FC Flora Tallinn

Avrupa kupalarına ilk kez 1994-95 sezonunda UEFA Kupası'nda katıldı. Eşleştiği Odense takımına evinde ve deplasmanda 3-0 kaybederek kupaya veda etti.

1995-96 sezonunda UEFA Kupası'nda ilk galibiyetini Lillestrom karşısında evinde 1-0 kazanarak elde etti. Deplasmanda rakibine 4-0 kaybederek kupaya veda etti.

1996-97 sezonunda UEFA Kupası'nda eşleştiği Haka takımına 2-2 ve 1-0 sonuçları ile boyun eğerek kupaya veda etti.

1997-98 sezonunda UEFA Kupası'nda eşleştiği Hapoel Petah Tikva takımına elenerek kupaya veda etti.

Tarihinde ilk kez Şampiyonlar Ligi ön elemesine 1998-99 sezonunda Steau Bükreş karşısında çıktı ve her iki maçı da kaybederek Avrupa Kupalarına veda etti.

1999-00 sezonunda Şampiyonlar Ligi ön elemelerinde eşleştiği Partizan takımına elenerek Avrupa Kupalarına veda etti.

2000-01 sezonunda UEFA Kupası'nda eşleştiği Club Brugge takımına elenerek turnuvaya veda etti.

2001-02 sezonunda UEFA Kupası'nda eşleştiği Dinamo Zagreb takımına elenerek kupaya veda etti.

2002-03 sezonunda Şampiyonlar Ligi ön elemelerinde eşleştiği Apoel takımına elenerek Avrupa Kupalarına veda etti.

2003-04 sezonunda Şampiyonlar Ligi ön elemelerinde eşleştiği Sheriff takımına elenerek Avrupa Kupalarına veda etti.

2004-05 sezonunda Şampiyonlar Ligi ön elemelerinde eşleştiği Gorica takımına elenerek Avrupa Kupalarına veda etti.

2005-06 sezonunda UEFA Kupası ön elemelerinde eşleştiği Esbjerg takımına elenerek kupaya veda etti.

2006-07 sezonunda UEFA Kupası'nda eşleştiği Lyn takımını deplasman golü kuralı ile eleyerek tarihinde ilk kez Avrupa Kupalarında tur atladı.

28 February 2023 itibarıyla^[1]

Not: Uyruk bilgisi futbolcuların FIFA uygunluk kurallarınca oynayabileceği millî takımı gösterir. FIFA kuralları haricinde başkaca uyruğa da sahip olabilirler.

№ Mevki Uyruk Futbolcu 1 KL   EST Ingmar Krister Paplavskis 2 DF   EST Märten Kuusk (kiralık geldiği kulüp: Újpest) 3 DF   EST Marko Lipp 4 DF   EST Marco Lukka 5 OS   EST Vladislav Kreida 6 OS   EST Mihkel Järviste 8 FV   EST Henrik Ojamaa 9 FV   EST Rauno Alliku 10 OS   EST Martin Miller 11 FV   EST Aleksandr Šapovalov 13 OS   EST Nikita Mihhailov 14 OS   EST Konstantin Vassiljev (Kaptan) 16 DF   EST Erko Jonne Tõugjas 20 FV   EST Sergei Zenjov

№ Mevki Uyruk Futbolcu 21 OS   EST Sten Reinkort 23 DF   EST Mihhail Kolobov 24 DF   EST Henrik Pürg 25 DF   EST Ken Kallaste 26 DF   EST Kristo Hussar 27 DF   EST Michael Lilander 28 OS   EST Markus Soomets 33 KL   EST Evert Grünvald 43 DF   EST Markkus Seppik 46 FV   EST Otto-Robert Lipp 57 FV   EST Tony Varjund 74 OS   EST Danil Kuraksin 77 KL   EST Kristen Lapa

#	İsim	Dönem	Maç
1	Martin Reim	1992-1999, 2001-2008	385
2	Marko Kristal	1989-1999, 2001-2004	263
3	Teet Allas	2000-2010	233
4	Gert Kams	2006-	180
5	Viktor Alonen	1992-2001	163
6	Sergei Mošnikov	2006-2011	157
7	Kristen Viikmäe	1996-2000, 2004-2008	141
8	Vjatšeslav Zahovaiko	1999, 2003-2009	140
9	Aleksander Saharov	1999-2005	138
10	Martin Kaalma	1996, 1998, 2001-2006	134

#	İsim	Dönem	Gol
1	Vjatšeslav Zahovaiko	1999, 2003-2009	121
2	Martin Reim	1992-1999, 2001-2008	69
3	Kristen Viikmäe	1996-2000, 2004-2008	64
4	Tor Henning Hamre	2002-2003	62
	Indrek Zelinski	1993-1999, 2001
6	Henri Anier	2008-2011	52
7	Marko Kristal	1989-1999, 2001-2004	51
8	Sander Post	2004-2008, 2010-2011	49
9	Jarmo Ahjupera	2001, 2003-2004, 2006-2009	48
10	Andres Oper	1994-1999	44

• Official website 28 Nisan 2007 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. (Estonca)
• UEFA.com entry 13 Eylül 2009 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.