数多の武芸者が”最強”を求め命を懸けた伝説の武芸仕合『海原大仕合』から２年。『海原大仕合』で天下無双と謳われた千石伊織の元に徳川幕府より、戦いへの誘いが届く。敵は幕府が”最強”を決めるため選んだ武芸者たち、その名は”幕下百剣”。伊織に付き従うのは、剣に魅せられた一ノ瀬家の娘・蘭。いずれも一騎当千の強者たちを相手に、千石伊織の新たな戦いが幕を開ける！！
大亀流を見逃すという密約を破られた半次郎は深傷を負った現当主・真ノ丞を逃すため追撃に来た誉と交戦することに！柔と剛の剣がぶつかり合う！ 同じく一ノ瀬蘭を逃そうとする忠家と伊織の時間を稼ぎに、土龍は羅門と再び対峙する！！ 重傷者を抱えた我間達は江戸城を脱出できるのか！？