8000 Commits · USCbiostats/iMutSig · GitHub

More Web Proxy on the site http://driver.im/

Commits

Commits on Oct 12, 2020

fix some typos

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Oct 5, 2020

fix #2 by removing d3heatmap from regular installation steps.

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
fix #2

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Sep 14, 2020

change the default version of heatmaps

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Sep 13, 2020

change the sidebar width and font size for tables. 44

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Jul 28, 2020

change the length of box on the top for 2-v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
pre-save sig_pm_v2, sig_pm_v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
remove any decomTumor2Sig

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
pre-save sig_pm_v2, sig_pm_v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
finish changing 1-v2, 1-v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
remove reactive values

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
remove the collapse button

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
add cached plots

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
fix 1-v2

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
fix 1-v2 and 1-v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
continue working on 1-v2

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
update two objects by adding the names to Fs and changing the colnames for full_sig_v2

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
change for 1-v2 and 1-v3

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
change the name for sig_full_v2 to allow index stay as character

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Jul 27, 2020

remove auto-hiding sidebar. trim the visPMS_full_modified function.

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
trim visPMS_full_modified function

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
add pmsignatures when method == collapse

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
update corr_mat.rdata

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
correct the cosine similarity calculation for PM signatures and force updating corr_mat.rdata

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
resave the corr_mat.rdata

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
add the library

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
only compare non-zero elements in pmsignature matrix

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
update the cosine similarity matrix

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
flatten the pmsignature for cosine similarity calculation.

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
pre-save objects to make it run faster

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
resave objects to make it run faster

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
remove library to make code run faster

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

Commits on Jul 26, 2020

allow two methods, expand and collapse

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
add decompTumor2Sig

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed
add heatmaps

Zhi Yang
authored and
Zhi Yang
committed

0