■コンテンツが重要な場合にはナビゲーションは右側に

ナビゲーションはあくまでも補足的なもの、緊急脱出のために活用するものという位置づけの場合にはナビゲーションは右側に設置します。 ナビゲーションが左にあると、ブラウザの横幅を狭くした場合にメインコンテンツ側が途中で切れてしまい読みづらくなるためです。

■ナビゲーションによる誘導が重要な場合はナビゲーションを左に

例えばアマゾンなどの巨大ECサイトではナビゲーションによる誘導が重要であるため、ナビゲーションが画面から切れてしまうことのないよう、左側にナビゲーション設置しています。

上記のほかの考え方として、ユーザがそのサイトと同時に利用する競合サイトと同じ位置にナビゲーションを設置する、という考え方もあります（ユーザの慣れや先入観に配慮する）。
ナビゲーション設置時には「コンテンツ」と「誘導」のいずれが大事なのかによって設置位置を調整するようにしましょう。