[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/

Prolinom i glutaminom bogati splajsing faktor jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SFPQ sa hromosoma 1.[3][4]

SFPQ
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jeviGeneCards: [1]
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za SFPQ
Genomska lokacija za SFPQ
Bend16q24.1Početak84,192,558 bp[1]
Kraj84,197,053 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001039504

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 16: 84.19 – 84.2 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Proteini se često nazivaju u skladu s aktivnošću s kojom su prvi put povezani ili organelama u kojima su prvobitno identificirani. Međutim, različiti jedarni faktori djeluju u višestrukim molekulskim reakcijama koje se odvijaju istovremeno unutar jedra. U jednom pregledu iz 2002., opisuju se funkcije jedarnih faktora PSF (polipirimidinski trakt-vezujući proteinu pridruženi splajsing faktor) i p54nrb/NonO. PSF je prvobitno nazvan faktor prerade zbog njegove povezanosti s drugim korakom pre-iRNK prerade, dok se smatralo da p54nrb/NonO učestvuje u regulaciji transkripcije. Nedavni dokazi pokazuju da pojednostavljena kategorizacija PSF-a i njegovog homologa p54nrb/NonO na bilo koju pojedinačnu jedarnu aktivnost nije moguća i zapravo ovi proteini pokazuju multifunkcionalne karakteristike u različitim jedarnim procesima.

Jedroo je složena organela u kojoj se odvija širok spektar procesa. Ovim aktivnostima se pripisuju specifični jedarni faktori. Naprimjer, biti "faktor orerade" obično će značiti vezivanje za RNK i sudjelovanje u aktivnostima prerade RNK, dok će temin "transkripcijski faktor" insinuirati interakcije s DNK i regulaciju transkripcije. Međutim, jedarne reakcije se događaju istovremeno i u vrlo bliskoj blizini . Zapravo, postoji unakrsni odnos između jedarnih procesa i određeni proteini mogu sudjelovati u više jedarnih događaja. U pomenur+tom pregledu razmatrani su podaci o dva takva multifunkcionalna proteina, PSF i p54nrb/NonO.

PSF, polipeptid od 100 kDa, identificiran je i karakteriziran u kompleksu sa PTB-om. Polipirimidinski trakt je regija koja se nalazi u većini introna viših eukariota za koju se može vezati nekoliko faktora i važna je za definiciju mjesta prerade 3'. Međutim, većina PSF-a je povezana s jedarnim matriksom i nisu vezanz za PTB. Imunofluorescentno bojenje je pokazalo nukleoplazmatsku distribuciju PSF-a u difuznim i punktatnim obrascima, gdje je lokalizacija u nukleoplazmatskim žarištima određena prisustvom RNK motiva prepoznavanja (RRM). N-terminal PSF-a bogat prolinom/glutaminom može biti uključen u interakcije protein-protein.[5]

Interakcije

uredi

Pokazano je da SFPQ ima interakcie sa PTBP1,[3][6] NONO,[7] CDC5L[8] i ubikvitinom C.[9]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000250685 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ a b Patton JG, Porro EB, Galceran J, Tempst P, Nadal-Ginard B (Mar 1993). "Cloning and characterization of PSF, a novel pre-mRNA splicing factor". Genes & Development. 7 (3): 393–406. doi:10.1101/gad.7.3.393. PMID 8449401.
  4. ^ "Entrez Gene: SFPQ splicing factor proline/glutamine-rich (polypyrimidine tract binding protein associated)".
  5. ^ Shav-Tal Y, Zipori D (Nov 2002). "PSF and p54(nrb)/NonO--multi-functional nuclear proteins". FEBS Letters. 531 (2): 109–14. doi:10.1016/S0014-5793(02)03447-6. PMID 12417296. S2CID 12485304.
  6. ^ Meissner M, Dechat T, Gerner C, Grimm R, Foisner R, Sauermann G (Jan 2000). "Differential nuclear localization and nuclear matrix association of the splicing factors PSF and PTB". Journal of Cellular Biochemistry. 76 (4): 559–66. doi:10.1002/(SICI)1097-4644(20000315)76:4<559::AID-JCB4>3.0.CO;2-U. PMID 10653975.
  7. ^ Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (Oct 2002). "PSF and p54nrb bind a conserved stem in U5 snRNA". RNA. 8 (10): 1334–47. doi:10.1017/S1355838202022070. PMC 1370341. PMID 12403470.
  8. ^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (Dec 2000). "Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry". The EMBO Journal. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093/emboj/19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
  9. ^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Sep 2005). "A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome". Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl:11858/00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Dopunska literatura

uredi