kromosomal pada leukemia dan limfoma.

Rujukan

^ ^a ^b (Inggris) Kufe, Donald W.; Pollock, Raphael E.; Weichselbaum, Ralph R.; Bast, Robert C., Jr.; Gansler, Ted S.; Holland, James F.; Frei III, Emil. (2003). Holland-Frei Cancer medicine. Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School Boston, Department of Surgical Oncology, University of Texas, MD Anderson Cancer Center, Department of Radiation and Cellular Oncology, University of Chicago Hospital, Chicago Tumor Institute, University of Chicago Chicago, University of Texas, MD Anderson Cancer Center, Houston, American Cancer Society, Derald H Ruttenberg Cancer Center, Mount Sinai School of Medicine New York (edisi ke-6). Hamilton on BC Decker Inc.,. hlm. Discovery and identification of oncogenes. ISBN 1-55009-213-8. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-07-17. Diakses tanggal 2010-09-18.
^ Roeder, R (1996-09). "The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II". Trends in Biochemical Sciences (dalam bahasa Inggris). 21 (9): 327–335. doi:10.1016/S0968-0004(96)10050-5. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-06-16. Diakses tanggal 2022-02-22.
^ Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000-12). "TRANSCRIPTION OF EUKARYOTIC PROTEIN-CODING GENES". Annual Review of Genetics (dalam bahasa Inggris). 34 (1): 77–137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. ISSN 0066-4197. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-10-22. Diakses tanggal 2022-02-22.
^ Latchman, David S. (1997-12). "Transcription factors: An overview". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology (dalam bahasa Inggris). 29 (12): 1305–1312. doi:10.1016/S1357-2725(97)00085-X. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-10-16. Diakses tanggal 2022-02-22.
^ Wärnmark, Anette; Treuter, Eckardt; Wright, Anthony P. H.; Gustafsson, Jan-Åke (2003-10-01). "Activation Functions 1 and 2 of Nuclear Receptors: Molecular Strategies for Transcriptional Activation". Molecular Endocrinology (dalam bahasa Inggris). 17 (10): 1901–1909. doi:10.1210/me.2002-0384. ISSN 0888-8809. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-02-07. Diakses tanggal 2022-02-22.
^ Zhang, Lei; Jha, Sunil Kr.; Yang, Zhixin; Zhao, Zhenbing; Tiwari, Bhupendra Nath (2017). "Machine Intelligence in Signal Sensing, Processing, and Recognition". Journal of Electrical and Computer Engineering (dalam bahasa Inggris). 2017: 1–2. doi:10.1155/2017/6168207. ISSN 2090-0147. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-05-09. Diakses tanggal 2022-02-22.
^ (Inggris) "Transcription factors as targets for cancer therapy". Laboratory of Molecular Cell Biology, The Rockefeller University; Darnell JE Jr. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2019-10-04. Diakses tanggal 2010-09-18.

Artikel bertopik genetika ini adalah sebuah rintisan. Anda dapat membantu Wikipedia dengan mengembangkannya.

[hfcm_a1385-1] (Inggris) Kufe, Donald W.; Pollock, Raphael E.; Weichselbaum, Ralph R.; Bast, Robert C., Jr.; Gansler, Ted S.; Holland, James F.; Frei III, Emil. (2003). Holland-Frei Cancer medicine. Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School Boston, Department of Surgical Oncology, University of Texas, MD Anderson Cancer Center, Department of Radiation and Cellular Oncology, University of Chicago Hospital, Chicago Tumor Institute, University of Chicago Chicago, University of Texas, MD Anderson Cancer Center, Houston, American Cancer Society, Derald H Ruttenberg Cancer Center, Mount Sinai School of Medicine New York (edisi ke-6). Hamilton on BC Decker Inc.,. hlm. Discovery and identification of oncogenes. ISBN 1-55009-213-8. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-07-17. Diakses tanggal 2010-09-18.

[2] Roeder, R (1996-09). "The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II". Trends in Biochemical Sciences (dalam bahasa Inggris). 21 (9): 327–335. doi:10.1016/S0968-0004(96)10050-5. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-06-16. Diakses tanggal 2022-02-22.

[3] Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000-12). "TRANSCRIPTION OF EUKARYOTIC PROTEIN-CODING GENES". Annual Review of Genetics (dalam bahasa Inggris). 34 (1): 77–137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. ISSN 0066-4197. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-10-22. Diakses tanggal 2022-02-22.

[4] Latchman, David S. (1997-12). "Transcription factors: An overview". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology (dalam bahasa Inggris). 29 (12): 1305–1312. doi:10.1016/S1357-2725(97)00085-X. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2022-10-16. Diakses tanggal 2022-02-22.

[5] Wärnmark, Anette; Treuter, Eckardt; Wright, Anthony P. H.; Gustafsson, Jan-Åke (2003-10-01). "Activation Functions 1 and 2 of Nuclear Receptors: Molecular Strategies for Transcriptional Activation". Molecular Endocrinology (dalam bahasa Inggris). 17 (10): 1901–1909. doi:10.1210/me.2002-0384. ISSN 0888-8809. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-02-07. Diakses tanggal 2022-02-22.

[6] Zhang, Lei; Jha, Sunil Kr.; Yang, Zhixin; Zhao, Zhenbing; Tiwari, Bhupendra Nath (2017). "Machine Intelligence in Signal Sensing, Processing, and Recognition". Journal of Electrical and Computer Engineering (dalam bahasa Inggris). 2017: 1–2. doi:10.1155/2017/6168207. ISSN 2090-0147. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2023-05-09. Diakses tanggal 2022-02-22.

[7] (Inggris) "Transcription factors as targets for cancer therapy". Laboratory of Molecular Cell Biology, The Rockefeller University; Darnell JE Jr. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2019-10-04. Diakses tanggal 2010-09-18.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]